Gen MIM Proteína codificada Función Consecuencias de alteración/síndrome

ACTR2 604221 Actin-related protein 2 La función específica de este gen aún no se ha determinado;
GENES LOCALIZADOS
sin embargo, EN EL BRAZO
se sabe que la proteína CORTO
que codifica es un
DEL CROMOSOMA
componente principal del complejo ARP2 / 3.2 Este complejo
está ubicado en la superficie de la célula y es esencial para la
forma y movilidad de la célula a través del ensamblaje y
protrusión de la actina lamellipodial. Se han encontrado dos
variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas
para este gen.
ADI1 613400 enzyme 1,2-dihydroxy-3- Este gen codifica una enzima que pertenece a la familia de las
keto-5-methylthiopentene enzimas de unión a metales aci-reductonadioxigenasa, que
dioxygenase están involucradas en la recuperación de metionina. Esta
enzima puede regular el procesamiento del ARNm en el
núcleo y puede llevar a cabo diferentes funciones
dependiendo de su localización. Los pseudogenes
relacionados se han definido en los cromosomas 8 y 20. El
corte y empalme alternativo da como resultado variantes de
transcritos múltiples que codifican diferentes isoformas.
AFF3 601464 Encoding protein AF4/FMR2 Este gen codifica un activador transcripcional nuclear Asociaciones pendientes de confirmación
family member 3 restringido por tejido que se expresa preferentemente en
tejido linfoide. El aislamiento de esta proteína definió Steichen-Gersdorf et al. (2008) informaron una niña con
inicialmente una familia de genes LAF4 / MLLT2 altamente displasia mesomelic (605274) y anomalías del sistema
conservados de factores de transcripción nuclear que pueden nervioso central asociadas con una deleción heterocigótica
funcionar en el desarrollo linfoide y la oncogénesis. En de 500 kb en el cromosoma 2q11.2 que contiene el gen LAF4.
algunos pacientes con ALL, este gen se ha encontrado Los hallazgos fueron similares a los descritos por Savarirayan
fusionado al gen de MLL. Se et al. (2000) con la adición de manifestaciones del sistema
hanencontradomúltiplesvariantes de nervioso central y anomalías urogenitales. Kraft y col. (2015)
transcritoempalmadasalternativamentequecodificandiferent revaluó al paciente informado por Steichen-Gersdorf et al.
esproteínasparaeste gen. (2008) y determinaron que tenía una deleciónintragénica de
353 kb en el gen LAF4 que abarca solo 9 exones del gen y que
da como resultado una proteína truncada de 850 residuos
que carece de un dominio que se predice que participa en la
activación de la transcripción. El knockout homocigótico del
gen Laf1 en ratones no dio como resultado un fenotipo
reconocible. Sin embargo, los ratones con la deleción
heterocigótica u homocigótica de 353-kb tenían un
zeugopodo corto en la extremidad superior y anormalidades
en las extremidades inferiores que recapitulaban parte del
fenotipo humano, incluido el centro de osificación triangular
pequeño de la tibia y la hipoplasia grave del peroné. . Los
ratones también tenían polidactilia de los pies con
penetrancia incompleta. Kraft y col. (2015) sugirieron que el
fenotipo en el paciente era similar al síndrome de Nievergelt
(163400), y concluyeron que la proteína truncada ejerce un
efecto dominante negativo que conduce a las anomalías de la
formación ósea. Una discusión de una posible asociación
entre la variación en el gen AFF3 y la susceptibilidad a la
artritis reumatoide
AFTPH encoding protein Aftiphilin
ALMS1 606844 centrosome and basal body Este gen codifica una proteína que contiene un dominio de
associated protein repetición en tándem grande, así como regiones adicionales
de baja complejidad. La proteína codificada funciona en la
organización de microtúbulos, particularmente en la
formación y mantenimiento de cilios. Las mutaciones en este
gen causan el síndrome de Alstrom. Hay un pseudogen para
este gen ubicado adyacente en la misma región del
cromosoma 2. Se han descrito variantes de corte y empalme
alternativas, pero no se ha determinado su naturaleza de
longitud completa
El síndrome de Alström (ALMS, en sus siglas en inglés) es una
enfermedad multisistémica que se caracteriza por distrofia
de los conos de la retina, sordera, obesidad, resistencia a la
insulina con hiperinsulinemia, diabetes mellitus tipo II,
cardiomiopatía dilatada (DCM, en sus siglas en inglés) y
disfunción hepática y renal progresivas. Se han identificado
unos 450 casos en todo el mundo. Las características clínicas,
la edad de aparición y la severidad pueden variar
considerablemente entre las familias y sus miembros. La
distrofia de los conos de la retina suele aparecer a las pocas
semanas después de nacer, siendo los primeros síntomas el
nistagmo y una fotodisforia, o sensibilidad lumínica, extrema.
La distrofia progresiva suele conducir a la ceguera en la
segunda década de vida. La mayoría de los pacientes
desarrollan sorderas neurosensoriales bilaterales, leves o
moderadas, que progresan lentamente. La cardiomiopatía
dilatada se manifiesta en dos tercios de los pacientes, tanto
en niños como en adolescentes. Los pacientes tienen riesgo
de sufrir una insuficiencia cardíaca congestiva, de modo
repentino, a cualquier edad. La obesidad, la resistencia a la
insulina y la hiperinsulinemia son manifestaciones tempranas
relacionadas entre sí. Los rasgos faciales de estos pacientes
son inconfundibles: ojos hundidos, cara redonda, orejas
marcadas, calvicie frontal prematura y cabello débil. Gran
parte de los niños tienen los pies anchos, gruesos y planos,
con los dedos de manos y pies cortos y gruesos, sin
polidactilia ni sindactilia. Son frecuentes las nefropatías de
lenta evolución, las disfunciones hepáticas, las enfermedades
crónicas respiratorias, la hipertrigliceridemia y la
 hipertensión. La mayoría de los pacientes muestran una
inteligencia normal, aunque algunos informes señalan
retrasos en el desarrollo psicomotor e intelectual. El
síndrome de Alström tiene origen en las mutaciones del gen
ALMS1, transmitiéndose como un carácter autosómico
recesivo. Su diagnóstico se realiza partiendo de las
características clínicas observadas, generalmente sin
confirmarlas genéticamente. La identificación de 2 alelos
mutados, o del ALMS1 mutado, con los típicos rasgos clínicos,
vendría a confirmar el diagnóstico. En caso que se detecten
mutaciones ALMS1 en los fetos a riesgo, es aconsejable
someterlos a un estudio prenatal y a una orientación
genética. Los diagnósticos diferenciales comprenden los
síndromes de Bardet-Biedl, Biemond II, de Wolfram y Cohen,
así como la DCM infantil esporádica y alteraciones en las
mitocondrias (consultar estos términos). A pesar de que no
exista ninguna terapia específica, los diagnósticos tempranos
y la intervención pueden moderar el avance de esta
enfermedad y mejorar la calidad de vida de los pacientes. Su
control incluye un seguimiento continuo y un tratamiento
para los síntomas clínicos que van apareciendo. La esperanza
de vida raramente supera los 40 años.
ABCG5 605459 ATP-binding cassette La proteína codificada por estos genes son miembros de la La sitosterolemia es una enfermedad rara autosómica
Y Y subfamily G, members 5 superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP recesiva de almacenamiento de esteroles caracterizada por la
ABCG8 605460 and 8 (ABC). Las proteínas ABC transportan varias moléculas a acumulación de fitoesteroles en sangre y tejidos. Las
través de las membranas extra e intracelulares. Los genes manifestaciones clínicas incluyen xantomas, artralgia y
ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABC1, MDR / aterosclerosis prematura. Las manifestaciones hematológicas
TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, blanco). Esta proteína es un incluyen anemia hemolítica con estomatocitosis y
miembro de la subfamilia White. La proteína codificada por macrotrombocitopenia. La enfermedad está causada por
este gen funciona como medio transportador para limitar la mutaciones en homocigosis o heterocigosis compuesta en los
 absorción intestinal y promover la excreción biliar de genes ABCG5 (2p21) y ABCG8 (2p21).
esteroles. Se expresa de una manera específica de tejido en
el hígado, el colon y el intestino. Este gen está organizado en
tándem en el cromosoma 2, en una orientación cabeza a
cabeza con el miembro de la familia ABCG8. Las mutaciones
en este gen pueden contribuir a la acumulación de esteroles
y la aterosclerosis, y se han observado en pacientes con
sitosterolemia
CAPG 153615 capping actin protein, Para que una célula no muscular cambie de forma durante el
gelsolin like movimiento, la red de filamentos de actina en la periferia de
la célula debe someterse a una reorganización marcada. La
familia de proteínas gelsolina afecta profundamente la
arquitectura de los filamentos de actina, modulando
rápidamente las estructuras de actina en respuesta a
estímulos externos. Estas proteínas son capaces de cortar,
nuclear y / o tapar los filamentos de actina de una manera
regulada por Ca (2+) y fosfoinosítido. Gelsolin (GSN; 137350),
el miembro fundador de la familia, se encuentra en casi todas
las células. Villin (VIL1; 193040) tiene un peso molecular
ligeramente más alto que la gelsolina y una distribución
tisular muy restringida, que se encuentra solo en las
microvellosidades intestinales y las células epiteliales
tubulares renales. Southwick y DiNubile (1986) encontraron
otro miembro mamífero de la familia gelsolin. Esta proteína,
primero purificada a partir de macrófagos alveolares de
conejo, se denominó proteína de protección de macrófagos.
La proteína fue rebautizada posteriormente como Cap G
(símbolo del gen CAPG). Se eligió 'Cap' porque, a diferencia
de otros miembros de la familia gelsolina / vilina, esta
proteína tapa los extremos con púas de los filamentos de
 actina pero no los corta. 'G' se incluyó en el nombre porque
la secuencia de aminoácidos derivada de Cap G se asemeja
mucho más a la gelsolina, que posee un 49% de identidad
con su mitad amino terminal. Dabiri et al. (1992) clonaron y
secuenciaron el cDNA humano para CAPG. El gen CAPG tiene
una longitud de 16.6 kb y contiene 10 exones y 9 intrones.
Mediante análisis de PCR de ADNs híbridos de células
somáticas e hibridación fluorescente in situ, Mishra et al.
(1994) encontraron que el gen CAPG está ubicado en la parte
proximal del brazo largo del cromosoma 2.
CCDC142 Coiled-Coil Domain
Containing 142
CTLA4 123890 cytotoxic T-Lymphocyte Este gen es un miembro de la superfamilia de Las mutaciones en este gen se han asociado con la diabetes
Antigen 4 inmunoglobulinas y codifica una proteína que transmite una mellitus insulinodependiente, la enfermedad de Graves, la
señal inhibitoria a las células T. La proteína contiene un tiroiditis de Hashimoto, la enfermedad celíaca, el lupus
dominio V, un dominio transmembrana y una cola eritematoso sistémico, la orbitopatía asociada a la tiroides y
citoplásmica. Se han caracterizado variantes de corte y otras enfermedades autoinmunes.
empalme transcripcionales alternativas, que codifican Síndrome linfoproliferativo autoinmune por una
diferentes isoformas. La isoforma unida a la membrana haploinsuficiencia CTLA4.
funciona como un homodímero interconectado por un enlace
disulfuro, mientras que la isoforma soluble funciona como un
monómero.
DHX57 DExH-box helicase 57
DPYSL5 608383 dihydropyrimidinaselike 5 Este gen codifica un miembro de la familia CRMP (proteína Yu et al. (2001) definieron un autoanticuerpo IgG
mediadora de respuesta colapsable) que se cree está paraneoplásico específico para CRMP5, que se expresa en
involucrada en el desarrollo neuronal. Se encontraron neuronas centrales y periféricas adultas y en carcinomas de
anticuerpos contra la proteína codificada en algunos pulmón de células pequeñas. Se detectó CRMP5-IgG en 121
pacientes con síntomas neurológicos que tenían síndrome de aproximadamente 68,000 pacientes con sospecha de
paraneoplásico. Un pseudogen de este gen se encuentra en síndrome paraneoplásico. Las características clínicas
 el cromosoma 11. Se han identificado múltiples variantes incluyeron corea (11%), neuropatía craneal (17%), neuropatía
empalmadas alternativamente, que codifican la misma periférica (47%), neuropatía autonómica (31%), ataxia
proteína. cerebelosa (26%), demencia subaguda (25%) y trastornos de
la unión neuromuscular (12 %). El carcinoma pulmonar, en su
mayoría de células pequeñas, se encontró en el 77% de los
pacientes; el timoma estaba en el 6%. Cross et al. (2003)
informaron 16 pacientes con anticuerpos IgG CRMP5 que
tenían neuritis óptica, 5 de los cuales tenían retinitis
coexistente. Quince de los pacientes tenían pérdida de visión
subaguda, discos ópticos hinchados y defectos de campo. Se
encontraron células inflamatorias vítreas, principalmente
células T citotóxicas. Todos los pacientes tenían otros
síntomas o signos neurológicos en algún momento de su
enfermedad.
ERLEC1 611229 Endoplasmicreticulumlectin Este gen codifica una proteína del retículo endoplásmico (ER)
1 residente que funciona en el reconocimiento de N-glicanos.
Se cree que esta proteína está implicada en la degradación
asociada a ER a través de su interacción con el complejo
ubiquitinaligasa asociado a la membrana. También funciona
como un regulador de múltiples vías celulares de respuesta al
estrés de una manera que promueve la supervivencia celular
metastásica. El corte y empalme alternativo da como
resultado múltiples variantes de transcripción. Se ha
identificado un pseudogen relacionado en el cromosoma 21
EVA1A encoding protein Eva-1
homolog A (C. elegans)
FAM49A Family with sequence
similarity 49 member A
FAM98A Family with sequence
similarity 98 member A
FAM136A 616275 Family with sequence Este gen codifica una proteína mitocondrialmente localizada
similarity 136 member A que está altamente conservada en todas las especies. El gen
se expresa en una variedad de tejidos que incluyen células de
linfoblastos humanos y epitelio neurosensorial de rata de la
cristaampullaris. Una mutación en este gen se ha asociado
con la enfermedad de Meniere familiar, un trastorno crónico
del oído interno. Varios pseudogenes de este gen se
encuentran en otros cromosomas. Resultadosalternativos de
empalme en múltiplesvariantes de transcripción
607871 F-box protein 11 Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas F-box
FBXO11 que se caracteriza por un motivo de aproximadamente 40
aminoácidos, el F-box. Las proteínas F-box constituyen una
de las cuatro subunidades del complejo ubiquitina proteína
ligasa llamadas SCF (SKP1-cullin-F-box), que funcionan en la
ubiquitinación dependiente de la fosforilación. Las proteínas
F-box se dividen en 3 clases: Fbws que contienen dominios
WD-40, Fbls que contienen repeticiones ricas en leucina y Fbx
que contienen diferentes módulos de interacción proteína-
proteína o ningún motivo reconocible. La proteína codificada
por este gen pertenece a la clase Fbxs. Puede funcionar como
una arginina metiltransferasa que dimetila simétricamente
los residuos de arginina, y actúa como una proteína
adaptadora para mediar en la edicación de p53, lo que
conduce a la supresión de la función p53. Se sabe que este
gen está regulado negativamente en los melanocitos de
pacientes con vitiligo, un trastorno de la piel que produce
despigmentación. Los polimorfismos en este gen se asocian
con otitis media crónica con derrame y otitis media
Asociaciones pendientes de confirmación
Para la discusión de una posible asociación entre la variación
en el gen FAM136A y la susceptibilidad a la enfermedad de
Meniere.
Mutaciones somáticas en el linfoma difuso de células B
grandes
Duan et al. (2012) demostraron que BCL6 (109565) tiene
como objetivo la ubiquitilación y la degradación proteasomal
mediante un complejo de ubiquitinaligasa de proteína SKP1-
CUL1-F-box (SCF) que contiene la proteína F-box FBXO11. Se
encontró que el gen que codifica FBXO11 se eliminó o se
mutó en líneas celulares de linfoma múltiple B difuso
múltiple (DLBCL), y esta inactivación de FBXO11 se
correlacionó con niveles aumentados y estabilidad de BCL6.
Del mismo modo, FBXO11 se eliminó o mutó en DLBCL
primarios. Notablemente, los mutantes de FBXO11 derivados
de tumor mostraron una capacidad alterada para inducir la
degradación de BCL6. La reconstitución de la expresión de
FBXO11 en células DLBCL delecionadas con FBXO11 promovió
la ubiquitilación y degradación de BCL6, inhibió la
proliferación celular y la muerte celular inducida. Las células
DLBCL delecionadas con FBXO11 generaron tumores en
 recurrente (COME / ROM), un trastorno de pérdida de ratones inmunodeficientes, y la tumorigenicidad se suprimió
audición, y la eliminación del gen homólogo de ratón da mediante la reconstitución de FBXO11. Duan et al. (2012)
como resultado el mutante de ratón sordo Jeff (Jf), un revelaron un mecanismo molecular que controla la
modelo de gen único de la otitis media También se han estabilidad de BCL6 y propusieron que las mutaciones y
identificado variantes de transcritos empalmados que deleciones en FBXO11 contribuyen a la linfomagénesis
codifican distintas isoformas para este gen mediante la estabilización de BCL6. Los autores declararon
que las deleciones / mutaciones encontradas en los DLBCL
son en gran medida monoalélicas, lo que indica que FBXO11
es un gen supresor de tumores haploinsuficientes
GEN1 612449 Este gen codifica un miembro de la familia de nucleasas Rad2
 Hollidayjunction 5' / xerodermapigmentosum grupo G, cuyos miembros se
flapendonuclease caracterizan por dominios N-terminal e interior de
xerodermapigmentoso grupo G nucleasaseguidos por
dominios hélice-horquilla-hélice y dominios C-terminales
desordenados. La proteína codificada por este gen participa
en la resolución de las uniones de Holliday, que son
estructuras intermedias de cuatro vías que unen
covalentemente el ADN durante la recombinación homóloga
y la reparación de rotura de doble cadena. La proteína
resuelve las uniones de Holliday creando incisiones dobles a
lo largo de la unión para producir productos dúplex mellados
que se pueden ligar. Además, se ha encontrado que esta
proteína se localiza en centrosomas donde se ha visto
implicada en la regulación de la integridad del centrosoma.
Resultados alternativos de empalme en múltiples variantes
de transcripción
138292 Este gen codifica la primera y la enzima limitante de la Síndromes miasténicos congénitos con defectos de la
GFPT1 glutamine--fructose-6- velocidad de la ruta de hexosamina y controla el flujo de glicosilación
phosphate transaminase 1 glucosa en la ruta de la hexosamina. El producto de este gen
cataliza la formación de glucosamina 6-fosfato.
 606402 Se encuentra que la proteína codificada por este gen está
GKN1 gastrokine regulada negativamente en tejido de cáncer gástrico humano
en comparación con la mucosa gástrica normal

GPATCH11 G-patchdomaincontaining
11

GTF2A1L G-patchdomaincontaining
11

600890 Este gen codifica la subunidad alfa de la proteína trifuncional
HADHA hydroxyacyl-CoA mitocondrial, que cataliza los últimos tres pasos de la beta-
dehydrogenase oxidación mitocondrial de los ácidos grasos de cadena larga.
trifunctionalmultienzyme El heterocomplejo mitocondrial unido a la membrana está
complex subunit alpha compuesto por cuatro subunidades alfa y cuatro beta, y la
subunidad alfa cataliza las actividades de la 3-hidroxiacil-CoA
deshidrogenasa y la enoil-CoAhidratasa. Las mutaciones en
este gen dan como resultado una deficiencia de proteína
trifuncional o deficiencia de LCHAD. Los genes de las
subunidades alfa y beta de la proteína trifuncional
mitocondrial se encuentran adyacentes entre sí en el genoma
humano en una orientación cara a cara
Deficiencia de proteinatrifuncional mitocondrial.
La deficiencia de proteína trifuncional mitocondrial
(deficiencia de TFP, o TFPD) es una alteración de la oxidación
de los ácidos grasos caracterizada por un amplio espectro
clínico que va desde manifestaciones neonatales graves
como la miocardiopatía, la hipoglucemia, la acidosis
metabólica, la miopatía esquelética y la neuropatía, la
hepatopatía y la muerte, hasta un fenotipo leve con
polineuropatía periférica, rabdomiólisis y retinopatía
pigmentaria.
Deficiencia de 3-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa de cadena
larga:
La deficiencia de 3-hidroxiacil CoA-deshidrogenasa de cadena
larga (LCHADD) es un trastorno mitocondrial de la oxidación
de ácidos grasos de cadena larga que se caracteriza, en la
 mayoría de casos, por la aparición en la primera infancia o en
la niñez de hipoglucemia hipocetósica, acidosis metabólica,
hepatopatía, hipotonía y, con frecuencia, afectación cardiaca
con arritmias, miocardiopatía o ambas cosas.

Hígado graso agudo del embarazo:

El hígado graso agudo del embarazo es una complicación
grave aunque poco frecuente que se produce en el tercer
trimestre del embarazo o en el inicio del periodo postparto.
Constituye un riesgo para la mortalidad perinatal y materna,
y se caracteriza por ictericia e incremento de las lesiones
hepáticas, e implica una insuficiencia hepática aguda y
encefalopatía.
143450 Deficiencia de proteinatrifuncional mitocondrial
HADHB hydroxyacyl-CoA
dehydrogenase
trifunctionalmultienzyme
complex subunit beta

LEPQTL1 Leptin, serum levels of

611786
MEMO1 Mediator of cell motility 1
Este gen codifica una proteína que se fosforila durante la
MPHOSPH M-phase phosphoprotein mitosis. La proteína se localiza en el nucléolo durante la
10 10 interfase y los cromosomas durante la fase M. La proteína se
asocia con los complejos de ribonucleoproteínanucleolar U3
pequeña 60-80S y puede estar involucrada en el
procesamiento previo al ARNr.
 609309 This locus is frequently mutated in hereditary nonpolyposis COLORECTAL CANCER, HEREDITARY NONPOLYPOSIS, TYPE 1.
MSH2 mutS homolog 2, colon colon cancer (HNPCC). When cloned, it was discovered to be MUIR-TORRE SYNDROME
cancer, nonpolyposis type 1 a human homolog of the E. coli mismatch repair gene mutS,
consistent with the characteristic alterations in microsatellite
sequences (RER+ phenotype) found in HNPCC
600678 Este gen codifica un miembro de la familia MutS de Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type5
MSH6 mutShomolog 6 reparación de desajuste de ADN. En E. coli, la proteína MutS Endometrial cancer, familial
ayuda a reconocer los nucleótidos mal emparejados antes de Mismatch repair cancer syndrome
su reparación. Una región altamente conservada de
aproximadamente 150 aa, llamada motivo de unión a
nucleótido de adenina Walker-A, existe en homólogos de
MutS. La proteína codificada se heterodimeriza con MSH2
para formar un complejo de reconocimiento de desajuste
que funciona como un interruptor molecular bidireccional
que intercambia ADP y ATP, ya que los desapareamientos de
ADN se unen y disocian. Las mutaciones en este gen pueden
estar asociadas con cáncer de colon no poliposo hereditario,
cáncer colorrectal y cáncer de endometrio. Se
handescritovariantes de transcritosquecodificandiferentes
isoformas
604887 Este gen codifica una enzima mitocondrial bifuncional
MTHFD2 methylenetetrahydrofolate codificada nuclearmente con actividades de
dehydrogenase (NADP+ metilentetrahidrofolato deshidrogenasa y
dependent) 2, metiltetrahidrofolatociclohidrolasa. La enzima funciona como
methenyltetrahydrofolatecy homodímero y es única en su requerimiento absoluto de
clohydrolase magnesio y fosfato inorgánico. La formación del complejo
enzima-magnesio permite la unión de NAD. El corte y
empalme alternativo da como resultado dos transcripciones
diferentes, una de codificación de proteína y otra de
codificación de proteína. Este gen tiene un pseudogen en el
 cromosoma 7
603766 Durante el inicio de la biosíntesis de proteínas, el factor 2 de
MTIF2 mitochondrial translational iniciación (IF-2) promueve la unión del ARNt iniciador a la
initiation factor 2 subunidad pequeña del ribosoma de una manera
dependiente de GTP. El IF-2 procariótico es un único
polipéptido, mientras que el IF-2 citoplásmicoeucariótico
(eIF-2) es una proteína trimérica. Las mitocondrias de hígado
bovino contienen IF-2 (mt), una proteína monomérica de 85
kD que es equivalente a IF-2 procariota. La proteína humana
predicha de 727 aminoácidos contiene una presecuencia de
29 aminoácidos. El IF-2 humano (mt) comparte una identidad
de secuencia de aminoácidos del 32 al 38% con IF-2 de
levadura (mt) y varias IF-2 procariotas, con el mayor grado de
conservación en los dominios G de las proteínas
606010
NRBP1 nuclear receptor
bindingprotein 1

165640 Este gen codifica la enzima limitante de la velocidad de la

ODC1 ornithinedecarboxylase 1 ruta de biosíntesis de poliamina que cataliza ornitina para
putrescina. El nivel de actividad de la enzima varía en
respuesta a estímulos promotores del crecimiento y muestra
una alta tasa de recambio en comparación con otras
proteínas de mamíferos. Originalmente localizado en los
cromosomas 2 y 7, se ha determinado que el gen que codifica
esta enzima está ubicado en 2p25, con un pseudogen
ubicado en 7q31-qter. Múltiples variantes de transcripción
empalmadas alternativamente que codifican distintas
 isoformas han sido identificadas
603681 Las mutaciones en este gen son una causa de sordera Neuropatía auditiva, autosómicarecesiva,1
OTOF otoferlin recesiva neurosensorial no sindrómica, DFNB9. La forma Sordera, autosómica recesiva 9
corta de la proteína codificada tiene 3 dominios C2, un único
dominio transmembranacarboxi-terminal encontrado
también en el factor de espermatogénesis C. elegans FER-1 y
la disferlina humana, mientras que la forma larga tiene 6
dominios C2. La homología sugiere que esta proteína puede
estar involucrada en la fusión de la membrana vesicular. Se
han encontrado varias variantes de transcripción que
codifican isoformas múltiples para este gen.
602404 Poco después de que se mapeó una forma de enfermedad de
PARK3 Parkinson disease 3 Parkinson autosómica dominante en 4q21-q22 y se demostró
(autosomal dominant, Lewy que se debía a mutaciones en el gen de la alfa-sinucleína
body (SNCA; 163890), la heterogeneidad genética se hizo evidente,
ya que en otras familias el trastorno no estaba relacionado
con 4q y no se asoció con mutaciones de SNCA. Gasser et al.
(1998) describieron un locus genético en 2p13 en el
parkinsonismo familiar con características clínicas muy
similares a las de la enfermedad de Parkinson esporádica,
incluida una edad media de inicio similar: 59 años en estas
familias, 59.7 años en la EP esporádica (Di Rocco et al., 1996).
) El puntaje lod multipunto máximo para las 6 familias en su
estudio fue de 3.96, considerando solo a los miembros
afectados. La ubicación más probable del locus para esta
forma de parkinsonismo familiar se consideró que estaba en
D2S441, con un intervalo de compatibilidad de relación de
verosimilitud de 100 a 1 que oscilaba entre D2S134 y D2S286,
que abarcaba 10,3 cM en 2p13. La puntuación máxima de lod
de 2 puntos fue de 3.20 con el marcador D2S441 en theta =
 0.03. Dos de las 6 familias fueron rastreadas
genealógicamente al sur de Dinamarca y el norte de
Alemania y se encontró que comparten un haplotipo común,
lo que sugiere un efecto fundador. West et al. (2001)
determinaron que las 2 familias informadas por Gasser et al.
(1998) con el haplotipo común compartieron 8 marcadores
correspondientes a una distancia genética de 3,2 cM. La
construcción de un mapa físico basado en BAC que cubre el
genotipo de locus PARK3 17 marcadores de microsatélites
permitió el refinamiento del haplotipo mínimo común para
PARK3 a una región que abarca una distancia física de
aproximadamente 2,5 Mb. Los 14 genes conocidos dentro de
la región crítica se secuenciaron de al menos 2 personas
afectadas de cada familia y no se detectaron mutaciones
potencialmente patogénicas, lo que implica que ninguno de
estos genes es probable candidatos para PARK3
610995 La prenylcysteine se libera durante la degradación de
PCYOX1 prenylcysteine oxidase 1 proteínas preniladas. PCYOX1 cataliza la degradación de la
prenilcisteína para producir cisteínas libres y un producto
isoprenoidehidrofóbico
 614797
PELI1 pellino E3 ubiquitinprotein
ligase 1
PLGLB2 plasminogen-like B2
616404 La proteína codificada por este gen es la subunidad más
POLR1A RNA polymerase I subunit A grande del complejo ARN polimerasa I. La proteína codificada
representa la subunidad catalítica del complejo, que
transcribe ADN en precursores de ARN ribosómico. Los
defectos en este gen son una causa del tipo de
disostosisacrofacial de Cincinnati
La proteína codificada por este gen pertenece a la subfamilia
PREPL prolylendopeptidaselike proliloligopeptidasa de serinapeptidasas. Las mutaciones en
este gen se han asociado con el síndrome de hipotonía y
cistinuria, también conocido como síndrome de deleción
2p21. Varias variantes de transcripción empalmadas
alternativamente que codifican isoformas iguales o
diferentes se han descrito para este gen
605158 Este gen codifica una peroxidasa que contiene hemo que se
PXDN peroxidasin secreta en la matriz extracelular. Está involucrado en la
formación de matriz extracelular, y puede funcionar en la
respuesta fibrogénica fisiológica y patológica en el riñón
fibrótico. Las mutaciones en este gen causan opacificación
Síndrome de atresiacoanal - pérdida auditiva - defectos
cardíacos - dismorfiacraneofacial
En una niña con síndrome miasténico congénito-22 (CMS22;
616224), Regal et al. (2014) identificaron mutaciones
heterocigotas compuestas en el gen PREPL: una deleción de
1-bp (c.807delT, NM_006036.4) en el exón 6, lo que resulta
en una sustitución met270-to-ter (M270X) heredada de su
padre no afectado, y una Deleción de 33.6 kb en el
cromosoma 2p21 que abarca los exones 5 a 10 del gen
SLC3A1 (104614) y los exones 9 a 14 del gen PREPL heredado
de su madre no afectada. Por lo tanto, la deficiencia PREPL
determinó el fenotipo en el paciente
En los miembros afectados de una familia paquistaní
consanguínea que segrega la opacificación corneal
autosómica recesiva, la catarata congénita y la microcórnea
(ASGD7; 269400), informada originalmente por Khan et al.
(2011) (familia MEP60), Khan et al. (2011) identificaron la
 corneal y otras anomalías oculares, y también microftalmia y homocigosidad para una deleción de 1-bp (c.2568delC) en el
disgenesia del segmento anterior exón 17 del gen PXDN, causando un cambio de marco
predictivo que da como resultado la terminación prematura
de la proteína (Cys857AlafsTer5) dentro del dominio de
peroxidasa de hemo. La mutación, que segregó con la
enfermedad en la familia, no se encontró en 170 controles
étnicamente emparejados.
607065 Este gen codifica la glutaminilciclasa pituitaria humana, que
QPCT Glutaminyl- es responsable de la presencia de residuos de piroglutamil en
peptidecyclotransferase muchos péptidos neuroendocrinos. La secuencia de
aminoácidos de esta enzima es 86% idéntica a la de
glutaminilciclasa bovina
Los retinoides, como la vitamina A, desempeñan papeles
RETSAT All-trans-retinol 13,14- esenciales en el desarrollo, la inmunidad, la diferenciación
reductase celular y la visión. Retinolsaturasa o RETSAT, es una enzima
que se prevé que funcionará en el metabolismo de los
retinoides
617314 SH3YL1 es una proteína evolutivamente conservada
SH3YL1 SH3 and SYLF domain implicada en el desarrollo del folículo piloso, la meiosis, la
containing 1 migración celular y la formación de la colmena dorsal.
También es un coregulador del receptor de andrógenos (AR;
313700) requerido para la inducción de un subconjunto de
genes regulados por AR
Este gen codifica una proteína de membrana integral de tipo I
TGOLN2 Trans-Golgi network integral que se localiza en la red trans-Golgi, una estación de
membrane protein 2 clasificación principal para proteínas secretoras y de
membrana. La proteína codificada cicla entre los endosomas
tempranos y la red trans-Golgi, y puede jugar un papel en la
formación de vesículas exocíticas. Alternativamente se
 hanobservadovariantes de transcritoquecodificanmúltiples
isoformas paraeste gen.
611800 Este gen es el objetivo de aberraciones choromosomales
THADA THYROID ADENOMA- 2p21 en adenomas tiroideos benignos. Los polimorfismos de
ASSOCIATED GENE un solo nucleótido (SNP) en este gen pueden estar asociados
con la diabetes tipo 2 y el síndrome de ovario poliquístico. La
proteína codificada probablemente esté implicada en la vía
del receptor de la muerte y la apoptosis.
603518 El producto codificado por este gen es un miembro de una Welander distal myopathy
TIA1 IA1 cytotoxic granule familia de proteínas de unión a ARN y posee actividad
associated RNA nucleolítica contra células diana de linfocitos citotóxicos
bindingprotein (CTL). Se ha sugerido que esta proteína puede estar implicada
en la inducción de la apoptosis ya que reconoce
preferentemente homopolímeros de poli (A) e induce la
fragmentación del ADN en los objetivos de CTL. La principal
especie asociada a gránulos es una proteína de 15 kDa que se
cree derivada del extremo carboxilo del producto de 40 kDa
mediante procesamiento proteolítico. Se ha encontrado un
empalme alternativo que produce diferentes isoformas para
este gen
606765 su gen codifica una glicoproteína unida a la membrana. La Acrofacial dysostosis, Cincinnati type, Autosomico
TPO thyroidperoxidase proteína codificada actúa como una enzima y juega un papel dominante.
central en la función de la glándula tiroides. La proteína
funciona en la yodación de residuos de tirosina en la
formación de tiroglobulina y fenoxiéster entre pares de
tirosinas yodadas para generar las hormonas tiroideas, la
tiroxina y la triyodotironina. Las mutaciones en este gen
están asociadas con varios trastornos de la hormonogénesis
tiroidea, que incluyen hipotiroidismo congénito, bocio
 congénito y defecto de la organización de la hormona
tiroidea IIA. Se han identificado múltiples variantes de
transcripción que codifican distintas isoformas para este gen,
pero no se ha determinado la naturaleza completa de
algunas variantes.

609332 Este gen codifica una proteína que contiene repeticiones Defectos gastrointestinales y síndrome de inmunodeficiencia
TTC7A TETRATRICOPEPTIDE tetratricopeptídicas. Las mutaciones en este gen interrumpen
REPEAT DOMAIN- el desarrollo intestinal y pueden causar enfermedad
CONTAINING PROTEIN 7A inflamatoria intestinal de inicio temprano y atresia intestinal.
Resultados alternativos de empalme en múltiples variantes
de transcripción
606961 Se sabe que el dominio globular WW, llamado así por los
WBP1  WW domain binding restos de triptófano conservados en el motivo de la proteína
protein 1 presente en diversas proteínas estructurales y reguladoras,
desempeña un papel en la mediación de las interacciones
proteína-proteína. Este gen codifica un ligando del dominio
WW de la proteína asociada a Yes cinasa. La transcripción de
lectura del gen corriente arriba vecino, que codifica la
subunidad B del complejo INO80, en este gen genera un
transcrito no codificante.
Los genes relacionados espacialmente con el gen duplicado en el caso de DAVID SANTIAGO BOLAÑOS COLLAZOS, el gen EML6, son los siguientes:

SPTBN1, RTN4, CLHC1,RPS27A.

Gen MIM Proteína codificada Función Consecuencias de

alteración/síndrome

EML6 Echinoderm microtubule Ver tabla más adelante.

associated protein like 6

RTN4 604475 Reticulon 4. Este gen pertenece a la familia de genes que codifican el retículo. Los reticulones están
Otras denominaciones asociados con el retículo endoplásmico y están involucrados en la secreción neuroendocrina o
Neurite outgrowth inhibitor en el tráfico de membrana en células neuroendocrinas. El producto de este gen es un potente
 (NOGO) inhibidor de la extensión de las neuritas que también puede ayudar a bloquear la
regeneración del sistema nervioso central en los vertebrados superiores. La regeneración de
axones en mamíferos adultos generalmente tiene éxito en el sistema nervioso periférico pero
es pobre en el sistema nervioso central. La inhibición es el resultado de las barreras físicas
impuestas por las cicatrices gliales, la falta de factores neurotróficos y las moléculas
inhibidoras del crecimiento asociadas con la mielina, la vaina aislante del axón. Estas
moléculas incluyen NI35, glicoproteína asociada a mielina (159460) y Nogo
SPTBN1 182790 SPECTRIN, BETA, Spectrin es una proteína reticulante de actina y andamio molecular que une la membrana
NONERYTHROCYTIC, 1 plasmática con el citoesqueleto de actina, y funciona en la determinación de la forma de las
células, la disposición de las proteínas transmembrana y la organización de los orgánulos. Está
compuesto por dos dímeros antiparalelos de subunidades alfa y beta. Este gen es un miembro
de una familia de genes de espectrina beta. La proteína codificada contiene un dominio de
unión a actina N-terminal y 17 repeticiones de espectrina que están implicadas en la
formación de dímeros. Se han encontrado múltiples variantes de transcripción que codifican
diferentes isoformas para este gen.
CLHC1 Clathrin heavy chain linker
domain containing 1
RPS27A 191343 Ribosomal protein S27a La ubiquitina, una proteína altamente conservada que tiene un papel principal en el
objetivo de proteínas celulares para la degradación por el proteosoma 26S, se
sintetiza como una proteína precursora que consiste en cadenas de polyubiquitina o
una única ubiquitina fusionada a una proteína no relacionada. Este gen codifica una
proteína de fusión que consiste en ubiquitina en el extremo N y en la proteína
ribosomal S27a en el extremo C. Cuando se expresa en levadura, la proteína se
procesa post-traduccionalmente, generando monómero de ubiquitina libre y proteína
ribosomal S27a. La proteína ribosomal S27a es un componente de la subunidad 40S
del ribosoma y pertenece a la familia S27AE de proteínas ribosómicas. Contiene
dominios de dedos de zinc de tipo C4 y se encuentra en el citoplasma. Los
pseudogenes derivados de este gen están presentes en el genoma. Al igual que con la
proteína ribosomal S27a, la proteína ribosomal L40 también se sintetiza como una
proteína de fusión con ubiquitina; de forma similar, la proteína S30 ribosómica se
sintetiza como una proteína de fusión con la proteína de tipo ubiquitina fubi.
Múltiples variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican las
mismas proteínas han sido identificadas
DECIPHER VARIANTE SEXO TAMAÑO FENOTIPO
ID
248649 2:54895322- 46XY 25.17 Mb Anormalidad del philtrum, Autismo, Disminución del
80068886 movimiento fetal, Retraso en el desarrollo del habla y del
Duplication lenguaje, Dificultades de alimentación en la infancia,
Discapacidad intelectual, Contractura de flexión de la
rodilla, Retusión del tercio medio, Baja estatura,
Estrabismo, Talipes equinovarus, Fisura palpebral superior

249336 2:49196958- 46XY 15.52 Mb Retraso en el desarrollo del habla y del lenguaje,
64716776 Dificultades de alimentación en la infancia, Discapacidad
intelectual, Micrognatia, Estrabismo
Amplification

251448 2:52897903- 46XX 2.06 Mb Discapacidad intelectual, microcefalia, hipotonía muscular

54954446

Deletion
251609 2:45265158- 46XY 10.34 Mb Hemangiomas capilares,
55608379 Boca estrecha, Nariz corta, Estatura baja, Dedos delgados.

Triplication
266595 2:24012182- 46XX 37.27 Mb Paladar hendido, fisuras palpebrales descendentes,
61283243 microcefalia, retraso moderado del desarrollo global, cresta
nasal estrecha, oligohidramnios, deterioro auditivo
neurosensorial, estatura baja, cifosis torácica

Duplication
270579 2:55022871- 46XY 196.22 kb Coartación de la aorta, ojo profundo, retraso en el
55219086 desarrollo del habla y el lenguaje, discapacidad intelectual,
microcefalia

Deletion
 
283267 2:53321604- 46XX 1.75 Mb Incierto
55068178
  Duplication      
284164 2:54202447- 46XX 8.88 Mb Posiblemente patógeno
63086967
Duplication
290281 2:54630810- unknown 724.22 kb incierto
55355031 VARIANTES GEN EML 6
Duplication

DECIPHER (DatabasE of genomiC varIation and Phenotype in Humans using Ensembl

Resources) es una base de datos interactiva basada en la web que incorpora un conjunto
de herramientas diseñadas para ayudar a la interpretación de variantes genómicas.