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Acceso público del HHS

Manuscrito del autor
Nat Rev Microbiol. Manuscrito del autor; disponible en PMC 06 de mayo de 2015.
autor manuscrito

Publicado en forma editada final como:

Nat Rev Microbiol. 2014 enero; 12(1): 63–69. doi:10.1038/nrmicro3136.

Muerte celular programada bacteriana: dar sentido a una paradoja

Kenneth W. Bayles, Ph.D.

Centro de Investigación de Estafilococos Departamento de Patología y Microbiología Centro Médico de la
Universidad de Nebraska Omaha, NE 68198

Resumen
Aunque el concepto de muerte celular programada (PCD) en bacterias se ha recibido con escepticismo, un
autor manuscrito

creciente cuerpo de evidencia sugiere que ya no se puede ignorar. Varios estudios recientes indican que las
manifestaciones fenotípicas de la apoptosis, procesos asociados con el desensamblaje celular ordenado, se
conservan en las bacterias. En este artículo de opinión, propongo un modelo para el control coordinado de
posibles efectores de PCD bacterianos y sostengo que los procesos involucrados son funcionalmente análogos a
los sistemas de PCD eucariotas.

Introducción
Quizás el mayor impedimento para reconocer la existencia de la muerte celular programada bacteriana (PCD) es

la creencia de larga data de que las bacterias viven únicamente como organismos unicelulares y, como tal, el

suicidio celular parece contrario a nuestra comprensión de los procesos evolutivos y las fuerzas impulsoras de la

selección natural. . Después de todo, ¿qué posible beneficio podría haber en el mantenimiento de genes cuyas
autor manuscrito

funciones son mediar en la autodestrucción de un individuo de vida libre? Por supuesto, no hay una ventaja

directa para ese individuo. Sin embargo, como se argumentó anteriormente1la especie en su conjunto podría
beneficiarse si la muerte de un individuo resulta en una ventaja para sus hermanos. En muchos sentidos, las

comunidades de biopelículas multicelulares proporcionan un contexto ideal para comprender la PCD bacteriana.

Por ejemplo, los estudios de desarrollo de biopelículas han demostrado la importancia de la muerte celular y la

lisis para la liberación de ADN genómico (denominado eDNA), que se incorpora a la matriz de la biopelícula y

sirve como molécula de adherencia.2-11. Además, como un conjunto interdependiente de células con estructuras

diferenciadas que cumplen funciones especializadas, las biopelículas bacterianas son similares a los organismos

eucariotas multicelulares complejos, en los que la PCD tiene un papel destacado en el desarrollo.12.

Como punto de partida, es importante definir qué se entiende por “PCD”. En primer lugar, la frase
autor manuscrito

"muerte celular programada" se reserva para todos los procesos codificados genéticamente que
conducen al suicidio celular. Aunque el proceso de apoptosis se asocia más comúnmente con PCD
eucariota, también existen otros mecanismos de PCD, incluida la muerte autofágica y la necrosis
programada.13,14(Cuadro 1). Todos estos mecanismos requieren energía metabólica y normalmente se
inducen en respuesta a señales fisiológicas o de desarrollo. Sin embargo, la apoptosis es el mecanismo
mejor caracterizado y se describió por primera vez en 1972.15. En este artículo original, se describieron
las manifestaciones morfológicas asociadas con la apoptosis, incluida la condensación de cromatina, la
fragmentación del ADN cromosómico, la formación de ampollas en la membrana, la contracción celular y
el desmontaje de la célula en vesículas rodeadas de membrana.
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Más tarde se descubrió que estos procesos eran una consecuencia de la activación de cisteína proteasas,
autor manuscrito

conocidas como caspasas, que orquestan la apoptosis al inducir una variedad de actividades celulares que

resultan en el desmantelamiento de la célula.dieciséis. Ahora se sabe que la apoptosis procede a través de una de

las dos principales vías de señalización: la vía intrínseca, que implica la permeabilización de la membrana externa

mitocondrial (MOMP) y se induce principalmente como resultado de una lesión celular (por ejemplo, daño en el

ADN o estrés oxidativo)17; y la vía extrínseca o "mediada por el receptor de muerte", que generalmente es

inducida por señales de desarrollo iniciadas por interacciones receptor-ligando en la superficie celular y es

independiente de MOMP18. De hecho, la muerte celular inducida por la vía extrínseca es en gran medida

independiente de las mitocondrias y se desencadena mediante la activación directa de las caspasas, lo que

conduce a la destrucción celular. Por el contrario, se cree ampliamente que la vía intrínseca es iniciada por

mitocondrias disfuncionales, como resultado del estrés celular (por ejemplo, daño en el ADN o estrés oxidativo),

que luego conduce a la activación de la caspasa. Por lo tanto, ambas vías implican la activación de caspasas; las

diferencias radican principalmente en cómo se induce la actividad de la caspasa.

autor manuscrito

En este artículo de Opinión, iré más allá de una discusión de por qué existe la PCD bacteriana, para centrarme

específicamente en el creciente número de estudios que describen actividades similares a la PCD en bacterias, y

propondré una vía modelo para aclarar cómo se pueden coordinar los procesos involucrados. Argumento que la

vía intrínseca a la apoptosis en los organismos eucariotas, incluidas algunas de sus estrategias de control

molecular, se conserva en las bacterias, donde proporciona funciones esenciales en respuesta al estrés. Además,

especulo que otros procesos bacterianos comúnmente asociados con la muerte, a saber, los sistemas de toxina-
antitoxina (TA) y la actividad de peptidoglicano hidrolasa, funcionan en roles análogos comparables a la muerte

autofágica y la necrosis programada, respectivamente.

Un preludio a la muerte
autor manuscrito

Desde hace varios años, la potencial implicación de los sistemas de AT en la DCP ha generado un gran interés.

Estos sistemas comprenden una toxina estable y una antitoxina lábil que contrarresta la actividad de la toxina.19.

Originalmente se describieron como "módulos de adicción" de plásmidos, en virtud del hecho de que los

componentes de toxina codificados por plásmidos de estos sistemas son más estables (resistentes a la proteasa)

en relación con sus contrapartes de antitoxinas, lo que hace que una célula bacteriana se vuelva "adicta". al

plásmido y su capacidad para renovar el suministro de antitoxina. Sin embargo, parecía probable un papel más

amplio para estos sistemas tras la observación de que la mayoría de los genomas bacterianos codifican múltiples

tipos de sistemas TA. El mejor caracterizado de los sistemas TA cromosómicos es MazEF deEscherichia coli,en el

que MazF es la toxina y MazE es la antitoxina20, que se inducen en respuesta a una variedad de compuestos

inductores de estrés20. Como una endoribonucleasa específica de sitio, MazF escinde las secuencias de ACA en

las moléculas de ARNm, lo que inhibe su traducción en productos proteicos.21. Aunque esta inhibición de la

traducción provoca la detención del crecimiento, queda por determinar el mecanismo preciso por el cual este
autor manuscrito

sistema conduce a la muerte. Se ha propuesto que la acción de MazF resulta en la eliminación selectiva de

transcritos que codifican inhibidores de muerte celular, mientras que los transcritos que codifican efectores de

muerte permanecen intactos.22. Este modelo sugiere que MazEF (y probablemente otros sistemas TA) podrían

promover una etapa bacteriostática y reversible en el camino hacia la muerte (Fig. 1). De acuerdo con esto, hay

estudios que indican que la muerte celular inducida por la activación de los sistemas TA puede revertirse

mediante la expresión de la antitoxina.23. Así, el crecimiento

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la inhibición causada por la acción de los sistemas TA puede funcionar para reducir la actividad metabólica, o
autor manuscrito

incluso alimentar la respuesta al estrés, en un intento de "capear la tormenta" hasta que se disponga de un

nuevo suministro de nutrientes, o se elimine la sustancia agresora y se elimine el daño. a la celda se repara.

verdugos de la muerte

El proceso eucariótico—La vía intrínseca de la apoptosis se inicia por una variedad de señales,
incluidas las asociadas con condiciones estresantes, como daño en el ADN, estrés oxidativo,
privación de nutrientes e infección. En el centro de este proceso se encuentra la familia de
proteínas del linfoma de células B 2 (Bcl-2), que se dividen en tres grupos según los dominios de
homología Bcl-2 (BH) que poseen. Dos grupos son proapoptóticos: los efectores Bax, Bak y Bok,
que contienen dominios BH1, BH2 y BH3; y las “proteínas solo BH3”, Bid, Bim, Bad, Bik, Bmf,
Bnip3, Hrk, Noxa y Puma. El tercer grupo está compuesto por proteínas antiapoptóticas (Bcl-2,
autor manuscrito

Bcl-XL, Bcl-W, A1 y Mcl-1) que contienen dominios BH1, BH2, BH3 y BH424. Aunque los detalles
moleculares no se comprenden por completo, las actividades de estas proteínas están asociadas
con la oligomerización de las proteínas efectoras Bcl-2 en la membrana externa mitocondrial, lo
que lleva a MOMP y la liberación de citocromo C, dos características de la apoptosis.25. Una vez
liberado, el citocromo C inicia la cascada de caspasas y los cambios morfológicos aguas abajo
asociados con el desensamblaje celular. Como era de esperar, todo el proceso está sujeto a un
control regulatorio complejo, principalmente a través de las proteínas exclusivas de BH3, que
funcionan bloqueando el efecto inhibidor de las proteínas antiapoptóticas Bcl-2 o estimulando
directamente las funciones de las pro. -Proteínas efectoras apoptóticas Bcl-224.

El proceso bacteriano—Se ha planteado la hipótesis de que las proteínas CidA y LrgA, que se
identificaron originalmente enestafilococo aureuspero están ampliamente conservados en las bacterias,
autor manuscrito

son moléculas similares a la holina que poseen funciones análogas al efector proapoptótico y miembros
antiapoptóticos de la familia de proteínas Bcl-21,26. Aunque las holinas se caracterizaron originalmente
como proteínas codificadas por bacteriófagos que coordinan la muerte y la lisis de las bacterias
infectadas, su papel hipotético en la PCD bacteriana está bien establecido, así como las similitudes con las
proteínas PCD eucariotas.1,26-28. loscidABCylrgABSe ha demostrado que los operones modulan la muerte
y la lisis a través de un proceso mal definido que involucra la regulación postraduccional de la actividad
de la peptidoglucano hidrolasa.29,30. loscidAcodifica una supuesta holina, con un efecto positivo sobre la
muerte y la lisis, mientras quelrgAcodifica una antiholina, con efecto inhibitorio sobre estos procesos (fig.
1). Además, los estudios indican que estas proteínas se oligomerizan dentro de la membrana bacteriana.
31, sugiriendo que cumplen un papel análogo al de las proteínas Bcl-2 como efectoras de muerte celular.
autor manuscrito

Paralelos entre procesos eucarióticos y bacterianos.Al insertarse en la membrana, tanto las holinas como las

proteínas de la familia Bcl-2 provocan la ruptura de la membrana, lo que conduce a la despolarización de la

membrana citoplásmica bacteriana y MOMP (que finalmente provoca la despolarización de la membrana

interna), respectivamente, y ambas están reguladas por proteínas homólogas que se oponen a sus funciones.

funciones Además, ambas familias de proteínas conducen a la activación de actividades aguas abajo (caspasas en

eucariotas y peptidoglicano hidrolasas en procariotas) que provocan el desensamblaje celular.

Sorprendentemente, la evidencia experimental que apoya

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se obtuvo una relación entre estas proteínas al demostrar que los miembros de la familia Bcl-2 son
autor manuscrito

funcionales en unE. colisistema diseñado para detectar actividad similar a la holina (en el que la lisis
celular depende de la presencia de una holina funcional)32. En este estudio, se encontró que dos
efectores proapoptóticos de la apoptosis en eucariotas, Bax y Bak, se oligomerizan en elE. colimembrana
citoplasmática e inducen la muerte celular y la lisis32. En una sorprendente correlación funcional, este
estudio también demostró que los mutantes Bax defectuosos en la inducción de la apoptosis tampoco
pudieron inducir la muerte celular y la lisis enE. coli. Además, la coexpresión de Bax enE. colicon la
proteína antiapoptótica, Bcl-XL, resultó en la inhibición de la muerte y lisis mediada por Bax. Por el
contrario, la coexpresión de Bax con la proteína proapoptótica BH3-solo, tBid (un derivado
constitutivamente activo de Bid), estimuló la muerte y la lisis. Finalmente, el reemplazo de la holina nativa
en el genoma del bacteriófago lambda con el gen que codifica Bax resultó en partículas de bacteriófago
infecciosas completamente funcionales.32. Juntos, estos datos proporcionan evidencia convincente de
que los miembros clave de la familia Bcl-2 funcionan utilizando un mecanismo similar al de la holina, e
autor manuscrito

incluso pueden señalar un origen bacteriano para estas importantes proteínas reguladoras de la
apoptosis.

A pesar de la escasez de información relacionada con el mecanismo de acción de la familia de proteínas

CidA/LrgA y Bcl-2, la evidencia experimental que se ha acumulado respalda su función como holinas y
sugiere un mecanismo común subyacente al control de la PCD en bacterias y eucariotas. Se ha propuesto
que la familia de proteínas Cid/Lrg se transfirió a la célula eucariota durante la relación endosimbiótica
entre una bacteria y una célula huésped, lo que condujo a lo que ahora conocemos como mitocondrias.
33,34. Se prevé que tanto los procesos moleculares como los fisiológicos que controlan la autólisis
bacteriana sigan siendo aspectos clave del control de la apoptosis en células de mamíferos, incluida la
interrupción física (o lisis) de la membrana externa mitocondrial, que conduce a la inducción de la
cascada de caspasas.26. Curiosamente, estudios recientes han revelado la presencia de unArabidopsis
thaliana lrgAB-gen similar implicado en el control de PCD en plantas35,36, lo que sugiere que la actividad
autor manuscrito

de la holina también puede ser la base de la PCD en las plantas. Se demostró que el producto de este
gen, AtLrgB, se localiza en el cloroplasto y su ausencia provoca clorosis intervenal y hojas
prematuramente necróticas, lo que sugiere que tiene actividad antiapoptótica. Similar a las mitocondrias,
el origen bacteriano propuesto del cloroplasto (que es un orgánulo importante en la PCD de la planta),
sugiere un origen común, o posiblemente la evolución convergente de la maquinaria molecular que
controla la PCD.37. En general, a pesar de que no existe una conservación de secuencia entre las
proteínas Cid/Lrg (en plantas o bacterias) y la familia Bcl-2, la conservación de la actividad similar a la
holina sugiere la existencia de un mecanismo universal subyacente al control de la PCD.38.

Eventos post-mortem
autor manuscrito

Como se describió anteriormente, uno de los mecanismos de PCD mejor caracterizados en organismos
eucariotas es la apoptosis, que en la vía intrínseca se inicia mediante un proceso bien estudiado que
conduce a MOMP y la liberación de citocromo C.39,40. En la vía intrínseca de la apoptosis (a diferencia de
la vía extrínseca), el citocromo C liberado tiene un papel importante en la siguiente fase, que implica la
activación de las enzimas caspasas que inducen el desensamblaje celular.41. Esta fase de "degradación"
es esencialmente un proceso post-mortem39y la liberación de citocromo C parece no tener mayor papel
que simplemente señalar que el

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las mitocondrias se han visto comprometidas (se ha producido la muerte celular) y que deben iniciarse los eventos post-
autor manuscrito

mortem. Las caspasas se consideran los efectores que estimulan la degradación mediada por enzimas hidrolíticas,

desencadenan la fragmentación del ADN cromosómico, la condensación de la cromatina, la formación de ampollas en la

membrana, el encogimiento celular y el desmontaje de la célula en vesículas encerradas en la membrana.dieciséis. Varios

de estos procesos forman la base de una variedad de ensayos que son útiles para la identificación de células que

experimentan apoptosis (Cuadro 2).

Procesos similares a la apoptosis en bacterias—Aunque ha habido referencias esporádicas a PCD bacteriano

en las últimas dos décadas42-45, la evidencia de procesos similares a la apoptosis en bacterias ha aumentado en

los últimos años. El primer ejemplo descrito de procesos similares a la apoptosis bacteriana fue el asociado con

la "muerte celular rápida" (RCD) enXanthomonas campestris, que es inducida por el crecimiento en un medio

rico en proteínas46,47. Durante RCD,X campestrislas células exhiben las características de la apoptosis, incluida

la tinción positiva de Anexina V y TUNEL (Cuadro 2) y la producción de una proteína con actividad de caspasa. El

crecimiento en presencia de almidón inhibió la RCD y los procesos similares a la apoptosis que se asociaron con
autor manuscrito

la muerte celular. En estudios de seguimiento, se demostró que la inducción de RCD dependiente de medios

ricos en proteínas es una función de la presencia de aminoácidos generadores de piruvato, como la glicina y la

alanina, en el medio de cultivo.48. Los autores demostraron que esto provocó la activación del ciclo TCA, lo que

aumentó el potencial reductor de la célula y estimuló la actividad de la cadena de transporte de electrones (ETC).

49. De acuerdo con esto,X campestrislas células sometidas a RCD exhibieron una mayor producción de ROS,
probablemente como resultado de una mayor actividad de ETC. Además, la adición de eliminadores de ROS al

medio de crecimiento resultó en la inhibición de RCD, lo que sugiere que estas moléculas están involucradas en

la inducción de la muerte celular.49.

En 2004, un estudio informó que la cianobacteria marinaTricodesmiospp. se somete a PCD "autocatalítica" en

respuesta a la falta de fósforo y nitrógeno50. Las reducciones dramáticas de la población están bien
autor manuscrito

documentadas en especies planctónicas eucariotas.51, desafiando el dogma de que la PCD está restringida a

organismos multicelulares. ¿Qué hace que elTricodesmio spp. estudio especialmente interesante es que se

observó un proceso similar a la apoptosis. Similar a RCD enX campestris, la privación de nutrientes desencadenó

la muerte celular, que estuvo acompañada por la degradación del ADN, así como la producción de una proteína

similar a la caspasa (denominada metacaspasa) que reaccionó con antisueros policlonales de caspasa-3 humana

y fue inhibida por un inhibidor de caspasa. Este estudio también reveló que las células muertas exhibieron la

degradación de los orgánulos subcelulares (incluidos los tilacoides, los carboxisomas y las vesículas de gas) y la

contracción celular, nuevamente, características de la apoptosis.

Ensteotococos neumoniaSe observaron eventos similares a la apoptosis después del tratamiento con un

complejo de lípidos y proteínas de la leche humana conocido como HAMLET.52. Este complejo de alfalactalbúmina
autor manuscrito

y ácido oleico se estudió originalmente debido a su capacidad para inducir la apoptosis en células de leucemia

Jurkat.53,54. Sin embargo, la exposición deS. pneumoniaea HAMLET reveló que es bactericida, produciendo una

pérdida de viabilidad de más de seis órdenes de magnitud en una hora, que estuvo acompañada de lisis de las

células. Además, las células muertas mostraban varios rasgos fenotípicos de la apoptosis, como el encogimiento

de las células, la condensación del ADN, la fragmentación del ADN y la despolarización de la membrana

dependiente del calcio. Este último fue particularmente sorprendente ya que la cinética deS. pneumoniaeLa

despolarización de la membrana fue similar a la de las mitocondrias y ambas fueron inhibidas por el Ca2+

-inhibidor del transporte, rojo de rutenio, un

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compuesto conocido por inhibir la despolarización de la membrana mitocondrial en células eucariotas.

autor manuscrito

Finalmente, se encontró que HAMLET induce la muerte celular en otras especies de estreptococos y Haemophilus

influenzae, lo que sugiere una conservación del mecanismo tanto en bacterias grampositivas como
gramnegativas.

Uno de los informes más recientes de apoptosis bacteriana reveló queEscherichia colilas células tratadas
con agentes que dañan el ADN y antibióticos tienen varias características típicamente asociadas con la
apoptosis, incluida la fragmentación del ADN, la condensación cromosómica, la exposición extracelular de
fosfatidilserina (PS) y la despolarización de la membrana55. Además, los autores demostraron que la
supresión de laRecAEl gen resultó en una reducción en los procesos similares a la apoptosis que ocurren
en respuesta al tratamiento con antibióticos. De particular interés fue el hallazgo de que el tratamiento
con agentes que dañan el ADN y antibióticos dieron como resultado la producción de una proteína que
interactúa con el péptido sustrato de caspasa fluorescente, FITC-Z-VD-FMK. El análisis posterior identificó
esta proteína como RecA y sugirió la participación del complejo de proteasa ClpXP en la regulación de
autor manuscrito

esta actividad.

También se demostró recientemente que el daño del ADN induce un proceso similar a la apoptosis en
Caulobacter crescentusque incluía la condensación cromosómica (denominada "perturbaciones en la
organización cromosómica"), la fragmentación del ADN y la despolarización de la membrana56. Se
encontró que todos estos procesos dependían de una endonucleasa previamente no caracterizada
(BapE) que demostró ser específica para el ADN superenrollado. Curiosamente, se descubrió
previamente que BapE era miembro del regulón SOS.57y se expresa en una etapa tardía después del
tratamiento con el agente que daña el ADN, la mitomicina C56. Estos resultados son consistentes con
el papel propuesto de BapE en un proceso similar a la apoptosis (en lugar de promover la reparación)
y sugieren que la PCD y el desensamblaje celular son el último recurso en respuesta al daño del ADN
en las bacterias (Fig. 1).
autor manuscrito

Finalmente, otro estudio reciente propuso que hay dos vías de PCD enE. coli, una mediada por el sistema MazEF y

otra vía distinta que exhibe las características de la apoptosis58. En las células de tipo salvaje, el daño del ADN

inducido por los antibióticos ácido nalidíxico o norfloxacina da como resultado lo que parece ser la muerte

celular mediada por MazEF; sin embargo, en unlaberintoEF mutante por deleción, la muerte celular todavía es

inducida por estos agentes pero mediante un proceso descrito como muerte similar a la apoptosis. Esta última

vía fue inducida en unRecA- ylexA-dependiente, consistente con el papel demostrado de RecA en PCD55, así como

el hallazgo de que el gen BapE estaba bajo control SOS57. Además, la muerte celular inducida por la última vía se

asoció con la despolarización de la membrana y la fragmentación del ADN, nuevamente, procesos comúnmente

asociados con la apoptosis. Los autores proponen que la inducción de la muerte celular mediada por MazEF

inhibe la "muerte similar a la apoptosis", enmascarando así este proceso en las células de tipo salvaje. En

general, estos informes recientes no solo demuestran la existencia de eventos similares a la apoptosis en las
autor manuscrito

bacterias, sino que también sugieren que estos procesos están relacionados con la respuesta SOS.

Una conservación de las vías de PCD.

El descubrimiento de eventos similares a la apoptosis en bacterias destaca la posibilidad de que organismos

ampliamente divergentes posean vías de PCD notablemente conservadas y previamente no reconocidas. Una

inspección más cercana de estas vías sugiere que su regulación también podría ser

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conservado (Fig. 2). Considere el papel que tiene RecA en el control de procesos similares a la apoptosis
autor manuscrito

en bacterias, lo que sugiere que PCD es parte de la respuesta SOS55,56,58. Como se propuso hace varios
años, la inducción de PCD bacteriana en respuesta al daño podría ser una opción de último recurso que
ocurre solo si el costo de reparación supera el costo de construir una nueva celda.1. Los resultados de laE.
coli55yC. cresentus56los estudios descritos anteriormente respaldan esta noción, considerando que la PCD
en estos organismos parece ocurrir solo después de que han fallado los intentos de reparar el daño. Con
base en estos hallazgos, junto con la observación de que el efecto bacteriostático del sistema MazEF es
solo un estado metabólico temporal que es reversible al agregar nutrientes o reparar el daño celular.23,
parece razonable proponer que la activación del sistema MazEF podría redirigir la energía normalmente
utilizada para el crecimiento para alimentar los mecanismos de reparación del ADN. En este modelo, se
prevé que el sistema MazEF retrase la inducción de la vía PCD primaria. Por lo tanto, en lugar de que la
"vía similar a la apoptosis" sea un sistema de respaldo paralaberintoEF-funciones asociadas como se
sugirió anteriormente58, se propone aquí que los eventos similares a la apoptosis observados en un
laberintoEFLos mutantes por deleción son en realidad una manifestación de la ruta PCD primaria que se
autor manuscrito

induce prematuramente en ausencia de MazEF. Este modelo podría explicar el “punto de no retorno” que
se ha observado en el que la acción de MazF ya no puede ser contrarrestada por MazE59. Además, es
consistente con la hipótesis de que “MazF es un regulador de la muerte celular más que un verdugo
celular”22.

Curiosamente, la respuesta al daño del ADN en los organismos eucariotas sigue una ruta similar que está

coordinada por la proteína multifuncional p53.60. En presencia de daño en el ADN, p53 coordina la inducción de

la detención del ciclo celular, las vías de reparación del ADN y los genes de supervivencia celular. En esto se

incluye la inducción de la autofagia, en la que la célula dañada degrada selectivamente los orgánulos y las

proteínas que no se requieren para la reparación (Cuadro 1). Por lo tanto, la respuesta inicial al estrés (como el

inducido por el daño del ADN) en los eucariotas es reprogramar la célula de modo que los componentes no
autor manuscrito

esenciales se degraden y reciclen para redirigir la energía para alimentar la respuesta al estrés (Fig. 2). De

hecho, como se propuso para el sistema MazEF, se ha demostrado que la inducción de la autofagia retrasa el

inicio de la apoptosis en un intento de reparar el daño.61. Sin embargo, además de sus funciones favorables a la

supervivencia, la autofagia en eucariotas también es conocida por su capacidad para inducir la muerte celular.

62,63en un proceso denominado muerte autofágica13. Aunque este “rol de Jano” de la autofagia (llamado así por

el dios romano que presidía la guerra y la paz) parece estar bien establecido14, la observación de que el sistema

MazEF produce funciones pro-supervivencia y pro-muerte22sugiere que este sistema también puede

desempeñar un papel de Janus en la determinación del destino de la célula bacteriana, tal vez incluso teniendo

la capacidad eventual de inducir directamente la muerte celular en ausencia de procesos de tipo apoptótico

como consecuencia de la interrupción prolongada del transcriptoma celular normal. (Figura 2).
autor manuscrito

En respuesta al daño insuperable en eucariotas, p53 cambia el programa de respuesta celular, a uno que se

caracteriza por una expresión disminuida de genes de supervivencia celular y que potencia la apoptosis.64.

Como regulador transcripcional de secuencia específica, p53 tiene la capacidad de responder a una amplia

gama de señales, incluidas aquellas asociadas con el daño al ADN, el metabolismo, la fecundidad y la privación

de nutrientes.sesenta y cinco. Al igual que con la autofagia, esta “red de genes” increíblemente compleja tiene un

papel decisivo en la determinación del destino celular66. Usando el eucarionte

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sistema como modelo, LexA, el regulador maestro deRecAexpresión y la respuesta SOS en bacterias,
autor manuscrito

podría cumplir potencialmente una función análoga a la de p53 (Fig. 2). LexA coordina la transcripción
del regulón SOS y gestiona una respuesta escalada, que da como resultado la reparación del daño (si
no es excesivo) o la muerte celular si el daño es extenso e irreparable.56. En este sentido, LexA parece
jugar también un papel decisivo en la determinación del destino celular en las bacterias, presidiendo la
reparación del daño, pero induciendo la muerte celular como último recurso si el daño es excesivo.

Como se describió anteriormente, las proteínas CidA y LrgA en procariotas y la familia Bcl-2 en
eucariotas parecen utilizar estrategias similares a las de la holina para alterar la integridad de las
membranas y provocar la muerte celular. Después de la muerte celular, los eventos post-mortem
en eucariotas pueden tomar múltiples formas (Fig. 2). Como se discutió, la inducción de MOMP en
la forma intrínseca de apoptosis es seguida por el desensamblaje ordenado de células dependiente
de caspasa. En ausencia de actividad de caspasa, puede ocurrir un proceso menos ordenado
autor manuscrito

conocido como necrosis programada (Cuadro 1). Exteriormente, la necrosis programada comparte
características en común con la "autólisis" bacteriana en el sentido de que ambas se caracterizan
por la disolución de sus envolturas externas y la liberación de su contenido citoplásmico en el
medio extracelular. Similarmente,29,30,67,68. Claramente, existen diferencias entre estos procesos
como resultado de la naturaleza de la pared celular bacteriana (que requiere la degradación por
hidrolasas de peptidoglicano). Sin embargo, a medida que continuamos aprendiendo más sobre el
control de la autólisis en bacterias, no sería sorprendente que surgieran más superposiciones
entre estos sistemas en organismos procariotas y eucariotas.

Conclusiones
autor manuscrito

La última década ha visto un gran progreso en nuestra comprensión de los mecanismos de muerte celular en las

bacterias. Una vez que se pensó que era un proceso pasivo que ocurre como consecuencia de un mal

funcionamiento metabólico letal, similar a arrojar una llave inglesa a un motor en marcha, ahora sabemos que la

muerte celular bacteriana es un proceso activo, genéticamente codificado y altamente coordinado asociado con

pre- y eventos post-mortem que son sorprendentemente similares a los procesos de PCD en células eucariotas.

De hecho, considerando la conservación funcional entre los procesos en bacterias y eucariotas, aquí se propone

que la muerte celular bacteriana, como muchos otros procesos metabólicos, comparte muchas similitudes con

los sistemas eucariotas, posiblemente incluso proporcionando los elementos básicos evolutivos de estos
sistemas. Como un proceso recientemente reconocido, apenas estamos comenzando a comprender cómo

funciona la PCD bacteriana y el propósito del modelo descrito aquí es sintetizar las observaciones realizadas

hasta la fecha en una hipótesis comprobable que guiará futuras investigaciones. Quedan muchas preguntas

sobre la regulación y las funciones de las proteínas relacionadas con PCD en las bacterias. ¿Cuál es la relación
autor manuscrito

entre los sistemas TA y la familia de proteínas Cid/Lrg, y qué señales podrían dictar la "decisión" de reparar el

daño celular o continuar por la vía de la muerte celular? ¿Los sistemas TA tienen una función favorable a la

supervivencia comparable a la observada para la autofagia en organismos eucariotas? ¿Cuál es el mecanismo

utilizado por las proteínas Cid/Lrg para inducir la muerte celular y cómo se regula este proceso? ¿Qué señales

conducen a los eventos post-mortem en las células muertas? Finalmente, ¿Cómo se benefician de la PCD los

procesos de desarrollo asociados con la formación de biopelículas? Las respuestas a estas preguntas no solo

deberían conducir a una mayor apreciación de los

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procesos, respuestas fisiológicas a los antibióticos y nuevos objetivos farmacológicos en bacterias, pero
autor manuscrito

también debería mejorar nuestra comprensión de estos procesos complejos en eucariotas.

Agradecimientos
El autor desea agradecer al Dr. Xu Luo por brindar su experiencia en apoptosis, así como a la Sra. Kari Nelson por su
asistencia editorial en el desarrollo de este manuscrito. El trabajo realizado en mi laboratorio está respaldado por
subvenciones de los Institutos Nacionales de Salud (P01-AI83211 y R01-AI038901).

Biografía
Kenneth W. Bayles recibió su formación en genética bacteriana con John Iandolo en la Universidad Estatal
de Kansas, Kansas, EE. UU. Ha ocupado cargos docentes en la Universidad de Idaho, Idaho, EE. UU. y en
el Centro Médico de la Universidad de Nebraska, Nebraska, EE. UU., donde es profesor de Microbiología.
Su laboratorio se ha centrado principalmente en el papel del ADN extracelular como molécula de matriz
autor manuscrito

de biopelícula y, más recientemente, en el control diferencial de la expresión génica durante el desarrollo

de la biopelícula.

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Recuadro 1. Vías alternativas de muerte celular

autor manuscrito

Mientras que la apoptosis se caracteriza por cambios morfológicos muy específicos y bien estudiados
que acompañan a la muerte celular, la necrosis programada y la muerte autofágica parecen ser
formas menos ordenadas de PCD. La necrosis se ha considerado durante mucho tiempo un proceso
descontrolado provocado principalmente por influencias externas, que inducen la inflamación celular,
la permeabilidad de la membrana plasmática, la entrada de agua y la fuga del contenido
citoplasmático al entorno circundante. La exposición resultante de los tejidos a estos constituyentes
citoplásmicos conduce a la respuesta inflamatoria característica asociada con la necrosis. Sin
embargo, estudios más recientes han revelado que este proceso puede estar estrictamente regulado,
lo que lleva a la designación de "necrosis programada". De hecho, se ha demostrado una
superposición considerable en el control de la necrosis programada y la apoptosis, aunque
generalmente se considera que el primero es un proceso independiente de caspasas. Se ha
propuesto que la muerte autofágica es la etapa final aguda de la autofagia en la que una célula
autor manuscrito

dañada o estresada degrada selectivamente orgánulos y proteínas como fuente de energía para
alimentar los costosos mecanismos de reparación necesarios para la supervivencia celular. Este
proceso se caracteriza por la formación de "autofagosomas" o estructuras unidas a doble membrana
que engullen macromoléculas y orgánulos citoplasmáticos, como las mitocondrias y el retículo
endoplásmico, que están destinados al reciclaje. Es de destacar que se ha sugerido que la autofagia
solo contribuye a la muerte celular al generar energía para la apoptosis y la necrosis, en lugar de ser
un efector directo de la muerte celular. Así, en lugar de pensar en términos de muerte autofágica,69.
Para descripciones más extensas de la necrosis programada y la muerte autofágica, se remite al
lector a varias revisiones destacadas de estos temas.13,14,70,71.
autor manuscrito
autor manuscrito

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Recuadro 2. Ensayos de apoptosis

autor manuscrito

Las manifestaciones morfológicas de PCD en eucariotas se denominan apoptosis e incluyen condensación

nuclear y citoplásmica, así como la fragmentación de la célula en vesículas unidas a la membrana (a

menudo denominadas "blebbing"). Hoy en día, uno de los indicadores de diagnóstico de apoptosis más

reconocidos es la fragmentación del ADN cromosómico, que está mediada por una nucleasa específica, CAD

(desoxirribonucleasa activada por caspasa).72,73. Esta actividad provoca el clásico laddering de ADN que es

una característica común de las células apoptóticas.74. El marcaje del extremo de la muesca de dUTP-biotina

mediado por TdT, comúnmente conocido como ensayo TUNEL, se dirige a estos fragmentos de ADN usando

una enzima específica llamada desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) que cataliza la adición de dUTP

marcados con biotina a los extremos de los fragmentos.75. En virtud del hecho de que la fragmentación del

ADN es exclusiva de las células apoptóticas, este ensayo identifica específicamente las células que

experimentan apoptosis. Otra característica de las células apoptóticas es la pérdida de la asimetría de los

fosfolípidos de la membrana, lo que da como resultado la exposición de la fosfatidilserina (que

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normalmente está orientada hacia el citoplasma) a la cara externa de la membrana citoplasmática.76, que

tiene un papel importante en el reconocimiento y eliminación de células apoptóticas por macrófagos77. La

localización de la fosfatidilserina en la superficie celular externa proporciona la base para la tinción de

anexina V, que se une preferentemente a fosfolípidos cargados negativamente, como la fosfatidilserina.78.

Finalmente, están disponibles una variedad de sustratos fluorogénicos para la detección directa de

actividades asociadas con diferentes caspasas inducidas durante la apoptosis.dieciséis. Estos sustratos

contienen secuencias de aminoácidos que son específicamente reconocidas y escindidas por diferentes
caspasas, provocando fluorescencia como consecuencia de la separación de los restos fluorogénicos y de

extinción de fluorescencia asociados (es decir, transferencia de energía de resonancia de fluorescencia;

FRET). Todos estos métodos permiten la identificación de células apoptóticas mediante microscopía de

epifluorescencia o técnicas de citometría de flujo.

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Nat Rev Microbiol. Manuscrito del autor; disponible en PMC 06 de mayo de 2015.
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Figura 1. Vía modelo de PCD bacteriana

En este modelo, una célula sana que ha sufrido algún tipo de daño (por ejemplo,
mutaciones inducidas por UV) responderá inicialmente, y probablemente
simultáneamente, induciendo sistemas de toxina-antitoxina (TA) (por ejemplo,
MazEF) y mecanismos de reparación (la respuesta SOS) . Las proteínas Cid y Lrg
están presentes pero se mantienen inactivas en este punto debido al efecto
inhibitorio de las proteínas Lrg sobre las proteínas efectoras Cid PCD. La actividad
del sistema TA, en virtud de su efecto inhibitorio sobre la traducción, da como
resultado la transición de la célula a un estado de reposo (bacteriostasis) que
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maximiza la energía y los recursos necesarios para reparar el daño. Si el daño es

irreparable, se alcanza un "punto de no retorno" y el efecto inhibitorio de las
proteínas Lrg sobre Cid se libera por un mecanismo desconocido y se produce la
muerte celular. Finalmente,

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Figura 2. Una conservación de las respuestas al estrés celular

El estrés celular, como el provocado por agentes que dañan el ADN, induce un programa de respuesta al estrés

que incluye mecanismos de reparación del ADN y vías de muerte celular. Esta respuesta incluye mecanismos
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para inhibir la división celular, dirigiendo todos los recursos disponibles para reparar el daño. Si los niveles de

daño son mínimos, los mecanismos de reparación serán suficientes para que la celda vuelva a funcionar. Similar

al papel de p53 en la evaluación de la extensión del daño a la célula y luego en la coordinación de una respuesta

adecuada, se prevé que el regulador LexA de la respuesta SOS cumpla un papel similar en la coordinación de la

respuesta al daño del ADN en las bacterias. En ambos casos, esto incluye procesos que dan como resultado el

reciclaje de componentes citoplasmáticos (sistemas TA y autofagia) en un intento de impulsar la reparación del

ADN. Si el daño es irreparable, los mecanismos de reparación se verán abrumados y se induce PCD, ya sea
muerte inducida por Cid-/Lrg (procariotas) o muerte inducida por la familia de proteínas Bcl-2 (eucariotas).

Alternativamente, también se puede inducir la muerte autofágica o inducida por el sistema TA. Finalmente, se

activan los eventos post-mortem, como los asociados con la apoptosis intrínseca y la necrosis (eucariotas), y los

procesos similares a la apoptosis y la autólisis (procariotas).

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Nat Rev Microbiol. Manuscrito del autor; disponible en PMC 06 de mayo de 2015.