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microbiológicas y miembros
de la familia de coronavirus
2. Introducción.
4. Genoma viral.
6. Conclusión.
7. Bibliografía.
Principales características microbiológicas y miembros de la familia de coronavirus | 3
Objetivos Características
• Conocer las características microbiológicas microbiológicas generales
generales de los coronavirus. de los coronavirus
• Describir el genoma viral de los coronavirus.
• Caracterizar los principales factores de virulencia
de los coronavirus.
Introducción
Las enfermedades emergentes nuevas frecuentemente
aparecen de repente. En 2012 se identificó por primera
vez que el coronavirus del síndrome respiratorio de
Oriente Medio (MERS-CoV, del inglés Middle East
respiratory syndrome-coronavirus) era la causa de casos Figura 1. Línea de tiempo de propagación mundial del COVID-19 (to-
graves de neumonía. El primer brote se produjo en Arabia mado de Peña- López B.O., Rincón- Orozco B. Generalidades de la pan-
Saudí y a partir de ahí se extendió por otros países árabes demia por COVID-19 y su asociación genética con el virus del SARS.
Salud UIS.
y a Europa debido al trasiego de personas.
Desde septiembre de 2012 hasta junio de 2013 se Los coronavirus (CoV) constituyen un amplio grupo de
confirmaron 58 casos, con 33 muertes. Un equipo de virus que se encuadran taxonómicamente en la subfamilia
investigación se desplazó a Arabia Saudí para observar Coronavirinae dentro de la familia Coronaviridae (order
un brote en marcha del MERS-CoV y describió que este Nidovirales); se designan bajo el término coronavirus
se extendía con facilidad entre los pacientes de tres todas las especies pertenecientes a los géneros
centros sanitarios diferentes.1 Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus
y Deltacoronavirus.3
Otro coronavirus, el del síndrome respiratorio agudo grave
Los coronavirus son virus zoonóticos, esto es,
(SARSCoV, del inglés severe acute respiratory syndrome-
pueden transmitirse entre animales y humanos. En
coronavirus), provoca una enfermedad similar al MERS-
líneas generales, se acepta que los alfacoronavirus
CoV con una tasa de mortalidad igualmente elevada.
y los betacoronavirus son capaces de infectar a
Los coronavirus causan infecciones respiratorias mamíferos, mientras que los gammacoronavirus y los
en humanos y otros animales; por ejemplo, causan deltacoronavirus pueden infectar a pájaros (aunque
aproximadamente el 15 % de los resfriados comunes y algunos de ellos también a mamíferos).3
el SARS, una infección de las vías respiratorias inferiores Así, se ha descrito que muchos coronavirus pueden
en humanos que puede ser mortal.1 usar a los mamíferos como reservorios u hospedadores
Recientemente, se aisló un nuevo coronavirus del intermediarios, destacando entre ellos los murciélagos,
tracto respiratorio inferior de pacientes en Wuhan, que en los que se facilita la recombinación y los eventos
sufrían de neumonía debido a causas desconocidas. La mutagénicos conducentes a una mayor diversidad
Organización Mundial de la Salud (OMS) lo llamó 2019- genética de los virus. En la infección a mamíferos, los
nCoV, mientras que el Comité Internacional de Taxonomía coronavirus infectan fundamentalmente células del
de Virus (ICTV) lo llamaron SARS-CoV-2, causante de la tracto respiratorio y el tracto gastrointestinal.3 (Figura 2).
enfermedad COVID-19. Posteriormente, se confirmó que
el virus es capaz de transmisión de persona a persona.2
Los viriones de coronavirus están recubiertos y tienen en En resumen, estructuralmente los coronavirus son virus
la superficie unas espículas de glicoproteína en forma esféricos de 100-160 nm de diámetro, envueltos y que
de palo de golf. Debido a estas estructuras parece que el contienen ARN monocatenario (ssRNA) de polaridad
virus lleve una corona y de ahí su nombre.1 Son redondos positiva de entre 26 y 32 kilobases de longitud. Poseen
u ovalados, a menudo polimórficos, con un diámetro de una nucleocápside de simetría helicoidal y en su envoltura
50 a 200 nm.2 presenta una estructura glicoproteica, codificada en la
región S de su genoma, que es la proteína responsable
Actualmente, se han aislado tres tipos de coronavirus de la unión con las células de su hospedador y, por tanto,
de los humanos: coronavirus humanos 229E, OC43 responsable del tropismo del virus.5
y coronavirus del SARS (SARS-CoV). Hay 6 tipos de
coronavirus previamente conocidos por infectar a los El nuevo coronavirus tiene un diámetro de 60 a 140 nm.
humanos. 229E y NL63 (de alfacoronavirus), OC43 La proteína espiga se encuentra en la superficie del
(de betacoronavirus), HKU1, coronavirus del síndrome virus y forma una estructura en forma de barra. Como
respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV) y coronavirus una de las principales proteínas antigénicas del virus,
del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV).4 la proteína espiga es la estructura principal utilizada
para la tipificación. La proteína de la nucleocápside
Los virus de la familia Orthomyxoviridae (virus de la encapsula el genoma viral y puede usarse como antgeno
influenza), la familia Paramyxoviridae (paramyxoviruses, de diagnóstico.2
virus sincitial respiratorio, virus del sarampión, virus de la
parotiditis, virus Hendra, virus Nipah y metapneumovirus Aun siendo este nuevo agente aislado similar a otros
humano), la familia Togaviridae (virus de la rubéola), betacoronavirus detectados en murciélagos, es
la familia Picornaviridae (rhinovirus) y la familia diferente del SARS-CoV y del MERS-CoV, y conforma
Coronaviridae (coronavirus del SARS) son los virus un nuevo linaje del subgénero Sarbecovirus dentro
respiratorios comunes. Además, el adenovirus, el del género Betacoronavirus. Donde más diferencias
reovirus, el virus Coxsackie, el virus ECHO, el virus del se han observado entre las especies de coronavirus
herpes, otros, también pueden causar enfermedades detectados de murciélagos cuya secuencia es conocida
respiratorias infecciosas.2 (Figura 3). y la secuencia del nuevo 2019-nCoV es en el gen S que
codifica la glicoproteína de la envoltura, responsable
del tropismo celular.5 Dos estudios por crioelectro-
microscopia electrónica han determinado la estructura
de la proteína S unida a la proteína ACE-2 (enzima
convertidora de angiotensina 2).4
Genoma viral
El genoma de los coronavirus destaca por ser el de mayor
tamaño de todos los virus de RNA conocidos, alrededor
de 30 kb. El genoma de los coronavirus puede funcionar
directamente como mRNA en la célula animal ya que es
de configuración positiva. No obstante, la mayor parte de
las proteínas del virus no proceden de la traducción de
RNA genómico.1 (Figura 5).
Figura 5. Coronavirus a) Micrografía electrónica de un coronavirus; un Figura 6. Organización del genoma de coronavirus humanos represen-
virión tiene unos 15nm de diámetro. B) Pasos de la replicación de un tativos (tomado de: Mclntosh K, Perlman S. Coronavirus, incluido el sín-
coronavirus (tomado de: Madigan MT. Martinko JM, Bender KS, Buc- drome respiratorio agudo grave (SRAG) y el síndrome respiratorio de
kley DH, Stahl DA. Genoma y diversidad de los virus. En Miguel Mar- Oriente Medio (SROM). En: Bennett J.E, Dolin R, Blaser M. J, editores.
tin-Romo, editores. Biología de los microorganismos. 2015. Madrid. Enfermedades infecciosas: Principios y práctica. 8va edición. España:
PEARSON EDUCACIÓN, SA. p. 279-306) Elsevier: 2016. P.2030-38).
En vez de eso, tras la infección, solo se traduce una La primera de las proteínas estructurales principales
porción del genoma, en concreto la que produce la es una proteína hemaglutinina-esterasa de superficie,
RNA replicasa. Esta enzima utiliza entonces el RNA presente en HCoV-OC43 y en HKU1, así como en
genómico como molde para producir cadenas negativas algunos betacoronavirus animales, que puede
complementarias a partir de las cuales se producen intervenir en la adhesión y/o liberación de la partícula
varios mRNA, que son luego traducidos para producir en la superficie celular. Este gen contiene secuencias
proteínas víricas. El RNA genómico de extensión similares a la hemaglutinina del virus de la gripe C, lo
completa también se forma a partir de las cadenas que probablemente refleja un episodio recombinante
negativas de RNA.1 entre familias virales que ocurrió muchos años atrás.
El siguiente gen codifica la glucoproteína de superficie
El tamaño del genoma de los coronavirus, incluye un que forma las proyecciones superficiales en forma de
número variable (de 6 a 11) de marcos de lectura abiertos pétalo y es responsable de la unión y de la estimulación
(ORF del inglés: Open Reading Frame). El primer ORF de anticuerpos neutralizantes.7
que representa aproximadamente el 67% del genoma
completo codifica para 16 proteínas no estructurales Las proteínas S de SARS-CoV y MERS-CoV se unen a
(PNS), mientras que los ORF restantes codifican para diferentes receptores del huésped a través de diferentes
proteínas accesorias y proteínas estructurales. Las dominios de unión a receptores (DUR). El SARS-CoV
cuatro proteínas estructurales principales para la utiliza la ECA2 como uno de los principales receptores
formación de la capside viral son la glucoproteína de y el CD209L como receptor alternativo, mientras que el
la superficie de la espiga (S), la proteína de envoltura MERS-CoV usa la dipeptidil peptidasa 4 (DPP4, también
pequeña (E), la proteína de la matriz (M) y la proteína de conocido como CD26) como el receptor primario.6
la nucleocápside (N).6 A grandes rasgos, los coronavirus inician su replicación
con la entrada de los viriones, forma infecciosa del virus,
Este ARN, que codifica (en orden desde el extremo 5’)
cuando pierden su envoltura y depositan su ARN viral en
una poliproteína grande, que se escinde por proteasas
el citoplasma de la célula eucariota, donde el parecido
codificadas por el virus para formar varias proteínas no
con el ARNm del hospedador le permite adherirse
estructurales, como una ARN polimerasa dependiente
directamente a los ribosomas para su traducción. Allí,
de ARN, metiltransferasas y una helicasa, además, de
se emplea como plantilla para traducirse directamente
cuatro o cinco proteínas estructurales entrelazadas
en la poliproteína 1a/1ab, en la cual están unidas todas
con un número variable de proteínas no estructurales y
las proteínas que formarán el complejo de replicación-
menores.7 (Figura 6).
transcripción en vesículas de doble membrana. A
partir de dicho complejo, se sintetizan diversos ARN
subgenómicos codificantes para los polipéptidos
y proteínas (estructurales y no estructurales) que
determinan la biología del virus y la simetría helicoidal
de su nucleocápsida.3
Principales características microbiológicas y miembros de la familia de coronavirus | 6
El nuevo coronavirus es muy similar en términos de Existe una RT-PCR del gen RdRp que detecta y
secuencias del genoma a seis coronavirus descubiertos amplifica una región conservada común a todos los
previamente. Un análisis de su secuencia genética betacoronavirus. Para un diagnóstico específico, una
y homología reveló que el nuevo virus tiene muchas vez conocida la secuencia genética del 2019-nCoV, se
similitudes con el SARS-CoV. Este nuevo coronavirus han desarrollado varias RT-PCR para detectar regiones
ahora está clasificado como beta-coronavirus.2 de 2019-nCoV a partir de muestras respiratorias (frotis
nasofaríngeos y orofaríngeos, lavados nasofaríngeos,
Los análisis genéticos indican que el COVID-19 tiene lavados boncoalveolares, aspirados traqueales y
una estrecha asociación evolutiva con los coronavirus esputos) y suero. Se dispone ya de reactivos comerciales
provenientes del murciélago que son similares al SARS y de alguna de ellas, con protocolos aprobados para su
es cercano a los CoV de SARS identificado en humanos. 6 realización.5 (Tabla 1).
El genoma del virus SARS-CoV-2, codifica la proteína N País Institución Genes diana
que está en el interior del virión asociada al RNA viral, y
China China CDC ORF1ab and N
las otras cuatro proteínas están asociadas a la envuelta
viral. La proteína S se ensambla en homotrímeros, y Alemania Charité RdRP, E, N
forma estructuras que sobresalen de la envuelta del Hong Kong HKU ORF1b-nsp14, N
virus. La proteína S contienen el dominio de unión al Instituto Nacional
Pancoronavirus y
receptor celular y por lo tanto es la proteína determinante de Enfermedades
dianas múltiples,
Japón Infecciosas.
del tropismo del virus y, además, es la proteína que tiene Departamento de
glicoproteína de la
la actividad de fusión de la membrana viral con la célula envoltura.
Virología III
y de esta manera permite liberar el genoma viral en el National Institute of
Tailandia N
interior de la célula que va a infectar.2 Health.
Tres primers de N,
Una diferencia notable es que la proteína S del nuevo Estados Unidos US CDC
RdRP
coronavirus es más larga que sus homologas de
murciélago, pero también que las proteínas S del Tabla 1. Protocolos aprobados para el diagnóstico de laboratorio de
SARS-CoV y MERS-CoV. El SARS-CoV penetra en la SARS-CoV-2 (tomado de; Diez izquierdo L, Gamarra Villaverde M, Gar-
célula empleando como receptor a la ACE-2. Aunque la cía- San Miguel, Rodríguez- Alarcón L, Latasa Zamalloa P, Monge Corella
S, et al. INFORME TÉCNICO. Nuevo coronavirus 2019-nCov. Centro de
estructura de la glicoproteína de la envoltura del SARS-
Coordinación de Alertas y Emergencias Sanitarias. 10 de febrero 2020).
CoV-2 es ligeramente diferente de la del SARS-CoV, se
ha demostrado in vitro que el ACE-2 sigue siendo un
receptor válido para el SARS-CoV-2.4 Principales factores
La secuencia obtenida del SARS-CoV-2 coincidía con la
de virulencia
que se obtuvo directamente de las muestras respiratorias Los coronavirus comunes infectan principalmente a
de varios pacientes en estudio. En total, se pudo adultos o niños mayores, causando el resfriado común.
obtener la secuencia de ARN completa de 8 muestras Algunas cepas pueden causar diarrea en adultos. Estos
correspondientes a 8 pacientes infectados por este virus se transmiten principalmente por gotitas y también
agente. Una vez realizada la caracterización genómica se pueden propagar a través de la ruta fecal-oral. La
y su secuenciación, se observó una alta homología con incidencia de infección por el virus corona es frecuente
virus del género Betacoronavirus, concretamente un en invierno y primavera. El período de incubación de los
88% de identidad con un virus SARS-like detectado en coronavirus suele ser de 3 a 7 días.2
murciélagos, un 79% de identidad con el SARS-CoV y un
La reinfección es frecuente y puede deberse al rápido
50% de identidad con el MERS-CoV.5
descenso de la concentración de anticuerpos tras la
Debido al limitado conocimiento sobre el SARS-CoV-2, infección. La proporción de infecciones sintomáticas
aún no se puede dar explicaciones razonables sobre el respecto al total de infecciones es del 50-90%,
número significativo de diferencias observadas en la dependiendo de la edad de la población estudiada,
secuencia de aminoácidos con el SARS humano y otros del método de detección viral y de la definición de
CoV similares al SARS. Por ejemplo, no se encontraron la «infección». En voluntarios adultos, el 72% de los
en las SARS-CoV-2 sustituciones de aminoácidos en infectados con el HCoV-229E desarrollaron resfriados.1
los dominios de unión a receptores que interactúan
En la década de 1960 se describieron por primera vez en
directamente con la proteína del receptor humano ECA2
las cavidades nasales de pacientes con resfriado común
comparado con el SARS-CoV15, pero se identificaron
y, hasta ahora, solo se conocían 6 especies (ya descritas),
seis mutaciones en otra región del DUR. Si estas
de coronavirus que podían infectar a humanos (HCoV)
diferencias podrían afectar el tropismo del virus hacia
y causar enfermedades respiratorias. Estos provocan
el huésped y la propiedad de transmisión del COVID-19
infecciones leves del tracto respiratorio superior; solo
en comparación con el SARS-CoV, es motivo actual de
en casos raros pueden provocar infecciones graves en
intensa investigación.6
población pediátrica y adultos de edad avanzada. Son
endémicos a nivel global y suponen un 10-30% de las
infecciones del tracto respiratorio superior en adultos.3
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