Introducción

Las proteínas son biomoléculas compuestas básicamente por carbono, hidrógeno,

oxígeno y nitrógeno. También pueden contener azufre, y algunos tipos de proteínas
también contienen elementos como fósforo, hierro, magnesio y cobre.
Se pueden considerar como polímeros de molécula pequeña llamados aminoácidos y,
por lo tanto, monómeros unitarios. Los aminoácidos están unidos por enlaces
peptídicos. Así, las proteínas son cadenas de aminoácidos que se pliegan en estructuras
tridimensionales que les permiten realizar miles de funciones. Las proteínas están
codificadas en el material genético de cada organismo, donde se especifican sus
secuencias de aminoácidos, y luego son sintetizadas por el ribosoma.
Las proteínas juegan un papel importante en la biología y son las biomoléculas más
versátiles y diversas. Realizan una serie de funciones diferentes, entre ellas brindar
energía al organismo. Con esta premisa, el ensayo que se presenta a continuación
permitirá desglosar la forma en la que los seres humanos obtienen energía a través de
las proteínas en un mecanismo llamado, metabolismo de las proteínas.
Definición, clasificación y estructura de los aminoácidos:
Los aminoácidos son las unidades básicas de las cuales están formadas las proteínas. Su
denominación responde a la composición química general que presentan, en la que un
grupo amino (-NH2) y otro carboxilo o ácido (-COOH) se unen a un carbono α (-C-).
Las otras dos valencias de ese carbono quedan saturadas con un átomo de hidrógeno (-
H) y con un grupo químico variable al que se denomina radical (-R). La fórmula general
de un aminoácido es:

Tridimensionalmente el carbono α presenta una configuración tetraédrica en la que el

carbono se dispone en el centro y los cuatro elementos que se unen a él ocupan los
vértices. Cuando en el vértice superior se dispone el -COOH y se mira por la cara
opuesta al grupo R, según la disposición del grupo amino (-NH2) a la izquierda o a la
derecha del carbono α se habla de α-L-aminoácidos o de α-D-aminoácidos
respectivamente. En las proteínas sólo se encuentran aminoácidos de configuración L.
Existen 20 aminoácidos distintos, cada uno de los cuales viene caracterizado por su
radical R:
Alamina-ALA
Valina-VAL
Prolina-PRO
Metionina-MET
Leucina-LEU
Isoleucina-ILE
Fenilalanina-PHE
Triptófano-TRP
Glicina-GLY
Treonina-THR
Serina-SER
Cisteína-CYS
Glutamina-GLN
Acido Aspártico-ASP
Asparragina-ASN
Tirosina-TYR
Ácido Glutamico-GLU
Lisina-LYS
Arganina-ARG
Histidina-HIS
No todos estos anteriores pueden ser sintetizados por el ser humano, y es ahí donde
entra la clasificación de los aminoácidos. Estos se clasifican en aminoácidos esenciales
y no esenciales. Los aminoácidos esenciales son aquellos que el cuerpo humano no
puede generar por sí solo. Esto implica que la única fuente de estos aminoácidos en esos
organismos es la ingesta directa a través de la dieta. Las rutas para la obtención de estos
aminoácidos esenciales suelen ser largas y energéticamente costosas. Cuando un
alimento contiene proteínas con todos los aminoácidos esenciales, se dice que son de
alta o de buena calidad. Algunos de estos alimentos son: la carne, los huevos, los lácteos
y algunos vegetales como la espelta, la soja y la quinoa. En humanos se han descrito
estos aminoácidos esenciales: Fenilalanina, Isoleucina, Leucina, Lisina, Metionina,
Treonina, Triptófano, Valina, Arginina e Histidina. Por otra parte, los aminoácidos qué
si pueden ser sintetizados por los seres humanos son llamados aminoácidos no
esenciales.
Los aminoácidos se encuentran unidos linealmente por medio de uniones peptídicas.
Estas uniones se forman por la reacción de síntesis (vía deshidratación) entre el grupo
carboxilo del primer aminoácido con el grupo amino del segundo aminoácido.
La formación del enlace peptídico entre dos aminoácidos es un ejemplo de una reacción
de condensación. Dos moléculas se unen mediante un enlace de tipo covalente CO-NH
con la pérdida de una molécula de agua y el producto de esta unión es un dipéptido. El
grupo carboxilo libre del dipéptido reacciona de modo similar con el grupo amino de un
tercer aminoácido, y así sucesivamente hasta formar una larga cadena. Podemos seguir
añadiendo aminoácidos al péptido, porque siempre hay un extremo NH2 terminal y un
COOH terminal.
 Síntesis de Novo
La síntesis de Novo se refiere a la síntesis de moléculas complejas a partir de moléculas
simples como azúcares o aminoácidos, en contraposición al reciclaje después de una
degradación parcial. Por ejemplo, los nucleótidos no son necesarios en la dieta, ya que
pueden construirse a partir de pequeñas moléculas precursoras como el formiato y el
aspartato. La metionina, por otro lado, es necesaria en la dieta porque, aunque puede
degradarse y luego regenerarse a partir de la homocisteína, no puede sintetizarse de
Novo.
De Novo es una frase latina que se traduce literalmente como "de lo nuevo", pero que
implica "de nuevo", "desde cero" o "desde el principio".
La síntesis de ácidos grasos se lleva a cabo en el citosol de las células y el producto
activos para la síntesis es el acetil CoA proveniente de la glucosa vía glucólisis. A esta
ruta también se le conoce como “síntesis de Novo” o síntesis completa.
Nucleótido
Las vías de Novo de los nucleótidos no utilizan bases libres: adenina (abreviada como
A), guanina (G), citosina (C), timina (T) o uracilo (U). El anillo de purina se forma un
átomo o unos pocos átomos a la vez y se une a la ribosa durante todo el proceso.1 El
anillo de pirimidina se sintetiza como orotato y se une a fosfato de ribosa y luego se
convierte en nucleótidos de pirimidina comunes.
Colesterol
El colesterol es un componente estructural esencial de las membranas de las células
animales. El colesterol también sirve como precursor de la biosíntesis de hormonas
esteroides, ácido biliar y vitamina D. En los mamíferos, el colesterol se absorbe de
fuentes dietéticas o se sintetiza de Novo. Hasta el 70-80% de la síntesis de colesterol de
Novo se produce en el hígado y aproximadamente el 10% de la síntesis de colesterol de
Novo se produce en el intestino delgado.
Ácido graso (lipogénesis de Novo)
La lipogénesis de Novo (DNL) es el proceso mediante el cual los carbohidratos
(principalmente, especialmente después de una comida rica en carbohidratos) de la
circulación se convierten en ácidos grasos, que pueden convertirse en triglicéridos u
otros lípidos.4 El acetato y algunos aminoácidos (especialmente leucina e isoleucina )
también pueden ser fuentes de carbono para DNL.
ADN
La síntesis de ADN de Novo se refiere a la creación sintética de ADN en lugar del
ensamblaje o modificación de secuencias de ADN molde precursoras naturales. La
síntesis inicial de oligonucleótidos va seguida de la síntesis de genes artificiales y,
finalmente, de un proceso de clonación, corrección de errores y verificación, que a
menudo implica la clonación de genes en plásmidos en Escherichia coli o levadura.
La primasa es una ARN polimerasa y puede agregar un cebador a una hebra existente en
espera de replicación. La ADN polimerasa no puede agregar cebadores y, por lo tanto,
necesita primasa para agregar el cebador de Novo.
Pool de aminoácidos
El pool de aminoácidos. Está constituido por los aminoácidos libres en los diferentes
líquidos corporales como el intersticial, el plasma y la linfa, entre otros. Existe un
continuo intercambio entre estos a través de las distintas barreras, membranas celulares,
capilares y otras. La cantidad y concentración de cada uno de los aminoácidos del pool
es biológicamente constante, ya que sus variaciones se producen dentro de límites más o
menos estrechos. La constancia del pool refleja un equilibrio dinámico entre los
procesos que le aportan y le sustraen aminoácidos.
Los procesos que aportan aminoácidos son:
La absorción intestinal
La absorción intestinal constituye la fuente principal de ingreso de nitrógeno
metabólicamente útil al organismo, la composición y cuantía de este aporte depende de
la dieta, generalmente una dieta balanceada aporta al pool entre 70 y 100 gramos de
aminoácidos al día.
El catabolismo de proteínas hísticas
Otro proceso que aporta aminoácidos al pool es el catabolismo de proteínas hísticas, que
consiste en la degradación de las proteínas de nuestro propio organismo, catalizado por
enzimas proteolíticas, muchas se localizan en los lisosomas y se han denominado
genéricamente catepsinas. El catabolismo de proteínas hísticas está sometido a
regulación, resulta inhibido por diferentes aminoácidos y por la insulina, el glucagón y
los glucocorticoides aceleran este proceso.
La síntesis de aminoácidos
La síntesis de aminoácidos ocurre a partir de sustancias precursoras provenientes de las
vías metabólicas de glúcidos fundamentalmente, aunque este proceso aporta
aminoácidos al pool, tiene limitaciones, ya que como veremos posteriormente, nuestro
organismo no es capaz de sintetizar todos los aminoácidos sino sólo algunos de ellos.
Los procesos que no aportan aminoácidos son:
La síntesis de proteínas
La síntesis de proteínas sustrae aminoácidos del pool. Este proceso está sujeto a una
estricta regulación genética, para que se efectúe la misma es necesario que todos los
aminoácidos que componen las proteínas estén presentes en el pool en cantidades
adecuadas.
La síntesis de otros compuestos nitrogenados
La síntesis de aminoácidos ocurre a partir de sustancias precursoras provenientes de las
vías metabólicas de glúcidos fundamentalmente, aunque este proceso aporta
aminoácidos al pool, tiene limitaciones, ya que como veremos posteriormente, nuestro
organismo no es capaz de sintetizar todos los aminoácidos sino sólo algunos de ellos.
El catabolismo de aminoácidos
El catabolismo de aminoácidos es otro de los procesos que sustrae aminoácidos del
pool, representa la vía de degradación de dichos compuestos con función
fundamentalmente energética. Se utilizan cada día unos 70 gramos con estos fines, lo
que cubre el 20% de las necesidades calóricas de un adulto normal.
 Catabolismo de proteínas y del nitrógeno de los aminoácidos.
Importancia biomédica:
En adultos normales, la ingesta de nitrógeno coincide con el nitrógeno excretado; el
balance positivo de nitrógeno es cuando existe un exceso de ingesta sobre el nitrógeno
excretado, ocurre en el crecimiento y en el embarazo; el balance negativo de nitrógeno
es donde existe una mayor salida de nitrógeno que ingesta, ocurre después de una
cirugía, cáncer avanzado y trastornos nutricionales como el kwashiorkor y marasmo.
El amoniaco altamente toxico en los humanos, proviene principalmente a partir del
nitrógeno alfa-amino de los aminoácidos
Los tejidos convierten el amoniaco en el grupo amino del aminoácido glutamina.
Amoniaco --> Glutamina --> (al hígado) Urea.
Si la función hepática está comprometida (como en la cirrosis y en la hepatitis),
lógicamente el hígado no procesará el amoniaco de forma normal y los niveles elevados
de amoniaco en la sangre generan signos y síntomas clínicos.
Recambio proteico:
La degradación y la síntesis (o renovación) contínua de las proteínas celulares se
produce en todas las formas de vida.
Cuando los tejidos se someten a una reorganización estructural, se producen
altas velocidades de degradación de proteínas. Aproximadamente el 75% de los
aminoácidos liberados por la degradación de proteínas se reutilizan; los
aminoácidos que no se incorporan inmediatamente a la nueva proteína se
degradan rápidamente.
La mayor parte de los esqueletos de carbono de los aminoácidos se convierten
en intermediarios anfibólicos.
En humanos, el nitrógeno amino se convierte en urea y se excreta en la orina.
Hay que tener en cuenta que las proteasas y las peptidasas degradan las proteinas hacia
aminoácidos.
La vida media es la susceptibilidad relativa de una proteína a su futura degradación; la
vida media de una proteína es el tiempo necesario para reducir su concentración a la
mitad de su valor inicial.
la secuencia de PEST es un complejo para degradar proteínas rápidamente, compuesta
por prolina, glutamato, serina y treonina.
Las proteasas intracelulares hidrolizan los enlaces peptídicos internos, formando
péptidos; estos péptidos son degradados a aminoácidos por endopeptidasas, y por tanto
aminopeptidasas, así como carboxipeptidasas, que eliminan los extremos amino y
carboxilo respectivamente.
Degradación independiente de ATP:
Degradación exclusiva para glucoproteínas.
Glucoproteína -> Asialoglucoproteína -> (Receptores de asialoglucoproteínas de las
células hepáticas) -> Lisosomas (Degradadas por proteasas lisosómicas).
la degradación de glucoproteinas ocurre en los lisosomas.
El receptor celular para la degradación de glucoproteínas es el receptor de
Asialoglucoproteínas.
Degradación dependiente de ATP y ubiquitina: La degradación de las proteínas
reguladoras con vidas medias cortas y de proteínas anormales, tienen lugar en el citosol;
requieren de ATP y ubiquitina. La ubiquitina es un polipéptido pequeño que se dirige a
muchas proteínas intracelulares para su degradación. La ubiquitina es un marcador de la
muerte.
en las reacciones implicadas en la unión de ubiquitina a las proteínas hay tres enzimas
involucradas:
- E1: Enzima activadora. - E2: Enzima transferasa. - E3: Enzima ligasa.
Los residuos amino terminales Met o Ser retardan la ubiquitinación, los residuos
terminales Asp o Arg la aceleran. Las proteínas solubles se someten a
poliubiquitinación (unión, catalizada por ligasa, de cuatro o más moléculas adicionales
de ubiquitina).
La degradación de las proteínas marcadas con ubiquitina tiene lugar en el proteosoma;
para la degradación, una proteína debe ingresar primero en el poro central.
El intercambio interrogarnos mantiene niveles circundantes de aminoácidos:
El músculo genera más de la mitad del conjunto corporal total de aminoácidos libres. ·
El hígado es el sitio necesario de las enzimas del ciclo de la urea para eliminar el exceso
de nitrógeno. La tasa de gluconeogénesis hepática por alanina es la más alta de todos los
aminoácidos. Después de una comida rica en proteínas, los tejidos esplácnicos liberan
aminoácidos, mientras que los tejidos periféricos extraen aminoácidos; son aminoácidos
de cadena ramificada.
En estado de ayuno, proporcionan al cerebro una fuente de energía (valina).
Ciclo de la glucosa-alanina:
La alanina se sintetiza en el músculo mediante la transaminación de piruvato (derivado
de glucosa), la alanina se libera en el torrente sanguíneo y es absorbida por el hígado.
En el hígado, la alanina se reconvierte en glucosa y se libera en el torrente sanguíneo
para repetir el ciclo. La alanina sufre una desamidación reductiva y el -H2N se convierte
en urea, que no es tóxica.
Los animales convierten el nitrógeno alfa-amino en productos finales variados: Los
humanos son ureotélicos, es decir, que excretan urea no tóxica; la urea es altamente
soluble en agua.
 Biosíntesis de la Urea:
Se produce en cuatro etapas:
1- Transaminación. 2- Desaminación oxidativa del glu. 3- Transporte del amoniaco. 4-
Rx. del ciclo de la urea.
Es importante saber que la expresión de los ARN de las enzimas del ciclo de la urea
aumenta varias veces en la inanición, debido a una degradación proteica incrementada
para proporcionar energía.
La transaminación transfiere nitrógeno alfa-amino a alfa-cetoglutarado, formando
glutamato.
Las rx. de transaminación interconvierten pares de alfa-aminoácidos y alfa-cetoácidos;
todos los aminoácidos comunes participan en la transaminación, excepto: L, P, HP, T.
Lisina, prolina, hidroxiprolina y treonina.
Alanina-Piruvato aminotransferasa: Piruvato -> Alanina.
Glutamato-Alfa-cetoglutarato: Alfa-cetoglutarado -> Alanina.
Como la alanina es también un sustrato para la glutamato aminotransferasa, el nitrógeno
alfa-amino de todos los aminoácidos, el nitrógeno alfa-amino de todos los aminoácidos
que se someten a la transaminación se puede concentrar en glutamato.
Es importante porque el glutamato es el único a.a que se somete a desaminación
oxidativa a un ritmo apreciable en tejidos de mamíferos.
La formación de amoniaco a partir de los grupos alfa-amino se produce principalmente
a través del nitrógeno alfa-amino del L-glutamato.
La transaminación se produce a través de un mecanismo de “ping-pong”, en donde se
reconoce un patrón de adición alternativa de un sustrato y la liberación de un producto.
La piridoxal fosfato (PLP), derivado de la Vit. B6, está presente en el sitio activo de
todas las aminotransferasas y desempeña un papel clave en la catálisis; durante la
transaminación, la piridoxal fosfato actúa como un “portador” de grupos amino.
La L-glutamato deshidrogenasa ocupa una posición central en el metabolismo del
nitrógeno.
La L-glutamato deshidrogenasa hepática puede usar NAD+ o NADP+ y liberea
nitrógeno en forma de amoniaco. alfa-cetoglutarato ----> L-glutamato.
La actividad de la GDH (Glutamato deshidrogenasa) es inhibida alostéricamente por
ATP, GTP y NADH, y se activa mediante ADP.
Las oxidasas de aminoácidos retiran el nitrógeno como amoniaco:
La aminoácido oxisada del hígado y riñón convierte un aminoácido en un alfa-
iminoácido que se descompone en un alfa-cetoácido con liberación de iones de amonio.
La flavina reducida se reoxida por el oxígeno molecular, formando H2O2 que luego se
divide en O2 y H2O por la catalasa.
La intoxicación por amoniaco es de peligro para la vida: El amoniaco se elimina
rápidamente de la circulación por el hígado y se convierte en urea; el amoniaco es
tóxico para el SNC.
La glutamina sintetasa estabiliza el amoniaco como glutamina:
La formación de glutamina es catalizada por la glutamina sintetasa mitocondrial; la
glutamina sirve como transportador de nitrógeno, carbono y energía entre los órganos,
desempeña un papel principal en la desintoxicación del amoniaco, así como en la
homeostasis ácido-base.
Cuando existe deficiencia de glutamina sintetasa en neonatos, estos adquieren daño
cerebral severo, falla multiorgánica y la muerte.
Glutaminasa y asparaginasa: Desamidato de glutamina y asparagina (Hay dos
isoformas humanas de glutaminasa mitocondrial):
1- Glutaminasa hepática: Aumentan en respuesta a la ingesta alta de proteínas.
2- Glutaminasa renal: Aumenta en la acidosis metabólica; altas concentraciones de
amoniaco en los túbulos renales, llega a producirse una acidosis metabólica.
La asparaginasa pasa de asparagina a aspartato.
La formación y secreción de amoniaco mantiene el equilibrio ácido-base:
La producción de amoniaco a partir de aminoácidos renales intracelulares,
especialmente glutamina, aumenta la acidosis metabólica y disminuye la alcalosis
metabólica.
La urea es el principal producto final del catabolismo del nitrógeno en humanos:
- La síntesis de 1 mol de urea requiere:
- 3 mol de ATP.
- 1 mol de amonio y aspartato.
- 5 enzimas.
El N-Acetilglutamato funciona únicamente como un activador enzimático.
El principal papel metabólico de la ornitina, la citrulina y el argininosucciato es la
síntesis de urea.
No hay pérdida o ganancia neta de ornitina, citrulina, argininosuccinato o arginina.
El carbamil fosfato sintetasa I inicia la biosíntesis de la urea:
La condensación de CO2, NH4+ y ATP, forma carbamil fosfato y está catalizada por la
carbamil fosfato sintetasa I.
La carbamil fosfato sintetasa I es la enzima limitante de la velocidad del ciclo de la
urea, y es solamente activada si existe N-acetilglutamato.
La síntesis de carbamil fosfato requiere dos moles de ATP y tiene como producto
restante adicional, dos moles de ADP y uno de Pi.
El carbamil fosfato + ornitina forma citrulina:
La L-ornitina transcarbamilasa, u ornitina carbamil transferasa, cataliza la rx. entre
carbamil fosfato y ornitina, formando citrulina; la citrulina es la primera molécula que
sale del ciclo de la mitocondria en el ciclo de la urea.
La entrada de la ornitina en las mitocondrias y la salida de las citrulinas, involucran
permeasas de la m.i.m.
La citrulina + aspartato forma argininosuccinato:
La argininosuccinato sintetasa vincula el aspartato y la citrulina, añadiendo el segundo
nitrógeno de la urea, formando argininosuccinato; la rx. requiere Mg y ATP y tiene un
intermediario: citrulil-AMP.
La escisión de argininosuccinato forma arginina y fumarato:
Catalizada por la argininosuccinato liasa; cuando el fumarato se forma, se le agrega
agua para formar L-Malato (fumarasa) y recordemos que el malato al oxidarse forma
oxaloacetato (malato deshidrogenasa), este oxaloacetato se transamina y reforma
aspartato, o bien, de oxaloacetato a FEP y produce glucosa (gluconeogénesis).
La división de la arginina libera urea y reordena la ornitina:
La arginina sufre una hidrólisis mediante la arginasa hepática, liberando urea y ornitina;
la ornitina vuelve a las mitocondrias del hígado y se repite el ciclo.
La ornitina y la lisina son potentes inhibidores de la arginasa (inhibición por
retroalimentación y alostérica, respectivamente); la arginina es precursor del NO (óxido
nítrico), rx. catalizada por la NO sintetasa.
La carbamil fosfato sintetasa I es la enzima marcapasos del ciclo de la urea:
La actividad de la CFS I está determinada por el N-acetilglutamato, ¿cómo se forma el
Nacetil glutamato? Mediante la enzima N-acetilglutamato sintetasa.
Acetil-CoA + Glutamato ----> N-Acetilglutamato + CoASH.
N-Acetilglutamato + H2O ----> Glutamato + Acetato.
La inanición eleva los niveles de enzimas para hacer frente a la producción de amoniaco
debido a la degradación protéica inducida por inanición.
Características generales de los trastornos metabólicos:
Los trastornos metabólicos asociados con las enzimas de la biosíntesis de urea ilustran
los principios generales de las patologías metabólicas hereditarias.
- Signos y Síntomas clínicos similares o idénticos.
 - El dx definitivo implica un análisis cuantitativo de la actividad de la enzima
sospechosa de tener defectos.
Los trastornos metabólicos están asociados a cada rx. del ciclo de la urea:
Cinco enfermedades bien documentadas representan defectos en la biosíntesis de las
enzimas del ciclo de la urea.
Ciclo de la urea
Matriz mitocondrial
1- El amonio que se libera por desaminación oxidativa se condensa con el CO2
para sintetizar Carbamil fosfato, por medio de la enzima carbamil fosfato
sintetasa1 cuyo activador alostérico es N-acetil glutamato. Para ésta rx se
utilizan 2 ATP.
2- El carbamil fosfato se condensa con la ornitina para formar citrulina, por medio
de la enzima ornitina carbamil transferasa.
Citosol hepático
3- La citrulina sale de la mitocondria y en el citosol recibe un amonio desde un
aspartato formando argininosuccinato, por medio de la enzima argininosuccinato
sintetasa. Para ésta rx se utiliza 1 ATP
4- El argininosuccinato se divide y forma fumarato y arginina, ésta rx la cataliza la
enzima argininosuccinatoliasa.
5- La arginina se dividirá y formará ornitina y urea por medio de la enzima
arginasa hepática
 Conclusión
En conclusión, el metabolismo de las proteinas se da porque las proteinas ingeridas
se degradan en aminoácidos mediante el proceso digestivas y las proteínas se
degradan por medio de vías tanto dependientes, como independientes, de ATP. La
ubiquitina establece como objetivo muchas proteínas intracelulares para
degradación. Los receptores de superficie celular hepáticos se unen a
asialoglucoproteínas circulantes destinadas para degradación lisosómica, y las
internalizan. Y que la transaminación canaliza el nitrógeno de aminoácidos hacia
glutamato. La lglutamato deshidrogenasa (GDH) ocupa una posición fundamental
en el metabolismo del nitrógeno.
References
file:///C:/Users/user/Desktop/semestre%201-2022/Bioquimica/HARPER%20BIOQ%2029TH.pdf

https://es.m.wikipedia.org/wiki/S%C3%ADntesis_de_novo

https://www.ecured.cu/Pool_de_aminoácidos