Está en la página 1de 13

Universidad Nacional

Autónoma De México

Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán

Carrera: Bioquímica Diagnóstica

Clave: 10569

Bioinformática Grupo 1051

“BLAST REPORTE”

Alumna: León Rodríguez Liliana Isabel

Profesora:
BQD. Larisa Andrea González Salcedo

Fecha de entrega de reporte: 6 de Noviembre del 2020


Característica Imagen Descripción
Secuencia nucleotídica contra bases de datos nucleotídicas

Se puede observar el
resultado para el
alineamiento del gen ESR1 y
la secuencia query que se
introdujo, donde se aprecia
Graphic que el color rojo es el que
Summary más abunda, por lo tanto la
evaluación y tamaño de los
nucleótidos que son
parecidos es mayor o igual a
200.
Se puede observar que la
secuencia que presenta
mayor similitud es la de
Homo sapiens estrogen
receptor 1 (ESR1), transcript
variant X6, mRNA y la que
posee menor similitud es
Macaca mulatta estrogen
receptor 1 (ESR1), transcript
variant X5, mRNA, esto se
Descriptions puede confirmar en las
columnas de lado derecho,
ya que se muestran los
puntajes para la similitud.
El nombre de la secuencia
es PREDICTED: Homo
sapiens estrogen receptor 1
(ESR1), transcript variant
X6, mRNA, su longitud es de
6260 y es la que presenta la
mayor similitud, por lo tanto
se puede observar que no
presenta ausencia de
nucleótidos.

Alignments

Análisis de dos secuencias nucleotídicas


Con respecto al puntaje de
Alignment alineamientos se puede
Scores decir que la cantidad de
nucleótidos que coinciden es
mayor o igual a 200.

Se observó que en tres


partes de la secuencia
nucleotídica Query hay
PREDICTED: Citocinas, mientras que en
Macaca mulatta Subject hay Timinas, así que
estrogen se puede decir que hay una
receptor 1 transición en la especie
(ESR1), Macaca mulatta y puede
transcript variant afectar a la síntesis del
X5, mRNA ARNm y, posteriormente, a
la fabricación de proteínas.
Su identidad es del 96% y en
cuanto a Gaps del 0%.

Se observó que en una parte


de la secuencia nucleotídica
Query hay una Citosina,
mientras que en Subject hay
Timina, así que se puede
PREDICTED: decir que hay una transición
en la especie Macaca
Macaca mulatta
mulatta y puede afectar a la
estrogen receptor síntesis del ARNm y,
1 (ESR1), posteriormente, a la
transcript variant fabricación de proteínas.
X1, mRNA Su identidad es del 96% y en
cuanto a Gaps del 0%.

Secuencia de proteína contra bases de proteínas


Se puede observar el
resultado para el
alineamiento del gen ESR1 y
la secuencia query, así como
los dominios de la proteína y
la clasificación de la misma,
en este caso sus dominios
son:
● Oest_recept
● NR_DBD_like
Graphic
summary También se observan las
secuencias de alineamiento
donde se aprecia que el
color rojo es el que más
abunda, por lo tanto la
evaluación y tamaño de los
nucleótidos que son
parecidos es mayor o igual a
200.
En la imagen se muestran
solo algunas de las 100
secuencias que se
encontraron de la proteína,
teniendo a 80 kDa estrogen
receptor [Homo sapiens]
como la que tiene mayor
similitud y a PREDICTED:
Descriptions estrogen receptor isoform X2
[Panthera pardus] con menor
similitud.
El nombre de la secuencia
es estrogen receptor isoform
1 [Homo sapiens], su
longitud es de 595 y es la
que presenta la mayor
similitud, por lo tanto se
puede observar que no
presenta ausencia de
nucleótidos, de igual manera
se presentan las cadenas o
secuencias de aminoácidos
textualmente, comparando la
secuencia Query con la
Subject.

Alignments
Análisis de dos secuencias proteicas

Con respecto al puntaje de


Alignment alineamientos se puede
Scores decir que la cantidad de
nucleótidos que coinciden es
mayor o igual a 200.

En esta secuencia aparecen


Estrogen unas cruces que significa
receptor [Papio que el aminoácido en Query
anubis] es parecido a los que están
en subject y a esto se le
llama conservación, esto es
en la especie Papio anubis.
Su identidad es del 99% y en
cuanto a Gaps 0%.

En esta secuencia aparecen


unas cruces en Query, al
igual que unos espacios, las
Estrogen cruces quieren decir que en
receptor isoform subject hay aminoácidos
X2 parecidos y los espacios
[Neomonachus significan que no tienen
schauinslandi] nada en común, esto es la
especie de Neomonachus
schauinslandi que es una
foca. Su identidad es del
99% y en cuanto a Gaps 0%.

Secuencia nucleotídica contra base de proteínas o contra una secuencia de proteínas (tblastn)
Se puede observar el
alineamiento del gen ESR1,
donde se aprecia que el
color rojo es el que más
abunda, por lo tanto la
evaluación y tamaño de los
nucleótidos que son
parecidos es mayor o igual a
200.

Graphic
Summary
En la imagen se muestran
solo algunas de las 100
secuencias que se
encontraron de la proteína,
teniendo a Homo sapiens
ESR1 mRNA for human
estrogen receptor alpha
splice variant, ERalphai45c,
complete cds como la que
Descriptions tiene mayor similitud y a
PREDICTED: Panthera
pardus estrogen receptor 1
(ESR1), transcript variant
X2, mRNA con menor
similitud.
El nombre de la secuencia
es Homo sapiens ESR1
mRNA for human estrogen
receptor alpha splice variant,
ERalphai45c, complete cds,
su longitud es de 1279 y es
la que presenta la mayor
Alignments similitud, por lo tanto se
puede observar que no
presenta ausencia de
nucleótidos, de igual manera
se presentan las cadenas o
secuencias de aminoácidos
textualmente, comparando la
secuencia Query con la
Subject.

También podría gustarte