TEMA # 8

AMINOACIDOS
_Estructura y Estereoquímica de los
aminoácidos
_Propiedades acido-base de los aminoácidos
_Punto Isoeléctrico y electroforesis
_ Síntesis de aminoácidos

Lic. Iván Maldonado Suarez

 INTRODUCCION
Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en los animales que
desempeñan funciones importantes tanto en estructura como funcionales importantes.
Las proteínas son biopolímeros de los α-aminoácidos, llamados así debido a que el
grupo amino está enlazado al átomo de carbono a adyacente al grupo carbonilo.

Las propiedades físicas y químicas de una proteína están determinadas por los
aminoácidos que la constituyen. Las subunidades individuales de los aminoácidos se
unen por medio de enlaces de amida llamados enlaces peptídicos. El grupo amino de
un aminoácido se une al grupo acido carboxílico de otro aminoácido, al unirse se pierde
una molécula de agua (deshidratación) y la formación del grupo amida.
 TIPOS DE FUNCIONES DE PROTEINAS
Las proteínas tienen una sorprendente variedad de propiedades estructurales y
catalíticas como resultado de sus diversas composiciones de aminoácidos. Debido a su
versatilidad, las proteínas desempeñan diversas funciones asombrosas en los
organismos vivos.

Las funciones de las proteínas en muchos casos son vitales e indispensables para los
seres vivos (regulación, catálisis, funcionales, estructurales, metabolicas, etc..)
ESTRUCTURA Y ESTEREOQUIMICA DE AMINOACIDOS
El término aminoácido podría significar cualquier molécula que contenga un grupo
amino y cualquier tipo de grupo ácido; sin embargo, el término casi siempre se usa
para referirse a un ácido carboxílico α-amino. (la denominación α-amino se refiere a la
ubicación del grupo amino, α es la numeración con alfabeto griego alternativa que
tienen los ácidos carboxílicos, numeración α es el carbono # 2 de la cadena principal.

Con excepción de la glicina, todos los demás α-aminoácidos son quirales. En todos los
aminoácidos quirales, el centro de quiralidad es el átomo de carbono asimétrico. La
mayor parte de los aminoácidos que se encuentran en forma natural tienen la
configuración (S) en el átomo de carbono.
La proyección de Fischer del enantiómero (S) de la alanina, con la cadena de carbonos
a lo largo de la vertical y el carbono del grupo carbonilo en la parte superior. Observe
que la configuración de la (S)-alanina es similar a la del L-()- gliceraldehído, con el
grupo amino a la izquierda en la proyección de Fischer
 MOMENTO DE RECORDAR
CARBONO QUIRAL.- Se refiere al carbono que tiene sus 4 enlaces unidos a 4 grupos
diferentes, también llamado carbono asimétrico (debido a que al tener 4 grupos
diferentes unidos a este carbono, si quisiéramos partir esa molécula a través de ese
carbono quiral NUNCA obtendríamos 2 fragmentos iguales de la molécula ASIMETRIA),
solo si 2 o mas grupos del carbono son iguales presenta simetría.

Cuando el carbono tiene un doble enlace con algún átomo o grupo eso es equivalente
como si ese carbono tuviera 2 enlaces simples con el mismo grupo, lo cual significa
que el carbono tiene 2 grupos iguales, no seria quiral
Un átomo de carbono no es quiral cuando tiene plano de simetria (se puede dividir en
2 partes iguales)
 MOMENTO DE RECORDAR
CONFIGURACION ‟R Y S” EN PROYECCION DE FISCHER.- Para dar notación R o S en
proyecciones de Fischer se siguen las mismas reglas que para una molécula
representada en el espacio.
1. Se clasifican por prioridades los 4 grupos unidos al carbono quiral, lo cual
dependerá del tamaño (numero atomico) del atomo (mayor tamaño del atomo mayor
prioridad) de cada grupo que se une directamente al carbono quiral.
2. Se gira comenzando por el grupo de prioridad (a o 1ra prioridad) hacia (b o 2da
prioridad) y (c o 3ra prioridad). Si el grupo (d o 4ta prioridad) se encuentra en la linea
vertical, el giro en el sentido de las agujas da notación R y el giro en sentido contrario
a las agujas S. Cuando el grupo (d) se encuentra en la horizontal es lo contrario.

Aunque los D-aminoácidos en ocasiones se encuentran en la naturaleza, asumiremos

que en general los aminoácidos que se discutirán más adelante son los L-aminoácidos
comunes, Los enantiómeros D pueden ser incluso tóxicos. Recuerde una vez más que
la nomenclatura D y L, así como los descriptores R y S, dan la configuración del átomo
de carbono asimétrico. Esto no implica al signo de la rotación óptica, (+) o (-), el cual
se debe determinar de manera experimental. Los aminoácidos combinan muchas de
las propiedades
 AMINOACIDOS ESTANDARES
Los aminoácidos estándar son los 20 a-aminoácidos comunes que se encuentran en
casi todas las proteínas. Los aminoácidos estándar difieren entre sí en la estructura de
las cadenas laterales unidas a sus átomos de carbono a. Todos los aminoácidos
estándar son L-aminoácidos.
El siguiente grafico muestra los 20 aminoácidos estándar, agrupados de acuerdo con
las propiedades
AMONIACIDOS ESTANDARES
 AMINOACIDOS ESENCIALES
Los humanos pueden sintetizar casi la mitad de los aminoácidos necesarios para
formar proteínas.
Otros aminoácidos, llamados aminoácidos esenciales, (son los que no se pueden
sintetizar en nuestro organismo) deben suministrarse en la dieta. Los diez aminoácidos
esenciales, marcados con asterisco (*), son los siguientes:
Arginina (Arg) Valina (Val) Metionina (Met) Leucina (Leu) Treonina (Tre) Fenilalanina
(Fen) Histidina (His) Isoleucina (Ile) Lisina (Lis) Triptófano (Trp)
A las proteínas que proveen todos los aminoácidos esenciales en las proporciones casi
correctas para la nutrición humana se les llaman proteínas completas. Estas proteínas
completas son aquellas que se encuentran en la carne, pescado, leche y huevos.
Alrededor de 50 g de proteína completa por día es lo adecuado para los humanos
adultos.
A las proteínas que son bastante deficientes en uno o más de los aminoácidos
esenciales se les llaman proteínas incompletas. Si la proteína en la dieta de una
persona proviene principalmente de una fuente incompleta, la cantidad de proteína
humana que puede sintetizarse está limitada por las cantidades de los aminoácidos
deficientes. Las proteínas de las plantas por lo general son proteínas incompletas. El
arroz, el maíz y el trigo son deficientes en lisina. El arroz también carece de treonina y
el maíz carece de triptófano. El frijol, los guisantes y otras leguminosas son las que
tienen proteínas más completas entre las plantas comunes, pero son deficientes en
metionina.
 AMONIACIDOS RAROS
Además de los aminoácidos estándar, en las proteínas se encuentran otros
aminoácidos en cantidades menores. Por ejemplo, la 4-hidroxiprolina y la 5-
hidroxilisina son versiones hidroxiladas de los aminoácidos estándar. Se les llaman
aminoácidos raros, aun cuando es común encontrarlos en el colágeno.

Algunos de los enantiómero D de los aminoácidos menos comunes se encuentran

también en la naturaleza. Por ejemplo, el ácido D-glutámico se encuentra en las
paredes celulares de muchas bacterias y la D-serina se encuentra en las lombrices de
tierra. Algunos aminoácidos de estado natural no son a-aminoácidos: el ácido γ-
aminobutírico (GABA) es uno de los neurotransmisores en el cerebro y la β-alanina es
un constituyente del ácido pantoténico que es una vitamina.
 PROPIEDADES ACIDOS-BASE DE AMINOACIDOS
Aunque por lo regular escribimos los aminoácidos con un grupo carboxilo (-COOH) y el
grupo amino (-NH2) intactos, su estructura real es iónica y depende del pH. El grupo
carboxilo pierde un protón, formando un ion carboxilato, y el grupo amino es
protonado a un ion amonio. A esta estructura se le llama ion dipolar o zwitterion (del
alemán “ion dipolar”).

La naturaleza dipolar de los aminoácidos proporciona algunas propiedades poco

usuales:
1.- Los aminoácidos tienen puntos de fusión altos, por lo general arriba de los 200 °C.

2.- Los aminoácidos son más solubles en agua que en éter, diclorometano y otros
disolventes orgánicos comunes.
3.- Los aminoácidos tienen momentos dipolares mayores (m) que las aminas o los
ácidos sencillos.
 PROPIEDADES ACIDOS-BASE DE AMINOACIDOS
4.- Los aminoácidos son menos ácidos que la mayoría de los ácidos carboxílicos y
menos básicos que la mayoría de las aminas. De hecho, la parte ácida de la molécula
de aminoácido es el grupo -NH3 ⁺ no un grupo -COOH. La parte básica es el grupo -
COO⁻, y no el grupo -NH2 libre.

5.- Debido a que los aminoácidos contienen tanto grupos ácidos (-NH3 ) como grupos
básicos (-COO), son anfotéricos (tienen propiedades ácidas y básicas).
6.- Un aminoácido tiene una carga positiva en una disolución ácida (pH bajo) y una
carga negativa en una disolución básica (pH alto) Debe haber un pH intermedio donde
el aminoácido esté balanceado de igual manera entre las dos formas, como el
zwitterion dipolar con una carga neta de cero. A este pH se le llama pH isoeléctrico o
punto isoeléctrico
 PROPIEDADES ACIDOS-BASE DE AMINOACIDOS
Las cadenas laterales del ácido aspártico y el ácido glutámico contienen
grupos carboxílicos ácidos. Estos aminoácidos tienen puntos isoeléctricos
ácidos de alrededor de un pH de 3. Se necesita una disolución ácida para
evitar la desprotonación del segundo grupo ácido carboxílico y para mantener
el aminoácido en un estado isoeléctrico neutro.
Los aminoácidos básicos (histidina, lisina y arginina) tienen puntos
isoeléctricos a valores de pH de 7.6, 9.7 y 10.8, respectivamente. Estos valores
reflejan la basicidad débil del anillo de imidazol, la basicidad intermedia de un
grupo amino y la basicidad fuerte del grupo guanidino.
Se necesita una disolución básica en cada caso para prevenir la protonación
de la cadena lateral básica para mantener el aminoácido eléctricamente
neutro.
Los demás aminoácidos se consideran neutros, sin cadenas laterales muy
ácidas o básicas. Sus puntos isoeléctricos son ligeramente ácidos (de
alrededor de 5 a 6) debido a que el grupo -NH3 es ligeramente más ácido que
el grupo básico -COO.
 ELECTROFORESIS
La electroforesis usa las diferencias en los puntos isoeléctricos para separar mezclas
de aminoácidos. Se coloca una banda de la mezcla de aminoácidos en el centro de una
capa de gel de acrilamida o de una pieza de papel filtro mojado con una disolución
reguladora.
Se colocan dos electrodos en contacto con los bordes del gel o papel y se aplica un
potencial de varios miles de volts a través de los electrodos. Los aminoácidos con
carga positiva (catiónicos) son atraídos al electrodo negativo (el cátodo) y los
aminoácidos con carga negativa (aniónicos) son atraídos al electrodo positivo (el
ánodo). Un aminoácido en su punto isoeléctrico no tiene carga neta, por lo que no se
mueve.
 ELECTROFORESIS
Utilizando como ejemplo considere una mezcla de alanina, lisina y ácido aspártico en
una disolución reguladora a un pH de 6. La alanina está en su punto isoeléctrico, en su
forma zwitteriónica dipolar con una carga neta de cero. Un pH de 6 es más ácido que
el pH isoeléctrico para la lisina (9.7), por lo que la lisina está en la forma catiónica. El
ácido aspártico tiene un pH isoeléctrico de 2.8, por lo que está en la forma aniónica.

Cuando se aplica un voltaje a una mezcla de alanina, lisina y ácido aspártico a un pH

de 6, la alanina no se mueve. La lisina se mueve hacia el cátodo con carga negativa y el
ácido aspártico se mueve hacia el ánodo con carga positiva. Después de un periodo,
los aminoácidos separados se recuperan cortando el papel o raspando las bandas del
gel. Si la electroforesis se está usando como una técnica analítica (para determinar los
aminoácidos presentes en la mezcla), el papel o el gel se trata con un reactivo como la
ninhidrina para hacer que las bandas sean visibles.
 CLASIFICACION DE PROTEINAS
Las proteínas se pueden clasificar de acuerdo con su composición química, su forma o
su función.
Las proteínas se agrupan en proteínas sencillas y conjugadas de acuerdo con su
composición química Las proteínas sencillas son aquellas que se hidrolizan para
formar sólo aminoácidos. Todas las estructuras de las proteínas que hemos
considerado hasta ahora son proteínas sencillas. Ejemplos son la insulina, la
ribonucleasa, la oxitocina y la bradicinina.
Las proteínas conjugadas están unidas a un grupo prostético no proteínico como un
azúcar, un ácido nucleico, un lípido o algún otro grupo.

Las proteínas se clasifican como fibrosas o globulares dependiendo de si forman

filamentos largos o se enrollan sobre sí mismas. Las proteínas fibrosas están llenas de
hebras, son duras y por lo general son insolubles en agua. Funcionan principalmente
como las partes estructurales del organismo. Algunos ejemplos de proteínas fibrosas
son la a-queratina en las las uñas y pezuñas, y el colágeno en los tendones.
Las proteínas globulares se pliegan en formas aproximadamente esféricas. Por lo
regular funcionan como enzimas, hormonas o proteínas transportadoras
PROTEINAS GLOBULARES Y FIBROSAS
 ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS
La estructura primaria es la estructura enlazada de manera covalente
de la molécula. Esta definición incluye la secuencia de los aminoácidos,
junto con cualquier puente disulfuro. Todas las propiedades de la
proteína están determinadas, de manera directa o indirecta, por la
estructura primaria, Cualquier plegado, puente de hidrógeno o
actividad catalítica depende de la estructura primaria apropiada.
Para comprender la estructura secundaria, aunque creemos que las
cadenas de péptido como estructuras lineales, éstas tienden a formar
arreglos ordenados enlazados por puentes de hidrógeno. En particular,
los átomos de oxígeno del grupo carbonilo forman enlaces por puentes
de hidrógeno con los hidrogeno de las amida (N-H). Esta tendencia
conduce a patrones ordenados del enlace por puente de hidrógeno:
hélice α y hoja plegada. A estos arreglos enlazados por puentes de
hidrógeno, si se presentan, se les llaman estructura secundaria de la
proteína.
Una proteína puede o no tener la misma estructura secundaria a lo
largo de su cadena (de extremo a extremo). Algunas partes pueden
enrollarse en una hélice a, mientras que otras partes se alinean en una
hoja plegada
 ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS
La estructura terciaria de una proteína es su conformación tridimensional completa.
Piense en la estructura secundaria como un patrón espacial en una región local de la
molécula. Partes de la proteína pueden tener la estructura de hélice α, mientras que
otras pueden tener la estructura de hoja plegada, y otras partes pueden ser enrollados
aleatorios. La estructura terciaria incluye todas las estructuras secundarias y todos los
dobleces y plegados entre ellas.
La estructura cuaternaria se refiere a la asociación de dos o más cadenas de péptido
en la proteína completa. No todas las proteínas tienen estructura cuaternaria. Las que
la tienen son aquellas que se asocian entre sí en su forma activa. Por ejemplo, la
hemoglobina, la transportadora del oxígeno en la sangre de los mamíferos, consiste en
cuatro cadenas de péptido conjugadas entre sí para formar una proteína globular
 REACCIONES DE SINTESIS DE AMINOACIDOS
AMINACION REDUCTICA
La aminación reductiva de cetonas y aldehídos es uno de los mejores métodos para la
síntesis de aminas. También forma aminoácidos. Cuando se trata un α-cetoácido con
amoniaco y como catalizador paladio, la cetona reacciona para formar una imina. La
imina se reduce a una amina por el hidrógeno y un catalizador de paladio. En estas
condiciones, el ácido carboxílico no se reduce.

El producto es un a-aminoácido racémico.

Llamamos a la aminación reductiva síntesis biomimética (“que imita el proceso
biológico”), debido a que se asemeja a la síntesis biológica de los aminoácidos.
La reacción con la aminación reductiva de un ácido α -cetoglutárico (un intermediario
en el metabolismo de los carbohidratos), usando el ion amonio como el agente de
aminación y el NADH como el agente reductor.
 AMINACION DE UN α-HALOACIDO
La reacción de Hell-Volhard-Zelinsky es un método efectivo para introducir bromo en
la posición α de un ácido carboxílico. El α-bromoácido racémico se convierte a un α -
aminoácido racémico por medio de la aminación directa, usando un gran exceso de
amoniaco.

SINTESIS DE STRECKER
La primera síntesis conocida de un aminoácido ocurrió en 1850 en el laboratorio de
Adolph Strecker en Tübingen, Alemania. Strecker adicionó acetaldehído a una
disolución acuosa de amoniaco y HCN. El producto fue un α-aminopropionitrilo, el
cual Strecker hidrolizó a alanina racémica.

La síntesis de Strecker puede formar un gran número de aminoácidos a partir de los

aldehídos apropiados. El mecanismo se muestra a continuación. Primero, el aldehído
reacciona con amoniaco para formar una imina. La imina es un análogo de nitrógeno
de un grupo carbonilo y es electrofílica cuando se protona. El ataque del ion cianuro
en la imina protonada forma un α-aminonitrilo