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Clases de aminoácidos
Dado que la secuencia de aminoácidos determina la configuración tridimensional final de
cada proteína, sus estructuras se analizan detalladamente en las siguientes cuatro
subsecciones. Los aminoácidos se pueden clasificar según su capacidad para interactuar con
el agua. Utilizando este criterio, pueden distinguirse cuatro clases: (1) apolares, (2) polares,
(3) ácidos y (4) básicos.
AMINOÁCIDOS APOLARES: Los aminoácidos apolares contienen principalmente
grupos R hidrocarbonados sin cargas positivas o negativas. Dado que interactúan poco con
el agua, los aminoácidos apolares (p. ej., hidrófobos) tienen un cometido importante en el
mantenimiento de la estructura tridimensional de las proteínas. En este grupo se encuentran
dos tipos de hidrocarburos en las cadenas R: las aromáticas y las alifáticas. Los
hidrocarburos aromáticos contienen estructuras cíclicas que los constituyen en una clase de
hidrocarburos insaturados con nubes electrónicas π conjugadas. El benceno es uno de los
hidrocarburos aromáticos más simples. El término alifático se refiere a hidrocarburos no
aromáticos, como el metano y el ciclohexano. La fenilalanina y el triptófano contienen
estructuras de anillo aromático. La glicina, la alanina, la valina, la leucina, la isoleucina y la
prolina poseen grupos R alifáticos. En las cadenas laterales alifáticas de la metionina hay
un átomo de azufre. La metionina contiene un grupo tioéter (—S—CH3) en su cadena
lateral. Su derivado, la adenosilmetionina S (SAM), es un importante metabolito que sirve
como donador de metilo en numerosas reacciones bioquímicas.
Se llama aminoácidos no esenciales a todos los aminoácidos que el cuerpo puede sintetizar, y
que no precisa de ingesta directa en una dieta. En humanos se han descrito estos
aminoácidos no esenciales para la nutrición