Temas 14.

Estructura y función de los ácidos nucleicos

 Composición química: azúcares, fosfato y bases nitrogenadas

 Estructura y propiedades de las bases púricas y pirimidínicas

 Nucleósidos y nucleótidos

 Estructura de los ácidos nucleicos. DNA y RNA

 Ácidos Nucleicos

 El DNA es el constituyente primario de los cromosomas de las células y es

el portador del mensaje genético.

 La función del RNA es transcribir el mensaje genético presente en el DNA

y traducirlo a proteínas.

 Las proteínas son las moléculas que finalmente ejecutarán las

"instrucciones" codificadas en los ácidos nucleicos.

Dogma central de la Biología Molecular

 Componentes de los ácidos nucleicos

Fosfato(s) ácido
Nucleótido +
Azúcar neutro
Nucleósido +
Base Nitrogenada básico

Componente ácido: Fosfatos

Ácido ortofosfórico
 Componentes de los nucleótidos

Componente neutro: Azúcares

Ribosa Desoxirribosa
 Componentes de los nucleótidos

Componente básico: Bases Nitrogenadas

pirimidina imidazol

Pirimidina Purina
 Componentes de los ácidos nucleicos
Componente básico: Bases Nitrogenadas
• Bases Purínicas (o Púricas)
pirimidina imidazol
NH2 O

NH2

• Bases Pirimidínicas

O NH2 O

CH3

O O O
 Propiedades fisicoquímicas de las bases nitrogenadas

 Existencia de dipolos

 Hidrofobicidad

 Disposición coplanar de los enlaces de cada anillo (C-N y C-C)

 Tautomería o isomería dinámica H

N
H
O
4 6 N
3N HN1
1 2 2 9
C N O H
N N N G
 Carácter básico O
H
O
1’ 1’

 Absorción de la luz en el ultravioleta

 Propiedades fisicoquímicas de las bases nitrogenadas

 Absorción de la luz en el ultravioleta

 Debido a su carácter aromático
 Máximo absorción cerca de 260 nm

Bases nitrogenadas Absorción máxima 260 nm

Proteínas Absorción máxima 280 nm

A260 A260
DNA = 1,8 RNA = 2,0
A280 A280
 Otras bases de interés biológico y clínico

Las bases nitrogenadas tienen poco interés bioquímico como sustancias libres, salvo en
las vías biosintéticas y degradativas de los ácidos nucleicos.

El ácido úrico es un derivado púrico que

constituye el producto final de la degradación
de purinas.

Análogos sintéticos, terapia antiviral

Cafeína • Aciclovir (9-(2-hidroximetil)guanina

• Ganciclovir (9-(1,3-dihidroxi-2-proposimetil)guanina

Antitumorales sintéticos
Teofilina • 5-fluorouracilo
 Nucleósidos

Fosfato(s) ácido
Nucleótido +
Azúcar neutro
Nucleósido +
Base Nitrogenada básico

ribosa ribonucleósidos
Azúcar
desoxirribosa desoxirribonucleósidos

Nucleósido enlace N-glicosídico

purínica nucleósidos purínicos

Base Nitrogenada
pirimidínica nucleósidos pirimidínicos
Nucleósidos
 Nucleósidos

 Nucleósidos purínicos  Nucleósidos pirimidínicos

adenosina desoxiadenosina citidina desoxicitidina

guanosina desoxiguanosina uridina Timidina

(desoxitimidina)

Ribonucleósidos Desoxirribonucleósidos Ribonucleósidos Desoxirribonucleósidos

 Nucleósidos

Timidina
citidina desoxicitidina uridina (desoxitimidina)

Otros nucleósidos de interés biológico y clínico

puromicina (antibiótico)
arabinosiladenina (antiviral y anticancerígeno)
AZT - derivado de timina (antirretroviral)
 Nucleótidos

Nucleótido = nucleósido + fosfato(s) = base nitrogenada + azúcar + fosfato(s)

purínica nucleótidos purínicos

Base Nitrogenada
pirimidínica nucleótidos pirimidínicos

enlace N-glicosídico

ribosa ribonucleótidos
enlace(s)
Fosfato(s) fosfato
Azúcar
desoxirribosa desoxirribonucleótidos

nucleósido
Fosfato

desoxiadenosina monofosfato (dAMP)

ácido desoxiadenílico
 Nucleótidos

Nucleósidos-monofosfato componentes del ARN (ribonucleótidos)

Purínicos Pirimidínicos

Nucleósidos-monofosfato componentes del ADN (desoxirribonucleótidos)

Purínicos Pirimidínicos
 Nucleótidos

Nucleósidos-Monofosfato: NMP Nucleósidos-Difosfato: NDP

dAMP
AMP dADP
ADP

Nucleósidos-Trifosfato: NTP

dATP
ATP
 Funciones de los nucleótidos

 Compuestos ricos en energía que participan en intercambios energéticos

ATP ADP

 Actúan como señales químicas  Componentes estructurales de cofactores

e intermediarios metabólicos

AMPc
NAD+

 Constituyentes de los ácidos nucleicos

 Niveles estructurales de los ácidos nucleicos

 Estructura primaria
Polímero lineal formado por la unión de numerosos nucleótidos mediante
enlaces fosfodiéster.

 Estructura secundaria
Disposición espacial relativa de los nucleótidos que se encuentran próximos en
la secuencia.
DNA – Doble cadena polinucleotídicas

RNA – Protuberancias, bucles y horquillas en determinadas regiones

de la molécula

 Estructuras de orden superior

Todas aquellas de orden superior a los niveles primario y secundario.

DNA – Resultantes del superenrollamiento y de la asociación con

proteínas básicas (cromatina, cromosomas).

RNA – Plegamiento tridimensional definido (tRNA).

 Estructura primaria

 Polímeros de nucleótidos unidos mediante

enlaces covalentes 3´- 5´fosfodiéster. 5´

 Secuencia en dirección 5´→ 3´

– base

– base

– base
– base

5’...-P-osa-P-osa-P-osa-P-osa-... 3’
5´

ARN ADN

Ribonucleótidos Desoxirribonucleótidos 3´
Fosfato enlazando los monómeros (enlace fosfodiéster)

Azúcar Ribosa 2’-Desoxirribosa

Adenina, A
Purinas
Guanina, G

Citosina, C
Pirimidinas
Uracilo, U Timina, T 3´ OH
 Estructura primaria

RNA DNA
- -
O A O A
O P O CH2 O
-
Extremo 5’ O P O CH2 O
-
O O

O OH G O G
O P O CH2 O O P O CH2 O
- -
O O

O OH U O T
O P O CH2 O O P O CH2 O
- -
O O

C O
C
O OH

O P O CH2 O O P O CH2 O
- -
O O

OH OH Extremo 3’ OH
 Estructura secundaria

 Cristalografía de rayos X del DNA (1951-1953)

Estudiada por:
• L.Pauling (Caltech)
• M.Wilkins y R.E.Franklin (Londres)
• J.D.Watson y F.H.C.Crick (Cambridge)

Periodicidad a 0,34 nm Estructura helicoidal

(forma en X)
Periodicidad
a 3,4 nm

Watson y Crick elaboraron el modelo de doble hélice

 DNA-B: Doble hélice

 Cada una de las hebras es un polinucleótido entrelazado

3´ 5´ con el otro en sentido antiparalelo

3,4 Å  El eje ribosa-fosfato se sitúa hacia el exterior de la doble

hélice, en contacto con el solvente

 Las bases nitrogenadas se sitúan, apiladas, en planos

aproximadamente perpendiculares al eje de la doble hélice,
hacia el interior de la estructura, en un entorno hidrofóbico.
36 Å

20 Å

5´ 3´
 ADN-B: Complementaridad de las bases nitrogenadas

H H
O N
(H3C) N
4
3N H
N1 6 A
9
T/U 1
N O N N A
O O
1’ 1’
T/U

H H
N O
4
3N HN1 6 N G
1 2 2 9
C N O H
N N N G
H
O O
1’ 1’
C
 DNA-B: Antiparalelismo de las hebras

5’ 3’
O 3´
5´
T A
O O CH2
- P O
O C G
GUANINA CITOSINA -
O P O
CH2 O O
O
G C
O O CH2
- P
O G C
O O
TIMINA ADENINA -
O P O T A
CH2 O O
O

C G
O O CH2
O
- P O
O
CITOSINA GUANINA - A T
O P O
CH2 O O
O
G C
O O CH2
-
O T A
O P O
ADENINA TIMINA -
O P O A T
CH2 O O

5´ 3’ 5’
O
3´
 DNA-B: Polianión

Residuos de pentosa
(hidrofílicos) en la superficie
de la doble hélice
perpendiculares a las bases
Fuerza de unión
por enlace de H

Grupos fosfato (ionizados),

en la superficie de la doble Interacciones
hélice: a pH fisiológico con el agua
el DNA es un polianión

Fuerzas
hidrofóbicas
de apilamiento de
bases
 Distintos tipos DNA

DNA-A DNA-B DNA-Z

los surcos
son más
parecidos
en anchura

Más surco Más

mayor
corta estrecho y larga
profundo
el surco mayor
no existe, es muy
surco poco profundo
menor
19º ancho y
superficial
bases algo surco menor,
inclinadas: profundo y
9º estrecho

dextrógira levógira
Estructuras superiores: cromatina y cromosomas
Estructura del RNA

 Mensajero
 Transferencia
 Ribosómico
 Estructura del RNA

RNA de transferencia RNA ribosómico

DNA bacteriano