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Artículo original

Un método rápido para verificar la configuración de la

deposición de células individuales para clasificadores de células

Olivia Roos Rodrigues, 1 Simón Monard 2 *

Resumen
1 Centro MRC de Medicina Regenerativa,
El estudio de células individuales revela una biología que no se puede explorar utilizando técnicas de
Universidad de Edimburgo, Edimburgo masa. Los clasificadores de células brindan la oportunidad de separar células individuales para cultivo
EH16 4UU, Reino Unido celular o para aplicaciones moleculares posteriores, como qPCR, para estudiar la expresión génica
2 El Laboratorio de Citometría, Instituto específica y la secuenciación de ARNm de células individuales. Algunos de estos estudios moleculares
Walter y Eliza Hall, Parkville 3052, pueden ser costosos, por lo que el investigador a menudo querrá estar seguro de que el clasificador de
Victoria, Australia células puede depositar de manera confiable una sola gota en cada pocillo de una placa de 96 o 384
pocillos. Tales placas pueden contener volúmenes muy pequeños de fluido ya que reducir el volumen
Recibido el 9 de noviembre de 2015; Revisado el 20 de
de fluido usado puede reducir el costo del ensayo. Pasar por alto algunos de los pozos podría dejar el
marzo de 2016; Aceptado el 7 de abril de 2016
conjunto de datos incompleto y requerir una costosa repetición. Verificar esto mediante microscopía,
Puede encontrar información adicional de en el mejor de los casos, lleva mucho tiempo y en el peor, es imposible. Aquí, Se describe un método
apoyo en la versión en línea de este artículo. colorimétrico económico para verificar si un pocillo, ya sea en una placa de 96 o 384 pocillos, recibió

* Correspondencia a: Simon Monard, The


una única gota clasificada de un clasificador de células en el fluido en el fondo del pocillo. La gota
Walter and Eliza Hall Institute, 1G Royal consiste en partículas suspendidas en una solución enzimática, peroxidasa de rábano picante, que se
Parade, Parkville, Victoria 3052, Australia. deposita en los pocillos de la placa de microtitulación que contienen un sustrato, 3,3 0, 5,5 0- tetrametilbencidina.
Correo electrónico: monard@wehi.edu.au
Este método no requiere equipo especial o experiencia y es lo suficientemente rápido como para
2016 Sociedad Internacional de
realizarse directamente antes del experimento de clasificación de una solaVC celda.
Publicado en línea el 3 de mayo de 2016 en
Avance de la citometría
Wiley Online Library (wileyonlinelibrary.com)

DOI: 10.1002 / cyto.a.22865


Términos clave
VC 2016 Sociedad Internacional para clasificación unicelular; citometría de flujo; peroxidasa de rábano picante; método colorimétrico de
el Avance de la Citometría detección; microesferas de poliestireno

S INGLE - la clasificación de células en placas o tubos se ha convertido en un recurso esencial en la


investigación biológica. Después de la clasificación, las células se pueden cultivar, cada pocillo dando
lugar a un cultivo clonal o se pueden estudiar en aplicaciones posteriores a nivel molecular utilizando,
por ejemplo, la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). La transcriptómica unicelular de alto
rendimiento ofrece un enfoque molecular imparcial para comprender el alcance, la base y la función de
la variación de la expresión génica entre células aparentemente idénticas (1). La expresión génica
unicelular, la secuenciación del ARNm unicelular (2) y la secuenciación del ADN unicelular se encuentran
entre las muchas técnicas genómicas unicelulares que los investigadores utilizan actualmente para
estudiar e identificar las diferencias entre células individuales en una población homogénea (3 , 4).

Se han desarrollado varias técnicas de clasificación de células, como la clasificación de placas de


índice, posicional y reflectante, en respuesta a las crecientes demandas en el análisis de células
individuales (5). Estas técnicas clasifican las células en placas de varios pocillos y realizan un
seguimiento del origen de la célula y la ubicación del pocillo clasificado. Las mejoras en el muestreo de
la diversidad de la población (6) han aumentado aún más el poder y el potencial de la clasificación
unicelular. Toda clasificación de una sola celda se beneficiaría enormemente de un método eficiente y
reproducible para validar la precisión de la deposición de una sola celda.
Determinar la eficacia de la clasificación unicelular es un desafío técnico. Si las
células se clasifican en pozos de fondo plano y se deja suficiente tiempo para que la célula
se asiente en el fondo, puede ser posible usar microscopía para determinar si cada

Citometría Parte A 89A: 594600, 2016


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bien contiene de hecho una celda. Este procedimiento requiere mucho sustrato para detectar la actividad peroxidasa en sangre (10). TMB se
tiempo, ya que las células no teñidas pueden ser difíciles de visualizar. convirtió en el sustrato de elección para los ensayos de
Con el fin de demostrar que el instrumento está clasificando una sola inmunoabsorción ligados a enzimas (ELISA).
partícula por pocillo, las microesferas fluorescentes se pueden El método que se describe a continuación utiliza el sustrato de la
clasificar en pocillos de una placa de fondo plano y la placa se puede enzima HRP y TMB para detectar gotas individuales clasificadas en pocillos
ver con un microscopio de fluorescencia invertida. La fluorescencia de de placas de microtitulación. Ninguno de estos reactivos es caro o peligroso
cada microesfera se puede ver incluso con un aumento menor, pero se y no se necesita ningún equipo especial, aunque es útil un lector de placas
debe permitir que las microesferas se asienten en el fondo de los del tipo utilizado en la detección ELISA. En nuestro ensayo, a diferencia de
pocillos. Si las células se clasifican en otros tipos de placas con pocillos ELISA, el fondo es muy bajo, ya que los pocillos que no han sido clasificados
de fondo cónico o redondo, la microscopía no es una opción, ya que no contienen HRP, por lo que los falsos positivos no son un problema, lo
no todas las partículas estarán en el mismo plano óptico. Además, que da al ensayo una sensibilidad exquisita.
algunos tipos de placas, como las placas de amplificación blancas de HRP utiliza peróxido de hidrógeno (H 2 O 2) para oxidar
384 pocillos (Nunc TM, Rochester, NY) no son transparentes, por lo que compuestos orgánicos e inorgánicos (10). HRP cataliza elec-
será necesaria alguna otra forma de verificación. Demostrar que el reacciones de transferencia de tron, puede reducir H 2 O 2 también 2 y H 2 O
clasificador de células está depositando una sola gota clasificada en el utilizando TMB como molécula donante. TMB en su sub-
fondo de una placa de microvaloración también es un desafío. Es La forma estratificada es incolora, cuando se oxida se vuelve azul.
posible clasificar las gotas en las tapas de las placas de El progreso de la reacción se puede controlar mediante la
microvaloración y asumir que una sola gota caerá en esa posición, aparición de la coloración azul o se puede medir la absorbancia a
pero generalmente las gotas clasificadas no se mueven directamente
650 nm en un espectrofotómetro o lector de placas. La intensidad
verticalmente y esto requerirá cierta consideración. Recientemente, se
del color y el tiempo de desarrollo variarán según las condiciones
describió un método para abordar este problema. Los investigadores
del ensayo. Para los ensayos de punto final, la reacción puede ser
utilizaron discos de papel tornasol colocados en el fondo de placas de
detenido con un ácido, por ejemplo, H 2 S0 4 para formar un producto amarillo. Esto
96 y 384 pocillos para ver la posición exacta de las gotas clasificadas
también se puede cuantificar en un lector de placas, pero midiendo
(7). Sin embargo, el enfoque requirió múltiples gotas clasificadas y una
absorbancia a 450 nm. En nuestros experimentos, descubrimos que no era
inspección cuidadosa de los discos con una lupa.
necesario terminar la reacción mediante la adición de una solución de
A continuación, describimos un método rápido que puede
parada, ya que el desarrollo de la mancha azul en pequeños volúmenes de
demostrar que se ha depositado una sola gota clasificada en el fluido
TMB fue muy rápido, generalmente evidente en el momento en que se
del pozo. El sistema puede distinguir fácilmente si un bien recibió más
retira la placa del clasificador de células. No es necesario un lector de
de una gota y la lectura es un cambio de color claramente visible en el
placas, pero permite una medida cuantitativa del desarrollo del color.
pozo. Aunque depositar una sola gota en un pozo no significa
El método se basa en el hecho de que las partículas de los
automáticamente que una sola célula o partícula esté contenida
clasificadores de gotas convencionales están contenidas en una corriente
dentro de esa gota, se pueden usar otras pruebas para determinar si
central. Cuando se forman gotitas, una partícula a clasificar estará dentro
cada gota clasificada contiene la partícula de interés. El retraso de
del núcleo del fluido dentro de una gotita más grande de fluido envolvente.
caída se puede verificar mediante varios métodos: Se puede clasificar
Este núcleo está formado por el líquido en el que se suspendieron las
un número conocido de células o microesferas en varios charcos en un
células. Si las partículas que se van a clasificar se suspenden en un tampón
portaobjetos de microscopio. El retraso de caída se cambia para cada
que contiene HRP, la gota clasificada contendrá algo de esta enzima. Antes
charco en una gota completa. El número de partículas en cada charco
de la clasificación, se preparan placas de microtitulación que contienen
se cuenta usando microscopía de contraste de fase. Se realizan ajustes
TMB. Una sola gota clasificada en un pocillo de dicha placa contendrá
hasta que casi todas las partículas se encuentran en el mismo charco y
suficiente HRP para volver el pocillo azul. Si se utiliza un lector de placas
se usa ese retardo de caída. El retraso de caída también se puede
para detectar y cuantificar el cambio de color, el método se puede utilizar
validar mediante el método RMAX descrito por Riddell et al. (8), donde
para determinar el número de gotas clasificadas en cada pocillo. Para estos
se determina el número de células objetivo en la corriente de residuos.
fines, las partículas en sí pueden ser cualquier cosa que active el clasificador

Fluidigm (South San Francisco, CA) ha desarrollado varios enfoques de células. En este estudio, Se utilizaron tanto microesferas de poliestireno

para la genómica unicelular basados en tecnología de micro y nanofluidos. carboxilato desacopladas como una línea celular linfoblastoide. Mostramos

El Biomark de Fluidigm TM El instrumento permite la multiplexación de que el volumen del núcleo de la gota cambia con la presión de la muestra y

muestras y sondas de oligonucleótidos y la clasificación de células que, como era de esperar, el núcleo de la gota se reduce con un tamaño de

individuales a menudo precede al paso de amplificación. El uso de Fluidigm boquilla más pequeño. La formación y deflexión de gotas no se ve afectada

Biomark y las tecnologías de secuenciación unicelular puede ser costoso, por los diferentes tipos de partículas analizadas en este estudio. Los

por lo que el investigador puede querer una prueba de que se están tamaños de boquilla utilizados para estos experimentos fueron 70 l my 100 l metro.

clasificando gotas individuales en cada pocillo y determinar las tasas de Aquí, describimos un método colorimétrico fácil, rápido y reproducible que
ocupación probables de los pozos en un tipo particular de placa. permite la verificación de la deposición de una sola gota en los pocillos de la
placa de microtitulación. Este procedimiento se puede realizar
En 1971, Van Weemen et al. propuso el uso de peroxidasa de inmediatamente antes de la clasificación. No se recomienda agregar TMB a
rábano picante (HRP) como alternativa a la radiactividad en un los medios de cultivo y agregar HRP a la suspensión de una célula para
inmunoensayo (9). Varios años después 3,3 0, 5,5 0- tetrametilbencidina clasificar.
(TMB) se sintetizó y presentó como un método más seguro

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METRO ATERIALES Y METRO ÉTODOS ninguna muestra fluyó al punto de interrogación. Cuando la presión
de la muestra aumenta a 0,1 psi por encima de la presión de la vaina,
Microesferas y HRP
la muestra comienza a fluir. La medición de la presión de la muestra y
Las microesferas utilizadas en este experimento fueron 4.5 l my
la vaina solo tuvo una precisión de un decimal. El fluido de la envoltura
10 l m Polybead V R microesferas de carboxilato (Polysciences
fue solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (Invitrogen,
Inc, PA). Las microesferas no se acoplaron a ninguna proteína.
CA).
Generalmente 2 l L de 4,5 l m microesferas y 5 l L de 10 l Se
añadieron microesferas m a 0,5 ml de solución salina tamponada Configuración de clasificación de celdas
con fosfato (PBS). Se utilizó HRP (Alpha Diagnostic International, Los clasificadores de células se ajustaron cuidadosamente para que las gotas
TX y ThermoFisher Scientific, MA) a una concentración final de 50 l g clasificadas estuvieran lo más cerca posible del centro de cada pocillo. Este ajuste se
/ mL o 250 l g / mL. realizó teniendo la trayectoria de las gotas clasificadas lo más vertical posible y cubriendo

la placa con papel de aluminio adhesivo. La lámina se alisa firmemente permitiendo ver el
Medida de absorbancia
Se utilizaron dos lectores de placas: BMG Omega TM Lector de perfil del pozo. La clasificación de 50 gotas en la cubierta de aluminio produce un charco

placas en serie (Offenburg, Alemania) y un dispositivo molecular V-max TM pequeño pero visible. No se utilizaron cubiertas de película de plástico o poliestireno, ya

Lector de microplacas cinético (CA). En ambos instrumentos se leyó la que pueden llevar una carga electrostática que puede hacer que el charco se mueva.

absorbancia a 650 nm. Puede ser necesario calzar la placa o realizar modificaciones en el soporte de la placa para

garantizar que las gotas caigan en el centro de todos los pocillos de la placa, ya que el
Imágenes de placas
movimiento de la placa puede no ser exactamente paralelo a las posiciones de los pocillos
Se tomaron imágenes de las placas de varias formas. Algunos
de cada fila. Esto es particularmente importante para clasificar en placas de 384 pocillos.
simplemente fueron fotografiados con la cámara digital en una
Otro enfoque utilizado en el clasificador de células Moflo fue hacer una plantilla de papel
Blackberry Curve. TM teléfono inteligente, (Waterloo, Ontario, Canadá)
de la posición del fondo de los pozos. La plantilla tenía una cruz en el centro de cada pozo.
otros fueron fotografiados usando un transluminador y una cámara
La plantilla se aseguró al soporte de la placa. El instrumento se ajustó de modo que las
digital Nikon SLR con lente macro montada en un fuelle. Esto produjo
gotitas clasificadas se clasificaran exactamente en los centros de las cruces. Luego, la
la mejor calidad de imagen con iluminación uniforme.
placa se colocó encima de la plantilla de manera que el centro de cada pocillo estuviera

Cultivo de células exactamente sobre las cruces en la plantilla de la placa y se aseguró con Bluetac. El
La línea de células B humanas linfoblastoides U266 se hizo crecer y se instrumento se ajustó de modo que las gotitas clasificadas se clasificaran exactamente en
mantuvo en medio RPMI con suero de ternero fetal al 10% (FCS) (Invitrogen, los centros de las cruces. Luego, la placa se colocó encima de la plantilla de manera que el
CA). Las células se utilizaron directamente del cultivo a una concentración centro de cada pocillo estuviera exactamente sobre las cruces en la plantilla de la placa y
de aproximadamente 1 millón de células / ml. se aseguró con Bluetac. El instrumento se ajustó de modo que las gotitas clasificadas se

clasificaran exactamente en los centros de las cruces. Luego, la placa se colocó encima de la plantilla de manera qu
Configuración del clasificador de células
FACS Jazz. BD FACSJazz TM clasificador de células (BD Biosciences, San José,
Clasificación de placas de 96 pocillos con múltiples gotas
CA), equipado con láser azul de argón (488 nm) y diodo rojo (633 nm) con un l
Placas de 96 pocillos Falcon TM ( Corning, Tewksbury, MA) se prepararon con
La boquilla m se configuró para la clasificación de una sola celda con el
100 l Solución de sustrato de alta sensibilidad LTMB (Biolegend, San Diego, CA) en
modo de gota de una sola celda 1.0. El retraso de caída se calculó
cada pocillo. Las microesferas se suspendieron en 50 o 250 l g / ml de HRP en PBS.
manualmente usando Accudrop TM perlas (BD Biosciences, San Jose, CA). La
Inmediatamente antes de la adquisición, las microesferas se resuspendieron y se
presión de la funda usada fue de 20 psi y la compensación de la muestra se
clasificaron basándose en la dispersión frontal frente a la dispersión lateral.
estableció en 0,3 psi y se mantuvo constante durante la duración del
experimento. La frecuencia de activación de caída fue de 30 kHz y la
Al clasificar, se clasificaron 4 microesferas por pocillo en la
amplitud de activación de caída fue de 15 V. El instrumento se activó en
Fila A, 3 microesferas por pocillo en la Fila B, 2 microesferas por
dispersión directa y la puerta de clasificación se estableció en dispersión
pocillo en la Fila C, 1 microesfera por pocillo en la Fila D, sin
frontal y dispersión lateral de microesferas. El fluido de la vaina no contenía
microesferas por pocillo en la Fila E y 1 microesfera por pocillo
conservantes, DNasa, RNasa, ni proteasa, solución salina tamponada con
para el resto de la placa Filas F – H.
fosfato (Fisher Bioreagents, Fair Lawn, NJ).
Inmediatamente después de clasificar la placa se retiró y se dejó
en la oscuridad durante 30 min. Las placas se fotografiaron y se
Moflo MLS. Se configuró un láser Moflo MLS (Beckman Coulter, FL) de
leyeron en un lector de placas BMG Omega Series midiendo la
tres láser equipado con un láser de argón azul (488 nm), un láser de
absorbancia a 650 nm.
diodo rojo (640 nm) y un láser de estado sólido amarillo-verde (561
nm) para una sola celda. clasificación usando el modo de clasificación Clasificación en placa de una sola gota de 384 pocillos
de celda única y desviación de gota única. Solo se utilizó el láser de 488 Placas de amplificación blancas de 384 pocillos (Nunc TM Rochester,
nm. El retraso de la gota se calculó de la forma habitual clasificando las NY) se prepararon agregando 10 l L de TMB a cada pocillo. 4.5
microesferas en portaobjetos de microscopio y observando al l m microesferas se suspendieron en PBS que contenía 50 l g / ml de
microscopio. Al ordenar con un 100 l m boquilla, la presión de la vaina HRP.
se fijó en 20 psi y la frecuencia de accionamiento de la caída en 31 kHz. El clasificador de células BD FACSJazz se ajustó cuidadosamente de modo

Al ordenar con un 70 l m la presión de la vaina de la boquilla fue de 60 que todas las gotas clasificadas estuvieran lo más cerca posible del centro de cada
psi y la frecuencia de 98 kHz. El instrumento se ajustó de manera que pocillo. Las microesferas individuales se clasificaron en placas utilizando varios
cuando la presión de la vaina y la muestra leyeran la misma presión patrones diferentes.

596 Deposición unicelular


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Figura 1. Placas de 96 pocillos después de la clasificación en el FACS Jazz TM clasificador de células seguido de una incubación de 30 minutos en la oscuridad. La
coloración azul es producida por TMB por catálisis por peroxidasa de rábano picante (HRP). La absorbancia a 650 nm se leyó en un lector de placas BMG Serie
Omega. La fila A recibió 4 gotas, la fila B 3 gotas, la fila C 2 gotas, la fila D una gota, la fila E sin gotas y las filas FH recibieron 1 gota por pocillo. A: Plato
preparado con 100 l L de TMB en cada pocillo y concentración de HRP de 50 l g / mL. B: Plato preparado con 100 l L TMB en cada pocillo y concentración de HRP
de 250 l g / mL. C: Valores de absorbancia relativa de TMB de la placa A. Los valores de absorbancia relativa se calcularon dividiendo los valores medios de
absorbancia de múltiples pocillos de gotitas por el valor medio obtenido para gotitas individuales. Los valores se representan como media 6 Error estándar.

Después de clasificar las placas se incubaron en la oscuridad Esto se repitió para presiones de muestra de 0,6 psi y 0,8 psi en
durante 15 min, tras lo cual se fotografiaron. columnas posteriores.
Cinco minutos después de completar la clasificación, las
Clasificación de placa de 96 pocillos de una sola gota
placas se fotografiaron y se leyeron en el lector de placas
Se preparó una muestra que contenía 0.5 mL de células
U266 en medio de cultivo, 2 l L de 4,5 l m microesferas, 5 l L 10 l m Molecular Devices V-max TM Lector de placas cinético.
microesferas, y 25 l L de 5 mg / mL de stock de HRP. Esto dio una
Clasificación de placa de PCR de 96 pocillos de una sola gota
concentración final de HRP de 250 l g / mL. 5 l Se añadió L de TMB a Placas de PCR Twin Tec de 96 pocillos (Hamburgo,
Eppendorf V
R

cada pocillo de microtitulación de vinilo de 96 pocillos. V platos R

Alemania) se prepararon agregando 5 l L TMB a las filas A y


(Thermo Scientific, Nueva York).
B, 2 l L TMB a las filas C y D, 1 l L TMB a las filas E hasta
El Moflo se ajustó, como se describió anteriormente, de modo que la
H. Las placas se mantuvieron en hielo y se cubrieron con celofán
muestra comenzara a fluir a 0,1 psi por encima de la presión de la vaina.
adherente para evitar la evaporación. Se tuvo especial cuidado para
Luego, la presión de la muestra se fijó a 0,2 psi por encima de la presión de
ajustar la trayectoria de las gotas clasificadas ya que el objetivo es muy
la vaina y se dejó estabilizar el caudal de la muestra. La ganancia de
pequeño.
dispersión frontal y lateral se ajustó para que los tres tamaños de partículas
Se preparó una muestra que contenía 2 l L de 4,5 l m microesferas
pudieran observarse simultáneamente y se hizo una puerta de clasificación
suspendidas en 0,5 ml de PBS que contienen 250 l g / ml de HRP. Las gotas
para cada uno de los tipos de partículas.
individuales se clasificaron en todas menos las dos últimas filas.
Una gota que contiene un 4.5 l m microesferas se clasificó en la
Inmediatamente después de la clasificación, se aplicaron cubiertas de
Columna 1, una gota que contiene una 10 l m microesfera se clasificó
celofán a las placas y las placas se fotografiaron en 5 minutos.
en la Columna 5, y una gota que contenía una celda se clasificó en la
Columna 9. La presión de la muestra se aumentó a 0,4 psi por encima
R ESULTADOS
de la presión de la vaina, se dejó estabilizar el caudal y luego se l m
microesferas se clasificó en la Columna 2, una gota que contiene una Clasificación de placas de 96 pocillos con múltiples gotas
10 l Se clasificó la microesfera m en la Columna 6, y una gota que La transición colorimétrica de líquido transparente a azul se
contenía una celda se clasificó en la Columna 10. puede detectar con tan solo una gota clasificada que contiene 50
l g / mL en 100 l L de TMB (Fig. 1A). Sin embargo, el cambio es

Citometría Parte A 89A: 594600, 2016 597


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las gotitas no alcanzaron los pocillos objetivo, estos pozos están rodeados con un círculo

negro y no se utilizaron para los valores medios calculados. Los 100 l La placa de la boquilla

m mostró cuatro pozos objetivo perdidos mientras que el 70 l La placa de la boquilla m

reveló uno de los pocillos objetivo perdidos. Se muestra un diagrama de puntos de

dispersión frontal y lateral con puertas de clasificación que muestran todas las partículas

en el mismo diagrama (Fig. 3E).

Clasificación de placa de PCR de 96 pocillos de una sola gota


La clasificación en placas de amplificación por PCR produjo
una coloración azul casi de inmediato. El color parece más intenso
cuando 5 l L de TMB se usa moderadamente intenso con 2
l LTMB y menos intenso con 1 l LTMB. Sin embargo, la señal se
puede ver claramente cuando se usa solo 1 l L de TMB (Fig. 4).

D ISCUSIÓN
Figura 2. Placas de 384 pocillos después de la clasificación de una sola gota
en el FACS Jazz TM clasificador de células. El plato se preparó con 10 l L TMB en Se describe una técnica colorimétrica fácil y reproducible que se
cada pocillo y concentración de HRP de 50 l g / mL. Se depositaron gotitas
puede utilizar para la validación de la clasificación de una sola gota
individuales en columnas alternas y la placa se incubó durante 15 min.
utilizando una solución de HRP y placas de microtitulación que
contienen TMB. Este método fue desarrollado simplemente para
asegurar al investigador y al operador que el clasificador de células
más rápido y obvio si 250 l Se utilizan g / mL de HRP (Fig. 1B). Este
está ajustado correctamente y que la gota desviada alcanzará su
cambio colorimétrico se puede cuantificar fácilmente utilizando un
objetivo. No puede demostrar que la gota contiene una partícula de
lector de placas como los que se utilizan para ELISA. La medición de la
interés solo que la gota llegó a su destino. Inicialmente, se demuestra
absorbancia a 650 nm da un resultado cuantitativo altamente
que una sola gota clasificada de una muestra de microesferas
reproducible (Fig. 1C). La clasificación en placas de 96 pocillos se
suspendidas en solución de HRP puede detectarse en un pocillo de
repitió veinte veces y los resultados entre ensayos fueron
cualitativamente comparables. placa de microtitulación que contiene 100 l L de TMB. Luego se muestra
que el sistema puede cuantificar fácilmente si una, dos o más gotas
Clasificación de placas de 384 pocillos
clasificadas bien recibidas.
El desarrollo del color es más rápido cuando se clasifican gotas
El método funciona bien para placas de PCR de 384 pocillos que
individuales en pocillos dentro de placas de 384 pocillos que contienen 10 l L
contienen 10 l L de TMB. El desarrollo del color es rápido y el color azul
de TMB (Fig. 2). El color se desarrolla en unos pocos minutos y los primeros
distintivo ya se está desarrollando cuando se retira la placa del
pocillos ya muestran una coloración azul en el momento en que se retira la
clasificador.
placa del clasificador de células. La clasificación en placas de 384 pocillos
El sistema funciona igualmente bien si las partículas clasificadas son
también se repitió más de diez veces y los resultados entre ensayos fueron
células o microesferas. Las células linfoblastoides U266 son células bastante
cualitativamente comparables.
grandes que varían de 10 a 20 l m de diámetro de tamaño. La clasificación de

Clasificación de placa de 96 pocillos de una sola gota con estas células no interrumpió la formación de gotas ni la desviación hacia los
aumento de la presión de la muestra pocillos. Ambos tamaños de microesferas y las células U266 se clasificaron
La figura 3 muestra que la clasificación 4.5 l m microesferas, 10 l m sin cambiar el diferencial de la muestra y los tres tipos de partículas
microesferas y células produjeron resultados muy similares. La formación y demostraron resultados similares con aumentos progresivos en el volumen
desviación de las gotas parece no verse obstaculizada por la presencia de del núcleo de la gota a medida que aumentaba el diferencial de la muestra.
células. Ambos tamaños de microesferas y las células U266 se clasificaron El mayor volumen de las células en comparación con las microesferas
secuencialmente en cada diferencial de muestra, por lo que las diferencias parece tener un efecto mínimo sobre los valores de absorbancia.
observadas no se debieron a la dificultad de duplicar presiones de muestra
idénticas. Las imágenes de la placa (Figs. 3A y 3B) y los gráficos que Finalmente, se demuestra que el sistema se puede utilizar con
cuantifican la absorbancia de TMB de los respectivos pocillos clasificados volúmenes muy pequeños de TMB presentando un target muy
(Figs. 3C y 3D) muestran como se esperaba, que el aumento del diferencial reducido. Gotitas depositadas en 1 l L de TMB provocan un cambio de
de muestra aumenta progresivamente el volumen del núcleo de la muestra color visible que muestra la robustez de la química. El desafío de
y por tanto los valores de absorbancia. Los valores medios de absorbancia clasificar en volúmenes de <2 l L evita que el contenido del pozo se
de TMB representados en las Figuras 3C y 3D se calcularon después de seque y ajusta el clasificador para entregar la gota en un objetivo tan
restar los valores de absorbancia de fondo respectivos medidos en la última pequeño. Debilidad de la señal observada en los pocillos de la placa de
fila de pocillos que no recibieron gotas clasificadas. Los valores de PCR de 96 pocillos al clasificar una sola gota en 1 l L de TMB
absorbancia leídos con el 70 l m tipo de boquilla se reducen en comparación probablemente se debe a que el TMB se secó parcialmente antes de
con los 100 fotografiar la placa y, en parte, la profundidad del fluido en el pozo es
l m boquilla por aproximadamente la mitad utilizando un diferencial de muy pequeña. Podría valer la pena considerar clasificar en una placa
muestra similar. Para este experimento solo 5 l Se añadió L de TMB al seca y agregar el fluido después de la clasificación si eso fuera
fondo de las placas de tipo ELISA de vinilo. El color parece tenue ya compatible con la aplicación posterior. Se muestra que el desarrollo
que el líquido se esparce muy finamente en el fondo del pozo. Varios del color azul es más pronunciado

598 Deposición unicelular


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Figura 3. Placas de 96 pocillos después de la clasificación de partículas individuales en 5 l L TMB en siete pocillos replicados (filas A – G), la fila H no tiene partículas
clasificadas. Cada tamaño de partícula se clasificó a diferenciales de muestra crecientes de 0,2, 0,4, 0,6, 0,8 psi por encima de la presión de la funda. 4.5 l m microesferas
(columnas 1 a 4 respectivamente), 10 l m microesferas (columnas 5–8) y células individuales, línea celular linfoblastoide B humana U266 (columnas 9–12). Ambos 70 l m A) y
100 l m B) Los tamaños de boquilla se utilizaron en un clasificador de células MoFlo MLS. Las placas se incubaron durante 5 min en la oscuridad. Los pozos objetivo no
detectados están marcados con un círculo negro. Los valores de absorbancia de TMB se cuantificaron tanto para 70 l m C) y 100 l m D) tamaños de boquilla. Los valores de
absorbancia se midieron en un dispositivo Molecular Devices V-max TM Lector de placas cinéticas que mide la absorbancia a 650 nm y se representan como media 6 Error
estándar. ( MI) Representación gráfica de puntos de dispersión directa (FS) frente a dispersión lateral (SS) de las puertas de clasificación para 4.5 l m, 10 l m microesferas y
células U266.

con un 100 l m, ya que entrega un mayor volumen de solución de HRP. Aunque todos los experimentos realizados utilizan placas de 96 o
Generalmente, cuando se clasifica en una sola celda, las tasas de eventos son 384 pocillos, el sistema se puede adaptar fácilmente a otros formatos,
bajas, por lo que se pueden usar boquillas de mayor tamaño. La ventaja de las como tubos de PCR individuales, tiras de tubos, placas de terasaki o
boquillas más pequeñas es que permiten frecuencias de impulsión de caída más placas de 1536 pocillos.
altas y, por lo tanto, tasas de eventos de muestreo más altas. Puede haber Como ya se mencionó, las partículas se usan simplemente para activar
ocasiones en las que se necesite una alta tasa de eventos, como cuando se el instrumento, una señal de prueba electrónica está disponible en el
clasifican células muy raras y, en este caso, podría ser prudente aumentar la instrumento Moflo MLS pero no se usó ya que creemos que el uso de
concentración de HRP. partículas imitaría mejor el comportamiento de las partículas clasificadas.

Citometría Parte A 89A: 594600, 2016 599


Artículo original

Las figuras 3 y 4 muestran que se pasaron por alto varios


pozos. Esto, en lugar de ser una falla del sistema, es lo que se
diseñó para demostrar y sugiere que valdría la pena realizar
algunos ajustes adicionales. Clasificación de una celda en el FACS
Jazz TM fue especialmente eficaz con las gotas que rara vez fallaban
en su objetivo.
El método descrito aquí es tanto sensible como cuantitativo.
Haciendo una curva estándar de concentración de HRP en una
placa de 96 pocillos (ver Información de apoyo), se puede calcular
la cantidad absoluta de HRP en cada gota. Como conocemos la
concentración de HRP, se puede dilucidar el volumen central de la
gota.
Cabe señalar que encontramos diferencias pronunciadas en la
reactividad de HRP de diferentes proveedores, lo que significaría que
Figura 4. Placa de PCR de 96 pocillos después de la clasificación de una sola gota de 4,5
se deben probar varias concentraciones para obtener resultados
l m microesferas en las filas A – F. Las filas G y H no tenían gotas. El plato se
preparó con 5 l L TMB en las filas A y B, 2 l L TMB en las filas C y D, 1 l L TMB en óptimos. Usar el método para validar la precisión de la colocación de
las filas E a H. La concentración de HRP fue 250 l g / mL. Las placas se las gotas no requiere un lector de placas o incluso una cámara. La
incubaron durante 5 min. Los pozos objetivo no detectados están marcados
coloración azul se desarrolla rápidamente por lo general en unos
con un círculo negro.
pocos minutos, lo cual es obvio para el ojo humano.
Aquí, demostramos un método de validación fácil y confiable para ayudar
gotitas en un experimento de clasificación de células reales. El
con la configuración de costosos experimentos de clasificación de una sola celda.
comportamiento de las partículas, especialmente las células en un chorro
El método es lo suficientemente sensible como para que una sola gota clasificada
de líquido, puede ser impredecible debido a la distribución no aleatoria de
pueda producir un rápido cambio de color visible. Este método es cuantitativo si
las células y la formación de dobletes o agregados celulares durante la
se utiliza un lector de placas pero, por lo demás, no requiere equipo especial.
preparación de la muestra (11,12). El método descrito en este artículo
Puede adaptarse a cualquier tipo de receptáculo de clasificación y cualquier tipo
podría usarse para investigar los efectos de células o agregados muy
de clasificador de células.
grandes en la formación de gotas.
En un intento de demostrar que la gota clasificada contiene
L ITERATURA C ITED
la partícula de interés, se acopló HRP directamente a la superficie
1. Shalek AK, Satija R, Shuga J, Trombetta JJ, Gennert D, Lu D, Chen P, Gertner RS, Gaublomme JT,
de las microesferas carboxiladas. Se esperaba que una sola Yosef N, et al. RNA-seq de una sola célula revela el control paracrino dinámico de la variación
celular. Nature 2014; 510: 363–369.
microesfera acoplada a HRP pudiera generar un cambio de color
2. Tang F, Barbacioru C, Wang Y, Nordman E, Lee C, Xu N, Wang X, Bodeau J, Tuch BB, Siddiqui A,
visible en TMB. Desafortunadamente, no se pudo generar un et al. Análisis del transcriptoma completo de mRNA-Seq de una sola célula. Nat Methods 2009;
6: 377–382.
cambio de color azul visible con una microesfera. Se exploraron
3. Macaulay IC, Voet T. Genómica unicelular: avances y perspectivas de futuro. PLoS
varios tamaños de microesferas de carboxilato y varios protocolos Genet 2014; 10: e1004126.
de acoplamiento. Se necesitan aproximadamente 0,2 ng de HRP 4. Chattopadhyay PK, Gierahn TM, Roederer M, Love JC. Tecnologías unicelulares para
monitorizar el sistema inmunológico. Nat Immunol 2014; 15: 128-135.
para lograr un cambio de color visible rápido, pero es posible que 5. Osborne GW. Avances recientes en la clasificación de células por citometría de flujo. Methods Cell Biol
no sea posible unir esta cantidad de HRP a una sola perla 2011; 102: 533–556.

6.
(consulte la Información complementaria). Sin embargo, si esto se Osborne GW, Andersen SB, Battye FL. Desarrollo de un nuevo método de clasificación de células que
muestrea la diversidad de poblaciones en citometría de flujo. Citometría A 2015; 87A: 1047–
lograra, un pozo positivo demostraría que la gota alcanzó el pozo 1051. Nov;

y que, de hecho, la gota contenía la partícula de interés. Por otro 7. Baumgartner T, Byrne P, Kweens M, O'Donnel C, Hendrikx J. Confirmación visual directa de la alineación
de la deposición del material de clasificación en la parte inferior de los pocillos de la placa de PCR de 96 y
lado, un pozo no puede mostrar cambio de color por dos razones, 384 pocillos. Cyto 2014; B254: 329.

o la gota nunca llegó al pozo o la gota no contenía la partícula, 8. Riddell A, Gardner R, Pérez-González A, Lopes T, Martinez L. Rmax. Un enfoque sistemático para evaluar
el rendimiento de clasificación de instrumentos utilizando la captura de flujo central. Métodos 2015; 1:
por lo que un resultado negativo podría ser ambiguo. Sin 64–73.

embargo, con este sistema que usa HRP soluble, un pozo 9. Van Weemen BK, Schuurs AHWM. Inmunoensayo con conjugados antígeno-enzima.
FEBS Lett 1971; 15: 232-236.
negativo mostraría definitivamente que la gota no alcanzó su 10. Holanda VR, Saunders BC. Un sustituto más seguro de la bencidina en la detección de sangre.
objetivo. Tetraedro 1974; 30: 3299-3302.
11. Lindmo T, Fundingsrud K. Medición de la distribución de intervalos de tiempo entre pases
Se realizaron algunos experimentos utilizando indicadores
celulares en citometría de flujo como método para la evaluación de los procedimientos de
quimioluminiscentes de la actividad de HRP que parecen tener una sensibilidad preparación de muestras. Citometría A 1981; 2: 151-154.
12. Riddell A, Gardner R, Bispo C, Andrade C. Tiempo entre partículas: uso de un microcontrolador
comparable o ligeramente mejor, pero como un lector de placas específico es un
pequeño y económico para medir la distribución de la tasa de eventos en un Beckman Coulter
requisito para tal ensayo, no se siguió el método. Moflo. Cyto 2014; B90: 228.

600 Deposición unicelular

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