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UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA CAMPUS


PASTO, FACULTAD DE MEDICINA.

VIRUS DE ARN (SARS-COV-2)

Carlos David Andrade Campaña


19 de agosto de 2020.

ARTICULO DE OPINION |VIRUS DE ARN (SARS-COV-2)


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(si su secuencia es homóloga al RNAm viral) o


Artículo de opinión – VIRUS DE ARN de sentido negativo (si su secuencia es
(SARS-COV-2) complementaria al RNAm viral).
“Los genomas RNA sentido positivo son
traducidos directamente por la célula
hospedadora, por lo que son en sí mismos
infecciosos. Por el contrario, los virus con
Carlos David Andrade Campaña1. Estudiante.
genoma RNA sentido negativo incluyen en su
cápside una enzima RNA polimerasa,
Universidad Cooperativa de Colombia Campus Pasto1.
dependiente de RNA. Debido a la fragilidad del
RNA, los genomas de los virus RNA suelen ser
PASTO, NARIÑO, COLOMBIA más pequeños que los de los virus DNA y
raramente superan las 30 Kb. Además, la
Resumen: La función de los virus es infectar
frecuencia de mutación, y por tanto la
a un huésped para cumplir su ciclo de
variabilidad genética, es mucho más alta que la
replicación e infección. Precisamente en este
de los virus DNA. Algunos ejemplos de virus
documento se aborda a los virus de RNA y se
RNA son: reovirus (10-12 segmentos de RNA
enfatiza en el nuevo virus (SARS-CoV-2) de la
bicatenario lineal), togavirus y flavivirus
familia que por sus características
(monocatenario lineal, sentido positivo, 11 Kb),
estructurales se clasifica en la familia de
picornavirus (monocatenario lineal, sentido
Coronaviridae, como gran dato los virus de
positivo, 7-9 Kb), coronavirus (monocatenario
ARN tienden a mutar más rápido que los virus
lineal, sentido positivo, 30 Kb), ortomixovirus (7-
de ADN, éste es un tema que está en estudio,
8 segmentos de RNA monocatenario lineal,
sin embargo evidencias indican a que una de
sentido negativo), paramixovirus
las exonucleasas que se encuentran en la
(monocatenario lineal, sentido negativo, 17-20
maquinaria celular no actúa correctamente en
Kb), rhabdovirus (monocatenario lineal, sentido
el momento de replicación del virus de ARN
negativo, 11 Kb), retrovirus (monocatenario
permitiendo variaciones en el genoma viral
lineal, sentido positivo, 3,5-9 Kb”).(1) (Navarra,
que al pasar a otro al huésped puede generar
2020)
cambios en los síntomas ya conocidos del
anterior hospedero. Así mismo se abordará el
ciclo de entrada donde la proteína de espiga
(S) y la enzima convertidora de angiotensina 2 II. MARCO TEÓRICO
(ACE2) permiten el ingreso del SARS-CoV-2
a la célula huésped. Desde el mes de noviembre de 2019,
enfermedad (COVID-19) se ha extendido
Palabras Clave: huesped, Coronaviridae, rápidamente por todo el mundo, causando una
exonucleasas, spike, genoma, angiotensina. pandemia que se ha extendido por todo el
mundo. El agente causal del COVID-19 es el
coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo
I. OBJETIVO severo (Sars-CoV2) es un nuevo β coronavirus.
En primer lugar, hagamos énfasis en los virus En datos actuales por empresas y modelos
con genoma RNA. Pueden ser mono o nacionales de estadística de cada país, los casos
bicatenario, lineal o circular y de distintos positivos de COVID-19 crecen a un ritmo
tamaños. Algunos pueden presentar, además, su demoledor cada día. Se debe tener en cuenta que
genoma segmentado. Los de genomas este, es un virus zoonótico (pasa de una especie
monocatenarios pueden ser de sentido positivo a otra)[2], según estudios encargados a buscar el

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origen de este contagio, con la diversa y SRR10168378 (NCBI BioProject


información científica se abre la posibilidad de PRJNA573298) 29,30”. [3] (Andersen,
que el salto primero fue de murciélago a un Rambaut, Lipkin, Holmes, & Garry, 2020)
pangoli, para luego pasar a humanos (los pasos
exactos aún se desconocen) los datos se obtiene Este estudio permite confirmar que el virus
con la comparación genética de virus aislados de (SARS-CoV-2) tiene un origen de selección
múrcielas (los murciélagos son hospederos natural. [3] (Andersen, Rambaut, Lipkin,
normales de los coronavirus) así como los Holmes, & Garry, 2020)
pangolies muestran semejanzas que permiten
crear esta hipótesis, como se evidencia en la Los coronavirus son virus de ARN de sentido
figura 1(Estudio de comparación genómica del positivo, de cadena sencilla relativamente
virus trabajo de Andersen y colaboradores. [3] grande (~ 30 kb). Su membrana tiene una
(Andersen, Rambaut, Lipkin, Holmes, & Garry, apariencia de corona, debido a su decoración
2020) con ‘espigas’ de glucoproteína [4] (OMS,
Coronavirus, 2020). En particular, la familia del
β-coronavirus incluye el virus del Síndrome
Respiratorio Agudo Severo (SARS) (SARS-
CoV), el virus del síndrome respiratorio del
Medio Oriente (MERS) (MERS-CoV) y el
agente causal COVID-19 SARS-CoV-2. En 5’
dos tercios del genoma del SARS-CoV-2
codifican dos poliproteínas, pp1a y pp1ab,
denominadas replicasa. Estas poliproteínas se
dividen en 16 proteínas no estructurales,
incluida la ARN polimerasa dependiente de
Figura 1: “Se puede observar las mutaciones ARN (RdRp), por dos proteasas virales
en los residuos de contacto de la proteína esenciales: la proteasa tipo 3C (3CLpro) y la
espiga (S) barra roja en la parte superior que proteasa tipo papaína (PLpro). El 3′ un tercio del
se alineó contra los coronavirus similares al genoma del SARS-CoV-2, como otros β
SARS-CoV más estrechamente relacionados coronavirus, codifica cuatro proteínas
y el propio SARS-CoV. Los residuos clave en estructurales esenciales y un conjunto de
la proteína espiga que hacen contacto con el proteínas accesorias, que pueden interferir con
receptor ACE2 están marcados con recuadros la respuesta inmune innata del huésped. Estas
azules tanto en el SARS-CoV-2 como en los proteínas estructurales son 6: (véase también la
virus relacionados, incluido el SARS-CoV figura 2)
(cepa Urbani). b, Adquisición del sitio de
escisión polibásica y glicanos unidos a O.
Tanto el sitio de escisión polibásico como los
tres glicanos unidos a O pronosticados - Glicoproteínas de espiga (S): Son las
adyacentes son exclusivos del SARS-CoV-2 y encargadas de dar la entrada al virus en
no se vieron previamente en los la célula de huésped.
betacoronavirus de linaje B. Las secuencias - Proteínas de envoltura pequeña (E):
que se muestran son de NCBI GenBank, solo están presentes en pequeñas
códigos de acceso MN908947, MN996532, cantidades y probablemente funcionen
AY278741, KY417146 y MK211376. Las como canales iónicos, no necesariamente
secuencias de coronavirus de pangolín son un
consenso generado a partir de SRR10168377

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necesarios para la replicación viral pero enzima es un receptor que se encuentra en los
esenciales para la patogénesis. pulmones, arterias, intestino, riñones y corazón
- Proteínas de membrana/matriz (M): (aquí coinciden los órganos con los síntomas de
son las proteínas más abundantes en la personas con COVID19) [7] (Peng Jia, y otros,
estructura del virus y son responsables 2005). Con la unión de la proteína viral (S) y la
de la curvatura de la membrana viral y (ACE2) inicia el ingreso del virus a la célula. Al
de la unión a la nucleocápside. tiempo que S1 se une a ACE2, S2 se separa y es
- Proteínas de la nucleocápside (N): se activada por la TMPRSS2 (proteasa
unen al genoma viral de ARN y aseguran transmembrana de serina 2 asociada a la
el mantenimiento del ARN en una superficie del huésped) una vez ocurrido este
conformación “beads-on-a-string”. [5] proceso con la unión de estas dos partes se da la
(Madrid, 2020) fusión de la membrana viral del huésped y su
genoma de ARN se libera en el citoplasma de la
Véase la figura 2: célula huésped. Entonces la maquinaria de
traducción de la célula huésped es utilizada por
los fragmentos del virus para la traducción de
las poliproteínas y las proteasas virales
esenciales.

Las poliproteínas (pp1a y pp1ab) se dividen en


16 proteínas efectoras no estructurales mediante
3CLpro y PLpro, lo que les permite formar el
complejo de replicación junto con la ARN
polimerasa dependiente de ARN, que sintetiza
una plantilla de cadena de ARN negativa de
longitud completa. Esta se utiliza para replicar
el genoma completo de ARN y generar las
plantillas individuales de mARN subgenómico
necesarias para la traducción de las proteínas
Figura 2: Imagen que ejemplifica la estructura estructurales y accesorias virales. Las nuevas
del SARS-CoV-2 [6] (Goñi, 2020) proteínas estructurales y accesorias recién
sintetizadas son transferida desde el retículo
endoplasmático al aparato de Golgi, donde se
El ciclo de infección del virus cuando ingresa a ensamblan los nuevos viriones. Finalmente, los
la célula es crucial, pues con el conocimiento de viriones maduros de SARS-CoV-2 se exocitan y
la puerta de entrada del virus se puede atacarlo, se liberan de la célula huésped al ambiente para
una de maneras más efectivas de bloquear el repetir el ciclo de infección. [8] (IBIAN
ataque del SARS-CoV-2 son las glicoproteínas Technologies, 2020)
de espiga (S) ya que son las que dan entrada al
virus. El periodo de incubación es de 2 a 12 días, con
una media de 5 días, tiempo en el cual los
El ciclo viral tiene bastante importancia, a pacientes van a presentar algún tipo de síntoma.
continuación, se describe a grandes rasgos el El modo de contagio principalmente es de
mecanismo de ingreso a la célula del virus Sars- persona a persona es por las gotículas que salen
CoV-2. La proteína (S) del virus se divide en despedidas de la nariz o la boca de alguien
dos (S1 y S2). S1 se va a unir con la enzima infectada al toser, estornudar o hablar. [9]
convertidora de angiotensina 2 (ACE2) esta

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(OMS, Preguntas y respuestas sobre la - M-CSF: entre sus funciones incremento


enfermedad por coronavirus (COVID-19), en actividad tumoricida, actividad
2019). También los fómites (objetos inanimados fagocítica, etc. [11] (Navarrete Márquez,
que entran en contacto por un agente Rangel Corona, Corona Ortega, Weiss
infeccioso), en este caso la ropa, billetera, Steider, & Mendoza Rincón, 2019)
dinero, bolsas de supermercado o cualquier
alimento que pudiera haberse contaminado por En algunos casos, estas citocinas provocan una
gotículas del virus, pueden ser de gran riesgo respuesta proinflamatoria aumentada,
para contagiarse [9] (OMS, Preguntas y desequilibrada y devastadora en el huésped que
respuestas sobre la enfermedad por coronavirus puede afectar principalmente pulmones o a un
(COVID-19), 2019) fallo multiorgánico. [12] (Iberoamericano,
2020)

La enfermedad del SARS-CoV-2 (COVID-19)


se asocia con cuadros graves de fiebre y
neumonía que puede derivar a un síndrome de
dificultad respiratoria aguda (SDRA). Se han
observado manifestaciones parecidas al
síndrome por liberación de citoquinas. [12]
(Iberoamericano, 2020).

IV. MATERIA

Como se nombra anteriormente los cuadros


Figura 3: Célula huésped humana en color graves de COVID19 se asocian a un síndrome
verde atacada por el virus SARS-CoV-2 en de liberación de citoquinas caracterizado por un
amarillo. [10] Imagen tomada del documento síndrome de dificultad respiratoria aguda y un
Gaceta (MÉXICO, 2020) síndrome de linfohistiocitosis
hemofagocítica. [13] (Tesini, 2020)

En algunos estudios de autopsias, se han


III. METODOLOGÍA identificado partículas víricas en diferentes
órganos, en heces y orina, por lo que se postula
Según diferentes fuentes de información los que además el virus puede producir daño directo
antígenos que permiten el daño celular del en los diferentes órganos corporales. [13]
SARS-CoV-2 se da a las células presentadoras (Tesini, 2020)
de antígenos (APC) que hacen parte del sistema
inmunitario como los macrófagos (células El mecanismo inicial que desencadenaría el
fagocitarias) que pueden producir un gran síndrome de liberación de citoquinas sería la
número de citocinas proinflamatorias como: unión del virus a la carboxipeptidasa de la
enzima convertidora de angiotensina (ACE2)
- Interleucina 1 para introducirse en las células humanas. Ello
- Interleucina 4 desencadenaría una liberación de la interleucina
- Interleucina 6 6 (IL-6) que tiene una alta actividad inflamatoria
- Interleucina 8 y estimularía células de la inmunidad, células

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vasculares endoteliales e hígado. [13] (Tesini, están expuestos a la selección natural.


2020) Lastimosamente la explotación de selvas
vírgenes, la trata de animales silvestres, abren
Basándose en su mecanismo de acción como una puerta de ingreso a nuevas amenazas
inhibidores de la acción de la interleucina 6
(IL6), los tratamientos inmunomoduladores se bilógicas que quizá han estado ocultas por
están evaluando como una opción para el mucho tiempo, sin lugar a duda la ciencia en los
tratamiento de la “tormenta de citoquinas” diferentes países se debe seguir impulsando por
aunque todavía no hay evidencias sólidas que gobiernos, empresas y universidades que
justifiquen su uso fuera de la investigación. [13] permitan generar nuevos proyectos destinados a
(Tesini, 2020) la investigación de amenazas bilógicas de este
V. DESARROLLO
tipo, que nos permitan ganar tiempo ante estas
nuevas amenazas.
Es importante aclarar que del 100% de Cabe destacar que a pesar de ser un nuevo virus
contagiados por este virus no todos van a
no es tan letal como estos virus que se presentan
enfermar, pues según datos de estadística con
pacientes infectados entre cada país pueden varar a continuación.
un poco, pero en general el 70% a 80% va a ser
asintomático (no presenta síntomas del virus) lo Virus Letalidad (%)
que los hace muy peligrosos para las personas
MERS-CoV 35% [15]
que tengan alguna comorbilidad, de ellos el
restante 10% a 15% va presentar síntomas graves Ebola 50% [16]
de la enfermedad dejando un 5% a 10% de
pacientes que fallese, se debe tener en cuenta las Marburgvirus 88% (Angola 2005)
estadísticas varían en cada país dadas las
[17]
características físicas y genéticas de las personas,
pero en general con los datos de fallecidos se ha SARS-CoV-2 >4%
podido concluir que la mayoría de fallecidos ha
Aproximadamente
tenido enfermedades anteriormente existentes las
cuales se familiarizan con los datos de
fallecimientos por este virus, las enfermedades
que muestran estos datos son: hipertensión Datos tomados: (OMS, Coronavirus causante
arterial o HTA, sarcoidosis, diabetes, obesidad.
del Síndrome respiratorio de Oriente Medio
Incluso una predisposición genética causada por
el receptor celular ACE2, tema por el cual aún se (MERS-CoV), 2019), (OMS, Enfermedad por el
encuentra en estudios. [14] (Salud, 2020) virus del Ebola, 2020), (OMS, Enfermedad por
virus de Marburgo, 2018),

VI. DISCUSIÓN Y CONCLUSIÓN


El porcentaje de letalidad muestra que al inicio
de un nuevo virus la mortandad puede ser
Los estragos de una pandemia que afecta a todo
mucho más devastadora, según estudios indican
el planeta es una clara señal de que debemos
que la inmunidad cruzada a las distintas cepas
prepararnos a nuevas emergencias de estilo,
de coronavirus a lo largo del tiempo generó algo
específicamente por nuevos virus, ya que
de inmunidad permitiendo que la tasa de
tienden a mutar bastante rápido porque también

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mortandad por el SARS-CoV-2 no sea tan alta. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles


[20] /PMC1287568/

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covid-19-mers-y-sars

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[16] OMS. (10 de Febrero de 2020). Enfermedad por


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[17] OMS. (15 de Febrero de 2018). Enfermedad por


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Gaceta Médica, 1. Obtenido de
https://gacetamedica.com/investigacion/la-
exposicion-al-coronavirus-del-resfriado-

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