Introducción a la expresión génica

(dogma central)
Cómo los genes del ADN proporcionan las instrucciones para hacer proteínas. El dogma
central de la biología molecular: ADN → ARN → proteína.
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Resumen: expresión génica

El ADN es el material genético de todos los organismos de la Tierra.
Cuando se transmite de padres a hijos, el ADN puede determinar algunas
de las características de los hijos (como el color de sus ojos o de su
cabello). Pero, ¿cómo puede la secuencia de una molécula de ADN
realmente tener efecto sobre las características de un ser humano o de
cualquier otro organismo? Por ejemplo, ¿cómo puede la secuencia de
nucléotidos (As, Ts, Cs y Gs) del ADN de las plantas de chícharos de
Mendel determinar el color de sus flores?

Los genes especifican productos funcionales

(como proteínas)
Una molécula de ADN no solo es una larga y aburrida cadena de
nucleótidos. En realidad, se divide en unidades funcionales
llamadas genes. Cada gen proporciona las instrucciones para formar un
producto funcional, o sea, una molécula necesaria para desempeñar un
trabajo en la célula. En muchos casos, el producto funcional es una
proteína. Por ejemplo, en el experimento de Mendel, el gen del color de
las flores tiene las instrucciones para hacer una proteína que ayuda a
producir moléculas coloridas (pigmentos) en los pétalos de las flores.
 Diagrama que muestra cómo un gen puede dictar un fenotipo
(característica observable) de un organismo. El gen del color de las flores
que estudió Mendel se compone de una tira de ADN que se encuentra en
un cromosoma. El ADN tiene una secuencia particular; parte de esta se
muestra en el diagrama y es 5'-GTAAATCG-3' (cadena superior), que
está emparejada con la secuencia complementaria 3'-CATTTAGC-5'
(cadena inferior). El ADN del gen especifica la producción de una
proteína que ayuda a formar pigmentos. Cuando la proteína está presente
y es funcional, se producen pigmentos y las flores de la planta tienen un
color púrpura.
Imagen basada en los datos experimentales reportados por Hellens et al^11start superscript, 1, end
superscript  y en una figura similar de Reece et al^22start superscript, 2, end superscript.

El producto funcional de la mayoría de los genes son proteínas, o para

ser más exactos, polipéptidos. El término polipéptido es solo una palabra
para designar una cadena de aminoácidos. Aunque muchas proteínas se
conforman de un solo polipéptido, algunas están hechas de varios
polipéptidos. Los genes que especifican polipéptidos se conocen como
genes codificantes de proteínas.

No todos los genes codifican proteínas. Por el contrario, algunos

proporcionan instrucciones para producir moléculas de ARN funcionales,
como los ARN de transferencia y los ARN ribosomales que desempeñan
papeles en la traducción. 
[Más sobre los genes codificantes de proteínas y de ARN]
 Ejemplos de diferentes productos funcionales que los genes pueden
especificar.

En este ejemplo, hay una sección de ADN que contiene tres genes
diferentes:

 El gen 1 codifica un ARNm, que luego se traduce para formar un

polipéptido (proteína o subunidad proteica).

 El gen 2 codifica un ARN regulador. Este ARN no se transcribe en

un polipéptido, sino que realiza una función en la célula misma (regula la
expresión de otros genes).

 El gen 3 codifica un ARN de transferencia (ARNt). Este ARN

tampoco se transcribe en un polipéptido, sino que se pliega en una forma
de trébol compleja y jugará un papel clave en la síntesis de proteínas.

¿Cómo puede la secuencia de ADN de un gen

especificar una proteína en particular?
Muchos genes proporcionan instrucciones para producir polipéptidos.
¿Cómo dirige exactamente el ADN la construcción de un polipéptido?
Este proceso consta de dos pasos: transcripción y traducción.
 En la transcripción, la secuencia de ADN de un gen se copia para
obtener una molécula de ARN. Este proceso es
llamado transcripción porque implica reescribir, o trancribir, la
secuencia de ADN en un "alfabeto" de ARN similar. En eucariontes, la
molécula de ARN debe someterse a un procesamiento para convertirse
en un ARN mensajero (ARNm) maduro.

 En la traducción, la secuencia de ARNm se decodifica para

especificar la secuencia de aminoácidos de un polipéptido. El
nombre traducción refleja que la secuencia de nucleótidos del ARNm se
debe traducir al "idioma", completamente diferente, de los aminoácidos.

Esquema simplificado del dogma central que muestra las secuencias de

las moléculas participantes.

Las dos cadenas de ADN tienen las siguientes secuencias:

5'-ATGATCTCGTAA-3' 3'-TACTAGAGCATT-5'

La transcripción de una de las cadenas de ADN produce un ARNm con

una secuencia casi idéntica a la otra cadena de ADN. Sin embargo,
debido a las diferencias bioquímicas entre el ADN y el ARN, las T del
ADN se reemplazan con U en el ARNm. La secuencia de ARNm es:
 5'-AUGAUCUCGUAA-5'

La traducción implica leer los nucleótidos del ARNm en grupos de tres,

cada uno de los cuales especifica un aminoácido (o proporciona una señal
de terminación que indica que ha finalizado la traducción).

3'-AUG AUC UCG UAA-5'

AUG \rightarrow→right arrow metionina AUC \rightarrow→right

arrow isoleucina UCG \rightarrow→right arrow serina
UAA \rightarrow→right arrow "alto"

Secuencia del polipéptido: (extremo-N) metionina-isoleucina-serina

(extremo-C)

Por lo tanto, durante la expresión de un gen codificante de proteína, la

información fluye de ADN \rightarrow→right
arrow ARN \rightarrow→right arrow proteína. Este flujo de información
se conoce como el dogma central de la biología molecular. Los genes
no codificantes (genes que producen ARN funcionales) también se
transcriben para producir ARN, pero este ARN no se traduce en un
polipéptido. Para cualquier tipo de gen, el proceso de pasar de ADN a
producto funcional se conoce como expresión génica.
[¿Por qué los genes codificantes de proteínas se expresan en dos pasos?]




Transcripción
En la transcripción, una cadena del ADN que compone al gen,
llamada cadena no codificante, funciona como molde para que una
enzima llamada ARN polimerasa sintetice una cadena de ARN
correspondiente (complementaria). Esta cadena de ARN se
llama transcrito primario.

Las dos cadenas de ADN tienen las siguientes secuencias:

5'-ATGATCTCGTAA-3' 3'-TACTAGAGCATT-5'

El ADN se abre para formar una burbuja y la cadena inferior sirve como
molde para la síntesis de una cadena de ARN complementaria. Esta es
llamada cadena molde. La transcripción de la cadena molde produce un
ARNm que es casi idéntico en secuencia a la otra cadena (cadena
codificante) de ADN. Sin embargo, debido a una diferencia bioquímica
entre el ADN y el ARN, las T del ADN se reemplazan con U en el
ARNm. La secuencia de ARNm es:

5'-AUGAUCUCGUAA-5'

El transcrito primario tiene la misma secuencia de información que la

cadena de ADN que no se transcribió, generalmente llamada cadena
codificante. Sin embargo, el transcrito primario y la cadena codificante
no son idénticos debido a ciertas diferencias bioquímicas entre el ADN y
el ARN. Una diferencia importante es que las moléculas de ARN no
contienen la base timina (T). En lugar de timina, las moléculas de ARN
utilizan una base similar llamada uracilo (U). El uracilo, al igual que la
timina, forma pareja con la adenina.
[Otras diferencias entre el ADN y el ARN]

-\text{OH}minus, O, H

Nucleótido de ADN: carece de un grupo hidroxilo en el carbono 2' del

azúcar (es decir, el azúcar es una desoxirribosa). Contiene una base
timina que tiene un grupo metilo unido a su anillo.

Nucleótido de ARN: tiene un grupo hidroxilo en el carbono 2' del azúcar

(es decir, el azúcar es una ribosa). Contiene una base uracilo que es muy
similar en estructura a la timina, pero no tiene un grupo metilo unido a su
anillo.
^3start superscript, 3, end superscript

Transcripción y procesamiento de ARN:

eucariontes frente a bacterias
En bacterias, el transcrito primario puede servir directamente como ARN
mensajero o ARNm. El ARN mensajero obtiene su nombre por el hecho
de actuar como mensajero entre el ADN y los ribosomas. Los ribosomas
son las estructuras de ARN y proteínas en el citosol donde se forman las
proteínas.

En eucariontes (como los seres humanos), el transcrito primario debe

someterse a algunos pasos extra para convertirse en un ARNm maduro.
Durante el procesamiento, se añaden casquetes en ambos extremos del
ARN y se eliminan cuidadosamente algunas de sus porciones en un
proceso conocido como empalme. Estos pasos no ocurren en bacterias.

Célula eucarionte: la transcripción ocurre en el núcleo. El transcrito

primario se somete a pasos de procesamiento adicionales en el núcleo
para convertirse en ARNm maduro. Luego, se exporta al citosol, donde
se puede juntar con un ribosoma y dirigir la síntesis de un polipéptido en
el proceso de traducción.

Bacteria: la transcripción ocurre en el citosol. Debido a esto, el ARNm no

necesita viajar a ningún otro lado antes de poder ser traducido por un
ribosoma. De hecho, un ribosoma puede comenzar a traducir un ARNm
incluso antes de que se transcriba completamente (mientras la
transcripción sigue en proceso).
El lugar donde ocurre la transcripción también es diferente entre
procariontes y eucariontes. La transcripción eucarionte ocurre en el
núcleo, donde se almacena el ADN, mientras que la síntesis de proteínas
ocurre en el citosol. Debido a esto, el ARNm eucarionte debe ser
exportado del núcleo antes de que pueda traducirse en un polipéptido.
Las células procariontes, por otra parte, no tienen núcleo, por lo que la
transcripción y la traducción se llevan a cabo en el citosol.

Traducción
Después de la transcripción (y de algunos pasos de procesamiento en
eucariontes), la molécula de ARNm está lista para dirigir la síntesis de
proteínas. El proceso de usar información de un ARNm para producir un
polipéptido se llama traducción.

El código genético
Durante la traducción, la secuencia de nucleótidos de un ARNm se
traduce en la secuencia de aminoácidos de un polipéptido.
Específicamente, los nucleótidos del ARNm se leen en tripletes (grupos
de tres) llamados codones. Existen 616161 codones que especifican
aminoácidos. Uno de esos codones es un codón de "inicio" que señala
dónde comienza la traducción. El codón de inicio codifica para el
aminoácido metionina, por lo que la mayoría de los polipéptidos
comienzan con este aminoácido. Otros tres codones de "terminación"
indican el final de un polipéptido. Estas relaciones se llaman código
genético. 
[Tabla del código genético]
 Tabla del código genético. Cada secuencia de tres letras de nucleótidos
de ARNm corresponde a un aminoácido en específico o a un codón de
terminación. UGA, UAG y UAA son codones de terminación. AUG es el
codón de metionina además de ser el codón de inicio.

La secuencia del ARNm es:

5'-AUGAUCUCGUAA-5'
 La traducción implica leer los nucleótidos del ARNm en grupos de tres,
cada uno de los cuales especifica un aminoácido (o proporciona una señal
de terminación que indica que ha finalizado la traducción).

3'-AUG AUC UCG UAA-5'

AUG \rightarrow→right arrow metionina AUC \rightarrow→right

arrow isoleucina UCG \rightarrow→right arrow serina
UAA \rightarrow→right arrow "alto"

Secuencia del polipéptido: (extremo-N) metionina-isoleucina-serina

(extremo-C)

Los pasos de la traducción

La traducción ocurre dentro de estructuras conocidas como ribosomas.
Los ribosomas son máquinas moleculares cuya función es construir
polipéptidos. Una vez que un ribosoma se monta sobre un ARNm y
encuentra el codón de "inicio", se desplazará rápidamente por el ARNm
un codón a la vez. Al avanzar, construirá poco a poco una cadena de
aminoácidos que refleja exactamente la secuencia de codones en el
ARNm.

¿Cómo "sabe" el ribosoma qué aminoácido insertar para cada codón?

Pues resulta que esta correspondencia no la hace el ribosoma por sí
mismo. En realidad, depende de un grupo de moléculas de ARN
especializadas llamadas ARN de transferencia (ARNt). Cada ARNt
tiene tres nucleótidos que sobresalen en un extremo y pueden reconocer
(complementar sus bases con) uno o unos cuantos codones en particular.
En el otro extremo, el ARNt transporta un aminoácido: específicamente,
el aminoácido que corresponde con esos codones.
 La traducción ocurre en el ribosoma. El ARNm se une al ribosoma,
donde puede interactuar con moléculas de ARNt.

En esta imagen, la secuencia del ARNm es:

3'-...AUG UAC AUC UCG GAU...-5'

El ARNt unido al tercer codón (5'-AUC-3') tiene la secuencia

complementaria 3'-UAG-5'. Lleva una cadena polipeptídica compuesta
por metionina e isoleucina, la cual se une al ARNt mediante la isoleucina.
A la derecha de este ARNt hay otro ARNt que se une al siguiente codón
(5'-UCG-3'). Dicho ARNt también tiene una secuencia de nucleótidos
complementaria (3'-AGC-5') y lleva al aminoácido serina, que es el
aminoácido especificado por el codón del ARNm. La serina que
transporta el ARNt será añadida a la creciente cadena polipeptídica.

Otros ARNt que transportan otros aminoácidos están flotando alrededor.

Uno lleva Glu (ácido glutámico) y la secuencia de nucleótidos en su
 extremo es 3'-CUU-5'. El otro transporta Asp (ácido aspártico) y la
secuencia de nucleótidos en su extremo es 3'-CUA-5'.

Hay muchos ARNt flotando en una célula, pero solo el ARNt que
coincide (cuyas bases se complementan) con el codón que se lee en ese
momento puede unirse y suministrar su carga de aminoácido. Una vez
que el ARNt está perfectamente unido a su codón correspondiente en el
ribosoma, su aminoácido se añadirá al final de la cadena polipeptídica.

1. El RNAt correspondiente se une al codón expuesto en la ranura que

está en la extrema derecha del ribosoma.

2. La cadena de aminoácidos se transfiere del ARNt en la ranura

central del ribosoma al aminoácido del ARNt en la ranura de la derecha.
Con esto, el aminoácido se agrega al final de la cadena de aminoácidos.

3. El ribosoma se desplaza un codón. El ARNt que antes estaba en la

ranura del centro se mueve a la ranura de la izquierda y sale del
ribosoma. El ARNt que antes estaba en la ranura de la derecha se mueve
a la ranura del centro y sigue unido a la cadena de aminoácidos. Un
nuevo codón queda expuesto en la ranura de extrema derecha para que se
una ahí un nuevo ARNt.
 Este proceso se repite muchas veces y el ribosoma se mueve sobre el
ARNm un codón a la vez. La cadena de aminoácidos se construye pieza
por pieza con una secuencia de aminoácidos que coincide con la
secuencia de codones en el ARNm. La traducción termina cuando el
ribosoma alcanza un codón de terminación y libera el polipéptido.

¿Qué sucede después?

Una vez terminado el polipéptido, este puede ser procesado, modificado,
combinado con otros polipéptidos o enviado a algún destino en
específico dentro o fuera de la célula. En última instancia, este
polipéptido realizará un trabajo específico para la célula o el organismo,
tal vez como molécula de señalización, algún elemento estructural o una
enzima.

Recapitulación:
 El ADN se divide en unidades funcionales llamadas genes, los
cuales pueden especificar polipéptidos (proteínas y subunidades
proteicas) o ARN funcionales (como los ARNt y ARNr).

 La información de un gen se utiliza para construir un producto

funcional en un proceso llamado expresión génica.

 Los genes que codifican polipéptidos se expresan en dos pasos. En

este proceso, la información fluye de ADN \rightarrow→right
arrow ARN \rightarrow→right arrow proteína, lo que constituye una
relación direccional conocida como el dogma central de la biología
molecular.
o Transcripción: una cadena del ADN del gen se copia en
ARN. En eucariontes, el transcrito de ARN se debe someter a pasos
adicionales de procesamiento para convertirse en un ARN mensajero
maduro (ARNm).
o Traducción: la secuencia de nucleótidos del ARNm se
decodifica para especificar la secuencia de aminoácidos de un
polipéptido. Este proceso ocurre dentro de un ribosoma y requiere de
moléculas adaptadoras llamadas ARNt.

 Durante la traducción, los nucleótidos del ARNm se leen en

grupos de tres llamados codones. Cada codón especifica un aminoácido
en particular o una señal de alto. Este conjunto de relaciones se conoce
como código genético.
[Referencias]