Metabolismo de nucleótidos

Hay dos tipos de rutas metabólicas que conducen a la formación de los

nucleótidos las rutas de novo y las rutas de recuperación. La síntesis de novo
empieza a partir de sus precursores metabólicos: aminoácidos, ribosa-5-fosfato,
CO2 y NH3. Las rutas de recuperación reciclan las bases libres y los nucleósidos
liberados de la degradación de los ácidos nucleicos.
Las vías de novo para la biosíntesis de purinas y pirimidinas son idénticas en casi
todos los seres vivos. Purinas y pirimidinas comparten varios precursores
importantes en las vías de síntesis de novo. El fosforribosil pirofosfato (PRPP)
resulta importante para ambos tipos de bases.
En cada vía un AA es un precursor importante: la glicina para las purinas y el
aspartato para las pirimidinas. La glutamina es la fuente más importante de grupos
amino. El aspartato también se utiliza como fuente de grupos amino en la
biosíntesis de purinas.
Hay pruebas, sobre todo en la síntesis de novo de las purinas, de que en la célula
las enzimas implicadas forman parte de grandes complejos multienzimáticos. Las
reservas celulares de nucleótidos (a excepción del ATP) son bastante pequeñas,
1% o menos de las cantidades necesarias para sintetizar el DNA celular.
La síntesis de novo de los nucleótidos de purina empieza con el PRPP
Los dos nucleótidos de purina originales de los ácidos nucleicos son el AMP
(adenosina-5’-monofosfato o adenosina) y el GMP (guanosina-5’-monofosfato o
guanosina). El origen de los átomos del anillo de purina fue determinado por John
Buchanan mediante el uso de marcadores isotópicos en aves.
La biosíntesis de los nucleótidos de purina está regulada por
retroinhibición.
Biosíntesis de los nucleótidos pirimidínicos
La ruta biosintética que conduce a los nucleótidos pirimidínicos es más sencilla
que la de los nucleótidos purínicos. Difiere en que el resto de D-ribosa-5-fosfato
se engarza al núcleo de la pirimidina después de la previa formación de éste a
partir de sus precursores.
Los primeros experimentos realizados con isótopos revelaron que el CO2 y el
amoniaco son precursores del anillo pirimidínico.

El primer avance importante de nuestros conocimientos sobre la biosíntesis

pirimidínica proceden del estudio de mutantes de Neurospora crassa deficientes
en su capacidad de sintetizar pirimidinas e incapaces de crecer en medios
carentes de citosina o uracilo pero si en presencia del ácido orótico (derivado
pirimidínico).

Experimentos realizados con ácido orótico isotópico mostraron que éste es un

precursor pirimidínico inmediato en Neurospora así como en diversas bacterias.
La ruta de los nucleótidos pirimidínicos que pasa por el ácido orótico, fue trazada
por A. Kornberg y colaboradores, conduce primero al ácido uridílico (UMP), del
cual derivan tanto el ácido citidílico (CMP) como el desoxitimidílico (dTMP).
La aciduria orótica es una enfermedad genética de la biosíntesis pirimidínica en el
hombre, en la cual se acumula ácido orótico en la sangre, que es excretado por la
orina. En los niños que presentan esta anomalía, se observa un menguado
crecimiento así como fallos en la formación de eritrocitos.
Regulación de la biosíntesis de los nucleótidos pirimidínicos.
La regulación de la velocidad de biosíntesis de nucleótidos pirimidínicos ha sido
objeto de serias investigaciones, especialmente las iniciadas por A. B. Pardee y
colaboradores.
Descubrieron que la aspartato-transcarbamoilasa de E. coli, que cataliza la
primera reacción de la secuencia (la condensación del carbamil-fosfato con el
ácido aspártico, que rinde ácido carbamil-aspártico), resulta inhibida por el CTP,
que es el producto final de esta secuencia reaccional.
El tipo de reacción cuyo modulador inhibidor es el CTP, tiene lugar en las
bacterias E. coli y Aerobacter aerogenes. Sin embargo, en la bacteria
Pseudomonas fluorescens, el principal modulador inhibidor es el UTP, mientras
que en algunas plantas lo es el UMP.
Regulacion de la síntesis de pirimidinas
Biosíntesis de los desoxirribonucleótidos
Dado que los desoxirribonucleótidos difieren de los ribonucleótidos tan solo en que
contienen 2-desoxirribosa en vez de ribosa como pentosa, se supuso que se
debían formar por una ruta similar a la antes descrita para los ribonucleótidos
solamente con la sustitución de la ribosa fosforilada precursora por un 2-
desoxiderivado análogo.
Un importante experimento fue llevado a cabo por I. A. Rose y B. S. Schweigert,
con un citidina etiquetada con C14 tanto en el anillo pirimidínico como en la ribosa.
Al ser ofrecida a células animales o bacterianas, este compuesto se incorporó a
los restos de ácido citidílico del RNA, así como a los de ácido desoxicitidílico del
DNA. Las proporciones de isótopo contenidas en las porciones pirimidínicas y de
ribosa o desoxiribosa resultaron idénticas a las presentes en los restos de los
ácidos citidílicos y desoxicitidílicos.
Otros ensayos directamente realizados con isótopos y con extractos bacterianos
exentos de células confirmaron que los ribonucleótidos etiquetados, de hecho se
convierten en los correspondientes desoxirribonucleótidos. Para la reducción
directa de los ribonucleótidos existen dos rutas distinta, que dependen de las
especies.
P. Reichard y colaboradores han demostrado que en E. coli, los cuatro
ribonucleósido-difosfatos (ADP, GDP, UDP, y CDP) son directamente reducidos a
los correspondientes desoxi-análogos.
En el proceso global, la reducción del resto de ribosa a 2-desoxirribosa requiere de
un par de átomos de hidrógeno que son donados finalmente por el NADPH y el
H+, sin embargo, el donador electrónico inmediato no es el NADPH, sino la forma
reducida de una pequeña proteína termoestable (contiene 108 restos de
aminoácidos) denominada tiorredoxina, que posee dos grupos –SH libres
pertenecientes a dos restos de cisteína.
La tiorredoxina puede ser óxidoreducida de modo reversible. Su forma oxidada o
de disulfuro, que contiene un resto de cistina, es reducida a la forma de ditiol por el
NADPH + H+, según una reacción catalizada por la tiorredoxina- reductasa:

Los equivalentes de reducción de la tiorredoxina reducida que se ha formado son

después transferidos al aceptor ribonucleósido-5´-difosfato (NDP) por la
ribonucleósido-difosfato-reductasa:
Formación del ácido desoxitimidílico
La formación de timidilato y, por tanto, la del DNA, resulta fuertemente retrasada
por las drogas aminopterina y ametopterina,. Estos agentes se denominan
medicamentos antifólicos. Debido a su semejanza estructural con el dihidrofolato,
son inhibidores competitivos de la conversión del dihidrofolato en tetrahidrofolato
por la dihidrofolato-reductasa:

La formación del timidilato es especialmente sensible a los niveles disminuidos de

tetrahidrofolato. De esta suerte, la síntesis del DNA resulta inhibida en la rápida
división de los leucocitos malignos.

Recuperación de las purinas

Las purinas libres formadas a partir de los nucleótidos son recuperados en los
vertebrados para su reutilización en la biosíntesis de nucleótidos y de ácidos
nucleicos.
El mecanismo principal de este proceso reside en la acción de la adenina-
fosforribosil-transferasa y en la de la guanina—fosforribosil-transferasa:
Estas importantes enzimas convierten a las purinas libres en sus correspondientes
nucleótidos, que son reutilizables. Otra ruta de recuperación resulta provocada por
la acción secuencial de la purino-nucleósido-fosforilasa:

Y la de nucleósido-quinasa tales como la adenosina-quinasa:

Dado que hasta el 90% de las purinas libres formadas por el hombre son
recuperadas y recicladas, estas rutas de recuperación, especialmente la descrita
en primer lugar, son de la mayor importancia por lo que se refiere a la economía
de las purinas en los vertebrados
La deficiencia de alguno de estos procesos de recuperación provoca el síndrome
de Lesch-Nyhan, rara enfermedad genética en la que se observa la deficiencia del
enzima guanina-fosforribosil-transferasa.
Degradación de las pirimidinas
En la mayoría de las especies animales las pirimidinas son degradadas a
amoniaco y urea. Pueden ser también utilizadas como precursores en la
biosíntesis de la β-alanina, y por tanto del coenzima A.