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Bacterias y hongos
Las Bacterias y los Hongos son los principales agentes de
descomposición, por lo que reciben también el nombre de
descomponedores. Actúan sobre la materia orgánica vegetal muerta y
sobre los productos de excreción y los cadáveres de los animales. Los
organismos que viven de materia muerta se llaman saprofitos. Que son
los organismos descomponedores transforman la materia orgánica en
nutrientes que pueden ser de nuevo utilizados por los productores: así, la
descomposición microbiana es la principal ruta de vuelta a la atmósfera
del dióxido de carbono absorbido inicialmente por las plantas durante la
fotosíntesis.
Hongos
Los hongos suelen ser los primeros en colonizar la materia orgánica, pues
tienen la capacidad metabólica de degradar la pared celular y liberar el
contenido del protoplasma, más fácilmente degradable. También hay
bacterias capaces de degradar la celulosa de la pared celular vegetal;
comunidades de estas bacterias viven en el intestino de los animales
herbívoros y son las responsables de la descomposición de la celulosa en
el rumen o estómago de muchos animales domésticos importantes.
Suelo y agua
Los microorganismos abundan en el suelo y el agua. Una cucharilla llena
de agua natural sin contaminar contiene aproximadamente un millón de
bacterias, y en los 15 cm superiores de un suelo bien fertilizado puede
haber más de cinco toneladas de bacterias y hongos por hectárea.
Descomposición y alimento
La descomposición por microorganismos afecta también a la economía
industrial. Ciertos productos alimenticios, como el queso y el yogur, se
forman gracias a la actividad de microorganismos específicos, pero el
resultado se degrada rápidamente cuando el proceso se ve contaminado
por otros microbios. Asimismo, la colonización microbiana de los
alimentos altera la consistencia, el olor y el sabor y los hace menos
apetitosos.