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BIOLOGÍA SEMINARIO - USMP (Semana 1-12) 2018
BIOLOGÍA SEMINARIO - USMP (Semana 1-12) 2018
BIOLOGÍA CELULAR Y
MOLECULAR 2016 SOLUCIONARIO
CÉSAR AMANZO
UNIVERSIDAD SAN MARTÍN DE PORRES - FACULTAD DE MEDICINA
USMP FMH Seminario de Biología Celular y Molecular 2016 Solucionario
SEMANA 2
SEMINARIO I-1
ORIGEN Y EVOLUCION DE LAS CÉLULAS
Se ha aceptado desde hace mucho tiempo que la atmósfera de principios del Arcaico era anóxica
y probablemente débilmente reductora, y dominado por especies oxidantes tales como el CO 2,
N2, CO y H2O, con pequeñas cantidades de H2, que se habría escapado rápidamente al espacio
exterior. La reducción de los gases suministrados por la desgasificación volcánica, como CH 4 y
NH3, habría sido destruida por radiación UV (fotodisociación), y pueden haber subsistido sólo a
nivel local alrededor de los respiraderos hidrotermales.
La comprensión del origen de la vida fue en gran parte especulativa hasta que la década de 1920,
cuando Oparin y Haldane, trabajando independientemente, propusieron un modelo teórico para
la "evolución química". El modelo Oparin- Haldane sugirió que, bajo las condiciones fuertemente
reductoras, como se teoriza que fue el estado de la atmósfera de la tierra primitiva (hace 4,0 y
3,5 mil millones años), las moléculas inorgánicas podrían formar espontáneamente moléculas
orgánicas (azúcares simples y aminoácidos).
En 1953, Stanley Miller, junto con su asesor de
postgrado Harold Urey, prueba esta hipótesis
mediante la construcción de un aparato que
simulaba la “tierra primitiva” de Oparin-Haldane.
Cuando una mezcla de gases en base a las
predicciones de la atmósfera primitiva fue
calentada y recibió una carga eléctrica, se
formaron compuestos orgánicos. Por lo tanto, el
experimento de Miller-Urey demostró cómo
algunas moléculas biológicas, tales como
aminoácidos simples, podrían haber surgido
abióticamente, a través de procesos no
biológicos, en las condiciones que se consideran
similares a los de la tierra primitiva. Este
experimento proporcionó la estructura para la
investigación posterior sobre el origen de la vida.
A pesar de muchas revisiones y adiciones, el
escenario de Oparin-Haldane sigue siendo parte
del modelo en uso hoy en día. El experimento de
Miller-Urey es simplemente una parte del
programa experimental producido por este paradigma.
(http://ncse.com/files/pub/creationism/icons/gishlick_icons1.pdf)
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El experimento se hizo con el fin probar que la síntesis de compuestos orgánicos era
espontánea, a partir de moléculas sencillas que se encontraban en la Tierra primigenia.
Partieron de la idea de Alexander Oparin y John Haldane, que dicha Tierra estaba compuesta
principalmente de NH3 (amoniaco), CH4 (metano), H2 (dihidrógeno), siendo estos tres la
composición de la atmósfera original; H 2O (agua), siendo esta la que simulaba los océanos.
A
Production of Amino Acids Under Possible Primitive Earth Conditions Stanley L. Miller SCIENCE, Vol. 117 May. 15, 1953
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(The origin of modern terrestrial life. HFSP Journal Vol. 1, September 2007)
3. ¿Qué puede señalar del origen y evolución temprana de la vida, hasta el surgimiento del
Último Ancestro Común Universal? Resuma.
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que contienen ARN debido a que los contra iones seleccionan las cargas negativas de ARN. Esta
presión osmótica es contrarrestada por la tensión de la membrana, conduciendo a la captación de
ácidos grasos. Este mecanismo podría haber favorecido que las vesículas que contienen moléculas
cargadas, tales como el fosfato de ribosa y/o polifosfato, sobre los que contienen moléculas neutras.
La encapsulación de replicadores ARN habría inducido una forma primitiva de competencia entre las
primeras células ARN, ya que los que contienen replicadores más eficientes habrían crecido más
rápido. En estos escenarios, la selección natural entre las protocélulas en competencia en la
ausencia de sistemas genéticos podría haber sido impulsado originalmente por las características
físico-químicas de los primeros sistemas Por último, el crecimiento de vesículas de membrana genera
un gradiente de pH transmembrana, lo que sugiere que algunas de las características universales de
los seres vivos podrían tener su origen en las características físico-químicas fundamentales.
El ATP (adenosintrifosfato) y otros NTPs (nucleótidos trifosfatos), incluyendo muchas bases
modificadas que no se incluyeron posteriormente en el ARN, probablemente se originaron por
primera vez como transportadores de energía en el protometabolismo y como coenzimas
catalizadores de péptidos antes del origen del RNA por sí mismo.
Se discute actualmente como las ribozimas pudieron iniciar la reacción autocatalítica y evitarse la
degradación de los productos, por la gran inestabilidad del ARN.
Durante la evolución una polimerasa eficiente no sólo fue capaz de replicarse a sí mismo, sino
también logro replicar plantillas de catalizadores que producen ya sea ribozimas (o péptidos) útiles
para el metabolismo de la célula ARN.
Se generaron varios tipos diferentes de síntesis de péptidos catalizados por ribozima, pero sólo uno
sobrevivió, llevando al aparato de traducción moderna con ARNt y ribosomas
Se supone que el código genético primitivo era más simple (por ejemplo, con un codón de dos
nucleótidos y menos aminoácidos) y se expandió en el curso de la evolución.
Se supone que los mecanismos de transferencia de genes estaban en funcionamiento muy
tempranamente, lo que permitió el intercambio genético entre células de ARN-proteína. Este
período terminó con el establecimiento de los modernos superfamilias de proteínas por las diferentes
combinaciones de plegamiento proteico.
El ADN se originó probablemente mucho más tarde que el ARN, es decir, en el mundo
ribonucleoproteína (también llamado "la segunda edad del mundo ARN”)
Se supone generalmente que el ADN reemplazó al ARN, ya que es más estable y se puede replicar
más fielmente
Se ha propuesto que el ADN primero se originó en los virus como una forma modificada de
ARN para proteger el material genético viral contra los mecanismos de defensa de la célula
infectada.
Los genomas celulares de ARN serían entonces transformados más tarde en genomas de
ADN siguiendo el reclutamiento por las células de ARN de las enzimas virales para producir
y replicar el ADN, o por la toma de control de las células de ARN por virus de ADN que vivían
en un estado de portador
El principio básico de la división celular y la herencia de membrana implica que todas las células
modernas se derivan de una sola célula.
Se establece claramente que LUCA (Último ancestro común universal, Last Universal
Common Ancestor, LUCA) no debe confundirse con la primera célula, pero era el producto de
un largo período de evolución. Siendo el último medio de que LUCA fue precedida por una larga
sucesión de antiguos "antepasados".
No hay un consenso sobre la naturaleza de LUCA. Para algunos autores LUCA era un organismo
muy simple, incluso, posiblemente, acelular, mientras que otros consideran que LUCA fue una
bacteria de tipo moderna o incluso un eucariota primitiva con un núcleo.
La identificación de un conjunto de genes presentes en Archaea, Bacteria y Eukarya ha dado lugar
a la definición de un contenido mínimo de genes de LUCA.
El conjunto mínimo de proteínas incluye un núcleo de proteínas ribosomales, aminoacil ARNt
sintetasas y factores de traducción (tanto para la iniciación y la elongación), de tal manera que el
aparato de traducción ya estaba bien establecido en LUCA.
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Reino Protista.
Los protistas son organismos eucariotas que no pueden ser clasificadas como una planta,
animal, o un hongo.
En su mayoría son unicelulares, pero algunos, como las algas, son pluricelulares. Las algas,
o "algas marinas", son protistas pluricelulares que proporciona alimentos, hábitat, y el oxígeno
para numerosos ecosistemas submarinos.
Los protistas mayormente unicelulares y por lo general se desplazan mediante cilios, flagelos,
o por mecanismos ameboides. Usualmente no tienen pared celular, aunque algunas formas
pueden tenerla.
Tienen orgánulos incluyendo un núcleo y pueden tener cloroplastos, por lo que algunos serán
verdes y otros no lo serán.
Son pequeños, aunque muchos son lo suficientemente grandes como para ser reconocido en
un microscopio de disección o incluso con una lupa.
Los nutrientes son adquiridos mediante la fotosíntesis, la ingestión de otros organismos, o
ambos.
A pesar de que se asemejan a una planta las algas, no se clasifica en el Reino Plantae porque
carece de la complejidad celular de las células vegetales.
Los protistas poseen células eucariotas y no disponen de órganos o de tejidos diferenciados.
Reino Fungi.
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Los hongos son pluricelulares, con una pared celular, orgánulos, e incluyen un núcleo, pero
no tienen cloroplastos.
No tienen mecanismos de locomoción.
Los hongos varían en tamaño desde tamaños microscópicos hasta muy grandes y visibles
sin microscopio.
Los nutrientes son adquiridos por absorción. En su mayor parte, los hongos adquieren
nutrientes a partir de material en descomposición.
Reino Plantae.
Son pluricelulares y la mayoría no se mueven, aunque los gametos de algunas plantas se
desplazan mediante cilios o flagelos.
Tienen organelas incluyendo núcleo y cloroplastos.
Las paredes celulares están presentes.
Los nutrientes son adquiridos por la fotosíntesis (todos ellos requieren luz solar).
Reino Animal.
Los animales son pluricelulares, y se mueven con la ayuda de los cilios, flagelos, o los
órganos musculares a base de proteínas contráctiles.
Tienen orgánulos, incluyendo un núcleo, pero no tienen cloroplastos ni paredes celulares.
Adquieren nutrientes por ingestión.
Reproducción sexual
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Virus.
Partícula consistente en ácido nucleico (ARN o ADN) encerrado en una cubierta proteica,
capaz de replicarse dentro de una célula huésped y propagarse de célula a célula.
Prión.
Los priones son partículas infecciosas proteicas, que se forma cuando las proteínas normales
se plieguen incorrectamente y aglutinan. El término prión (de las primeras letras de partícula
infecciosa proteica) fue propuesta (Prusiner 1982) para distinguir el patógeno infeccioso de
virus o viroides. Los priones se definieron como "pequeñas partículas infecciosas
proteináceas que se resisten a la inactivación por procedimientos que modifican los ácidos
nucleicos".
Los priones ('partículas infecciosas proteináceas') son los agentes infecciosos no
convencionales que consisten en una molécula proteíca priónica mal plegada (PrP); en su
estado mal plegado, las moléculas se agregan entre sí e imponen su estructura anómala en
las moléculas de PrP benignos. Los priones actúan como plantillas de corrupción (semillas)
que incitan una reacción en cadena de mal plegamiento y la agregación de PrP. Los priones
crecen, se fragmentan y propagan, perturbando la función del sistema nervioso y en última
instancia causan la muerte del individuo afectado.
La proteína prión anormal (PrPsc) tiene una abundancia de hojas beta.
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No - ir a 3
2. Podría ser una planta o un protista, o una bacteria azul-verde. Asegúrese de que el verde es realmente parte del organismo,
sin embargo. Un animal podría haber comido algo verde, por ejemplo.
¿Unicelular? ir a 6
¿Multicelular? Plantae. Busque paredes celulares, estructura interna. En el microscopio compuesto podría ser capaz de
ver los cloroplastos.
4. ¿Podría ser un monera o un protista?. ¿Puedes ver algún detalle dentro de la célula?
Sí - Protista. Usted debe ser capaz de ver al menos un núcleo y/o vacuola contráctil, y una forma definida. El movimiento
debe estar presente, con cilios, flagelos, o el movimiento ameboide. Los cilios o flagelos pueden ser difíciles de ver.
No - Monera. En caso de ser bastante pequeño. Puede ser en forma de guiones cortos (varillas), pequeños puntos (cocos),
o curvado o espiral en forma. El más grande de ellos que se encuentra comúnmente en el agua dulce se llama Spirillum
volutans. Es en forma de espiral, y puede ser casi un milímetro de largo. Excepto por Spirillum, es muy difícil ver móneras
excepto en un microscopio compuesto con una iluminación especial.
No - Hongo. En caso de ser ramificado, filamentos incoloros. Puede tener algún tipo de cuerpo fructífero (las setas es un
tipo de hongo, no se olvide). Por lo general, unido a alguna pieza de materia en descomposición - pueden formar un
recubrimiento difuso en o alrededor de un objeto. En el agua, algunas infecciones bacterianas de los peces y otros animales
y bacterias de ácido láctico vivos para el intestino del bebé. A diferencia de otras bacterias, éstas
pueden ser confundidos con un hongo.
parecen ser adaptados de forma única para residir en el tracto digestivo humano e interactuar
6. Lo más probable Protista. Si consiste en largos filamentos verdosos, no ramificados sin estructura aparente en el interior, son
con nosotros en simbiosis desde el momento en que nacemos. Tradicionalmente se ha
bacterias azul-verde (a veces erróneamente llamadas algas verde-azules), un Monera. La mayoría de los protistas verdes son
considerado que selasmueven
flagelados, es decir, bacterias presentes
rápidamente en la leche
con un movimiento materna
en espiral. A menos que fueron
usted adquiridas
consiga que se por mera
detengan,
realmente no se puede ver los flagelos. Tenga cuidado con las colonias de protistas, sin embargo, como Volvox, que forma una
contaminación de la piel
bola giratoria de células verdes. No se deje engañar pensando que es una planta.
Recuerde, cuanto más se observa el organismo, mayor seguridad de que pueda ser. Muchos seres vivos tienen etapas que se
parecen a los miembros de otro Reino.
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(http://www.ruf.rice.edu/~bioslabs/studies/invertebrates/kingdoms.html)
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Sin embargo, se ha encontrado que los lactobacilos y enterococos aislados presentes en la leche
humana son genotípicamente diferente de los aislados en la piel dentro del mismo huésped.
Además, varios estudios sugieren la existencia de una microbiota mamaria durante la última
etapa del embarazo y la lactancia. Bacterias en vivo desde el intestino materno podrían colonizar
la glándula mamaria a través de una ruta endógena (la llamada vía entero-mamaria), con células
dendríticas y macrófagos maternos.
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SEMANA 3
SEMINARIO I-2
COMPOSICIÓN Y ORGANIZACIÓN MOLECULAR DE LA MEMBRANA CELULAR.
Las bicapas formadas por lípidos con colas hidrocarbonadas cortas serían
mucho más fluidas. Las bicapas también serían menos estables, ya que las
colas más cortas serían menos hidrofóbicas y, por lo tanto, las fuerzas que
impulsan la formación de la bicapa se reducirían.
C. Todas las cadenas de hidrocarburos son saturadas.
Las bicapas formadas por lípidos con colas hidrocarbonadas saturadas serían
mucho menos fluidas. Considerando que una bicapa lipídica normal tiene la
viscosidad del aceite de oliva, una bicapa de lípidos hecho con colas de
hidrocarburos saturados tendría la consistencia de la grasa de tocino.
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En una proteína transmembrana con una estructura alfa-hélice, debido a que el agua
está ausente en el interior de la bicapa, los átomos que forman la columna vertebral son
impulsados para formar enlaces de hidrógeno uno con otro en el interior de la hélice.
Los enlaces de hidrógeno se maximizan si la forma
de la cadena del polipéptido es el de una hélice alfa
regular, y así la gran mayoría de los segmentos que
atraviesan la membrana son cadenas
polipeptídicas organizadas como hélices-alfa.
En estas hélices-alfa transmembrana, las cadenas
laterales hidrofóbicas están orientadas hacia la
parte externa de la hélice, donde entran en contacto
con las colas de los lípidos hidrofóbicos, mientras
que los átomos en el interior de la hélice forman
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El orden es: CO2 (pequeña y no polar) > etanol (pequeña y ligeramente polar) >
H2O (pequeña y polar) > glucosa (grande y polar) > Ca2 + (pequeña y cargada) >
ARN (muy grande y muy cargada). Esta lista muestra claramente las dos
propiedades básicas que rigen la capacidad de las moléculas para difundir a
través de una bicapa lipídica: el tamaño (pequeño > grande) y la polaridad (no
polar > polar > cargado).
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Cuatro mecanismos básicos por los que las moléculas del soluto se
mueven a través de membranas. Los tamaños relativos de las letras
indican las direcciones de los gradientes de concentración.
(A) La difusión simple a través de la bicapa, que procede siempre de mayor a
menor concentración.
(B) La difusión simple a través de un canal acuoso formado dentro de una
proteína de membrana o un grupo de tales proteínas. Al igual que en una, el
movimiento es siempre hacia abajo un gradiente de concentración.
(C) La difusión facilitada en el que las moléculas del soluto se unen
específicamente a una proteína transportadora de membrana (un transporte
facilitado). Al igual que en A y B, el movimiento es siempre de mayor a menor
concentración.
(D) El transporte activo por medio de una proteína transportadora con un sitio
de unión específico que se somete a un cambio en la afinidad impulsado con
energía liberada por un proceso exergónico, tal como la hidrólisis de ATP. El
movimiento se desarrolla en contra de un gradiente de concentración.
(Cell and Molecular Biology. Concepts and Experiments / Gerald Karp, 7th Edition, 2013)
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SEMANA 4
SEMINARIO I-3
CITOPLASMA, CITOESQUELETO, MATRIZ EXTRACELULAR
Las mitocondrias (F) están presentes en mayor número, usualmente miles por
cada célula.
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2. ¿En cuál de los siguientes tipos de células Usted espera una alta densidad de
filamentos intermedios citoplasmáticos? Explique su respuesta.
a. Amoeba proteus (una ameba de vida libre).
b. Célula epitelial de la piel humana.
c. Célula muscular lisa en el tracto digestivo de un vertebrado.
d. Célula nerviosa en la médula espinal de un ratón.
e. Espermatozoide humano.
f. Célula vegetal.
Las células que migran rápidamente de un lugar a otro, como las amebas (A) y
células espermáticas (E), no necesitan filamentos intermedios en su citoplasma, ya
que no desarrollan o mantienen grandes fuerzas de tracción. Las células vegetales
(F) son empujadas y tiradas por las fuerzas del viento y el agua, pero se resisten a
estas fuerzas a través de sus paredes celulares rígidas hechas a base de celulosa,
más que por su citoesqueleto.
Las células epiteliales (B), células de músculo liso (C), y los largos axones de
las células nerviosas (D) son ricos en filamentos intermedios citoplasmáticos,
que les impiden la rotura a medida que se estiran y comprimen por los movimientos
de los tejidos circundantes.
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(Cell and Molecular Biology. Concepts and Experiments. 7 th Edition. Gerald Karp 2013)
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CONTRACCION MUSCULAR:
o Los filamentos delgados son regulados por la unión de cationes calcio a la
troponina C, y envuelve –vía el complejo de troponinas- el movimiento de la
tropomiosina hacia el surco del filamento delgado, removiendo el bloqueo
estérico que obstaculiza el enlazamiento de las cabezas de miosina a las
moléculas de actina.
o Los filamentos delgados exhiben dos estados estructurales:
Estado desactivado, en el cual la tropomiosina bloquea el sitio de
enlazamiento de la miosina a las moléculas de actina.
Estado activado en el cual la tropomiosina se mueve fuera del surco
descubriendo el sitio de enlazamiento de miosina.
o Al inicio del ciclo, la cabeza de la miosina, que carece de un nucleótido unido,
se encuentra estrechamente unida al filamento de actina (estado I).
o La unión de ATP a la cabeza de la miosina, reduce la afinidad de la cabeza de
la miosina por la actina (estado II). La hidrólisis parcial del ATP (durante la cual
ADP y Pi permanecen unidos a la miosina), activa la cabeza de la miosina, la
que experimenta un cambio conformacional y se desplaza respecto del filamento
fino (estado III).
o La miosina activada contacta a una molécula de actina y se une a ella
produciéndose la liberación de Pi (estado IV).
o Una vez unida a actina, la cabeza de la miosina experimenta un nuevo cambio
conformacional que se traduce en un desplazamiento del filamento fino y en la
liberación de ADP (estado V).
o De esta manera, cada cabeza de miosina se desplaza hacia el extremo (+) del
filamento fino adyacente. Mientras la concentración de Ca++ sea alta y exista
ATP disponible, los ciclos de formación de puentes actina-miosina continúan y
el sarcómero continúa contrayéndose.
o En ausencia de ATP, el complejo actina-miosina se estabiliza, fenómeno que
explica el "rigor mortis"
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(Molecular biology of the cell / Bruce Alberts, et.al. Sixth edition. 2015)
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SEMANA 5
SEMINARIO I-4
MOTILIDAD NO MUSCULAR. HUSO ACROMÁTICO
“La cooperación entre los microtúbulos y microfilamentos ha sido mejor estudiado en las
células pigmentadas. En los mamíferos, los gránulos de pigmento (melanosomas) son
transportados en finos procesos periféricos de pigmento celular por una de las isoformas
de miosina: miosina Va. Los melanosomas son luego transferidos a los folículos
pilosos, donde se incorporan en un pelo en desarrollo. Los ratones que carecen de
actividad miosina Va son incapaces de transferir los melanosomas en los folículos
pilosos, causando que su pelaje tenga un color mucho más claro. Los seres humanos
que carecen de un gen normal que codifica miosina Va sufren de una enfermedad rara
denominada síndrome Griscelli; estos individuos presentan el albinismo parcial (falta
de coloración de la piel) y sufren otros síntomas que se cree están relacionadas con
defectos en el transporte de vesículas.
En el año 2000 se descubrió que un subgrupo de pacientes portadores del síndrome de
Griscelli tenía un gen normal miosina Va, pero carecía de un gen funcional que codifica
una proteína de membrana periférica denominado RAB27A. La familia de las proteínas
Rab son moléculas que regulan el tráfico de vesículas. Las proteínas Rabs también
están involucrados en la fijación de motores basados en gen de miosina (y kinesina)
para la superficie de membrana”
(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
“En contraste con los motores de miosina II, que trabajan en conjunto y se unen sólo
transitoriamente a los filamentos de actina a fin de no interferirse unos con otros, la
miosina V se mueve continuamente, a lo largo de los filamentos de actina y sin dejar
de hacerlo. Las funciones de la Miosina V están bien estudiados en la levadura
Saccharomyces cerevisiae, que se somete a un patrón estereotípico de crecimiento y
división denominada gemación. Filamentos de actina en la célula madre en el punto
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(Molecular biology of the cell / Bruce Alberts, et.al. Sixth edition. 2015)
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2. Describa los pasos tomados por una célula de mamífero al arrastrarse sobre un
sustrato.
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Las secuencia repetitiva de las actividades que se produce cuando una célula se
arrastra sobre el substrato
Paso 1 Protrusión del borde anterior de la célula en forma de un lamelipodio.
Paso 2 Adherencia de la superficie más baja del lamelipodio al sustrato, una unión
que está mediada por las integrinas que residen en la membrana plasmática. La
célula utiliza esta unión para sujetar el sustrato.
Paso 3 Movimiento de la mayor parte de la célula hacia delante sobre el sitio de
unión, que permanece relativamente estacionario Este movimiento se consigue
mediante una fuerza (tracción) contráctil ejercida contra el sustrato.
Paso 4 Célula después que las uniones con el sustrato se han cortado y la parte
posterior de la célula es tirada hacia delante.
(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 6th edition, 2010).
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En las células, la mayor parte de las subunidades de actina están unidos a timosina,
que bloquea la actina en una forma que no puede hidrolizar su ATP unido y no puede
ser agregado a cualquier extremo de un filamento. La timosina reduce la
concentración de subunidades de actina libre alrededor de la concentración crítica.
Las subunidades de actina son reclutadas de este grupo inactivo por profilina, cuya
actividad es regulada de modo que la polimerización de la actina ocurre cuando y
donde sea necesario. La ventaja de tal disposición es que la célula puede mantener
un gran número de subunidades para un crecimiento explosivo en los sitios y los
tiempos de su elección.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Fifth Edition, 2008)
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 6th edition, 2010).
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La célula ciliada normal está compuesta por unas 250 proteínas organizadas en
torno a un axonema o conjunto de microtúbulos que se extienden desde el
citoplasma hasta el extremo final del cilio.
El cilio normal consiste en un par central de microtúbulos rodeados por una vaina
y otros 9 dobletes externos formando la organización característica “9+2”
(AXONEMA).
Los complejos de dineína se asocian a los dobletes periféricos, los puentes de
nexina sostienen los dobletes periféricos entre sí y los rayos radiales (radial
spoke) unen el par central con los periféricos.
Los microtúbulos y sus proteínas asociadas están anclados en el citoplasma
apical de la célula por un complejo de 9 tripletes de microtúbulos.
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SEMANA 6
SEMINARIO I-5
MITOCONDRIAS. ADN MITOCONDRIAL
ESPACIO INTERMEMBRANA
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MATRIZ MITOCONDRIAL
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ESPACIO INTERMEMBRANA
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Estructuras de tres tipos de transportadores de electrones en sus formas oxidados y reducidos. (a) FMN de
NADH deshidrogenasa, (b) el grupo hem del citocromo c, y (c) la ubiquinona (coenzima Q). Los grupos hem
de los diferentes citocromos de la cadena transportadora de electrones difieren en las sustituciones en los
anillos de porfirina (indicados por el sombreado azul) y el tipo de unión con la proteína.
Los citocromos sólo pueden aceptar un electrón, mientras que FMN y las quinonas pueden aceptar dos
electrones y dos protones en reacciones sucesivas, como se muestra. FAD difiere de FMN en que tiene un
grupo de adenosina unido al fosfato.
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SEMANA 7
SEMINARIO I-6
LISOSOMAS. MUERTE CELULAR. APOPTOSIS Y NECROSIS
CONCEPTOS PREVIOS
Los lisosomas juegan un rol clave en el recambio de organelas, regulan la
destrucción de las organelas por sí mismas y su reemplazo. Una mitocondria
tiene una vida media de 10 días
Las hidrolasas ácidas son enzimas hidrolíticas que son activas en
condiciones ácidas.
Una H+ ATPasa en la membrana bombea H + hacia el interior del lisosoma,
manteniendo el lumen con un pH ácido.
La bomba bomba H+ lisosomal pertenece a la familia de ATPasas tipo V y
tiene una arquitectura similar a la de las ATP sintasas de ATP (ATPasas tip-
F) mitocondriales y cloroplásticas, que convierten la energía acumulada en
los gradientes de H+ en ATP.
En contraste con estas enzimas, la ATPasa H+ vacuolar trabaja
exclusivamente a la inversa, bombeando
H+ dentro de la organela. Similares o
idénticas ATPasas tipo-V acidifican todas
las organelas endocíticas y exocíticas,
incluyendo lisosomas, endosomas,
algunos compartimentos del aparato de
Golgi y muchas vesículas de transporte y
vesículas secretoras. Además de
proporcionar un entorno de pH bajo que es
adecuado para las reacciones que se
producen en el lumen del orgánulo (Lumen:
espacio interior de una estructura tubular), el
gradiente de H+ proporciona una fuente de
energía que impulsa el transporte de
pequeños metabolitos a través de la
membrana de la organela.
AUTOFAGIA
La autofagia, una ruta catabólica conservadas evolutivamente en las células
eucariotas, juega un papel importante en la respuesta al estrés y la
degradación de los componentes citosólicos dañados.
Hay tres tipos generales de autofagia que puede entregar materiales
intracelulares
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La organela es rodeada por una doble membrana que produce una estructura
denominada autofagosoma.
La membrana externa mitocondrial se fusiona con el lisosoma para
producir un autofagolisosoma en el cual la organela es degradada y los
productos de la degradación se hacen disponibles para la célula.
En condiciones de ayuno grandes porciones de citosol son capturadas de
forma no selectiva en autofagolisosomas.
Los metabolitos derivados de la digestión del material capturado contribuyen
a la supervivencia celular cuando la disponibilidad de nutrientes externos es
limitada.
Se calcula que una mitocondria experimenta autofagia cada 10 minutos (ej.
Hepatocito).
Si la célula es deprivada de nutrientes, se observa un marcado incremento
en la autofagia.
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(Essential cell biology / Bruce Alberts [and seven others]. -- Fourth edition. 2014).
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Al activarse por la unión del ligando de Fas, los dominios de muerte en las
colas citosólicas de los receptores de muerte Fas unen proteínas
adaptadoras intracelulares, que a su vez se unen a caspasas iniciadoras
(caspasa-8 principalmente), formando un complejo señalizador inductor de
muerte (DISC).
Una vez dimerizadas y activadas en el DISC, las caspasas iniciadoras
escinden sus parejas y luego activan las caspasas ejecutoras posteriormente
para inducir la apoptosis.
o En algunas células, la vía extrínseca recluta a la vía apoptótica
intrínseca para amplificar la cascada de caspasas y matar a la célula.
o Muchas células producen proteínas inhibidoras que actúan
restringiendo la vía extrínseca.
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Las tres clases de proteínas de la familia Bcl2. Tener en cuenta que el dominio
BH3 es el único dominio BH compartida por todos los miembros de la familia
Bcl2; que media las interacciones directas entre los miembros de la familia pro-
apoptóticas y miembros de la familia anti-apoptóticas.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
4. Indaga sobre la necroptosis. ¿En qué consiste? ¿Cuáles serían sus funciones?
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apoptosis. ¿Cómo las imágenes confirman las diferencias entre los dos
procesos? Explique su respuesta.
NEURONA NECRÓTICA
NEURONA APOPTÓTICA
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SEMANA 9
SEMINARIO II-1
TRANSPORTE INTRACELULAR
1. Describa los pasos que se producen entre el momento en que un ribosoma se une a un
ARN mensajero que codifica una proteína de secreción y el momento en que una proteína
abandona el Retículo Endoplásmico Rugoso (RER).
Todas las proteínas de secreción son sintetizadas por ribosomas citosólicos, el tráfico
diverge en dos ramales principales. En cada una de las estaciones intermedias por las
que pasa la proteína hasta su destino final, se realiza una decisión de sí la proteína se
queda retenida en ese compartimento o sigue hasta su destino final. En la mayoría de
las ocasiones se necesita una señal determinada, pero también hay señales por defecto
(en ausencia de señal).
La hipótesis de la señal.
Una proteína se dirige al Retículo Endoplasmático (RE) mediante una secuencia de
señal, un tramo corto de aminoácidos que, por lo general está en su amino terminal.
(Células. Lewin. 2da Edición. 2011)
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¿Cómo una proteína transmembrana de paso único con una secuencia señal de RE
escindido está integrado en la membrana del RE?.
En esta proteína, el proceso de translocación co-traduccional se inicia por una
secuencia de señal de RE N-terminal (rojo) que funciona como una señal de inicio de
transferencia, abriendo el translocador como se muestra en la figura. Además de esta
secuencia de transferencia de inicio, la proteína también contiene una secuencia de
detención de transferencia (naranja); cuando esta secuencia entra en el translocador e
interactúa con un sitio de unión dentro del poro, el translocador se abre en la costura y se
descarga la proteína lateralmente en la bicapa lipídica, donde la secuencia de parada de
transferencia permanece para anclar la proteína en la membrana. (En esta figura los
ribosomas se han omitido para mayor claridad.)
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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2. ¿Cómo logra una proteína integral recién sintetizada insertarse en una membrana?
Todas estas proteínas se dirigen inicialmente al RE por una secuencia señal de RE,
un segmento de ocho o más aminoácidos hidrófobos, que también está implicada en
el proceso de translocación a través de la membrana.
No todas las proteínas producidas por los ribosomas unidos al RE se liberan en la luz
del RE. Algunas permanecen incrustadas en la membrana del RE como proteínas
transmembrana. El proceso de translocación de estas proteínas es más complicado
de lo que es para las proteínas solubles, debido a que algunas partes de la cadena
del polipéptido deben ser trasladadas por completo a través de la bicapa lipídica,
mientras que otras partes permanecen fijas en la membrana.
o En el caso más simple, la de una proteína transmembrana con un solo
segmento que abarca la membrana, la secuencia señal N-terminal inicia la
translocación como lo hace para una proteína soluble.
o Pero el proceso de transferencia se detiene por una secuencia adicional de
aminoácidos hidrofóbicos, una secuencia de detención de transferencia,
localizado a lo largo de la cadena polipeptídica.
o En este punto, el canal de translocación libera la cadena polipeptídica en
crecimiento hacia los lados en la bicapa lipídica.
o La secuencia señal N-terminal se escinde, mientras que la secuencia de
detención de transferencia permanece en la bicapa, atraviesa la membrana
mediante un segmento α-helicoidal que ancla la proteína en la membrana.
o Como resultado, la proteína termina como una proteína transmembrana de
paso único insertado en la membrana con una orientación de la N-terminal
definido en el lado luminal de la bicapa lipídica y el C-terminal en el lado
citosólico.
o Una vez insertada en la membrana, una proteína transmembrana no cambia
su orientación, que se conserva a lo largo de cualquier evento posterior de
gemación y fusión.
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(Essential cell biology / Bruce Alberts [and seven others]. -- Fourth edition. 2014).
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3. Describa algunas de las maneras en que las organelas membranosas pueden mantener
sus composiciones únicas a pesar del continuo tráfico de membranas y materiales que
se desplazan a través de ellas.
Los estudios sugieren que las proteínas se mantienen en una organela por una
combinación de dos mecanismos:
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Las proteínas residentes de RE solubles, tales como BiP, también contienen una
breve señal de recuperación de RE en su extremo C-terminal, pero es diferente:
se compone de una Lys-Asp-Glu-Leu o una secuencia similar. Si esta señal
(llamada la secuencia KDEL) se elimina de BiP por ingeniería genética, la
proteína es secretada lentamente de la célula. Si la señal se transfiere a una
proteína que normalmente se secreta, la proteína será devuelta ahora de manera
eficiente al RE donde se acumulará.
La vía de la recuperación KDEL explica sólo en parte cómo se mantienen las
proteínas residentes del RE en el RE. Como se mencionó, las células que
expresan las proteínas residentes modificadas genéticamente del RE, donde la
secuencia KDEL se ha eliminado experimentalmente, secretan estas proteínas.
Pero la tasa de secreción es mucho más lenta que para una proteína secretora
normal.
Parece que un mecanismo que es independiente de la señal KDEL normalmente
retiene las proteínas residentes RE y que sólo las proteínas residentes que
escapan a este mecanismo de retención son capturadas y se devuelve a través
del receptor KDEL.
La vía de recuperación para regresar proteínas escapadas de nuevo al RE
depende de las señales de recuperación de RE. Las proteínas de membrana RE
residentes, por ejemplo, contienen señales que se unen directamente a cubiertas
COPI y por lo tanto se empaquetan en vesículas de transporte COPI recubiertos
para la entrega retrógrada de RE. La señal de recuperación mejor caracterizada
de este tipo consta de dos lisinas, seguido de cualquier otros dos aminoácidos, en
el extremo C-terminal de la proteína de membrana del RE.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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Las secuencias señal son necesarias y suficientes para dirigir una proteína a un
determinado destino.
Una vez que una vesícula de transporte ha alcanzado su objetivo, debe reconocer
y acoplarse con su organela específica. Sólo entonces puede fusionarse la
membrana de la vesícula con la membrana diana y efectuar la descarga vesicular.
La impresionante especificidad del transporte vesicular sugiere que cada tipo de
vesícula de transporte en la célula muestra marcadores moleculares en la
superficie que identifican la vesícula según su origen y la carga. Estos marcadores
deben ser reconocidos por los receptores complementarios en la membrana diana
apropiada, incluyendo la membrana plasmática.
El proceso de identificación depende de una diversa familia de GTPasas
monoméricas llamadas proteínas Rab.
Las proteínas Rab específicas sobre la superficie de cada tipo de vesícula son
reconocidas por las correspondientes proteínas de anclaje en la superficie
citosólica de la membrana diana.
Cada organela y cada tipo de vesícula de transporte lleva una combinación única
de proteínas Rab, que sirven como marcadores moleculares para cada tipo de
membrana.
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SEMANA 10
SEMINARIO II-2
1. Señala las funciones de cada una de las estructuras mencionadas en la siguiente tabla
relacionando las características estructurales de la molécula y la función que cumplen:
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Uniones gap.
(A) Un dibujo de las membranas plasmáticas de interacción de dos células adyacentes conectadas por
uniones comunicantes. Cada bicapa lipídica se muestra como un par de láminas rojas. Proteínas de
ensamblaje denominadas conexones (verde), cada uno de los cuales está formado por seis subunidades
de conexinas, que penetran en las bicapas lipídicas yuxtapuestas. Dos conexones se unen a través del
espacio intercelular para formar un canal acuoso continuo que conecta las dos células. (B) La organización
de conexinas en conexones y de los conexones en canales intercelulares. Los conexones pueden ser
canales homoméricos o heteroméricos, y los canales intercelulares puede ser homotipicos o heterotıpicos.
(C) La estructura de alta resolución de un canal de hendidura homomérico, determinado por cristalografía
de rayos X de la conexina humana. En esta vista, estamos mirando hacia abajo en el poro, formado a partir
de seis subunidades de conexina. La estructura ilustra las características generales del canal y sugiere un
tamaño de poro de aproximadamente 1,4 m, como se predijo a partir de estudios de permeabilidad GAP-
unión con moléculas de varios tamaños.
(Molecular Biology of The Cell. Bruce Alberts. Sixth Edition, 2015)
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2. Se requiere una fuerza de unos 20 piconewtons (pN) para tirar de una proteína
transmembrana como P-selectina de una bicapa lipídica pura. Para tirar de una molécula
de P-selectina fuera de la membrana plasmática se requiere más de 110 pN. ¿Por qué
crees que se necesita mucha más fuerza para tirar de P-selectina fuera de la membrana
plasmática que fuera de una bicapa lipídica?
CONSIDERACIONES PREVIAS:
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¿POR QUÉ CREES QUE SE NECESITA MUCHA MÁS FUERZA PARA TIRAR DE P-
SELECTINA FUERA DE LA MEMBRANA PLASMÁTICA QUE FUERA DE UNA BICAPA
LIPÍDICA?
Para eliminar la P-selectina de una bicapa se requiere solamente superar las
interacciones hidrofóbicas con los lípidos de la bicapa.
Para removerla de la membrana plasmática se requiere, además, que todos los
enlaces en el lado citoplasmáticos sean rotos. (En caso que se pregunte: se
necesita una fuerza de 10.000 pN para romper un enlace carbono-carbono.)
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PROTEOGLICANOS
Las membranas basales y otras matrices extracelulares suelen contener grandes
cantidades de un tipo distintivo de complejo proteína-polisacárido llamado
proteoglicano.
Un proteoglicano consiste en una molécula de proteína núcleo a la que las
cadenas de glicosaminoglicanos (GAGs) se unen covalentemente. Cada cadena
de glicosaminoglicano se compone de un disacárido de repetición; es decir, que
tiene la estructura -ABABA-, donde A y B representan dos azúcares diferentes.
Los GAGs son muy ácidos debido a la presencia de ambos grupos sulfato y
carboxilo unidos a los anillos de azúcar.
Debido a las cargas negativas presentes en los GAGs sulfatados, los
proteoglicanos se unen un gran número de cationes, que a su vez se unen un gran
número de moléculas de agua.
Como resultado, los proteoglicanos forman un gel poroso, hidratado que llena el
espacio extracelular como material de embalaje y resistente a las fuerzas de
aplastamiento (compresión).
Esta propiedad complementa la de las moléculas de colágeno adyacentes, que
resisten fuerzas de tracción y proporcionan un andamio para los proteoglicanos.
Juntos, colágenos y proteoglicanos ofrecen al cartílago y a otras matrices
extracelulares fuerza y resistencia a la deformación.
La matriz extracelular del hueso además se compone de colágeno y
proteoglicanos, pero se endurece mediante impregnación con sales de fosfato de
calcio.
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Los GAG se clasifican de acuerdo con el tipo de disacárido repetitivo que contienen. Los
grupos sulfato están añadidos en las posiciones puestas de relieve en los disacáridos.
(Lewin’s cells. — 3rd ed. 2015)
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Las lamininas son una familia de glicoproteínas extracelulares que constan de tres
cadenas polipeptídicas diferentes unidos por enlaces disulfuro y organizados en
una molécula semejante a una cruz con tres brazos cortos y un brazo largo.
o Al menos 15 diferentes lamininas han sido identificadas.
Al igual que la fibronectina, la laminina extracelular puede influenciar gran medida
el potencial de una célula para la migración, el crecimiento y la diferenciación. Por
ejemplo, las lamininas desempeñan un papel fundamental en la migración de
células germinales primordiales.
Estas células se encuentran en el saco vitelino, que se encuentra fuera del propio
embrión, y luego migran a través del torrente sanguíneo de los tejidos y embriones
a la gónada en desarrollo, donde finalmente dan lugar a los espermatozoides o los
óvulos.
Durante su migración, las células germinales primordiales atraviesan superficies
que son particularmente ricas en laminina.
Los estudios indican que las células germinales primordiales poseen una proteína
de la superficie celular que se adhiere fuertemente a una de las subunidades de
la molécula de laminina
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Fibronectina
Un modelo del andamio de la membrana basal. Las membranas basales contienen dos moléculas
formando una red, de colágeno IV (rosa), y laminina (verde), que está indicado por las moléculas en
forma de cruz engrosadas. Las redes de colágeno y lamininas están conectadas por moléculas de
entactina (púrpura)
4. Explique qué sucede a nivel molecular cuando un leucocito migra desde el interior de un
vaso sanguíneo hacia el espacio intercelular.
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SEMANA 12
SEMINARIO II-3
Las células pueden detectar señales tanto químicas como físicas. Las señales físicas por lo
general se convierten en señales químicas a nivel del receptor
Comunicación
Comunicación Explicación
humana
Autocrina Hablar consigo La célula que produce el mensaje expresa receptores en su
mismo superficie capaces de responder a ese mensajero.
En algunos casos, las células pueden responder a los
mediadores locales que ellas mismos producen.
En consecuencia, las células que liberan el mensaje se
estimularán (o inhibirán) a sí mismas
Paracrina Hablar con Las moléculas mensajeras viajan sólo distancias cortas a
personas través del espacio extracelular a las células que se encuentran
durante una en las proximidades de la célula que genera el mensaje.
fiesta En lugar de entrar en el torrente sanguíneo, las moléculas de
señal difunden localmente a través del fluido extracelular, que
queda en la vecindad de la célula que la secreta.
Actúan como mediadores locales en las células cercanas.
Muchas de las moléculas señal que regulan la inflamación en el
sitio de una infección o el control de la proliferación celular en
la curación de heridas funcionan de esta manera.
Las moléculas mensajeras paracrinas generalmente están
limitadas en su capacidad para viajar por todo el cuerpo, ya
que son inherentemente inestables, o son degradados por las
enzimas, o se unen a la matriz extracelular.
Endocrina Un anuncio en Las moléculas mensajeras alcanzan sus células diana por
la radio medio del paso a través del torrente sanguíneo.
Los mensajeros endocrinos también se denominan hormonas,
y por lo general actúan sobre las células diana localizadas en
sitios distantes en el cuerpo
Las moléculas de señalización extracelular utilizadas de esta
manera se denominan hormonas, y, en los animales, las
células que producen hormonas se llaman células endocrinas.
En los organismos multicelulares, el estilo más "público" de la
comunicación de célula a célula implica transmitir la señal a lo
largo de todo el cuerpo mediante la secreción en el torrente
sanguíneo de un animal o la savia de la planta.
Señalización Una Al igual que las células endocrinas, las células nerviosas
sináptica conversación (neuronas) pueden transmitir mensajes a través de largas
telefónica distancias.
En el caso de la señalización neuronal, un mensaje no se
difunde ampliamente, pero en su lugar se entrega rápida y
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Ejemplos:
Receptores acoplados a proteínas G (GPCR)
o Una gran familia de receptores que contienen siete α-hélices
transmembrana.
o Promueven la activación de proteínas de unión a GRTP heterotriméricas
llamadas proteínas G, que se asocian con la cara interna de la membrana
plasmática y transmiten señales hacia múltiples proteínas intracelulares.
(http://1.bp.blogspot.com/-PK7YlKuJEoA/Un5ZLygSjrI/AAAAAAAAHhc/gh4DfstAndc/s1600/%25C3%259Cbersicht+GPCR+Liganden.png)
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(http://4.bp.blogspot.com/-zfuM9lBDo4Y/UHLVdZ7mSgI/AAAAAAAAC5Y/7RP7gsvuDgs/s1600/%C3%9Cbersicht+Effekt+G%C2%B4Proteine.jpg)
http://www.nature.com/nrc/journal/v7/n2/images/nrc2069-f1.jpg
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(http://www.vi.cl/gepe/12-05.jpg)
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Otras enzimas que atraviesan una sola vez la membrana, como la guanil ciclasa,
tienen una estructura general similar a las proteína cinasas receptoras pero
diferentes actividades enzimáticas.
La adenil ciclasa cataliza la conversión de ATP en 3´:5´-AMT cíclico, que se usa
para propagar la señal.
La guanil ciclasa cataliza la conversión de GTP en 3´:5´-GMT cíclico, que se usa
para propagar la señal.
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Fosfoproteína fosfatasas
o Revierten el efecto de las proteína cinasas al eliminar los grupos fosforilo
añadidos por estas últimas.
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Existe una serie de otros tipos de receptores que actúan por mecanismos únicos.
Algunos de estos receptores, por ejemplo, los receptores de célula B o T que están
implicadas en la respuesta a antígenos extraños, se asocian con moléculas de
señalización conocidas como las proteína-tirosina quinasas citoplasmáticas.
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Los receptores rara vez actúan de manera directa sobre los procesos
intracelulares que finalmente regulan.
Los receptores inician una secuencia de eventos reguladores que comprenden
proteínas intermediarias y moléculas pequeñas.
El uso de vías de emisión de señales de múltiples pasos permite a las células
amplificar señales, ajustar la cinética de emisión de señales, insertar puntos de
control, integrar señales múltiples, y mandar señales a distintos efectores.
Las vías ramificadas otorgan a las células la capacidad para integrar múltiples
señales entrantes, y dirigir información hacia los puntos de control correctos. La
ramificación puede ser convergente, con regulación de puntos terminales
comunes por señales múltiples, o divergente, con ramificación de una vía única
para controlar más de un proceso.
(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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Las entradas de estas redes son los receptores que captan las señales del exterior
y que suelen tener un dominio extracelular, un dominio transmembrana y un
dominio intracelular.
Estos receptores pueden unir moléculas específicas llamadas ligandos solubles o
interactuar con otros receptores de membrana de otras células.
Muchos receptores al unir su ligando cambian la conformación de su porción
intracelular que se activa.
Esta activación puede realizar un cambio químico específico (frecuentemente
fosforilación) sobre alguna proteína intracelular.
Una vez fosforilada la proteína, ésta tiene capacidad para modificar (fosforilar) a
otras proteínas que a su vez modifican a otras y así sucesivamente.
Estas cascadas de señalización se entrecruzan unas con otras dibujando unas
complejas redes que son capaces de integrar la información de los estímulos y
estados externos e internos.
En estas cascadas de señalización se suele producir un proceso de amplificación
de la señal ya que cada elemento activa a más de uno, y según avanzamos de
nivel puede haber más elementos involucrados.
Para limitar en el tiempo la acción de la señal y preparar la red para detectar
nuevos estímulos se necesita que actúen las fosfatasas que retiran el fósforo de
las quinasas inactivándolas.
Un fino equilibrio entre la acción de quinasas y fosfatasas es clave en las redes de
fosforilación.
( http://medmol.es/temas/70/ )
Las células diana pueden utilizar una gran variedad de mecanismos intracelulares,
incluyendo los circuitos de retroalimentación, para ajustar la forma en la que
responden a señales extracelulares.
Los circuitos de retroalimentación positiva pueden ayudar a la célula a responder de
forma todo o nada a un incremento gradual en la concentración de una señal
extracelular o a convertir una señal de corta duración en una respuesta de larga
duración o incluso irreversible.
La retroalimentación negativa retrasada permite a la célula desensibilizarse a una
molécula señal, lo cual posibilita responder a pequeñas variaciones de la
concentración de la molécula señal en un amplio rango de concentraciones.
(Molecular Biology of the Cell / Bruce Alberts [et al.].-- 5th ed. 2008).
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(Cell and Molecular Biology Concepts and Experiments Gerald Karp 7th edition, 2013).
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5. Los receptores nucleares tienen un sitio de unión para una molécula señal y para una
secuencia de ADN. ¿Cómo es posible que receptores nucleares idénticos en diferentes
células puedan activar genes diferentes cuando se unen a una misma molécula señal?
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