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BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA:
1) Basic Medical Biochemistry. A Clinical Approach. Marks, Marks and
Smith
2) Lehninger Principles of Biochemistry (4º Ed). Nelson and Cox.
3) Bioquímica. Stryer
La comprensión completa del proceso de síntesis de proteínas ha sido uno de los mayores
desafíos de la bioquímica. La síntesis de proteínas eucariotas requiere mas de 70 proteínas
ribosomales, 20 o más enzimas para activar a los aminoácidos precursores y una docena o mas de
enzimas auxiliares y otros factores proteicos para la iniciación, elongación y terminación de las
proteínas junto con otras 100 enzimas adicionales para el procesamiento final y 40 o más tipos de
ARNs. En suma, se requiere aproximadamente 300 macromoléculas diferentes. Una idea de la
importancia de este proceso la da la cantidad de recursos destinados. Hasta un 90% de la energía
celular utilizada en todos los procesos biosintéticos se usa en la síntesis de proteínas.
A pesar de la gran complejidad de este proceso, se puede decir que ocurre a una velocidad
muy alta. En bacterias, por ej. se sintetiza un polipéptido de 100 aminoácidos en alrededor de 5
segundos. Por otra parte la síntesis, la localización y la degradación de miles de proteínas está
finamente regulada para responder a las necesidades celulares metabólicas del momento.
I. EL CÓDIGO GENÉTICO
La transcripción, la transferencia del mensaje genético de ADN a ARN, y la traducción, la
transferencia del mensaje genético del lenguaje de nucleótidos de los ácidos nucleicos al lenguaje
de aminoácidos de las proteínas, dependen de apareamiento de bases. A finales de 1950 y
comienzos de 1960, los biólogos moleculares al intentar descifrar el proceso de traducción
reconocieron dos problemas. El primero consistió en decodificar la relación entre el "lenguaje" de
los ácidos nucleicos y el "lenguaje" de las proteínas, y el segundo consistió en determinar el
mecanismo molecular por el que se produce la “traducción” entre esos dos lenguajes. Veinte
aminoácidos diferentes se incorporan comúnmente en las proteínas, y, por lo tanto, el alfabeto de
las proteínas tiene 20 caracteres. El alfabeto de los ácidos nucleicos, sin embargo, tiene solamente
cuatro caracteres, correspondientes a los cuatro nucleótidos del ARNm (A, G, C y U). Si el código
para un aminoácido estuviera constituido por dos nucleótidos, entonces sólo 4 2= 16 aminoácidos
podrían ser especificados. Por lo tanto, el número de nucleótidos que codifican para un aminoácido
tiene que ser tres, proporcionando 43o 64 combinaciones posibles o "codones", más de lo
necesario, pero no demasiado excesivo. Los científicos se propusieron determinar los codones
específicos para cada aminoácido. En 1961, Marshall Nirenberg produjo la primera decodificación
del código genético (la colección de los codones que especifican todos los aminoácidos encontrados
en las proteínas) al mostrar que el poli (U), un polinucleótido en el que todas las bases son uracilo,
da lugar a polifenilalanina en un sistema de síntesis de proteínas libre de células. Por lo tanto, el
codón UUU debe codificar para fenilalanina. Como resultado de experimentos utilizando
polinucleótidos sintéticos en lugar de ARNm, se identificaron otros codones.
Los biólogos moleculares pioneros reconocieron que, debido a que los aminoácidos no
pueden unirse directamente a los tres nucleótidos que forman sus codones se requiere de
"adaptadores". Se encontró que los "adaptadores" eran moléculas de ARN que se denominaron
ARN de transferencia (ARNt).
ARN de transferencia(ARNt)
Aminoácido
adaptador
Un ARNt diferente
para cada codón,pero
NO ES ASI !!!
Sin solapamiento
Con solapamiento
Marco de lectura 1
Marco de lectura 2
Marco de lectura 3
II. RELACIÓN ENTRE EL ARNm Y LAS PROTEÍNAS GENERADAS
A. Mutaciones puntuales
Las mutaciones puntuales se producen cuando sólo se altera una base en ADN, produciendo
un cambio en una única base de un codón del ARNm. Hay tres tipos básicos de mutaciones
puntuales: mutaciones silenciosas, mutaciones de cambio de sentido y mutaciones sin sentido. Las
mutaciones puntuales se dice que son "silenciosas" cuando no afectan la secuencia de aminoácidos
de la proteína.Por ejemplo, un cambio de codón de CGA a CGG no afecta a la proteína porque
ambos codones especifican arginina. En mutaciones sin sentido, un aminoácido en la proteína es
sustituido por un aminoácido diferente. Por ejemplo, un cambio de CGA a CCA causa una
sustitución de arginina por prolina. Una mutación "sin sentido" causa la terminación prematura de
la cadena polipeptídica. Por ejemplo, un cambio de codón UGA a CGA causa la sustitución de un
codón para arginina por un codón de terminación y la síntesis de la proteína mutante termina en
ese punto.
B. Las inserciones, deleciones y mutaciones que cambian el marco de lectura
Una inserción se produce cuando se añaden uno o más nucleótidos al ADN. Si la inserción no
genera un codón de terminación, puede producirse una proteína con aminoácidos de más.Cuando
uno o más nucleótidos se eliminan del ADN, se denomina a la mutación como una deleción. Si la
eliminación no afecta ni al inicio de la traducción, ni a los codones de terminación puede producirse
una proteína con menos de la cantidad normal de aminoácidos.
Una mutación de desplazamiento de marco de lectura se produce cuando el número de
nucleótidos insertados o eliminados no es un múltiplo de tres. El marco de lectura se desplaza en el
punto de la inserción o la deleción. Más allá de ese punto, la secuencia de aminoácidos de la
proteína traducida a partir de ese ARNm difiere de la proteína normal.
Brazo TC
Brazo D
Posición oscilante
Brazo del anticodón
En un primer paso el aminoácido es activado cuando su grupo carboxilo reacciona con ATP
para formar un complejo enzima/aminoacil-AMP y pirofosfato. La ruptura del enlace de alta energía
del ATP provee la energía y la hidrólisis subsecuente del pirofosfato por una pirofosfatasa favorece
el avance de la reacción removiendo uno de los productos.
Aminoacil-ARNt sintetasa
Aminoácido + ARNt + ATP aminoacil-ARNt + AMP + PPi
Adenina
Un
aminoácido
Adenina
5aminoacil adenilato
(aminoacil-AMP)
Adenina
Adenina
Aminoacil-AMP Adenosina
Am Am
Adenina Adenina
3´del ARNt
Trans-est
Aminoacil-ARNt
V. EL PROCESO DE TRADUCCION
La traducción de una proteína involucra tres pasos: iniciación, elongación y terminación.
Comienza con la formación del complejo de iniciación. Luego, la síntesis del polipéptido ocurre por
una serie de pasos de elongación que se repiten cuando se agrega cada aminoácido a la cadena en
crecimiento. La terminación ocurre cuando se llega a un codón de terminación (en el marco de
lectura) del ARNm y se libera la cadena polipeptídica.
A. Iniciación de la traducción
En eucariotas, la iniciación de la traducción involucra la formación de un complejo formado
por metionil-ARNtiMet, ARNm, y un ribosoma. El metionil-ARNtiMet(también conocido como Met-
ARNtiMet) inicialmente forma un complejo con el Factor proteico de Iniciación eucariota 2 (eIF2),
que une GTP. Este complejo luego se une a la subunidad menor del ribosoma (40S). El “cap”en el
extremo 5' del ARNm une un factor de iniciación conocido como “proteína de unión a cap” (CBP).
CBP contiene varias subunidades, incluyendo eIF4E. Se unen otros factores de iniciación, y luego el
ARNm se une al complejo eIFs-Met-ARNtiMet– 40S. En una reacción que requiere la hidrólisis del ATP
(debida a la actividad helicasa de un factor eIF), este complejo desenrolla las estructuras
secundarias del ARNm y lo recorre hasta que localiza el codón de iniciación AUG (generalmente el
primer AUG). Se hidroliza GTP, se liberan los factores de iniciación y se une la subunidad mayor del
ribosoma (60S). El ribosoma está ahora completo. Contiene una subunidad menor y una mayor, y
tiene dos sitios de unión para el ARNt, conocidos como sitios P (peptidilo) y A (aminoacilo). Durante
la iniciación el Met-ARNtiMetse une al ribosoma en el sitio P. El proceso de iniciación difiere entre
procariotas y eucariotas. En las bacterias, el metionil-ARNt de iniciación se transforma en formil-
metionil-ARNtfMetque participa en la formación del complejo de iniciación. Sólo se requieren tres
factores de iniciación (IFs) para generar este complejo en procariotas, comparado con la docena o
más que se requieren en eucariotas. Los ribosomas también difieren en su tamaño. Los procariotas
tienen ribosomas 70S, compuestos de subunidades 30S y 50S, y los eucariotas tienen ribosomas
80S, compuestos de subunidades 40S y 60S. A diferencia del ARNm eucariota, el ARNm bacteriano
no presenta “cap”. La identificación del triplete AUG de iniciación en los procariotas ocurre cuando
una secuencia del ARNm (conocida como la secuencia de Shine–Dalgarno) se une a una secuencia
complementaria cercana al extremo 3' del ARNr 16S de la subunidad menor del ribosoma.
eIF-2 es uno de los puntos de control de la síntesis de proteínas en eucariotas. Una de sus
subunidades es fosforilada cuando la célula sufre estrés y se requiere una disminución del gasto de
energía. Tal es el caso del ayuno de aminoácidos y glucosa, infección viral, proteínas mal plegadas,
deprivación de suero, hiperosmolaridad y shock térmico. En ese caso se previene la formación del
complejo de preiniciación y por lo tanto se bloquea la síntesis de proteínas.
Subunidad menor del ribosoma
Subunidadmenor
Subunidad mayor
del ribosoma
Subunidad mayor
Los pasos de
elongación 1 a 3 se
repiten con otro
aminoácido
3. Translocación
La translocación en eucariotas involucra otra proteína G, el factor de elongación EF2(EF-G en
procariotas) que forma un complejo con GTP y se une al ribosoma, causando un cambio
conformacional que mueve el ARNm y los ARNt unidos con respecto al ribosoma. El ARNt
descargado es desplazado del sitio P y se libera del ribosoma. El peptidil-ARNt se mueve al sitio P, y
el siguiente codón del ARNm ocupa el sitio A. Durante la translocación, se hidroliza GTP a GDP y se
libera del ribosoma junto con el factor de elongación.
C. Terminación de la traducción
Las tres etapas de la elongación se repiten hasta que un codón de terminación se localiza en
el sitio A del ribosoma. Normalmente en las células no hay ARNt con anticodones que puedan
aparearse con los codones de terminación. En cambio se unen factores de liberación al ribosoma,
ocasionando la hidrolisis del enlace entre la cadena peptídica y el ARNt por la peptidiltransferasa. El
polipéptido recientemente sintetizado se libera del ribosoma, que se disocia en sus subunidades
liberando también el ARNm.
VI. POLISOMAS
Mientras un ribosoma se desplaza a lo largo del ARNm generando una cadena polipeptídica,
un segundo ribosoma se puede unir al extremo 5' libre del ARNm. Muchos ribosomas pueden
traducir simultáneamente un dado ARNm, formando un complejo conocido como polisoma. Un
único ribosoma cubre aproximadamente 80 nucleótidos del ARNm. Por lo tanto se encuentran
ribosomas en el ARNm a intervalos de aproximadamente 100 nucleótidos. La cadena polipeptídica
creciente unida al ribosoma se hace mas larga a medida que el ribosoma se mueve desde el
extremo 5' hacia el 3' del ARNm.