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Spanish WB Webinar PDF
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Introduccin y Optimizacin
10 Abril 2013
Ariana Veiga
Western Blot
En qu Tambin llamado Inmunoblot
consiste el
Western Tcnica utilizada para identificar una protena en una muestra que contiene
Blot? varias protenas
Las protenas de la muestra se separan mediante electroforesis en gel en funcin de su
peso molecular
Cmo
funciona?
A continuacin se utiliza un anticuerpo especfico para detectar la protena de inters
El resultado aporta informacin sobre el peso molecular de la protena y su cantidad
relativa en la muestra
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En qu casos es til utilizar
Western Blot?
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Organizacin del Webinar
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Preparacin de las muestras para la
electroforesis
Lisis: Las clulas o los tejidos se tratan con un tampn de lisis y seguidamente se
degradan mecnicamente para liberar las protenas
Clulas: mantenerlas en hielo, lavar con PBS fro y aadir el tampn de lisis (~1ml por
cada milln de clulas). Despus agitar durante 30 minutos a 4 C
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Lisis
Lisis: Las clulas o los tejidos se tratan con un tampn de lisis y seguidamente se
degradan mecnicamente para liberar las protenas
Clulas: mantenerlas en hielo, lavar con PBS fro y aadir el tampn de lisis
(~1ml por cada milln de clulas). Despus agitar durante 30 minutos a 4 C
Tejido: diseccionar rpidamente el tejido y mantenerlo en hielo. Congelar
inmediatamente en nitrgeno lquido y homogeneizar en tampn de lisis (300 l
por cada 5 g de tejido). Aclarar las cuchillas del homogeneizador con 2 x 300
l de tampn, y agitar despus durante 2 horas a 4 C
Centrifugar a 4 C durante 20 minutos, aspirar el sobrenadante y mantenerlo
en hielo
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Condiciones reductoras y
desnaturalizantes
SDS y DTT/
-mercaptoetanol
Nota: Algunos anticuerpos solo reconocen las protenas nativas (no reducidas y/o no desnaturalizadas). En este caso SDS y/o -mercaptoetanol o
DTT no deben aadirse a los tampones.
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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SDS-PAGE
-
Corriente elctrica
Frente de migracin
+
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Geles
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Objetivo de la transferencia
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Cmo funciona la transferencia?
Montaje de la transferencia
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Transferencia en medio
hmedo o semi seco?
Ventajas Inconvenientes
El gel y la membrana se intercalan y fijan Adecuado El proceso de
firmemente entre finas esponjas y papel para protenas transferencia es
absorbente grandes o ms largo
Este montaje sndwich se sumerge en un difciles de
Medio compartimento que contiene el tampn de transferir
Hmedo transferencia donde se aplica a continuacin
la corriente elctrica
Un tampn de transferencia se compone
normalmente de 25mM Tris, 190mM Glicina
y 20% de Metanol
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Por qu se utilizan anticuerpos?
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Inmunodeteccin
Bloqueo de la
membrana Leche, BSA, etc
Eptopo
Lavado (TBST)
Incubacin con
Protena Protena
anticuerpo secundario Anticuerpo
conjugado
Lavado (TBST)
Deteccin
Protena
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Deteccin
Sustrato (perxido de hidrgeno + luminol)
Los sustratos cromognicos (4-cloronaftol o DAB) tambin pueden utilizarse con las
enzimas HRP o AP, dando lugar a un producto coloreado que se deposita en la
membrana prximo a la zona del anticuerpo
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Controles de carga
Los controles de carga son anticuerpos usados para asegurar que la carga de protenas en cada calle del gel de
SDS PAGE es constante
Un anticuerpo control de carga detecta una protena altamente conservada y presente en cantidades similares
independientemente del tipo de muestra
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Controles de carga
Nota: la afinidad del anticuerpo puede variar segn la especie o naturaleza de la protena (nativa o
recombinante), etc
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Controles positivos y negativos
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Pptidos de bloqueo
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Adecuado para Western Blot
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Inmungeno y especificidad
La seleccin del inmungeno permite producir un anticuerpo que reconozca y se fije sobre
una regin especfica de la protena (eptopo)
NERTCRCDKP
NERTCRCDKP
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Ausencia de bandas,
o bandas muy dbiles
Origen del problema Solucin
Incompatibilidad con el anticuerpo Seleccionar un anticuerpo secundario que sea
secundario compatible con la especie y el isotipo del anticuerpo
primario (ej. Anticuerpo secundario anti-IgM de ratn
con anticuerpo primario IgM hecho en ratn)
No hay suficiente protena o Aumentar la cantidad de lisado, de anticuerpo
anticuerpo para producir una seal primario o de anticuerpo secundario (incluso una
combinacin de los tres)
Tiempo de incubacin insuficiente Incubar la membrana con el anticuerpo primario
para producir una seal durante la noche a 4C
La membrana no se ha bloqueado Bloquear durante menos tiempo o usando un agente
correctamente de bloqueo diferente. La adicin de Tween 20 al
tampn de bloqueo reduce la fijacin del anticuerpo
al agente de bloqueo
La protena no se ha transferido Comprobar que se ha producido la transferencia
correctamente del gel a la usando un colorante como rojo de Ponceau. Es
membrana posible que sea necesario aumentar o disminuir el
tiempo de transferencia
Las protenas hidrfobas son ms Para este tipo de protenas usar membranas de
difciles de transferir PVDF
La muestra no expresa la protena Revisar literatura y bases de datos sobre la protena
de inters de inters
El anticuerpo no reconoce la Verificar que la secuencia del inmungeno est
protena de inters presente en la protena a estudiar
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Ruido de fondo
Origen del problema Solucin
Exceso de lisado celular, anticuerpo Reducir la carga de protena en el gel y/o diluir ms
primario o secundario que provocan los anticuerpos
uniones no especficas
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Exceso de protena y/o anticuerpo
Dilucin de
la muestra y
anticuerpo
primario
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Optimizacin del tampn de bloqueo
5% leche 5% BSA
5% BSA 5% leche
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Burbujas de aire, lavados insuficientes,
transferencia incompleta
Durante la transferencia,
contacto insuficiente entre
el gel y la membrana
Lavados insuficientes
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Protenas en estado nativo
Algunos anticuerpos presentan mayor afinidad por las estructuras nativas de las
protenas que por las formas desnaturalizadas y/o reducidas
La imagen muestra un Western Blot de colgeno III humano purificado, en la
forma reducida y desnaturalizada a la izquierda, y en su forma nativa a la derecha
La estructura tridimensional del sitio de unin del anticuerpo al antgeno se
pierde al desnaturalizar y reducir la protena
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Conocer la protena de inters
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Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodeteccin
Controles recomendados en WB
Seleccin de anticuerpos
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Protocolos y material de inters
SwissProt www.uniprot.org
Protocolos detallados de WB
www.abcam.com/protocols
Anticuerpos
Anticuerpos secundarios validados para WB
secondarios Conjugados a fosfatasa alcalina (AP) o peroxidasa (HRP)
AbExcel
www.abcam.com/abexcel
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Optiblot reactivos para WB
Ms informacin: www.abcam.com/Optiblot
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Anticuerpos monoclonales de conejo
( ), ptimos para WB
Histona H3 RabMAb: ventajas para WB
(fosfoT3) RabMAb
Alta afinidad mayor factor de dilucin (hasta
1:500.000 en algunos RabMAbs)
Alta especificidad seal especfica, sin o
con muy poco ruido de fondo
Reconocen eptopos diversos ideal para la
deteccin de modificaciones post-
traduccionales (ej. fosforilacin, metilacin,
acetilacin)
Cada RabMAb has sido testado en WB en
muestras humanas, de ratn y rata para
determinar la reactividad
Ms de 4000 RabMAbs disponibles
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AbExcel anticuerpos secundarios
Ms informacin:
AbExcel: http://www.abcam.com/AbExcel
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Bolgrafo Luminol para membrana
(ab166858)
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Contctanos
soportecientifico@abcam.com
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Promocin especial para participantes
Gama Optiblot
RAbMAbs
Gama AbExcel
Cdigo : SPWEB-XBIS1
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Preguntas?
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