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Unidad 1. Biotransformaciones
Ingeniera de biorreactores I
Unidad 1. Biotransformaciones
1. Biotransformaciones
ndice
Unidad 1. Biotransformaciones..2
Presentacin de la unidad2
Propsitos de la unidad3
Competencia especfica...4
1.1. Concepto de biotransformacin..4
1.1.1. Procesos biocatalizados5
1.1.2. Fundamentos de la biocatlisis7
1.2. Teora de la catlisis enzimtica...10
1.2.1. Cintica enzimtica..11
1.2.2. Mecanismo de reaccin enzimtica..15
1.3. Factores que afectan la cintica enzimtica...17
1.3.1. Especificidad.18
1.3.2. Desnaturalizacin.19
1.3.3. pH...20
1.3.4. Temperatura..21
1.3.5. Inhibicin21
1.3.6. Inmovilizacin de enzimas..24
Actividades...26
Autorreflexiones...27
Cierre de la unidad..27
Para saber ms27
Fuentes de consulta28
1. Biotransformaciones
Unidad 1. Biotransformaciones
Presentacin de la unidad
Sabas que hoy en da las transformaciones biolgicas de la materia tienen gran auge
y que los bioprocesos son indispensables para la produccin de antibiticos, probiticos,
biopolmeros, biocombustibles?
Para ser capaz de disearlos, es necesario, como punto de partida, que comprendas
cules son las sustancias y factores que pueden o no favorecer dichos bioprocesos; de
ah la importancia del estudio de esta primera unidad.
Para comenzar, debes considerar que la velocidad de una reaccin qumica se aumenta o
disminuye agregando una sustancia llamada catalizador.
Nuevos compuestos
Sustrato
Enzima
Figura 1. Representacin del proceso de degradacin de una sustancia (sustrato) por una
enzima. Fuente: personas.ya.com, s.f.
1. Biotransformaciones
Sabas que las enzimas son importantes en los procesos industriales?
Por ejemplo, el detergente en polvo tiene unas enzimas llamadas lipasas que remueven
selectivamente las manchas de manteca, aceite o lpiz labial de la ropa, o bien, proteasas
que remueven las manchas de sangre y huevo.
Estas enzimas son amigables con el ambiente ya que permiten remplazar compuestos
qumicos poco biodegradables, minimizar el uso del agua y por supuesto, el consumo de
energa.
Las enzimas que se usan actualmente son producidas por bacterias y hongos, las cuales
se reproducen en grandes equipos llamados biorreactores o fermentadores.
Propsitos de la unidad
1. Biotransformaciones
propiedades catalticas de las enzimas y por ende en su
actividad tales como: especificidad, temperatura, pH,
inhibicin e inmovilizacin.
Competencia especfica
Alguna vez te has preguntado cules son los bioprocesos y los mecanismos
responsables de que la fermentacin de la pia se lleve a cabo? o bien qu sustancias
son las responsables de la conversin del alimento en la boca, en el estmago y en el
intestino? Todos estos fenmenos, se llevan a cabo gracias al empleo de enzimas que
actan como biocatalizadores, a travs del proceso llamado biotransformacin.
Fructosa
Sacarosa
Enzima
Figura 2. Ejemplificacin de un proceso de biotransformacin de sacarosa para produccin de
glucosa y fructosa. Fuente: genomasur.com, s.f.
1. Biotransformaciones
Un ejemplo de biotransformacin tiene lugar cuando la leche se almacena en bolsas
hechas con estmagos de terneras recin sacrificadas (figura 3), as, las enzimas ah
presentes, dan lugar a la formacin de una sustancia semislida y fcil de almacenar que
conoces con el nombre de queso.
Te imaginas todo lo que puedes llegar a crear a partir de las biotransformaciones? Hoy
da se acepta incluso, que estos procesos sustituirn en gran parte a la sntesis orgnica,
con lo que, se evitarn problemas de contaminacin ambiental, ya que los
biocatalizadores son biodegradables, las condiciones suaves de trabajo implican poco
consumo energtico y por tanto, poco costo y emisin de contaminantes.
1. Biotransformaciones
Por lo tanto, el objetivo de la biocatlisis es el uso de las enzimas y de dichas reacciones
con fines tecnolgicos. Para desarrollar procesos biocatalticos a gran escala, se suelen
seguir las etapas a continuacin citadas:
1. Biotransformaciones
Pues bien, las enzimas son complejos protenicos, encargados de disminuir la energa
necesaria para que se realicen reacciones qumicas al interior de los organismos
biolgicos (figura 5).
1. Biotransformaciones
Estos biocatalizadores, actan sobre una sustancia denominada sustrato. Al unirse a l,
a travs del sitio activo (parte funcional de la enzima), se forma un complejo (complejo
enzima-sustrato) que posteriormente da lugar al producto de inters, tal como se
muestra en la siguiente figura 6:
El cofactor puede ser un ion metlico o bien una molcula orgnica, llamada coenzima,
aunque algunos enzimas necesitan de ambos. El cofactor puede estar fuertemente unido
a la protena (suele ser el in metlico, aunque puede igualmente ser un coenzima) y
recibe entonces el nombre de grupo prosttico, o dbilmente unido, por lo que en
realidad acta como un sustrato especfico de la enzima (co-sustrato; suele ser una
molcula orgnica, coenzima). El complejo enzima-cofactor catalticamente activo recibe
el nombre de holoenzima. Cuando se separa el cofactor, la protena restante, que por s
misma es inactiva catalticamente, se designa con el nombre de apoenzima (Figura 7).
1. Biotransformaciones
Apoenzima
Holoenzima
Para concluir este tema, es importante enfatizar que los procesos de biotransformacin
o biocatlisis son importantes ya que reducen riesgos de contaminacin, esta es una de
las razones por las que se han convertido en una herramienta valiosa para la sociedad,
especialmente dentro del campo industrial.
1. Biotransformaciones
Es importante, para el control de un bioproceso, conocer aspectos fundamentales de los
biocatalizadores empleados, tales como los mecanismo de reaccin y cintica
enzimtica, mismos que sern abordados en el siguiente tema.
Sabas que las enzimas son biocatalizadores que pueden llegar a acelerar unas 106
veces ms la velocidad de una reaccin? As, por ejemplo, un proceso de fermentacin
que sin ayuda de enzimas podra tardar hasta 180 das en efectuarse, bajo condiciones
normales de temperatura, puede reducirse de 15 a 20 das, interesante no crees?
Tal como estudiaste en el tema anterior, en todos los sistemas vivos se realizan
reacciones qumicas que por s mismas ocurren a velocidades muy bajas. Las enzimas
son herramientas moleculares que permiten que dichas reacciones ocurran a niveles
tiles para las clulas (figura 8).
Figura 8. La catlisis permite que las reacciones costosas transcurran por caminos mucho ms
sencillos. Fuente: WILEY-VCH, 2008.
Pues bien, esta incgnita ser respondida a travs del desarrollo del presente tema, que
tiene como propsito que analices cmo la presencia de enzimas dentro de una reaccin
qumica influencia la velocidad de la misma. Asimismo, identificars las herramientas que
1. Biotransformaciones
te permitirn calcular la afinidad que tiene un biocatalizador por un sustrato y la velocidad
mxima que puede llegar a adquirir.
Tal como se estudi en el tema anterior, las reacciones qumicas que se efectan en
presencia de biocatalizadores, ocurren en dos etapas (figura 9):
Etapa 2
Etapa 1
1. Biotransformaciones
En la etapa 1 puede distinguirse que se forma el complejo enzima-sustrato, sin embargo,
cierta parte de dicho complejo, se disocia para restablecer la enzima libre y el sustrato; en
cambio, en la etapa 2, el complejo enzima-sustrato se disocia para generar la enzima libre
y el producto; de tal forma, que las velocidades con sus respectivas constantes cinticas,
para cada uno de los procesos individuales, se pueden expresar como:
1 = 1 [][] 1:
= [] 1:
= [] 2:
Donde:
k1, k2, k3=constantes microscpicas de velocidad
[E]=concentracin de enzima libre
[S]=concentracin de sustrato
[ES]=concentracin del complejo enzima-sustrato
[ ] = [] + []
Donde:
[ET]=concentracin total de enzima
[] = [ ] []
1 = 1 ([ ] [])[]
= [ ][] [][]
Este modelo cintico adopta la hiptesis del estado estacionario, segn la cual la
concentracin del complejo enzima-sustrato es pequea y constante a lo largo de la
reaccin. Por tanto, la velocidad de formacin del complejo enzima-sustrato (v1) es igual a
la de su disociacin (v2 + v3):
1 = 2 + 3
1. Biotransformaciones
Entonces, sustituyendo en esta expresin, las ecuaciones respectivas de velocidad, se
tiene:
1 [ ][] 1 [][] = 2 [] + 3 []
1
(1 [ ][] 1 [][] = 2 [] + 3 []) ( )
1
2 3
[ ][] [][] = [] + []
1 1
Despejando la [ES]:
2 3
[][] + [] + [] = [ ][]
1 1
2 3
[] ([] + + ) = [ ][]
1 1
2 + 3
[] ([] + ) = [ ][]
1
[ ][]
[] = 2 +3
[] +
1
2 +3
Sustituyendo 1
= , se tiene:
[ ][]
[] =
+ []
Donde:
km=constante de Michaelis-Menten
1. Biotransformaciones
3 [ ][]
=
+ []
[]
=
+ []
A partir del modelo previamente citado, se realiza el clculo de las constantes cinticas
Vmax y km.
1. Biotransformaciones
1.2.2. Mecanismo de reaccin enzimtica
El valor de Vmax se puede determinar a partir del valor mximo obtenido de la curva;
mientras que la km corresponde a la concentracin de sustrato a la cual la velocidad de la
reaccin es la mitad de la Vmax.
A partir de este grfico, que corresponde con una lnea recta, se toman las siguientes
consideraciones:
1. Biotransformaciones
En conclusin, existen mtodos grficos que facilitan el clculo preciso de km y Vmax. Los
cuales se hacen a partir de la manipulacin matemtica de los datos empleados para la
representacin de Michaelis-Menten y de Lineweaver-Burk (figura 12).
1. Biotransformaciones
1.3. Factores que afectan la cintica enzimtica
Has notado que cuando dejas un alimento a temperatura ambiente, por un determinado
lapso de tiempo, este tiende a descomponerse a mayor velocidad que uno que se
encuentra en el congelador; o que si agregas unas gotas de limn sobre la pulpa, de una
manzana partida por la mitad, disminuye su oxidacin; o que cuando hierves la leche
tiende a descomponerse ms lentamente; o bien, que la fruta se conserva por ms tiempo
cuando la preparas en mermelada? (figura 12).
Todos los fenmenos descritos indican que existen factores que son capaces de modificar
la velocidad de una reaccin enzimtica.
Ahora bien, existen sustancias que son capaces de modificar la velocidad de reaccin
enzimtica pero hacindola ms lenta, es decir, la retrasan. A estas sustancias se les
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llama inhibidores. El uso de inhibidores es muy importante en la industria farmacutica y
en la industria alimenticia ya que al hacer ms lentas las reacciones evitamos la
formacin, durante un tiempo determinado, de sustancias o productos indeseables que
hacen que tanto los medicamentos como los alimentos se descompongan rpidamente.
En la industria alimenticia a estos inhibidores se les llama conservadores. Estos
pertenecen a un grupo de sustancias llamadas aditivos que suelen agregarse a los
alimentos procesados para mejorarlos.
Como ves, existen mltiples factores que aceleran o retardan la velocidad de reaccin,
por lo que, a travs del desarrollo del tema Factores que afectan la cintica enzimtica
podrs analizar el empleo de enzimas en las biotransformaciones y describir la influencia
de dichos factores fisicoqumicos.
1.3.1. Especificidad
Cuando la enzima slo puede actuar sobre un tipo de sustrato, se dice que muestra
especificidad absoluta. Si puede actuar sobre sustratos con estructuras muy similares,
se dice que muestra especificidad relativa.
Las enzimas aceleran las reacciones alterando la conformacin de sus sustratos para que
logren llegar al estado de transicin. El modelo ms simple para entender esta interaccin
enzimasustrato es el modelo de llave-cerradura, en el cual el sustrato encaja
perfectamente en el sitio activo de la enzima.
En muchos casos, las conformaciones tanto de la enzima como del sustrato son
modificadas cuando logran unirse: es el llamado modelo de encaje inducido. Esta
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alteracin de las conformaciones hace que logren llegar ms rpido al estado de
transicin.
1.3.2. Desnaturalizacin
Otros de los factores que afectan la actividad enzimtica es la temperatura. Los aumentos
de temperatura aceleran las reacciones enzimticas, por cada 10C de incremento, la
velocidad de reaccin se duplica. Sin embargo, cuando la temperatura es muy elevada,
dichos biocatalizadores se desnaturalizan, es decir, sufren un cambio en su estructura,
por lo que se observa prdida de actividad cataltica hasta la anulacin.
1. Biotransformaciones
Otros factores que intervienen en esta modificacin son: el pH, los cambios de
concentracin, la velocidad de agitacin o la presencia de agentes desnaturalizantes
(figura 14).
1.3.3. pH
Los aminocidos que forman a las enzimas estn ionizados, es decir, se encuentran
cargados positiva o negativamente, dependiendo el pH del medio. Los biocatalizadores al
contener ambas cargas a lo largo de su cadena, experimentan fuerzas de atraccin y
repulsin que permiten el mantenimiento de la estructura tridimensional de la protena.
Cualquier modificacin del pH, por encima o debajo del ptimo, afecta drsticamente la
actividad enzimtica.
1. Biotransformaciones
1.3.4. Temperatura
1.3.5. Inhibicin
1. Biotransformaciones
Figura 17. Efecto del inhibidor en la actividad enzimtica. Fuente: Luengo, L., s.f.
1. Biotransformaciones
la enzima, a bajas concentraciones de I, la inhibicin puede vencerse aadiendo una gran
cantidad de S con lo que aumenta la cantidad de complejo enzima-sustrato sobre el
complejo enzima-inhibidor. Ya que es necesario aadir ms sustrato para vencer la
inhibicin, km ser mayor. Matemticamente la ecuacin para una cintica Michaelis
Menten con inhibicin competitiva es:
[]
=
[] + (1 + []/ )
[]
=
([] + )(1 + []/ )
En la inhibicin acompetitiva (figura 20) el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo
despus de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, el inhibidor y el sustrato no
compiten.
1. Biotransformaciones
De esta manera, aunque todo el sustrato est
saturando la enzima y toda la enzima est como
complejo enzima-sustrato, el inhibidor puede
enlazarse produciendo un complejo inactivo
enzima-sustrato-inhibidor.
Impedimento del paso de sustrato al centro activo por bloqueo durante la unin
al soporte.
Los grupos reactivos del soporte reaccionan con algn grupo del centro activo
de la enzima esencial para la actividad cataltica.
Durante la unin al soporte se puede originar cambio en la estructura
tridimensional de la enzima.
Las condiciones del proceso pueden causar desnaturalizacin.
1. Biotransformaciones
Figura 21. Simulacin del efecto de la inmovilizacin en la actividad enzimtica. Fuente: Tripod,
s.f.
La desactivacin enzimtica puede causarse por un grupo reactivo en el sitio activo que
participa en la reaccin de enlace (Esquema 3).
1. Biotransformaciones
La orientacin de la molcula de enzima unida al soporte puede impedir el acceso del
sustrato al sitio activo, o la liberacin del producto (efectos estricos; Esquema 5).
Actividades
La elaboracin de las actividades estar guiada por tu docente en lnea, mismo que
te indicar, a travs de la Planeacin didctica del docente en lnea, la dinmica que t
y tus compaeros (as) llevarn a cabo, as como los envos que tendrn que realizar.
1. Biotransformaciones
Autorreflexiones
Para la parte de autorreflexiones debes responder las Preguntas de Autorreflexin
indicadas por tu docente en lnea y enviar tu archivo. Cabe recordar que esta actividad
tiene una ponderacin del 10% de tu evaluacin.
Cierre de la unidad
Para saber ms
Puedes consultar el video realizado por Gonzlez et al. (2010), de Investigadores del 4to.
Grado de PEDECIBA Qumica. El propsito de este documental es profundizar en el
concepto de biocatlisis, sus aplicaciones, usos y fuentes de diversas enzimas con fines
tecnolgicos
(http://www.youtube.com/watch?feature=player_detailpage&v=VgqJ88vBc2E).
1. Biotransformaciones
analizar paso a paso la resolucin de problemas relacionados con la ecuacin de
Michaelis-Menten, y el clculo de las constantes cinticas km y Vmax
(http://www2.uah.es/sancho/farmacia/problemas%20cinetica%20enzimatica%2010-
11%20con%20respuestas.pdf).
Fuentes de consulta
Bsicas:
Ehu. (s.f.). Motivos que hacen de km un parmetro cintico importante. Recuperado de:
http://www.ehu.es/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#km
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http://repositorio.bib.upct.es/dspace/bitstream/10317/282/5/ANEXO%20II.%20MODELO%
20DE%20MICHAELIS-%20MENTEN.pdf
1. Biotransformaciones
Complementarias:
Franco, V. L. (2007). Enzimas: qu son y para qu sirven. Rev. R. Acad. Cienc. Exact.
Fs. Nat. VIII Programa de Promocin de la Cultura Cientfica y Tecnolgica.
Koolman y Rohm. (2004). Enzimas: fundamentos. Bioqumica. En: Texto y Atlas. 3era.
Edicin. Editorial: Panamericana. Pg. 88-97.
Voet, D., Voet, J. G., Pratt, C. (2009). Captulo 12. Cintica, inhibicin y regulacin de las
enzimas. En: Fundamentos de Bioqumica. Editorial: Medica Panamericana. Buenos
Aires. Pg. 357-377.
1. Biotransformaciones
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http://www.uib.es/facultat/ciencies/prof/josefa.donoso/campus/modulos/modulo4/modulo4_
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Luengo, L. (s.f.). Efecto del inhibidor en la actividad enzimtica. [Imagen]. Recuperado de:
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1. Biotransformaciones
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WILEY-VCH. (2008). La catlisis permite que las reacciones costosas transcurran por
caminos mucho ms sencillos. [Imagen]. Recuperado de: http://ebookee.org/Catalysis-
Concepts-and-Green-Applications_166415.html