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Compuesto
Estado de oxidacin
N orgnico (R-NH2)
-3
Amonaco (NH3)
-3
Nitrgeno gaseoso (N2)
0
Oxido nitroso (N20)
+1 (promedio por N)
Oxido de nitrgeno (NO)
+2
Nitrito (NO2-)
+3
Bixido de nitrgeno (NO2) +4
Nitrato (NO3-)
+5
Amonificacin
Es el proceso por el cual los compuestos
nitrogenados encontrados en el suelo,
productos de la descomposicin de materiales
orgnicos complejos tales como protenas,
aminocidos, cidos nucleicos y nucletidos
son degradados a compuestos simples por
organismos que habitan el suelo, principalmente
bacterias y hongos. Estos microorganismos
metabolizan estos compuestos y liberan el
exceso de nitrgeno en forma de amonaco o
in amonio.
AMONIFICACION
Materia orgnica
Suelo
Compuestos
nitrogenados
orgnicos
Se descomponen
Proceso de amonificacin
NH3
O
Bacterias y hongos
El exceso
NH4+
Nitrificacin
La nitrificacin es el proceso por el cual
varias especies de bacterias comunes en
los suelos son capaces de oxidar el
amonaco o el in amonio. Es un proceso
generador de energa, y la energa
liberada es utilizada por estas bacterias
como fuente de energa primaria. Un
grupo de bacterias oxida el amonaco o
in amonio a nitrito y luego otro grupo lo
oxida a nitrato.
Segunda reaccin
Primera reaccin
NH3,
NH4+
oxidacin
NO2-
oxidacin
NO3-
Primera reaccin
2NH3 + 3O2
2NO2 + O2
Nitrobacter
2NO3-
suelo
Raices plantas
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Asimilacin
consumo de E
clula vegetal
NO3-
amino ac
protenas
transferencia a ac.nucleicos
NH4+
nucletidos
Proceso de
asimilacin
plantas
animales
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El ciclo se completa
plantas
animales
mueren
mueren
suelo
Compuestos
nitrogenados
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Las plantas pueden tomar el amonio y el nitrato a travs de las races y pueden usarlos para la
sntesis de sus protenas y los cidos nucleicos. Los animales obtienen su nitrgeno al comer
las plantas o a otros animales. En el metabolismo de los compuestos nitrogenados en los
animales acaba formndose in amonio que es muy txico y debe ser eliminado. Esta
eliminacin se hace en forma de amonaco (algunos peces y organismos acuticos), o en
forma de urea (el hombre y otros mamferos) o en forma de cido rico (aves y otros animales
de zonas secas). Estos compuestos van a la tierra o al agua de donde pueden tomarlos de
nuevo las plantas o ser metabolizados por diferentes organismos.
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(NH2)2CO
urea
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Los procesos principales que componen el ciclo del nitrgeno que pasa por
la biosfera, la atmsfera y la geosfera son cinco:
1- La fijacin del nitrgeno
2- la toma del nitrgeno (crecimiento de organismos)
3- la mineralizacin del nitrgeno (desintegracin)
4- la nitrificacin
5- la denitrificacin.
Los microorganismos, particularmente las bacterias, juegan un importante
papel en todas las principales transformaciones del nitrgeno. Como
procesos de mediacin microbiana, ocurren ms rpidamente que los
procesos geolgicos, tales como los movimientos de placas, que es un
proceso puramente fsico.
La velocidad de las transformaciones llevadas a cabo por los
microorganismos se ven afectadas por factores ambientales como la
temperatura, la humedad y la disponibilidad de recursos que influyen en la
actividad microbiana.
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Adems del nitrgeno que fija la bacteria hay eventos naturales que pueden
causar la fijacin de pequeas, pero significativas cantidades de nitrgeno.
Fijacin biolgica (microorganismos)
Fijacin de N2
relmpagos
fuegos forestales
flujos de lava
Fijacin antropognica
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N orgnico
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4- La nitrificacin
NH4+
NO3Parte del amonio producido por la descomposicin se convierte en nitrato a
travs de un proceso llamado nitrificacin. Las bacterias que llevan a cabo
esta reaccin obtienen energa de la misma. La nitrificacin requiere la
presencia del oxgeno. Por consiguiente, la nitrificacin puede suceder
solamente en ambientes ricos de oxgeno, como las aguas que circulan o
que fluyen y las capas de la superficie de los suelos y sedimentos. El proceso
de nitrificacin tiene algunas importantes consecuencias. Los iones de
amonio tienen carga positiva y por consiguiente se pegan a partculas y
materias orgnicas del suelo que tienen carga negativa. La carga positiva
previene que el nitrgeno de amonio sea barrido (o lixiviado) del suelo por las
lluvias. Por otro lado, el in de nitrato con carga negativa no se mantiene en
las partculas del suelo y puede ser barrido del perfil de suelo. Esto lleva a
una disminucin de la fertilidad del suelo y a un enriquecimiento de nitrato de
las aguas corrientes de la superficie y del subsuelo (contaminacin).
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5- La denitrificacin
NO3N2+ N2O
A travs de la denitrificacin, las formas oxidadas de nitrgeno como el nitrato
y el nitrito (NO2-) se convierten en dinitrgeno (N2) y, en menor medida, en gas
xido nitroso (N2O). La denitrificacin es un proceso anaerbico llevado a cabo
por bacterias que utilizan compuestos nitrogenados como aceptores de
electrones en la respiracin anaerbica y que pueden convertir el nitrato en
formas ms reducidas de nitrgeno (NO, N2O, N2) que se van a la atmsfera
dando lugar al proceso de desnitrificacin a travs de la siguiente secuencia
de reacciones:
NO3NO2NO
N2O
N2.
El xido ntrico y el xido nitroso son gases importantes para el ambiente. El
xido ntrico (NO) contribuye a formar smog, y el xido nitroso (N2O) es un gas
de invernadero importante, por lo que contribuye a los cambios globales
climatolgicos.
Una vez que se convierte en dinitrgeno, el nitrgeno tiene pocas
posibilidades de reconvertirse en una forma biolgica disponible, ya que es un
gas y se pierde rpidamente en la atmsfera. La denitrificacin es la nica
trasformacin del nitrgeno que remueve el nitrgeno del ecosistema (que es
esencialmente irreversible), y aproximadamente balancea la cantidad de
nitrgeno fijado por los microorganismos fijadores de nitrgeno.
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NH3
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Reduccin de nitratos
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a)
NO3-
NO2-
luego NO2-
NH2OH
NH3
N orgnico (R-NH2)
hidroxilamina
Nitrito reductasa, inhibible por NH3
amino cidos, protenas, nucletidos
NH3
NO2NO
N2O
oxido ntrico
oxido nitroso
N2
atmosfera
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Las flechas amarillas indican las fuentes humanas de nitrgeno para el ambiente. Las flechas
rojas indican las transformaciones microbianas del nitrgeno. Las flechas azules indican las
fuerzas fsicas que actan sobre el nitrgeno. Y las flechas verdes indican los procesos
naturales y no microbianas que afectan la forma y el destino del nitrgeno.
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El complejo nitrogenasa
El proceso de fijacin biolgica del N2 requiere de un
complejo enzimtico con mltiples centros redox. El
complejo nitrogenasa est formado por dos protenas:
una reductasa, que aporta los electrones con elevado
poder reductor y una nitrogenasa que utiliza estos
electrones para reducir el N2 a NH3. La transferencia de
electrones desde el componente reductasa al
componente nitrogenasa est acoplada a la hidrlisis de
ATP por parte de la reductasa. El complejo nitrogenasa
es sumamente sensible a la inactivacin por O2, el cual
la inhibe en forma irreversible. En los ndulos la
concentracin de O2 se mantiene baja gracias a la
leghemoglobina, una protena homloga a la
hemoglobina.
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Debido a la gran estabilidad del triple enlace entre los dos tomos de N, el
N2 es muy inerte, y su activacin es un proceso que requiere mucha
energa. Se deben transferir 6 electrones para reducir el N2 a 2 NH3 a
travs de una serie de pasos intermediarios. Se cree que los tres pasos
sucesivos de reduccin se producen directamente en la nitrogenasa, sin
acumulacin de intermediarios libres.
diimina
hidrazina
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Microorganismos fijadores de N2
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Complejo nitrogenasa
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Esquema de la reaccin
En principio, la reduccin de N2 a NH3 es un proceso en
el que intervienen seis electrones.
2NH3
N2 + 6e- + 6H+
La reaccin biolgica genera al menos un mol de H2,
adems de dos moles de NH3 por cada mol de N2.
2NH3 + H2
N2 + 8e- + 8H+
Los 8 e- de elevado potencial proceden de la ferredoxina
reducida, generada durante la fotosntesis o procesos
oxitativos. Por cada molcula de N2 reducida se
hidrolizan al menos 16 molculas de ATP.
2NH3+H2+16 ADP+16 Pi
N2+8e-+8H++16ATP
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Fijacin de nitrgeno
Flujo de eFerredoxina nitrogenasa reductasa nitrogenasa N2 NH3
La ruptura del piruvato a acetil -CoA + CO2 da el potencial reductor
necesario para reducir la ferredoxina. La unin y ruptura de ATP en
ADP + Pi es requerida tambin para bajar el potencial de reduccin
de la nitrogenasa (Ede - 0.25 V a - 0.40 V) y hacer posible la
ruptura del enlace covalente triple entre los dos tomos de N.
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Fe-protena
El componente reductasa y nitrogenasa del
complejo nitrogenasa son protenas ferrosulfuradas, en las cuales el hierro se
encuentra entrelazado con un tomo de
azufre de un residuo de cistena y con sulfuro
inorgnico. La reductasa o ferro-protena , es
un dmero de subunidades idnticas de 30 kd
conectadas mediante una agrupacin 4Fe-4S.
La funcin de la reductasa es la transferencia
de e- desde un donante apropiado, como la
ferredoxina
reducida,
al
componente
nitrogenasa. La unin e hidrlisis de ATP
desencadena un cambio conformacional que
acerca
el
componente
reductasa
al
componente nitrogenasa, para as poder
transferir su electrn hasta el centro donde se
reduce el nitrgeno.
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Complejo nitrogenasa
Est constituido por dos metaloprotenas
y contiene tres tipos de grupos
prostticos.
2 unidades de dinitrogenasa
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Funcin de la nitrogenasa.
a) Pasos de la fijacin de N2
empezando por el piruvato. Los
electrones son aportados desde
la dinitrogenasa reductasa a la
dinitrogenasa, de uno en uno, y
cada electrn se asocia con la
hidrlisis de 2-3 ATPs. b) Pasos
hipotticos en la reduccin de N2
y liberacin de H2 y resumen de
la actividad nitrogenasa.
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Nitrogenasa
subunidad
nifD
subunidad
nifK
FeMo-co
nifH
nifN
regulador positivo
nifA
nifV
regulador negativo
nifL
nifZ
nifW
nifB
nifQ
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Algunos sustratos artificiales que son estructuralmente similares al N2, como el acetileno y
el cianuro, son tambin reducidos por la nitrogenasa. En el laboratorio la actividad
nitrogenasa se mide fcilmente por cromatografa gaseosa midiendo la reduccin del
acetileno a etileno ya que la nitrogenasa puede llevar a cabo esta reaccin.
Cuando comienza el experimento (a tiempo 0), los resultados no muestran C2H4, pero, a
medida que pasa el tiempo la produccin de C2H4 aumenta. Cuando se produce etileno, se
consume el acetileno. Si el vial contuviera un extracto enzimtico, las condiciones deberan
ser anxicas, aunque la nitrogenasa procediera de una bacteria aerbica. La prueba
directa de la fijacin de N2 se obtiene con un istopo no radioactivo de nitrgeno, 15N,
como trazador y por espectrometra de masa.
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Sin embargo, Str2 muestra una semejanza de secuencia muy elevada con las
superxido dismutasas, que contienen manganeso. De hecho Str2 es una
superxido dismutasa cuya funcin en la clula es consumir superxido (O2-),
formando O2 en el proceso, e impidiendo as el dao oxidativo a los
componentes celulares. Se ha demostrado que Str2 suministra electrones a
Str1. La fuente de estos electrones es O2-, que forma parte de la reduccin de
O2 por una molibdeno CO deshidrogenasa.
Flujo de e- en la fijacin de nitrgeno clsica
piruvato flavodoxina dinitrogenasa reductasa dinitrogenasa
Flujo
de e- en
thermoautotrophicus
la
fijacin
de
nitrgeno
en
Streptomyces
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Asimilacin de nitrgeno
La mayora de los organismos lo asimilan
a partir de amonio o de nitrato. Pocos
microorganismos pueden asimilarlo a
partir de N2.
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Incorporacin de amonio
La incorporacin de nitrgeno en materiales
orgnicos a partir de amonio es relativamente
fcil porque esta en una forma mas reducida
que otras formas de nitrgeno inorgnico.
El amonio es incorporado inicialmente en el
esqueleto de la cadena carbonada por uno de
los dos mecanismos que siguen: 1) aminacin
reductiva; 2) sistema glutamina sintetasaglutamato sintasa.
Una vez incorporado, el nitrgeno puede ser
transferido a otros esqueletos carbonados por
las enzimas llamadas transaminasas.
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glutamina + ADP + Pi + H+
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2 glutamato + NADP+
Esta va es ms costosa porque usa ATP. Sin embargo a veces los procariotas
utilizan esta va porque el valor del Km de la glutamato deshidrogenasa para el
NH4+ es elevado (aproximadamente 1mM) y, por lo tanto esta enzima no esta
saturada cuando el NH4+ escasea. Por el contrario la afinidad de la glutamina
sintetasa hacia el NH4+ es muy elevada. Por lo tanto, para captar el amoniaco
cuando ste escasea, es necesaria la hidrlisis del ATP.
El resto de los aminocidos se sintetizan a partir de intermediarios del ciclo del
cido tricarboxlico y de otros importantes intermediarios metablicos.
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Si bien las vas para la biosntesis de aminocidos son muy variadas, los
esqueletos carbonados provienen de intermediarios de la gliclisis, de la va de
las pentosas fosfato o del ciclo del cido ctrico. En base a estas
consideraciones de partida, los aminocidos se pueden agrupar en seis familias
biosintticas.
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Oxalacetato + glutamato
Piruvato + glutamato
aspartato + -cetoglutarato
alanina + -cetoglutarato
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Bibliografa
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FIN
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