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Tabla de Contenidos
1.- INFORMACIN DEL GRADO EN BIOQUMICA Y BIOLOGA MOLECULAR ............................................. 3
ESTRUCTURA DE LOS ESTUDIOS DE GRADO ................................................................................................................................ 3
SEGURIDAD ...................................................................................................................................................................................... 3
Curso
Cuatrimestre
Anual
4,5
4,5
Fisiologa Microbiana*
4,5
Fisiologa Humana
4,5
4,5
Genmica*
4,5
4,5
Optativas
Asignatura
Trabajo Fin de Grado
ECTS
12
4,5
Ingeniera Tisular*
4,5
4,5
Nanobiotecnologa*
4,5
6
6
Pg. 3 de 10
Seguridad
Medidas de seguridad a adoptar durante la actividad acadmica
Todo estudiante debe familiarizarse con los elementos de seguridad disponibles en su entorno
(localizacin de extintores, mangueras, duchas de seguridad y lavaojos)
Todo estudiante debe estar al tanto de las salidas principales de emergencia, las cuales deben respetarse
y evitar que sean invadidas por objetos innecesarios
El personal docente responsable las prcticas de laboratorios ser el encargado de aplicar los principios
de Prevencin de Riesgos Laborales, as como de velar por el cumplimiento de los cdigos de buenas
prcticas en el desarrollo de las mismas.
El acceso al laboratorio estar limitado y controlado por el docente responsable
Pg. 4 de 10
8:40
9:30
Martes - Asteartea
FIS.HUM (T)
FIS.HUM (T)
Mircoles -
Jueves - Osteguna
BIO.DES (S2)[6-11]{2/2}
BIO.DES (T)
10:40
11:30
13:00
13:50
MET.AVBQ (S1)
[13-15]
GENOM (GO1) (13-15)
EAE (T)
F.MICR.IND (T)
FIS.MICR (T)
Viernes - Ostirala
EAE (GO1)
EAE (GA1)
14:00
GENOM (GO1) (13-15)
14:50
BIO.DES (GL1) [10]
Bio DES (GL2) [11]
F.MICR.IND (GL1) [13]
15:00
FIS.HUM (GL1) [12]
15:50
FIS.MICR (GL1) [9]
GENOM (GO1) [8-11]
{1/3} MET.AVBQ (GL1)
[4-7]
15:55
16:45
17:00
17:50 F.MICR.IND (GL1) [13]
MET.AVBQ (GL1) [4-7]
F.MICR.IND (GL1)
[13]
FIS.HUM (GL1) [12]
FIS.MICR (GL1) [9]
MET.AVBQ (GL1) [34]
Pg. 5 de 10
ASIG
ASIG
(M)
[1-10]
{1/2}
<1.1>
FIS.HUM
AMP.BM
MET.AV BQ
GENOM
BIO.DES
F.MICR.IND.
FIS.MICR
EAE
SYST.BIO
27808
26728
26860
26746
26864
26862
26709
25039
26729
ASIGNATURA
Fisiologa Humana
Ampliacin de Biologa Molecular
Mtodos Avanzados en Bioqumica
Genmica
Biologa del Desarrollo
Fundamentos de Microbiologa Industrial
Fisiologa Microbiana
Euskararen Arauak eta Erabilerak
Systems Biology
PROFESOR
IGOR AURREKOETXEA
FERNANDO MORO, SONIA BAUELOS
JOSE LUIS RODRIGUEZ, MARIA ASUNCION REQUERO
ASIER FULLAONDO
ELENA VECINO
MARIA ANTONIA UNANUE, MARIA INES ARANA
ALICIA MUELA
JUAN CARLOS ODRIOZOLA
KEPA RUIZ
Segundo cuatrimestre:
Lunes - Astelehena
8:40
9:30
Martes - Asteartea
BIO.ESTR (GA1) [21-25]
BIO.ESTR (S1) [26-30]
BIO.ESTR (T)
10:40
11:30
12:00
12:50
FARM.M (T)
13:00
13:50
KE (GA1)
Mircoles - Azteazkena
14:00
14:50
Viernes - Ostirala
Jueves - Osteguna
Pg. 6 de 10
17:00
17:50
17:55
18:45
FARM.M(GO1)[23]
FARM.M(GO2)[24]
NANOBT(GL1)[25]
NANOBT(GL2)[26]
18:50
19:40
ASIG
ASIG
(M)
[1-10]
{1/2}
<1.1>
ASIGNATURA
BIO.EST R
27807
NANOBT
26731
FARM.M
26865
Farmacologa Molecular
ING.TIS
26730
SINT.OBC
26732
KE
25138
M.EVOL
26813
Ingeniera Tisular
Sntesis Orgnica en Biociencias
Komunikazioa Euskaraz: Zientzia eta Teknologia
Molecular Evolution
PROFESOR
ARTURO MUGA
ALICIA ALONSO
LEYRE URIGEN, RAFAEL
RODRIGUEZ EIDER BILBAO
IMANOL TELLITU
JUAN CARLOS ODRIOZOLA
MIREN ITZIAR ALCORTA
Pg. 7 de 10
PROFESORADO
(departamento)
Ext.
e-mail
Mtodos Avanzados
en Bioqumica
94 601 2485
joseluis.arrondo@ehu.es
94 601 2741
mariasun.requero@ehu.es
Biologa Estructural:
Aplicaciones
Biomdicas
946 01 2624
arturo.muga@ehu.es
CD3.P0.5
Fernando Moro
(Bioqumica y Biologa Molecular)
94 601 2545
Fernando.moro@ehu.es
CD3.PO.16
Sonia Bauelos
(Bioqumica y Biologa Molecular))
94 601 8050
sonia.banuelos@ehu.es
Unidad
Biofsica
Elena Vecino
(Biologa Celular e Histologa)
Alicia Muela
(Inmunologa, Microbiologa y
Parasitologa)
946 01 2820
elena.vecino@ehu.es
1P2D.OL2
946 01 2611
alicia.muela@ehu.es
CD5.P0.3
Fisiologa Humana
94 601 2830
igor.aurrecoechea@ehu.es
OR10.1
Fundamentos de
Microbiologa
Industrial
M Ins Arana
(Inmunologa, Microbiologa y
Parasitologa)
M Antonia Unanue
(Inmunologa, Microbiologa y
Parasitologa)
94 601 2612
Ines.arana@ehu.es
CD5.PO.4
94 601 2610
marian.unanue@ehu.es
CD5.PO.19
Genmica
Asier Fullaondo
(Gentica, Antropologa Fsica y
Fisiologa Animal)
946 01 5696
asier.fullaondo@ehu.es
F1.PO.6
Systems Biology
Kepa Ruiz
(Lgica y Filosofa de la Ciencia)
943 01 5628
kepa.ruiz-mirazo@ehu.es
Unidad
Biofsica
94 601 5542
juancarlos.odriozola@ehu.es
E 1P1.2
Ampliacin de
Biologa Molecular
Biologa del
Desarrollo
Fisiologa
Microbiana
Norma y Uso de la
Lengua Vasca
(Euskera)
Euskararen Arauak
eta Erabilerak
Farmacologa
Molecular
Rafael Rodriguez
(Farmacologa)
94 601 2739
rafael.rodriguez@ehu.es
Leyre Urigen
(Farmacologa)
94 601 5674
leyre.uriguen@ehu.es
Despacho
CD3.PO.15
CD.PO.13
Fac Medicina
y EU
Enfermera
OD7
Fac Medicina
y EU
Enfermera
OP6
Pg. 8 de 10
Ingeniera Tisular
Eider Bilbao
(Zoologa y Biologa Celular Animal)
F2S2.10
Molecular Evolution
Itziar Alkorta
(Bioqumica y Biologa Molecular)
CD3.PO.14
Nanobiotecnologa
Alicia Alonso
(Bioqumica y Biologa Molecular)
946013385, 946013354
alicia.alonso@ehu.es
CD3.PO.12
Sntesis Orgnica en
Biociencias
Imanol Tellitu
(Qumica Orgnica II)
946 01 5438
imanol.tellitu@ehu.es
CD2.P2.24
Comunicacin en
Euskera: Ciencia y
Tecnologa(Euskera)
Komunikazioa
Euskaraz: Zientzia eta
Teknologia
juancarlos.odriozola@ehu.es
94 601 5542
E 1P1.2
Pg. 9 de 10
- 1 cuatrimestre:
- 2 cuatrimestre:
Optativas:
- 1 cuatrimestre:
Fisiologa Microbiana
Fisiologa Humana
Genmica
- 2 cuatrimestre:
Farmacologa Molecular
Ingeniera Tisular
Nanobiotecnologa
Pg. 10 de 10
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 12
El TFG deber estar orientado a la aplicacin de las competencias generales asociadas a la titulacin, a capacitar para la
bsqueda, gestin, organizacin e interpretacin de datos relevantes, normalmente de su rea de estudio, para emitir
juicios que incluyan una reflexin sobre temas relevantes de ndole cientfica y/o tecnolgica, y que facilite el desarrollo de
un pensamiento y juicio crtico, lgico y creativo. Las actividades formativas podrn ser de carcter amplio y estarn
orientadas al desarrollo y aplicacin de las competencias adquiridas a lo largo de toda la titulacin de Grado.
El TFG deber estar orientado a la aplicacin de las siguientes competencias asociadas a la titulacin:
Transversales
1. Capacidad para el anlisis, sntesis y razonamiento de forma crtica en la aplicacin del mtodo cientfico.
2. Desarrollar el aprendizaje autnomo y la adaptacin a nuevas situaciones.
3. Capacidad para transmitir ideas y comunicarlas a una audiencia profesional y no profesional, propiciando la utilizacin
de idiomas extranjeros, especialmente el ingls.
4. Capacidad de colaborar y trabajar en equipos multidisciplinares y multiculturales respetando la igualdad de gnero.
5. Desarrollar las habilidades para la aplicacin de los conocimientos adquiridos al mundo profesional.
6. Capacidad creativa y emprendedora: formular, disear y gestionar proyectos, buscar e integrar nuevos conocimientos y
actitudes.
7. Desarrollar el compromiso tico y la capacidad de participacin en el debate social.
Especficas
8. Conocer los procedimientos habituales utilizados por los cientficos para generar, transmitir y divulgarla informacin
cientfica de Bioqumica y Biologa Molecular.
9. Expresarse en trminos cientficamente precisos sobre los diferentes procesos celulares a nivel
molecular, y utilizar la terminologa del rea.
10. Trabajar de forma adecuada en un laboratorio qumico/bioqumico, incluyendo seguridad qumica y biolgica,
manipulacin, eliminacin de residuos qumicos y registro anotado de actividades.
11. Conocer las bases de las estrategias experimentales utilizadas en la investigacin bioqumica.
12. Analizar e interpretar adecuadamente datos y resultados experimentales propios del campo de Bioqumica y Biologa
Molecular.
13. Desarrollar la capacidad de analizar cuantitativamente los procesos biolgicos.
14. Utilizar adecuadamente las herramientas cuantitativas bsicas para el anlisis de datos en Bioqumica y Biologa
Molecular
15. Comprender el papel del profesional de Bioqumica y Biologa Molecular en el contexto cientfico y social.
16. Disear, realizar y evaluar estrategias experimentales multidisciplinares en el mbito de la Bioqumica y Biologa
Molecular para la resolucin de problemas biolgicos complejos.
17. Habilidad para interpretar y evaluar la literatura cientfica del rea.
TEMARIO
Ver Normativa Trabajo Fin de Grado en Bioqumica y Biologa Molecular
(http://www.zientzia-teknologia.ehu.es/p240content/es/contenidos/informacion/normativa_academica/es_normativ/nor_tfg.html)
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
GA
GL
GO
GCL
TA
TI
GCA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
El TFG comprender las siguientes actividades:
1) Tutoras individualizadas.
2) Trabajo autnomo del/de la estudiante guiado por su Director/a en las fases de desarrollo, entrega, exposicin y
Pgina :
ofdr0035
1/2
Pgina :
ofdr0035
2/2
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 6
Descripcin
Esta asignatura supone el desarrollo prctico de los fundamentos tericos presentados en el curso anterior, relacionados
con las propiedades estructurales de las biomleculas y el estudio de las interacciones intermoleculares, a travs de las
principalmente tcnicas espectroscpicas.
Contenidos
Estabilidad conformacional de protenas. Aplicaciones de la espectroscopia diferencial. Anlisis espectro FT-IR:
Estructura secundaria de protenas. Anlisis de espectros de dicrosmo circular de macromolculas. Efecto de la
polaridad entorno en espectro fluorescencia. Interaccin protena-ligando: Fluorescencia. Deteccin de Ca2++ por
fluorescencia. FRET. Aplicaciones de la Polarizacin de fluorescencia. Anlisis de espectros de Resonancia Magntica
Nuclear. Introduccin a la difraccin de rayos X
TEMARIO
Estabilidad conformacional de protenas Clculo de la variacin de la nerga libre de Gibbs para el proceso de
desnaturalizacin de una protena con distintos agentes. Comparacin de Cm
Aplicaciones de la espectroscopia diferencial Clculo de potenciales redox
Anlisis espectro FT-IR: Estructura secundaria de protenas Obtencin de estructura secundaria de protenas
Anlisis de espectros de dicrosmo circular de macromolculas Obtencin de estructura secundaria de protenas y cidos
nucleicos
Efecto de la polaridad entorno en espectro fluorescencia Propiedades de emisin de sondas libres y localizadas/unidas a
biomolculas
Interaccin protena-ligando Clculo de Kd de la unin mediante parmetros fluorescentes. Anisotropa, extincin,
tiempos de vida. Caracterizacin de receptores hormonales
Deteccin de Ca2+ por fluorescencia Clculo de Kd y cinticas
FRET Clculo de distancias intermoleculares
Aplicaciones de la polarizacin de fluorescencia Desarrollo de experimentos relacionados con la tcnica
Anlisis de espectros de Resonancia Magntica Nuclear Resolucin 3D de estructura de protenas
Introduccin a la difraccin de rayos X Resolucin 3D de estructura de protenas
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
5
S
5
10
20
Leyenda:
GA
GL
40
GO
10
40
20
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
TI
GCA
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
La asignatura consta de clases magistrales (M) donde se actualizar la informacin que no se haya incluido en el curso
de "Espectroscopa de Biomolculas" y se explicarn los protocolos de prcticas, seminarios donde se desarrollaran
tcnicas ms complejas o recientes, prcticas de laboratorio y prcticas de ordenador sobre tratamientos de los datos
obtenidos en las prcticas de laboratorio o con datos experimentales reales que se suministrarn o prcticas in silico con
instrumentacin no eccesible al laboratorio de prcticas.
Pgina :
ofdr0035
1/3
EVALUACION
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
Sistema de Evaluacin:
La evaluacin se reparte de la siguiente forma: Trabajo en el laboratorio e informe del mismo (60%). Asistencia, actitud e
informe sobre las prcticas de ordenador (20%). Trabajo individual o seminario sobre un tema de actualidad relacionado
con el contenido de la asignatura (20%).
La asistencia a las prcticas de laboratorio y ordenador es obligatoria, ser sometida a control y se entregarn las hojas
de asistencia el mismo da de su realizacin.
La nota final se obtendr sumando las calificaciones parciales de los tres apartados evaluados. Para optar a aprobar la
asignatura es necesario alcanzar un mnimo (40%) en cada uno de los apartados mencionados. Si no se aprueba la
asignatura en la convocatoria ordinaria, las calificaciones parciales de los apartados aprobados se guardarn para la
convocatoria extraordinaria del ao en curso (julio).
Criterios para la calificacin de los apartados mencionados:
- Realizacin adecuada del protocolo de prcticas, anlisis, interpretacin y presentacin de resultados.
- Planteamiento y desarrollo correcto de los ejercicios, elaboracin y presentacin de tareas encomendadas.
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
Pagina Moodle del curso
http://moodle3.ehu.es/course/view.php?id=2652
En ella se colgarn los protocolos de prcticas que los alumnos deben haberse leido antes de su realizacin y llevar el da
de la prctica. Se emplear tambin para la entrega, correcin y evaluacin de los informes y trabajos a presentar.
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
- Estructura de protenas, Gmez-Moreno C., Sancho, J (2003), ed. Ariel Ciencia
- Biological Spectroscopy, Campbell I.D. and Dwek, R.A. (1984), Benjamin Cummings
- Methods in Molecular Biophysics. Structure, dynamics, function. I.N. Serdyuk, N.R. Zaccai, J. Zaccai (2007) Cambridge
Bibliografa de profundizacin
- Principles of Physical Biochemistry. 2nd ed. K.E. van Holde, W. Curtis Johson y P. Shing
Ho.Prentice Hall, 2006.
- Physical Chemistry. Principles and Applications in Biological Sciences 4 ed
I. Tinoco, K. Sauer y J.C. Wang. Prentice Hall , 2001.
- Biomolecular Crystallography: Principles, Practice, and Application to Structural Biology. B.
Rupp.(2010) Garland Sciences.
- Spectroscopy for the Biological Sciences. G.G.Hammes (2005) Wiley Interscience.
- Principles of Fluorescence Spectroscopy. 3 ed J.R. Lakowicz. (2006) Springer.
- Molecular Spectroscopy J.M. Brown. (1998) Oxford University Press.
- Introduction to Biophysical Methods for Protein and Nucleic Acid Research. J.A. Glasel y M.P.
Deutscher (eds.) (1995). Academic Press.
- Biophysical Chemistry. Part II: Techniques for the study of biological structure and function. C.
R. Cantor and P. R. Schimmel. (1980) W. H.Freeman and Company.
Revistas
- Nature
- Nature Methods
- Annual Review o0f Biophysics
- Biophysical Journal
- Biochemistry
Direcciones de internet de inters
Rayos X:
http://www.ruppweb.org/Xray/101index.html
http://www.mpibpc.mpg.de/groups/de_groot/compbio/p3/index.html#x-ray
Pgina :
ofdr0035
2/3
http://www.biop.ox.ac.uk/coot/
http://www.ysbl.york.ac.uk/%7Ecowtan/sfapplet/sfintro.html
NMR:
http://nmrwiki.org/wiki/index.php?title=Materials_for_teaching_NMR
Dicroismo circular:
http://pcddb.cryst.bbk.ac.uk/home.php
http://biomodel.uah.es/lab/dc/inicio.htm
Pgina :
ofdr0035
3/3
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 6
La asignatura esta dividida en dos mdulos. En el primero de ellos, se desarrollan los conceptos de estabilidad y
plegamiento de protenas y su relacin con procesos patolgicos. Tambin la respuesta celular ante situaciones
potencialmente patolgicas y las posibles terapias aplicables. En el segundo, se tratan de forma sistemtica las
interacciones entre distintas macromolculas: protenas, cidos nucleicos y lpidos. Se describen los tipos de
interacciones que permiten la formacin de complejos estables entre las mismas y la regulacin de su afinidad relativa.
En el bloque de temas interaccin protena-ligando se describen conceptos bsicos del diseo y optimizacin de
inhibidores de protenas. Al ser una asignatura que se imparte en el segundo cuatrimestre del ltimo ao del grado,
utilizar el conocimiento general adquirido por el estudiante (estructura de protenas, metabolismo, termodinmica...). Se
intentar integrar estos conocimientos para darles una proyeccin aplicada.
Contenidos
Estabilidad conformacional de las protenas. Plegamiento proteico. Patologas relacionadas con el plegamiento proteico.
Interacciones protena - ligando. Diseo de frmacos. Interacciones protena protena. Interacciones protena - cidos
nucleicos. Interacciones protena lpido. Ingeniera de estructuras. Diseo de funciones proteicas.
Sistema de Evaluacin
La docencia magistral ser evaluada mediante pruebas escritas tipo respuestas mltiples y preguntas cortas (50-65%).
As mismo re realizar un trabajo monogrfico sobre un tema relacionado con la asignatura, que se expondr en los
seminarios (10-15%). Se valorarn tambin las actividades relacionadas con las prcticas de ordenador (20-25%)
TEMARIO
Plegamiento proteico Estados nativo y desnaturalizado. El equilibrio de desnaturalizacin. Estabilidad termodinmica de
protenas. Medida de la estabilidad conformacional. Interacciones que contribuyen a la estabilidad de las protenas e
importancia relativa. Importancia de la flexibilidad en la funcionalidad proteica (protenas intrnsecamente desordenadas).
Experimento de Anfinsen. Paradoja de Levinthal. Las distintas etapas del plegamiento (intermediarios). Aspectos
termodinmicos y cinticos del plegamiento. Estados de transicin e intermediarios. Implicaciones del plegamiento en
distintos procesos fisiolgicos y patolgicos.
Plegamiento proteico y patologa El problema de la agregacin proteica y las chaperonas. Chaperonas intra e
intermoleculares. Patologas relacionadas con plegamiento defectuoso de protenas: enfermedades amiloidognicas.
Caractersticas de las transiciones conformacionales asociadas a estas patologas (prin, transtirretina,..). Respuestas
celulares al plegamiento defectuoso y agregacin proteica. Chaperonas farmacolgicas. Terapias actuales y crtica de las
mismas.
Interacciones entre macromolculas Interacciones protena - ligando. Diseo de frmacos. Diseo de frmacos. Ciclo de
diseo. Diseo racional y combinatorio. Especificidad, afinidad y adaptabilidad de un frmaco. Optimizacin de
inhibidores. Interacciones protena protena. Naturaleza de las superficies de interaccin. Naturaleza de las superficies
de interaccin. Interacciones protena lpido. Ingeniera de estructuras. Diseo de novo de estructuras. Andamios
proteicos: aplicaciones. Diseo de funciones proteicas.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
38
S
5
GA
5
58
10
10
Leyenda:
GL
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
EVALUACION
Aclaraciones :
Pgina :
TI
GCA
12
Aclaraciones :
ofdr0035
GO
12
1/2
GO: P. Ordenador
Pgina :
ofdr0035
2/2
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
COMPETENCIAS/DESCRIPCIN/OBJETIVOS
El objetivo principal es familiarizar al alumno con conceptos y metodologas actuales en el estudio de interacciones entre
macromoleculas, de gran inters en investigacin bsica e industria. Los contenidos que se tratarn son: las bases
moleculares de las interacciones protena-protena; mtodos biofsicos en la caracterizacin de interacciones; concepto
de redes de interaccin e interactomas; bases de datos; sistemas de cribado de alto rendimiento (HTS); tcnicas de
deteccin in vivo e in vitro de interacciones protena-protena.
TEMARIO
TEMARIO
1. Conceptos generales sobre interacciones protena-protena. Conceptos de genoma, proteoma e interactoma. Redes
de protenas. Organizacin funcional del proteoma. Terminologa de redes (nudos, ncleos y mdulos). Redes en
levaduras. Bases de datos y mapas de interacciones protena-protena. Anlisis de redes complejas y modelos de redes.
Implicaciones biolgicas de las redes.
2. Bases moleculares de las interacciones: complementariedad, flexibilidad, “hot spots”. Interacciones
importantes en biologa: Dominios dedicados. Reconocimiento en el sistema inmune. Interaccin de protenas con cidos
nucleicos y con membranas. Mtodos biofsicos para la caracterizacin de interacciones: Estructura de complejos,
calorimetra, biosensores.
3. Tcnicas de alto rendimiento (HTS) Concepto de HTS. Tcnicas de deteccin aplicable a HTS. Herramientas
informticas y estadsticas.
4. Tecnologa de microarrays.
5. Mtodos para la deteccin de interacciones entre macromolculas: A) sistemas de doble hbrido; B) sistemas
combinados de purificacin por afinidad y espectrometra de masas; C) phage-display; D) anlisis sistematico de
interacciones genticas mediante ensayos de letalidad sinttica; E) correlacin de perfiles de expresin de mRNA; F)
ChIP (chromatin immunoprecipitation).
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
30
45
Leyenda:
GA
10
GL
15
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Examen escrito tipo test
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
No hay un nico libro que pueda calificarse de libro de texto
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
Pgina :
TI
GCA
7,5
Aclaraciones :
ofdr0035
GO
5
1/2
GO: P. Ordenador
- High throughput protein expression and purification: methods and protocols (2009) Sharon A. Doyle. Totowa, N.J.:
Humana Press ; [London : Springer, distributor]
- High Throughput Screening: Methods and Protocols (2002) Ed Humana Press
- Proteomics and Protein-Protein Interactions: Biology, Chemistry, Bioinformatics, and Drug Design. (2005) Gabriel
Waksman. Springer.
- Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins, Part C: Protein-Protein Interactions and Genomics (2000) Methods
in Enzymology, Volume 328.
Bibliografa de profundizacin
Se trabajar sobre artculos de publicaciones cientficas
Revistas
Science, Nature, Cell, Curr. Opin. Chem. Biol.
Direcciones de internet de inters
------
Pgina :
ofdr0035
2/2
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
COMPETENCIAS:
La asignatura pretende introducir al alumno en las bases celulares y moleculares de la biologa del desarrollo.
Comprender la manipulacin de embriones, el uso de clulas madre y los procesos de regeneracin y cicatrizacin. Esta
asignatura se impartir al final de los estudios ya que necesitar de las bases del conocimiento de asignaturas troncales
para su mejor comprensin en las aplicaciones a la biomedicina y biotecnologa.
OBJETIVOS:
Concepto de embriologa y biologa del desarrollo. Modelos animales empleados. Fecundacin, segmentacin
determinacin e induccin en el desarrollo embrionario. Tcnicas de generacin de animales transgnicos y sus
aplicaciones biomdicas y en particular al estudio del cancer. Formacin del patrn y genes implicados. Tipos de clulas
madre. Aislamiento y diferenciacin de las clulas madre embrionarias. Utilizacin de clulas madre con fines
teraputicos. Cicatrizacin. Angiognesis. Regeneracin de tejidos. Apoptosis y moldeado de los rganos durante el
desarrollo. Genes implicados en la muerte celular y en el envejecimiento.
SISTEMA DE EVALUACIN:
-La docencia magistral ser evaluada por un examen que representar el 50% de la nota final.
-Las prcticas de aula correspondientes a un trabajo en equipo presentado escrito y oral constituirn un 30%.
-Las prcticas de laboratorio supondr un 10%.
-Los seminarios supondrn un 10%.
TEMARIO
Tema 1-Bases para el estudio de la Biologa del Desarrollo Conceptos de embriologa.
Tema 2-Modelos animales y vegetales. Micro-manipulacin. Medios de cultivo e instalaciones.
Tema 3-Tcnicas de generacin de animales transgnicos y sus aplicaciones biomdicas.
Tema 4-Fertilizacin in Vitro. Clonacin.
Tema 6- Desarrollo embrionario Fecundacin. Segmentacin. Gastrulacin. Determinacin e induccin.
Desarrollo temprano. Formacin del patrn. Genes implicados.
Tema 7- Organognesis. Neurulacin.
Tema 8- Aplicaciones e implicaciones biomdicas de la biologa del desarrollo Teratologa.
Periodos crticos en el desarrollo embrionario.
Tema 9-Clulas madre. Clonacin teraputica. Regeneracin de tejidos. Bases de la desdiferenciacin
celular.
Tema 10-Muerte celular y envejecimiento. Apoptosis y moldeado de los rganos durante el desarrollo. Genes implicados.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
24
S
3
GA
6
GL
12
36
7,5
12
12
Leyenda:
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
Aclaraciones :
Pgina :
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GO
1/2
TI
GCA
GO: P. Ordenador
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
-Gilbert, S.F. 2005.- Biologa del desarrollo. Edt. Med. Panamericana.
-Wolpert L, et al., 2010 Principios del Desarrollo. Ed. Panamericana.
-Flores V, 2013, Embriologa Humana. Ed. Panamericana
-Alberts, G. et al., 2008.- Biologa Molecular de la Clula 5 Ed. Ediciones Omega.
Bibliografa de profundizacin
-Huillon, C.H., 1975.- Embriologa. Edit. Omega, Barcelona
-Monterde J.G. 1997.- Embriologa Veterinaria. Ed. El autor. Crdoba
-Noden, D.M. Y A. De Lahunta, 1990.- Embriologa de los Animales Domsticos. Edit. Acribia, S.A.
Revistas
- Development
- Genes and Development
- Int. Journal Develop. Biology
- Scientific American
Direcciones de internet de inters
Pgina :
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2/2
2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
COMPETENCIAS ESPECFICAS
- Conocer los aspectos fundamentales de la fisiologa y bioqumica de los microorganismos para poder valorar su
impacto ecolgico y social.
- Saber interpretar la diversidad metablica de los microorganismos como una consecuencia de la adaptacin al hbitat.
- Adquirir capacidad para identificar microorganismos empleando procedimientos basados en caractersticas fisiolgicas.
COMPETENCIAS TRANSVERSALES
Se trabajarn las siguientes competencias transversales:
- Capacidad de anlisis, sntesis, organizacin y planificacin.
- Comunicacin verbal y escrita.
- Razonamiento crtico y toma de decisiones.
- Compromiso tico y sensibilidad medioambiental.
TEMARIO
NUTRICIN Introduccin a la fisiologa y metabolismo de los microorganismos. Nutrientes y categoras nutricionales.
Bioenergtica. Transporte en membrana
DIVERSIDAD METABLICA Metabolismo central. Quimioorganotrofia: Fermentaciones y Respiraciones. Quimiolitotrofia.
Fototrofia. Asimilacin de nitrgeno, fsforo y azufre.
REGULACIN Y CRECIMIENTO Regulacin, y adaptacin al medio ambiente. Crecimiento
CONTENIDOS
Tema 1. Introduccin a la fisiologa y metabolismo de los microorganismos
Tema 2. Nutricin
Tema 3. Transporte
Tema 4. Bioenergtica
Tema 5. Metabolismo central
Tema 6. Quimioorganotrofia I: Fermentacin
Tema 7. Quimioorganotrofia II: Respiracin
Tema 8. Quimiolitotrofia
Tema 9. Fototrofia
Tema 10. Asimilacin de nitrgeno, fsforo y azufre
Tema 11. Regulacin y adaptacin al medio ambiente
Tema 12. Crecimiento
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
Horas de Actividad No Presencial del Alumno
Leyenda:
M
27
S
6
40,5
GA
GO
2
15
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
Aclaraciones :
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
Pgina :
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GL
10
1/2
TI
GCA
GO: P. Ordenador
- Trabajos individuales
Aclaraciones :
La docencia magistral ser evaluada mediante pruebas escritas tipo preguntas cortas y representar 70% de la nota final.
La docencia prctica ser evaluada mediante pruebas escritas tipo preguntas cortas y seguimiento continuado del trabajo
personal, representando 20% de la nota final.
La docencia en seminarios ser evaluada mediante la resolucin de ejercicios y valoracin de participacin y actitud del
alumno, representando 10% de la nota final
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
-Bata de laboratorio
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
Madigan, M.T., Martinko, J.M., Stahl, D.A. and Clark, D.P. 2011. Brock Biology of Microorganisms:Global Edition (13 ed.).
Prentince Hall.
White, D. 2006. The physiology and biochemistry of prokaryotes (3 ed.). Oxford University Press. Oxford
Bibliografa de profundizacin
Lengeler, J.W., Drews, G. and Schlegel, H.G. 1999. Biology of the prokaryotes. Blackwell Science. New Jersey
Moat, A.G. and Foster, J.W. 1995. Microbial physiology (3 ed.). Wiley-Liss Inc. New York
Revistas
Annual Review of Microbiology (http://www.annualreviews.org/)
FEMS Microbiology Reviews (http://www.sciencedirect.com/)
Microbiology and Molecular Biology Reviews (http://mmbr.asm.org/)
Nature reviews microbiology (http://www.nature.com/nrmicro/)
Direcciones de internet de inters
Sociedad Espaola de Microbiologa (SEM): http://www.semicro.es/
American Society Microbiology: http://www.asm.org
Pgina :
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2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
Esta asignatura estudia el funcionamiento de los distintos sistemas corporales, su regulacin y su interrelacin,
permitiendo al alumno relacionar los conocimientos sobre los distintos rganos y sistemas, y adquirir una idea del
organismo humano como una serie de procesos integrados, que le permitan comprender como ste se adapta a los
cambios internos y ambientales. Los conocimientos adquiridos permitirn al titulado dar solucin a problemas o consultas
concretas, separando la informacin relevante de la que no lo es, y discriminando entre lo que se sale de los patrones
establecidos de normalidad fisiolgica, y lo que es realmente patolgico.
Contenidos
Se centra principalmente en las funciones de la sangre y el aparato cardiocirculatorio, el aparato respiratorio, el aparato
digestivo, el hgado, el pncreas y las vas biliares, el rin y las vas urinarias, el sistema endocrino, el sistema nervioso
central y perifrico y el sistema nervioso vegetativo.
Sistema de evaluacin
La docencia magistral ser evaluada en un examen final escrito que constar de alrededor de 20 preguntas cortas. La
nota de este tipo de docencia contribuir con un 60-80% en la nota final.
Las prcticas de laboratorio se evaluarn mediante ejercicios, evaluados en cada prctica, y constituir el 20-40% de la
nota final.
TEMARIO
Fisiologa del sistema nervioso Descripcin de los sistemas de recepcin de la informacin, tanto exterior como del medio
interno. Tratamiento de la informacin y elaboracin de respuestas. Sistemas de ejecucin de las respuestas.
Sangre y fisiologa cardiovascular Transporte de sustancias por el organismo. Proteccin y defensa del mismo.
Adaptaciones a los distintos grados de actividad fsica.
Fisiologa Respiratoria Intercambio de gases entre el organismo y la atmosfera. Regulacin de las concentraciones de
gases y del pH del organismo. Adaptaciones a distintas situaciones naturales como altura o buceo.
Fisiologa de la digestin y absorcin de nutrientes Ingestin, digestin y absorcin de nutrientes. Mecanismos
reguladores de la ingesta, el metabolismo y la adiposidad.
Fisiologa renal Equilibrio hidroelectroltico del organismo. Regulacin del volumen, composicin, osmolaridad y pH de los
lquidos corporales.
Sistema endocrino Mantenimiento de la homeostasis. Regulacin del equilibrio del medio interno y adaptacin a los
cambios en el medio ambiente.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
Horas de Actividad No Presencial del Alumno
Leyenda:
M
35
GA
GL
10
52,5
GCL
TA
TI
GCA
15
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
Aclaraciones :
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Examen escrito tipo test
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
Pgina :
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GO
1/2
GO: P. Ordenador
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
- Tratado de Fisiologa Mdica. Guyton AC. Interamericana-McGraw Hill
- Fisiologa. Berne R.M., Levi M.N. Mosby
- Fisiologa Humana. Un enfoque integrado. Silverthorn, DU., Editorial Mdica Panamericana
- Fisiologa Humana. Pocock G, Richards CD. Masson
- Fisiologa Humana. Fox ST. McGraw-Hill/Interamericana
- Giza Fisiologia. Garro MA. Elhuyar
- Fisiologa humana. Tresguerres JAF. Interamericana-McGraw Hill
Bibliografa de profundizacin
- Fisiologa Humana. Schmidt RF. Interamericana-McGraw Hill.
- Fisiologa humana. Cingolani L.F., Houssay A.B. El Ateneo.
- Fisiologa Mdica. Ganong WF. 19 ed. El Manual Moderno, 2004
- Physiology: Cases and problems. Constanzo L. Lippincott Williams/Wilkins.
- Fisiologa animal. Mecanismos y adaptaciones. Eckert R., Randall D., Augustine G. Interamericana-McGraw Hill.
- Fundamentos de Fisiologa de la actividad fsica y el deporte. Mer A. Editorial Mdica Panamericana.
- Fisiologa Respiratoria. West JB. Editorial Mdica Panamericana.
- Principles of Neural Science. Kandel ER. Elsevier
- Fisiologa Renal. Vander A.J. Interamericana-McGraw Hill
Revistas
- Annual Review of Physiology
- Physiological Reviews
Direcciones de internet de inters
http://www.medicapanamericana.com/fisiologia/silverthorn/inicio.asp
http://www.juntadeandalucia.es/averroes/~29701428/salud/
http://www.blackwellpublishing.com/matthews/default.html
Pgina :
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2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
Esta asignatura ofrece al alumno los conocimientos bsicos para que pueda utilizar las principales tcnicas de seleccin y
mejora de microorganismos de inters industrial, dominar las tcnicas de medida del crecimiento microbiano, as como
conocer los equipos y las etapas de los proceso de produccin industrial en los que intervengan microorganismos.
Asimismo, se presentan al alumno una serie de procesos de produccin microbiana industrial seleccionados por su
inters aplicado, como son la produccin, utilizando microorganismos, de compuestos qumicos, antibiticos, alimentos y
bebidas alcohlicas.
Contenidos:
La asignatura se estructura en torno a los siguientes temas:
Introduccin. Aislamiento y seleccin de microorganismos. Mecanismos reguladores del metabolismo microbiano. Mejora
gentica de los microorganismos. Mantenimiento de cultivos de microorganismos. Crecimiento de microorganismos.
Formulacin del medio de cultivo. Desarrollo del inculo en fermentaciones. Esterilizacin. Instalaciones y equipo.
Produccin de alimentos y bebidas. Produccin de metabolitos primarios y secundarios. Produccin de protena
monocelular
Evaluacin:
La evaluacin se llevar a cabo mediante distintos sistemas: exmenes escritos con preguntas de desarrollo para evaluar
la docencia magistral (60% de la nota final), realizacin de un informe y evaluacin continuada para evaluar las prcticas
de campo y de laboratorio (30% de la nota final), y evaluacin continuada para evaluar los seminarios (10% de la nota
final).
TEMARIO
Seleccin de microorganismos con fines industriales Criterios para la seleccin de un microorganismo en la industria.
Aislamiento y seleccin de un microorganismo de inters industrial. Mecanismos reguladores del metabolismo primario y
secundario microbiano. Superacin de mecanismos reguladores. Mtodos de mejora gentica. Mantenimiento de cultivos
de microorganismos. Colecciones de cultivos.
Crecimiento de microorganismos en ambientes controlados Caracterizacin del crecimiento de microorganismos en
cultivos discontinuos y continuos. Diseo y formulacin del medio de cultivo. Desarrollo del inculo en fermentaciones
industriales. Esterilizacin. Instalaciones y equipo.
Principales productos de la microbiologa industrial Descripcin de procesos de produccin de alimentos y bebidas.
Descripcin de procesos de produccin de metabolitos primarios y secundarios. Descripcin de procesos de produccin
de protena monocelular.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
25
S
5
45
7,5
Leyenda:
GA
GL
15
GO
GCL
TA
TI
GCA
15
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
Programa terico: Examen final escrito que consta de 4-6 preguntas con extensin variable.
Programa prctico: Evaluacin Continua y entregar cuaderno de prcticas individual. Organizar el cuaderno tratando
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1/2
cada prctica como si de un artculo de investigacin se tratara: Introduccin, Objetivo, Materiales y Mtodos,
Resultados, Discusin y Conclusiones. Entregar el cuaderno 3 semanas despus de las prcticas.
Seminarios y ejercicios: Ejercicios entregables y 1 2 problemas en el examen final escrito. Seminarios sobre produccin
de compuestos determinados.
Prcticas: 30% de la nota final
Teora: 55% de la nota final
Seminarios y ejercicios: 15% de la nota final
Para aprobar la asignatura: hay que tener aprobado los tres apartados.
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
Waites MJ, Morgan NL, Rockey JS, Hington G. (2001) Industrial Microbiology. An Introduction. Blackwell Science, Oxford.
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
Leveau JY, Bouix M (2000) Los microorganismos de inters industrial. Acribia. Zaragoza.
Okafor N (2007) Modern industrial microbiology and biotechnology Science Publishing
Renneberg R (2008). Biotecnologa para principiantes. Revert
Bibliografa de profundizacin
Hui YH, Goddik LM, Hansen AS, Josephsen J, Nip W-K (2004) Handbook of food and beverage fermentation technology
Marcel Dekker
Glick,B.R., Jack. J. Pasternak (2003) Molecular Biotechnology: Principles and Applications of Recombinant DNA. ASP
Press
Singh, Jr. V.P., R.D. Stapleton (2002) Biotransformations: Bioremediation Technology for Health and Environmental
Protection Progress in Industrial Microbiology) Elsevier
Salminen, S., Atte von Wright, Arthur C Ouwehand (2004) Lactic Acid Bacteria: Microbiological and Functional Aspects,
Marcel Dekker
Revistas
Biotechnology Advances
Biotechnology Annual Review
Critical Reviews in Biotechnology
Current Opinion in Biotechnology
Journal of Biotechnology
Microbial Biotechnology
Microbiology today
Nature Biotechnology
The scientist
Trends in Biotechnology
Direcciones de internet de inters
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.cnb.uam.es/
http://www.simhq.org/
http://www.semicro.es/
http://www.efb-central.org/index.php
http://www.bio.org/
http://www.asebio.com/conozca/index.cfm
http://www.biotecnologica.com/
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GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
26746 - Genmica
COMPETENCIAS/DESCRIPCION/OBJETIVOS
Descripcin
La presente asignatura pretende dar una visin general de las tcnicas que se utilizan en los estudio globales del
genoma, abordando las diferentes estrategias que van desde la secuenciacin a los microarrays y desde el estudio de la
variacin gentica a las diferencias en la expresin gnica. En cada uno de los apartados (secuenciacin, genmica
comparativa, variacin y transcriptmica) se ilustrar la potencia de los anlisis mediante el estudio de casos particulares
en cada una de las aproximaciones .
El objeto ltimo de la asignatura es que los estudiantes conozcan las posibilidades de las distintas aproximaciones de
anlisis globales, aplicados a la resolucin de cuestiones biolgicas.
Objetivos
Conocer y ser capaz de utilizar las distintas estrategias aplicables a los estudios globales de los genomas.
Seleccionar las aproximaciones ms adecuadas para las cuestiones biolgicas de inters.
Desarrollar la capacidad de anlisis crtico de los resultados de cada una de las aproximaciones.
Evaluacin
La evaluacin final incluir la valoracin de las diferentes actividades que se desarrollan en la asignatura. Para ello se
realizaran exmenes escritos, con diferentes modalidades de preguntas, se valorar la calidad y correccin de la
realizacin de las prcticas y de la resolucin de ejercicios, casos y problemas. Se valorarn los trabajos realizados
durante la asignatura y la calidad de las exposiciones.
TEMARIO
SECUENCIACIN DE GENOMAS y PROYECTO GENOMAS ORGANIZACIN Y OBJETIVOS Objetivos bsicos de la
genmica. Mapeando genomas. Mapas genticos. Mapas fsicos. Secuenciacin automtica. Proyecto genoma humano
GENMICA COMPARATIVA Y FUNCIONAL Genmica comparativa. Clustering de secuencias por homologa. Genes
ortlogos y parlogos. Filogenias
ANLISIS DE LA VARIACIN GENTICA Variacin gentica. Tipos de marcadores: SNPs y cambios en el nmero de
copias. Naturaleza de las variaciones. Clasificacin y distribucin. Desequilibrio de ligamiento y mapas haplotpicos
ANLISIS DE LA EXPRESIN GENMICA Anlisis de microarrays de expresin. Tipos y mtodos. Diseo experimental.
Anlisis estadsticos. Minera de datos
PROGRAMA DE TEORA
PROYECTO GENOMAS ORGANIZACIN Y OBJETIVOS
TEMA 1.-Objetivos bsicos de la genmica. Mapeando genomas. Mapas genticos. Mapas fsicos
TEMA 2.-Proyecto genoma humano: Objetivos. Historia. Situacin actual del proyecto genoma humano. Recursos en
Internet.
TEMA 3.- Proyectos genoma de animales. Rodentia. Otros vertebrados. Proyectos genoma de invertebrados
TEMA 4.- Proyecto genomas vegetales: Arabidopsis thaliana. Leguminosas. Otras plantas
TEMA 5.- Proyectos genoma microbianos. Secuenciando genomas microbianos. Genomas de Levaduras. Genoma de
parsitos. Concepto de Genoma mnimo. Metagenmica y genmica ambiental
SECUENCIACIN DE GENOMAS Y ANOTACIN
TEMA 6.- Secuenciacin automtica. Mtodo de Sanger. Secuenciacin masiva. Ensamblaje de contigs. Nuevos
mtodos de secuenciacin masiva.
TEMA 7.- Secuenciacin de genomas. Secuenciacin jerrquica, Shotgun, verificacin de secuencia
TEMA 8.- Localizacin de genes en la secuencia de un genoma. Bsqueda de genes: mtodos extrnsecos, intrnsecos e
integrados. Localizacin de genes en organismos procariotas. Bsqueda de ORFs. Bsqueda de genes en organismos
eucariotas. Localizacin de genes de RNA funcionales.
TEMA 9.- Genmica comparativa. Clustering de secuencias por homologa. Genes ortlogos. Filogenias.
TEMA 10.- Determinacin de la funcin de los genes. Anlisis computerizado de la funcin de los genes. Gene Ontology.
Asignacin de las funciones por anlisis experimental. Anotacin. Comparacin de genomas
TEMA 11.- Identificacin de secuencias reguladoras, otros genes no codificadores de protenas.
TEMA 12.- Conclusiones obtenidas de los estudios sobre genomas. Estudios de casos de genomas unicelulares y de
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genomas pluricelulares
ANLISIS DE LA VARIACIN GENMICA
TEMA 13.- Variacin gentica. Tipos de marcadores: SNPs y cambios en el nmero de copias (CNV). Naturaleza de las
variaciones. Clasificacin y distribucin. Desequilibrio de ligamiento y mapas haplotpicos
TEMA 14.-Tecnologa. Descubriendo nuevos SNPs. Genotipado de SNPs. Resecuenciacin. Anlisis de CNV.
TEMA 15.- Conclusiones obtenidas de los estudios sobre genomas. Los SNPs y las enfermedades complejas.
Diagnstico, pronstico y farmacogenmica. Alternativas a los anlisis de SNPs. Aplicaciones de los anlisis de CNVs.
ANLISIS DE LA EXPRESIN GENMICA. TRANSCRIPTMICA
TEMA 16.- Anlisis de microarrays de expresin. Tipos y mtodos. Diseo experimental. Anlisis estadsticos. Minera de
datos.
TEMA 17.- Validacin de resultados de arrays. Anlisis de genes nicos (Western , Q-PCR, etc). Bases de datos de
expresin
TEMA 18.- Otras aplicaciones de los microarrays. Chromatin IP, Tiling array, siRNA array, etc
TEMA 19.- Conclusiones obtenidas de los estudios de microarrays. Los microarrays y las enfermedades complejas:
algunos ejemplos. Diagnstico, pronstico y farmacogenmica.
PROGRAMA DE PRCTICAS
1) Alinamiento de secuencias
2. Bsequeda de ORFs, bsqueda de genes (analisis de homologa )
3. Bsqueda y anlisis de SNPs
4. Anlisis global del genoma
5. Transcriptmica
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
30
S
5
45
7,5
Leyenda:
GA
GL
GO
10
GCL
TA
TI
GCA
15
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
Greg Gibson, Spencer V. Muse (2009) A primer genome science 3rd edition. Editorial Sinauer
Bibliografa de profundizacin
Terry A. Brown, Ed Panamericana (2008) Genomas. 3 Edicin
Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer (2006) Discovering Genomics, Proteomics, and Bioinformatics. Editorial Cold Spring
Harbor Laboratory Press, 2 edicin
Reece R.J. (2004) Analysis of Genes and Genomes Ed. Wiley
Revistas
Nature
Science
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2/3
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3/3
2013/14
GUA DOCENTE
Centre
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
Fourth year
SUBJECT
Crditos ECTS : 4,5
Brief description:
Biology is being transformed into a data-rich science by means of the numerous and significant experimental advances
recently obtained through the development of genome sequencing and ‘high-throughput’ techniques,
which are opening completely new avenues of research to unravel the complex mechanisms and interaction networks
underlying the extraordinary evolutionary and organizational properties of living organisms. This has lead to the
emergence of a novel discipline called ‘Systems Biology’, combining various ingredients of other fields
within the natural sciences, like Molecular Biology, Mathematical or Theoretical Biology, Systems Dynamics and
Bioinformatics. The main goal of the present course is, thus, to introduce students to the most basic aspects of this new
discipline, emphasizing in particular how the integration of theoretical and experimental strategies can be extremely fruitful
and also helpful to address some of the most intricate and interesting open questions in Biology.
Contents:
Nature and relevance of the Systems Biology approach. Levels of description/organization in the biological domain. Life
from a systemic perspective. Mathematical modeling and simulations in Biology. Self-organization phenomena and
complexity sciences. Origins of life. Evolutionary and organization theories. The concept of ‘organism’.
Cellular metabolism as the basic form of biological organization. Multicellularity and the problem of development.
Information as a key relational idea in Biology. Regulation/control mechanisms. Beyond the individual: life as a collective
network of organisms in an open-ended evolutionary process.
Evaluation procedure: Oral presentation of a theme from the subject list (30%) and written essay about it (20%) – to
be carried out in small groups. Active participation in lectures and seminars (10%). ‘Practicum report’
– including results to various exercises (20%). Written exam: answer to one or several theoretical questions and
practical exercise or commentary on a short selected text (20%).
TEMARIO
List of subjects/themes: Introduction to Systems Biology. Methodological review: modeling and simulation strategies in
Biology. Explanations in terms of laws, mechanisms, functions. Reductionism and emergence. “Bottomup” and “top-down” approaches to biological complexity. The ‘self-organization’
and ‘complex systems’ paradigm: the network view. The “omics” revolution: new methods
for quantitative analysis. The impact of "high-throughput" technologies and bioinformatics. Artificial Life and Synthetic
Biology: fabricating in order to understand? Evolutionary thinking and biological organization: reproduction vs metabolism.
Origins of the living. The ‘organism’ idea. Multicellular organisms and the problem of development. Selforganization patterns in biology: reaction-diffusion processes, biochemical oscillations, morphogenesis. The concept of
information in Biology. Mechanisms of (genetic and epigenetic) control/regulation. Levels of organization/selection in
Biology: genes, organisms, species… Ecosystem dynamics. Life as a collective network of interacting systems in
evolution.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
Horas de Actividad No Presencial del Alumno
Leyenda:
M
27
S
5
GA
10
40,5
10
10
GL
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
Pgina :
TI
GCA
Aclaraciones :
ofdr0035
GO
3
1/2
GO: P. Ordenador
Bibliografa de profundizacin
To be explored.
Revistas
Molecular Systems Biology
BMC Systems Biology
PLoS Computational Biology
IET Systems Biology
Journal of Theoretical Biology
Biological Theory
BioSystems
Theory in Biosciences
Artificial Life
Complexity
BioEssays
Origins of Life & Evolution of Biospheres
Direcciones de internet de inters
Too numerous.
Pgina :
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2/2
GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 6
1/3
M
20
20
Leyenda:
GA
20
GL
35
GO
20
GCL
TA
TI
GCA
35
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
Bertaratzeko orduak, astero:
1,5 teoria-ordu (ikasgelan)
1,5 praktika-ordu (ikasgelan)
1.5 praltika-ordu (informatika-gelan)
Bereziki garrantzitsuak izango dira bertaratzeko orduetatik kanpo irakasleak harrera-orduetan edota noizean behinkako
mintegietan ikasle talde txikiei emango dizkien argibideak
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Examen escrito tipo test
- Examen oral
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
Ebaluazio jarraia lehentsiko da. Ebaluazioa beti ere, eskoletan egindako ariketen antzerako ariketen bidez egingoda
lauhilabetean zehar. Ebaluazio jarraia ganditzen duen ikasleak ez du idatzizko azterketa egin beharko.
Ebaluazio jarraia egiten ez duten ikasleei aukera emango zaie bukaerako azterketa idatzi bat egiteko.
Ikasle guztiek ere ahozko azterketa bat gaindituko beharko dute, beti ere irakasgaian landu nahi diren gaitasunei lotuta.
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
NORMAS DE EUKALTZAINDIA:
http://www.euskaltzaindia.net/arauak/
JAGONET: lugar de consultas de Euskaltzaindia: http://www.euskaltzaindia.net/jagonet
EUSKALTZAINDIA (1985-2005): Euskal Gramatika, Lehen Urratsak I-VI. Bilbo: Euskaltzaindia. Baita Interneteko helbide
honetan ere: http://www.euskaltzaindia.net/iker_jagon/iker/gramatika
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
ALBERDI, X. & I. Ugarteburu (1999): Euskaltzaindiaren araugintza berria; ikastaroa. Bilbo: EHUko Argitalpen Zerbitzua
ALBERDI, X & I. Sarasola (2001): Euskal Estilo-libururantz. Bilbo: EHUko Argitalpen Zerbitzua
ZUBIMENDI, R. eta ESNAL, P. (1993): Idazkera liburua. Eusko Jaurlaritzako Kultura Saila
Bibliografa de profundizacin
CABR, M.T.& J. Feliu (2001). La terminologa centfico-tcnica: reconocimientos, anlisis y extraccin de informacin
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GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
El contenido de la asignatura comprende los procesos generales comunes de los frmacos, referidos a la
Farmacodinamia (accin y mecanismo de accin) y a la Farmacocintica (procesos de absorcin, distribucin,
metabolismo y excrecin)
Contenidos
Aspectos moleculares de la interaccin de los frmacos con sus dianas biolgicas. Introduccin a la farmacologa del
sistema nervioso vegetativo y perifrico, la farmacologa del sistema nervioso central, los frmacos analgsicos,
antiinflamatorios e inmunomoduladores, farmacologa de los aparatos digestivo, respiratorio y sistema cardiovascular,
farmacologa de los antimicrobianos y anticancerosos, farmacogenmica y desarrollo de nuevos frmacos.
TEMARIO
TEMA 1. Introduccin a la farmacologa. Conceptos generales, conceptos de frmaco, medicamento y droga. Ciclo
general de los frmacos en el organismo. TEMA 2. Absorcin y distribucin de los frmacos. Paso de los frmacos a
travs de las barreras biolgicas. Difusin a travs de los lpidos. Transporte mediado por transportadores. Vas de
administracin. Cintica de absorcin. Biodisponibilidad. Distribucin de los frmacos en el organismo. Barrera
hematoenceflica. Barrera placentaria. Concepto de volumen de distribucin. TEMA 3. Metabolismo y excrecin de los
frmacos. Metabolismo farmacolgico. Lugares de biotransformacin y vas. Factores que modifican el metabolismo de
los frmacos. Excrecin renal y excrecin por otras vas. Cintica de eliminacin. TEMA 4. Mecanismos de accin de los
frmacos. Fundamentos de la interaccin frmaco-receptor. Nomenclatura y clasificacin de los receptores. Concepto de
agonismo y antagonismo en relacin con el efecto farmacodinmico. Cuantificacin de la respuesta: curva dosis-efecto.
Estudios de fijacin de radioligandos. TEMA 5. Aspectos moleculares de la interaccin de los frmacos con sus dianas
farmacolgicas. Lugares de accin de los frmacos. Canales inicos. Enzimas. Molculas transportadoras. Receptores.
Otras dianas de accin de los frmacos. TEMA 6. Introduccin a la farmacologa del sistema nervioso autnomo.
Organizacin del sistema nervioso autnomo. Neurotransmisin. Concepto y caractersticas de los neurotransmisores.
Neurotransmisin colinrgica. Frmacos estimulantes y bloqueantes de la transmisin de la placa motora. TEMA 7.
Farmacologa del sistema nervioso parasimptico. Frmacos parasimpaticomimticos de accin directa e indirecta.
Frmacos colinomimticos y muscarnicos. TEMA 8. Farmacologa del sistema nervioso simptico. Aminas
simpaticomimticas de accin indirecta. Frmacos simpaticolticos. Antagonistas de receptores alfa-1 y 2. Antagonistas
de receptores beta-1 y 2. Frmacos que modulan la transmisin noradrenrgica. TEMA 9. Introduccin a la farmacologa
del sistema nervioso central. Mecanismo de actuacin de sinapsis y neurotransmisores. Principales
neurotransmisores. Caractersticas de sus receptores, efectos y frmacos relacionados. Monoaminas. Otros
transmisores. TEMA 10. Frmacos opiodes. Clasificacin de los analgsicos opiceos: agonistas del receptor opioide mu
(morfina y otros). Antagonistas opiceos. TEMA 11. Farmacologa de los trastornos neurolgicos. Frmacos
antiepilpticos. Frmacos empleados en la enfermedad de Parkinson. Frmacos empleados en la enfermedad de
Alzheimer. Frmacos antioxidantes utilizados en procesos neurodegenerativos. TEMA 12. Frmacos ansiolticos e
hipnticos. Frmacos ansiolticos: benzodiacepinas. Frmacos sedante-hipnticos. TEMA 13. Frmacos antidepresivos,
antimanacos y antipsicticos. Frmacos antidepresivos. Antidepresivos tricclicos. Inhibidores de la MAO. Inhibidores
selectivos de la recaptacin de serotonina. Otros antidepresivos. Caractersticas farmacolgicas del litio. Antipsicticos:
mecanismo de accin.
TEMA 14. Anestsicos locales y generales. Anestsicos locales. Anestsicos inhalatorios: gaseosos y lquidos voltiles.
Caractersticas cinticas y farmacodinmicas. Anestsicos intravenosos. TEMA 15. Analgsicos-antipirticosantinflamatorios no esteroideos. Eicosanoides. Derivados del cido saliclico (aspirina). Paracetamol. Derivados del cido
propinico (ibuprofeno). TEMA 16. Antiinflamatorios esteroideos. Mineralocorticoides y glucocorticoides. Glucocorticoides
naturales y sintticos. Mecanismo de accin. Acciones farmacolgicas. Frmacos anticorticoideos TEMA 17.
Farmacologa del aparato digestivo y respiratorio. Frmacos inhibidores y neutralizantes de la secrecin cida, frmacos
protectores de la mucosa. Frmacos procinticos. Frmacos laxantes. Frmacos antidiarreicos. Frmacos emticos y
antiemticos. Frmacos antiasmticos. Frmacos antitusgenos. TEMA 18. Frmacos del sistema cardiovascular.
Antagonistas del calcio. Diurticos del asa. Diurticos tiazdicos. Ahorradores de potasio. Antagonistas de receptores de
mineralocorticoides. Nitratos. β bloqueantes. Inhibidores de la enzima convertidora de la angiotensina (IECAs).
Antagonistas receptores AT1 TEMA 19. Quimioterapia antiinfecciosa. Antibiticos beta lactmicos. Aminoglucsidos.
Tetraciclinas. Cloranfenicol. Antibiticos macrlidos y otros antibiticos. TEMA 20. Frmacos antivricos. Frmacos
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antivricos para VIH (antirretrovirales). Otros frmacos antivricos. TEMA 21. Frmacos antineoplsicos. Citostticos.
Hormonas. Nuevos frmacos en oncologa TEMA 22. Farmacogentica y farmacogenmica. Principios de terapia gnica.
Farmacogentica. Factores que influyen en la respuesta a los frmacos. Polimorfismo gentico en la farmacocintica y la
farmacodinamia. TEMA 23. Desarrollo de nuevos frmacos. Identificacin y validacin de dianas farmacolgicas.
Investigacin preclnica e investigacin clnica.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
30
45
Leyenda:
GA
5
GL
5
GO
5
10
7,5
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
TI
GCA
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Trabajos individuales
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
1. Velzquez. Manual de Farmacologa bsica y clnica, Editorial Mdica Panamericana. ISBN 9788498354379.
2. FARMACOLOGIA HUMANA (5 ED). JESUS FLOREZ , MASSON, 2008. ISBN: 9788445818619.
Bibliografa de profundizacin
1. Receptores para neurotransmisores. Ediciones en Neurociencias, 2003. ISBN 8488648219.
2. Netter. Farmacologa ilustrada, Ed. 2008, ISBN: 9788445819012.
3. The Pharmacological Basis of Therapeutics". 12th Edition. 2011Ed. Mac Graw Hill. ISBN 9780071624428.
4. Farmacologa. 7 Ed. Rang y Dale. Ed. Elsevier. 2012. ISBN 9788480869089.
Revistas
Nature Reviews- Drug discovery
Trends in Pharmacological Sciences
Current Opinion on Pharmacology
Pharmacogenetics
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GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
Esta asignatura presenta los principios y conceptos bsicos en ingeniera de clulas y tejidos, describe las tcnicas
bsicas de ingeniera tisular y familiariza al estudiante con la aplicacin de principios y aproximaciones de ingeniera
tisular a casos prcticos. Concretamente, se explican las bases biolgicas de las aplicaciones y extensiones de la biologa
celular y tisular en biotecnologa humana y se familiariza al estudiante con el instrumental, instalaciones y principales
tcnicas de la ingeniera tisular.
Contenidos:
Ingenieria tisular y tecnologa celular. Tejidos. Cultivo celulares. Transformacin epitelio-mesenquimtica. Matriz
extracelular (ECM). Interacciones celula-ECM. Induccin y morfognesis. Determinacin y diferenciacin. Control in vitro
del desarrollo tisular. Funcin de la ECM en la formacin del patrn. Sintesis in vivo de tejidos y rganos. Modelos
organotpicos e histotpicos de tejidos ingenierados. Andamiajes. Mecnica de clulas y tejidos. Biomateriales. Modelado
de clulas y su ambiente. Interacciones clula-polmeros. Procesado de andamiajes polimricos. Polmeros
biodegradables. Bioresorpcin. Transplante de clulas y tejidos bioingenierados. Criobiologa de clulas y tejidos.
Inmunomodulacin e inmunoaislamiento. Ingenieria de tejidos fetales. Aplicaciones de la ingenieria tisular.
Sistema de Evaluacin:
Examen final escrito declarativo (espacio limitado): pertinencia de la respuesta, utilizacin de terminologa cientfica,
expresin y argumentacin (60%)
Seminario (desarrollo escrito, presentacin oral):(20%)
Cuaderno de prcticas: interpretacin y elaboracin de los datos, expresin correcta y bien argumentada, capacidad de
sntesis y anlisis (10%)
Informe de visitas a centros de I+D+i: expresin correcta y bien argumentada, capacidad de sntesis y anlisis (10%)
TEMARIO
Introduccin. Ingenieria tisular: concepto, historia y retos actuales. Tecnologa celular. Tecnologa constructiva.
Integracin en el ser vivo. Biologia celular del desarrollo. Fecundacion y desarrollo embrionario temprano. Control y
regulacion del desarrollo. Diferenciacin celular. Concepto de tejido y clasificacin general de los tejidos animales.
Epitelios. Tejido conectivo. Tejido muscular. Tejido nervioso. Mtodos bsicos. Cultivo de lneas celulares continuas.
Cultivos primarios. Tcnicas y aplicaciones. Transfeccin.
Crecimiento y diferenciacin Transformacin epitelio-mesenquimtica (EMT). Factores de crecimiento. Composicin y
diversidad de la matriz extracelular (ECM). Receptores de molculas de la ECM. Interacciones celula-ECM y
transduccin de seales. Molculas de la ECM y sus ligandos. Induccin y morfognesis. Determinacin y diferenciacin
celulares
Control in vitro del desarrollo tisular. Determinantes mecnicos y qumicos. Funcin de la ECM en la formacin del patrn.
Regulacin del comportamiento celular por protenas de la ECM. Factores de crecimiento. Citokinas. Biorreactores.
Ensamblaje de tejidos en microgravedad. Sintesis in vivo de tejidos y rganos. Ambiente vital para la sntesis in vivo de
rganos. Principios bsicos de diseo de moldes. Ejemplos.
Modelos para la ingenieria tisular. Modelos organotpicos e histotpicos de tejidos ingenierados. Modelo del gel de
colgeno. Modelos epitelio-mesenquimticos. Modelos vasculares. Andamiajes. Interacciones moleculares. Transporte
molecular y celular a traves de los tejidos. Mecnica de las clulas y los tejidos.
Biomateriales. Modelado de clulas y su ambiente. Litografa blanda. Monocapas autoensambladas. Impresion por
microcontacto. Modelado por microfluidos. Modelado de flujo laminar. Interacciones de clulas con polmeros: mtodos de
caracterizacin, superficies polimricas, polmeros en suspensin, y andamiajes y geles polimricos tridimensionales.
Interacciones con la matriz. Modelado de substrato. Transduccin de seales y regulacin funcional via ECM. Procesado
de andamiajes polimricos. Polmeros biodegradables. Criterios de seleccin. Bioresorpcin.
Transplante de clulas y tejidos bioingenierados Estrategias de actuacin. Papel del hospedador. Fuente de las clulas.
Inmunologa de clulas no autlogas. Criopreservacin. Criobiologa de las clulas y los tejidos. Inmunomodulacin.
Inmunoaislamiento.
Ingenieria de tejidos fetales. Conceptos bsicos, consideraciones ticas y perspectivas futuras. Clulas ama
pluripotentes. Diferenciacin in vitro. Aplicaciones in vivo.
Aplicaciones de la ingenieria tisular. Hgado y pncreas. Sistema cardiovacular. Sistema hematopoytico. Cartlago y
hueso. Tegumento. Otros rganos y sistemas.
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TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
27
S
3
GA
3
GL
4
50
Leyenda:
GO
GCL
TA
TI
GCA
8
4,5
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
EVALUACION
Aclaraciones :
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
- Bruce M. Carlson, M.D. 2007. Principles of Regenerative Biology 2007 Elsevier Inc
- Lanza R, Gearhart J, Hogan B, Melton D, Pedersen R, ThomsonJ, West M. 2004. Handbook of Stem Cells. Elsevier
Inc.
- Lanza RP, Langer R, Vacanti J. 2007. Principles of tissue engineering. 3 ed. Acad. Press, San Diego, 1291 pgs.
Bibliografa de profundizacin
- Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. 2006. Introduccin a la Biologa Celular.
Ed. Mdica Panamericana. 2 Edicin.
- Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. 2002. Biologa Molecular de la Clula. 4 Edicin, Ed.
Omega, Barcelona, 1592 pgs.
- Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. 2003. Essential Cell Biology. 2 Edicin,
Garland Publ, Inc, New York & London, 896 pgs.
- Fawcett DW. 1987. Tratado de Histologa. Interamericana McGraw Hill. Madrid.
- Hauser, Hansjrg; Fussenegger, Martin M. (Eds.) Tissue Engineering. Series: Methods in Molecular Medicine , Vol. 140,
2nd ed., 2007, 336 pgs
- Jeanne F. Loring, Robin L. Wesselschmidt and Philip H. Schwartz (eds) 2007. Human Stem Cell Manual A Laboratory
Guide. Elsevier Ltd.
- Junqueira LC, Carneiro J. 2005. Histologa Bsica. 6 Edicin, Masson SA, Barcelona, 488 pgs + CD.
- Karp G. 1998. Biologa Celular y Molecular. McGraw-Hill-Interamericana, Mxico DF, 746 pgs + apndices.
- Khnel W. 2005. Atlas Color de Citologa e Histologa. 11 Edicin. Ed. Mdica Panamericana. Buenos Aires, 536 pgs.
- Lodish H, Darnell J, Berk A, Zipursky SL, Matsudaira P, Baltimore D. 2002. Biologa Celular y Molecular. 4 Edicin, .
Ed. Mdica Panamericana. Buenos Aires, 1084 pgs.
- Marigmez I, Cajaraville MP. 1999. Zelula. Zelula eukariotikoaren azalpenerako testuliburua. I zatia. Udako Euskal
Unibertsitatea, Iruea, 598 pgs.
- Patrick, CW Jr., Mikos AG, McIntire LV, Langer RS. 1998. Frontiers in Tissue Engineering Elsevier Ltd.
- Williams DF. 2006. The Biomaterials: Silver Jubilee Compendium. The Best Papers Published in BIOMATERIALS
19802004 2006 Elsevier Ltd.
- Young B, Heath JW. 2000. Wheaters Histologa funcional. Texto y atlas en color. 4 Edicin. Harcourt, Churchill
Livingstone, Madrid, 413 pgs
Revistas
Cell, Tissues, Organs
Journal of Biomimetics, Biomaterials, and Tissue Engineering
Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine
Stem Cell
Tissue Engineering
Direcciones de internet de inters
Pgina :
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2/3
www.tissueengineering.gov
www.cbte.group.shef.ac.uk
www.termis.org
http://pages2.inrete.it/mbiomed/tissueng.htm
http://www.ehu.es/seh/
Pgina :
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2013/14
GUA DOCENTE
Centre
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
Fourth year
SUBJECT
Crditos ECTS : 4,5
Molecular evolution is the process of evolution at the scale of DNA, RNA and proteins. Molecular evolution emerged as a
scientific field in the 1960's as researchers from molecular biology, evolutionary biology and population genetics sought to
understand recent discoveries on the structure and function of nucleic acids and protein. Some of the key topics that
spurred development of the field have been the evolution of enzyme function, the use of nucleic acid divergence as a
“molecular clock” to study species divergence, and the origin of non-functional or junk DNA. Recent
advances in genomics, including whole-genome sequencing, high-throughput protein characterization, and bioinformatics
have led to a dramatic increase in studies on the topic. The aim of this course is to provide the student with the basic
concepts necessary to understand the increasing number of scientific works in the field.
TEMARIO
Syllabus:
1. Evolution: An Historical view
2. Evolution: Fundamental concepts
3. Genes, Genetic Codes and Mutation Nucleotide Sequences.
4. Evolutionary change in Nucleotide Sequences.
5. Evolutionary change in Amino Acid Sequences.
6. Molecular Clocks.
7. Molecular Phylogenetics.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
M
30
S
4
GA
6
45
Leyenda:
GL
GO
5
GCL
TA
TI
GCA
8,5
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
METHODOLOGY:
The teaching methodology consists of:
1. Class sessions. Oral presentations by the teacher to cover the main topics in the program
2. Classroom activities. Activities in the class are designed to strengthen key concepts of the course and transversal skills.
They will include the following activities: 1) The preparation of a Glossary, 2) Important names in evolution (seminar), 3)
In-class debate.
3. Seminar. Each student will choose a topic on which to prepare an oral presentation at the end of the course
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
Aclaraciones :
GRADING:
25% Participation in sessions, 25% Work in class, 25% Seminars, 25% Final exam
The evaluation is based on attendance and active engagement in all the activities of the course (class sessions,
classroom activities, seminars).
Attendance at less than 70% of course activities, or failure to present the assessed essays directly prevents students
passing the course. Partial grades corresponding to course activities are held over from one academic year to the next on
student demand.
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1/2
ASSESSMENT:
Each activity will include an assessment sheet evaluation criteria will be provided.
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
On line course, basic bibliography and class notes.
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
1. HALLIBURTON, R. (2004) Introduction to population genetics. Pearson Prentice-Hall, USA.
2. HIGGS, P. & ATTWOOD, T.K. (2005) Bioinformatics and molecular evolution. Blackwell Publishing.
3. LI, W-H. & GRAUR, D. (2000) Fundamentals of Molecular Evolution. 2nd Ed. Sinauer Associates Inc., Massachusetts.
4. MOUNT, D.W. (2001) Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
5. NEI, M. & KUMAR, S. (2000) Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York.
6. LEHNINGER, A. L., NELSON, D. L. & COX, M. M. (2000) Principles of Biochemistry. 3th Ed. Worth Publishers. Nueva
York.
7. LEWIN, B. (1999) Genes VII. Oxford University Press. Oxford.
8. STRYER, L., BERG, J. M. & TYMOCZKO, J. L. (2002) Biochemistry. 6th Ed. W. H. Freeman. New York.
Bibliografa de profundizacin
- AYALA, F.J. & VALENTINE. (1983). La evolucin en accin. Alhambra.
- DAWKINS, R. (2004) The ancestor's tale. A pilgrimage to the dawn of life. Weindenfeld & Nicolson.
- DOBZHANSKY, T.H., AYALA, F.J., STEBBINS, G.L. & VALENTINE, J.W. (1980). Evolucin. Omega.
- GOULD, S.J. (1991). La vida maravillosa. Crtica.
- HEDRICK, P. W. (2000) Genetics of Populations. 2nd Ed. Jones and Barlett Publishers Inc.
- LPEZ-FANJUL, C. & TORO, M.A. (1987). Polmicas del evolucionismo. Eudema. Madrid.
- MOUNT, D.W. (2001) Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
- RIDLEY, Mark (1993) Evolution. Blackwell.
- SAMPEDRO, J. (2002). Deconstruyendo a Darwin. Drakontos, Crtica, Barcelona.
- STRACHAN, T. (1992). The Human Genome. Bios S.P.
Revistas
Science, Nature, Trends. Ecol. Evol., Annu. Rev. Ecol. Evol. S.,
Direcciones de internet de inters
http://www.allaboutscience.org/
Some lectures and videos about Darwintheory
http://sandwalk.blogspot.com/2007/01/what-is-evolution.html
Strolling with a skeptical biochemist
http://understandingevolution.com/evolibrary/search/topicbrowse2.php?topic_id=41
Some information about evolution. Evo-devo theory, macroevolution, microevolution. Tutorials and comics. Berkeley
university.
http://www.talkorigins.org/faqs/comdesc/default.html#intro
About macroevolution
http://www.mansfield.ohio-state.edu/~sabedon/biol1510.htm#vocabulary
Introduction to evolution
Pgina :
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2013/14
GUA DOCENTE
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
26731 - Nanobiotecnologa
COMPETENCIAS/DESCRIPCION/OBJETIVOS
TEMARIO
Introduccin a la nanotecnologa La interfase entre nanotecnologa y Biotecnologa.. nano.Propiedades en la escala
nano.. La necesidad de la escala nano y sus caractersiticas.
Nanoherramientas I: Tcnicas instrumentales de caracterizacin Microscopas: AFM, electrnica, NSOM. Otras tcnicas
(SPR....).
Nanoherramientas II: Estrategias y tcnicas de nanofabricacin. Tipos de nanolitografas y nanomodelado.
Nanomanipulacin.
Nanomateriales y nanopartculas: Basados en el carbono, de origen natural, metlicos..
Estructuras autoensambladas. Utilizacin de biomolculas como moldes. Nanoingeniera de cidos nucleicos . Otros
ejemplos.
Aplicaciones a la obtencin nanoimagen: Puntos cunticos (quantum dots).
Microfluidos: Comportamiento de los fluidos en microescala y sometidos a campos. Aplicaciones. El laboratorio en un chip
(Lab on chip).Nanobiosensores.
Nanoporos y sus aplicaciones.para la deteccin/secuenciacin de DNA. Aplicaciones a la Biomedicina Nanosistemas de
diagnostico y tratamiento.
Liberacin controlada de frmacos. Nanomedicina regenerativa. Otras aplicaciones mdicas: Implantes y ciruga.
Usos en otras reas: Nanoelectrnica basada en material inorgnico o biolgico. Nanoagricultura, nanocosmtica.
Impacto econmico y social Perspectivas futuras y evaluacin de riesgos.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
Horas de Actividad No Presencial del Alumno
Leyenda:
M
25
S
4
GA
35,5
12
GL
6
GO
4
12
GCL
TA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
TI
GCA
6
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
En las clases magistrales (M) se explicarn los contenidos del temario y se resolvern ejercicios y problemas
relacionados con los conceptos explicados. Las clases prcticas de ordenador consistirn en sesiones en las que se
realizarn simulaciones de utilizacin de tcnicas complejas como el microscopio de fuerza atmica (AFM). En los
seminarios los alumnos expondrn, individualmente o en grupo, temas actuales y en la salida de campo (GCA) se visitar
un centro donde se investigue en nanociencias.
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
Pgina :
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BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
- Introduction to Nanoscience. GL Hornyak, J. Dutta, HF Tibbals y AK Rao. CRC 2008
- Fundamentals in Nanotechnology. GL Hornyak, JJ Moore, HF Tibbals y J. Dutta,
CRC, 2009.
- BioNanotechnology. Elisabeth S. Papazoglou, Aravind Parthasarathy. Morgan y
Claypol, 2007.
- Plenty of room for Biology at the bottom: An introduction to Bionanotechnology. E.
Gazit. Imperial College Press 2007.
- Introduction to BioMEMS. Albert Folch. CRC Press, 2013.
- Understanding Nanomedicine: An Introductory textbook. R. Burgess. Pan Standford
Publishing, 2012.
Bibliografa de profundizacin
- NANOTECHNOLOG IN BIOLOGY AND MEDICINE: Methods, Devices, and Applications. Tuan Vo-Dinh (ed) CRC
2007
- Nanobiotechnology. Concepts, Applications and Perspectives. C.M.Niemeyer y C.A. Mirkin(eds.). Wiley
& sons 2004.
- Nanobiotechnology II: More concepts and applications. Chad A. Mirkin and Christof M. Niemeyer
(eds) Wiley 2007
- Bionanotechnology: Lessons from Nature. D.S.Goodsell, 2004
- Controlled Nanoscale motion. H.Linke y A.Mansson, Springer, 2007.
- Nanobiotechnology of Biomimetic membranes. D.T. Martin.Springer 2007
- Protein Nanotechnology. T. Vo-Dinh. Humana Press 2005.
Revistas
Science, Nature, Nature Nanotechnology, Small, Nano Letters, Angewandte Chemie, Langmuir, Biophysical Journal,
Nanotechnology, ACS Nano
Direcciones de internet de inters
USA National Nanotechnology Initiative. http://www.nano.gov/
European Commision.NanoTechnology http://ec.europa.eu/nanotechnology/links_en.html
National Cancer Institute Alliance for Nanotechnolgy in cancer.http://nano.cancer.gov/
blog~nano: Nanoscale Materials and Nanotechnology http://nanoscale-materials-and-nanotechnolog.blogspot.com.es/
Nanotechnology Now: http://www.nanotech-now.com/
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GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 4,5
Esta asignatura presenta al alumno una visin general de la sntesis orgnica orientada a las molculas de inters en el
campo de la bioqumica y biotecnologa. Se estudian los puntos ms destacables a considerar en el anlisis y
planificacin de una sntesis: anlisis retrosinttico, estrategias sintticas, proteccin de grupos funcionales. Adems, se
desarrollan los mtodos fundamentales para poder acceder a molculas enantioenriquecidas. Por ltimo se presenta al
alumno los principios fundamentales sobre los que se sustenta la sntesis en fase slida y la qumica combinatoria.
TEMARIO
Tema 1: Introduccin a la qumica orgnica.
Tema 2: Estructura y enlace en los compuestos orgnicos.
2.1. Frmulas centesimal, emprica y molecular.
2.2. Formulacin y nomenclatura de los compuestos orgnicos.
Concepto de grupo funcional y de serie homloga.
2.3. Estructuras de Lewis. Cargas formales.
2.4. Orbitales atmicos.
2.5. El tomo de carbono. Hibridaciones y enlaces.
Tema 3: Estructura y propiedades moleculares.
3.1. Polaridad de enlace y polaridad de las molculas.
3.2. Atracciones y repulsiones intermoleculares.
3.3. Estructura y propiedades fsicas.
3.4. Efectos estricos y efectos electrnicos.
3.5. Efecto resonante.
3.6. Acidez y basicidad.
Tema 4: Estereoqumica.
Tema 5: Perspectiva de las reacciones orgnicas.
5.1. Tipos de reacciones orgnicas.
5.2. Mecanismos de reaccin.
5.3. Termodinmica y cintica de las reacciones orgnicas.
5.4. Perfil energtico de una reaccin.
5.5. Intermedios de reaccin.
Tema 6: Alcanos y cicloalcanos.
6.1. Propiedades de los alcanos.
6.2. Reactividad de los alcanos. Combustin. Halogenacin radicalaria.
Tema 7: Alquenos.
7.1. Propiedades fsicas de los alquenos.
7.2. Reactividad general de los alquenos.
7.3. Hidrogenacin cataltica.
7.4. Halogenacin.
7.5. Adicin de haluros de hidrgeno.
7.6. Adicin de agua.
7.7. Epoxidacin.
7.8. Dihidroxilacin.
Tema 8. La reaccin de sustitucin nuclefila y la reaccin de eliminacin. Estudio conjunto de la reactividad de haluros,
alcoholes, teres y aminas.
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Tema 9. La reaccin de adicin a grupo carbonilo. Estudio conjunto de la reactividad de aldehdos y cetonas.
Tema 10. La reaccin de sustitucin nuclefila sobre grupo acilo. Estudio conjunto de la reactividad de cidos carboxlicos
y sus derivados. Estrategias de proteccin y desproteccin en sntesis. Introduccin a la sntesis en fase slida.
TIPOS DE DOCENCIA
Tipo de Docencia
Horas de Docencia Presencial
Horas de Actividad No Presencial del Alumno
Leyenda:
M
27
S
8
GA
8
40,5
12
12
GL
GO
2
GCL
TA
TI
GCA
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
La primera parte del temario trata de repasar y profundizar, en la medida adecuada, conceptos que el alumno ha
adquirido en la asignatura "Qumica" que cursaron en el primer ao de la Titulacin.
En el desarrollo del programa se prestar especial atencin a ilustrar conceptos estructurales y de reactividad tomando
como ejemplo biomolculas sencillas y, paralelamente, tratando de destacar las similitudes conceptuales entre procesos
propios de la qumica orgnica y procesos establecidos para diferentes rutas metablicas.
EVALUACION
- Examen escrito a desarrollar
- Examen escrito tipo test
Aclaraciones :
Sistema de Evaluacin:
Los alumnos sern evaluados mediante un examen que comprenda preguntas tipo test y ejercicios de aplicacin.
Representar el 70% de la nota final. La realizacin de ejercicios y su discusin en el aula supondr un 30% de la nota
final.
MATERIALES DE USO OBLIGATORIO
BIBLIOGRAFIA
Bibliografa bsica
1. "Qumica Orgnica". L. G. Wade, Jr., Pearson-Prentice Hall, 5ed, 2004.
2. "Qumica Orgnica". K. P. C. Vollhardt, N. E. Schore, Omega, 3ed, 2000.
3. "Qumica Orgnica. Estructura y Reactividad". S. Ege, Editorial Revert, 1997.
4. "Qumica Orgnica". J. McMurry, International Thompson Editores, 5ed, 2001.
5. "Cuestiones y Ejercicios de Qumica Orgnica". E. Quio, R. Riguera, McGraw-Hill, 2ed, 2004.
6. "Formulacin y Nomenclatura. Qumica Orgnica". W. R. Peterson, Eunibar, 7ed, 1985.
7. “Nomenclatura y Representacin de los Compuestos Orgnicos”. E. Quio, R. Riguera, McGraw-Hill
Interamericana de Espaa. 1996.
Bibliografa de profundizacin
1. WARREN, S. "Organic synthesis. The disconnection approach". Wiley & sons, Chisester, 1999.
2. GAWLEY, R. E.; JEFFREY, R. E. "Principles of asymmetric synthesis". Pergamon, Londres, 1996
3. NICOLAU, K. C.; SORENSEN, E. J. "Classics in total synthesis: targets, strategies, methods". VCH, Weinheim, 1996
4. NICOLAU, K. C. "Classics in total synthesis ii: more targets, strategies, methods". VCH, Weinheim, 2003.
5. COREY, E.J.; CHENG, X.-M. "The logic of chemical synthesis". Wiley & sons, Nueva York, 1995.
Revistas
- The Journal of Chemical Education: http://jchemed.chem.wisc.edu/
- Organic Syntheses: http://www.orgsyn.org/
- The Journal of Organic Chemistry: http://pubs.acs.org/journal/joceah
- Organic Letters: http://pubs.acs.org/journal/orlef7
- European Journal of Organic Chemistry: http://www3.interscience.wiley.com/journal/27380/home
- Tetrahedron: http://www.sciencedirect.com/science/journal/00404020
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GUA DOCENTE
2013/14
Centro
Ciclo
Indiferente
Plan
Curso
4 curso
ASIGNATURA
Crditos ECTS : 6
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M
20
20
Leyenda:
GA
20
GL
35
GO
20
GCL
TA
TI
GCA
35
M: Magistral
S: Seminario
GA: P. de Aula
GL: P. Laboratorio
GCL: P. Clnicas
TA: Taller
GCA: P. de Campo
GO: P. Ordenador
Aclaraciones :
1. ORDENAGAILU-GELAKO PRAKTIKAK
Ordenagailuko 9 praktika egingo ditugu, irakasgaiaren gida-lerroak markatuko dituztenak. Praktika horiek binaka egingo
dituzte ikasleek eta guztiak egongo dira antolatuta bikote bakoitzak aukeratuko duen gai baten inguruan. Proiektu oso bat
bezala planteatuko dira praktikak. Aukeratutako gaiaren inguruan hainbat motatako testuak sortu beharko dituzte ikasleek:
idatzizkoak eta ahozkoak; didaktikoak, dibulgaziozkoak, glosategiak, definizioak; ikasleek sortuak eta itzuliak.
Ordenagailu-gelan landutakoak maiz eskatuko du gelatik kanpoko lantze edo hobetze lan bat.
2. TXOSTEN TEKNIKOA
Gelako jardueren aurrera eramango dugun proiektua da. Talde-lana izango da, eta azken kalifikazioak ponderazio bat
edukiko du ikasle bakoitzaren parte-hartzearen arabera. Txosten teknikoaren dokumentu idatzia sortuko dute ikasleek
lehenengoz talde-lanean. Ondoren, ikaskideen aurrean ahoz aurkezteko dokumentua prestatuko dute. Ahozko
aurkezpena indibiduala izango da: ikasle bakoitzak prestatuko du bere aurkezpena eta ikasleek banan-banan egingo dute
aurkezpena besteen aurrean.
3. KONTROL-ARIKETAK
Ikasle bakoitzak lortu duen gaitasun linguistikoen maila zehazkiago neurtzeko, zenbait porba egingo dira lauhilekaoren
bukaeran: testa, idazlanak eta terminoen azterketa.
EVALUACION
- Examen escrito tipo test
- Examen oral
- Realizacin de prcticas (ejercicios, casos o problemas)
- Trabajos individuales
- Trabajos en grupo
- Exposicin de trabajos, lecturas...
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Irakasgaiaren ebaluazioa jarraitua izango da. Ebaluazio jarraitua gainditzen ez duten ikasleek edo arrazoiren batengatik
klasera etortzerik ez duten ikasleek, bukaerako azterketa egin ahal izango dute.
1. EBALUAZIO JARRAITUA
Ordenagailu-praktiketako proiektua (%30)
Txosten teknikoa (%30)
Kontrol-ariketak (%25)
Ahozko aurkezpenak (%15)
Irakasgaiaren liburukia
6
2. AZTERKETA
Testa (50 ariketa)
(%15)
Terminoen azterketa
(%10)
Itzulpena
(%30)
Idazlana
(%30)
Ahozko aurkezpena
(%15)
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