CAPITULO

Introducci
n a la
Microbiolog
a
1.1 Microbiologa
1.2 Los microorganismos
como clulas
1.3 Los virus, entes
microscpicos no
celulares
1.4 Clulas eucariotas y
procariotas
1.5 Posicin de los
microorganismos en
la naturaleza
Louis Pasteur (1822
1895)
Qumico y Bilogo Francs
que fund la ciencia de la
Microbiologa, demostr la
teora de los grmenes
como causantes de
enfermedades (patgenos),
invent el proceso que lleva
su nombre y desarroll
vacunas contra varias
enfermedades incluida la
rabia.

1.6 Taxonoma y
filogenia
1.7 Algunos trabajos
claves en
microbiologa
1.8 El inicio de la
genmica microbiana
y la
post-genmica
1.9 Referencias
bibliogrficas

1.1 Microbiologa

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

La Microbiologa es el estudio de un grupo amplio y diverso de organismos microscpicos que

existen como clulas aisladas o asociadas. Los microorganismos incluyen bacterias, hongos, protozoarios y
virus que aunque son microscpicos no son celulares. La Microbiologa analiza la diversidad microbiana y su
evolucin as como el rol de los microorganismos en el mundo en general, en la sociedad humana, en el
cuerpo humano y en animales y plantas.
La Microbiologa gira en torno a dos temas fundamentales, uno bsico y otro aplicado. Como ciencia
bsica, la Microbiologa suministra algunas de las herramientas de investigacin ms verstiles para
determinar la naturaleza de los procesos caractersticos de la vida. Los sofisticados conocimientos que
poseemos sobre los principios fsicos y qumicos que gobiernan los procesos vitales han surgido de estudios
con microorganismos. Esto se debe a que los microorganismos comparten con las clulas de los organismos
pluricelulares muchas propiedades bioqumicas. Adems, las clulas microbianas pueden alcanzar elevadas
densidades de poblacin en cultivo y son fcilmente manipulables para estudios genticos. Ejemplo el
conocimiento del ADN surgi de un estudio de transferencia gentica en bacterias.
Como ciencia biolgica aplicada, la Microbiologa se ocupa del rol de los microorganismos en
diferentes sectores como la industria de alimentos. Los productos agrcolas o los animales en explotaciones
ganaderas deben llegar a los consumidores con calidad sanitaria. Los microorganismos tienen gran
importancia en la industria alimentaria porque pueden ocasionar el deterioro de los alimentos y ocasionar
prdidas econmicas inmensas. Las industrias de enlatado, congelado, desecado de alimentos y otras, tienen
como finalidad acondicionar los alimentos de tal modo que no sufran deterioro. Los microorganismos
causantes de enfermedades y transmitidos por alimentos tambin son dignos de consideracin. Los alimentos
deben estar adecuadamente preparados y controlados para evitar la transmisin de enfermedades, ya que el
alimento apto para el consumo humano puede servir tambin para sustentar el crecimiento de muchos
microorganismos.
No todos los microorganismos tienen efectos indeseables sobre los alimentos o sobre los
consumidores. Por ejemplo, los productos lcteos, como queso, yogurt, mantequilla, que se manufacturan en
gran medida por la actividad microbiana, son de gran valor econmico. De modo similar, productos de
importancia en la industria alimentaria como encurtidos, bebidas alcohlicas, cido ctrico, actico, enzimas y
otros son obtenidos por actividad microbiana.
1.2 Los microorganismos como clulas
Microorganismo es un organismo que no se puede observar a simple vista (microscpico), constituido
por una clula o varias, incluyendo los virus. La clula es la unidad fundamental de toda materia viva. La
clula es una entidad aislada de otras clulas por una membrana celular y en algunos casos por una pared
celular. Contiene una variedad de estructuras (ncleo o nucleoide, citoplasma) y componentes qumicos
(protenas, cidos nucleicos, lpidos, polisacridos), que hacen posible su funcionamiento.
Todos los organismos celulares son estructuras altamente organizadas que muestran alguna forma de
metabolismo. Esto es, las clulas toman sustancias qumicas del medio y las transforman, conservan parte de
la energa liberada, de modo que las clulas pueden usarla y luego eliminan los productos de desecho. Todas
las clulas poseen reproduccin, es decir, son capaces de dirigir una serie de reacciones bioqumicas que
conducen a su propia sntesis. Como resultado de los procesos metablicos, una clula crece y se divide para
formas dos clulas. Muchas clulas sufren diferenciacin, un proceso por el que se transforman nuevas
sustancias o estructuras. A menudo, la diferenciacin celular es parte de un ciclo vital en el que las clulas
forman estructuras especiales relacionadas con la reproduccin, la dispersin o la supervivencia.

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Las clulas responden a seales qumicas en su medio ambiente, tales como las producidas por otras
clulas. Por tanto pueden comunicarse e incluso estimar su propio nmero en el ambiente circundante por
medio de pequeas molculas que se difunden y pasan entre clulas vecinas. Con frecuencia los organismos
vivos tienen movimiento por autopropulsin, y en el mundo microbiano existen diferentes mecanismos
responsables de la movilidad. Finalmente, a diferencia de las estructuras inertes, las clulas pueden
evolucionar, cambiando permanentemente sus caractersticas y transmitiendo las nuevas propiedades a su
descendencia. De alguna forma, la primera clula debi originarse a partir de una estructura no celular hace
ms de 3 800 millones de aos. Despus se produjeron una serie de sucesos altamente probables, tales como el
crecimiento y divisin, originndose poblaciones de clulas a partir de las cuales tuvo lugar la evolucin
mediante la seleccin de nuevas caractersticas y mayor diversidad.

1.3 Los virus, entes microscpicos no celulares

Los virus no son clulas. Carecen de muchos de los atributos de las clulas y no son sistemas
dinmicos abiertos. Una partcula vrica aislada es una estructura esttica muy estable e incapaz de cambiar o
reemplazar sus partes constituyentes. Slo cuando se asocia con una clula el virus es capaz de replicarse y
adquirir algunos de los atributos de un sistema vivo. As, a diferencia de las clulas, los virus no tienen
metabolismo propio. Aunque poseen informacin gentica (ADN o ARN) los virus carecen de un sistema de
traduccin y usan la maquinaria de la clula para la sntesis de protena. Los virus infectan diversos
organismos incluyendo a los microorganismos.

1.4 Clulas eucariotas y procariotas

Las clulas eucariotas son por lo general ms grandes y estructuralmente ms complejas que las
procariotas. Su caracterstica diferencial es la presencia de estructuras limitadas por membranas denominadas
orgnulos que corresponden al ncleo, mitocondrias y cloroplastos. Los microorganismos eucariotas son las
algas, los hongos y los protozoos. Las clulas procariotas tienen una estructura interna ms simple y carecen
de orgnulos o estructuras rodeadas por membranas (Tabla 1.1). Los procariotas corresponden a las Bacteria y
Archaea.
Los genomas presentan una organizacin diferente en clulas procariotas y eucariotas. En los
procariotas, el ADN se encuentra como una larga molcula de dos cadenas formando el cromosoma que se
condensa para originar una masa visible llamada nucleoide. En la mayora de los organismos procariotas el
ADN es circular y en general poseen un cromosoma. Por esta razn la mayora de los procariotas contiene una
copia de cada gen y son genticamente haploides. Asimismo la mayora de los procariotas contienen ADN
extracromosmico dispuesto de manera circular constituyendo los plsmidos (que confieren propiedades
especiales a las clulas pero no requeridas para la supervivencia).
En los eucariotas, el ADN se presenta dentro del ncleo en molculas lineales empaquetadas en un
estado muy organizado formando los cromosomas. El nmero depende del organismo, por ejemplo
Saccharomyces cerevisiae contiene 16 cromosomas (ocho pares). El humano contiene 46 (23 pares). Los
cromosomas eucariotas adems de ADN contienen tambin protenas que favorecen el plegamiento y
empaquetamiento del ADN, as como otras protenas necesarias para la expresin gnica. Una diferencia
fundamental es que los eucariotas contienen dos copias de cada gen y son, por tanto genticamente diploides.
Un procariota tpico como la bacteria Escherichia coli contiene un cromosoma con ADN de alrededor
de 4,6 millones de pares de bases y cerca de 4 300 genes. Una clula eucariota como la de los humanos
contiene mil veces ms ADN que E. coli y alrededor de siete veces su nmero de genes.

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Tabla 1.1 Caractersticas diferenciales entre Procariotas y Eucariotas

Caracterstica
Organizacin
del
material
gentico
Membrana nuclear
ADN con histonas
Nmero de cromosomas
Intrones en los genes
Nucleolo
Desarrollo de mitosis
Recombinacin gentica
Mitocondrias
Cloroplastos
Membrana
plasmtica
con
esteroles
Flagelos
Retculo endoplasmtico
Peptidoglicano
Ribosomas
Lisosomas y peroxisomas
Microtbulos
Citoesqueleto
Diferenciacin

Procariotas
Ausente
No
Uno*
Raro
Ausente
No
Parcial
unidireccional
Ausentes
Ausentes
No**
Submicroscpicos,
una fibra
Ausente
Presente***
70 S
Ausentes
Ausentes o raros
Ausente
Rudimentaria

Eucariotas
Presente
Si
Ms de uno
Comn
Presente
Si
transferencia Meiosis y fusin gametos
Presentes
Presentes
Si
Microscpicos,
20 microtbulos
Presente
Ausente
80 S
Presentes
Presentes
Presente
Tejidos y rganos

*Algunas excepciones
** Excepcin micoplasmas y metantrofos
*** Excepcin micopolasmas y arqueobacterias
Fuente: Prescott et al. 1999
1.5 Posicin de los microorganismos en la naturaleza
Existen millones de organismos vivos en la naturaleza. El hombre en su afn de ordenarlos cre la
taxonoma Ciencia de la clasificacin, nomenclatura e identificacin.
Carlos Linneaus, a mediados del siglo XVIII, orden a todos los seres vivos en
dos reinos bien definidos (segn tipo de nutricin; fotosntesis, absorcin y ingestin).
Reino animalia: Organismos mviles, hetertrofos (absorcin, ingestin)
Reino plantae: Organismos inmviles, auttrofos (fotosntesis).

Ernest Haeckel, en 1866 propuso un tercer reino, denominado Protista,

conformado por organismos unicelulares o multicelulares pero carentes de especializacin tisular (sin
tejidos). Los Protistas inferiores incluan clulas procariotas: bacterias, cianobacterias (algas verdes
azules) y los Protistas superiores clulas eucariotas: algas, hongos y protozoos.

Chatton, en 1937 dividi a los seres vivos en dos grupos segn presentaran o no
membrana (organizacin celular). Aparecieron los trminos:
Eucariota: Organismos cuyas clulas tienen membrana nuclear: protozoos, algas, hongos.
Procariota: Organismos cuyas clulas carecen de membrana nuclear: bacterias.

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Whittaker, en 1969 propuso un sistema de clasificacin basado en dos niveles de

organizacin celular y tres formas de nutricin.
a) Reino Monera: Procariotas, bacterias y algas azul verdosas. Predominantemente absorcin,
algunas fotosntesis.
b) Reino Protista: Eucariotas, unicelulares, microalgas, protozoos, hongos sencillos. Eucariotas sin
tejidos verdaderos. Absorcin, ingestin, fotosntesis.
c) Reino Fungi: Eucariotas osmtrofos, Hongos filamentosos y levaduras. Eucariotas pluricelulares
multinucleados con ncleos dispersos en su micelio con pared y a menudo tabicado. Absorcin.
d) Reino Plantae: Eucariotas fotosintticos, multicelulares con clulas eucariotas, pared celular
rgida y nutricin fotoautotrfica.
e) Reino Animalia: Eucariotas fagtrofos, multicelulares con clulas eucariotas sin pared celular y
nutricin principalmente ingestiva.

1.6 Taxonoma y filogenia

La taxonoma es la ciencia de la clasificacin. Se apoya en propiedades fsicas observables que
constituyen el fenotipo de una clula e incluyen su apariencia (morfologa), la forma en la que interaccionan
con colorantes o tintes y su capacidad de convertir en producto qumico determinado en otro.
Un mtodo diferente y nuevo de clasificacin es la filogenia, que detecta diferencias en
microorganismos basadas en caractersticas genticas codificadas en el ADN y en el ARN que est implicado
en la sntesis de protenas. Particular importancia tienen las secuencias de base par en el ARN ribosmico (16
Svedberg). En 1987 Carlos Woese a travs de la secuenciacin del ARNr 16S determin que los procariotas
estn divididos en dos grupos:
Arqueobacterias: Bacterias que producen metano y otros que viven en medios ambientes muy cidos, muy
calientes o muy salinos (ambientes extremos).
Eubacterias: Bacterias comnmente aisladas del cuerpo, suelo y agua.
En 1990, Carlos Woese propuso un nuevo Taxon superior al reino que denomin Dominio. Todos los
seres vivos se agruparan en tres dominios: Bacteria, Archaea y Eukarya. De estos dominios dos son
exclusivamente microbianos y estn formados por clulas procariotas del reino Monera. y el tercero Eukarya
incluye a los reinos Protista, Fungi, Plantae y Animalia.

Dominio Reino Divisin Clase Orden Familia Gnero Especie

a.

Dominio
Reino
Divisin
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

:
:
:
:
:
:
:
:

b. Dominio

Bacteria
Monera
Proteobacteria
Alphaproteobacteria
Rhodosprillaes
Acetobacteriaceae
Acetobacter
Acetobacter aceti

Archaea

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Reino
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

c. Dominio
Reino
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

:
:
:

:
Monera
:
Euryarchaeota
Methanobacteria
:
Methanobacteriales
Methanobacteriaceae
Methanobacterium
Methanobacterium thermoautotroplicum

:
:
:
:
:
:
:
:

Eukarya
Fungi
Ascomycota
Plectomycetes
Eurotiales
Tricomaceae
Aspergillus
Aspergillus niger

La unidad bsica taxonmica es la especie. Los grupos de especies con mayores similitudes se
agrupan en conjuntos denominados gneros y a su vez grupos de gneros con similitudes suficientes se
agrupan en familias. Una vez que el organismo ha sido definido, recibe un nombre segn el sistema binomial
de nomenclatura establecida por Linneo. El nombre del gnero se escribe con mayscula y se coloca delante
de la especie que nunca se escribe con mayscula. El gnero y la especie se imprimen en cursiva. Ejm:
Escherichia coli. Una vez mencionado el nombre del gnero, se puede abreviar usando slo la mayscula
pero nunca se abrevia el nombre de la especie ejemplo E. coli.
La filogenia se refiere a organismos segn su evolucin histrica, mientras que la taxonoma se refiere
a organismos segn caractersticas observables de las clulas. Ambos son mtodos de clasificacin y
suministran diferentes clases de informacin. Un rbol filogentico (Figura 1.1) muestra las relaciones
evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree tuvieron una descendencia comn. Cada rama
representa un descendente del nodo o antecesor. Cada nodo se denomina unidad taxonmica. Adems de las
diferencias filogenticas, algunas caractersticas fenotpicas separan consistentemente tres categoras de
organismos vivos: Bacteria, Archaea y Eukarya (Tabla 1.2).

Figura 1.1 Arbol de vida filogentico establecido de una secuencia de RNA ribosmico.

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Tabla 1.2 Caractersticas diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

Caracterstica
Ncleo incluido en membrana
Pared de clula (cido murmico)
Membrana plasmtica

Bacteria
Ausente
Presente
Bicapa
Enlaces
ster
S
No
S
S
S
S

Fotosntesis basada en clorofila

Metanognesis
Reduccin de S a H2S
Nitrificacin
Desnitrificacin
Fijacin de nitrgeno
Sntesis y almacenamiento de poli hidroxi
alcanoato
S
Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y
kanamicina
S
Sensibilidad de ribosomas a la toxina de difteria
No

Archaea
Ausente
Ausente
Monocapa
Enlaces
ter
No
S
S
No
S
S

Eukarya
Presente
Ausente
Bicapa
Enlaces
ster
S
No
No
No
No
No

No

No
S

No
S

Fuente: Rittman y McCarty, 2001

1.7 Algunos trabajos claves en Microbiologa

1664: Robert Hooke describi cuerpos fructferos de mohos
creciendo sobre objetos de cuero.

1684: Antonie van Leeuwenhoek observ por primera vez a los

microorganismos con detalles (microscopios muy simples).

1864: Louis Pasteur finaliz la controversia sobre la generacin

espontnea (hiptesis de que los organismos vivos pueden originarse a partir de la
materia inerte).

1866: Ferdinand Cohn, estudi la bactera oxidante del azufre

Beggiatoa y el bacilo esporulante Bacillus.

1876: Roberto Koch enunci la teora microbiana del origen de las

enfermedades infecciosas.

1882: Roberto Koch, etiologa de la tuberculosis.

1884: Postulados de Koch, demostraron que un determinado

microorganismo causa una determinada enfermedad (Figura 2).
1.
El microorganismo patgeno sospechoso debe estar presente en todos los
casos de la enfermedad y ausente en animales sanos.
2.
El microorganismo sospechoso debe ser cultivado en forma pura fuera del
cuerpo del animal (en laboratorio).
3.
El microorganismo obtenido por cultivo en el laboratorio el ser inoculado
en animales sano debe causar enfermedad.
4.
El microorganismo debe ser reaislado de los animales inoculados
experimentalmente y al ser cultivado en el laboratorio debe tener las mismas
caractersticas que el microorganismo original.
1884: Christian Gram, tincin de Gram.
1887: Richard Petri, placas de Petri.
1889: Martinus Beijerinck, concepto de virus.
1929: Alexander Fleming, penicilina.
1953: James Watson, Francis Crick y Rosalind Franklin, estructura del ADN.
1966: Marshall Nirenberg y Gobind Khorana, descubrimiento del cdigo gentico.
1967: Thomas Brock, descubrimiento de bacterias capaces de crecer en fuentes termales
con agua en ebullicin.
1973: Stanley Cohen, Annie Chang, Robert Helling, Herbert Boyer, DNA recombinante.
1979: Sntesis de insulina por tcnica de ADN recombinante.
1983: Luis Montagnier, VIH como causa del Sida.
1988: Kary Mullis, reaccin en cadena de la polimerasa (PCR).
1995: Craig Venter y Hamilton Smith, secuenciacin del genoma de Haemophylus
influenzae.
1999: The Institute for Genomic Research (TIGR) y otros, ms de 100 genomas
secuenciados total o parcialmente.

Figura 1.2

Los postulados de Koch (Fuente: Madigan et al.,2004).

1.8 El inicio de la genmica microbiana y la postgenmica

En julio de 1995, J. Craig Venter y Hamilton O. Smith, de la compaa Celera

Genomics, y Claire M. Fraser del Institut for Genomic Research (TIRG), publicaron la
primera secuencia completa del cromosoma de un microorganismo: Haemophilus
influenzae cepa Rd. Este hecho marc un hito en la historia del estudio de los
microorganismos. El grupo de Fraser continu con la secuencia del genoma de
Mycoplasma genitalium, bacteria que tiene el genoma ms pequeo de las especies
conocidas. Les interesaba conocer el nmero y calidad de genes esenciales de la clula.
Posteriormente continuaron con el genoma de Methanococcus jannaschii, una
extraordinaria arqueobacteria aislada de las costas de Mxico a 2 600 metros de
profundidad, a 200 atmsferas de presin, que crece a 85 C, y es capaz de transformar el
CO2 a metano y generar la energa para su metabolismo. La secuencia revel que
alrededor del
50 % de genes no se relacionan con secuencias previas, sugiriendo que
codifican para mecanismos fisiolgicos inexplorados. Ese mismo ao la secuencia del
genoma de Saccharomyces cerevisiae, el primer eucariota se complet, encontrndose
aproximadamente 6 000 genes y al menos 2 000 de funcin desconocida.
A raz de la consolidacin del programa gentico en los ltimos aos (genmica o
estudio del genoma), la postgenmica es el punto de partida para las investigaciones en el
futuro. Al estudio del transcriptoma (el repertorio de las molculas de RNA mensajero
que se expresan) y el proteoma (el anlisis de las protenas y su condicin, ya sea normal
o patolgica), se le ha llamado comnmente postgenmica. El conocimiento de los
genomas de los microorganismos facilitar la tarea de su estudio; sin embargo, su
conocimiento no reemplaza la necesidad de conocer las funciones que realizan en la
clula. El nmero de genes importantes sin caracterizar subraya el hecho de que contar
con el genoma de un microorganismo es justo el punto de inicio para su comprensin y
estudio. Por lo tanto, el gran reto para el futuro es definir las funciones de las protenas
del genoma y descifrar las redes funcionales de regulacin.
Los datos aportados actualmente indican que un microorganismo puede contener
alrededor de 1 000 a 5 000 genes, de los cuales 20-70% son consideradas protenas
putativas que son descritas como de funcin desconocida. Algunas de la protenas
reguladoras pueden tener una docena de funciones celulares que pueden variar de una
clula microbiana a otra; adems, una protena puede contener varios dominios
funcionales lo cual complica el anlisis estructura-funcin. Desde luego, la genmica es
slo el primer paso para discernir los procesos fundamentales que gobiernan la vida. El
gran reto en el futuro es definir la funcin de las protenas codificadas por el genoma,
incluyendo el gran nmero de nuevas protenas de funcin desconocida, y descifrar las
redes funcionales de los genomas. Integrar los resultados de los esfuerzos de
secuenciacin con la informacin existente y con una base de datos bien desarrollada
producir un panorama amplio del metabolismo celular y de la funcin gentica.
La tecnologa, por s misma, no proporciona un entendimiento sustantivo del
universo microbiano. Vivimos la edad de la informacin, con excesivos genes,
secuencias, reacciones, y datos, los cuales debemos de integrar para lo cual es necesario
desarrollar rpidamente la bioinformtica necesaria para organizarla. La ecologa
microbiana necesita de proyectos para cultivar nuevos microorganismos, describir la
composicin y dinmica de las comunidades microbianas, hacer la metagenmica a gran
escala y sin fines comerciales; estudiar la expresin de los genes y las interacciones in
situ, crear las bases de datos y herramientas informticas necesarias para poder interpretar

el enorme flujo de datos que se est generando; por lo que ser indispensable incorporar
cientficos en computacin y bioinformtica, con amplios conocimientos en biologa
molecular. Este es el reto al que se enfrentan los microbilogos del siglo XXI.
1.9 Referencias bibliogrficas
Baca, E. (2010). La Microbiologa. De sus inicios a la genmica. Recuperado de
http://www.elementos.buap.mx/num49/htm/3.htm
Madigan, M.; Martinko, J. y Parker, J. (2004). Brock. Biologa de los Microorganismos
(10 ed.) Madrid, Espaa: Pearson Educacin, S.A.
Rittman, B. y McCarty. P. (2001). Biotecnologa del Medioambiente, Principios y
Aplicaciones. Espaa: McGraw Hill Interamericana.
Prescott, L, Harley J., y Klein, D. (1999). Microbiologa. Espaa: McGraw Hill
Interamericana.