BIOQUMICA MDICA

Macromolculas: Son estructuras de elevado peso molecular formadas por la unin de

molculas relativamente pequeas que constituyen monmeros o precursores que al unirse
entre s forman la estructura polimrica caracterstica de las macromolculas. De este modo
las protenas son polmeros de aminocidos, los polisacridos de monosacridos y los cidos
nucleicos de los nucletidos.

Principios generales de la organizacin macromolecular: Existe un grupo de

caractersticas comunes a todas las macromolculas que se recogen bajo el nombre de
Principio de organizacin de las macromolculas, entre las mencionadas caractersticas se
pueden citar al carcter polimrico, el carcter uniforme, el carcter lineal, el carcter
tridimensional, el carcter informacional, la tendencia a la agregacin, la relacin estructurafuncin y el elevado peso molecular.
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Elevado peso molecular: el peso molecular de las macromolculas se mide en una

unidad de masa denominada "Dalton" (D), que equivale a 1/12 del peso atmico del
istopo ms abundante del elemento carbono. Existen otras unidades derivadas que
son ms utilizadas como el kilodalton (kD), que equivale a 1000 dalton. Todas las
macromolculas presentan un peso superior a los 5 kD.

Carcter polimrico: todas las macromolculas son agregados polimricos de

componentes ms sencillos llamados monmeros o precursores, unido cada uno al
siguiente por medio de un enlace polimerizante de tipo covalente fuerte.

Carcter uniforme: el mismo tipo de precursor y el mismo tipo de enlace polimerizante

forma a cada una de las macromolculas. El enlace polimerizante aunque es distinto en
cada una siempre es de tipo covalente, formado por condensacin, donde los grupos
qumicos de dichos monmeros se combinan ocurriendo la prdida de una molcula de
agua.

Carcter lineal: al carecer de ramificaciones se puede afirmar que son lineales, existen
excepciones como algunos polisacridos en los que pueden aparecer ramificaciones.

Carcter tridimensional: la macromolcula presenta una estructura compleja con una

organizacin que ocupa las tres dimensiones. Para el estudio de esta estructura se ha
dividido en niveles que van desde el primario hasta el cuaternario, donde cada uno de
ellos posee un grado de organizacin diferente. Cada uno de estos niveles se estabiliza

por interacciones dbiles excepto el primario que tiene enlaces covalentes que unen a
los monmeros lo que lo hace el nivel ms estable. No todas las macromolculas
presentan estos niveles bien definidos por lo que se toma como modelo para su
explicacin a las protenas.
1. Estructura primaria: se refiere al orden de disposicin de los monmeros en la
cadena polimrica y tambin pude recibir el nombre de estructura primaria. Al ser su
enlace polimerizante de tipo covalente este nivel es el ms estable y el que
determina el resto de los niveles estructurales. Todos los precursores tienen
comprometidos sus dos extremos, uno con el que le antecede y otro con el que le
sucede, excepto el primero y el ltimo que presentan grupos libres. La diferencia
que existe entre estos grupos libres es la que le proporciona la polaridad a la
estructura. Cada uno de los precursores que forman parte de la cadena se
denominan residuos pues han perdido una de sus partes en las formacin del
enlace polimerizante.
En el nivel primario se distinguen dos zonas:
Montona: compuesta por los elementos que integran el enlace polimerizante que se mantiene
constante en cada tipo de polmero recibiendo el nombre de eje covalente. Esta zona permite
diferenciar una macromolcula de otra, por ejemplo: las protenas de los cidos nucleicos; y
diferenciar las macromolculas del mismo tipo segn el nmero de residuos.
Variable: est formada por la parte variable en cada punto de la cadena provocado por la diferencia
entre las caractersticas del precursor al que corresponda dicho punto. Esta zona permite diferenciar
una macromolcula de otra del mismo tipo, por ejemplo: el glucagn de la insulina, donde ambas son
macromolculas del mismo tipo pero compuestas por distintos aminocidos. Existen monosacridos
donde esta zona es montona pues estn formados por la polimerizacin del mismo precursor.
2. Estructura secundaria: se refiere a la forma que toma la cadena polimrica en
sectores pequeos debido a las interacciones entre los elementos del eje covalente.
Existen estructuras secundarias regulares e irregulares pero las que poseen un
ordenamiento regular son las fundamentales, de ellas las dos formas ms
frecuentes son:
Helicoidales: producidas por interacciones dbiles intracatenarias pueden aparecer con giro a la
derecha o a la izquierda.

Plegadas: se muestra como una lnea en forma de zigzag con ngulos bien definidos, descrita por el
eje covalente. Si los sectores de esta lnea tiene enfrentados los mismos extremos entonces e dice
que son paralelos; si los extremos son opuestos reciben el nombre de anti paralelos.
3. Estructura terciaria: conformacin o disposicin espacial que adoptan los tomos
en la macromolcula y posee un carcter irregular. Esto es producido por los
dobleces y plegamientos de la cadena que se establecen mediante interacciones
dbiles entre los elementos de la parte variable de la estructura primaria. Se pueden
distinguir sectores con una estructura secundaria regular y sectores con una
estructura secundaria sin ordenamiento regular.
4. Estructura cuaternaria: este nivel est definido solamente en las protenas y se
encuentra en estas cuando estn formadas por ms de una cadena polimrica
conocidas con el nombre de subunidades. Estas subunidades presentan estructura
terciaria y estn unidas entre s por interacciones dbiles aunque existen
excepciones como la cistena.
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Carcter informacional: la informacin que poseen las macromolculas est

estrechamente relacionada con la variedad de su estructura y cuanto mayor sea esta
mayor ser la informacin que posean. Esta informacin molecular les permite
interactuar con de forma especfica entre ellas mismas o con otras macromolculas de
diferente tipo y puede ser clasificada de dos en dos variantes:

1. Informacin secuencial: la que est contenida en la secuencia de monmeros del

polmero es decir en la estructura primaria y es en ella donde est contenida la
informacin de cmo deben ser ordenados los precursores durante la sntesis de la
macromolcula, como debe ser construida su estructura tridimensional y donde deben
comenzar y concluir los procesos a los que ser sometida. Al estar determinada por la
estructura primaria se puede decir que es la ms estable.
2. Informacin conformacional: se encuentra contenida en la estructura tridimensional y
de acuerdo a lo analizado sobre la informacin secuencial podemos afirmar que esta
determina la informacin conformacional. Este tipo de informacin permite
interacciones especficas en el espacio mediante determinados sitios que presenta la
macromolcula en su estructura tridimensional donde interviene un mecanismo
denominado reconocimiento molecular que tiene una gran relevancia en el estudio de
las protenas.

Tendencia a la agregacin: las macromolculas tienden a agregarse unas con otras.

Proceso durante el que se forman grandes estructuras supramoleculares de gran
complejidad. Este proceso pude ser realizado de dos formas: de forma covalente o de
forma no covalente y sucede entre los grupos qumicos de los precursores que no
forman parte de del eje covalente provocando que no se rompa. Las anteriores uniones
pueden formarse espontneamente o mediante un proceso asistido por otras
macromolculas.

Relacin estructura-funcin: la funcin realizada por cada una de las

macromolculas est directamente determinada por su estructura, o lo que es lo
mismo, existe una estrecha relacin entre la estructura primaria, la conformacin y la
funcin. Por lo tanto se puede afirmar que cualquier modificacin en la estructura de la
macromolcula provocara un cambio o alteracin de su funcin original.

Desnaturalizacin: proceso producto del cual la macromolcula pierde su estructura

tridimensional conservando la estructura primaria. Esto puede ser provocado por
agentes desnaturalizantes que intervienen en la formacin de las interacciones dbiles
desorganizando la estructura tridimensional de dicha macromolcula pero sin romper
los enlaces covalentes lo que provoca que su estructura primaria se mantenga intacta.
Al mantenerse la estructura primaria esto hace posible la reversibilidad del proceso
llevando a la macromolcula a sus condiciones originales. Uno de los agentes
desnaturalizantes ms conocidos es el calor.

Protenas: en casi todos los procesos que ocurren en las clulas estn presentes las
protenas (del griego proteos, que significa primero o ms importante). Entre las
macromolculas, el cido desoxirribonucleico (ADN) es la memoria que contiene la
informacin gentica, y los cidos ribonucleicos (ARN) son las decodificadoras, ya que son
capaces de convertir la informacin almacenada en el genoma, en la informacin secuencial
de las protenas, que les permite adquirir su estructura tridimensional funcional. Las protenas
son las macromolculas ejecutoras. Existen miles de protenas diferentes, cada una con
funcin especfica. Una determinada estructura permite una funcin determinada y las
protenas son un ejemplo sobresaliente; por ello se vuelve importante e imprescindible el
estudio de la estructura de las protenas, lo que permite comprender su diversidad funcional,
la relacin estructura-funcin y sus propiedades ms relevantes.

Estructura de las protenas: cuando la cadena polipeptdica tiene un peso molecular mayor
que 5 000 D, se considera que es una protena. La organizacin tridimensional de las
protenas les permite realizar su funcin, porque esta estructura permite la cercana de las
cadenas laterales de los residuos aminoaciditos involucrados en su funcin. Esta compleja
estructura se divide en cuatro niveles de organizacin para su estudio: primario, secundario,
terciario y cuaternario.
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Nivel primario: la estructura primaria de las protenas se caracteriza por el orden o

secuencia de sus L-- aminocidos, unidos mediante enlace peptdico, cuya fortaleza y
estabilidad en medio acuoso, permite la formacin de largos polmeros. La secuencia

aminoacdica que caracteriza a cada protena est determinada genticamente.

Nivel secundario: la estructura secundaria es el ordenamiento que adopta la cadena
poli peptdica con predominio del eje longitudinal como consecuencia de la formacin
de puentes de hidrgeno entre los oxgenos carbonlicos y los nitrgenos amdicos.
Este nivel est caracterizado por dos conformaciones regulares: la -hlice y la

conformacin .
1. La -hlice: se forma cuando la secuencia aminoacdica permite los giros alrededor del
carbono , formndose puentes de hidrgeno intracatenarios y paralelos al eje de la hlice.
Estas interacciones unen cada espira alternativamente con la que est ubicada por debajo y
por arriba. Formando parte de las invariantes de esta estructura regular est la de poseer 3,6
residuos de aminocidos por vuelta, el arrollamiento es hacia la derecha, y las distancias entre
las espiras es de 54 nm. La estabilidad de este nivel radica en los puentes de hidrgenos
establecidos, que unen las espiras entre s, y que las cadenas laterales de los residuos
aminoaciditos se proyectan hacia afuera de la hlice.
2. Conformacin : la hoja plegada se constituye entre varias cadenas poli peptdicas paralelas
estabilizadas por puentes de hidrgeno entre el oxgeno carbonlico y el nitrgeno amdico.
Estas interacciones unen cada cadena poli peptdica alternativamente con la que est
ubicada a su derecha y a su izquierda. Las cadenas laterales de los residuos de aminocidos
se proyectan por encima y por debajo del plano de la hoja plegada, contribuyendo a estabilizar
esta conformacin.
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Nivel terciario: el nivel terciario en las protenas globulares se establece por el

plegamiento de la cadena poli peptdica, lo que ocasiona que se acerquen residuos de
aminocidos que estn alejados en los niveles primario y secundario. Este nivel queda
estabilizado por interacciones dbiles y por el enlace covalente por puente disulfuro,
segn la identidad de los aminocidos cuyas cadenas laterales se enfrenten. Si se

enfrentan los grupos sulfidrilos de dos cistenas se forma el puente disulfuro, si son uno
acido (-) con otro bsico (+) se establecer una unin salina o electrosttica o inica; si
son dos apolares la unin ser hidrofbica; si son dos grupos hidroxilados o uno
hidroxilado y el otro cido o bsico ser el puente de hidrgeno y si son anillos
aromticos se establecern las fuerzas de van der Waals del tipo de apilamiento.
El nivel terciario de las protenas globulares comprende el plegamiento de regiones entre las hlices, las hojas plegadas , as como las combinaciones o motivos de estas caractersticas
secundarias formando estructuras compactas o dominios.
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Nivel cuaternario: se denomina nivel cuaternario al nivel estructural de las protenas

constituido por dos o ms cadenas poli peptdicas, idnticas o diferentes en su
estructura, generalmente en nmero par, unidas por interacciones no covalentes y en
ocasiones por puentes disulfuro. Cada una de estas cadenas polipeptdicas reciben
indistintamente los nombres de monmero o subunidades, y el conjunto forma la
protena oligomrica.

Modelos principales de las estructuras secundaria de las protenas: hlices y

conformacin .

Propiedades elctricas de los aminocidos: Los aminocidos, por poseer grupos

disociables, en dependencia del pH del medio son capaces de disociar dichos grupos y
presentar especies inicas distintas con carga neta diferente. El valor del pKa de un grupo
determina su fortaleza como acido. En los aminocidos los valores de pKa de sus grupos
disociables se numeran del ms acido (pk menor) al menos acido o ms bsico (pk mayor),
as el pK1 de la alanina corresponde al pKa del grupo COOH y el pK2, al pK del grupo
NH2.

A valores del pH > pK el grupo predomina en su forma disociada. A valores de pH < pK predomina en
su forma no disociada y si el valor del pH coincide con el del pK, ambas formas coexisten en iguales
cantidades. Por ejemplo, para un aminocido neutro como la alanina, pueden presentarse 3
diferentes especies inicas: A valores de pH < pK1 la especie inica de la alanina es la que se
representa en a) presentando la molcula carga positiva y sometida a la accin de un campo
elctrico migrara al polo negativo (ctodo); a valores del pH > pK1, predomina la especie de c) con
carga neta negativa y migrara al polo positivo (nodo); si el valor del pH = pK entonces predomina el
ion bipolar representado en b) y la carga elctrica neta sera cero. El ion bipolar es el que predomina
en el punto isoelctrico que corresponde con el valor del pH al cual la carga elctrica del aminocido

es cero y si se sometiera a la accin de un campo elctrico no migrara a ningn polo por no mostrar
afinidad por ninguno de ellos.

Polisacridos: son molculas largas de carbohidratos de unidades de monosacridos unidos

por enlaces glucosdicos (los monosacridos son molculas que presentan como
caracterstica comn poseer un grupo carbonilo <que puede ser aldehdo o cetona> y varios
grupos hidroxilos). Se extienden en la estructura de lineal a muy ramificado. A diferencia de
otros polmeros biolgicos, como los cidos nucleicos o las protenas, los polisacridos no son
portadores, en general , de informacin.

Estructura de los polisacridos: Los polisacridos estn compuestos de cadenas largas de

unidades de monosacridos unidos por enlaces glucosdicos. Los polisacridos contienen
ms de diez unidades de monosacridos. Las definiciones de qu tan grande debe ser un
carbohidrato caer en las categoras polisacridos u oligosacridos varan de acuerdo a la
opinin personal.

Funcin de los polisacridos: pueden cumplir dos funciones en el medio biolgico; la de

reserva energtica o la estructural. En este sentido, el tipo anomrico de enlace suele ser
decisivo. Mientras que los polisacridos con azcares unidos en a- suelen ser reserva
energtica, los formados por enlaces de tipo b- suelen cumplir funciones estructurales. Esta
diferencia la vemos claramente en los glucanos, es decir, los polisacridos compuestos por
unidades de glucosa. En general, los polisacridos se denominan con el nombre radical del
monosacrido o monosacridos constituyentes seguido del sufijo -ano: glucanos, galactanos,
mananos, arabinogalactanos, etc.

cidos nucleicos: constituyen una familia de biomoleculas relacionadas funcionalmente con

los mecanismos de conservacin, transmisin y expresin de la informacin gentica.

Estructura general de cidos nucleicos: constituyen un grupo de macromolculas cuya

funcin esencial es la de conservar, transmitir y expresar la informacin gentica. Esta
informacin se transmite de generacin en generacin y es la que garantiza que todos los
individuos de una especie sean esencialmente iguales y puedan dar origen a descendientes
tambin iguales a sus progenitores.

Tipos principales de cidos: los tipos principales de cidos nucleicos son dos; los cidos
ribonucleicos (ARN) y los cidos desoxirribonucleicos (ADN) cada uno de ellos con funciones
especficas dentro del amplio fenmeno del procesamiento de la informacin gentica.

ADN: cido DesoxirriboNucleico. Es el tipo de molcula ms compleja que se conoce. Su

secuencia de nucletidos contiene la informacin necesaria para poder controlar el
metabolismo un ser vivo. El ADN es el lugar donde reside la informacin gentica de un ser
vivo. El organismo humano posee 1012 clulas somticas y cada una de ellas posee en su
ncleo 48 molculas de ADN que constituyen el contenido fundamental de los cromosomas.
En cada una de las mitocondrias existe un nmero variable de molculas de ADN que se
diferencian en algunos aspectos de las molculas del ADN nuclear.

Estructura primaria del ADN: est compuesto por una secuencia de nucletidos formados
por desoxirribosa. Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucletidos de ADN
son Adenina, Guanina, Citosina y Timina Estas hebras se enfrentan una a la otra en forma
antiparalela y esta estructura se estabiliza por la formacin de puentes de hidrgeno entre las
bases nitrogenadas.

Estructura secundaria o Modelo de Watson y Crick: solo existen dos pares de bases, el
que forma la adenina con la timina unidas por dos puentes de hidrgeno y el de la guanina
con la citosina unidas por tres puentes. La secuencia de bases de una hebra es
complementaria a la de la otra hebra y en ella se conserva la informacin gentica.

El ADN est formado por hebras de polidesoxinucletidos (que resultan de la unin de gran nmero
de desoxinucletidos) enlazados mediante un enlace fosfodister. Este enlace se establece entre la
posicin 3 de un desoxinucletido y la posicin 5 del otro, por lo que se denomina 35. De esta
forma la hebra posee un extremo con el grupo fosfato de la posicin 5 libre (extremo 5) y el otro que
presenta libre el grupo OH de la posicin 3 (extremo 3). Cada desoxinucletido a su vez est
formado por una base nitrogenada que puede ser purnica o pirimidnica, por la D-2-desoxirribosa y
una molcula de cido fosfrico. Las bases purnicas del ADN son la adenina (A) y la guanina (G),
mientras que la pirimidnicas son la citosina (C) y la timina (T). Cuando se forma el polmero hay una
zona con una estructura montona pues en ella se alternan la desoxirribosa y el grupo fosfato a todo
lo largo de la cadena, pero tambin una zona diversa pues las bases nitrogenadas que sobresalen
de la estructura montona son diferentes en cada sector de la molcula. Es precisamente en el
orden o sucesin de esas bases nitrogenadas donde est contenida la informacin gentica.

Lo ms trascendental del modelo era que la estructura solo poda acomodar dos pares de bases, los
formados por la adenina y la timina (A-T) y por la citosina y la guanina (C-G). Las bases de cada par
se dice que son complementarias.

ARN: Los cidos ribonucleicos (ARN) son polmeros de ribonucletidos, es decir, de

nucletidos que contienen ribosa. Presentan gran heterogeneidad en su tamao. Los hay tan
pequeos con apenas 80 nucletidos hasta molculas gigantes de varios miles de bases. Es
por ello que las propiedades fsicas que dependen del peso, el tamao y la forma de las
molculas tambin son muy variables en estas macromolculas.

Estructura del ARN: estn formados por una cadena de ribonucletidos que contiene como
bases nitrogenadas principales: la adenina, la guanina, la citosina y el uracilo. La cadena se
pliega sobre s misma originando una estructura estabilizada por puentes de hidrgeno entre
las bases nitrogenadas que es su estructura secundaria, y por interacciones entre las bases y
el eje covalente ribosa fosfato adquieren la estructura tridimensional conocida como estructura
secundaria.

Tipos de ARN: Los tres tipos principales de ARN, el ribosomal, de transferencia y mensajero,
participan en la sntesis de protenas o en los mecanismos de expresin de la informacin
gentica.
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Mensajero (ARNm); portador de la informacin de los genes para la sntesis de

protenas, de forma lineal.

Ribosomal (ARNr); asociado a protenas forma los ribosomas, tiene estructura

secundaria de doble hlice en algunas zonas.

Transferente (ARNt); se ocupa de transportar los aminocidos hasta los ribosomas
donde se sintetizan las protenas.