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Manual de Bioquimica
Manual de Bioquimica
BIOQUMICA................................................................................................. 1
I. CLULA..................................................................................................... 2
II. AGUA........................................................................................................ 8
III. AMINOCIDOS.......................................................................................13
IV. ENZIMAS Y COENZIMAS.......................................................................17
V. INTRODUCCIN AL METABOLISMO.................................................... 20
VI. CARBOHIDRATOS................................................................................ 27
VII. LPIDOS................................................................................................ 35
BIBLIOGRAFA............................................. ..............................................39
BIOQUMICA
La Bioqumica juega un papel trascendental
en todas las reas de Ciencias de la
Salud.
Gran parte de las enfermedades son
consecuencia de alteraciones moleculares
en clulas, rganos o tejidos. Se requieren
slidos fundamentos bioqumicos para
entender su fisiopatologa, llegar al
diagnstico y desarrollar una teraputica
apropiada.
La bioqumica es la
qumica de la vida.
La bioqumica puede definirse de manera
ms formal como la ciencia que se
ocupa de la base qumica de la vida (del
griego, bios: vida). La clula es la unidad
estructural de los sistemas vivientes. La
consideracin de este concepto conduce
a una definicin funcional de la bioqumica
como la ciencia que se ocupa de los
constituyentes qumicos de las clulas
vivas y de las reacciones y procesos que
experimentan. Con esta definicin, la
bioqumica abarca extensas reas de la
biologa celular, la biologa molecular y la
gentica moIecular.
El campo de la bioqumica es tan amplio
como la vida misma. Dondequiera
que hay vida, se producen procesos
qumicos. Los bioqumicos los estudian
en microorganismos, vegetales, insectos,
peces, aves, mamferos y en el ser
humano.
El hecho de que la Bioqumica sea la ciencia
que estudia la vida a nivel molecular como
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Curso Propedutico
Curso Propedutico
UNIDAD I:CLULA
Conceptos de Clula,
Tejido y rgano
Clula
La clula es la unidad de organizacin
(estructura) y funcin bsica de la vida
en todos los organismos. Proceden de la
divisin de otra clula preexistente, siendo
idntica a esta gentica, estructural y
funcionalmente. Las semejanzas bsicas
entre su estructura y composicin molecular
proporcionan evidencias que todas las
clulas tiene un origen evolutivo comn
(Figura 1.1).
Tipos de clula
Las clulas se pueden clasificar en dos
grandes grupos: Eucariotas y Procariotas.
La procariota es una clula sin ncleo celular
diferenciado, es decir, su ADN no est
confinado en el interior de un ncleo, si no
libremente en el citoplasma (ej. Bacterias)
y carece de organelos. En contraste, la
clula eucariota es compleja y altamente
organizada, contienen organelos rodeados
de membrana con funciones especficas que
se encuentran en el citoplasma. Presentan
un ncleo prominente que contiene el 99%
del cdigo gentico, el ADN.
Organelos de las
clulas eucariotas
Tejido
En biologa se llama tejido a una estructura
constituida por un conjunto organizado
de clulas diferenciadas, ordenadas
regularmente, que realizan un trabajo
fisiolgico coordinado. Esta estructura
forma un nivel superior de organizacin
biolgica superior a la clula.
rgano
Un rgano es una agrupacin de diversos
tejidos que forman una unidad estructural
encargada del cumplimiento de una funcin
determinada. Se encuentra en un nivel
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Retculo Endoplasmtico
Consta de una red de membranas internas
paralelas que envuelven al ncleo y se
extienden hacia muchas regiones del
citoplasma y estn conectadas entre s.
Existen dos tipos de retculo: Liso (REL) y
rugoso (RER).
El RER se considera como una extensin de
la membrana nuclear, presenta numerosos
ribosomas en su superficie externa. El RER
tiene una funcin principal en la sntesis,
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Lisosomas
Son organelos esfricos que se encuentran
dispersos en el citoplasma de la mayora
de las clulas animales, se encuentran
rodeados por una nica membrana y
estn llenos de enzimas digestivas que
se sintetizan en el RER. Las enzimas
hidrolizan macromolculas complejas por
lo que se liberan los monmeros que los
componen y son reutilizados por la clula.
En condiciones normales, los lisosomas
degradan membranas y organelos que
han han dejado de funcionar en la clula
(autofagia).
Mitocondria
Las mitocondrias presentan doble membrana:
externa e interna. La membrana externa es
permeable a molculas pequeas e iones.
La membrana interna esta plegada
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UNIDAD II:AGUA
Importancia biomdica
El 71% de la superficie terrestre esta
cubierta por agua y el 97% est en los
ocanos. En los seres vivos,
el agua
representa el 70% del peso total. Es la
nica sustancia que podemos encontrar
en la tierra de forma natural como slido
(hielo), lquido o gas (vapor de agua).
Gracias a sus propiedades fisicoqumicas
permite la vida en nuestro planeta.
El agua, una molcula notablemente
esencial para la vida, solubiliza y modifica
las caractersticas de biomolculas como
cidos nucleicos, protenas y carbohidratos
al formar puentes de hidrgeno con sus
grupos funcionales.
Tiene una propension leve a disociarse
hacia iones hidroxido y protones.
La concentracion de protones, o acidez,
de soluciones acuosas por lo general se
reporta usando la escala de pH.
La homeostasis, conservacin de la
composicin del medio interno que es
esencial para la salud, incluye considerar
la distribucin del agua en el cuerpo
y la preservacin del pH as como de
concentraciones electrolticas apropiadas.
En el cuerpo, el agua puede encontrarse
en un compartimento intracelular y otro
extra-celular. Dos terceras partes del agua
corporal total (55 a 65% del peso corporal
en varones y alrededor de 10% menos
en mujeres) es lquido intracelular. Del
lquido extracelular remanente, el plasma
sanguneo constituye cerca de 25 por
ciento.
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18 Dalton (Da)
0 C
100 C
1g/cm3
097 g/cm3
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H O + H O H O+ + OH 223
El proton transferido en realidad se relaciona
con una agrupacin de moleculas de agua.
Los protones existen en solucion no solo
como H3O+, sino tambien como multimeros
tipo H5O2+ y H7O3+. Sin embargo, el
proton se representa de manera sistematica
como H+, aun cuando de hecho esta muy
hidratado.
El PH es el logaritmo negativo De la
concentracin de ion hidrgeno:
El termino pH fue introducido en 1909
por Sorensen, quien lo definio como el
logaritmo negativo de la concentracion de
ion hidrogeno:
pH = log [H]
Esta definicion, si bien no es rigurosa,
es suficiente para muchos propositos
bioquimicos; a fin de calcular el pH de una
solucion: 1. Se calcula la concentracion
de ion hidrogeno [H+]. 2. Se calcula el
logaritmo base 10 de [H+]. 3. El pH es el
negativo del valor que se encuentra en el
paso 2.
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Estructura Primaria
Secuencia de aminocidos de una
cadena polipeptdica.
Se escribe del N- al C-terminal.
Estructura Secundaria
Es la conformacin local de secuencias de
residuos de aminocidos en un polipptido.
Se distinguen tres clases de estructura
secundaria: Hlice, Lmina plegada y
vueltas-.
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Anlisis enzimtico en
diagnstico de enfermedades
paperas
distrofia
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UNIDAD V: INTRODUCCIN
AL METABOLISMO
Metabolismo y leyes de la
termodinmica en sistemas
biolgicos
Los seres vivos son mquinas qumicas,
obtienen sus componentes y energa
mediante reacciones qumicas. Al conjunto
de reacciones qumicas en un ser vivo se
denomina metabolismo. El metabolismo
est constituido por dos procesos:
catablico y anablico. El catabolismo,
tambin llamado reaccin exergnica, es
un proceso acompaado de prdida de
energa, en tanto que el anabolismo, o
reaccin endergnica es acompaada por
ganancia de energa (Figura 5.1).
Oxidaciones Biolgicas
Desde el punto de vista qumico, la oxidacin
se define como la perdida de electrones,
en tanto que la reduccin es la ganancia
de electrones. De este modo, la oxidacin
siempre se acompaa de reduccin de un
aceptor de electrones.
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Cadena respiratoria y
Fosforilacin oxidativa
La cadena respiratoria consiste de un
conjunto de transportadores de electrones
situados en la membrana interna mitocondrial.
La respiracin esta acoplada a la generacin
del intermediario de alta energa, ATP, por
medio de fosforilacin oxidativa. Diversos
frmacos (ej. Amorbital) y venenos (ej.
Cianuro, monxido de carbono) inhiben la
fosforilacin oxidativa.
Una unidad de respiracin mitocondria
consiste en una cadena respiratoria y una
ATP sintasa, enzima responsable de la
sntesis de ATP.
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Ciclo de Krebs
El ciclo del cido ctrico o ciclo de los cidos
tricarboxlicos, esta ruta metablica es la
tercera etapa de la respiracin celular, el
proceso de energa en las clulas. Forma
parte de la repiracin aerobia, requiere de
oxgeno, y se desarrolla entre los procesos
de gluclisis y cadena respiratoria; es una
secuencia de reacciones en las mitocondrias
que oxidan la porcin acetilo de la acetilCoA y reducen coenzimas que se reoxidan
por medio de la cadena de transporte de
electrones, enlazada a la formacin de
ATP. El ciclo de krebs es la va comn final
para la oxidacin de carbohidratos, lpidos
y protenas ya que se metabolizan hacia
acetil-CoA o intermediarios del ciclo (Figura
5.7 y 5.8).
La descarboxilacin oxidativa del piruvato
es un paso anterior al propio ciclo de Krebs.
Durante la gluclisis en el citoplasma se
produce el piruvato, que pasa por una etapa
de transicin para convertirse en acetil CoA
para que pueda entrar en el ciclo.
El piruvato pasa del citoplasma en las
mitocondrias donde el complejo enzimtico
piruvato deshidrogenasa lo convierte en
acetil coA.
La transformacin del piruvato en acetil
CoA es de gran importancia ya que une la
gluclisis y el ciclo de Krebs
El ciclo empieza con la reaccin entre
la porcin acetilo de la acetil-CoA y el
oxaloacetato, lo que forma citrato. Las
reacciones siguientes se liberan dos
molculas de CO2 y se regenera el
oxaloacetato. Este proceso es aerobio;
requiere oxgeno como el oxidante final
de las coenzimas reducidas. Las enzimas
del ciclo estn ubicadas en la matriz
Reaccin 1
La reaccin inicial entre la acetil-CoA y
el oxaloacetato para formar citrato est
catalizada por la citrato sintasa.
Reaccin 2
La enzima aconitasa isomeriza el citrato
hacia isocitrato; esta reaccin ocurren
en 2 pasos: deshidratacin hacia cisaconitato, y rehidratacin hacia isocitrato.
El veneno fluoroacetato es txico por
que la fluoroacetil-CoA se condensa con
oxaloacetato para formar fluorocitrato, que
inhibe la aconitasa, lo que hace que se
acumule el citrato.
Reaccin 3
El isocitrato pasa por deshidrogenacin
catalizada por la isocitrato deshidrogenasa
para formar, en un inicio, oxalosuccinato,
que permanece unido a la enzima y pasa por
descarboxilacin hacia -cetoglutarato.
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Reaccin 4
El -cetoglutarato pasa por descarboxilacin
oxidativa en una reaccin catalizada por un
complejo de mltiples enzimas. El complejo
de -cetoglutarato deshidrogenasa origina
la formacin de succinil-CoA. La arsenita
inhibe la reaccin, lo que hace que se
acumule el sustrato, -cetoglutarato.
Reaccin 6
La primera reaccin de deshidrogenacin,
que formar fumarato, es catalizada por la
succinato deshidrogenasa.
Reaccin 7
La fumarasa cataliza la adicin de de agua
a travs del doble enlace del fumarato, lo
que produce malato.
Reaccin 5
La succinil-CoA se convierte en Succinato
mediante la enzima succinato tiocinasa.
Reaccin 8
La malato deshidrogenasa convierte al
malato en oxaloacetato.
Cada vuelta del ciclo genera 12 ATP (Figura
5.9).
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UNIDAD VI:
CARBOHIDRATOS
Importancia biomdica
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Clasificacin de los
Carbohidratos
1.- Monosacridos: son aquellos carbohidratos
que no pueden ser hidrolizados en molculas
ms sencillas.
Pueden subdividirse en
triosas, tetrosas, pentosas,
hexosas, heptosas u
octosas, dependiendo de
la cantidad de tomos de
carbn que contengan;
y como aldosas y cetosas dependiendo si
tienen o no grupo aldehido o cetona en su
estructura.
2.- Disacridos: Se producen de dos
molculas del mismo o de diferentes
monosacridos cuando se unen entre
si: ejemplos de estos compuestos son la
maltosa, que produce dos molculas de
glucosa, y la sucrosa, que produce una
inolcula de glucosa y una de fructosa
(Figura 6.1).
disacridos
cuya
estructura
est
conformada por dos monmeros, uno de
ellos o ambos, glucosa. Al ser hidrolizados,
estos disacridos se degradan hacia
glucosa que puede ser utilizada para
obtencin de energa.
3.- Oligosacaridos: son productos de
condensacion de 3 a 10 monosacaridos.
Casi ninguno es digerido por las enzimas
del ser humano.
4.- Polisacaridos: Son productos de
condensacion de mas de 10 unidades
de monosacaridos; los ejemplos son los
almidones y las dextrinas, que pueden
ser polimeros lineales o ramificados. Los
polisacaridos a veces se clasifican como
hexosanos o pentosanos, dependiendo
de la identidad de los monosacaridos
que los constituyen (hexosas y pentosas,
respectivamente) Figura 6.2.
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Metabolismo de carbohidratos:
Digestin.
Los carbohidratos de la dieta de los que los
humanos tomamos energa entran en el
organismo en una forma compleja, en forma
de monosacridos, disacridos, polmetros
de almidn (amilasa y amilopectina) y
glicgeno. El polmero celulosa (tambin
formado por glucosas) tambin es
consumido pero no digerido.
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Glucolisis: Metabolismo
de la glucosa.
Como hemos mencionado anteriormente,
la glucosa es un carbohidrato esencial en
la dieta ya que al pasar por un proceso de
oxidacin es capaz de aportar de la energa
necesaria para realizar todas las funciones
biolgicas. La oxidacin es un proceso
mediante en el cual se aaden molculas
de oxgeno a una molcula o bien se le
extraen electrones, por lo que no siempre
la oxidacin es vinculada al oxgeno. Estos
procesos requieren de alguna manera
el transporte de oxgeno y electrones
de un lugar a otro. As , toda reaccin de
oxidacin debe acompaarse de reduccin
(eliminacin de oxgeno o adhesin de
hidrgeno o electrones a una sustancia)
En el cuerpo humano, los carbohidratos
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Gluconeognesis:
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UNIDAD VII:LPIDOS
Los lpidos son un grupo de compuestos
heterogneo, que incluye grasas, aceites,
esteroides, ceras y compuestos relacionados
ms por sus propiedades fsicas que por
sus propiedades qumicas.
Tienen la propiedad comn de ser:
1) relativamente insolubles en agua
2) solubles en solventes no polares
Son importantes constituyentes de la dieta
no slo debido a su alto valor energtico,
sino tambin debido a las vitaminas
liposolubles y los cidos grasos
esenciales contenidos en la grasa de
alimentos naturales.
Las combinaciones de lpido y protena
(lipoprotenas) sirven como el medio para
transportar lpidos en la sangre. Los
lpidos tienen funciones esenciales en la
nutricin y la salud, y el conocimiento de
la bioqumica de los lpidos es necesario
para entender muchas enfermedades
biomdicas.
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Presentan
conformacin
extendida.
Rotan alrededor de
los enlaces carbono
-carbono sencillos.
Forman
agregados estables
(empaquetamiento).
(Figura 7.2).
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BIBLIOGRAFA
1.- Bioqumica Ilustrada Harper
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