La Ionizacin a Presin Atmosfrica (API) es una tcnica de ionizacin blanda
que, al actuar a presin atmosfrica, y no en alto vaco como es lo habitual en otras tcnicas, consigue un altsimo rendimiento. Como interfase para HPLC, tiene la virtud de aceptar todo el flujo procedente de un cromatgrafo lquido de alta presin convencional, hasta 1 a 4 mL/min., lo que incide favorablemente sobre la sensibilidad del proceso LC-MS. En general, ionizan la muestra a presin atmosfrica, eliminan el disolvente, se ioniza el analito y se traslada los iones al MS. En la figura 9 se muestra el mecanismo de evaporacin inica para tcnicas a presin atmosfrica. Las dos ionizaciones API ms comnmente utilizadas son el Electrospray, (ESI), y la Ionizacin Qumica a Presin Atmosfrica, APcI. En la ionizacin ESI se aplica una tensin de 3-6 KV entre el capilar de entrada de la muestra y el contraelectrodo. Por efecto del intenso gradiente de campo elctrico presente, la muestra emerge del capilar de entrada en forma de un aerosol de pequeas gotas, que adquieren una carga elctrica muy elevada. Al avanzar estas gotas por la cmara de desolvatacin, llega un momento en que su tamao es tan pequeo, que las fuerzas culombianas de repulsin entre los iones con mltiple carga generados en su interior son capaces de vencer la tensin superficial, momento en que los iones escapan a la fase gaseosa denominndose a este proceso evaporacin inica. Una caracterstica de esta tcnica es que al producir una enorme abundancia de iones con carga mltiple, pueden determinarse masas moleculares de molculas muy grandes como protenas.