Flujo génico y estructura de

población

Clase 8
 Diversidad Genética

Mutación Deriva
+ -

Diversidad
+/- +
Selección Migración
 Migración fuerza homogeneizante
• Diferenciación es
inversamente proporcional a
tasa de migración

• Nivel de diferenciación se
puede utilizar para estimar
niveles históricos de flujo
génico

• Flujo génico impacta tamaño

efectivo de población

• Estimativa flujo génico

importante para genética de
conservación, forense y
evolución
 Flujo génico femenino
Y
Y mt mt
Y
mt mt Y mt
Y Y
mt
mt mt

mt mt Y mt
Y Y
Y mt Y
Y

• Sociedades matrilocales mujeres se quedan en lugar

y hombres se dispersan
• Loci mitocondriales baja diversidad dentro de
poblaciones y mucha diferenciación entre
poblaciones
• Loci cromosoma Y tendrá patrón inverso
• Poblaciones matri-locales y patri-locales
en thailandia
 Modelo Isla continente de estructura génica
q1 = (1 − m)q0 + mqm

∆q = q1 − q0
qm
= − m ( q0 − q m )

m
• Equilibrio se
q0
alcanza cuando
– qm = q o
1-m

m: fracción de población
originada por migrantes
 Equilibrio de migración
qt = (1 − m)t q0 + [1 − (1 − m) t ]qm

Equilibrio se alcanza
cuando q0 se
aproxima a qm.
 Efecto Wahlund
HE depende definición población
Sub-poblaciones:
HE = 2pq = 2(1)(0) = 2(0)(1) = 0
Sub-poblaciones juntas:
HE = 2pq = 2(0.5)(0.5) = 0.5

HE SIEMPRE aumenta cuando se

mezclan poblaciones: Efecto
Wahlund

Excepción : frecuencias alélicas

iguales en todas sub-pobs
 Cuantificar el efecto Wahlund
1
P= ∑p 2
• Para un grupo k de k
i

sub-poblaciones, con
1
frecuencias alélicas pi H = ∑ 2 pi qi
k
1
Q = ∑ qi2
k

• Para todas las 1 k

q = ∑ qi
poblaciones k i =1
 Efecto Wahlund
1
Efecto Wahlund se debe a
Q − q = ∑ qi2 − q 2
2

k
la varianza en frecuencias
1
alélicas entre poblaciones
= ∑ (qi − q ) 2
k
Relacionado a nivel de = Vq
diferenciación entre
poblaciones

Q = q + Vq
i
2
 Efecto Wahlund y Endogamia
• Ambos efectos son similares
• Se distinguen por efecto sobre diferenciación

Q = q + Vq
i
2
Q = q + fpq
2
 Estadísticas F
• Cuantifican la estructura genética poblacional
• Estima porporción de diversidad genética en la población
total (T), en las sub-poblaciones (S) y en los individuos (I)

T
S
 Estadísticas F
• Miden estructura poblacional

1 − FIT = (1 − FST )(1 − FIS )

• FST: diferenciación entre sub-poblaciones
• FIT: desviaciones de HWE en población total
• FIS: desviaciones de HWE en sub-poblaciones
 HT − H S
FST = HT es la heterocigosidad promedio
HT esperada en la población total

H S − HO HS es la heterocigosidad promedio
FIS = esperada en las sub-poblaciones
HS

HO es la heterocigosidad observada
HT − H O dentro de una sub-población
FIT =
HT
 Cálculo de FST
Sub-Población A1 A1 A1A2 A2A2 p q
1 10 20 10 0.5 0.5
2 25 10 5 0.75 0.25
Total 35 30 15 0.63 0.37

HS = (∑2piqi)/2 = ((2*0.5*0.5)+(2*0.75*0.25))/2 = 0.437

HT = 2pq = 2(0.63)(0.37) = 0.466

6.3% de la variación
genética está entre
FST = (HT-HS)/HT = poblaciones

La heterocigosidad esperada
(0.466 - 0.437)/ 0.466 = 0.063 aumentará en un 6.3%
cuando sub-poblaciones se
junten
 FST
• FST se calcula para cada
locus y se promedia entre
loci

• FST es partición de V (q)

varianza FST =
– V(q) es varianza q entre
poblaciones
pq
– Denominador es varianza
máxima que puede ocurrir
entre poblaciones
 Otras estimativas de FST: GST
• Diversidad genética de Nei
– Generalización para
múltiples loci con múltiples
HT = 1 − ∑ p i
2

alelos

m n
1
HS = ∑ (1 − ∑ pi )
– GST = DST/ HT 2

– DST = HT – HS m i =1 j =1

– HS es HE promedio para m
subpoblaciones, calculado pi es frec alélica en población total
para i alelos con frecuencia
pi.
 Otras estimativas de FST: RST
• Se utiliza para
microsatélites n
– Asume mutación
escalonada (“Stepwise”) ∑ (i a −i) 2

– Mutación alta en
microsatélites S= i =1

• ia es largo alelo a, n es n
número de loci
• S es variación
• S barra es varianza total
y Sw es varianza dentro
de poblaciones