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Fundamentos en Bioquímica

Andrea Morales Anabalón, PhD.


andreamoralesan@santotomas.cl
¿Qué es la bioquímica?
El análisis químico de la materia viva revela que los seres vivos están
formados por una serie de elementos y compuestos químicos. Los
elementos químicos que forman parte de la materia viva se denominan
bioelementos, que, en los seres vivos, forman biomoléculas, que podemos
clasificar en:

• Inorgánicas
o Agua
o Sales minerales
o Algunos gases: O2, CO2, N2, ...
• Orgánicas
o Glúcidos
o Lípidos
o Proteínas
o Ácidos Nucleicos
• Tabla 1.1. Los elementos encontrados en los organismos a

• Elementos de
• mayor formación
• de enlace covalente Número Elementos traza Número
• (todos los organismos) atómico (todos los organismos) atómico
• ___________________________________________________________________________

• H 1 Mn 25
• C 6 Fe 26
• N 7 Co 27
• O 8 Cu 29
• P 15 Zn 30
• S 16

• Iones monoatómicos Elementos traza


• (todos los organismos) (algunos organismos)

• Na+ 11 B 5
• Mg+ 12 Al 13
• Cl- 17 Si 14
• K+ 19 V 23
• Ca2+ 20 Mo 42
• I 53
__________________________________________________________________________

• a
Tomado de A. L. Lehninger, Bioquímica. Barcelona: Ediciones Omega, 1972, p. 17.

V: vanadio Si: silicio


Abundancias relativas aproximadas, en átomos por 100 átomos, de los bioelementos en
todos los organismos y en la corteza terrestre
• _________________________________________________________
• Elemento Organismos a Corteza terrestre h
• _______________________________________________________________________________________________________

• H 49 0,22
• C 25 0,19
• O 25 47
• N 0,27 <0,1
• Ca 0,073 3,5
• K 0,046 2,5
• Si 0,033 28
• Mg 0,031 2,2
• P 0,030 <0,1
• Na 0,015 2,5
• Otros Trazas 13,7
• _________________________________________________________________
• a
Tomado de E. S. Deevey, Scientific American (septiembre, 1970), p. 149
• h
Tomado de E. Frieden, Scientific American (julio, 1972), p. 52
Abundancias relativas aproximadas de los bioelementos:

Humanos v/s Corteza terrestre


CLASIFICACIÓN DE BIOELEMENTOS

PRIMARIOS SECUNDARIOS OLIGOELEMENTOS


(% del PC) (% del PC) (% del PC)
O 65 K 0,30 F 0,001
C 18 S 0,25 Cu 0,0002
H 10 Na 0,20 I 0,00004
N 3 Cl 0,15 Mn 0,00003
Ca 1,5 Mg 0,05 Zn vestigios

P 1 Fe 0,005 Co vestigios

TOTAL 98,50 TOTAL 0,955 Mo vestigios

En cualquier ser vivo se pueden encontrar alrededor de 70


elementos químicos, pero no todos, solo unos ±20-30 son
indispensables y comunes a todos los seres.
Las biomoléculas son las que naturalmente se
Biomoléculas encuentran en los sistemas biológicos donde
cumplen funciones específicas.

•H2O •Nucleótidos y ácidos nucleicos.


•Proteínas •Fosfatos, bicarbonato, nitratos, ácidos orgánicos.
•Lípidos •Gases como CO2 y O2.
•Glúcidos
Jerarquía
Molecular de la
estructura
biológica
 Niveles de organización Sistema
(aparato digestivo)
de la materia: desde
átomos hasta órganos y Órgano
(hígado)
sistemas.
Tejido
(Tejido
hepático)

Célula

Organización (hepatocito)

Jerárquica de Orgánulo
(núcleo)

Organismos
Multicelulares Molécula
(DNA)

Átomo
(carbono)
Agua

Estructura electrónica
del oxígeno

0.0965 nm H
O 104.5º

0.0965 nm
H
Propiedades biológicas
 Disolvente,de sustancias tóxicas y compuestos bipolares.
Incluso moléculas biológicas no solubles (ej. lípidos)
como dispersiones coloidales
 Reactivo, en reacciones de hidratación, hidrólisis y
oxidación-reducción
 Permite la difusión (principal transporte de muchas
sustancias nutritivas).
 Termorregulador, permitiendo la vida en una amplia
variedad de ambientes térmicos
 Interviene en el mantenimiento de la estructura celular.
Funciones del agua
Relacionadas con las propiedades
 Soporte o medio donde ocurren las reacciones
metabólicas
 Amortiguador térmico
 Transporte de sustancias
 Lubricante, amortiguadora del roce entre órganos
 Favorece la circulación y turgencia
 Da flexibilidad y elasticidad a los tejidos
 Puede intervenir como reactivo en reacciones del
metabolismo, aportando hidrogeniones o hidroxilos al
medio.
Propiedades del agua

Acción disolvente
El agua es el líquido que más sustancias disuelve (disolvente universal),
esta propiedad se debe a su Capacidad para formar puentes de hidrógeno
con otras sustancias, ya que estas se disuelven cuando interaccionan con
las moléculas polares del agua
Constante dieléctrica a 20ºC

Su elevada constante dielectrica permite


La disociación de la mayoría de las sales inorganicas en
su seno y permite que las disoluciones puedan conducir
la electricidad
Constante dieléctrica a 20ºC, D

Agua 80
Metanol 33
Etanol 24
Acetona 21.4
Benceno 2.3
Hexano 1.9
Punto Punto
fusión, ºC ebullición, ºC
Agua 0º 100º
Metanol -98º 65º
Etanol -117º 78º
n-Propanol -127º 97º
Acetona -95º 56º
Hexano -98º 69º
Benceno 6º 80º
Cloroformo -63º 61º
Calores de vaporización, DHvap (cal/g)
Agua 540
Metanol 263
Etanol 204
n-Propanol 164
Acetona 125
Hexano 101
Benceno 94
Cloroformo 59
El calor específico del agua se define como la cantidad de energía necesaria para elevar
la temperatura, en un grado Celsius.
Para evaporar un gramo de agua se precisan 540 calorías.
Punto Punto
fusión, ºC ebullición, ºC

HCl -114.24º -85.06º


H2O 0º 100º
NH3 -77.73º -33.34º
CH4 -182.47º -161.45º
Enlaces de hidrógeno en el agua

H H
O
1

H
2

O 3

H H H
O H 4
O
H O H
H
Esta asociación intermolecular que se da en el agua líquida y en el hielo,
se suele representar por una línea de puntos. En el hielo, la longitud del
enlace de hidrógeno es de 1,77 Å que se compara con la longitud del
enlace covalente H-O de 0,99 Å.

Esta estructura muestra que cada átomo de


oxígeno de las moléculas de agua que forman
una masa de hielo está unido por dos enlaces
covalentes a sendos átomos de hidrógeno y por
puente de hidrógeno a moléculas vecinas. La
energía de los puentes de hidrógeno es
aproximadamente un 1% del enlace covalente.
Esta gran diferencia de energía hace la distinción
entre el enlace covalente, que es un enlace
químico y por lo tanto muy fuerte, y el mal
llamado enlace de hidrógeno, que sólo es una
asociación física, porque es una atracción dipolo-
dipolo
Estructura del agua en los seres vivos (1)

 El agua constituye el 75 % del peso de las células.


 Los puentes de hidrógeno confieren al agua sus
extraordinarias propiedades (PF: 0 °C; PE 100 °C;
calor de vaporización: 2.26 J/g).
 Los puentes de hidrógeno tienen una vida media muy
corta (1 x 10-9 seg) (“flickering clusters”)
 En el agua líquida, cada molécula forma puentes de
hidrógeno con otras 3.4 moléculas y en el hielo con 4
moléculas.
Estructura del hielo

 Cada molécula de agua forma el


máximo de 4 puentes hidrógeno en
una red cristalina regular.
 En el agua líquida, cada molécula
forma un promedio de 3.4 puentes
hidrógeno con otras moléculas de
agua.
 La red cristalina del hielo ocupa
mas espacio que el mismo número
de moléculas de agua líquida. El
hielo es menos denso que el agua
líquida y por eso flota.
¿Por qué se derrite el
hielo?

Cuando la energía externa


o medio ambiental es
superior a la que se
encuentra en la masa de
hielo, existe mayor vibración
entre las moléculas de agua,
y, como consecuencia, se
rompe dicha red
tridimensional para dar paso
al agua líquida que se
caracteriza por su falta de
forma
EL AGUA Y LAS SALES:
COMPORTAMIENTO

EL AGUA DISUELVE LAS SALES


“INTERACCIONES ELECTROSTÁTICAS HIDRATANDO SUS IONES:
SOLVATACION
Tensión superficial
Tensión superficial

A nivel microscópico, la tensión superficial se debe a que las fuerzas que


afectan a cada molécula son diferentes en el interior del líquido y en la
superficie. Así, en el seno de un líquido cada molécula está sometida a
fuerzas de atracción que en promedio se anulan

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