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  • Biomoléculas

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    lmanconatani
    13 vistas26 páginas
    El documento proporciona una introducción a la visualización y el análisis de estructuras moleculares, incluyendo diferentes formas de representar proteínas y la información estructural almacenada en la Protein Data Bank. También describe el software WebLab y cómo puede usarse para visualizar y comparar las estructuras de la citocromo c6 y la plastocianina, identificando sus enlaces de hierro-azufre y aminoácidos ligantes.

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    de 26

    Visualización y análisis

    de
    estructuras moleculares
    barras barras

    densidad densidad
    superficie superficie
    Different graphical representations
    of the same protein
    transparencia densidad

    densidad enzima-sustrato
    estructura
    secundaria DNA-proteína

    -hélice y hoja 
    1qd6 1qbq

    1aiy 2gls
    1qne 3crx

    virus3600
    The Protein Data Bank (PDB)
    http://www.rcsb.org/pdb/index.html

    1FXK

    Archaeal Prefoldin - Chaperone


    Estructuras de
    Macromoléculas
    Software para su
    representación y análisis:

    WebLab
    Cu ligands:
    His-35 Cys-84
    His-87 Met-92

    Anabaena
    plastocyanin
    Plastocyanin
    Plastocyanin
    Plastocyanin
    Plastocyanin
    His-87

    His-37
    Met-92

    Cys-84
    Plastocyanin
    His-87

    His-37

    Met-92

    Cys-84

    Plastocyanin
    Heme ligands:
    His-19 Met-61

    Cytochrome c6
    Met-58
    Phe-61
     

    
    

    Cys-14

    Val-25 Cys-17
    Heme
    environment
    Cytochrome c6
    Cytochrome c6
    Cytochrome c6
    Cytochrome c6
    Met-61

    His-19

    Cytochrome c6
    WebLab ViewerLite

    Citocromo c6 ..\..\..\Mis documentos\webdpto\biomoleculas\estructuras\Cyt.


    msv

    Plastocianina ..\..\..\Mis documentos\webdpto\biomoleculas\estructuras\Pc.


    msv

    Acciones:
    Visualizar las dos estructuras
    Formas de representación:
    Centros redox
    Esqueleto y Cadenas laterales
    Superficie
    Ver Enlaces de H: Asp8, Asn32, Lys4 y Glu15 en Pc
    Identificación de átomos en archivo pdb

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