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Plastics in the marine environment

are reservoirs for antibiotic and metal


resistance genes

14/09/2020 Javier Castañeda Díaz


Introducción

Los plásticos están compuestos de materiales


orgánicos, sintéticos o semisintéticos.
Nanoplásticos: (<100 nm) Microplásticos: (100 nm-5 mm)

Macroplásticos: (>5 mm)


Los plásticos alojan microorganismos, entre ellos
¨bacterias¨. Clasificación de plásticos según su tamaño.
En Giro del pacifico norte se recolectaron muestras de Estudios metagenómicos para identificar
macro y micro plásticos. comunidades bacterianas.

Los datos de la existencia de genes (ARG-MRG) y composición


de comunidades microbianas fueron depositados en NCBI por Muestra de agua de mar del
Bryant et al., (2016). giro del pacifico norte.
Objetivo

Analizar la diversidad y abundancia de ARG y MRG en la microbiota de microplásticos y


macroplásticos de agua de mar obtenidos en el giro del pacifico norte.
Metodología
SARG
(SQUID Analysis
Report Generator)
Procesar los en PRINSEQ para Algoritmo Ublast para la selección de Comparación de genes de resistencia con
verificar y agrupar los datos. secuencias de genes y secuencias de ARNr la base de datos de SARG para genes ARG.
16s para la identificación genes ARG y MRG.

Programa Anova
Para el análisis de MRG se utilizo el protocolo de Gupta et al.
Determinar la abundancia y diversidad de ARG y MRG.
(2018) y se utilizó BacMet para la comparación de los datos
obtenidos.
Comparar la abundancia de genes de resistencia
Coeficiente de correlación
tanto en plásticos como en agua de mar. de Pearson y de Spearman.

Análisis de Procrustes
Analizar la relación que tienen estos genes de resistencia tanto de ARG
como de MRG con la composición microbiana de los plásticos.
Resultados
Conclusión

Los plásticos son un problema de contaminación ambiental, dentro de ambientes marinos estos plásticos
servirían como un reservorio de genes de resistencia tanto a metales pesados como a antibióticos para
diversos géneros bacterianos. Los genes que confieren resistencia a más de dos sustancias presentaron
mayor abundancia en la microbiota de plásticos y además se pudo demostrar que el tamaño de los
plásticos no influiría en la abundancia de genes de resistencia. Es necesario realizar más estudios para
poder comprender los riesgos que implicaría la presencia de plásticos en el mar como reservorios de
genes de resistencia y como estos afectarían al ambiente y a la salud humana en un futuro.

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