Pruebas post hoc

Curso: Diseño Experimental

Prof. Dairo J. Pérez Polo
Departamento de Ingeniería Agronómica y Desarrollo Rural
Facultad de Ciencias Agrícolas
Universidad de Córdoba
 Pruebas post hoc
• La prueba F de ANAVA no indica cual de los tratamientos
registró la mejor respuesta.

• Pruebas post hoc se conocen como:

- Análisis post-ANAVA
- Pruebas de medias
- Comparaciones múltiples
 Pruebas post hoc
I. Pruebas diseñadas o planificadas (a priori):
• Diferencia mínima significativa-DMS/LSD*
• Contrastes ortogonales

II. Pruebas sugeridas por los datos (a posteriori):

• Contrastes no ortogonales: Bonferroni, Schefeé
• Comparaciones múltiples: Tukey*, Duncan*, SNK, Dunnet*.
 Diferencia mínima significativa-DMS
• Experimentos balanceados:

2  CM Re sid .
DMS  t / 2, glRe sid . 
r
• Experimentos desbalanceados:

1 1
DMS  t / 2, glRe sid .  CM Re sid .   
r r 
 i j 
Siendo ri y rj las repeticiones de los tratamientos comparados
 Prueba DMS experimentos balanceados
• Ejemplo fertilización N+K de albahaca (DCA-FS):
  0,05  5%; gl Re sid . 8; CM Re sid . 4,15; r  3

2  CM Re sid . 2  4,15
DMS  t / 2, glRe sid .   t0, 025(8) 
r 3
2  4,15
DMS  2,306   3,84
3

T3-T4 2,9<3,84 ns Tratamiento Promedio Grafica de Duncan

T3-T2 26,76>3,84* T3 50,38 a T3 T4 T2 T1
T3-T1 35,09>3,84* T4 47,48 a
T4-T2 23,86>3,84*
T4-T1 32,19>3,84* T2 23,62 b
T2-T1 8,33>3,84* T1 15,29 c
Prueba DMS experimentos desbalanceados
• Ejemplo lenteja (DCA-FS): Tratamiento ri
T1 4
1 1
DMS  t / 2, glRe sid .  CM Re sid .    T2 3
r r  T3 2
 i j 
T4 3
T5 4
  0,05  5%; gl Re sid . 11; CM Re sid . 11493
1 1 1 1
DMS  t0,025(11)  11493      180,22 DMS  t0, 025(11)  11493      192,66
 4 3  3 3

1 1
DMS  t0, 025(11)  11493      204,35
4 2

1 1
DMS  t0, 025(11)  11493      166,85
4 4

1 1
DMS  t0,025(11)  11493      215,40
 2 3
 Prueba DMS experimentos desbalanceados
• Ejemplo lenteja (DCA-FS):
T4-T1=104,20<180,22 ns Tratamiento Promedio
T4-T5=226,70>180,22* T4 746,7 a
T4-T2=261,40>192,66* T1 642,5 ab
T5 520 bc
T4-T3=439,20>215,40*
T2 485,3 bcd
T1-T5=122,50<166,85 ns
T3 307,5 d
T1-T2=157,20<180,22 ns
T1-T3=335,00>204,35*
Grafica de Duncan
T5-T2=34,70<180,22 ns T4 T1 T5 T2 T3
T5-T3=212,50>204,35*
T2-T3=177,80<215,40 ns
 En resumen
1. Determinar el valor crítico
2. Ordenar los tratamientos de mayor a menor promedio
3. Determinar las diferencias entre medias de tratamientos
4. Comparar la diferencias de medias con el valor critico
5. Construir el gráfico de Duncan
6. Agrupar medias de tratamientos con sistema de letras
 Contrastes ortogonales
• Son pruebas de hipótesis entre medias de tratamientos de interés.

• Los contrastes son independientes y su número debe ser de t-1

• No se requiere que la prueba F del ANAVA sea significativa

• Un contraste se considera como una combinación lineal de medias,

dondet la suma algebraica de los coeficientes (Ci) es igual a 0.
   ci  i  c1  1  c2   2  ...  ct  t
i 1
t
 ci  0
i 1
 Contrastes ortogonales
• Comparar la media de un tratamiento A con un testigo T:
H 0 :  A  T   A  T  0

H 1 :  A  T   A   T  0
• Comparar dos sistemas de labranza (A y B) con un sistema
tradicional (T):

 A  B
H 0 : T   2 T   A   B  0
2
  B
H 1 : T  A  2 T   A   B  0
2
 Contrastes ortogonales
• Comparar tres especies nativas (A, B y C) con dos especies
mejoradas (D y E):
 A   B  C  D   E
H0 :   2 A  2  B  2C  3 D  3 E  0
3 2
   B  C  D   E
H1 : A   2 A  2  B  2 C  3 D  3 E  0
3 2
 Contrastes ortogonales
• Ejemplo genotipos de frijol:
Tratamiento Genotipo
T1 ICA-22 1,43 5,71
T2 ICA-24 1,29 5,15
T3
T3 Diacol
Diacol Calima
Calima 1,01
1,01 4,05
4,05
T4
T4 Diacol
Diacol Andina
Andina 1,38
1,38 5,52
5,52
T5
T5 Regional
Regional 1,31
1,31 5,24
5,24

- C1: Genotipos ICA vs. Genotipos Diacol:

1   2 3   4
H0 :   1   2  3   4  0
2 2
   2 3   4
H1 : 1   1   2  3   4  0
2 2
 Contrastes ortogonales
- C2: Genotipos ICA vs. Genotipo Regional:
1   2
H0 :  5  1   2  25  0
2
1   2
H1 :   5  1   2  25  0
2

- C3: Genotipos Diacol vs. Genotipo Regional:

3   4
H0 :  5  3   4  2 5  0
2
  4
H1 : 3  5  3   4  25  0
2
 Contrastes ortogonales
- C4: Genotipos mejorados vs. Genotipo Regional:
1   2  3   4
H0 :  5  1   2  3   4  45  0
4
1   2  3   4
H1 :  5  1   2  3   4  4 5  0
4
 Contrastes ortogonales
• Tabla de contrastes ortogonales:
Total de tratamiento (yi.)
Contraste T1 T2 T3 T4 T5   ci yi.  2 r  ci2 SCC F
(Ci)
5,71 5,15 4,05 5,52 5,24

C1 1 1 -1 -1 0 1,66 4·4=16 0,1040 5,20*

C2 1 1 0 0 -2 0,14 4·6=24 0,0060 0,30
C3 0 0 1 1 -2 0,83 4·6=24 0,0345 1,73
F ,1, glReCsid4 .  F0, 05,11,12  4,75
1 1 1 -4 0,28 4·20=80 0,0035 0,18

  c  y   C  (c  y )  (c  y )  ( c  y )  ( c  y )  ( c  y )
i i. 1 1 1. 2 2. 3 3. 4 4. 5 5.

  c  y   C  (1 5,71)  (1 5,15)  (1 4,05)  (1 5,52)  1,29

i i. 1

 c  1  1    1    1  4
2 2 2 2 2
1

SCC 
 c  y i i.
2


1,66
 0,1040 F
SCC

0,1040
 5,20
r c 2
i 16 CM Re sid . 0,02
 DHS de Tukey
• Experimentos balanceados:

CM Re sid .
T  q (t , glRe sid . ) 
r
• Experimentos desbalanceados:

q (t , glRe sid . ) 1 1
T   CM Re sid .   
2 r r 
 i j 

Siendo ri y rj las repeticiones de los tratamientos comparados

 DHS de Tukey experimento balanceado
• Ejemplo fertilización N+K de albahaca (DCA-FS):
CM Re sid .
T  q ( t , glRe sid . ) 
r
4,15
T0, 05  q0, 05( 4,8. )   4,53 1,18  5,33
3

T3-T4 2,9<5,33 ns Tratamiento Promedio Grafica de Duncan

T3-T2 26,76>5,33 * T3 50,38 a
T3-T1 35,09>5,33 *
T4 47,48 a
T3 T4 T2 T1
T4-T2 23,86>5,33 *
T4-T1 32,19>5,33 * T2 23,62 b
T2-T1 8,33>5,33 * T1 15,29 c
 DHS de Tukey experimento desbalanceado
• Ejemplo lenteja (DCA-FS):

q ( t , glRe sid . ) 1 1
T   CM Re sid .   
2 r r 
 i j 

q0, 05( 5,11) 1 1 q0, 05(5,11) 1 1

T0,05   11493      262,17 T0, 05   11493      245,50
2  4 3 2 4 4
q0, 05(5,11) 1 1 q0, 05( 5,11) 1 1
T0, 05   11493      300,67 T0,05   11493      243,48
2 4 2 2 3 3

q0, 05( 5,11) 1 1

T0, 05   11493      316,94
2  2 3
DHS de Tukey experimentos desbalanceados
• Ejemplo lenteja (DCA-FS):
T4-T1=104,20<262,17 ns Tratamiento Promedio
T4-T5=226,70<262,17 ns T4 746,7 a
T4-T2=261,40>280,38 ns T1 642,5 ab
T5 520 abc
T4-T3=439,20>313,48 *
T2 485,3 abc
T1-T5=122,50<242,82 ns
T3 307,5 c
T1-T2=157,20<262,17 ns
T1-T3=335,00>297,39*
Grafica de Duncan
T5-T2=34,70<262,17 ns T4 T1 T5 T2 T3
T5-T3=212,50>297,39 ns
T2-T3=177,80<313,48 ns
 Rangos múltiples de Duncan
R p  r ( p , glRe sid . )  S yi .
Siendo p, la diferencia entre pares de medias a comparar en orden ascendente o
descendente.

• Experimentos balanceados:
CM Re sid .
S yi . 
r
• Experimentos desbalanceados: reemplazar el error estándar
(S y ) por la media armónica (rh ).
i.

t
rh 
1
  r 
 i
Rangos múltiples de Duncan experimentos balanceados
• Ejemplo fertilización N+K de albahaca (DCA-FS):
CM Re sid . 4,15
S yi .    1,18
r 3

R2  r0, 05( 2,8)  S yi .  3,26 1,18  3,85

R3  r0, 05( 3,8)  S yi .  3,40 1,18  4,01
R4  r0, 05( 4,8)  S yi .  3,48 1,18  4,11

T3-T4 2,9<3,85 ns Tratamiento Promedio Grafica de Duncan

T3-T2 26,76>4,01 T3 50,38 a T3 T4 T2 T1
T3-T1 35,09>4,11
T4 47,48 a
T4-T2 23,86>3,85
T4-T1 32,19>4,01 T2 23,62 b
T2-T1 8,33>3,85 T1 15,29 c
Rangos múltiples de Duncan experimentos desbalanceados
• Ejemplo lenteja (DCA-FS):
t 5 5
rh    3
1 11111 5
  r  4 3 2 3 4 3
 i

CM Re sid . 11493
S yi .    61,90
rh 3

R2  r0, 05( 2,11)  S yi .  3,11  61,90  192,51

R3  r0,05(3,11)  S yi .  3,27  61,90  202,41

R4  r0, 05( 4,11)  S yi .  3,35  61,90  207,37
R5  r0,05(5,11)  S yi .  3,39  61,90  209,84
Rangos múltiples de Duncan experimentos desbalanceados
• Ejemplo lenteja (DCA-FS):
T4-T1=104,20<192,51 ns Tratamiento Promedio
T4-T5=226,70<202,41* T4 746,7 a

T4-T2=261,40>207,37 * T1 642,5 ab
T5 520 bc
T4-T3=439,20>209,84 *
T2 485,3 bcd
T1-T5=122,50<192,51 ns
T3 307,5d
T1-T2=157,20<202,41 ns
T1-T3=335,00>207,37*
T5-T2=34,70<192,51 ns Grafica de Duncan
T4 T1 T5 T2 T3
T5-T3=212,50>202,41 *
T2-T3=177,80<192,51 ns
 Dunnet
• Experimentos balanceados:

2  CM Re sid .
D  t (t 1, glRe sid ) 
r
• Experimentos desbalanceados:

1 1
D  t (t 1, glRe sid . )  CM Re sid .   
r r 
 j c 
Siendo rj y rc las repeticiones del tratamiento y el control comparados.
 Dunnet experimentos balanceados
• Ejemplo fertilización N+K de albahaca (DCA-FS):
2  CM Re sid .
D  t (t 1, glRe sid ) 
r
2  4,15
D  t0,05(3,8)   2,88  2,04  5,88
3

T2 T3 T4
T1 (testigo) -8,33* -35,09* -32,19*