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I INTRODUCCIÓN
Las isoenzimas son distintas formas moleculares de una misma enzima que
presentan o muestran especificidad por el mismo sustrato. Ej. Las distintas formas
moleculares de alcohol deshidrogenasa (ADH) se diferencian en la carga eléctrica neta,
en el peso molecular o en ambas simultáneamente, pero todas ellas deshidrogenan el
alcohol (sustrato) convirtiéndolo en aldehído. La principal característica de las
isoenzimas es que deben tener la misma especificidad de sustrato.
Algunos autores opinan que solamente deben considerarse como isoenzimas aquellas
formas moleculares que están presentes en el mismo órgano o tejido, que tienen un
origen genético similar y actividades catalíticas muy similares. Las peroxidasas, las
esterasas y las fosfatasas presentan distintas formas moleculares en el mismo órgano o
tejido, pero tienen una amplia especificidad de sustrato, de manera que pueden
transformar diferentes compuestos. Además, pueden tener diferentes orígenes y, por
tanto, no se las considera como verdaderas isoenzimas.
Variabilidad: Con las isoenzimas es posible al menos estudiar tres tipos de variabilidad
genética:
Variabilidad Ontogénica
También existen ejemplos en los que un mismo tejido muestra diferentes isoenzimas en
distintos momentos del desarrollo. Por ejemplo, las Peroxidasas de coleoptilo en las
primeras horas de germinación de la semilla de trigo cambian de forma dramática.
Resumen del método utilizado por Mendel (cruzamientos en los que segrega un
locus).
Obtención de la primera generación filial (F 1 con genotipo Aa) entre dos líneas puras
homocigóticas (P1 con genotipo AA y P2 con genotipo aa). Autofecundación o
cruzamiento de dos individuos de la F1 para conseguir la segunda generación filial (F2).
Sin embargo, si entre los alelos A y a existe una relación de codominancia (A=a), en la
F2 encontraremos tres fenotipos distintos (patrones isoenzimáticos) con las siguientes
proporciones: 1/4 AA, 1/2 Aa y 1/4 aa. En este último caso, a cada genotipo le
corresponde una apariencia externa distinta. Los resultados obtenidos en la F 2 nos
permiten deducir en ambos casos (dominancia completa A>a o codominancia A=a) que
el carácter estudiado (sistema enzimático) está controlado por un solo locus con dos
alelos (A y a).
1.- Un locus con dos alelos con dominancia completa (A>a) y estructura
cuaternaria monomérica.
Supongamos que el alelo activo A lleva información para el polipéptido a y que el alelo
a es un nulo. Un alelo nulo puede ser un alelo amorfo que llevaría información para un
polipéptido no funcional, o podría tratase de una delección o pérdida del gen o alelo que
codifica para el polipéptido correspondiente. Los. individuos homocigotos AA (P1)
producen cadena polipeptídica a y presentan una sola isoenzima (monómero a) los
homocigotos aa (P2) carecen de polipéptido activo y no presentan ninguna isoenzima, y
los heterocigotos Aa (F1) también sintetizan el monómero a y tienen, por tanto, una
isoenzima idéntica a la de los homocigotos AA. Los heterocigotos Aa (F1) tienen el
mismo patrón isoenzimático que los homocigotos dominantes AA. El cruzamiento de
dos heterocigotos (Aa x Aa) produce una F2 con dos clases individuos, los que tienen
una sola isoenzima (monómera) y los que carecen de isoenzima en proporciones 3/4 y
1/4, respectivamente. Esta segregación de la F 2 coincide con la esperada para un locus
con dos alelos y dominancia completa.
Aunque lo más habitual es que exista codominancia entre los alelos que codifican para
isoenzimas, sin embargo, hay ejemplos de dominancia completa, como son las
Peroxidasas, Fosfatasas alcalinas y Esterasas. Estas isoenzimas además tienen en
muchas especies vegetales estructura monomérica.
En este caso, ambos alelos (A y a) dan lugar a polipéptidos activos, el alelo A lleva
información para la cadena polipeptídica a y el alelo a para la b. Los individuos
homocigóticos AA (P1) presentan un solo monómero activo (a) y los homocigóticos aa
(P2) muestran otro monómero activo (b) con distinta migración electroforética. El
cruzamiento de ambos homocigotos produce una F1 heterocigótica (Aa) que tiene
simultáneamente las dos isoenzimas (monómeros a y b) observados por separado en los
parentales. Por tanto, en los individuos de la F1 se expresan simultáneamente los dos
alelos, existiendo codominancia.
El cruzamiento de dos heterocigotos (Aa x Aa) produce una F2 con tres clases
individuos, 1/4 AA con una sola isoenzima (monómero a), 1/2 Aa con dos isoenzimas
(monómeros a y b) y 1/4 aa con otra isoenzima de menor migración (monómero b). En
este caso, los dos homocigotos presentan apariencias externas diferentes a las de los
heterocigotos. La segregación obtenida en la F 2 se corresponde con la de un locus con
dos alelos codominantes.
3.- Un locus con dos alelos codominantes (A=a) y estructura cuaternaria dimérica.
Resumen del método utilizado por Mendel (cruzamientos en los que segregan dos
loci).
Obtención de la primera generación filial (F 1 con genotipo AaBb) entre dos líneas puras
homocigóticas (P1 con genotipo AABB y P2 con genotipo aabb). Autofecundación o
cruzamiento de dos individuos de la F1 para conseguir la segunda generación filial (F2).
Observando la apariencia externa (fenotipo) de los individuos de la F 1 (AaBb) es posible
deducir las relaciones de dominancia o codominancia de los alelos A y a y los alelos B y
b que controlan los caracteres estudiados. Si el fenotipo (patrón isoenzimático) de la F1
es uniforme e igual al de uno de los parentales (P 1 o P2) se trata de un caso de
dominancia, si el alelo A domina sobre a (A>a) y el B sobre el b (B>b) la F1 tiene el
mismo aspecto que el parental P1(Primera Ley de Mendel o Principio de la
Uniformidad).
Si en los individuos de la F1 se expresan al mismo tiempo los alelos A y a y los alelos B
y b, se dice que existe codominancia en ambos loci (A=a, B=b) y su fenotipo (patrón
isoenzimático) es diferente al de los dos parentales (P1 y P2).
En la segunda generación filial (F2) se observan individuos de nueve genotipos distintos
en las siguientes proporciones: 1/16 AABB + 2/16 AABb + 1/16 Aabb + 2/16 AaBB +
4/16 AaBb + 2/16 Aabb + 1/16 aaBB + 2/16 aaBb + 1/16 aabb. Estas proporciones se
obtienen de la combinación independiente de lo que le sucede a cada locus por separado
(1/4 AA + 1/2 Aa + 1/4 aa) X (1/4 BB + 1/2 Bb + 1/4 bb). Cuando existe dominancia
completa en ambos loci (A>a, B>b) en la F2 se observan cuatro fenotipos diferentes con
las siguientes proporciones: 9/16 AB, 3/16 Ab, 3/16 aB y 1/16 ab. En este caso no es
posible distinguir a los homocigotos dominantes de los heterocigotos en cada locus.
Esta segregación fenotípica también procede de la combinación independiente de lo que
le sucede a cada locus por separado, (3/4 A + 1/4 a) X (3/4 B + 1/4 b). (Tercera Ley de
Mendel o Principio de la Combinación Independiente).
Sin embargo, si entre los alelos A y a existe una relación de codominancia (A=a), y
entre los alelos B y b también (B=b), en la F2 encontraremos nueve fenotipos distintos
(patrones isoenzimáticos), tantos como genotipos diferentes y con las mismas
proporciones: 1/16 AABB + 2/16 AABb + 1/16 Aabb + 2/16 AaBB + 4/16 AaBb + 2/16
Aabb + 1/16 aaBB + 2/16 aaBb + 1/16 aabb . En este último caso, a cada genotipo le
corresponde una apariencia externa distinta.
5.- Dos loci independientes con dos alelos con dominancia completa en cada locus
(A>a) (B>b) y estructura cuaternaria monomérica.
El cruzamiento de dos diheterocigotos AaBb x AaBb origina una F2 formada por cuatro
clases de descendientes. Se observan individuos con dos isoenzimas o monómeros
(monómero a y monómero b) de igual aspecto que los individuos de la F 1 (AaBb),
dichos individuos tienen al menos un alelo A y otro B, siendo, por tanto, su genotipo A-
B-. También, se obtienen en esta F 2 individuos que poseen solamente el monómero a y
que tienen al menos un alelo A (genotipo A-bb) e individuos que solamente poseen una
isoenzima (el monómero b) teniendo al menos un alelo B (genotipo aaB-). Por ultimo,
en esta F2 se obtienen también individuos que no presentan ninguna isoenzima o
monómero, dichos individuos son homocigotos para los dos alelos nulos (aabb). Si
tenemos en cuenta que los loci A, a y B, b son independientes, es decir, que se
encuentran en cromosomas diferentes o en el mismo cromosoma, pero muy alejados
entre si, las proporciones con las que se observan estos cuatro tipos de descendientes en
la F2 es la siguiente: 9/16 A-B-, 3/16 A-bb, 3/16 aaB- y 1/16 aabb. Se cumple la
segregación correspondiente a la 3ª ley de Mendel o Principio de la Combinación
Independiente 9 AB: 3 Ab: 3 aB: 1 ab.
Es importante hacer notar que los patrones isoenzimáticos observados en este caso son
idénticos a los descritos para el caso de un locus con dos alelos codominantes (A=a) y
estructura cuaternaria monomérica. La única diferencia es que cuando se trata de dos
loci (A,a y B,b) con dominancia completa (A>a y B>b), en la F2 aparecen individuos que
carecen simultáneamente de las dos isoenzimas o monómeros a y b. Por consiguiente,
para decidir si se trata de un locus con dos alelos codominantes y estructura cuaternaria
monomérica o si se trata de dos loci con dominancia completa y estructura también
monomérica, es necesario observar en la F 2 individuos que carezcan simultáneamente
de ambos monómeros, es decir, individuos sin isoenzimas. Cuando los loci analizados
son independientes, es relativamente fácil encontrar en la F 2 individuos sin los dos
monómeros, ya que la proporción esperada es 1/16. Sin embargo, si ambos loci están
situados sobre el mismo cromosoma y muy cerca (están estrechamente ligados), la
probabilidad de obtener en la F2 individuos que carezcan de ambas isoenzimas o
monómeros es muy baja. De manera que para una distancia genética de 10 Morgan
(Fracción de recombinación r=0,1) y un total de 200 descendientes (N=200), solamente
1/4 p2 N carecerán de ambos monómeros, es decir, ni si quiera se espera un individuo
del tipo aabb, ya que 1/4 x (0,1) 2 x 200 = 0,5. En tal situación (cuando no observamos
individuos aabb), interpretaríamos que las isoenzimas estudiadas son monómeros
controlados por un solo locus con dos alelos activos y codominantes.
6.- Dos loci independientes con dos alelos codominantes cada locus (A=a y B=>b) y
estructura cuaternaria monomérica.
En este caso, los alelos A y a dan lugar a polipéptidos activos, el alelo A lleva
información para la cadena polipeptídica a y el alelo a para la b. Los alelos B y b llevan
información para los polipéptidos activos d y g, respectivamente. Supondremos, para
facilitar la comprensión, que todos los monómeros presentan distinta migración, y que
los monómeros a y b muestran una mayor migración electroforética que los d y g. Los
homocigotos AABB tienen las isoenzimas o monómeros a y d, mientras que los
homocigotos aabb poseen los monómeros b y g. El cruzamiento de ambos homocigotos
(AABB x aabb) origina una F1 diheterocigótica que presenta simultáneamente las cuatro
isoenzimas o monómeros (a, b, d y g). Por tanto, en ambos loci los alelos son
codominantes (A=a y B=b), ya que en el heterocigoto se expresan simultáneamente
ambos alelos. Una de las características de la codominancia es que a cada genotipo le
corresponde un fenotipo o apariencia externa distinta, de manera que los homocigotos
son distintos de los heterocigotos.
El cruzamiento de dos diheterocigotos (AaBb x AaBb) da lugar a una F2 constituida por
nueve clases de individuos diferentes, tantas como genotipos distintos. Los nueve
genotipos diferentes de esta F2 se obtienen combinando de forma independiente lo que
le sucede a cada locus por separado, de manera, que en el locus A,a se observan tres
clases de individuos en las proporciones 1/4 AA + 1/2 Aa + 1/4 aa; en el locus B,b se
obtienen también tres clases de individuos en las proporciones 1/4 BB + 1/2 Bb + 1/4
bb. La combinación independiente de ambos loci (1/4 AA + 1/2 Aa + 1/4 aa) X (1/4 BB
+ 1/2 Bb + 1/4 bb) da como resultado la siguiente segregación en la F 2: 1/16 AABB +
2/16 AABb + 1/16 Aabb + 2/16 AaBB + 4/16 AaBb + 2/16 Aabb + 1/16 aaBB + 2/16
aaBb + 1/16 aabb. En esta F2, como se puede observar, existen nueve fenotipos
diferentes correspondientes a los nueve genotipos anteriormente mencionados. Además,
los individuos de la F2 muestran dos, tres o cuatro monómeros. Los homocigotos para
ambos loci presentan dos isoenzimas: a y d (AABB), a y g (AAbb), b y d (aaBB) o b y g
(aabb). Los diheterocigotos tienen cuatro isoenzimas o monómeros, como los
individuos de la F1: a, b, d y g. Los homocigotos para un locus y heterocigotos para el
otro locus presentan tres monómeros: AABb (a, d y g), aaBb (b, d y g), AaBB (a, b y d)
y Aabb (a, b y g).
Hasta el momento, hemos considerado que en cada uno de los loci analizados existían
solamente dos alternativas o alelos. Sin embargo, cuando se llevan a cabo análisis
isoenzimáticos en poblaciones es frecuente encontrar que en un locus existen más de
dos alelos o formas alternativas. Una serie alélica tiene lugar siempre que existen más
de dos alelos en un mismo locus, el ejemplo típico de serie alélica es el sistema ABO de
grupos sanguíneos en la especie humana.
El número total de genotipos diferentes que se pueden encontrar en una población para
n alelos es:
un locus en el que existe
CR = Combinaciones con repetición
CR = n(n+1)
II
OBJETIVOS
Aplicar los conocimientos de las leyes de Mendel en la interpretación de los
marcadores moleculares isoenzímaticos.
3 ADH PGM
Para averiguar las relaciones de dominancia o codominancia entre los alelos
de los cuatro loci que codifican para cuatro isoenzimas diferentes, Alcohol
deshidrogenasa (ADH), Fosfoglucosa mutasa (PGM), Catalasa (CAT) y
Peroxidasa (PER) en centeno, se han cruzado dos plantas homocigóticas (P1
x P2) que presentaban isoenzimas distintas. Las plantas de la F1 fueron
uniformes y mostraron los patrones isoenzimáticos indicados a la derecha.
Indique las relaciones de dominancia o codominancia entre los alelos de
ADH, PGM, CAT Y PER. P1 F1 P2 P1 F1 P2
Indique la estructura cuaternaria.
CAT PER
P1 F1 P2 P1 F1 P2
4. A C O 50 Plantas de la F2
El cruzamiento de dos
plantas homocigóticas
(P1 x P2) para Aconitasa
(ACO) ha dado lugar a
una F1 uniforme. La
autofecundación de la F1
ha originado una F2 P1
Gel Nº 1: 25 primeras plantas de la F2
compuesta por 50 F1 P2
plantas. Averigüe:
Las interacciones entre
alelos, el nº de loci y la
estructura cuaternaria
para aconitasa.
La segregación TGel Nº 2: 25 últimas plantas de la F2
observada y esperada.
Comprobación
mediante c2.
5. CAT
El cruzamiento de dos
plantas homocigóticas (P1 x
P2) para Catalasa (CAT)
originó una F1 uniforme. La
autofecundación de la F1 dio
lugar a una F2 formada por P1 F1 P2 Gel Nº1: 25 plantas de la F2
25 plantas. Averigüe:
El nº de loci, interacciones
entre alelos y estructura
cuaternaria.
La segregación observada
y esperada.
Comprobación mediante
c2.
6 ADH
El cruzamiento
de dos plantas
Gel Nº1: Plantas de la 1 a la 25
homocigóticas
(P1 x P2) para
Alcohol
deshidrogenasa
(ADH) ha dado P1 F1 P2
lugar a una F1 Gel Nº2: Plantas de la 26 a la 50
uniforme. La
autofecundació
n de la F1 ha
originado una
F2 compuesta
por 50 plantas.
Averigüe:
El nº de loci,
interacciones
entre alelos y
estructura
cuaternaria.
La segregación
observada y
esperada.
Comprobación
mediante c2.
7 PGD 50 Plantas de la F2
El cruzamiento de
dos plantas
homocigóticas (P1 x
P2) para 6-
Fosfogluconato
deshidrogenasa
(PGD) ha dado lugar
a una F1 uniforme. La Gel Nº 1: 25 primeras plantas de la F2
autofecundación de la
F1 ha originado una
F2 compuesta por 50
plantas. Averigüe:
El nº de loci,
interacciones entre
alelos y estructura
cuaternaria. Gel Nº 2: 25 últimas plantas de la F2
Segregación
observada y
esperada.
Comprobación
mediante c2.
8 PER 100 Plantas de la F2
El cruzamiento de
dos plantas
homocigóticas (P1 x
P2) para Peroxidasa
(PER) originó una P1 P2 Gel Nº 1: Plantas de la 1 a la 25
F1 uniforme. La F1
autofecundación de
la F1 dio lugar a una Gel Nº 2: Plantas de la 26 a la 50
F2 formada por 100
plantas. Averigüe:
El nº de loci, las
Gel Nº 3: Plantas de la 27 a la 75
interacciones entre
alelos y la
estructura
cuaternaria de las Gel Nº 4: Plantas de la 76 a la 100
isoenzimas.
La segregación
observada y
esperada.
Comprobación
mediante c2.
9 ACO
La autofecundación
de una F1
heterocigótica para
Aconitasa (ACO),
procedente del P1 F1 P2 Gel Nº 1: Plantas de la 1 a la 25
cruzamiento de dos
plantas
homocigóticas (P1 X
P2) dio 100
descendientes.
Averigüe:
El nº de loci, las Gel Nº 2: Plantas de la 26 a la 50
interacciones entre
alelos, la estructura
cuaternaria de las
isoenzimas de
Aconitasa, y si
existe o no
Gel Nº 3: Plantas de la 27 a la 75
ligamiento.
La segregación
observada y
esperada para cada
locus por separado
y en conjunto.
Comprobación Gel Nº 4: Plantas de la 76 a la 100
mediante c2.
PRACTICA Nº 14
I. INTRODUCCIÓN
ADN circular: el número de fragmentos que se generan tras una digestión, es el mismo
que el número de dianas presentes en su secuencia para esa enzima. Cuando una enzima
corta una vez sólo, nos revela el tamaño del ADN circular. La suma del tamaño de los
fragmentos debe de coincidir con el tamaño total del ADN digerido. Como antes, hay
que tener en cuenta que el número de fragmentos no es siempre coincidente con el
número de bandas que aparecen en un gel de agarosa, ya que puede haber fragmentos de
igual tamaño que migran juntos. En cualquier caso, la información obtenida mediante
electroforesis no nos revela el orden ni la localización de las dianas de restricción. Para
poder realizar un mapa, se ha de cortar una muestra del ADN a mapear con una enzima
de restricción, una segunda muestra del mismo ADN con otra enzima diferente y una
tercera muestra de dicho ADN con las dos enzimas simultáneamente (digestión doble).
Esta tercera digestión nos da la clave para determinar el orden de las dianas para ambas
enzimas de restricción.
III. METODOLOGÍA
Para resolver los problemas de aplicación, es necesario recurrir al conocimiento
teórico para poder dar una solución concreta a los problemas genético-reales
recopilados.
Problemas modelo: Un gen clonado muestra el siguiente mapa de restricción para las
enzimas EcoRI y HindIII:
a) Dibujar los patrones de los fragmentos de ADN esperados con cada enzima al
separar los fragmentos mediante electroforesis en gel de agarosa. Hacer lo mismo
para el caso de la digestión doble.
Para EcoRI el gen tiene dos dianas, por lo que será cortado en tres fragmentos de
tamaños 4Kb+3Kb+1Kb. Para HindIII también tiene dos dianas, pero en diferentes
posiciones, por lo que generará tres fragmentos pero de tamaños 4.5Kb+2Kb+1.5Kb.
Cuando utilizamos las dos enzimas para digerir el gen, obtendremos 5 fragmentos
diferentes (existen 4 puntos de corte, generando fragmentos de diana a diana de
ambas enzimas), aunque dos de ellos presentan el mismo tamaño (1Kb), por lo que
los observaremos como una única banda en el gel de agarosa. Los tamaños serán, por
tanto, de 3.5Kb+2Kb+1(x2) Kb+0.5Kb (ver figura).
a) Dibujar el patrón esperado para una copia mutante del gen que ha perdido el
primero de los cortes de EcoRI
Si la copia mutante del gen pierde una diana para EcoRI, al cortar con esta enzima,
obtendremos solo dos fragmentos, siendo uno de ellos, la suma de los dos entre los
cuales se encontraba la diana perdida para EcoRI, 7Kb+1Kb. Para el corte con
HindIII el patrón de bandas no se vería afectado, pero sí nuevamente para la
digestión doble, ya que hay un corte menos, 4,5Kb+2Kb+1Kb+0,5Kb (ver figura).
b) Dibujar el patrón esperado para una copia mutante del gen en la que ha aparecido
una nueva diana para HindIII en el centro del fragmento de 2Kb.
IV.1. Se ha cortado con PstI un plásmido bacteriano circular que contiene un gen de
resistencia a la ampicilina. Tras la electroforesis se observa una banda de 20 Kb.
¿Qué deducirías de los resultados que se plantean a continuación?
a) Con EcoRI, el plásmido se corta en dos fragmentos: uno de 11.5 Kb y otro de 8.5
Kb
b) La digestión PstI+EcoRI genera tres fragmentos de: 6 Kb, 5.5 Kb y 8.5 Kb
c) El ADN del plásmido cortado con PstI se ha mezclado y ligado con fragmentos de
ADN cortados con PstI. Todos los clones recombinantes son resistentes a la
ampicilina.
d) Tras cortar uno de los clones recombinantes con PstI se obtienen dos fragmentos:
20Kb y 6 Kb.
e) El clon anterior se corta con EcoRI y se obtienen 10 Kb, 8.5 Kb y 7.5 Kb.
IV.2. Se conoce un gen autosómico con tres alelos La, Lb y l que se diferencian en una
diana para la enzima de restricción PstI (↓ sitio de corte):
Diseñar un experimento para diferenciar los genotipos de los diferentes individuos
que pudieren existir en una población si utilizamos como sonda el fragmento
homólogo de ADN señalado en el esquema.
4.3 En una población de centeno se ha aislado un gen de secuencia única. Se extrae el
ADN genómico de 10 plantas diferentes de la población, se digiere con Eco RI; los
segmentos producidos se separan mediante electroforesis en gel de agarosa y se
transfiere mediante Southern. Posteriormente, se hibrida esta membrana usando
como sonda radioactiva el gen de secuencia única de centeno clonado en un vector
bacteriano. Por último se realiza una autoradiografía y se revela
4.4. El siguiente pedigrí representa a una familia con alguno de sus miembros afectado por
una enfermedad autosómica dominante. El ADN de todos los individuos fue digerido con
la enzima PstI y sometido a electroforesis en gel de agarosa. Se analiza este ADN mediante
hibridación tipo Southern con una sonda que corresponde a un fragmento de ADN
humano clonado en un plásmido bacteriano. Los resultados del revelado de la hibridación
se muestran junto al pedigrí.
4.6 Dos hombres se disputan la paternidad de un niño. Los forences deciden utilizar el
método de la huella de ADN (VNTR) para resolver el caso, analizando el ADN de
la madre (M), del hijo (H) y de los posibles padres (P1 y P2). Los resultados
obtenidos en el esquema a) ¿Quién es el padre? b) Atribuya el mayor número
posible de bandas al padre y a la madre. c)¿Existe alguna banda que no sea posible
atribuida al padre o a la madre? Explique este tipo de bandas.