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Unidad 1.

Fundamentos de la microbiología
- Microorganismos y microbiología
- Estructura y funciones de las células microbianas

Estructura de la célula procariótica


“Buscar diferencias entrena la observación,
buscar similitudes entrena el entendimiento”
Jorge Wagensberg
Árbol filogenético Universal

Procariotas Eucariotas
Bacteria Archaea Eukarya
Animals
Entamoebae Slime
Green nonsulfur molds
bacteria Euryarchaeota
Fungi
Mitochondrion Methanosarcina
Methano- Extreme Plants
Gram- Crenarchaeota bacterium
positive
halophiles
Proteobacteria Thermoproteus
bacteria Methano- Ciliates
Chloroplast Pyrodictium coccus Thermoplasma
Cyanobacteria Thermococcus
Flavobacteria Flagellates
Marine Pyrolobus
Crenarchaeota Methanopyrus
Trichomonads

Thermotoga

Thermodesulfobacterium Microsporidia

Aquifex Diplomonads
(Giardia)
Citoplasma Nucleóide Ribosomas
Plásmido

Membrana
Pared celular citoplásmica
Procariota
Membrana Retículo
citoplásmica endoplásmico

Ribosomas
Núcleo Golgi

Nucleolo Mitocondria
Membrana
nuclear Cloroplasto
Citoplasma

Eucariota
La forma celular no es un buen indicador de otras características
Prokaryotes Eukaryote

Cytoplasmic
membrane Nucleus

Cell
wall
Mitochondrion
Bacteria Archaea Eukarya

Heliobacterium domesticaldum
Methanopyrus kandleri
Saccharomyces cerevisiae
Forma:
- Coco: esférica u ovoide (Streptococcus,
Lactococcus)
- Bacilo: cilíndrica o de bastoncillo (Bacillus)
- Hifas: filamentos largos (Actinomicetos)
- Bacilos largos retorcidos: espirilos y
espiroquetas

Cocos, bacilos y espiroquetas Bacterias filamentosas


(Sphaerotilus natans)
Tamaños de virus, procariota y eucariota

Yeast cell (Eukarya)


~8 µm in diameter
Virus

Cell of
Escherichia
coli (Bacteria)
~1 × 3 µm
Nucleus
Tamaño:
- De 0,3 μm (Mycoplasma) a 7-8 μm
(Oscillatoria) de diámetro
- Existen bacterias tan grandes como
células eucariotas
- E. coli: 1,1 a 1,3 μm de ancho y de 2 a
6 μm de largo)
Epulopiscium fishelsoni
(600 μm x 75 μm )

Thiomargarita namibiensis
(400 μm diámetro)
Estructura de la célula procariótica
Membrana plasmática
Membrana plasmática:
 Separa el interior celular del exterior.
 Si la membrana se rompe, la célula muere.

1. Permeability Barrier—Prevents leakage and functions as a


gateway for transport of nutrients into
and out of the cell

2. Protein Anchor—Site of many proteins involved in transport,


bioenergetics, and chemotaxis

3. Energy Conservation—Site of generation and use of the


proton motive force
Membrana plasmática:
Fosfolípidos. Estructura básica (procariotas y eucariotas)
Contacto con el entorno

Régión hidrofílica

Región hidrofóbica Ácidos grasos

Región hidrofílica

Glicerol
Fosfato

Glicerofosfatos

Ácidos grasos 6-8 nm


grosor
Membrana plasmática:
Formada por lípidos y proteínas
No es una estructura rígida, es viscosa.
Las proteínas se pueden desplazar en la membrana

Out
Phospholipids
Hydrophilic
groups
6–8 nm
Hydrophobic
groups

In

Phospholipid
Integral molecule
membrane
proteins
Membrana plasmática:
Estructuralmente compleja: modelo del mosaico fluido (Singer y Nicholson)
> Proteínas periféricas: 20-30% del total
Solubles en soluciones acuosas
Algunas son lipoproteínas
> Proteínas integrales: 70-80% del total
Insolubles en soluciones acuosas
Anfipáticas
Pueden llevar unidos hidratos de carbono

Estabilidad por puentes de H e interacciones hidrofóbicas. Out


Phospholipids
Hydrophilic
groups
6–8 nm
Hydrophobic
groups

In

Phospholipid
Integral molecule
membrane
proteins
Membrana plasmática:
Estructura general de los lípidos de membrana en Bacteria, Eukarya y Archaea.

Isopreno, estructura básica


Ester de las cadenas laterales
Ether
hidrofóbicas en los lípidos
de Archaea

Bacteria Archaea
Eukarya
Membrana plasmática en arqueas:
Fitanil: polímero de isopreno 20C
Enlace éter fitanil Bifitanil: polímero de isopreno 40C

¿Qué características tendrán las


membranas formadas por bifitanil?
CH3
Dieter de groups
glicerol Unidad de isopreno

Bifitanil

Tetraeter de glicerol
Membrana plasmática en arqueas:
Las monocapas lipídicas de arqueas son muy resistentes a la disgregación.
Este tipo de membrana aparece entre las Archaea hipertermófilas que
crecen a altas temperaturas

Phosphate
Glycerol
Phytanyl
Membrane
protein
Biphytanyl

Lipid bilayer Lipid monolayer


Membrana plasmática:
Agentes que refuerzan las membranas: Esteroles y Hopanoides

 Esteroles: Ausentes de casi todas las membranas de procariotas (excepto bacterias metanótrofas y
micoplasmas). Dependiendo del tipo celular, los esteroles pueden suponer del 5 al 25% del total de
los lípidos de membrana de los eucariotas. Son moléculas planas que dan rigidez a las membranas.

 Hopanoides: moléculas similares a los esteroles, pero están presentes en muchas especies del
dominio Bacteria. Hasta ahora no se han encontrado hopanoides en el dominio Archaea.

Colesterol, un esterol típico Diplopteno, un hopanoide


Función de la membrana plasmática:
Barrera de permeabilidad: evita la pérdida de sustancias del interior y la
entrada indiscriminada.

100.000 X
Función de la membrana plasmática:
Muchas sustancias TIENEN que ser TRANSPORTADAS al interior de la célula

PROTEÍNAS TRANSPORTADORAS

Saturables: Si la concentración de
sustrato es lo suficientemente alta
como para saturar al transportador, la
velocidad de entrada alcanza un Transporter saturated
máximo y la adición de más sustrato with substrate

Rate of solute entry


no aumenta la velocidad.

Específicas: Muchas proteínas


transportadoras sólo reaccionan con Transport
un tipo único de moléculas.

Reguladas: El equipamiento
específico de transportadores Simple diffusion
presentes en la membrana depende
de los nutrientes presentes en el
medio y de su concentración.
External concentration of solute
Clases de sistemas de transporte de membrana:
1. Transporte simple
2. Translocación de grupo Simple transport: Out In
3. Sistema ABC Driven by the energy
Uniporte in the proton motive
force
Antiporte
Simporte

Transported
substance

Group translocation:
Chemical modification
of the transported
substance driven by
phosphoenolpyruvate

1
2

ABC transporter: 3
Periplasmic binding
proteins are involved
and energy comes
from ATP
1.Transporte simple

Out

In

Uniporter Antiporter Symporter


1.Transporte simple Lac permease
(a symporter)

Sodium–proton antiporter

Phosphate symporter

Potassium uniporter

Sulfate symporter

Out In
2. Translocación de grupo.

In Out
Non-specific Specific
components components
Cytoplasmic
membrane
Enz HPr Enz Enz Enz
I IIa IIb IIC
Pyruvate Glucose
Direction of P transfer
Glucose 6–P
Direction of glucose
transport
3. Sistemas ABC Peptidoglycan

Periplasm Periplasmic–
binding protein
Out
Transported
substance

Membrane-
spanning
transporter

In
ATP–hydrolyzing
protein
Estructura de la célula procariótica
Paredes celulares de procariotas
La pared celular en Bacteria
Gram positivas: Gram–positive Gram–negative
se tiñen con cristal Peptidoglycan Peptidoglycan
violeta+etanol Cytoplasm Cytoplasm
Membrane Cytoplasmic membrane
Periplasm
Gram negativas:
Outer membrane
no se tiñen con cristal (Iipopolysaccharide and protein)
violeta+etanol Outer membrane
Cytoplasmic
Peptidoglycan membrane
Cytoplasmic Peptidoglycan
membrane
La pared celular en Bacteria
Peptidoglicano
Solo presente en Bacteria. El N-acetilmurámico y el DAP no han sido encontrados en
Archaea o Eukarya
DAP aparece en Bacterias Gram negativas y algunas Gram positivas
N-Acetylglucosamine (G) N-Acetylmuramic acid (M)
En la mayoría de los cocos Gram positivos
hay lisina en lugar de DAP.

Otra peculiaridad del peptidoglicano es la


presencia de D-aminoácidos.

Hay numerosos peptidoglicanos descritos


(>100), pero NAG y NAM son siempre N-Acetyl
constantes, con enlace beta-(1,4). group

Lysozyme-
Hay más variaciones en los aminoácidos. sensitive
Peptide bond
cross-links
L-Alanine

D-Glutamic acid

Meso-diamino-
pimelic acid

D-Alanine
Ácido diaminopimélico
Similar a lisina

Diaminopimelic Lysine
acid
Peptidoglicano en Escherichia coli
y Staphylococcus aureus Glycan backbone
Puente de pentaglicinas ausente en Interbridge
Gram negativos.
Los Gram positivos pueden tener Peptides
hasta 25 capas de peptidoglicano
apiladas.

Escherichia coli
(gram-negative)

Staphylococcus aureus
(gram-positive)
Peptide bonds

Glycosidic bonds
Ácidos teicoicos y estructura global de la pared celular grampositiva

Estructura del ácido ribitolteicoico y diagrama global de la pared celular grampositiva

El ácido teicoico es un polímero de ribitol. Están unidos covalentemente al ácido murámico del peptidoglicano

Wall-associated
protein Teichoic acid Lipoteichoic
acid

Peptidoglycan

Ribitol Cytoplasmic
membrane
Protoplastos y su formación
La lisozima rompe los enlaces glicosídicos del peptidoglicano.
Algunos antibióticos interfieren con la síntesis del peptidoglicano y consiguen un efecto similar.

Wall Lysozyme H2O enters Lysis


Membrane digests wall

Protoplastos en soluciones H2O enters H2O enters Low solute solution


hipotónicas o isotónicas.

Lysozyme
digests wall

Protoplast

Isotonic solute solution


La pared celular Gram negativa
Lipopolisacárido, lípido A, fosfolípidos, porinas y lipoporoteína en la membrana externa.

Porina: hace que la membrana externa de las Gram negativas sea permeable a pequeñas moléculas.
Estructura del lipopolisacárido de bacterias gram negativas
En bacterias Gram negativas, el peptidoglicano sólo supone el 10% de la pared celular

La mayor parte de la pared celular está representada por la membrana externa.

Esta bicapa lipídica (asimétrica) está compuesta por fosfolípidos, proteínas y polisacáridos.

Los lípidos y los polisacáridos están unidos en la membrana externa y forman la capa de lipopolisacárido o LPS.

O-specific polysaccharide Core polysaccharide Lipid A

KDO: cetodeoxioctonato GluNac: N-acetilglucosamina


Hep: heptosa GlcN: glucosamina
Glu: glucosa
Gal: galactosa
Fosfolípidos en E. coli
≈70% ≈20% ≈5-10%
Pared de Escherichia coli observada por microscopía electrónica
Micrografía electrónica de transmisión

Outer membrane
Periplasm

Cytoplasmic
membrane
Paredes celulares de arqueas
Pseudomureína en lugar de peptidoglicano
¿Qué diferencias se ven respecto a la de Bacteria? Lysozyme-insensitive N-Acetyl
group
β(1,3)

N-Acetylglucosamine N-Acetyltalosaminuronic acid

Peptide
cross-links
Capa S

Es una capa superficial paracristalina formada por proteínas o glicoproteínas

Es el tipo de pared más común en Archaea

Es capaz de soportar bastante fuerza osmótica

También se puede encontrar en algunas especies de Bacteria


Estructura de la célula procariótica
Otras estructuras
superficiales
Cápsulas o capas mucosas bacterianas
Materiales de secreción viscosos (polisacáridos o
proteínas), que no se consideran parte de la
pared celular porque no aportan ninguna
resistencia estructural significativa.

Función: fijación a superficies sólidas, resistencia


a fagocitosis, formación de biopelículas…

Cell Capsule
Fimbrias y pelos (pili)
Son estructuras filamentosas formadas por proteínas que se prolongan desde la
superficie celular y pueden desempeñar varias funciones
Fimbrias: ayudan a los microorganismos a fijarse sobre superficies (aparecen en
patógenos humanos como Salmonella, Neisseria gonorrhoeae y Bordetella
pertussis.
Pili: similares a las fimbrias pero más largos y uno o unos pocos sobre la superficie
celular. Además de unirse a superficies, participan en conjugación (intercambio
genético entra bacterias)

Flagella

Fimbriae
Pili
En esta micrografía electrónica, el pilus está cubierto con virus, por lo que es más
fácilmente observable.

Virus-
covered
pilus
Estructura de la célula procariótica
Inclusiones celulares
Polímeros carbonados de reserva:
ácido poli-beta-hidroxibutírico
Es una de las inclusiones más comunes en
procariotas. Polímeros de enlaces éster
Forman gránulos. Los polímeros (PHA, poli-beta-
hidroxialcanoatos), sirven de reserva de
β-carbon
carbono y de energía. Aparece en bacterias y
arqueas.

Estos polímeros son plásticos

Poly-β-
hydroxybutyrate
Polifosfato y azufre
Se acumulan al ser, en muchas ocasiones, nutrientes limitantes

Sulfur
Magnetosomas
Inclusiones de mineral férrico (magnetita)
Vesículas de gas
Aparecen en muchas cianobacterias
Vesículas de gas
Proteínas de las vesículas de gas y su estructura

GvpA

4.6 nm
GvpC
Estructura de la célula procariótica
Endosporas
Endosporas
Células diferenciadas, resistentes a calor y agentes físicos/químicos, funcionan como estructuras de
supervivencia.
Las bacterias que forman endosporas se encuentran habitualmente en el suelo y los géneros
endosporulantes mejor estudiados son Bacillus y Clostridium

Se han revivido esporas de más de 25 millones de años


Endosporas
Célula vegetativa -> endospora -> célula vegetativa

Vegetative cell
Germination

Developing spore

Sporulating cell

Mature spore
Endosporas
Estructura de la endospora bacteriana (Bacillus)

Exospora
Cubierta de la espora
Pared cortical
Corteza
DNA
Ácido dipicolínico
Se encuentra en el núcleo de todas las endosporas estudiadas
Es capaz de unirse a calcio. Suponen alrededor del 10% del peso seco de la endospora.
Reducen la disponibilidad de agua y se intercalan en el DNA, estabilizando de este modo el DNA
frente a la desnaturalización por calor

SASPs (Small acid-soluble proteins)


Función de condensación del DNA en la endospora, contribuye a la resistencia a UV y otros daños
en el DNA. Durante la germinación, estas proteínas han de ser eliminadas.

Carboxylic acid
groups
Estructura de la célula procariótica
Movimiento microbiano
Movilidad por deslizamiento
Existen bacterias que se mueven por deslizamiento en superficies sólidas
Movilidad por deslizamiento
El movimiento de las proteínas implicadas y el de la célula son inversos
In

Cytoplasmic
membrane

Peptidoglycan

Outer
membrane

Out
Movement of outer Surface
Movement of cell membrane proteins
Flagelos en bacteria
Apéndices largos y finos que se encuentran libres por un extremo y unidos a la célula por el otro

Finos (15-20 nm de grosor), se observan por microscopía electrónica.

Flagelación polar vs. Flagelación perítrica


14 nm
L
Filament P

Flagellin MS

Hook Estructura flagelar


Outer Estructura y movimiento flagelar
membrane
(LPS) Movimiento impulsado por gradiente de protones

L Ring
Rod
P Ring
Periplasm Peptidoglycan

MS Ring Rod
Basal
body MS Ring

C Ring Mot
Mot protein
Cytoplasmic Fli proteins C Ring
Mot (motor switch) protein
membrane protein
45 nm
Biosíntesis del flagelo
Ensamblaje de los anillos MS y C
Formación de los otros anillos, gancho y proteína terminal
Adición de moléculas de flagelina Filament
Hook- synthesis
filament
junction
Late
Outer hook
membrane Early
hook Cap
Motor Filament
MS/C (Mot) P L
ring proteins ring ring

Peptidoglycan Cytoplasmic membrane


Tipos de movimiento en procariotas con flagelación perítrica y polar
Carrera y vuelco

Reversible flagella

Tumble—
flagella CCW rotation CW rotation
pushed
Bundled apart Unidirectional flagella
flagella (CW rotation)
(CCW rotation) Cell
Flagella bundled stops,
(CCW rotation) CW rotation reorients
CW
rotation
Perítrica Polar
Quimiotaxis
Movimiento dirigido por agentes químicos (atraen o repelen)
Depende del gradiente temporal no espacial
Carrera y vuelco/giro

Attractant
Tumble
Tumble

Run

Run

No attractant present: Attractant present:


Random movement Directed movement
Quimiotaxis

Attractant
Cells per tube

Control
Repellent

Time
Fototaxis
Movimiento dirigido por luz (atraen o repelen)

Light

0 1 2
Time (h)

Rhodospirillum centenum
400 500 600 700 850 Bacteria roja fototrófica
Wavelength nm
Thiospirillum jenense
Bacteria roja fototrófica
Quimiotaxis en E. coli. (Brock 14ed 7.8)

MCP = Methyl-accepting Chemotaxis Proteins


Quimiotaxis en E. coli.

- La célula deja de avanzar si la concentración de atrayente se mantiene


constante (aunque sea alta).

- La célula solo avanza si va encontrando concentraciones superiores de


atrayente.

- Un mecanismo similar (pero opuesto) ocurre durante el movimiento


en presencia de sustancia repelentes.

- El gradiente que detecta la bacteria se basa en el TIEMPO.

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