Guía Institucional para El Análisis de Sensibilidad y Resistencia Antibiótica 2023

INSTITUTO MEXICANO DEL SEGURO SOCIAL
Guía Institucional para Análisis de

Sensibilidad y Resistencia Antibiótica
2023
Guía Institucional para el Análisis de Sensibilidad y Resistencia Antibiótica
INSTITUTO MEXICANO DEL SEGURO SOCIAL
Director General
Maestro Zoé Alejandro Robledo Aburto
Director de Prestaciones Médicas

Dra. Célida Duque Molina
Titular de la Unidad de Planeación e Innovación en Salud

Dr. Hermilo Domínguez Zárate
Encargada del Despacho de la Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios

Especializados
Mtra. Nancy Sandoval Gutiérrez
Titular de la División de Laboratorios Especializados

Dra. en C. Clara E. Santacruz Tinoco
AUTORES
Dr. Germán Alberto Venegas Esquivel

MNF Infectología
Hospital de Ginecología y Obstetricia 221
OOAD México Poniente Toluca, Estado México
M. en C. Daniel Romero Romero

Jefe de Laboratorio Hospital General de Zona 252
OOAD México Poniente Atlacomulco, Estado de México
QBP. Leticia Chávez Navarro

Jefe de Área
Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados,
CDMX
Mtra. Circe Mayelli Coronel Degollado

Responsable de Proyecto B
Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados,
CDMX
Dr. Jorge Rafael Gamboa Cerdeña

Coordinador de Programas Médicos
Jefatura de Prestaciones Médicas, CDMX
CONTENIDO
I. GLOSARIO Y ABREVIATURAS ................................................................................................................... 7
II. INTRODUCCIÓN ........................................................................................................................................... 9
III. ANTECEDENTES ....................................................................................................................................... 10
IV. MARCO NORMATIVO .............................................................................................................................. 12
V. JUSTIFICACIÓN .......................................................................................................................................... 14
VI. OBJETIVOS ................................................................................................................................................. 14
VII. ÁMBITO DE APLICACIÓN ..................................................................................................................... 14
VIII. HOMOLOGACIÓN DEL REGISTRO DE DATOS DE LOS LABORATORIOS DE

MICROBIOLOGÍA............................................................................................................................................ 15
1. Estandarización del registro de datos del paciente. ....................................................................... 15
2. Estandarización y delimitación del estudio de las muestras de laboratorio .......................... 19
3. Delimitación de los patógenos prioritarios de interés y seguimiento mediante la

vigilancia de la RAM ...................................................................................................................................... 20
4. Delimitación de los antibióticos de interés para su vigilancia de la RAM ............................... 22
IX. EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS EQUIPOS DE MICROBIOLOGÍA ............. 27
1. Extracción Equipo Vitek 2 Compact™ ................................................................................................. 27
2. Extracción Equipo Phoenix BD® .......................................................................................................... 30
3. Extracción MicroScan ............................................................................................................................... 32
X. EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS EQUIPOS A TRAVÉS DE INTERFACES ... 36
1. Extracción por REAL .................................................................................................................................. 36
XI. HOMOLOGANDO INFORMACIÓN MEDIANTE BacLink ............................................................... 51
1. Creación de un archivo compatible con WHONET ......................................................................... 51

Paso 1.- Explorando el archivo con ajuste con Excel ........................................................................... 51
Paso 2.- Identificar el archivo compatible con BacLink ..................................................................... 55
2. Configurar la conversión ......................................................................................................................... 55

Paso 1. Configurar la conversión................................................................................................................ 55
Paso 2. Iniciar BacLink .................................................................................................................................. 55
5
Paso 3. Ajuste de idioma.............................................................................................................................. 56

Paso 4. Configuración de Nuevo formato .............................................................................................. 57
Paso 5. Configuración de laboratorio o Nombre de laboratorio. .................................................... 57
Paso 6. Estructura del Archivo. .................................................................................................................. 58
Paso 7. Configuración de Antibióticos. ................................................................................................... 59
Paso 8. Configuración de los campos de datos. ................................................................................... 59
XII. EJECUTAR LA CONVERSIÓN ............................................................................................................... 71

Paso 1. Definir archivo y destino de guardado para posteriormente ser utilizado en
WHONET........................................................................................................................................................... 71
XIII. GENERACIÓN DE UN LABORATORIO EN WHONET. ............................................................. 78

Paso 1. Configuración de un laboratorio WHONET. ............................................................................ 79
Paso 2. Configuraciones de antibióticos. ................................................................................................ 80
Paso 3. Configuración de localizaciones. ................................................................................................ 82
1. GENERACIÓN DEL REPORTE RAM. ...................................................................................................... 84

Paso 1. Tipo de análisis. ................................................................................................................................. 86
1. Reportes demográficos. ........................................................................................................................... 87

Paso 1.- Reporte de general de RAM. ....................................................................................................... 87
Paso 2.- Selección de microorganismos. ................................................................................................ 87
Paso 3.- Archivo de datos. ........................................................................................................................... 89
Paso 4.- Comenzar análisis. ........................................................................................................................ 90
2. Reportes de RAM. ...................................................................................................................................... 91

Paso 1.- Reporte de RAM por sensibilidad. ............................................................................................. 91
Paso 2.- Selección de microorganismos. ................................................................................................ 92
Paso 3.- Archivo de datos. ........................................................................................................................... 94
Paso 4.- Comenzar análisis. ........................................................................................................................ 95
ANEXO 1 ............................................................................................................................................................ 97
CATÁLOGO DE DIAGNÓSTICOS INFECCIOSOS DEL PACIENTE ..................................................... 97
ANEXO 2............................................................................................................................................................ 99
CATÁLOGO DE TIPO DE MUESTRAS ........................................................................................................ 99
ANEXO 3.......................................................................................................................................................... 101
CATÁLOGO DE MICROORGANISMOS ................................................................................................... 101
XV. BIBLIOGRAFÍA. ................................................................................................................................. 103
6
I.GLOSARIO Y ABREVIATURAS
AWaRe: ACCESS, WATCH, RESERVE [acceso, precaución, último recurso].

Herramienta desarrollada por la OMS para reducir la propagación de la resistencia
a los antimicrobianos, sus eventos adversos y costos, así como el uso correcto de
estos medicamentos.
RAM: Resistencia a los antimicrobianos.
IAAS: Infecciones Asociadas a la Atención en Salud. Son aquellas infecciones que

afectan al paciente durante el proceso de asistencia en un hospital u otro centro
sanitario, que no estaba presente ni incubándose en el momento del ingreso.
OMS: Organización Mundial de la Salud
MDR: Mutidrogoresistente; basada en la susceptibilidad antibiótica in vitro; se

considera según el microorganismo y número de antibióticos a los que ofrece
resistencia.
ESKAPE: Acrónimo para los 6 microorganismos de importancia por sus mecanismos

de resistencia y escasas opciones terapéuticas cuando estos son resistentes a los
antimicrobianos Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella
pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterobacter
cloacae
WHONET: Es una aplicación de escritorio gratuita de Windows para la gestión y

análisis de datos de laboratorios de microbiología con un enfoque particular en la
vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos desarrollada y respaldada por la
OMS y Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial Resistance at the
Brigham and Women’s Hospital in Boston Massachusetts.
BacLink: Es un software de extensión de WHONET que realiza una conversión y

estandarización de los datos de microbiología extraídos de los equipos
automatizados existentes para su análisis en WHONET.
GLASS: Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System (Sistema

Mundial de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos por sus siglas en
inglés).
PCI: Prevención y control de infecciones. Es un enfoque práctico basado en la

evidencia que evita que los pacientes y los trabajadores de la salud se vean
perjudicados por infecciones evitables y como resultado de la resistencia a los
antimicrobianos.
7
PROA: Programa de optimización de antimicrobianos. Conjunto integral y

coherente de medidas destinadas a fomentar el uso responsable y racional de los
antimicrobianos con el objeto de mejorar el resultado de los pacientes a lo largo de
todo el proceso asistencial. El uso responsable y racional comprende la prescripción
de los antimicrobianos sólo en caso necesario y la elección del esquema posológico,
la dosis, la vía de administración y la duración más convenientes de acuerdo con un
diagnóstico certero y óptimo. Estas acciones se complementan con el acceso a
antimicrobianos de calidad y asequibles y con la adopción de medidas preventivas
destinadas a evitar las infecciones relacionadas con la atención de salud y las
adquiridas en la comunidad, medidas como la implantación de los componentes
básicos para la prevención y control de las infecciones.
8
II.INTRODUCCIÓN
La resistencia antimicrobiana (RAM) se produce cuando los microorganismos como

las bacterias, hongos, virus y parásitos; a lo largo del tiempo sufren cambios
promovidos por la exposición a los antimicrobianos (antibióticos, antifúngicos,
antivíricos, antipalúdicos o antihelmínticos); el resultado a esta exposición
promueve que estos tratamientos se vuelvan ineficaces, lo que incrementa el riesgo
de propagación de enfermedades infecciosas, prolongación de las mismas,
incrementos en costos hospitalarios, incrementos en estancias hospitalarias e
incremento en la mortalidad.
Los antibióticos pertenecientes al grupo de fármacos antimicrobianos;

históricamente cambiaron la medicina moderna prolongando la esperanza de vida
del ser humano, al ser la cura de diversas enfermedades infecciosas; si estos pierden
su eficacia, ello pondrá en riesgo el combate de enfermedades, procedimientos
quirúrgicos, quimioterapias u otros tratamientos; la Organización Mundial de la
Salud (OMS) ha estimado que sin intervenciones proactivas y coordinadas, para el
año 2050 habrá más de 10 millones de muertes al año asociadas a la RAM.
La RAM es considerada una amenaza para la salud pública mundial, en 2015 en la

Asamblea Mundial de la Salud se adopta el Plan de Acción Mundial sobre la
Resistencia Antimicrobiana, el cual busca hacer frente a la RAM mediante diversos
objetivos; plan que se alinea en México en 2018 mediante la Estrategia Nacional de
Acción contra la resistencia a los Antimicrobianos estableciendo 5 objetivos
prioritarios para generar intervenciones necesarias encaminadas a controlar,
reducir o en su caso eliminar el riesgo que implica la RAM.
El Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) como institución de salud en México;
ha manifestado su interés en la atención al problema de la RAM; mediante acciones
de intervención con los programas de Prevención y Control de Infecciones (PCI) y el
Programa de Optimización de Antimicrobianos (PROA); enfocados en la
concientización y comprensión de la RAM, reducir la incidencia de infecciones a
través de medidas preventivas y utilizar de forma óptica los agentes
antimicrobianos; en alineación a uno de los objetivos de la estrategia nacional; el
cual establece el generar conocimientos y evidencia de la RAM a través de la
vigilancia y la investigación; con un diseño de aplicación diagnóstica y terapéutica,
el Instituto Mexicano del Seguro Social toma acciones con el fin de fortalecer el
cuidado de los derechohabientes y usuarios.
9
III.ANTECEDENTES
El Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), a través de la Dirección de

Prestaciones Médicas, tiene como uno de sus propósitos fundamentales,
proporcionar atención médica profesional y de la más alta calidad a la población
derechohabiente, mediante el desarrollo e implementación de programas
estratégicos, guías, lineamientos y protocolos de atención prioritarios en todos los
niveles de atención; con el objetivo de alcanzar el mayor impacto positivo en la salud
tanto de los derechohabientes y sus familias.
Se ha estimado que 700,000 personas a nivel mundial fallecen al año por

infecciones provocadas por microorganismos multidrogoresistentes (MDR); para
2050 se han estimado 10 millones de muertes anuales y un total acumulativo de 100
billones de dólares de producción económica estarán en riesgo debido al aumento
de infecciones MDR; en 2019 se publica en la revista de Lancet una estimación
mediante modelos predictivos; estimando 4.9 millones de muertes asociadas a la
RAM y 1.27 millones de atribución directa para el mismo año del estudio.
En 2015 la OMS lanza el Sistema Global Antimicrobial Resistance and Use

Surveillance System (GLASS); sistema que comenzó con vigilancia de la RAM en
bacterias que causan infecciones humanas, y ha ampliado su alcance a la vigilancia
del consumo de antimicrobianos; con el objetivo de enfrentar desafíos futuros,
mejorar la calidad y representatividad de los datos para informar la carga de RAM;
es así como para 2022; 126 países participaban en este sistema de vigilancia.
Reforzar la vigilancia en la RAM es fundamental para mejorar la base científica para

informar las evaluaciones de riesgo e identificar oportunidades de mitigación; a
pesar de los esfuerzos globales y regionales siguen existiendo lagunas en la
comprensión de la magnitud, distribución y tendencia de las infecciones resistentes
a los antimicrobianos.
El porcentaje estimado de la RAM varía sustancialmente y la interpretación de los

datos es limitada; debido a diferencias en la cobertura y vigilancia; sin embargo a
pesar de estas limitaciones permiten identificar lugares en donde la RAM es alta y
genera preocupación; por lo que es importante generar estrategias que mitiguen la
problemática.
La metodología GLASS proporciona un enfoque estandarizado para la recopilación,

análisis e intercambio de datos nacionales de la RAM y cuenta con un enfoque
estratégico:
● Fomentar sistemas nacionales de vigilancia y armonizar estándares globales.
10
● Monitorear las tendencias globales de resistencia a los antimicrobianos en

bacterias de rápido crecimiento que causan infecciones comunes en humanos.
● Estimar el alcance y carga de la resistencia a los antimicrobianos a nivel
mundial mediante indicadores seleccionados.
● Detectar resistencias emergentes y su propagación.
● Generar datos para evaluar el impacto de intervenciones e informar la
implementación de estrategias de prevención y control.
● Informar la investigación y el desarrollo de nuevas herramientas para la
prevención diagnóstico y tratamiento.
Teniendo como objetivo la población en atención médica y de quienes se recolectan

muestras clínicas; la metodología GLASS requiere que los datos se recopilen a través
de un sistema de vigilancia integral con un enfoque en muestras clínicas
significativas en infecciones bacterianas en humanos (sangre, orina, heces, exudado
vaginal y uretral) enviadas a laboratorios. De igual manera se han establecido
microorganismos de importancia Acinetobacter spp., Escherichia coli, Klebsiella
pneumoniae, Neisseria gonorrhoeae, Salmonella spp., Shigella spp.,
Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae; de interés por su
preocupación en el desarrollo e investigación de nuevos antibióticos para su
tratamiento.
La presente guía está orientada en fortalecer las estrategias de vigilancia de la RAM

y de los Programas de Optimización de Antimicrobianos, a través de un análisis
microbiológico de la información obtenida en las unidades; que otorguen datos que
permitan generar estrategias de vigilancia, monitorización, generación de
indicadores, y favorezcan el desarrollo de nuevas herramientas para mejorar la
prescripción antibiótica con el objetivo de mitigar el incremento en la RAM.
11
IV.MARCO NORMATIVO
o Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos.

o Ley General de Salud.
o Plan Nacional de Desarrollo 2019-2024.
o Programa Nacional de Salud 2019–2024.
o Programa Sectorial de Salud 2020-2024.
o Norma Oficial Mexicana NOM-017-SSA2-2012, Para la vigilancia
epidemiológica, publicada en el Diario Oficial de la Federación el 19 de febrero de
2013.
o Norma Oficial Mexicana NOM-045-SSA2-2005, Para la vigilancia
epidemiológica, prevención y control de las infecciones nosocomiales, publicada en
el Diario Oficial de la Federación el 20 de noviembre de 2009.
o Norma Oficial Mexicana NOM-035-SSA3-2012, En materia de información en
salud, publicada en el Diario Oficial de la Federación el 30 de noviembre de 2012.
o Norma Oficial Mexicana NOM-007-SSA3-2011, Para la organización y
funcionamiento de los laboratorios clínicos, publicada en el Diario Oficial de la
Federación el 27 de marzo de 2012.
o ACUERDO por el que se declara la obligatoriedad de la “Estrategia Nacional
de Acción contra la Resistencia a los Antimicrobianos”. Diario Oficial de la
Federación 5 de junio de 2018.
o ACUERDO por el que se emiten las disposiciones y el “Manual Administrativo
de Aplicación General en Materia de Control Interno”. Diario Oficial de la Federación
3 de noviembre de 2016.
o Norma que establece las disposiciones para la aplicación de la Vigilancia
Epidemiológica de las Infecciones Asociadas a la Atención de la Salud, su
Prevención y Control en el IMSS, 2000-001-030, con fecha de registro el 27 de
noviembre del 2017.
o Norma para elaborar, actualizar, autorizar, aprobar y registrar, los manuales
de organización, los manuales de funcionamiento específico y los manuales de
integración y funcionamiento de Comités o Comisiones del Instituto Mexicano del
Seguro Social, 1000-001-019, 11 de noviembre del 2021.
o Manual para la Implementación de los Paquetes de Acciones para Prevenir y
Vigilar las Infecciones Asociadas a la Atención de la Salud (IAAS), Primera Edición,
2019 Secretaría de Salud.
o Manual de Integración y Funcionamiento del Comité Local de Calidad y
Seguridad del Paciente en el Instituto Mexicano del Seguro Social, clave: 2000-021-
006, 2 de febrero del 2022.
12
o Código de Ética de los Servidores Públicos del Gobierno Federal y su última

reforma publicada en el Diario Oficial de la Federación el 05 de febrero de 2019.
o Guía Técnica para la Organización de la Vigilancia Epidemiológica,
Prevención y Control de las Infecciones Asociadas a la Atención de la Salud, 2019.
o Breviario para la Vigilancia Epidemiológica de las Infecciones Asociadas a la
Atención de la Salud, su Prevención y Control, 2021.
o Procedimiento para la atención médica en el proceso de hospitalización en
las unidades médicas hospitalarias de segundo nivel de atención del Instituto
Mexicano del Seguro Social 2022. 2660-003-056.
o Programa Institucional de Prevención y Control de IAAS, 2019-2024.
o Lineamiento Técnico Prevención y control de IAAS (PCI) y Optimización del
uso de Antimicrobianos (PROA) del Instituto Mexicano del Seguro Social. 2022.
13
V.JUSTIFICACIÓN
El Instituto Mexicano del Seguro Social cuenta con un marco normativo en la

vigilancia, prevención y control de infecciones, atención médica hospitalaria, y
lineamientos para la optimización de antimicrobianos; la presente guía atiende a la
necesidad de concretar y estandarizar la vigilancia de la RAM enunciando la
estandarización de los datos de vigilancia así como una guía práctica para generar
las bases de datos; que favorecerán la vigilancia y supervisión de las acciones de
programas de intervención como los lineamientos PCI y PROA.
VI.OBJETIVOS
Establecer un sistema de vigilancia nacional de manera estandarizada para el

monitoreo de las tendencias de la resistencia a los antimicrobianos en cultivos y
bacterias de interés mundial; generando datos para un diagnóstico situacional y
posteriormente evaluar el impacto de intervenciones e informar la implementación
de estrategias de prevención, diagnóstico y control.
VII.ÁMBITO DE APLICACIÓN
La presente guía está dirigida a todos los responsables de laboratorio a participar en

la notificación de la RAM en atención a las necesidades de vigilancia para generar
datos que favorezcan las estrategias de prevención, diagnóstico y control de la RAM.
14
VIII.HOMOLOGACIÓN DEL REGISTRO DE DATOS DE LOS

LABORATORIOS DE MICROBIOLOGÍA
La presente guía contempla a todos los laboratorios de microbiología establecidos

en las unidades médicas que realizan determinación de la susceptibilidad y
resistencia a los antimicrobianos por métodos automatizados (Vitek™, Phoenix
BD® y MicroScan); los cuales cuentan con bases de datos establecidas; que
satisfacen necesidades diarias para generar informes clínicos, procesamiento de
muestras y almacenamiento a largo plazo; desafortunadamente, estos sistemas
tienen una capacidad limitada para el análisis de datos.
Mediante la metodología GLASS la cual proporciona un enfoque estandarizado para

la recopilación, análisis e intercambio de datos sobre la RAM; el Instituto Mexicano
del Seguro Social mediante una iniciativa de vigilancia que permita obtener estos
datos, ha establecido en esta guía una estrategia adaptada que genere un reporte
estandarizado; en apoyo mediante la plataforma WHONET; el cual es un
complemento a los sistemas existentes; disponible en forma gratuita en el sitio web
WHO Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial Resistance at The
Brigham and Women's Hospital in Boston, Massachusetts por la OMS,
https://whonet.org/index.html. Esta plataforma tiene por objetivo homologar la
información de los equipos automatizados para generar reportes de resistencia o
sensibilidad acumulados; sin embargo es importante estandarizar los datos de
registro para posteriormente conjuntar esta información.
Dentro de los componentes centrales de la Metodología GLASS; uno de ellos es la

vigilancia de los sitios de resistencia antimicrobiana; dentro del Instituto Mexicano
del Seguro Social los laboratorios de las unidades de atención son referentes; los
cuales recogen activamente muestras tomadas de los pacientes y enviarán la
información para su análisis posterior.
Dentro de esta metodología es importante delimitar la vigilancia de casos;

recabando información de cada paciente e identificar sus características;
garantizando la privacidad del paciente y estos datos podrán ajustarse a
necesidades locales según la estrategia de vigilancia.
1. Estandarización del registro de datos del paciente.
Los registros demográficos de los pacientes de una manera ordenada y consistente;

ayudará a generar una base sólida para vigilancia de la RAM. El Instituto Mexicano
15
del Seguro Social en un esfuerzo por estandarizar estos registros ha definido los
rubros principales de estudio, que permitirán ingresar estos datos a la plataforma
de análisis (WHONET) para generar un reporte estandarizado.
● Datos del paciente: estos contienen datos esenciales que permitirán el

análisis de datos con base a rubros como; sexo, edad, servicio del paciente,
diagnósticos del paciente y origen de infección (comunitaria vs hospitalaria).
● Datos de la muestra: tanto el rubro de microorganismo como resultado es
otorgado por el equipo sin embargo es importante la estandarización de muestras
de los equipos a la plataforma de análisis (WHONET).
Existen datos mínimos establecidos por los sistemas de vigilancia (GLASS), sin
embargo estos deberán ser empatados con los datos locales y ajustados en cada
unidad; en la siguiente tabla se muestran los datos GLASS establecidos como parte
de la vigilancia mundial, así como la descripción de los datos que serán registrados
en los equipos dentro del Instituto y que posteriormente se enlazarán a el programa
de WHONET. (Tabla 1)
TABLA 1. Datos para la estandarización de registros
Registro en Equipo
Nombre enlazado a
Configuración Semiautomatizado
Tipo Descripción BackLink
mínima GLASS (Vitek, BD Phoenix™,
(WHONET)
MicroScan)
Número de Seguridad
Identificación del Número de Seguridad Número de
Social completo sin
paciente Social identificación.
agregado (11 dígitos)
Nombre completo del

Nombre del Nombre completo
Nombre del paciente paciente (Nombre y
paciente
Apellidos)
Género Sexo Masculino/Femenino Sexo

Datos del paciente
Fecha de nacimiento
Fecha de Fecha de Nacimiento
Fecha de nacimiento del paciente
nacimiento (D/M/Y)
(día/mes/año)
Localización o (Ver tipo de

Localización Localización
servicio Localización Tabla 2)
Fecha de Fecha de Admisión del Admission date

Fecha de Admisión
Admisión paciente (Días/Mes/año) (D/M/Y)
Diagnóstico se agregará Apartado de Motivo;

Origen de la se agregará la
Diagnóstico con base al Catálogo de
Infección enfermedad en
Diagnóstico en Anexo 2
código
16
Registro en Equipo
Nombre enlazado a
Configuración Semiautomatizado
Tipo Descripción BackLink
mínima GLASS (Vitek, BD Phoenix™,
(WHONET)
MicroScan)
Se agregará si el
diagnóstico está
asociado a IAAS
(infecciones que
afectan al paciente
durante el proceso de
Infección asociada asistencia en un Comentario: Agregar
a la atención en Tipo de infección hospital u otro centro “SI”; si corresponde a
salud sanitario, que no estaba IAAS
presente ni
incubándose en el
momento del ingreso).
Todo aquel con más de
72 horas después del
ingreso
Fecha de Recepción Fecha de muestra

Fecha de toma Fecha de solicitud
(Día/Mes/año). (D/M/Y)
Ver tipos de muestra

(Ver tipo de cultivos)
Tipo de Muestra Tipo de Muestra Tipo de Muestra
(Deberá registrarse con
dicha codificación)
Microorganismo. (Ver
Datos de la muestra
Patógeno Microorganismos listado de principales Microorganismo

Microorganismos)
Para datos de
manera horizontal
-Resultado de
Para datos horizontales
-Antibiótico. antibiótico.
Para datos de
Resultados de
Resultado Para datos verticales manera vertical
susceptibilidad -Nombre del antibiótico -Nombre del
-Resultado del antibiótico 1.
antibiótico (MIC) -Resultado del
antibiótico 1.
(corresponderá MIC)
El apartado de localización hace referencia al origen del servicio en donde el

paciente se encuentra ubicado; el Instituto Mexicano del Seguro Social cuenta con
diversos servicios de atención médica dentro de cada una de las unidades a nivel
nacional; por lo que se han ajustado estos servicios que permitirán una vigilancia
17
más estandarizada y dar seguimiento al comportamiento de la RAM mediante el

ingreso de datos ajustados a WHONET. (Tabla 2)
TABLA 2. Servicios ajustados para análisis WHONET
Localización por Tipo de servicios Tipo de Servicios Tipo de

servicios IMSS WHONET localización Código localización
WHONET WHONET
Medicina Interna, Medicina Internado Med in
Dermatología,
Endocrinología,
Reumatología,
Geriatría, etc.
Cirugía general, Cirugía Internado Sur in

cirugía pediátrica,
angiología,
oncología
quirúrgica.
Trasplante de Servicio de Trasplante Internado Tran in

médula ósea.
Traumatología y Traumatología Internado Trm in

ortopedia.
UCIA Unidad de cuidados Internado Aicu in

intensivos para adultos
UTIP Unidad de cuidados Internado Picu in

intensivos pediátricos
UCIN Unidad de cuidado Internado Nicu in

intensivo neonatal
Área de quemados. Quemados Internado Burn in
Ginecología y Obstetricia/Ginecología Internado obg in

Obstetricia.
Pediatría. Pediatría Internado Ped in
Infectología. Infectología Internado Inf in
Hematología y Hematología/Oncología Internado Hao in

Oncología Médica.
Urgencias. Urgencias Ambulatorio Eme out
Nefrología. Mixto Internado Mix in
Epidemiología. Otro Ambiente Oth env
18
Localización por Tipo de servicios Tipo de Servicios Tipo de

servicios IMSS WHONET localización Código localización
WHONET WHONET
Laboratorio. Laboratorio Laboratorio Lab lab
Unidad de medicina Otra clínica Ambulatorio Cli out

familiar, consulta
externa, etc.
Otra unidad. Otro Hospital Otro hos unk
No se menciona. Desconocido Desconocido unk unk
2. Estandarización y delimitación del estudio de las muestras

de laboratorio
En cada unidad hospitalaria diariamente se realizan diversos tipos de cultivos;

considerando la metodología GLASS el cual consiste en delimitar o establecer el
enfoque de vigilancia de la RAM; se han considerado las muestras y patógenos
prioritarios (hemocultivo, orina, heces, exudados uretrales y cervicales) para este
sistema de vigilancia. En el Instituto Mexicano del Seguro Social como primer
esfuerzo de vigilancia de la RAM se ha optado por la estrategia enfocada en
muestras específicas y de importancia considerando su interés por su impacto,
mortalidad y costos en la atención; delimitando el estudio a dos muestras:
● Hemocultivos (sangre y/o catéter central).

● Urocultivos (orina).
La estandarización de este tipo de muestras permitirá una vigilancia dirigida que

favorecerá las estrategias de intervención tanto diagnósticas, de tratamiento y
prevención; en la siguiente tabla se anexan los cultivos prioritarios; en conjunto con
el nombre asociado en la plataforma WHONET y algunas infecciones que delimita
este tipo de cultivos. (Tabla 3)
TABLA 3. Estandarización de muestras para análisis WHONET
Grupo Tipo de Descripción específica. Nombre Infecciones

anatómico. muestra. WHONET asociadas o
Diagnósticos.
Cardiovascular. Hemocultivo Hemocultivo tomado de Catéter Bacteriemia.
“Sangre” central acceso central central (cc) Sepsis sin foco.
Hemocultivo Hemocultivo tomado de sitio Sangre (sa) Infección
periférico de punción periférico relacionada a
19
Punta de Punta de catéter. (5cm punta) + Catéter (ca) catéter.

catéter hemocultivo central previo al Endocarditis.
retiro Otros.
Orina Urocultivo Urocultivo CH ½, punción y/o Orina (or) Infección de vías
sonda urinarias.
Este enfoque dirigido se generará mediante los datos otorgados; sin embargo es
importante mencionar que dentro de las unidades se procesan otro tipo de
muestras; por lo que si bien el enfoque de este reporte está enlazado a hemocultivos
y urocultivos; el registro de muestras deberá estar enlazado conforme al Anexo 2.
Catálogo de tipo de muestras; ya que esto permitirá posteriormente dar
seguimiento a otro tipo de muestras de importancia conforme progresa la vigilancia
de la RAM.
3. Delimitación de los patógenos prioritarios de interés y

seguimiento mediante la vigilancia de la RAM
Con la finalidad de reforzar la vigilancia a nivel mundial, la OMS con el apoyo de la

División de Enfermedad Infecciosas de la Universidad de Tübingen (Alemania); han
establecido los patógenos prioritarios para la investigación, desarrollo e innovación
(I+D) de nuevos antibióticos; estos criterios de selección se basaron en el grado de
letalidad de las infecciones, el hecho de que el tratamiento requiera o no
hospitalización prolongada, la facilidad de transmisión y si estas infecciones
provocan o pueden prevenirse (ejemplo: vacunación); esta lista incluye bacterias
MDR de potencial peligro tanto en hospitales, hogares de cuidado o pacientes con
dispositivos invasivos.
Esta lista de patógenos prioritarios se han establecido por prioridad crítica, elevada
y media; cuya farmacorresistencia va en ascenso y que están relacionados con
muchos casos de enfermedades comunitarias.
20
Figura 1. Patógenos prioritarios para la Investigación y Desarrollo de nuevos

antibióticos para la OMS
Estos patógenos establecidos por la OMS son de importancia tanto comunitaria

como hospitalaria, los cuales se refuerzan con patógenos de importancia
hospitalaria conocida como grupo ESKAPE; palabra formada con las primeras
iniciales de seis bacterias: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella
pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterobacter
spp.; las cuales son de alta importancia por su grado de resistencia antibiótica, las
escasez en opciones terapéuticas cuando estas son resistentes y su importancia en
infecciones asociadas a la atención en salud. El Instituto Mexicano del Seguro Social
en un esfuerzo para dirigir la vigilancia de la RAM se enfoca en microorganismos de
importancia como previamente se ha mencionado; con un enfoque al grupo
ESKAPE y Streptococcus pneumoniae; por su importancia tanto en infecciones
comunitarios como hospitalarias. (Tabla 4)
21
TABLA 4. Microorganismos de interés para la vigilancia RAM
Características Microorganismo de interés Prioridad OMS
Cocos Gram positivos Enterococcus faecium 2 elevada
Cocos Gram positivos Staphylococcus aureus 2 elevada
Bacilos Gram negativos

Klebsiella pneumoniae 1 alta
fermentador de lactosa
Bacilos Gram negativos no

Acinetobacter baumannii 1 alta
fermentadores de lactosa
Bacilos Gram negativos no

Pseudomonas aeruginosa 1 alta
fermentadores de lactosa
Bacilos Gram negativos

Escherichia coli 1 alta
fermentador de lactosa
Cocos Gram positivos Streptococcus pneumoniae 3 media
Este enfoque dirigido será el reporte que se generará mediante los datos otorgados;
sin embargo es importante mencionar que existen otro tipo de microorganismos al
igual que en el tipo de muestras; por lo que si bien el enfoque de este reporte está
enlazado a este grupo de microorganismos; el registro de microorganismos deberá
estar enlazado conforme al Anexo 3. Catálogo de microorganismos; estos tomados
de los microorganismos prioritarios y algunos otros de importancia en las diversas
infecciones que se presentan a nivel hospitalario; mismo que servirán
posteriormente para extender la vigilancia de la RAM.
4. Delimitación de los antibióticos de interés para su

vigilancia de la RAM
Los laboratorios realizan pruebas de susceptibilidad antimicrobiana de acuerdo con

estándares internacionales principalmente basados en el Committee on
Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) y Clinical and Laboratory Standards
Institute (CLSI); ambos organismos son referentes para el proceso de muestras
microbiológicas; dentro del Instituto Mexicano del Seguro Social se ha seleccionado
el laboratorio CLSI como referente para dar seguimiento a la vigilancia de la RAM.
Dentro de la metodología GLASS es importante el estandarizar los antibióticos de

vigilancia; la elección de los agentes antimicrobianos más apropiados para probar e
informar es una decisión de cada laboratorio la cual debe consultarse con el equipo
22
administrativo, el equipo de antimicrobianos; el CLSI en 2023 publica M100-ED: 2023

Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing 33er Edition;
documento que establece la elección de estos agentes antimicrobianos
considerando antimicrobianos aprobados para su uso clínico, factores específicos
de pacientes (ejemplo: edad, zona del cuerpo, etc.) y factores específicos de
microorganismos (perfil general de susceptibilidad) para realizar pruebas y notificar
cualquier agente individual.
Este mismo documento sugiere dar seguimiento a las directrices institucionales; el

Instituto Mexicano del Seguro Social ha establecido los antimicrobianos de
vigilancia mediante la metodología AwARe, en conjunto con la estandarización
previa de los microorganismos y considerando las recomendaciones del CLSI en los
4 niveles para determinar los agentes antimicrobianos que los laboratorios de
microbiología deben considerar para pruebas e informes, se establecen los
antimicrobianos de interés a seguir. (Tabla 5)
TABLA 5. Niveles sugeridos para informes por laboratorios según (CLSI)
Agentes antimicrobianos que los laboratorios de microbiología deben considerar para pruebas e
informes. (CLSI).
Nivel 3: Agentes
Nivel 4: Agentes
antimicrobianos que son
Nivel 2: Agentes antimicrobianos
Nivel 1: Agentes apropiados para las
antimicrobianos que son que pueden
antimicrobianos pruebas primarias de
apropiados para pruebas justificar pruebas e
que son rutina en instituciones que
primarias de rutina, pero informes a pedido
apropiados para atienden a pacientes con
que pueden informarse del médico si los
las pruebas y los alto riesgo de MDR, pero
siguiendo las reglas de agentes
informes que sólo deben informarse
notificación en cascada antimicrobianos en
primarios de siguiendo las reglas de
establecidas en cada otros niveles no son
rutina. notificación en cascada
institución. óptimos debido a
establecidas en cada
varios factores.
institución.
Adaptado de: CLSI. 2023. M100 Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Vol.
M100-Ed33.
En este esfuerzo por estandarizar la vigilancia se hace un ajuste con base a los
fármacos disponibles y de vigilancia en el AwARe dentro del Instituto Mexicano del
Seguro Social; que favorezcan las vigilancia de la RAM con un enfoque a los
medicamentos prescritos en cada unidad; en color azul se establecen los
antibióticos que son exclusivos de reporte en infecciones urinarias. (Tabla 6)
23
TABLA 6. Antibióticos sugeridos para el reporte de microorganismos con base al

AwARe
Microorganismo Antibiótico por grupo AwARe. Nivel 1 Nivel 2 Nivel 3 Nivel 4

Ampicilina
Penicilina
Gentamicina
Nitrofurantoina (solo reporte en
Enterococcus (Orina)
orina)
faecium o
Tetraciclina (solo reporte en orina) (Orina)
Enterococcus spp.
Ciprofloxacino/Levofloxacino (solo
(Orina)
reporte en orina)
Vancomicina
Linezolid
Penicilina
Clindamicina.
Oxacilina/Cefoxitin
Doxiciclina.
Tetraciclina.
Staphylococcus Gentamicina
aureus o Trimetoprim Sulfametoxazol
Staphylococcus spp. Nitrofurantoina (solo reporte en
(Orina)
orina)
Minociclina
Ciprofloxacino/levofloxacino
Vancomicina
Linezolid
Ampicilina
Cefazolina
Amoxicilina con ácido clavulánico.
Gentamicina
Amikacina
Tetraciclina
Trimetropin sulfametoxazol
Enterobacter spp no Nitrofurantoina (solo reporte en
(Orina)
incluyendo orina)
Salmonella y shigella. Cefuroxime
Cefotaxima o Ceftriaxona
Cefepime
Piperacilina/Tazobactam
Ertapenem
Imipenem
Meropenem
Amikacina
Acinetobacter spp
Gentamicina
24
Doxiciclina
Trimetroprim-sulfametoxazol
Minociclina
Tetraciclina (solo reporte en orina) (Orina)
Ceftazidima
Cefepime
Piperacilina-tazobactam
Imipenem
Meropenem
Colistin
Amikacina (solo reporte en orina) (Orina)
Ceftazidima
Cefepime
Pseudomonas spp Ciprofloxacino/levofloxacino
Piperacilina-tazobactam
Imipenem
Meropenem
Penicilina
Amoxicilina
Amoxicilina ácido clavulánico
Trimetoprim sulfametoxazol
Clindamicina
Doxiciclina
Tetraciclina
Eritromicina
Streptococcus
Cefuroxima
pneumoniae
Cefotaxima/Ceftriaxona
Cefepime
Ertapenem
Imipenem
Meropenem
Levofloxacino/Moxifloxacino
Vancomicina
Linezolid
Adaptado de: CLSI. 2023. M100 Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Vol.
M100-Ed33.
Realizando el ajuste con base al procedimiento por CLSI y ajustando a la

disponibilidad de antibióticos disponibles por AwARe dentro del Instituto se
muestra la lista de antibióticos estandarizada para vigilancia dentro de la RAM
misma que anexa el código WHONET que permitirá posteriormente anexar estos
datos a esta plataforma. (Tabla 7)
25
TABLA 7. Antibióticos de interés para vigilancia RAM
Código
Antibiótico por AwARe Nombre WHONET
WHONET
Amikacina AMK30 Amicacina (CLSI, EUCAST-30µg)
Amoxicilina AMX30 Amoxicilina (CLSI-30µg)
Amoxicilina/Ácido clavulánico (CLSI, EUCAST
Amoxicilina ácido clavulánico AMC20
(Most bacteria)-20/10µg)
Ampicilina (CLSI, EUCAST (Enterobactereales)-
Ampicilina AMP10
10µg)
Penicilina PEN10 Penicilina G (CLSI, DIN,SRGA-10 unit)
Clindamicina CLI2 Clindamicina (CLSI, EUCAST-2µg)
Dicloxacilina OXA1 Oxacilina (CLSI, EUCAST-1µg)
Cefoxitin FOX30 Cefoxitina (CLS,EUCAST-30µg)
Doxiciclina DOX30 Doxiciclina(CLSI, SRGA,BSAC-30µg)
Gentamicina GEN10 Gentamicina (CLSI,EUCAST-10 µg)
Nitrofurantoina NIT300 Nitrofurantoina (CLSI-300µg)
Tetraciclina TCY30 Tetraciclina (CLSI, EUCAST-30µg)
Trimetoprima/sulfametoxazol (CLSI, EUCAST-
Trimetoprima y sulfametoxazol SXT1.2
1.25/23.75µg)
Cefepime FEP30 Cefepime (CLSI, EUCAST-30µg)
Cefotaxima CTX30 Cefotaxima (CLSI, SRGA,BSAC-30µg)
Ceftazidima CAZ30 Ceftazidima (CLSI, SRGA, BSAC-30µg)
Ceftriaxona CRO30 Ceftriaxona (CLSI, EUCAST-30µg)
Cefuroxima CXM30 Cefuroxima (CLSI, EUCAST-30µg)
Ciprofloxacino CIP5 Ciprofloxacino (CLSI, EUCAST-5µg)
Eritromicina ERY15 Eritromicina (CLSI, EUCAST-15µg)
Ertapenem ETP10 Ertapenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Imipenem y cilastatina IMP10 Imipenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Levofloxacino LVX5 Levofloxacino (CLSI, EUCAST-5µg)
Meropenem MEM10 Meropenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Moxifloxacino MFX5 Moxifloxacino (CLSI, EUCAST-5µg)
Piperacilina/tazobactam TZP100 Piperacilina/tazobactam (CLSI-100/10µg)
Vancomicina VAN30 Vancomicina (CLSI, AFA-30µg)
Linezolid LNZ30 Linezolid (CLSI-30µg)
Colistimetato COL10 Colistín (CLSI, EUCAST-10µg)
Una vez delimitados los datos de interés en el paciente, las muestras

microbiológicas de vigilancia, microorganismos de interés y los antibióticos de
vigilancia; se podrá generar un reporte; sin embargo previo al reporte es importante
extraer la información para posteriormente homologar datos y así poder generar un
reporte mediante la plataforma WHONET.
26
IX.EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS

EQUIPOS DE MICROBIOLOGÍA
Los laboratorios a nivel Nacional cuentan con bases de datos establecidas por cada
uno de los equipos automatizados de microbiología; para la generación de un
informe WHONET,se deberá realizar la extracción de datos de manera individual;
dentro del Instituto Mexicano del Seguro Social se cuenta con diversos equipos
automatizados cada uno de ellos con particularidades diferentes; por lo que se
deberá consultar la extracción con base al equipo disponible en cada unidad.
Esta extracción de información se genera en cada equipo y su respectiva

plataforma; misma que puede realizarse mediante funciones establecidas en cada
software sin requerir instalación adicional ni interrumpir la operatividad del sistema.
NOTAS:
● Es importante que la extracción de esta información en cada uno de los
equipos sea de forma segura por lo que deberá contar con USB “virgen” con el
objetivo de no contaminar los equipos.
● En caso de no contar con la instalación de los software de apoyo para la

extracción de información es importante generar el contacto con el proveedor para
la instalación de estas extensiones consideradas en el contrato.
1. Extracción Equipo Vitek 2 Compact™
Dentro del escritorio del equipo podrá acceder a la información mediante el sistema
VITEK 2 Systems mismo que se encuentra en su escritorio; en caso de no contar con
dicho acceso deberá consultar con el proveedor para su instalación.
a) Acceder a la pantalla principal y visualizar el icono de caja de herramientas y

elegir la opción aislamientos inactivos.
27
b) Se desplegará una segunda ventana. Seleccionar el periodo de fechas de

interés para extraer los datos, y elegir las opciones “MIC” e “Interpretación”,
finalmente elegir el icono del CD y la flecha.
c) Se observará una ventana con los aislamientos identificados en el tiempo

elegido. Seleccionar “Si” para confirmar la exportación de datos.
28
d) Finalmente elegir la carpeta donde se guardará el archivo plano extraído y

convertido con el nombre deseado. Corroborar que el archivo sea guardado en
formato “.txt”.
Al finalizar dar clic en “Cerrar” y así se podrá utilizar la interfaz creada, con lo que se
puede acceder a ella a través de la opción “Tratamiento de datos” de la pantalla
principal de observa.
29
2. Extracción Equipo Phoenix BD®
Este sistema y su plataforma contienen el software EpiCenter, con un filtro de

tratamiento de datos preconfigurado que se aplica para el análisis en WHONET.
a) Generación de filtro en EpiCenter.
En la Barra de Herramientas de EpiCenter, seleccionar el icono “Ver Datos”
Una vez en la pantalla “Ver datos” se encontrará “Filtros definidos” en la cual hay
dos secciones: Filtros Personalizados y Filtros Predefinidos. Seleccionar el reporte
WHONET.
30
Se desplegará una ventana donde debe seleccionar la fecha en la que desea

exportar los datos, seleccionar en la primera casilla la fecha inicial y en la segunda
casilla la fecha final, finalmente hacer clic en “Ejecutar”.
Finalmente se desplegará una tabla donde se muestran los registros que serán
exportados, dar clic en el botón “Vista previa”.
31
A continuación seleccionar en el botón del sobre para exportar el informe a un

archivo y guardar el archivo en la carpeta correspondiente para su posterior
análisis.
3. Extracción MicroScan
Con el uso del equipo Microscan y el software LabPro se puede crear por única
ocasión una interfaz entre el software del sistema automatizado y un reporte en
texto plano o formatos .txt o .xls para descargar la información periódicamente
haciendo los siguientes pasos.
a) Ingresar al centro de comandos de LabPro.
b) Clic en el ícono de Utilidades y a continuación doble clic en la opción Interfaz.
32
c) En la opción “Configurar dispositivos de comunicación”, se crea una nueva

interfaz, la cual dirigirá datos de exportación a una carpeta en el disco duro del
equipo.
Configuración de un nuevo dispositivo de comunicación
a) Hacer clic en Dispositivo, después Agregar dispositivo o el icono “+” y en LIS.
33
En la pantalla de Configuración del Dispositivo se observarán las siguientes

opciones:
-Nombre Configuración: nombre la configuración de la interfaz, por ejemplo:

WHONET.
-Physical: cambiar la opción Serial a la opción File (Archivo).
-Data Link: LabPro automáticamente cambiará a Null.
-Message: LabPro elegir esta opción en MicroScan.
b) Hacer clic en la opción Physical y luego en Configurar. En Propiedades de

nuevo dispositivo, se observará: Importar Nombre de Archivo y Exportar Nombre de
Archivo los cuales indican desde y hacia qué ubicación se exportarán los datos.
c) El archivo EXPORT EXP. Se encuentra en la carpeta Microscan, contenido en

la carpeta LabPro en el disco local D, esta es una opción predeterminada donde se
ubicará el archivo generado.
34
Para generar el archivo con la base de datos del periodo elegido se deberá
seleccionar el icono Monitor de Interfaz, donde se encontrará la nueva interfaz
creada, hacer clic en Dispositivo y seleccionar Transmitir datos del paciente.
a) Seleccionar el periodo de fechas a extraer o la secuencia de folios internos de

interés, posteriormente hacer clic en el icono de Transmisión nuevamente y deberá
aparecer la pantalla del monitor y el Estado “enviando”.
d) Esperar hasta que quede el estado “inactivo” nuevamente. Si se ha

transmitido datos previamente se debe activar la casilla retransmitir datos
previamente enviados, para enviar nuevamente toda la selección.
35
Cuando haya finalizado toda la transmisión de datos, el sistema lo indicará. Se debe

buscar el archivo Export.exp en la ubicación generada previamente. Finalmente el
archivo generado estará listo para transformar los datos a formato WHONET.
X.EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS

EQUIPOS A TRAVÉS DE INTERFACES
1. Extracción por REAL
Los equipos VITEK en el Instituto que cuentan con software REAL permiten exportar
sus datos de manera sistematizada para su análisis e interpretación.
1. Identificar la PC asociada al VITEK, encender el equipo e identificar el acceso

directo a REAL en el escritorio.
2. Situar el cursor sobre el ícono de acceso directo y pulsar dos veces sobre él,
aparecerá una ventana emergente con el mensaje Bienvenido a REAL como el
siguiente: Si tiene usuario y contraseña y los conoce, escribir datos en el campo
correspondiente. Si no había generado usuario y contraseña anteriormente use las
que presentamos:
1) Usuario: SUPO
2) Contraseña: 2018
3) Clic ENTER
36
3) Aparecerá una ventana emergente como la que visualizamos aquí… En el

margen izquierdo, en el área de azul oscuro, identificar la leyenda “Reportes”,
seleccionar y automáticamente desplegará un menú.
37
4. En el menú de reportes observará dos opciones; Reportes y paneles de

control. Presionar en “Reportes”.
38
5. En el mismo listado se desplegará un nuevo menú con las siguientes

opciones: Reportes estadísticos y listados avanzados, antecedentes del paciente.
Seleccionar la opción “Reportes estadísticos y listados avanzados”
6. Aparecerá en el campo gris una sesión con encabezado que dice:

Reportes/Reportes/Reportes estadísticos y Listados avanzados. Identificar la
leyenda en negritas que dice: Reporte y contiene un listado…presione el listado
desplegable
39
7. Existen múltiples opciones, muchas de ellas pueden ser útiles para los
trabajos de los subcomités de antimicrobianos. Nos centraremos en la parte de
debajo de la lista en la sesión que dice “Listados”, de ahí en la opción que dice
“Exportación a WHONET”. Seleccionar “Exportación a WHONET”.
40
8. Ahora necesitamos que indique el rango temporal para exportar los datos.
Identificar el campo que dice “Información de la orden” Fecha de la orden. Para el
rango inferior seleccionar: 01/01/2018 No se preocupe si el equipo se instaló en una
fecha posterior, este rango inferior es para garantizar que no se extravíe algún
archivo.
41
9. Ahora vamos a indicarle al equipo cuál será el rango superior para construir
su base de datos… Identificar el campo que dice “Información de la orden” Fecha de
la orden. Para el rango superior seleccionar: 31/08/2023. Si la base fuera muy extensa
solicitar bases por año a partir del 2019 para tener archivos manejables: la fecha de
inicio sería 1/01/2019 y finalización 31/12/2019. Haríamos algo similar para 2020, 2021,
2022, 2023. Pero solo en caso de que su base fuera muy extensa y no le permita
extraerlo en un solo archivo.
10. Ahora vamos a indicarle a REAL que extraiga los datos de los cultivos en los
que se haya logrado el aislamiento y prueba de susceptibilidad de antibióticos.
Identificar el campo que dice “Preferencias de Reporte”, desplegará el listado:
inclusión ID/AST Aislamientos con AST Todos los aislamientos, seleccionar
aislamientos con AST.
42
11. En la opción “Modo de renderización” seleccionar PDF, debajo observará un

recuadro que dice “Exportar”, seleccione XLSX.
43
12. Aparecerá una ventana emergente que dice “Opening Reporte” …. La ventana
emergente le preguntará “What should Firefox do with this file?”, que queremos
hacer con el archivo, seleccionar la opción: “Save file” para guardar el archivo y
presionar el rectángulo que dice Ok.
44
13. Finalmente aparecerá el explorador de Windows que preguntará cómo

nombrar el archivo se sugiere: Reporte 2019_2023_Siglas de su unidad.xlsx
14. Al concluir lo anterior regresar al rectángulo exportar y seleccionar extensión

“.txt” Finalmente aparecerá él explorador de Windows que preguntara cómo
nombrar el archivo se sugiere: Reporte 2019_2023_Siglas de su unidad.txt Excel tiene
un número máximo de 1.048.576 filas por hoja, en caso de que la base fuera muy
45
extensa este segundo archivo permitirá recuperar esos datos; Reporte

2019_2023_Siglas de su unidad.xlsx
IV.INSTALACIÓN DE WHONET y BacLink
WHONET es un complemento de los sistemas existentes en este caso de los datos

previamente extraídos; si bien la plataforma WHONET permite la generación del
reporte antes deberá homologarse la información obtenida para generar un
reporte; mismo que se podrá homologar mediante el Software BacLink.
El propósito del software de extensión BacLink es la conversión y estandarización

de datos microbiológicos generados por los diferentes equipos existentes; estos
datos se pueden convertir semanalmente, mensualmente o según sea solicitado.
46
Tanto WHONET como BacLink están disponibles en forma gratuita en el sitio web
del WHO Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial Resistance at the
Brigham and Women 's Hospital in Boston, Massachusetts por la OMS.
https://whonet.org/index.html
BacLink permite tomar datos con una variedad de estructuras (texto delimitado,
Microsoft Excel, Epi Info o dBASE) de equipos como Vitek, MicroScan, Phoenix, entre
otros; y crear nuevos archivos con la estructura estándar de WHONET se tendrán
beneficios de:
● Análisis de datos.
● Capacidad de compartir datos.
Este programa puede ser instalado en cualquier equipo; se sugiere la instalación en
el mismo equipo de microbiología (solicitar al proveedor) donde podrán generar
constantemente los reportes o en un equipo institucional.
1. Ingresar a la página www.whonet.org en la cual se indica el enlace de

descarga de archivo de instalación, se puede elegir entre 2 versiones de acuerdo
con la capacidad del equipo a instalar.
2. Al abrir el archivo descargado se abrirá la ventana de instalación del

software, a continuación, dar clic en instalar.
47
3. A continuación, se implementan las instrucciones de instalación, ubicación y

aceptación de términos de licenciamiento.
48
4. Finalmente, al completar la instalación del software se indicará el icono para

salir del proceso y aparecerá la pantalla de “instalación exitosa”
49
5. Posterior a la instalación, deberán aparecer en el escritorio los accesos

directos tanto de la plataforma BacLink 2023 como del programa WHONET 2023.
50
XI.HOMOLOGANDO INFORMACIÓN MEDIANTE BacLink
Como se ha mencionado WHONET es un complemento de los sistemas existentes;

el propósito del software de extensión BacLink es la conversión y estandarización
de datos microbiológicos generados por los diferentes equipos existentes. Para
conocer más del programa BacLink podrán encontrar herramientas y manuales de
apoyo en la siguiente liga de consulta. https://whonet.org/training.html
Este proceso de estandarización de archivos mediante BacLink para

posteriormente ser llevados a la plataforma WHONET y contar con un reporte RAM
debe generarse mediante 3 pasos principales:
1) Crear un archivo compatible con BacLink: con la extracción de datos de los

equipos automatizados en formato “texto simple” (txt) o Excel; mediante BacLink
podrá homologar con los datos necesario para el reporte.
2) Configurar la conversión: especifica detalles del archivo que desea importar,
organizando campos de datos, esta configuración es muy fácil ya que BacLink ya
está programado con todos los detalles necesarios sobre la estructura del archivo;
sólo debe realizarse una vez siempre y cuando se realice la conversión en el mismo
equipo.
3) Ejecutar la conversión: después de configurar la conversión, estará listo para
convertir sus archivos; el archivo creado por la conversión BacLink es un archivo
WHONET válido que podrá analizarse posteriormente con WHONET.
1. Creación de un archivo compatible con WHONET
Paso 1.- Explorando el archivo con ajuste con Excel
Es necesario explorar el archivo en Excel para conocer el orden de los datos; por lo
que antes de abrir el formato de archivo tendrá que abrir Excel y hacer lo
siguiente:
1) Abrir Excel.
2) Seleccionar Abrir.
3) Seleccionar Examinar y buscar la carpeta del archivo extraído del equipo.
4) Corroborar que se encuentren en vista todos los archivos de lo contrario no
podrá ver los formatos .txt.
5) Seleccionar el archivo .txt y abrir.
51
Una vez que logre abrir el archivo aparecerá la siguiente pantalla la cual tendrá que
configurar de la siguiente manera:
1) Elegir el tipo de archivo que describa los datos con mayor precisión:
Seleccionar Delimitados – Caracteres como comas o tabulaciones separan campos.
2) Comenzar a importar en la fila: Seleccionar 1.
3) Origen del archivo: seleccionar Windows (ANSI)
4) Seleccionar: Siguiente.
Posteriormente aparecerá un paso 2 en el cual solo deberá seleccionar el área de

“separadores”; según corresponda a su formato otorgado por el equipo este podrá
52
ser variable sin embargo la manera de corroborar que es el separador correcto lo

verá en la pantalla inferior cuando este delimite los títulos de la columna como en
el ejemplo.
Existen distintos separadores (Tabulación (Tab), Punto y coma (;), Coma (,), Espacio,
otro); es importante recordar el tipo de separador que permitió este reconocimiento
ya que será utilizado posteriormente en el Paso 2 “Identificar el archivo compatible
con BacLink. Clic en siguiente.
Posteriormente aparecerá un paso 3 dar clic en Finalizar.
53
Una vez realizado se abrirá un formato Excel donde debe observar cómo aparecen
los campos de manera horizontal o vertical; como ayuda delimite el nombre del
paciente y/o microorganismo; en caso de que el siguiente nombre y/o
microorganismo se repita de manera vertical más de 2 veces es probable que todo
el documento se encuentre con pacientes en más de una fila; a este formato le
llamaremos formato “Más de una fila/ secuencia de antibióticos variable” y en caso
que los nombres de los pacientes y/o microorganismos aparezcan de manera
horizontal y estos no se repitan la secuencia de datos estaría en filas y a este formato
lo llamaremos “una sola fila/secuencia fija de antibióticos” es importante recordar
el tipo de formatos ya que será utilizado posteriormente en el Paso 2 “Identificar el
archivo compatible con BacLink. Una vez reconocido esto podrá cerrar el
documento y usted podrá decidir si guarda este documento como respaldo o solo
de reconocimiento.
54
Paso 2.- Identificar el archivo compatible con BacLink
El archivo de extracción del equipo se realizó en formato texto (txt); este será el
archivo que se manipulara en BacLink; la elección de este formato es debido a que
es una manera de menor peso para Windows y pueda extraerse toda la información
de los equipos; mediante la extensión del software BacLink permitirá visualizar los
datos al momento de empatar la información con los archivos WHONET. Es
necesario no olvidar el paso previo para identificar los separadores y la orientación
de los datos.
2. Configurar la conversión
Paso 1. Configurar la conversión
Importante generar una Carpeta en nuestro equipo donde se destinarán los

archivos generados, facilitando su localización; de igual manera contar con la
ubicación del archivo exportado de los equipos de microbiología.
Paso 2. Iniciar BacLink
55
● Seleccionar el icono BacLink instalado en el escritorio de su computador

desplazando la siguiente ventana.
Paso 3. Ajuste de idioma
BacLink actualmente cuenta con 17 idiomas, por lo que es importante ajustar el

idioma al inicio para facilitar los pasos siguientes.
1) Oprimir en “Select language o Selección de idioma”.

2) Seleccionar en todo los rubros “spanish”.
3) Seleccionar Aceptar.
56
Paso 4. Configuración de Nuevo formato
1) Seleccionar Nuevo formato.
Paso 5. Configuración de laboratorio o Nombre de laboratorio.
1) País: seleccionar México.

2) Nombre del laboratorio: será el nombre de Hospital Completo (ejem; Hospital
General Regional 251).
3) Código de laboratorio: será el número de Hospital (ejem; 251).
4) Oprimir estructura del archivo.
57
Paso 6. Estructura del Archivo.
Recordar el Paso 1 “Crear un archivo compatible con BacLink”, con el objetivo de

conocer el delimitador de campos.
1) Estructura de archivo: Seleccionar Texto (delimitado).

2) Delimitador de campos: Seleccionar el delimitador previamente visualizado
al explorar el archivo en Excel cómo se realizó en el Paso 1.- Explorando el archivo
con ajuste con Excel; seleccionar el tipo de separador que delimitó el archivo en
columnas.
3) Carpeta de archivo: No se deberá modificar; ya que en automático dirige a los
códigos WHONET.
4) Nombre: Seleccionar el archivo de extracción del equipo en formato txt.
5) Archivo de origen: Seleccionar Windows (ANSI)
5) Conjunto de caracteres: Seleccionar europeo occidental (Windows)
6) Seleccionar Antibióticos.
Ahora proporcionaremos a BacLink información sobre los resultados de antibiótico

de nuestros equipos para posteriormente este software homologar la información
reportada por su equipo con la que ingresara a la plataforma WHONET.
58
Paso 7. Configuración de Antibióticos.
1) ¿Su archivo incluye resultados para los antibióticos?: Seleccionar Sí.

2) Normas: Seleccionar CLSI (Laboratorio de referencia a nivel mundial).
3) ¿Cuántas filas de datos son necesarios para los antibióticos de un
aislamiento?: Nuevamente recordando el Paso 1.- Explorando el archivo con ajuste
con Excel seleccionaremos en más de una fila al formato que llamamos “Más de una
fila/ secuencia de antibióticos variable” (ya que los datos se encontraban de manera
vertical) y “una sola fila/secuencia fija de antibióticos” (ya que los datos se
encontraban de manera horizontal)
4) ¿En qué secuencia aparecen los antibióticos?: Nuevamente recordando el
Paso 1.- Explorando el archivo con ajuste con Excel seleccionar secuencia de
antibióticos variable para aquellos formatos de “Más de una fila/ secuencia de
antibióticos variable” (ya que los datos se encontraban de manera vertical) y
seleccionar secuencia de antibióticos fija para aquellos de “una sola fila/secuencia
fija de antibióticos” (ya que los datos se encontraban de manera horizontal)
5) ¿Cuáles métodos incluyen el archivo de datos?: Seleccionar CIM
(Concentración mínima inhibitoria).
6) Oprimir en Aceptar.
Paso 8. Configuración de los campos de datos.
59
Ahora se realizará la parte más importante de la configuración; consiste en definir

la relación entre los campos de datos de su archivo y el campo de datos
correspondiente.
● ¿La fila de datos del archivo de datos contiene los nombres de los campos de
datos?: Seleccionar Sí.
1) Oprima en campo de datos.
En esta pantalla, verá la lista predeterminada de campos de WHONET; con el

objetivo de homologar información especificada en el apartado de “Homologación
del Registro de Datos de los Laboratorios de Microbiología”; modificaremos esta
lista para agregar datos faltantes de la lista predeterminada.
1) Oprimir en lista de campo de Datos.

2) Oprimir en Modificar la lista de campos de campos de datos.
60
Al dar clic inmediatamente genera una pantalla con campos de datos extra para
agregar al archivo; el dato faltante a este registro el cual es la fecha de admisión o
ingreso del paciente y el motivo que empatarán con los datos de interés para la
vigilancia de la RAM; por lo que se deberán seguir los siguientes pasos:
1) Seleccionar “Admission date”

2) Corroborar que se encuentren seleccionados:
a. Exportar el nuevo archivo.
b. Mostrar en la lista de campos.
3) Oprimir Aceptar.
61
Este proceso deberá ser repetido para el rubro correspondiente a motivo, usted
corrobora que ambos rubros tanto “admisión date” y “motivo” aparezcan en la lista,
datos conforme se estableció en el apartado de “Homologación del Registro de
Datos de los Laboratorios de Microbiología”.
Ahora es momento de cargar los datos de su archivo en el lado derecho de la

pantalla para lograr empatar los datos con la lista predeterminada.
1) Oprimir en seleccionar un archivo de datos ejemplo.

2) Seleccionar la localización en su computadora del archivo descargado (txt).
En este punto se observa de lado izquierdo la lista predeterminada y del lado

derecho la lista de su archivo que permitirá empatar con el nuevo archivo. De no
visualizar este archivo deberá regresar al Paso 1.- Explorando el archivo con ajuste
con Excel ya que probablemente el delimitador o el orden de los datos no sea el
correcto; o los datos en la configuración de la estructura no fueron correctos.
62
Definir la relación entre los campos de WHONET y los datos de su archivo; es

probable que si en el equipo automatizado no se han homologado los datos de
entrada de muestras pueda tener algunos datos que no empaten; sin embargo
posterior a la homologación de datos estos siempre deberán estar presentes.
Por otro lado para evitar generar dificultad al generar el listado algunos datos no
considerados quedarán como <ninguno>. Para realizar el empate deberá realizar lo
siguiente:
1) Oprimir en un campo WHONET a la izquierda.

2) Seleccionar en el correspondiente al campo de la derecha.
3) Confirmar mediante “Clic” en el signo “=”.
Ejemplo: “Nombre completo” a la izquierda y “Patient Name” a la derecha y “=”; esto

genera en la pantalla de la izquierda la siguiente equivalencia “Nombre
completo=Patient Name”. Lo cual se deberá generar con cada uno de los datos
solicitados en el apartado de “Homologación del Registro de Datos de los
Laboratorios de Microbiología”.
Hay que recordar que algunos archivos previo a la homologación de datos no

tendrán todos los archivos y estos deberán quedar como <ninguno> y posterior a
esta homologación todos deberán tener un asignado.
Ejemplo: Este es un archivo sin estructura estandarizada a la Homologación por lo

que podrán observar que existirán datos que no tendrán correspondencia; sin
63
embargo una vez homologado los registros en el equipo estos deberán ser
empatados en su totalidad.
Una vez homologados los datos en los equipos al momento del registro usted
deberá visualizar esta relación. (Recordando que la pantalla de la derecha será
variable según esté asignado en su unidad ya que algunos nombres podrán estar
en inglés como en el ejemplo previamente comentado. (Tabla 8)
TABLA 8. Homologación de datos en BacLink
Pantalla Izquierda: Pantalla derecha: (Dato correspondiente

según reporte de su equipo)
Número de identificación NSS.
Apellido <Ninguno de los siguientes>
Nombre <Ninguno de los siguientes>
Nombre completo Nombre del paciente
Sexo Género del paciente.
Fecha de nacimiento (D/M/Y) Fecha de nacimiento (día/mes/año)
Edad Edad ó <Ninguno de los siguientes>
Localización Servicio del paciente
Servicio <Ninguno de los siguientes>
64
Admission date Fecha de ingreso(día/mes/año)
Número de muestra <Ninguno de los siguientes>
Fecha de muestra Fecha de entrega de muestra

(día/mes/año)
Motivo de muestra Diagnóstico. (Ver Anexo 1)
Número de aislamiento <Ninguno de los siguientes>
Microorganismo Microorganismo reportado
Comentario IAAS
Antibiótico 1 (No definido) Definir antibiótico. (ver apartado

correspondiente)
Si comete un error, puede utilizar la opción “ninguno de los siguientes” para eliminar
la coincidencia. Ahora hará coincidir los campos de antibióticos. En la parte inferior
de la lista izquierda verá un opción “Resultado de antibiótico 1”; dado que con la
estandarización de reporte de antibiótico como se especifica en el apartado de
“Homologación del Registro de Datos de los Laboratorios de Microbiología”; para
agregar el número de antibióticos deberá hacer lo siguiente:
1) Clic en agregar y deberá agregar un total de 29 antibióticos establecidos en

la siguiente lista los cuales son de interés. (Tabla 9)
TABLA 9. Antibióticos de interés para vigilancia RAM
Antibiótico por AwARE Código Nombre WHONET

WHONET
Amikacina AMK30 Amicacina (CLSI, EUCAST-30µg)
Amoxicilina AMX30 Amoxicilina (CLSI-30µg)
Amoxicilina ácido clavulánico AMC20 Amoxicilina/Ácido clavulánico (CLSI,

EUCAST (Most bacteria)-20/10µg)
Ampicilina AMP10 Ampicilina (CLSI, EUCAST

(Enterobactereales)-10µg)
Penicilina PEN10 Penicilina G (CLSI, DIN,SRGA-10 unit)
65
Clindamicina CLI2 Clindamicina (CLSI, EUCAST-2µg)
Dicloxacilina OXA1 Oxacilina (CLSI, EUCAST-1µg)
Cefoxitin FOX30 Cefoxitina (CLS,EUCAST-30µg)
Doxiciclina DOX30 Doxiciclina(CLSI, SRGA,BSAC-30µg)
Gentamicina GEN10 Gentamicina (CLSI,EUCAST-10 µg)
Nitrofurantoina NIT300 Nitrofurantoina (CLSI-300µg)
Tetraciclina TCY30 Tetraciclina (CLSI, EUCAST-30µg)
Trimetoprima y SXT1.2 Trimetoprima/sulfametoxazol (CLSI,

sulfametoxazol EUCAST-1.25/23.75µg)
Cefepime FEP30 Cefepime (CLSI, EUCAST-30µg)
Cefotaxima CTX30 Cefotaxima (CLSI, SRGA, BSAC-30µg)
Ceftazidima CAZ30 Ceftazidima (CLSI, SRGA, BSAC-30µg)
Ceftriaxona CRO30 Ceftriaxona (CLSI, EUCAST-30µg)
Cefuroxima CXM30 Cefuroxima (CLSI, EUCAST-30µg)
Ciprofloxacino CIP5 Ciprofloxacino (CLSI, EUCAST-5µg)
Eritromicina ERY15 Eritromicina (CLSI, EUCAST-15µg)
Ertapenem ETP10 Ertapenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Imipenem y cilastatina IMP10 Imipenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Levofloxacino LVX5 Levofloxacino (CLSI, EUCAST-5µg)
Meropenem MEM10 Meropenem (CLSI, EUCAST-10µg)
Moxifloxacino MFX5 Moxifloxacina (CLSI, EUCAST-5µg)
Piperacilina/tazobactam TZP100 Piperacilina/tazobactam (CLSI-

100/10µg)
Vancomicina VAN30 Vancomicina (CLSI, AFA-30µg)
Linezolid LNZ30 Linezolid (CLSI-30µg)
Colistimetato COL10 Colistín (CLSI, EUCAST-10µg)
66
Para el empate de antibióticos seguirá la misma secuencia para cada uno de los
antibióticos. Importante hay que especificar que será UNO a UNO; esto es
importante recalcar que el ingreso y definición de antibióticos uno a uno será
únicamente en aquellos que en el formato Excel contaban con información de
manera horizontal es decir (“una sola fila/secuencia fija de antibióticos”), en aquellos
que sus datos se encontraban de manera vertical (Más de una fila/ secuencia de
antibióticos variable”), solo definiremos el primer antibiótico y el resultado
correspondiente a MIC. Se ejemplifica los archivos con antibiótico (“una sola
fila/secuencia fija de antibióticos”)
● Dar clic en un campo WHONET a la izquierda. “Resultado de antibiótico 1”.

● Dar Clic en el correspondiente al campo de la derecha. “AN- Amikacina”
● Confirmar mediante Clic en el signo “=”.
Esto se hace secuencialmente hasta completar los 29 antibióticos de la lista
establecida. Al agregar los datos usted podrá observar en la pantalla izquierda
“Resultado de antibiótico 1(No definido) = AM-Ampicilina=”, Puede existir que no
logre empatar algún antibiótico ya que el equipo no corre este antibiótico por lo que
quedará en “Resultado antibiótico 5 (No definido) = <Ninguno>”.
1) Seleccionar antibiótico.
2) Clic en definir.
Inmediatamente se presentará una pantalla para definir el tipo de antibiótico para

aquellos que se empataron, algunos inmediatamente presentan la sugerencia a
definir; aquellos que no podrá realizar la búsqueda y deberá empatarlos con los
mismo establecidos en la tabla de antibióticos.
67
1) En el buscador podrá buscar los antibióticos correspondientes y deberá

seleccionar el correspondiente a la tabla.
2) Clic en aceptar.
En el apartado de “Homologación del Registro de Datos de los Laboratorios de

Microbiología”; se anexaron los antibióticos de importancia; se anexan nuevamente
los datos para selección uno a uno de los antibióticos.
De esta manera realizará la configuración de los 29 antibióticos establecidos

recordando que en caso de no encontrarse dicho antibiótico quedará como (No
definido) =<Ninguno>. Al empatar todos los rubros concluimos el apartado de
campo de datos con clic en Aceptar.
68
En caso de que su archivo fue en caso horizontal (Más de una fila/ secuencia de
antibióticos variable”), en la pantalla solo observará nombre antibiótico 1,
seleccionara el rubro correspondiente a antibiótico y en el resultado 1 el valor
correspondiente a la MIC; más tarde se tendrán que definir códigos los cuales
solicitará automáticamente BacLink. Concluir con Aceptar.
69
Al completar la estructura del archivo deberá concluir dando Clic en Aceptar.
Ahora será momento de guardar la configuración mediante clic en Guardar, el

archivo guardado será en formato “.cfg” esto se genera automáticamente. Una vez
guardado dar clic en Salir.
70
XII.EJECUTAR LA CONVERSIÓN
Una vez completado el formato es momento que BacLink haga la conversión de los
datos para esto el formato del archivo estará cargado y se continuará con los
siguientes pasos.
Paso 1. Definir archivo y destino de guardado para posteriormente ser

utilizado en WHONET.
1) Formato de archivo.
a. Nombre: Seleccionar “Examinar” y agregar el archivo de texto extraído en el
equipo.
2) Nuevo archivo de datos.
a. Nombre: Seleccionar “Examinar” y definir la carpeta donde se guardará el
archivo.
b. Formato de archivo: Seleccionar “WHONET SQLite”.
3) Clic en comenzar conversión.
BacLink mostrará los resultados de la conversión de los primeros tres aislamientos

en el archivo de datos original; el propósito es permitirle inspeccionar visualmente
la precisión de la conversión.
● Primero concentrarse en la columna del medio para ver si BacLink está

leyendo los valores de los datos correctamente y verifique la columna final para ver
si BacLink está convirtiendo los valores correctamente.
71
● En este ejemplo podrán existir rubros en blanco en los que no se agregó por
falta de información; en caso de no ser coincidente los rubros mínimos necesarios
previamente mencionados regresar a la estructuración del archivo para ver
coincidencias de empate.
● En caso de que su archivo fuese horizontal (Más de una fila/ secuencia de
antibióticos variable”), puede no observar el resultado de antibióticos los cuales
tendrá que definir posteriormente.
● Dar clic en Siguiente 3 veces para que inicie el análisis completo.
Al revisar los tres casos ejemplo para su análisis observará que inicia a correr un
análisis el cual deberá completar hasta mencionar lo siguiente:
● La conversión ha finalizado.
● Tiempo transcurrido
● Número de aislamientos.
72
Dar Clic en continuar y a continuación emergerá una pantalla la cual le preguntará

lo siguiente ¿Quiere revisar los nuevos códigos?; a lo que seleccionaremos “Si”.
Esto mostrará una pantalla donde se resumen los códigos desconocidos por
BacLink y habrá que definirlos similar a los campos previamente establecidos; se
especifica que solo se definirán los cultivos de interés, localizaciones y
microorganismos de interés mencionados en el apartado de “Homologación del
Registro de Datos de los Laboratorios de Microbiología”; al igual que con los
antibióticos seleccionaremos Definir códigos y posteriormente definir códigos.
73
Esta definición ocurrirá para aquellos valores no definidos lo más frecuentes será la
definición de los microorganismos, tipo de muestra y localización, aunque en caso
de contar con un archivo horizontal (Más de una fila/ secuencia de antibióticos
variable”), puede ser necesario definir los códigos de los antibióticos; para este
proceso se seleccionarán el código desconocido y se definirá el código faltante; al
igual que los antibióticos se tendrá que consultar el apartado de “Homologación del
Registro de Datos de los Laboratorios de Microbiología” y sus Anexos para dar
cumplimiento a los datos mínimos necesarios para homologar los datos
desconocidos. (Tabla 10)
Ejemplo: En este ejemplo se definen códigos de microorganismos el cual puede ser

buscado mediante nombre o código una vez seleccionado damos clic en aceptar.
74
TABLA 10. Microorganismos de vigilancia RAM
Microorganismo Código Whonet Nombre WHONET
Enterococcus faecium efm Enterococcus faecium
Staphylococcus aureus sau Staphylococcus aureus
Klebsiella pneumoniae kpn Klebsiella pneumoniae
Acinetobacter baumannii aba Acinetobacter baumannii
Pseudomonas aeruginosa pae Pseudomonas aeruginosa
Escherichia coli eco Escherichia coli
Streptococcus Streptococcus
spn
pneumoniae pneumoniae
En algunos microorganismos podrán aparecer subespecies en el nombre del

microorganismos (Staphylococcus aureus ss aureus, Klebsiella pneumoniae ss
75
pneumoniae); sin embargo sólo se seleccionarán microorganismo y su especie

(Staphylococcus aureus). Recordando que debe buscar los nombres de estos
microorganismos y sus claves; como se mencionó asociado a estos 7 principales
microorganismos, sin embargo se deberá homologar todo el catálogo mencionado
en el anexo de catálogo de microorganismos.
Esta definición de códigos también puede solicitar la definición de muestras, tipos

de localización, microorganismos, diagnósticos las cuales se generan con la misma
dinámica que para los microorganismos recordando los códigos establecidos en el
apartado de “Homologación del Registro de Datos de los Laboratorios de
Microbiología” y sus anexos.
La definición de la localización o servicio solicitará los códigos los cuales de igual

manera se establecieron en el apartado de “Homologación del Registro de Datos de
los Laboratorios de Microbiología” y sus anexos; sin embargo solicitará de igual
manera un apartado de tipo de localización los cuales deberán ser anexados como
se especifica en la tabla (servicios y tipo de localización). (Tabla 11)
TABLA 11. Servicios ajustados para vigilancia RAM
Tipo de Tipo de Servicios

Localización por Tipo de
servicios. localización Código
servicios IMSS. localización.
WHONET. WHONET WHONET.
Medicina Interna,
Dermatología,
Endocrinología, Medicina. Internado Med in
Reumatología,
Geriatría, etc.
Cirugía general,
cirugía pediátrica,
angiología, Cirugía. Internado Sur In
oncología
quirúrgica.
Trasplante de Servicio de
Internado Tran In
médula ósea. Trasplante.
Traumatología y
Traumatología. Internado Trm In
ortopedia.
Unidad de
cuidados
UCIA Internado Aicu In
intensivos para
adultos.
76
Unidad de
cuidados
UTIP Internado Picu In
intensivos
pediátricos.
Unidad de
cuidado
UCIN Internado Nicu In
intensivo
neonatal.
Área de quemados. Quemados. Internado Burn In
Ginecología y Obstetricia/Gine
Internado obg In
Obstetricia. cología.
Pediatría. Pediatría. Internado Ped In
Infectología. Infectología. Internado Inf In
Hematología y Hematología/On
Internado Hao In
Oncología Médica. cología
Urgencias. Urgencias. Ambulatorio Eme Out
Laboratorio. Laboratorio. Laboratorio Lab Lab
Unidad de medicina
familiar, consulta Otra clínica. Ambulatorio Cli Out
externa, etc.
Otra unidad. Otro Hospital. Otro Hos unk
No se menciona. Desconocido. Desconocido unk unk
Una vez que se completen la definición de los principales códigos completará el

proceso dando clic en continuar.
77
Nuevamente dar comenzar conversión para actualizar los códigos definidos, lo más
probable es que vuelva a solicitarle definir los datos faltante sin embargo; al no ser
rubros de interés daremos clic en continuar y daremos por finalizado la generación
del archivo a WHONET importante recordar que el archivo generado será en
formato WHONET(SQLite) para su localización posterior.
XIII.GENERACIÓN DE UN LABORATORIO EN WHONET.
La importancia de crear un laboratorio virtual en la plataforma WHONET; es para

general un análisis homologado de la información de los sistemas de vigilancia o
78
información otorgada por los laboratorios de microbiología clínica; por lo que el

primer paso para poder generar un reporte es crear un laboratorio compatible con
el formato de datos GLASS o un solo laboratorio "nacional" que se pueda utilizar para
analizar y administrar datos.
Antes de generar un reporte se deberá generar un laboratorio el cual solo se genera

en una ocasión y servirá para continuar con los siguientes reportes solicitados. Esto
se agrega para conocimiento y pueda ayudar en cada una de las unidades el análisis;
sin embargo se buscará únicamente contar con el archivo SQLite para ser
procesado posteriormente en un único laboratorio a nivel nacional.
Paso 1. Configuración de un laboratorio WHONET.

Este paso permitirá relacionar los datos ya previamente estandarizados en BacLink
para su análisis posterior y delimitará el resto de los datos no definidos.
1. Clic en Nuevo laboratorio.
Al seleccionar se generarán pestañas similares a las trabajadas iniciaremos con los

datos generales del laboratorio:
1) País: seleccionar México.

2) Nombre del laboratorio: será el nombre de Hospital Completo (ejem; Hospital
General Regional 215).
3) Código de laboratorio: será el número de Hospital (ejem; 251).
79
4) Seleccionar Humano.
Paso 2. Configuraciones de antibióticos.

En este paso se seleccionarán las normas, metodología y antibióticos que servirán
para el reporte; al igual que en BacLink se seleccionarán los 29 antibióticos
establecidos.
1) Normas: Seleccionar CLSI 2023 (Estados Unidos)

2) Metodología: Seleccionar CIM.
3) En la pantalla izquierda buscará uno a uno cada antibiótico, seleccionando y
posteriormente clic en la flecha (-->) para agregar y estos irán apareciendo en la
pantalla derecha como se observa en el ejemplo.
4) Es posible que al agregar el antibiótico en algunos casos pueda aparezca una
alarma de error, al cual dará clic en Aceptar; y solo corroborará que sea correcto el
antibiótico seleccionado.
80
Al completar el procedimiento usted podrá obtener una pantalla similar la cual

incluye los 29 antibióticos establecidos en el apartado de “Homologación del
Registro de Datos de los Laboratorios de Microbiología”; para dar concluido este
proceso dar clic en Aceptar.
81
Paso 3. Configuración de localizaciones.
Ahora se definirán las localizaciones para ajustarse las localizaciones de los

pacientes al igual que se realizó en BacLink; para esto ahora deberá dar clic en
Localizaciones.
82
Estos archivos deben agregarse uno a uno tal y como se observa en la pantalla, con
base a los datos establecidos en el apartado de “Homologación del Registro de
Datos de los Laboratorios de Microbiología”; estos deberán escribirse manualmente
en cada columna y deberá encontrarse como se observa en la pantalla.
En este caso al ser opcionales el apartado de campo de datos y alertas; omitiremos

el registro y daremos clic en Guardar.
83
Con este paso se concluirá la generación de laboratorio para pasar a generar un

reporte de RAM.
1. GENERACIÓN DEL REPORTE RAM.
El trabajo previamente realizado se culmina generando un reporte RAM, estos se

tomarán de los archivos previamente ajustados en BacLink y con el laboratorio
creado el primer paso será seleccionar el laboratorio creado y dar clic en Abrir.
Inmediatamente quedará una pantalla en gris en donde en la parte superior

seleccionara Análisis de datos y en la ventana de apertura nuevamente Análisis de
datos; con apertura de una ventana “Análisis de datos: (Nombre de laboratorio).
84
85
Paso 1. Tipo de análisis.
Al seleccionar el Tipo de análisis se abrirán dos pestañas en las cuales se deben

seleccionar las variables de interés para generar los reportes.
Dentro de esta pestaña nos interesan dos pestañas donde generamos el reporte
establecidos:
● Listado de aislamientos y resumen.

● %RIS y medidas de las pruebas. (este solo en caso de que cada unidad quisiera
generar un reporte de sensibilidades; este reporte otorga en automático el
porcentaje; para fines de reporte y vigilancia RAM únicamente generamos el reporte
mediante la pestaña de Listado de aislamientos y resumen)
A continuación especificaremos los tipos de reportes a generar para su análisis
posterior.
86
1. Reportes demográficos.
Paso 1.- Reporte de general de RAM.
Una vez seleccionado el tipo de análisis pasaremos a selección de análisis de uno

de los dos reportes demográficos.
1) Seleccionar pestaña de Listado de aislamiento y resumen.

2) Formato para los informes: Seleccionar Listado.
3) Opciones: Seleccionar interpretaciones de las pruebas
4) Clic en Aceptar.
Paso 2.- Selección de microorganismos.
Para este paso seleccionaremos los microorganismos de estudio o los codificados

dentro del ajuste en el apartado de “Homologación del Registro de Datos de los
Laboratorios de Microbiología” y sus anexos.
87
1) En la selección de microorganismos se realizará lo siguiente:

2) Lista de microorganismos de WHONET: Seleccionar Grupos de
microorganismos o lista en caso de seleccionar de manera individual los
microorganismos de interés.
3) De la lista de la izquierda selecciona en caso de lista extendida
microorganismo por microorganismo y en caso de grupo de microorganismos ALL
Todos los microorganismos o GM+ o GM-.
4) Pasar a lista derecha mediante clic -->.
5) Clic en aceptar.
Como se mencionó esto será en caso de que la unidad quisiera generar su reporte
de lo contrario la información se concentrará con los archivos SQLite.
88
Paso 3.- Archivo de datos.
En este paso se cargará el archivo generado en BacLink para que WHONET haga el
reporte de este; mediante clic en Archivo de datos.
1) Nombre: seleccionar el tipo de archivo a reconocer SQlite (*.sqlite)

2) En la primera pantalla se despliegan las localizaciones de archivos deberá
buscar la ubicación de este y aparecerán en la pantalla de en medio.
3) Seleccionar el archivo a analizar.
5) Clic en aceptar.
89
Paso 4.- Comenzar análisis.
Una vez estructurado los apartados de tipo de análisis, microorganismos y

archivo seleccionar “Comenzar análisis”.
90
El equipo comenzará el análisis y posteriormente generará la siguiente pantalla

donde se resume el análisis para poder anexar los datos a la base general se deberá
grabar el resultado en formato Excel dando clic en el icono de grabar tabla muy
importante que se selecciones “mostrar columnas ocultas”; que muestra todos los
datos del archivo.
2. Reportes de RAM.
Los reportes de RAM estarán basados en porcentajes de sensibilidad de los

microorganismos este deberá generarse por microorganismos Gram negativos y
Gram positivos ya que el panel de cobertura de antibióticos es diferente en ambos
grupos. En este reporte se realizaron 2 reportes, uno para Gram negativos y uno
para Gram positivos.
Paso 1.- Reporte de RAM por sensibilidad.
Una vez seleccionado el tipo de análisis pasaremos a selección de análisis de uno

de los dos reportes de microorganismos.
1) Seleccionar pestaña de %RIS y medidas de las pruebas.

2) Formato para los informes: Seleccionar Resumen y Tablas.
91
3) Resumen colocar las variables a requerir para su relación. (ejemplo, edad,

tipo de muestra, fecha)
4) Columnas: seleccionar % de sensibles
5) Antibióticos: Seleccionar Todos los antibióticos.
6) Opciones: Seleccionar Porcentaje de aislamientos.
7) Histogramas: Seleccionar puntos de corte.
8) Clic en Aceptar.
Paso 2.- Selección de microorganismos.
Para este paso seleccionaremos los microorganismos de estudio como se realizó en

el reporte previo pudiendo ser por Gram negativos y/o Gram positivos.
92
En la selección de microorganismos se realizará lo siguiente:
1) Lista de microorganismos de WHONET: Seleccionar Grupos de

microorganismos.
2) De la lista de la izquierda selecciona GM+ Microorganismos Gram positivos o
GM- Microorganismo Gram negativos según sea el caso o individualmente o todos
los microorganismos.
4) Clic en aceptar.
93
Paso 3.- Archivo de datos.

En este paso se cargará el archivo generado en BacLink para que WHONET haga el
reporte de este; mediante clic en Archivo de datos.
1) Nombre: seleccionar el tipo de archivo a reconocer SQlite (*.sqlite)

2) En la primera pantalla se despliegan las localizaciones de archivos deberá
buscar la ubicación de este y aparecerán en la pantalla de en medio.
3) Seleccionar el archivo a analizar.
5) Clic en aceptar.
94
Paso 4.- Comenzar análisis.
Una vez estructurado los apartados de tipo de análisis, microorganismos y archivo

seleccionar “Comenzar análisis”.
El equipo comenzará el análisis y posteriormente generará la siguiente pantalla

donde se resume el análisis para poder anexar los datos a la base general se deberá
grabar el resultado en formato Excel dando clic en el icono de grabar tabla muy
importante que se selecciones “mostrar columnas ocultas”; que muestra todos los
datos del archivo.
95
Estos serán los archivos Excel que otorga para su conocimiento y análisis en caso
de realizarlo de manera individual en cada unidad.
Estas tablas finales en Excel son el producto final de un análisis los cuales
posteriormente serán conjuntados para generar un reporte RAM a nivel nacional
que permita dar vigilancia a esta problemática de salud pública que genere un
diagnóstico situacional, y fomente estrategias de mitigación de este problema.
96
ANEXO 1
CATÁLOGO DE DIAGNÓSTICOS INFECCIOSOS DEL
PACIENTE
Los diagnósticos infecciosos son diversos y variados con base al catálogo CIE-10; esto
puede generar confusión al registro de datos por lo que tomando la metodología
de estudio de prescripción de la Encuesta de Prevalencia Puntual sobre Uso de
Antibióticos en Hospitales. OPS/OMS, 2021-23; se ha considerado una opción para
limitar el número de diagnósticos y este pueda ser estandarizado; por lo que el
Instituto Mexicano del Seguro Social adopta estos rubros diagnósticos y se empatan
con los tipos de cultivo que favorezcan el correcto llenado de este ítem. Agregando
otro para aquellos cultivos que no puedan delimitarse.
Diagnóstico Tipo de cultivo probablemente

Ejemplos
en Código enlazado
CNS Líquido cefalorraquídeo. Infecciones del sistema nervioso central
EYE Otro. Endoftalmitis
Exudado faríngeo y Exudado Infecciones de oído, nariz, garganta, laringe
ENT
Nasal. y boca
Bronquitis aguda o exacerbaciones de
BRON Bronquiales.
bronquitis crónica
PNEU Bronquiales. Neumonía
CF Otros. Fibrosis quística
Infecciones cardiovasculares: endocarditis,
CVS Tejido corazón.
injerto vascular
Infecciones gastrointestinales (por ej.,
GI Heces.
salmonelosis, diarrea asociada a antibióticos)
Absceso y/o Líquidos Sepsis intraabdominal, incluyendo
IA
abdominales. hepatobiliar
Infección en el sitio de inyección que
SST-SSI Heridas. (Punción aspiración)
involucra piel o tejido blando pero no hueso
Celulitis, heridas, tejido blando profundo que
SST-O Heridas. (Punción aspiración) no involucra hueso, no relacionados con
cirugía
Artritis séptica, osteomielitis en el sitio
BJ-SSI Líquido articular.
quirúrgico
Artritis séptica, osteomielitis, no relacionado
BJ-O Tejido o Líquido articular.
con la cirugía
Urocultivos. (muestras Infección sintomática de las vías urinarias
CYS
ambulatorias) inferiores (ej., cistitis)
Urocultivos. (muestras de Infección sintomática de las vías urinarias
PYE
hospitalización) superiores (ej, (pielonefritis)
97
Urocultivos. (muestras
ASB Bacteriuria asintomática
ambulatorias)
Infecciones obstétricas o ginecológicas, ITS
OBGY Exudado Vaginal
en mujeres
Exudado uretral y/o Prostatitis, orquitis y epididimitis, ITS en
GUM
Espermocultivo. hombres
BAC Hemocultivos, y puntas de catéter. Bacteriemia confirmada por laboratorio
Sepsis clínica (sospecha de infección del
torrente sanguíneo sin confirmación de
Hemocultivos, y puntas de catéter.
laboratorio/resultados no disponibles, no se
CSEP (sin otro diagnóstico
realizaron cultivos de sangre o cultivo
documentado)
sanguíneo
negativo), excluyendo neutropenia febril
Neutropenia Febril u otra forma de
Hemocultivos (Pacientes manifestación de infección en huésped
FN
oncológicos) inmunocomprometido (ej., VIH,
quimioterapia, etc.) sin sitio anatómico claro
Hemocultivos. (sin otro Respuesta inflamatoria sistémica sin sitio
SIRS
diagnóstico documentado) anatómico claro
Completamente indefinido; sitio sin
UND Desconoce
inflamación sistémica
No aplicable, uso de antimicrobianos que no
NA No mencionado
sea tratamiento
Este empate de información se hizo con base a los cultivos disponibles en la mayoría
de las unidades; no olvidando que la asociación del tipo de cultivo a la enfermedad
es una probabilidad para facilitar el registro de la información, sin embargo no
necesariamente puede confirmar la infección (ejemplo colonizaciones de pacientes,
bacteriuria asintomática); por tal motivo en este esfuerzo inicial tratamos de
estandarizar los datos y como rubro importante es identificar IAAS de manera
estratégica por su alto impacto en la salud.
Importante mencionar que el cultivo no orienta al diagnóstico se deberá ajustar con

el diagnóstico probable documentado en la solicitud.
98
ANEXO 2
CATÁLOGO DE TIPO DE MUESTRAS
Infecciones
Tipo de Descripción Nombre
Grupo anatómico asociadas o
muestra específica WHONET
Diagnósticos
Hemocultivo
Hemocultivo Catéter central
tomado de acceso
central (cc)
central.
Bacteriemia.
Hemocultivo
Sepsis sin foco.
Hemocultivo tomado de sitio
Sangre (sa) Infección
periférico de punción
relacionada a
periférica.
catéter.
Punta de catéter.
Endocarditis.
(5cm punta) +
Cardiovascular. Punta de Otros.
hemocultivo Catéter (ca)
“Sangre” catéter
central previo al
retiro
Tejido: Corazón, Mediastinitis.
Tejido. Corazón. (cr)
válvula cardiaca Endocarditis.
Cultivo tomado en
botella de
Mielocultivo Infecciones
Mielocultivo hemocultivo y
(mo) hematológicas.
aspiración de
médula ósea.
Punción lumbar,
Líquido Cefalorraquídeo. Infecciones de
LCR, tomada de
cefalorraquídeo (ce) SNC.
ventriculostomía.
Líquido de
cavidad Peritonitis
Líquido de
peritoneal, Diálisis. (di) asociada a
diálisis
distinguir del diálisis.
líquido de diálisis
Empiema, o
líquido tomado
Líquido pleural Pleural. (lp) Derrame pleural.
Líquidos o fluidos por punción
pleural.
Infecciones
intraabdominale
Líquido de origen s.
abdominal que no Sepsis
Líquido Abdominal.
se especifica el abdominal.
abdominal (ab,ad,ao)
origen (biliar, Perforación
páncreas, etc). Intestinal.
Absceso
abdominal.
Infecciones de
Líquido Líquido por
Fluido articular. herida
Osteoarticular articular o punción articular.
(ft p rd) quirúrgica.
sinovial
Osteomielitis.
99
Artritis séptica.
Infecciones de
herida
quirúrgica.
Por Punción
Piel y tejidos Herida Herida (ha) Celulitis.
aspiración.
Infecciones de
piel y tejidos
blandos.
Aspirado Neumonía
Aspiración
bronquial, lavado Bronquial (br) asociada a
bronquial
bronquial. ventilación.
Respiratorio Expectoración Expectoración. Esputo (es) Neumonía.
Exudado Nasal Exudado nasal. Nariz (na) Colonización.
Exudado Exudado
Faríngeo (fa) Faringitis.
nasofaríngeo nasofaríngeo.
Por punción o
Líquido biliar Bilis (Bi) Colangitis.
quirúrgico.
Digestivo Solo muestra de
Gastroenteritis
Coprocultivo evacuación Heces (He)
Infecciosa.
líquida.
Exudado Exudado vaginal.
Vagina (va) Vaginosis.
vaginal Consulta externa
Reproductor Exudado uretral Exudado uretral. Uretra (ur) Uretritis.
Espermocultivo Espermocultivo. Semen (sm) Uretritis.
Urocultivo CH ½,
Infección de vías
Orina Urocultivo punción y/o Orina (or)
urinarias.
sonda.
Absceso (de Abscesos
cualquier origen) cutáneos.
Abscesos Abscesos (as)
indicar sitio de Abscesos
toma de muestra hepáticos.
Infección
Biopsia de Secreciones (No
Biopsia (bx) dirigida a
tejido muestren origen)
biopsia.
Control de Control de calidad
Control de
calidad (interno realizados por el Laboratorio.
calidad (qc)
y externo) hospital.
Muestras
Otros Ambientales. ambientales Superficies
Epidemiología.
(superficies) solicitadas por (surf)
epidemiología.
Cultivo de
Alimentos Alimento (al) Epidemiología.
alimentos.
Tejido enviado
para estudio.
Según el tejido
Biopsia Muestra de 1 cm Biopsia
solicitado.
cúbico
aproximadamente
Otros Desconocido Desconocido Desconocido
100
ANEXO 3
CATÁLOGO DE MICROORGANISMOS
Este catálogo se seleccionó como otros agentes de importancia y de vigilancia;

recordar que al momento del registro deberá localizar todos los microorganismos
similares a los mencionados como principales y así como el resto de la lista.
Código
Objetivos Microorganismo Nombre WHONET
WHONET
Enterococcus faecium efm Enterococcus faecium
Staphylococcus aureus sau Staphylococcus aureus
Klebsiella pneumoniae kpn Klebsiella pneumoniae

Principale
s de Acinetobacter baumannii aba Acinetobacter baumannii
interés
Pseudomonas aeruginosa pae Pseudomonas aeruginosa
Escherichia coli eco Escherichia coli
Streptococcus pneumoniae spn Streptococcus pneumoniae
Enterococcus faecalis efa Enterococcus faecalis
Streptococcus beta-hem Grupo

Streptococcus agalactiae bsb
B
Gram Streptococcus beta-hem Grupo

Streptococcus pyogenes bsa
positivos A
Staphylococcus epidermidis sep Staphylococcus epidermidis
Staphylococcus haemolyticus shl Staphylococcus haemolyticus
Staphylococcus hominis sho Staphylococcus hominis
Enterobacter cloacae ecl Enterobacter cloacae
Salmonella spp Sal Salmonella spp
Shigella spp shi Shigella spp
Gram Klebsiella oxytoca kox Klebsiella oxytoca

negativos Acinetobacter calcoaceticus aca Acinetobacter calcoaceticus
Acinetobacter lwoffii alw Acinetobacter lwoffii
Pseudomonas putida ppu Pseudomonas putida
Stenotrophomonas maltophilia pma Stenotrophomonas maltophilia
101
Proteus mirabilis pmi Proteus mirabilis
Morganella morganii mmo Morganella morganii
Serratia marcescens sma Serratia marcescens
Candida auris crs Candida auris
Candida albicans cal Candida albicans
Candida parapsilosis cpa Candida parapsilosis

Hongos
Candida krusei ckr Candida krusei
Candida tropicalis ctr Candida tropicalis
Candida glabrata cgl Candida glabrata
102
XV.BIBLIOGRAFÍA.
1) Organización Mundial de la Salud. (Internet) Plan de Acción Mundial Sobre la

Resistencia a los Antimicrobianos. OMS;(Citado 01 de septiembre de 2023).
Recuperado a partir de:
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255204/9789243509761-spa.pdf.
2) Organización Mundial de la Salud (Internet). OMS; (Citado 01 de septiembre

de 2023). Recuperado a partir de: https://www.who.int/es/news/item/29-04-2019-
new-report-calls-for-urgent-action-to-avert-antimicrobial-resistance-crisis.
3) ACUERDO por el que se declara la obligatoriedad de la “Estrategia Nacional

de Acción contra la Resistencia a los Antimicrobianos”. Diario Oficial de la
Federación 5 de junio de 2018.
4) Instituto Mexicano del Seguro Social. Lineamiento Técnico Prevención y

control de IAAS (PCI) y Optimización del uso de Antimicrobianos (PROA) del
Instituto Mexicano del Seguro Social. México. 2022.
5) Global antimicrobial resistance and use surveillance system (GLASS) report

2022. Geneva: World Health Organization; 2022. Recuperado a partir de:
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/364996/9789240062702-eng.pdf.
6) World Health Organization. National antimicrobial resistance surveillance

systems and participation in the Global Antimicrobial Resistance Surveillance
(GLASS). A guide to planning, implementation and monitoring and evaluatión.
WHO. (Citado 01 de septiembre de 2023). Recuperado a partir de:
https://www.who.int/publications/i/item/WHO-DGO-AMR-2016.4.
7) Programas de optimización de los antimicrobianos en instituciones sanitarias

de los países de ingresos bajos y medianos. Manual práctico de la OMS
[Antimicrobial stewardship programmes in health-care facilities in low and middle-
income countries. A WHO practical toolkit]. Ginebra: Organización Mundial de la
Salud; 2020.
8) Laxminarayan, Ramanan. 2022. “The overlooked pandemic of antimicrobial

resistance”.The Lancet 399 (10325): 606–7. https://doi.org/10.1016/S0140-
6736(22)00087-3.
9) Boucher HW, Talbot GH, Bradley JS, Edwards JE, Gilbert D, Rice LB, et al. Bad
bugs, no drugs: No ESKAPE! An update from the Infectious Diseases Society of
America. Clin Infect Dis. 2009;48(1):1–12.
103
10) WHO Regional Office for Europe/European Centre for Disease Prevention and
Control. Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2022 – 2020 data.
Copenhagen: WHO Regional Office for Europe; 2022. Global antimicrobial resistance
surveillance system (GLASS) report: early implementation 2020. Geneva: World
Health Organization; 2020.
11) CDC. Antibiotic Resistance Threats in the United States, 2019. Atlanta, GA: U.S.
Department of Health and Human Services, CDC; 2019.
12) Organización Panamericana de Salud. Patógenos multirresistentes que son

prioritarios para la OMS; OMS;(Citado 01 de septiembre de 2023). Recuperado a partir
de: https://www.paho.org/es/noticias/4-3-2021-patogenos-multirresistentes-que-
son-prioritarios-para-
oms#:~:text=Helicobacter%20pylori%2C%20Staphylococcus%20aureus%2C%20Stre
ptococcus,riesgo%20la%20salud%20de%20la
13) CLSI. 2023. M100 Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility

Testing. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Vol. M100-Ed33.
14) Miller, J Michael et al. “A Guide to Utilization of the Microbiology Laboratory

for Diagnosis of Infectious Diseases: 2018 Update by the Infectious Diseases Society
of America and the American Society for Microbiology.” Clinical infectious diseases:
an official publication of the Infectious Diseases Society of America vol. 67,6 (2018):
e1-e94. doi:10.1093/cid/ciy381.
15) Organización Mundial de la Salud. (Internet) Manuel de WHONET Sistema

Mundial de Vigilancia de La resistencia a los Antimicrobianos. OMS; (Citado 01 de
septiembre de 2023). Recuperado a partir de:
https://whonet.org/WebDocs/WHONET_for_GLASS.Spanish.pdf
16) Organización Panamericana de la Salud. Manual Metodología PPS OPS 2021-

2023 versión 1.0. 2021. p. 1–51.
104

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INSTITUTO MEXICANO DEL SEGURO SOCIAL

Guía Institucional para Análisis de

INSTITUTO MEXICANO DEL SEGURO SOCIAL

Director de Prestaciones Médicas

Titular de la Unidad de Planeación e Innovación en Salud

Encargada del Despacho de la Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios

Titular de la División de Laboratorios Especializados

Dr. Germán Alberto Venegas Esquivel

M. en C. Daniel Romero Romero

QBP. Leticia Chávez Navarro

Mtra. Circe Mayelli Coronel Degollado

Dr. Jorge Rafael Gamboa Cerdeña

I. GLOSARIO Y ABREVIATURAS ................................................................................................................... 7

II. INTRODUCCIÓN ........................................................................................................................................... 9

III. ANTECEDENTES ....................................................................................................................................... 10

IV. MARCO NORMATIVO .............................................................................................................................. 12

VI. OBJETIVOS ................................................................................................................................................. 14

VII. ÁMBITO DE APLICACIÓN ..................................................................................................................... 14

VIII. HOMOLOGACIÓN DEL REGISTRO DE DATOS DE LOS LABORATORIOS DE

1. Estandarización del registro de datos del paciente. ....................................................................... 15

2. Estandarización y delimitación del estudio de las muestras de laboratorio .......................... 19

3. Delimitación de los patógenos prioritarios de interés y seguimiento mediante la

4. Delimitación de los antibióticos de interés para su vigilancia de la RAM ............................... 22

IX. EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS EQUIPOS DE MICROBIOLOGÍA ............. 27

1. Extracción Equipo Vitek 2 Compact™ ................................................................................................. 27

2. Extracción Equipo Phoenix BD® .......................................................................................................... 30

3. Extracción MicroScan ............................................................................................................................... 32

X. EXTRACCIÓN DE LAS BASES DE DATOS DE LOS EQUIPOS A TRAVÉS DE INTERFACES ... 36

1. Extracción por REAL .................................................................................................................................. 36

XI. HOMOLOGANDO INFORMACIÓN MEDIANTE BacLink ............................................................... 51

1. Creación de un archivo compatible con WHONET ......................................................................... 51

2. Configurar la conversión ......................................................................................................................... 55

Paso 3. Ajuste de idioma.............................................................................................................................. 56

XII. EJECUTAR LA CONVERSIÓN ............................................................................................................... 71

XIII. GENERACIÓN DE UN LABORATORIO EN WHONET. ............................................................. 78

1. GENERACIÓN DEL REPORTE RAM. ...................................................................................................... 84

1. Reportes demográficos. ........................................................................................................................... 87

2. Reportes de RAM. ...................................................................................................................................... 91

CATÁLOGO DE DIAGNÓSTICOS INFECCIOSOS DEL PACIENTE ..................................................... 97

CATÁLOGO DE TIPO DE MUESTRAS ........................................................................................................ 99

ANEXO 3.......................................................................................................................................................... 101

CATÁLOGO DE MICROORGANISMOS ................................................................................................... 101

XV. BIBLIOGRAFÍA. ................................................................................................................................. 103

AWaRe: ACCESS, WATCH, RESERVE [acceso, precaución, último recurso].

RAM: Resistencia a los antimicrobianos.

IAAS: Infecciones Asociadas a la Atención en Salud. Son aquellas infecciones que

OMS: Organización Mundial de la Salud

MDR: Mutidrogoresistente; basada en la susceptibilidad antibiótica in vitro; se

ESKAPE: Acrónimo para los 6 microorganismos de importancia por sus mecanismos

WHONET: Es una aplicación de escritorio gratuita de Windows para la gestión y

BacLink: Es un software de extensión de WHONET que realiza una conversión y

GLASS: Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System (Sistema

PCI: Prevención y control de infecciones. Es un enfoque práctico basado en la

PROA: Programa de optimización de antimicrobianos. Conjunto integral y

La resistencia antimicrobiana (RAM) se produce cuando los microorganismos como

Los antibióticos pertenecientes al grupo de fármacos antimicrobianos;

La RAM es considerada una amenaza para la salud pública mundial, en 2015 en la

El Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), a través de la Dirección de

Se ha estimado que 700,000 personas a nivel mundial fallecen al año por

En 2015 la OMS lanza el Sistema Global Antimicrobial Resistance and Use

Reforzar la vigilancia en la RAM es fundamental para mejorar la base científica para

El porcentaje estimado de la RAM varía sustancialmente y la interpretación de los