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Señorío Chortí (llamado por varios historiadores como payaqui; se extendió en partes del
municipio de Metapán, gran parte del occidente y centro del departamento de
Chalatenango, y formado también con el departamento guatemalteco de Chiquimula y
parte del suroccidente de Honduras)
Señorío de Cuzcatlán (Señorío náhua pipil; se extendió desde el río Paz hasta el Río
Lempa con algunas excepciones en el recorrido de este último)
Señorío Potón (denominado por los náhuas como Popocatepet; se extendió en toda la
zona oriental, el departamento de Cabañas, y partes de los departamentos de
Chalatenango y San Vicente)2627
Parte de las ruinas de la villa de San Salvador en el valle de La Bermuda (que estuvo
poblada desde su fundación en 1528 hasta 1545, cuando San Salvador se trasladó al valle
de las Hamacas), hoy conocida como el sitio arqueológico Ciudad Vieja
A finales de 1524 o principios de 1525 Pedrarias Dávila (conquistador
de Panamá y Nicaragua) envió a Francisco Hernández de Córdoba a Honduras y este a su
vez envió a Hernando de Soto hacia Olancho pasando por Nequepio (nombre con el que los
indígenas Chorotegas conocían al Señorío de Cuzcatlán), ante esto Pedro de Alvarado envió
a un grupo de hombres liderados por Gonzalo de Alvarado para fundar la villa de San
Salvador; la villa de San Salvador fue fundada por Diego de Holguin y Gonzalo de Alvarado el
1 de abril de 1525 en un lugar desconocido. En 1526 estalló una sublevación indígena que
obligó a abandonar la villa.
Entre diciembre de 1527 a febrero de 1528 Diego de Alvarado fue enviado a conquistar el
Señorío de Cuzcatlán, lo cual logró, posteriormente la villa de San Salvador fue refundada
por Diego de Alvarado en el sitio conocido como Ciudad Vieja, en el valle de la Bermuda, a 8
kilómetros al sur de la actual Suchitoto. Para 1528 se estima un aproximado de 90 pueblos
conquistados y repartidos entre los españoles. Desde 1529 a 1540 Luis de Moscoso, Diego
de Rojas, Pedro de Portocarrero, entre otros capitanes del ejército de Pedro de Alvarado,
prosiguen y ponen fin a la conquista y pacificación de El Salvador.
En 1530, una expedición al mando del capitán Luis de Moscoso termina la conquista de la
zona oriental y fundó la villa de San Miguel de la Frontera. En 1530 Hernando de
Chávez y Pedro Amalín (enviados por Pedro de Alvarado) conquistan el Reino Payaquí y
derrotan a Copán Galel en Cítala, siendo apresado y ejecutado finalmente en La Ermita. 27
En 1537 es vencido Lémpira (líder de una resistencia lenca) en Honduras. En 1540 el área de
El Salvador es pacificada, quedando el actual territorio salvadoreño plenamente controlado
por los españoles.42
Las provincias de San Salvador y San Miguel dentro de la gobernación de Guatemala, antes
de la creación de la Real Audiencia de los Confines en 1542
En los años que siguieron a la conquista, los españoles introdujeron animales y cultivos
europeos en el territorio de El Salvador. Hubo un gran esfuerzo para inculcar la cultura y la
religión de los conquistadores a los indígenas. Las órdenes religiosas, en especial los
franciscanos y dominicos, colaboraron con el Imperio español en el proceso
de evangelización. Se estableció el sistema de la encomienda, para controlar a la población
nativa. Este sistema fue la recompensa que recibió cada conquistador por su servicio a la
Corona.2
La encomienda consistía en la asignación de un número específico de indígenas adultos,
quiénes debían pagarle al encomendero, un tributo en productos o trabajo. Este sistema se
prestó para muchos abusos en contra de los aborígenes. La esclavitud de los nativos fue
expresamente prohibida en 1542, por las Leyes Nuevas. La Corona española estableció la
caducidad de las encomiendas, generalmente después de un período de dos vidas, (es decir,
después de la muerte de la primera generación de descendientes del encomendero), pasando
los indígenas a pagar un tributo directo al Rey. Para el año de 1550 había un total de 168
pueblos (los cuales tenían una población total de 17,500 personas) repartidas entre los
españoles con el sistema de la encomienda.41
Economía de la colonia
Como el territorio salvadoreño carecía de riquezas minerales importantes, la agricultura se
transformó en la base de las actividades económicas. Entre 1550 y 1600, las dos actividades
principales fueron el cultivo del cacao, realizado principalmente en la región de Izalco en el
actual departamento de Sonsonate; y la extracción de la resina del árbol de bálsamo en la
región costera. En el siglo XVII, la siembra del cacao decayó, y fue sustituido por el cultivo del
jiquilite, la planta que sirve de base para la elaboración del colorante del añil.2
Incursiones corsarias
Durante la época colonial ocurrieron tres incursiones de corsarios en el actual territorio
salvadoreño: el primero fue Sir Francis Drake el cual incursionó en dos ocasiones en territorio
salvadoreño (primeramente a inicios de abril de 1579 en el Golfo de Fonseca y posteriormente
en 1586 en el puerto de Acajutla),27 el segundo fue el inglés Thomas Cavendish el cual ancló
en el Golfo de Fonseca en julio de 1587, finalmente la tercera incursión de corsarios en
territorio salvadoreño fue la de un equipo francés liderado por Eduardo Davis, Tomas
Eatan y William Dampier los cuales anclaron en el Golfo de Fonseca en julio de 1684 y
asediaron el pueblo de Santa María de Meanguera provocando el despoblamiento del Golfo.