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I NTRODUCCIÓN A LA M ORFOMETRÍA G EOMÉTRICA

C URSO T EÓRICO -P RÁCTICO

Silvina Van der Molen


(Unidad de Biología y Manejo de Recursos Acuáticos, svandermolen@cenpat.edu.ar)

Rolando González-José
(Unidad de Diversidad, Sistemática y Evolución, rolando@cenpat.edu.ar)

CENPAT- CONICET
Puerto Madryn, Chubut
Argentina

La Morfometría Geométrica, definida como la unión entre la biología y la


geometría, se ha convertido en una herramienta fundamental para el estudio de
estructuras fenotípicas. Su principal innovación teórica radica en un cambio rotundo
en la aproximación al tamaño y la forma de las estructuras bajo estudio. En lugar de
enfocarse en el análisis multivariante de un conjunto de medidas lineales entre
puntos morfométricos, la Morfometría Geométrica propone estudiar los cambios en el
tamaño y la forma a partir del desplazamiento en el plano (2D) o en el espacio (3D)
de un conjunto de puntos morfométricos o “landmarks”. La relación espacial en dos o
tres dimensiones de estos landmarks siempre se conserva a lo largo de todo el
análisis, lo que permite “reconstruir” con tanta precisión como se desee la forma y el
tamaño del espécimen estudiado. Desde comienzos de los años ’90 se han
desarrollado un conjunto de métodos analíticos y gráficos que permiten observar
estos cambios espaciales desde una óptica estadística, un paso fundamental en el
desarrollo de un método biológico. La literatura científica reciente refleja la
aceptación de estos métodos en aquellas disciplinas con una larga historia y
Introducción a la Morfometría Geométrica

tradición en la medición de las formas biológicas. En resumen, la Morfometría


Geométrica brinda una aproximación minuciosa y potente al cambio en la forma, que
promete enriquecer los análisis morfológicos de los próximos tiempos.
En este curso, proponemos una introducción a los principales aspectos teóricos
y prácticos de la Morfometría Geométrica. El curso comprende una primera sección
teórica, donde se repasará brevemente la historia de este método, sus ventajas con
respecto a los métodos clásicos, las principales técnicas y sus aplicaciones a casos
puntuales. La segunda sección comprende los aspectos prácticos de la Morfometría
Geométrica, donde los métodos estudiados se implementan sobre bases de datos
reales y utilizando el software disponible en la actualidad.

¿A QUIÉNES ESTÁ DIRIGIDO EL CURSO ?

El curso está orientado a alumnos avanzados e investigadores en Biología,


Antropología, Paleontología, Geología, Estadística, Matemática y Medicina.

¿C ÓMO ESTÁ ORG ANIZ ADO EL CURSO ?

El curso comprende 30 horas de clases a lo largo de 5 días (seis horas por día
aproximadamente), repartidas en 15 horas de contenidos teóricos y 15 de prácticas
en computadora.
Se proveerá una selección de bibliografía (artículos en formato pdf), recursos
web y los programas y materiales audiovisuales utilizados durante el curso.

¿Q UÉ CONOCIMIEN TOS PREVIO S SE REQUIEREN ?

Se requieren conocimientos mínimos de análisis multivariante y manejo a nivel


de usuario de paquetes estadísticos básicos y hojas de cálculo (Excel, Statistica,
Systat, SPSS, etc.).

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Introducción a la Morfometría Geométrica

P ROGR AM A
• Introducción:
o Breve historia y antecedentes
o ¿qué es la Morfometría Geométrica?
• Repaso de aplicaciones en las Ciencias Naturales
• Ventajas (y desventajas) con respecto a la morfometría clásica
• Definiciones:
o Landmark (criterios para su selección)
o Outlines / contornos
o Tamaño y forma
o Transformaciones en MG
o Alometría
o Espacios en morfometría Geométrica
o El espacio de Kendall
o Forma consenso
o Modelos y métodos en MG
• Principales métodos en Morfometría Geométrica
o Métodos de superposición
ƒ Definición
ƒ Diferentes técnicas de superposición (GLS, Procrustes,
Bookstein’s edge-matching)
ƒ Distancias de Procrustes
ƒ F de Goodall y T 2 de Hotelling
ƒ Caso práctico 1.
o Métodos de deformación
ƒ Definición
ƒ Thin-Plate Spline (TPS): la metáfora de Bookstein
ƒ Forma (Weight matrix, Principal y Partial Warps)
ƒ Cambio uniforme y no-uniforme
ƒ Análisis canónico de la weight matrix
ƒ Relative Warp Analysis
ƒ Singular Warp Analysis (Partial Least Squares Analysis)
ƒ Caso práctico 2.
ƒ Caso práctico 3.
ƒ Caso práctico 4.
o Linear-distance based methods
ƒ Euclidean Distance Matrix Analysis I (EDMA I)
ƒ Form matrix y Form Difference Matrix.
ƒ Euclidean Distance Matrix Analysis II (EDMA II)
ƒ Shape matrix y Shape Difference Matrix
ƒ Estudios de crecimiento a partir del EDMA: Growth matrix
ƒ Presentación gráfica de los resultados
ƒ Caso práctico 5
o Análisis de Fourier
ƒ Introducción
ƒ Captura de contornos
ƒ Función elíptica de Fourier
ƒ Descomposición de las curvas en elipses armónicas
ƒ Obtención de los coeficientes de Fourier
ƒ Análisis multivariante de los coeficientes de Fourier
ƒ Caso práctico 6.

• Aspectos prácticos: obtención de las configuraciones en 2D y 3D para su


utilización en Morfometría Geométrica
o Tomografías computadas (CT scans)
o MRI
o Tecnología Láser
o Brazos digitalizadores
o Truss Data

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Introducción a la Morfometría Geométrica

o Fotografías
• Recursos web en Morfometría Geométrica

Prácticas

• Clase práctica 1: Preparación de los datos


o Presentación de las bases de datos a utilizar
o Digitalización de landmarks y outlines (programas TPSUtil y
TPSDig)

• Clase Práctica 2: Métodos de Superposición


o F de Goodall y distancias de Procrustes(programa IMP)
o Obtención de medidas clásicas a partir de landmark coordinates
(programa IMP)
o Obtención de la forma consenso, los componentes principales,
los eigenvalues, los polígonos de configuraciones, etc, en dos o
tres dimensiones (Morphologika).

• Clase Práctica 3: Métodos de Deformación


o Obtención de la forma consenso, los partial warps, los
componentes uniformes, el centroid size y los relative warp
scores (programas TPSRelw, TPSRegr y Morpheus)

• Clase Práctica 4: Análisis de Fourier (programa Shape)


o Obtención de los outlines y chain-codes
o Obtención de las coeficientes de Fourier
o Análisis de componentes principales a partir de los coeficientes
de Fourier.

• Debate y discusión de casos prácticos puntuales - evaluación final.

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