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MANUAL DE BIOQUIMICA
ENFERMERÍA
2019
PROFESORES:
VERÓNICA PLAZA SANTANA
LUIS CASTILLO BARAHONA
CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES
EVALUACIÓN PONDERACIÓN
Prueba 25%
práctica
Prueba 25%
escrita
Informes 30%
Seminarios 10%
Quiz de 10%
entrada
TOTAL 100%
No entrega una visión Entrega una visión general Entrega una visión general Entrega una descripción
general del tema a estudiar, del tema a estudiar, sin del tema a estudiar, con un general del tema, basada en
Redacción de la Introducción o realiza una copia textual marco teórico y sin marco teórico apoyado en al la literatura disponible, la
de la guía y/o páginas de referencias. (0,3 ptos) menos una referencia. cual es citada en la sección
internet. (0 pto) (0,5 ptos) “Referencias
Bibliográficas”.
(0,7 ptos)
No se explicitan, o no Son una copia literal de la Son una leve modificación Son originales y acordes a las
Objetivos generales
tienen relación con las guía o están de los objetivos actividades propuestas.
y/o específicos
actividades redactados ejemplificados en (0,3 ptos)
realizadas. (0 pto) incorrectamente. (0,1 pto) la guía. (0,2 ptos)
Metodología
Es una copia del protocolo Describe en forma Describe forma incompleta Describe el procedimiento
experimental presente en la incompleta el el procedimiento experimental realizado
Elaboración del guía, en informes de procedimiento experimental considerando completo,considerando
procedimiento semestres anteriores, o experimental sin considerar materiales, métodos y materiales, métodos y
experimental describe los procedimientos métodos y técnicas técnicas utilizadas. (0,3 técnicas utilizadas en el
sin utilizadas, o no menciona ptos) laboratorio. (0,5
coherencia. (0 pto) materiales utilizados. ptos)
(0,1 pto)
Resultados
Es plagio total o parcial, o Describe de manera Describe de manera Describe de manera
no los presenta. (0 pto) desordenada unos pocos ordenada gran parte de la ordenada y completa toda
Registro escrito de las resultados, o no hace información obtenida, y la información obtenida,
observaciones recopiladas referencia a las figuras, hace referencia a las figuras, haciendo referencia a las
en las actividades tablas o ejemplos de tablas o ejemplos de figuras tablas o ejemplos de
cálculos. Los datos no cálculos. Solo algunos datos cálculos. Todos los datos
contemplan incluyen unidades. (0,3 incluyen unidades. (0,5
unidades. (0,2 ptos) ptos) ptos)
Presenta solo una Las figuras no presentan Las figuras están elaboradas Las figuras presentan título,
Confección de figuras aproximación de las figuras, título o una breve en forma incompleta breve descripción de su
(imágenes, tablas, cuadros sin descripción, o presenta descripción, o éstas son (rótulos, unidades, escala, representación y están
y/o cálculos) obtenidas en figuras que no corresponden erróneas o incompletas tamaño) o no tienen real correctamente elaboradas
las actividades a sus observaciones en el (rótulos, unidades, escala, coherencia con lo (rótulos, unidades, escala,
laboratorio. tamaño). observado. (0,3 ptos) tamaño, color). (0,5 ptos)
(0 pto) (0,2 ptos)
Discusión
Sólo describe los resultados Analiza sólo algunos de los Analiza los resultados Analiza todos los resultados
obtenidos o realiza un resultados obtenidos y no obtenidos y esperados sin obtenidos y esperados y
análisis erróneo de los los compara con contextualizarlos ni realiza proyecciones
Análisis de resultados mismos. (0 pto) bibliografía pertinente. proyectarlos en un marco contextualizadas en un
(0,5 ptos) teórico pertinente, marco teórico pertinente,
fundamentado en al menos fundamentado en al menos
una referencia. (1,0 pto) dos referencias de distinto
autor.
(1,5 ptos)
Conclusiones
Resume o discute No se relacionan con los Se relacionan sólo con Son originales y se
Elaboración de los resultados objetivos planteados o son algunos de los objetivos relacionan con los
conclusiones obtenidos. erróneas. planteados. objetivos planteados y la
(0 pto) (0,2 discusión.
ptos) (0,3 (0,5 ptos)
ptos)
Referencias
Escribe referencias sin considerar el formato solicitado.
Escribe todas las referencias de acuerdo al formato.
Referencias bibliográficas
(0 (0,5
pto) ptos)
TOTAL
Nombres _____________________________________ ____________________________________ Carrera:______________ (Suma de puntaje)
_____________________________________ ____________________________________
PRELABORATORIO BIOQUIMICA
I.- UTENSILIOS DE LABORATORIO
Variable independiente:
________________________________
Ensayo A:
Ensayo A Ensayo B
Ecuación de la recta:
x y x y
___________________________________________
(mg/L) (A) (mg/L) (A)
1 0,143 1 0,024 Valor de
2
2 0,270 2 0,044 R :_________________________________________
3 0,392 3 0,067 __________________
4 0,532 4 0,096
Ensayo B:
5 0,639 5 0,109
Ecuación de la recta:
_____________________________________________
Valor de
2
R :___________________________________________
c) Se pretende cuantificar la cantidad de proteína de una muestra problema de
caseína, la proteína presente en la leche. Para ello se dispuso de una batería
de tubos que contienen una concentración conocida de dicha proteína y se
midió su absorbancia en un espectrofotómetro a una longitud de onda óptima,
obteniéndose los siguientes resultados.
Tubo B 1 2 3 4 5 MP
Concentración
(mg/ml) 0 1 2 4 8 10 X
Absorbancia a 540
nm 0 0,034 0,071 0,142 0,277 0,345 0,176
Ecuación de la recta:____________________________________________________
Valor de R2:_____________________________________________________________
Concentración muestra problema: ______________________________________
IV.- Tutorial para el uso de Regresión Lineal en Calculadora Científica CASIO
fx-82 MS o similar
V.- BIBLIOGRAFÍA
Página 1: http://www.scielo.cl
Tema:
_________________________________________________________________________
Artículos encontrados:
_________________________________________________________________________
Referencia:
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
Página 2: http://www.pubmed.org
Tema:
_________________________________________________________________________
Artículos encontrados:
_________________________________________________________________________
Referencia:
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
_________________________________________________________________________
Laboratorio 1: Espectrofotometría de Proteínas
1.1. INTRODUCCIÓN
Cada uno de estos cambios necesita una cantidad exacta de energía para
producirse y varía según la composición atómica y el tipo de unión química
de átomos o moléculas.
1
𝐴 = − log 𝑇 (4) 𝐴 = l og (5)
𝑇
𝐼𝑜
𝐴 = 𝐿𝑜𝑔 = 𝑎 × 𝑏 × 𝑐 (6)
𝐼
Dónde:
a = (coeficiente de absorción específico o absortividad). Es la absorción que
presenta la muestra en disolución cuando su concentración es 1g/L y el
espesor del recipiente es de 1 cm. Cuando la concentración de la
muestra se expresa en moles/L, este coeficiente de denomina
absortividad molar o coeficiente de absorción molar (e).
1.1.4.2. Linealidad
Si representamos gráficamente la absorbancia de una muestra problema a
distintas concentraciones, obtendremos una curva lineal que parte del eje
de las ordenadas y las abscisas (Figura 1.5).
Absorbancia "
1.1.4.3. Asociaciones
1. Fuente de radiación.
2. Selector de longitud de
onda
3. Recipiente para la
muestra.
4. Detector.
5. Dispositivo de lectura.
Figura 1.6. Componentes de un espectrofotómetro.
Prisma
(sistema de dispersión)
ancho de banda, y espectro-fotómetro, si lleva
que consta de una monocromador. Los selectores
longitud de onda pueden ser de gelatina o de
nominal, que es vidrio coloreado, y realizan una
donde se halla la transmisión selectica de
máxima intensidad radiaciones. Otros son
de luz. Cuanto más interferenciales, y consisten en
estrecho sea este una fina película sobre la que se
ancho de la banda releja el haz de luz y da lugar a
mejor será el la destrucción de unos colores
monocromador. Se mientras otros aumentan su
re-quiere un sistema intensidad.
de dispersión y una
red de difracción.
Recipiente Reciben el nombre Las de vidrio se utilizan Dispersión de la luz en una
red de difracción
para las de cubetas y puedennormalmente para la región
muestras ser de sección
visible del espectro, pero no
cuadrada o redonda sirven en la región ultravioleta,
(tubos). ya que estas longitudes de
Generalmente, onda no atraviesan el vidrio.
tienen un ancho
Las cubetas de cuarzo sirven
interior (camino
indistintamente para laCubetas
región de Cubetas de
óptico) de 1cm, porvisible o ultravioleta, pero tienen
Vidrio Cuarzo
eso se prefieren las de
el inconveniente de ser muy
sección cuadrada,
caras y de rayarse con
que al tener los lados
facilidad.
paralelos, ofrecen
Las más utilizadas son de
Cubetas de
mayor exactitud en material plástico. Son Plástico
las medidas. desechables y con ello se
Pueden ser de
eliminan las interferencias por
distintos materiales.
ralladuras en la cubeta o una
mala limpieza de las mismas.
Esquema de un tubo
Detector Es el sistema que Suelen ser tubos fotomultiplicador
convierte la señal fotomultiplicadores. Están
luminosa en señal formados por un cátodo de un
eléctrica. metal sensible a la luz, que es
capaz de emitir electrones en
forma proporcional a la
cantidad de energía radiante
incidente.
La señal se amplifica por una
serie de dínodos (electrodos
utilizados para lograr la emisión
secundaria de electrones), de
manera que aumenta
considerablemente la
sensibilidad del aparato.
Dispositivo Una vez que la señal En modelo de haz sencillo es
de lectura eléctrica amplificada necesario realizar un pre-ajuste Luz
sale del detector de la señal de referencia,
pasa a los sistemas de haciendo pasar el haz de luz por
lectura. Pueden ser la cubeta vacía, con agua
galvanómetros o destilada o con el diluyente
sistemas de lectura empleado en la técnica; de
digital. También esta manera obtenemos el cero
pueden procesarse de absorbancia o el 100% de
en un ordenador y transmitancia. Posteriormente,
pasar a la impresora. podemos realizar la medida de Disolvente Muestra
la muestra problema. Cada vez puro problema
que se modifica la longitud de
onda seleccionada, podemos
repetir esta operación.
Los aparatos de doble haz
incorporan un sistema que
desdobla el haz de luz
Fotomultiplicador
procedente de la fuente de ò
radiación, de manera que uno
incide sobre la cubeta de Lectura
referencia y otro sobre la
cubeta con la muestra
Espectrofotómetro de
problema. Estos aparatos doble haz.
permiten la realización de un
barrido automático de
longitudes de onda, cosa que
no es posible en los de has
sencillo. Como ventaja estos
últimos son más sencillos y su
costo es menor que los de doble
haz.
Espectrofotometria y proteinas
Las proteínas organizan la mayor parte de los procesos vitales a todos los
niveles (celular, tisular y orgánico), constituyendo alrededor del 50% del peso
seco del organismo. De hecho, la identidad de un individuo viene
determinada por el conjunto de proteínas. La forma externa, el color y tipo
de cabello, la estatura, la forma de la cara, etc., son circunstancias escritas
de algún modo en el mensaje genético de cada organismo y expresadas
mediante proteínas.
OBJETIVOS:
- Conocer distintos métodos directos e indirectos de detección y
cuantificación de proteínas.
- Realizar curvas de calibración para cada método.
- Compara métodos para cuantificación de proteínas (ventajas y
desventajas).
- Determinar la concentración de proteínas para una muestra desconocida.
- Conocer el grado de pureza de una muestra problema.
I. MÉTODO DE BIURET
INTRODUCCIÓN
El método de Biuret se fundamenta en que al
añadir una solución fuertemente alcalina de
sulfato cúprico (CuSO4) a una solución de
proteína, se obtiene como resultado la
formando enlaces de coordinación y
estableciendo un complejo entre el ion cúprico
y los enlaces peptídico (nitrógenos amídicos),
expresado en la aparición de una coloración
violeta-púrpura (Figura 1.11). La
Figura 1.11. Formación complejo de Biuret
determinación de proteína se realiza midiendo
la absorbancia en espectro visible a una
longitud de onda 540 nm.
MATERIALES E INSTRUMENTOS:
- Pipetas
- Tubos de ensayo
- Gradilla
- Baño Termoregulador
- Espectofotómetro
- Cubetas de Espectofotómetro
REACTIVOS:
- Reactivo de Biuret
- Seroalbúmina bóvina (BSA) 10 mg/ml
- Muestra problema de proteína
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
Concentración
N° V (mL) albúmina V (mL) V (mL) de reactivo
albúmina
Tubo patrón disolvente de Biuret
(mg/ml)
1 0 3,0 3,0
2 0,3 2,7 3,0
3 0,6 2,4 3,0
4 0,9 2,1 3,0
5 1,2 1,8 3,0
6 1,5 1,5 3,0
7 1,8 1,2 3,0
MP 3,0 3,0
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
1. Graficar la curva de calibración del método de Biuret (Concentración
BSA v/s Absorbancia).
2. Calcular la concentración de proteínas de la muestra problema a través
de este método.
3. Calcular la absortividad de la muestra problema.
II. MÉTODO DE BRADFORD
El método de Bradford se fundamenta en que el reactivo de Bradford es un
colorante hidrofóbico cuyas disoluciones acuosas en presencia de ácido
fosfórico tienen un color pardo y que, al encontrarse en el entorno
hidrofóbico del interior de una proteína, origina un color azul intenso que se
puede medir fácilmente. Debido a su forma de reconocimiento es
relativamente sensible a la presencia de contaminantes en la muestra tales
como restos de detergente y líquidos orgánicos como el metanol, los que
podrían alterar la medición. Su principal ventaja es que resulta más rápido y
fácil de emplear que otros métodos alternativos, y más sensible que la
medida de directa de absorbancia a 280nm. La sensibilidad del método
varía entre 1-15 µg de proteína.
MATERIALES E INSTRUMENTOS:
- Pipetas
- Tubos de ensayo
- Gradilla
- Espectofotómetro
- Cubetas de Espectofotómetro
REACTIVOS:
- Reactivo de Bradford
- Seroalbúmina bóvina (BSA) 1 mg/ml
- Muestra problema de proteína
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
Concentración
N° V (µL) albúmina V (µL) V (mL) de reactivo
albúmina
Tubo patrón disolvente de Bradford
(mg/ml)
1 0 300 3
2 10 290 3
3 20 280 3
4 30 270 3
5 40 260 3
6 50 250 3
7 60 240 3
MP 300 3
2) Mezclar bien cada tubo y dejar incubar por 10 minutos a temperatura
ambiente.
3) Medir absorbancia a 595nm.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
1. Graficar la curva de calibración del método de Bradford (Concentración
BSA v/s Absorbancia).
2. Calcular la concentración de proteínas de la muestra problema a través
de este método.
3. Calcular la absortividad de la muestra problema.
LABORATORIO 2: PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS
INTRODUCCIÓN
Especificidad y Variabilidad
Cada proteína es específica de cada individuo o grupo de individuos. Es
decir, las características de un organismo se deben a su constitución
proteica. La especificidad se establece según ciertos niveles. Algunas
proteínas, de hecho, han conservado su estructura a lo largo de la
evolución, es como es el caso de la histona, proteína presente en gran parte
del reino animal. Otras en cambio, parecen presentarse únicamente en
algunas líneas evolutivas y ser específicas de algunos taxones, por ejemplo,
la hemoglobina solo se encuentra en los vertebrados.
Amortiguadora del pH
De acuerdo a la composición de las proteínas, podemos decir que poseen
un carácter anfótero: se pueden comportar como ácidos o como bases
liberando o captando protones del medio. De esta forma pueden
neutralizar las variaciones del pH que se produzcan en el medio acuoso
donde se encuentren.
Solubilidad
En muchos casos, las proteínas son macromoléculas de elevado peso
molecular, solubles en soluciones acuosas a base de aguay soluciones
salinas diluidas (en algunos casos de proteínas de membrana es necesaria
la presencia de algún jabón o agente solubilizante). En estas condiciones las
proteínas forman soluciones coloidales traslucidas u opalescentes cuya
viscosidad depende de la concentración y del tamaño de las proteínas que
forman dichas soluciones. En solventes orgánicos tienden a interactuar más
entre sí que con el medio.
Comportamiento eléctrico
Los aminoácidos polares con carga (positiva o negativa) confieren a las
proteínas, a su vez, una carga eléctrica que le permite moverse en un
campo eléctrico. La carga neta de la proteína es la suma aritmética de las
cargas positivas y negativas; por ejemplo, una proteína con tres unidades
de ácido aspártico, dos de ácido glutámico y una lisina tendrá a pH 7 una
carga neta de -4, por lo que en un campo eléctrico se desplazaría hacia el
polo positivo. Este movimiento hace posible la separación de los distintos
componentes proteicos de un extracto, por medio de electroforesis de
proteínas en geles con una matriz de poliacrilamida.
Estabilidad
La estructura final de una proteína, denominada estructura nativa, es su
conformación más estable en las condiciones llamadas fisiológicas
(temperatura entre 20 y 37 °C y pH próximo al neutro). Esta estructura se
mantiene en virtud de enlaces e interacciones débiles (puentes de
hidrogeno, fuerzas de Van der Waals). Si las condiciones de temperatura y
pH cambian, elevando la temperatura por encima de 70°C o haciendo el
medio muy acido o muy alcalino, los enlaces que mantienen unida la
estructura final se desestabilizan y se rompen. Este proceso se conoce como
desnaturalización.
Actividades Experimentales
INTRODUCCIÓN
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
- Completar la siguiente tabla y calcular los milieqivalentes de base
adicionada
INTRODUCCIÓN:
En las cadenas polipeptídicas de las proteínas los grupos alfa - carboxilo de los
aminoácidos, (salvo los terminales) se encuentran constituyendo los enlaces
peptídicos. De este modo los grupos que pueden cargarse eléctricamente son:
Carboxilos libres de los aminoácidos dicarboxílicos, cuyo pK fluctúa alrededor de 4;
delta-amino de la lisina, guanidina de la arginina, fenol de la tirosina, sulfhidrilo de
la cisteína, cuyos pK son superiores a 9 e imidazol de la histidina cuyo pK en las
proteínas es de 5,6 a 7,0. Estos grupos se comportan como ácidos débiles y
confieren a las proteínas la capacidad de actuar como amortiguadores del pH.
MÉTODO: Titulación con ácido en presencia de indicador que vira entre límites
donde se supone que existe propiedad amortiguadora.
SUERO SANGUÍNEO
1) Depositar en vaso precipitado 2ml de Agua destilada y 1ml de Suero Sanguíneo.
2) Agitar la solución.
3) Añadir 3 gotas de Rojo de Metilo.
4) Titular con HCl 0,01 N hasta que se logre distinga un cambio en la coloración
(amarillo - anaranjado).
5) Registrar el Gasto de HCl utilizado en la titulación.
SUERO DESPROTEINIZADO
1) Depositar 1 ml de suero sanguíneo en un tubo de ensayo y llevar a baño
termorregulador (100°C) durante 2 minutos. (Se logrará apreciar un precipitado
de color amarillo)
2) Añadir al tubo de ensayo 2ml de Agua destilada.
3) Moler precipitado con una varilla y Filtrar.
4) Adicionar 3 gotas de Rojo de Metilo
5) Titular el filtrado con HCl 0,01 N hasta que se aprecie un cambio en la coloración
(amarillo - anaranjado).
6) Registrar el Gasto de HCl en mL utilizado en la titulación.
CONTROL
1) Tomar 3mL de Agua destilada y adicionar 3 gotas de Rojo de Metilo
2) Titular con HCl 0,01N hasta que se note un cambio en la coloración
(intensificación del color rojo)
3) Registrar el Gasto de HCl utilizado en la titulación.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
1. Completar la siguiente tabla con los valores obtenidos del gasto y los
miliequivalentes de HCl.
MUESTRA CONCENTRACIÓN HCL (N) GASTO DE HCl (ML) MILIEQUIVALENTES DE HCl
Suero Sanguíneo
Suero
desproteinizado
Control
INTRODUCCIÓN
La caseína representa el 80% de las proteínas presentes en la leche y el 2,7% en
composición de la leche líquida, existen cuatro tipos de caseína: a, b, g y k, todas
estas precipitan del líquido cuando este cambia a un pH determinado. En este
estado, se dice que la proteína se encuentra en su punto isoeléctrico.
Los grupos ácidos o básicos libres de las cadenas polipeptídicas se ionizan en
función del pH del medio. De su número y su grado de ionización depende la carga
neta de la proteína. Al pH en que el número de cargas eléctricas positivas y
negativas es igual, la proteína está eléctricamente neutra y se dice que se
encuentra en su punto isoeléctrico (pI). A este pH, correspondiente al pI, la
solubilidad de la proteína es mínima. La caseína tiene un pI definido, cuyo valor se
encuentra entre 3,5 y 6,2.
Figura 2.2. Aminoácidos, en forma catiónica (izquierda), aniónica (izquierda) y sin carga (centro).
MÉTODO: Determinación del punto isoeléctrico de la caseína
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
Obs. Obs.
Tubo Meq [Ácido] Meq [Base] pH
iniciales Finales
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
La mayor parte de las proteínas pueden precipitarse en las soluciones acuosas por
la adición de ciertos ácidos, tales como el tricloroacético y el perclórico, los cuales
forman con la proteína sales insolubles en ácido. Estos reactivos se emplean
comúnmente para “aclarar” los fluidos biológicos o extractos celulares de proteínas
antes de realizar los análisis para determinar la existencia de moléculas de bajo
peso molecular, tales como la glucosa y los aminoácidos.
Otros precipitantes análogos de las proteínas son los ácidos túngstico, ortotúngstico
y metafosfórico. Las proteínas también pueden ser precipitadas por cationes, tales
como Zn+2 y el Pb+2.
Las proteínas se pueden precipitar de las soluciones mediante un agente
precipitante de carga opuesta a la de las proteínas; esto requiere que el pH de la
solución debe ser controlado de tal modo que la proteína quede en el lado ácido
o básico de su punto isoeléctrico.
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL:
1) Enumerar 4 tubos de ensayo.
2) Adicionar a los tubos del 1-4 1ml de HCl 0,1N y a los tubos del 5-8 1ml de NaOH
0,1N.
3) Añadir 1ml de Albúmina a todos los tubos.
4) Agregar a los tubo 1 y 5: 1 ml de Acetato de plomo 10%
5) Agregar a los tubo 2 y 6: 1 ml de Sulfato de Zinc 10%
6) Agregar a los tubo 3 y 7: 1 ml de Tungstato de Sodio 10%
7) Agregar a los tubo 4 y 8: 1 ml de Ferrocianuro de Potasio 1,0%
8) Observar la presencia de precipitado en cada tubo.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS:
Ánodo Cátodo
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
Actividades Experimentales:
3.1. INFLUENCIA DE LA TEMPERATURA SOBRE LA ACTIVIDAD DE LA
β FRUCTOFURANOSIDASA.
INTRODUCCIÓN:
La temperatura es un factor que puede favorecer o perjudicar las
reacciones catalizadas por enzimas, puesto que menos dentro de cierto
margen, las reacciones enzimáticas se comportan como reacciones
químicas ordinarias, en donde su velocidad aumenta con la temperatura
(Figura 3.2). La diferencia que existe con las enzimas es que se llega a un
punto en el que a temperaturas altas, la enzima se inactiva por el calor. El
rango de temperatura en el cual una enzima mantiene una conformación
estable, competente desde el punto de vista catalítico, depende de (y, por
lo general, excede de manera moderada) la temperatura normal de las
células en las cuales reside.
Velocidad de reacción
Temperatura
Figura. 3.2 Relación entre velocidad de reacción y temperatura de una reacción química catalizada.
REACTIVOS:
- Glucosa-Fructosa 0,01 M
- Sacarosa 0,45 M
- Preparación enzimática
- Buffer Citrato 0,2 M
- Reactivo 3,5-dinitrosalicilato (DNS)
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL:
1. Preparar baños de incubación a 0ºC, 10°C, 30°C, 40°C, 50°C, 60°C y 70°C.
2. Disponer una serie de 7 tubos de ensayo, en el que tres tubos estarán en
cada temperatura. Agregar los componentes del sistema enzimático,
excepto el sustrato. Mezclar
3. Equilibrar cada tubo con sus respectivos controles a las diferentes
temperaturas de incubación elegidos a iniciar la reacción con el sustrato.
4. Incubar exactamente durante 40 minutos. Detener la reacción con 3,5-
dinitrosalicilato. Completar volumen a 20 mL con agua.
5. Medir absorbancia en espectrofotómetro a una longitud de onda de 540
nm.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS:
INTRODUCCIÓN:
El efecto del pH en la cinética enzimática se debe a cambios en el estado de
ionización de los componentes del sistema enzimático (enzima libre, complejo
enzima-sustrato, sustrato). Es imposible que la enzima reaccione sólo con una
especie iónica de un sustrato ionizable o tenga diferente afinidad con las diferentes
especies iónicas del sustrato, sino que la enzima posee numerosos grupos ionizables
que se ven afectados por el pH al que se encuentren sometidas. Si se varía la
ionización de estos grupos a nivel del sitio activo o en algún punto lejano, pero que
de algún modo altere el sitio activo se afecta el tipo de unión y estabilidad del
complejo enzima-sustrato o la actividad catalítica misma.
Dentro de los grupos ionizables, los que se encuentran mayormente cargados son
los grupos carboxilos (negativos) y las aminas protonadas (positivos). La ganancia
o pérdida de grupos cargados cruciales afecta de manera negativa la unión al
sustrato, de modo tal, que atrasa o anula la reacción.
Las enzimas son activas en un rango limitado de pH y la mayoría de los casos, se
puede encontrar un pH o una zona de pH en la cual la actividad enzimática es
mayor, lo que se denomina pH óptimo (por lo general un pH entre 5 y 9). Hay que
considerar además, que la enzima puede inactivarse por desnaturalización a pH
extremos y que la estabilidad de la enzima o los sustratos frente a diversos agentes
desnaturalizantes puede variar en función del pH. La naturaleza de la solución
amortiguadora también puede interferir.
FUNDAMENTO:
Determinación de la velocidad de la hidrólisis de la sacarosa por la β-
fructofuranosidasa, a diferentes pH.
REACTIVOS:
- Glucosa-Fructosa 0,01 M
- Sacarosa 0,45 M
- Preparación enzimática
- Buffer Citrato 0,2 M
- Reactivo 3,5-dinitrosalicilato (DNS)
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
EXPRESIÓN DE RESULTADOS:
OBJETIVOS:
- Estudiar la relación de la concentración de sustrato en la velocidad de una
reacción enzimática.
- Calcular constante de Michaelis-Menten
INTRODUCCIÓN:
La concentración de sustrato determina la actividad enzimática medida como
la velocidad de la catálisis enzimática. Si la concentración de la enzima se
mantiene saturada, la producción de producto será a una velocidad máxima.
Según la cinética micheliana las enzimas que poseen este comportamiento en que
la velocidad de reacción depende principalmente de la concentración de sustrato
pueden representarse en una gráfica descrita por la
ecuación de Michaelis-Menten que corresponde a
una hipérbole rectangular (Figura 3.3):
Los ejes representan a la velocidad de reacción v en
la ordenada y la concentración de sustrato [S] en la
abscisa.
Donde Km (constante de Michaelis-Menten)
representa a la concentración del sustrato que se
encuentra a la mitad de la velocidad máxima Figura. 3.3.
Km Representación gráfica de la
experimentada por la reacción. Km (constante de Ecuación de Michaelis-Menten.
Michaelis) es una constante propia de cada enzima
bajo condiciones determinadas.
La ecuación que representa a la recta es la ecuación de Michaelis-Menten:
𝑉𝑚á𝑥 × [𝑆]
𝑣=
𝐾𝑚 + [𝑆]
Las condiciones en que ocurren estas reacciones
enzimáticas, rara vez son saturadas de sustrato, por
lo cual esta relación nos permite calcular los
parámetros bajo estas condiciones cambiantes de
sustrato y enzima en un tiempo determinado.
[𝑆] 1 𝐾𝑚
= × [𝑆] + (16)
𝑣 𝑉𝑚á𝑥 𝑉𝑚á𝑥
[
En donde la pendiente es YX, el punto que
intersecta al eje de la abscisa corresponde a la
-Km, y el que intersecta al eje de la ordenada
WX
corresponde a YX .
Figura 3.6. Representación gráfica de
Hanes-Woolf
REACTIVOS:
- Solución de glucosa-fructosa 0,01 M.
- Soluciones de sacarosa a diferentes concentraciones.
- Reactivo 3,5-dinitrosalicilato.
- Buffer acetato pH = 4,7 0,05 M
- Solución extracto de β-fructofuranosidasa con una dilución que asegure un
producto 5 moles/min.
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL:
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
Cualquier tipo de inhibición que no puede Figura 3.8. Representación gráfica del efecto
ser anulada por el simple expediente de de un inhibidor no competitivo.
elevar la concentración de sustrato se designa como no competitiva. En
este caso el sustrato no puede impedir la combinación del inhibidor con la
enzima.
REACTIVOS:
- Yodoacetato 0,001 M
- Solución de glucosa-fructosa 0,01 M.
- Soluciones de sacarosa a diferentes concentraciones.
- Reactivo 3,5-dinitrosalicilato.
- Buffer acetato pH = 4,7 0,05 M
- Solución extracto de β-fructofuranosidasa con una dilución que asegure un
producto 5 moles/ minuto.
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL:
1. A partir de seis concentraciones conocidas de sustrato iniciales: 0,45 M; 0,3
M; 0,2 M; 0,1M; 0,05M y 0,03M (con concentraciones finales entre 3M y
0,01M, en el volumen de incubación).
2. Calcular una concentración de yodoacetato que en la mezcla final de
reacción quede entre 1x10-4 y 1x10-3 M.
3. Colocar una serie de tubos la cantidad de yodoacetato calculada, el
amortiguador y la preparación enzimática, disponer para cada tubo de
una concentración de sacarosa determinada.
4. Disponer de una segunda serie semejante a la anterior con iguales
componentes del sistema enzimático, pero con agua en lugar de
yodoacetato.
5. Pre-incubar ambas series de tubos durante 3 minutos a la temperatura que
se usará en la reacción enzimática.
6. Hacer los controles más indispensables.
7. Iniciar la reacción en cada tubo, agregando las cantidades calculadas de
sustrato. Permitir que ocurra la reacción controlando el tiempo en cada
tubo.
8. Al término del tiempo detener la reacción con 2,0 mL de reactivo 3,5-
dinitrosalicilato.
9. Desarrollar el color de todos los tubos, llevándolos a un baño de agua
hirviente durante 5 minutos. Enfriar.
10. Complete con agua hasta el volumen de 20 mL
11. Medir la absorbancia en el espectrofotómetro con la longitud de onda
más adecuada.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS:
1. Tabular los resultados consignando número de tubo, concentración molar
de sustrato agregado, concentración molar de sustrato en el volumen
interno de reacción, valor recíproco de la concentración molar de sustrato
del volumen de reacción, concentración del inhibidor, lecturas del
colorímetro, micromoles de producto producido, valor recíproco de la
velocidad.
2. Hacer una gráfica de la velocidad de reacción en función de la
concentración del sustrato para ambas reacciones con y sin inhibidor.
Determinar el valor de V y de Km con y sin inhibidor.
3. Hacer una gráfica del valor recíproco de la velocidad en función del valor
recíproco de la concentración del sustrato (gráfica de Lineweaver-Burk)
para las reacciones con y sin inhibidor. Determinar el valor de V y de Km con
y sin inhibidor.
4. Comparar Km y Vmáx de la reacción en presencia y ausencia del inhibidor.
5. Determinar tipo de inhibicion.
LABORATORIO 4: METABOLISMO DE LOS Glúcidos
INTRODUCCIÓN
TRANSPORTE DE NUTRIENTES
La absorción que se produce en el intestino consiste en el pasaje de las
sustancias nutritivas a la sangre, a través del epitelio intestinal y los capilares
sanguíneos. En este proceso, es muy importante la intervención de las
membranas de la célula que constituyen los tejidos.
Pero los productos de la digestión no llegan a todas las células del organismo
directamente, sino que pasan por el hígado. Los capilares sanguíneos de las
vellosidades intestinales se reúnen en la vena porta, que llevan la sangre
desde el intestino hacia el hígado. Las sustancias procesadas en él salen a
través de la vena hepática.
ACTIVIDADES EXPERIMENTALES:
INTRODUCCIÓN
El hígado desempeña muchas funciones importantes, entre ellas el
metabolismo glucosídico de organismo animal, ya que es capaz de
almacenar glucógeno y entregar glucosa a la circulación de acuerdo a los
requerimientos del mismo organismo, de modo que se mantiene un nivel de
glucosa sanguínea aproximadamente constante (glicemia). Es importante
destacar que en la regulación de la glicemia participan otras glándulas
como las suprarrenales y el páncreas. El glucógeno hepático puede
formarse a expensas de glucosa (Glucogenogénesis), como también de
residuos provenientes del metabolismo de hidratos de carbonos, proteínas y
lípidos (Gluconeogénesis). La degradación del glucógeno hasta glucosa se
llama glucogenólisis y se realiza en el hígado, riñones e intestino. Requiere
que la Glucosa.1 fosfato (G1P), producida en la fosforilación del glucógeno,
se convierta a glucosa por acción de la glucosa-6 fosfatasa, liberándose
glucosa al torrente sanguíneo. Esta fosfatasa no ha sido hallada en el
músculo, lo que explica la incapacidad de este tejido para entregar glucosa
a la sangre.
Si se extrae el hígado de un animal bien alimentado, no sometido a un ayuno
previo, y que incube, ya sea en forma de papilla o de cortes, en un medio
salino apropiado desprovisto de sustrato, predomina el fenómeno de la
glucogenólisis. La técnica de los cortes de tejido fue desarrollada
principalmente por Warburg y colaboradores en 1926, en sus estudios sobre
metabolismo tumoral. Entiéndase por corte un trozo de tejido vivo que
conserva la estructura y organización del órgano de origen. El corte está
desprovisto de circulación sanguínea, debe tener un espesor no mayor que
0,3 - 0,5µm para permitir la difusión libre del oxígeno y de metabolitos. Esta
técnica permite efectuar variaciones controladas en el medio de
incubación, y además, analizar químicamente el tejido y el medio para
detectar cambios en los metabolitos.
La glucogenólisis puede estudiarse fácilmente in vitro, incubando cortes de
hígado en soluciones salinas (solución de Krebs) y midiendo la desaparición
de glucógeno del tejido y la aparición de glucosa en el medio de
incubación catiónica; es menor si se remplaza por potasio. La adición de
adrenalina o glucagón estimula la glucogenólisis. Para conocer el contenido
de glucógeno se aprovecha la propiedad del polisacárido de ser extraído
fácilmente con ácido tricloroacético. La concentración de glucógeno así
aislado puede determinarse usando el método del yodo. La cantidad de
glucosa formada se medirá con el método de Somogyi-Nelson.
FUNDAMENTO:
Es posible determinar el curso de la glucogenólisis en cortes de hígado de
un mamífero o un ave, incubados en solución salina de Krebs para esto se
lleva a cabo la cuantificación del glucógeno presente en los cortes
mediante su reacción con el yodo. La cuantificación de glucosa presente
en los líquidos de incubación es cuantificada por el método de Somogyi-
Nelson.
REACTIVOS
- Trozos de hígado.
- Solución de cloruro de sodio a 0,9%
- Solución de Krebs.
- Ácido tricloroacético (TCA) al 5%.
- Reactivo de yodo.
- Solución de glicógeno 0,025%.
- Solución de glucosa al 0,1%.
- Solución de Ba (OH)2 0,3%.
- Solución de ZnSO4 al 5%.
- Reactivo de Somogyi
- Reactivo de Nelson.
- Agua destilada.
MATERIALES
- Tubos de ensayo.
- Placa Petri
- Corcho.
- Papel filtro.
- Mortero
- Hielo.
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL: EXTRACCIÓN DE GLUCÓGENO Y GLUCOSA
1) Rotular un círculo de papel absorbente delimitando 3 regiones enumeradas
cada una y colocar dentro de una cápsula de Petri (Humedecer con solución
de Krebs).
2) Cortar los trozos de hígado sobre un corcho humedecido con solución de Krebs.
3) Pesar porciones de cortes de hígado de 150mL. Es conveniente que las diversas
porciones no difieran en más de 10mg.
4) Colocar cada porción pesada, dentro de tubos de ensayo que contienen 2mL
de solución de Krebs. Incubar los tubos a 37°C.
5) El primer tubo no se incubará y se utilizará como tiempo cero de la reacción.
Incubar los otros tubos durante 30 y 60 minutos a la temperatura indicada
(37°C).
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
1. Tabular los resultados indicando el peso de los cortes, el tiempo de incubación
de cada corte, las lecturas espectrofotométricas, cantidad de glucógeno de
los cortes y de glucosa liberada.
2. Confeccionar una gráfica de los µmoles de glucosa liberada y glucógeno
presente en el medio en función del tiempo de incubación.
3. Hacer un balance entre el glucógeno desaparecido de los cortes y la glucosa
aparecida en el medio de incubación, en términos porcentuales.
4.2. HIDRÓLISIS ÁCIDA Y ENZIMÁTICA DE UNA DISOLUCIÓN DE GLUCÓGENO
INTRODUCCIÓN
La hidrólisis de los enlaces glucosídico del glucógeno pueden ser catalizados
por ácidos o por enzimas. En la hidrólisis con un ácido fuerte hay un
rompimiento de enlaces al azar, formándose inicialmente, además de
glucosa, polisacáridos de menor tamaño molecular (dextrinas) y
oligosacáridos, los cuales finalmente se convierten en glucosa.
La velocidad de la hidrólisis depende de la naturaleza y concentración del
ácido así como la temperatura y tiempo de reacción.
La hidrólisis enzimática del glucógeno se logra con varias enzimas más o
menos específicas, por ejemplo la amilasa salival humana. En esta enzima
también se encuentra en una variedad de tejidos vegetales como también
en el jugo pancreático (amilasa pancreática). La amilasa cataliza la
hidrólisis de los enlaces alfa 1-4, pero no los 1-6, obteniéndose finalmente
maltosa, isomaltosa y glucosa como productos.
FUNDAMENTO:
Los productos generados en la catálisis total del glucógeno pueden ser
cuantificados por espectrofotometría al realizarles el método de Somogyi-
Nelson.
REACTIVOS
- Solución de glucógeno 8mg/mL
- Solución de glucosa al 0,001M.
- HCl 0,6N
- NaOH 0,6N
- Reactivo de Somogyi
- Reactivo de Nelson.
- Una disolución de saliva 1:80
MATERIALES:
- Tubos de ensayo.
- Propipeta.
- Calculadora.
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL: HIDRÓLISIS ÁCIDA DEL GLUCÓGENO
1) Preparar una serie de ocho tubos de ensayo enumerados correctamente.
2) El tubo número uno corresponde al blanco y contiene: 0,4mL de agua destilada,
0,6mL de HCL 1N y 1mL NaOH 0,6 N.
3) El tubo número dos contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL 1N,
inmediatamente agregar 1mL NaOH 0,6 N.
4) El tubo número tres contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL 1N,
colocar a baño hirviendo por dos minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
5) El tubo número cuatro contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL
1N, colocar a baño hirviendo por cuatro minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
6) El tubo número cinco contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL 1N,
colocar a baño hirviendo por seis minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
7) El tubo número seis contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL 1N,
colocar a baño hirviendo por ocho minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
8) El tubo número siente contiene: 0,4mL de solución glucógeno, 0,6mL de HCL 1N
colocar a baño hirviendo por diez minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
9) El tubo número ocho contiene: 0,4mL de solución de glucógeno, 0,6mL de HCL
1N colocar a baño hirviendo por quince minutos y agregar 1mL NaOH 0,6 N.
10) Enfriar los tubos expuestos al baño hirviendo.
11) A todos los tubos agregar 1mL de reactivo de Somogyi y se calientan en baño
de agua hirviente durante 10 minutos. Enfriar.
12) Agregar 1mL de reactivo de Nelson y agitar.
13) Diluir los tubos completar 10mL con agua destilada. Agitar.
14) Medir Absorbancia de sus muestras a 540nm.
EXPRESIÓN DE RESULTADOS
1. Calcule la cantidad de glucosa liberada de cada uno de los individuos,
considerando que para un patrón de glucosa 0,02g/L se obtiene una
absorbancia de 0,335 cumpliéndose la ley de Lambert-Beer para una celda de
1cm.
2. Calcule el grado de hidrólisis en cada una de las hidrólisis, tomando en
consideración que el tubo corresponde al 100% de hidrólisis.
3. Confeccione un gráfico de porcentaje de hidrólisis (ácida y enzimática) versus
tiempo de incubación.
4. Compare la eficiencia de la hidrólisis ácida sobre la enzimática y explique esta
eficiencia de catálisis.
Laboratorio 5: Transformación genética
• El gen gfp, que codifica para la proteína fluorescente verde, que está
ubicado bajo el control del promotor del operón arabinosa.
Materiales:
7 asas de inoculación*: sirven para transferir bacterias y para medir 10 µL de
plasmidio ya que están calibradas para retener ese volumen de líquido en
el aro.
4 pipetas de transferencia*: para transferir medio de cultivo.
*Nota: debes dejar estos materiales en la bolsa hasta el momento de su uso
porque la exposición innecesaria podría contaminarlos.
1 tubo con medio LB: para agregar a las bacterias en la fase de
recuperación.
2 tubos con solución de transformación: tienen los rótulos “+PLASMIDIO” y “-
PLASMIDIO”.
Linterna UV: para observar la fluorescencia.
Gradilla de esponja: para colocar los tubos con solución de transformación
en el hielo y en el baño a 42°C.
4 placas con medio de cultivo: tienen rótulos correspondientes a su
composición. No deben abrirse innecesariamente porque podrían
contaminarse.
Basurero: para desechar el material contaminado después de usarlo (asas
de inoculación, pipetas y tubos).
Contenedor con hielo:
para mantener los tubos
a 4° C.
Placa con Escherichia
coli: Estas son las
bacterias sin transformar,
sensibles al antibiótico
ampicilina. De aquí cada
grupo tomará las
bacterias para colocarlas
en los tubos con solución
de transformación.
DNA plasmidial: la
solución contiene el
plasmidio que cada
grupo transferirá a su
experimento usando un
asa.
Masking tape: para cerrar
las placas al finalizar el
experimento.
Baño termostático: es un
baño con agua a 42°C
donde se realizará el shock térmico colocando la gradilla de esponja con
los tubos.
Incubador: es una estufa donde la temperatura se mantiene a 37°C que
sirve para incubar placas con cultivos hasta la sesión siguiente.
Precauciones
Las bacterias con las que se trabajará son aptas para el trabajo en
laboratorio con alumnos, pero sin embargo es necesario tener precauciones
en su manejo. Se debe evitar el contacto con la piel y si esto ocurre
accidentalmente se recomienda lavarse las manos con agua y jabón,
evitando diseminar las bacterias en el ambiente de trabajo. No se deben
tocar las colonias bacterianas con las manos. Las asas de inoculación,
pipetas y tubos, después de su uso quedan contaminados y deben
desecharse en el basurero.
También se debe tener cuidado con las linternas UV, no se debe
iluminar los ojos con esta luz ya que podría resultar un daño en la vista.
Actividades DÍA 1
6. Etapa de recuperación. Saca la gradilla con los tubos del hielo y déjala
en el mesón. Abre el tubo rotulado –PLASMIDIO y utilizando una pipeta
de transferencia agrégale 250 µL de caldo LB. Cierra el tubo y repite
el procedimiento con el tubo +PLASMIDIO y usando una nueva pipeta
de transferencia. Desecha las pipetas en el basurero. Incuba durante
10 minutos a temperatura ambiente. Nota: también puedes mantener
los tubos en tus manos para que la temperatura de recuperación sea
más adecuada.
7. Selección de transformantes. Distribuye las placas de Petri con medio
de cultivo en el mesón sin abrirlas. Las placas contienen lo siguiente:
• LB (Luria Broth): medio de cultivo que provee los nutrientes para
el crecimiento bacteriano.
• Amp: antibiótico ampicilina, inhibidor del crecimiento
bacteriano.
• Ara: arabinosa, azúcar inductor de la expresión de gfp.
8. Golpea suavemente los tubos con tus dedos para mezclar la solución.
Utilizando una pipeta de transferencia para el tubo +PLASMIDIO y otra
para el -PLASMIDIO, toma 100 µL de las soluciones de los experimentos
“de transformación” y “control” y transfiérelas a las placas apropiadas
como indica la figura. Desecha las pipetas en el basurero.
9. Usando un asa para cada placa, esparce las suspensiones por todo
el agar, moviéndola rápidamente de ida y vuelta a lo largo de toda
la superficie. Desecha las asas en el basurero. NO PRESIONES MUCHO
EL AGAR, PUES PUEDE ROMPERSE. No mantengas las placas abiertas
más tiempo del necesario porque podrían contaminarse.
10. Apila tus placas y fíjalas con masking tape. Escribe el nombre de tu
grupo y luego llévalas a la estufa incubadora a 37°C donde deben
permanecer hasta el día siguiente. Durante la incubación el agar
debe estar hacia arriba, como se indica en la figura.
Responde
Apóyate en la siguiente figura para responder las preguntas a
continuación.
1. ¿En cuál de las placas encontrarás bacterias con las mismas características
de aquellas que inicialmente observaste (sin transformar)? Explica tus
predicciones.
2. Si ocurre la transformación bacteriana ¿en cuál o cuáles placas crecerán
las bacterias modificadas genéticamente? Explica tus predicciones.
3. ¿Cuáles placas debemos comparar para determinar si ha ocurrido la
transformación bacteriana? Justifica tu respuesta.
4. ¿Para qué realizamos los experimentos control?
5. Identifica cuáles son los eventos que deben ocurrir para observar el rasgo
fenotípico deseado (la fluorescencia verde)
Actividades Día 2
Una vez incubadas las placas durante toda la noche a 37°C podrás observar
el crecimiento bacteriano, su forma, cantidad, color con luz normal y color
con luz ultravioleta. Registra los resultados en la siguiente tabla.
+PLASMIDIO -PLASMIDIO
LB/amp LB/amp/ara LB/amp LB
¿Qué forma tiene el
crecimiento
bacteriano?
Crecimiento
(césped, colonia)
¿Cuántas colonias
hay?
Con luz UV
Calculo de la eficiencia de la transformación
La eficiencia de transformación es un dato que nos indica cuán
efectivo fue el experimento en lograr introducir las moléculas de DNA
plasmidial en las células bacterianas. Es un número que representa el
número total de bacterias que crecieron en la placa produciendo colonias
y expresan la proteína fluorescente verde dividido en la cantidad de DNA
plasmidial utilizada.
N° de colonias en la placa de agar
Eficiencia de transformación =
µg de DNA plasmidial en la placa de agar
Para el cálculo de la cantidad de DNA plasmidial en la placa de agar
deberás solicitar al profesor que te indique la concentración de la solución
que se usó en el experimento. Registra este dato a continuación:
Concentración de solución de DNA plasmidial = _ _ _ _ _ _ µg/µL
Para calcular el numerador de la expresión del cálculo de la
eficiencia de transformación tienes que contar las colonias presentes en la
placa LB/amp/ara.
Para calcular el denominador necesitas saber cuánto DNA se
colocaste en la placa. Para esto necesitas el dato de la concentración de
la solución y el volumen de esta solución que colocaste en la placa.
µg de DNA plasmidial = Concentración (en µg/µL) × Volumen (en µL)
Para esto debes tener en cuenta que colocaste 10 µL de DNA
plasmidial sobre 250 µL de solución de transformación y sobre eso
agregaste 250 µL de medio LB. Finalmente colocaste 100 µL de esa mezcla
en la placa con medio de cultivo. ¿Qué volumen de los 10 µL iniciales
están contenidos en los 100 µL que colocaste en la placa?
Cálculos
Laboratorio 6: Extracción de ADN genómico
Los Kits también incluyen soluciones de lisis, unión y lavado que no contienen
fenol ni cloroformo para extraer proteínas, tampoco requieren etanol para
precipitar al ADN. Los kits comerciales disminuyen la extracción a unas
cuantas horas porque reducen el número de pasos del procedimiento y,
utilizados bajo las recomendaciones de cada proveedor, garantizan una
extracción de alta pureza ya que tanto la recuperación del ADN como la
eliminación de contaminantes son muy eficientes.
Nitrógeno líquido
Pistilos u homogeneizadores
Los pistilos disgregan la muestra mediante fricción con la pared del tubo que
contiene la muestra, adicionalmente se puede utilizar algún material
abrasivo como vidrio pulverizado o resinas. El proceso se realiza
manualmente, con pistilos plásticos o con ayuda de dispositivos
electrónicos, conocidos como homogenizadores. Es recomendable
adicionar un poco del buffer de lisis antes de iniciar, estas soluciones
desnaturalizan a las proteínas y mantienen estable al ADN. Cuando se
utilizan dispositivos es necesario colocar el tubo sobre una cama de hielo, lo
cual evita que el ADN se fragmente por el calor que genera la fricción. El
uso de pistilos u homogeneizadores se recomienda en general para
muestras pequeñas y tejidos blandos, aunque también se usa para tejidos
no fibrosos como hojas jóvenes o flores. No es recomendable utilizar este
método con tejidos congelados, porque las células del interior del tejido se
descongelan antes de entrar en contacto con la solución de lisis y el ADN se
fragmenta por acción de las DNasas. En este caso se recomienda que el
tejido se disgregue en presencia de nitrógeno líquido. Alternativamente se
pueden utilizar el buffers comerciales como RNALater® ICE (Ambion®). La
muestra se sumerge en el reactivo y se mantiene a -20°C toda la noche,
posteriormente se puede descongelar la muestra y macerar sin requerir
nitrógeno líquido (http://
www.ambion.com/catalog/CatNum.php?AM7030M, consultado en
octubre del 2010).
b) Homogeneización química
Lisis celular
Después de que son eliminados los lípidos y las proteínas, se recupera el ADN.
Para ello, se adiciona etanol y soluciones con altas concentraciones de
iones de sodio o amonio que se unen a los grupos fosfato, esta mezcla
reduce las fuerzas repulsivas entre las cadenas y permite que el ADN se
pliegue sobre sí mismo haciéndolo insoluble.Un paso de centrifugación
permite que el ADN permanezca en el fondo del tubo mientras que el etanol
es desechado. Los restos de etanol se eliminan con un lavado con etanol al
70% y el remanente se elimina por evaporación.
Redisolución del ADN
2. Protocolo Comercial
Guia basada en Extracción y purificación de ADN. Laura Patricia Alejos Velázquez, María del Consuelo
Aragón Martínez,2Amelia Cornejo Romero
6.1. Parte experimental:
Materiales:
v Columna de Hibing.
v Tubos de 2ml
v BL Buffer
v TL Buffer
v HBC Buffer
v DNA Wash Buffer
v Elution Buffer
v OB proteasa
• Centrifuga
• Baño termoregulador 55ºC
• Baño termoregulador 70ºC
• Hielo
• Tubos Eppendorf
• Etanol absoluto
Protocolo:
Materiales:
• Agarosa
• Buffer TAE 1X
• Buffer DYE
• Gel red
• Agua destilada
• Cubeta electoforesis
• Fuente de poder