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CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS

5.1- El Código Genético y


el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación,
elongación y
terminación.

5.4- Modificaciones post-


translacionales de las
proteínas.
CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS
CLASE 5.1.

• La translación es la síntesis de proteínas dirigida por el mRNA, constituye el


primer paso para la formación de proteínas funcionales.

• Las cadenas de polipéptidos deben plegarse en conformaciones funcionales


apropiadas a través de varios procesamientos que incluyen el transporte y
clasificación.

• La síntesis de proteínas dirigida por mRNA es un proceso altamente conservado a


lo largo de la evolución..

Tema 5: Síntesis de proteínas


CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS

5.1- El Código Genético y el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación, elongación y terminación.

5.4- Modificaciones post-translacionales de las proteínas.

5.5- Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos
Elhai J (2017). Companion to Crick et al (1961). Current Genetics (2021)

Tema 5: Síntesis de proteínas Elhai J (2017). Companion to Crick et al (1961).


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos

The Cell. 7th ed. Cooper

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos

The Cell. 7th ed. Cooper

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos

The Cell. 7th ed. Cooper

Tema 5: Síntesis de proteínas


EL CÓDIGO GENÉTICO

-Todos los mRNAs son traducidos en sentido 5′-3′, y las cadenas de polipéptidos
son sintetizadas desde el extremo amino al carboxilo.
-Infecciones con fagos T4 WT y/o mutantes en bacterias E. Coli mostraron que
los amino-acidos son codificados por tripletes de nucleótidos
-Problema: Cómo asignar a cada triplete de nucleótidos su correspondiente
amino-ácido?

-AAA: LISINA

-CCC: PROLINA

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell. 7th ed. Cooper


EL CÓDIGO GENÉTICO: 43= 64 POSIBLES COMBINACIONES

The Cell. 7th ed. Cooper


Tema 5: Síntesis de proteínas
EL CÓDIGO GENÉTICO: 43= 64 POSIBLES COMBINACIONES

-M: GENERALMENTE INICIA LA TRADUCCION


-STOP: UAA, AUG y UGA FINALIZAN LA TRADUCCION
-EL CÓDIGO GENÉTICO ESTÁ DEGENERADO, MUCHOS AMINO-ACIDOS
ESTÁN CODIFICADOS POR MÁS DE UN TRIPLETE.

Tema 5: Síntesis de proteínas


RNAs DE TRANSFERENCIA (tRNA)
Los tRNAs son moléculas adaptadoras que parean los codones (3 nucleótidos en el RNA)
con los amino-ácidos correspondientes
-Los tRNAs están formados por 70-80 nucleótidos
-Los tRNAs tienen la secuencia CCA en N-terminal
-El anticodón se une al codón apropiado en cada caso
-Estructura y modificaciones en capítulo 3.

Tema 5: Síntesis de proteínas


AMINOACYL tRNA SINTASAS
Amino-acyl tRNA sintasas catalizan en dos pasos la unión del amino-ácido al tRNA (-3´).

1. Formación de un intermediario
aminoacyl AMP.

2. Unión del amino-ácido al extremo 3´


1 del tRNA y liberación de AMP.

3. Proceso muy selectivo: La tRNA sintasa


debe reconocer tanto los aminoácidos como
2 el tRNA con el anti-codon específico.
-En humanos hay una tRNA sintasa para
cada aa.
Mol. Biol. Of The Cell. Alberts 6th ed.

Tema 5: Síntesis de proteínas


AMINOACYL tRNA SINTASAS
Amino-acyl tRNA sintasas catalizan en dos pasos la unión del amino-ácido al tRNA (-3´)

3.1. La tRNA sintasa reconoce los aa´s por : 1. Formación de un intermediario


-Tamaño (una vez unido al AMP). Amino-acyl AMP.
-Afinidad/Interacción con anticodón
2. Unión del amino-ácido al extremo 3´
del tRNA y liberación de AMP.

3. Proceso muy selectivo: La tRNA sintasa


debe reconocer tanto los aminoácidos como
el tRNA con el anti-codon específico.
-En humanos hay una tRNA sintasa para
cada aa.

Tema 5: Síntesis de proteínas Mol. Biol. Of The Cell. Alberts 6th ed.
AMINOACYL tRNA SINTASAS
Aminoacyl tRNA sintasas catalizan en dos pasos la unión del amino-ácido al tRNA (-3´)

3.1. La tRNA sintasa reconoce los aa´s por : 3.2. La tRNA sintasa edita un aa incorrectamente
-Tamaño (una vez unido al AMP). Incorporado si no encaja perfectamente en el
-Afinidad/Interacción con anticodón sitio de síntesis.
-Hidroliza el AMP ó el aa en el sitio de edición.

Tema 5: Síntesis de proteínas Mol. Biol. Of The Cell. Alberts 6th ed.
PAREAMIENTO NO ESTÁNDAR DE LOS tRNA SOBRE LOS mRNA
• El pareamiento codón-anticodón es menos astringente que las uniones A-U; G-C
estándard. Los tRNAs pueden reconocer más de un codon en el mRNA.

• Las células tienen unos 40 tRNAs para 20 aminoácidos, lo que es efecto de un


pareamiento no estandarizado de bases que se denomina “wobble” (bamboleo) en
la tercera posición

Tema 5: Síntesis de proteínas


PAREAMIENTO NO ESTÁNDAR DE LOS tRNA SOBRE LOS mRNA

• El pareamiento codón-anticodón
es menos astringente “wobble”
(bamboleo) en la tercera posición

Tema 5: Síntesis de proteínas


MODIFICACIONES DE LOS tRNAs Y ENFERMEDAD
1. ALTERACIONES EN MODIFICACIONES DEL tRNA

Sabine A. Fuchs. Genetics in Medicine, 2019


Tema 5: Síntesis de proteínas
VARIANTES PATOGÉNICAS DE LOS ARS Y ENFERMEDAD
2. ALTERACIONES EN ARS (Aminoacyl tRNA sintasas )

LEUCINE (L)-ARS

TIROSINE (Y)-ARS

Tema 5: Síntesis de proteínas Sabine A. Fuchs. Genetics in Medicine, 2019


VARIANTES PATOGÉNICAS DE LOS ARS Y ENFERMEDAD
2. ALTERACIONES EN ARS

Tema 5: Síntesis de proteínas Sabine A. Fuchs. Genetics in Medicine, 2019


CMT ES UNA ENFERMEDAD CAUSADA POR VARIANTES ARS
Charcot – Marie –Tooth (CMT) es una enfermedad neuromuscular hereditaria sin cura.

DOI 10.1002/emmm.201100626

Tema 5: Síntesis de proteínas


CMT ES UNA ENFERMEDAD CAUSADA POR VARIANTES ARS
Charcot – Marie –Tooth (CMT) es una enfermedad neuromuscular hereditaria sin cura.

Berciano J. et al J. Neurol. 2011,

Tema 5: Síntesis de proteínas


CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS

5.1- El Código Genético y el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación, elongación y terminación.

5.4- Modificaciones post-translacionales de las proteínas.

5.5- Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Síntesis de proteínas


RIBOSOMAS
-Estructuras formadas por rRNA y proteínas que realizan la síntesis de proteínas
-Los ribosomas son denominados por su velocidad de ultra-centrifugación:
70S en bacterias y 80S en eukaryotas.

Tema 5: Síntesis de proteínas


LOS RIBOSOMAS ESTÁN FORMADOS POR 2 SUBUNIDADES
-Estructuras formadas por rRNA y proteínas que realizan la síntesis de proteínas
-Los ribosomas son denominados por su velocidad de ultra-centrifugación:
70S en bacterias y 80S en eukaryotas; constan de dos subunidades

-La subunidad grande (50S) puede


catalizar la formación de enlaces
peptídicos incluso en ausencia de
hasta el 90% del contenido de
proteínas.
-Una imagen de alta resolución muestra
que en la subunidad 50S, las proteínas
están ausentes del sitio catalítico de la
Actividad peptidyl-transferasa.

Tema 5: Síntesis de proteínas


LOS rRNA Y LA ACTIVIDAD CATALÍTICA
-Estructuras formadas por rRNA y proteínas que realizan la síntesis de proteínas
-Los ribosomas son denominados por su velocidad de ultra-centrifugación:
70S en bacterias y 80S en eukaryotas; constan de dos subunidades

-La subunidad grande (50S) puede


catalizar la formación de enlaces
peptídicos incluso en ausencia de
hasta el 90% del contenido de
proteínas.
-Una imagen de alta resolución muestra
que en la subunidad 50S, las proteínas
están ausentes del sitio catalítico de la
Actividad peptidyl-transferasa.

Tema 5: Síntesis de proteínas


LOS rRNA Y LA ACTIVIDAD CATALÍTICA
-Estructuras formadas por rRNA y proteínas que realizan la síntesis de proteínas
-Los ribosomas son denominados por su velocidad de ultra-centrifugación:
70S en bacterias y 80S en eukaryotas; constan de dos subunidades

A site – aminoacyl

P site – peptidyl

E site - exit
Tema 5: Síntesis de proteínas
CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS
CLASE 5.2.

5.1- El Código Genético y el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación, elongación y terminación.

5.4- Modificaciones post-translacionales de las proteínas.

5.5- Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Síntesis de proteínas


TRASLACIÓN: INICIO
-La traducción no comienza necesariamente en el extremo 5´de un mRNA.

mRNA policistrónico: Codifica para varias proteínas (usualmente procariotas).


mRNA unicistrónico, usualmente eucariotas.
UTR: regiones del mRNA NO traducidas (función reguladora?)

The Cell: A Molecular Approach 9th ed.

Tema 5: Síntesis de proteínas


TRASLACIÓN: INICIO
-La traducción no comienza necesariamente en el extremo 5´de un mRNA.
-El inicio de la traducción tiene importantes diferencias entre procariotas y eucariotas:
-En procariotas por secuencias específicas alineadas al 16S rRNA.
-En eucariotas por unión específica de la 7-metil-guanosina cap a la subunidad 40S y escanéo en
busca del codón de iniciación.

The Cell: A Molecular Approach 9th ed.

Tema 5: Síntesis de proteínas


TRASLACIÓN
-La traducción no comienza necesariamente en el extremo 5´de un mRNA.
-El inicio de la traducción tiene importantes diferencias entre procariotas y eucariotas:

-Una misma molécula de mRNA puede ser simultáneamente traducida por varios
ribosomas (polisoma).

Tema 5: Síntesis de proteínas


TRASLACIÓN
1. Inicio:
-Requiere al menos 12 proteínas denominadas eIFs (eukaryotic Initiation Factors)
1. Se ensamblan eIF1, eIF1A y eIF3 junto a 40S.
1 2. Se ensamblan eIF2-GTP con tRNA iniciador (MET).
2 3. Se forma el complejo de pre-iniciación de 1, 2 y eIF5.
4. eIF4E reconoce el m7G cap del mRNA.
Se une a eIF4A y eIF4B.
5. La proteínas PABP (Poly-A binding protein), se une a la
cola de poli-As del extremo 3´del mRNA y eIFG (en -3´).
3
-Se forma un complejo de eIFs en extremos -5´ y -3´.

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


TRASLACIÓN
1. Inicio:
-Requiere al menos 12 proteínas denominadas eIFs (eukaryotic Initiation Factors)

6 1. Se ensamblan eIF1, eIF1A y eIF3 junto a 40S.


2. Se ensamblan eIF2-GTP con tRNA iniciador (MET).
3. Se forma el complejo de pre-iniciación de 1, 2 y eIF5.
4. eIF4E reconoce el m7G cap del mRNA.
Se une a eIF4A y eIF4B.
5. La proteínas PABP (Poly-A binding protein), se une a la
cola de poli-As del extremo 3´del mRNA y eIFG (en -3´).

-Se forma un complejo de eIFs en extremos -5´ y -3´.


7

6. El complejo inicia un escaneo hacia el AUG


7. eIF5B induce la hidrólisis de GTP-eIF2 lo que provoca:
a) Disociación de los eIFs.
b) Reclutamiento de la subunidad 60S para formar el
Complejo de iniciación 80S.
Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.
TRASLACIÓN
1. Inicio:
-Requiere al menos 12 proteínas denominadas eIFs (eukaryotic Initiation Factors)
-Excepcionalmente: Algunos mRNAs eucariotas y mRNAs virales tienen secuencias IRES.

IRES: Internal Ribosomal Entry Site.


-Traslación independiente de 5´cap.
-Requiere unión directa de iEF4A/G
y/ó
-Unión al 40S

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


TRASLACIÓN
1. Inicio.
2. Elongación: Unión de tRNAs para elongar una cadena polipeptídica.

1 1.-El primer aminoácido está unido en P (peptidil).

2.-El segundo aminoácido se une en A (aminoacil)


a donde llega escoltado por el factor de elongación
eEF1α unido a GTP.
3
3.-Despues del enlace peptídico y la hidrólisis de
2 GTP-eEF2, se unen el primer y segundo
aminoácidos, el sistema se desplaza 3 nucleótidos
hacia 3´ dejando A, libre de nuevo y liberando el
tRNA.
-La subunidad ribosomal pequeña proporciona un
nivel extra de vigilancia, es el centro de
decodificación: Sensor de un correcto
alineamiento entre el codon y el anti-codon.
Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.
TRASLACIÓN
1. Inicio.
2. Elongación: Unión de tRNAs para elongar una cadena polipeptídica.

*-Un momento importante es la


regeneración de eEF1α-GTP a cargo
eEF1βγ.

*-Así eEF1α-GTP puede segur


escoltando aminácidos para
elongación.

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


TRASLACIÓN
1. Inicio.
2. Elongación: Unión de tRNAs para elongar una cadena polipeptídica.
3. Terminación: llegada a codones STOP: UAA, UAG ó UGA

* -No existen tRNAs específicos se realiza a


través de un factor de liberación.

-El factor de liberación se une en A, y


estimula la hidrólisis de la unión tRNA-aa
y la liberación de todos los componentes
del complejo.

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


REGULACIÓN DE LA TRASLACIÓN
1. Regulación de la expresión genética o transcripción.
2. Regulación por unión de represores a secuencias específicas del mRNA.

-Ferritina: su mRNA tiene una secuencia


IRE (Iron Response Element) en 5´.
-En ausencia de hierro la proteína IRF
(Iron Regulatory Factor), se une a IRE para
impedir su traslación.

-Otros ejemplos: Union de proteínas


represoras por union a los eIFs en 3´.
HuR.
-Afectan a la localización subcelular y la
estabilidad del mRNA.

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


REGULACIÓN DE LA TRASLACIÓN: miRNA
1. Regulación de la expresión genética o transcripción.
2. Regulación por unión de represores a secuencias específicas del mRNA.

https://www.youtube.com/watch?v=t5jroSCBBwk

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


REGULACIÓN DE LA TRASLACIÓN: miRNA
1. Regulación de la expresión genética o transcripción.
2. Regulación por unión de represores a secuencias específicas del mRNA.

https://www.youtube.com/watch?v=t5jroSCBBwk

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 9th ed.


REGULACIÓN DE LA TRASLACIÓN: miRNA
1. Regulación de la expresión genética o transcripción.
2. Regulación por unión de represores a secuencias específicas del mRNA.
3. Regulación global de la traslación por modulación de eIF2 y eIF4.

Tema 5: Síntesis de proteínas The Cell: A Molecular Approach 7th ed.


CAPÍTULO 5: MECANISMOS DE BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS

5.1- El Código Genético y el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación, elongación y terminación.

5.4- Modificaciones post-translacionales de las


proteínas.

5.5- Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Síntesis de proteínas


MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
VER CAPÍTULOS 7 & 9.

Tema 5: Síntesis de proteínas


MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES

-Proteolisis: Es un proceso irreversible llevado a acabo por las proteasas. Lo vemos en el


capítulo 7.

-Ubiquitinización: Modificación de proteínas a través de la adición de moléculas de


ubiquitina en residuos de lisina. Lo vemos en capítulo 7.

-Principales modificaciones covalentes (reversibles) de proteínas:


• Fosforilación de Ser, Thr, Tyr (Muchas proteínas; señalización intracelular; cap. 9)
• Acetilación de Lys (e.g. histonas)
• Metilación de of Lys and Arg (e.g.histones)
• Ubiquitilación / SUMOilación de Lys (cap. 7)
• O-glycosilación Ser, Thr
Glicosilación
• N-glycosilación: Asn Proteínas de membrana y
• Palmitilación: Cys extracelulares
• Miristilación: Gly Lipidación
• Prenilación: Cys
• ADP-ribosilación: Arg
• Oxidación o hidroxilación; Pro, Lys (e.g. collagens)
• Citrulinación: Arg (e.g. histones)
• Nitrosilación (adición de grupos NO): Cys
Tema 5: Síntesis de proteínas
FOSFORILACIÓN DE PROTEÍNAS
La fosforilación de proteínas regula la actividad de múltiples proteínas efectoras (cap. 9)
-Las protein kinasas transfieren grupos fosfato (ATP) a los grupos hidroxilos (-OH) de
Ser, Thr (S/T kinasas) ó Tyr (T kinasas).

-Las fosfatasas defosforilan las proteínas.

CAPÍTULO 9.

Tema 5: Síntesis de proteínas


ACETILACIÓN/METILACIÓN/NITROSILACIÓN DE PROTEÍNAS

Tema 5: Síntesis de proteínas


ACETILACIÓN/METILACIÓN/NITROSILACIÓN DE PROTEÍNAS

Tema 5: Síntesis de proteínas


ACETILACIÓN/METILACIÓN/NITROSILACIÓN DE PROTEÍNAS

Tema 5: Síntesis de proteínas


GLICOSILACIÓN DE PROTEÍNAS
• Glicosilación: Añade cadenas de carbohidratos a las proteínas para formar
Glicoproteínas.
• Juegan un papel importante en el ER, transporte de proteinas y en el
reconocimiento de sitios de unión en interacciones moleculares

Tema 5: Síntesis de proteínas


GLICOSILACIÓN DE PROTEÍNAS
• Glicosilación: Añade cadenas de carbohidratos a las proteínas para formar
Glicoproteínas.
• Juegan un papel importanre en el ER, transporte de proteinas y en el
reconocimiento de sitios de unión en interacciones moleculares

N-linked glycoproteins: El carbohidrato se une al átomo de


hidrógeno de la cadena lateral de la asparagine.

O-linked glycoproteins: El carbohidrato carbohydrate se une


al átomo de oxígeno de la cadena lateral de la serina o
treonina

Tema 5: Síntesis de proteínas


GLICOSILACIÓN DE PROTEÍNAS
La glicosilación constituye un primer paso en el ER y Golgi para la adición de otros
carbohidratos (azúcares), que se añaden secuencialmente.

Tema 5: Síntesis de proteínas


GLICOSILACIÓN DE PROTEÍNAS
La glicosilación constituye un primer paso en el ER y Golgi para la adición de otros
carbohidratos (azúcares), que se añaden secuencialmente, uno a uno.

-La incorporación de lípidos a las cadenas de oligosacáridos (glicolípidos) , suele


dirigir las proteínas diana a la membrana plasmática (naturaleza hidrofóbica).
Ejemplos

-Frecuentemente el lípido es el inositol.


-Las proteínas resultantes se suelen llamar anclas
GlicosilPhosfatidilinositol (GPI).
Tema 5: Síntesis de proteínas Mol. Biol. Cell, Alberts 6th Ed.
The Cell: A Molecular Approach 7th ed.
CÓMO SE ASOCIAN LAS PROTEÍNAS A LAS MEMBRANAS BILIPIDICAS
-Básicamente a través de regiones hidrofóbicas ricas en :
Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met & Trp.

-La adición de cadenas de ácidos grasos incremente esta hidrofobibidad. 8


6

3
1 2 5
4 7
1 Una hélice alpha Mol. Biol. Cell, Alberts 6th Ed.

2 Múltiples hélices alpha 4 Vía una hélice alpha con residuos


orientados a la MP.
3 Barril de láminas beta con 5 Por unión covalente a un lípido o un 7 Por unión no-covalente
algunas cadenas unidas a grupo prenil. a otras proteínas de
8 membrana
ácidos grasos (1). 6 GPI: Unión de un polisacárido a
inositol.
Tema 5: Síntesis de proteínas
LIPIDACIÓN DE PROTEÍNAS
1. N-miristoilación: Un ácido graso (ácido mirístico) se une en N-terminal a una glicina.
La proteína resultante se asocial a la cara interna de la membrana plasmática

Tema 5: Síntesis de proteínas


LIPIDACIÓN DE PROTEÍNAS
1. N-miristoilación: Un ácido graso (ácido mirístico) se une en N-terminal a una glicina.
La proteína resultante se asocial a la cara interna de la membrana plasmática
2. Prenilación: Grupos prenilo, se unen a un grupo sulfuro en la cadena lateral de una
cisteina cerca del C-terminal. Las proteínas resultantes se asocian al control de
proliferación y diferenciación celulares (e.j. Proteínas RAS)

Tema 5: Síntesis de proteínas


LIPIDACIÓN DE PROTEÍNAS
1. N-miristoilación: Un ácido graso (ácido mirístico) se une en N-terminal a una glicina.
La proteína resultante se asocial a la cara interna de la membrana plasmática
2. Prenilación: Grupos prenilo, se unen a un grupo sulfuro en la cadena lateral de una
cisteína cerca del C-terminal. Las proteínas resultantes se asocian al control de
proliferación y diferenciación celulares (e.j. Proteínas RAS)
3. Palmitoilación: El ácido palmítico (un ácido graso) se une al grupo sulfuro en la
cadena lateral de una cisteína interna. La proteína resultante se asocial a la cara
interna de la membrana plasmática.

Tema 5: Síntesis de proteínas


LIPIDACIÓN DE PROTEÍNAS. ENFERMEDADES ASOCIADAS
1. N-miristoilación: Un ácido graso (ácido mirístico) se une en N-terminal a una glicina.
La proteína resultante se asocial a la cara interna de la membrana plasmática
2. Prenilación: Grupos prenilo, se unen a un grupo sulfuro en la cadena lateral de una
cisteína cerca del C-terminal. Las proteínas resultantes se asocian al control de
proliferación y diferenciación celulares (e.j. Proteínas RAS)
3. Palmitoilación: El ácido palmítico (un ácido graso) se une al grupo sulfuro en la
cadena lateral de una cisteína interna. La proteína resultante se asocial a la cara
interna de la membrana plasmática.

Adapted from Resh et al., (2012) Trends Mol.Med

Tema 5: Síntesis de proteínas


CITRULIZACIÓN
La citrulinación consiste en la coversión enzimática de residuos de Arg.
Provoca un ligero cambio de masa pero pérdida de cargas (+), alterando su capacidad
de interacción molecular. Afecta a las histonas y otras proteínas

Tema 5: Síntesis de proteínas Adapted from Witalison., (2015) Curr. Drug Targets
CITRULIZACIÓN
La citrulinación consiste en la coversión enzimática de residuos de Arg.
Provoca un ligero cambio de masa pero pérdida de cargas (+), alterando su capacidad
de interacción molecular. Afecta a las histonas y otras proteínas

Tema 5: Síntesis de proteínas Arseniy E Yuzhalin Can. Res 2019.


PLEGAMIENTO Y DESTINO DE LAS PROTEINAS
CLASE 5.3.

5.1- El Código Genético y el RNA de Transferencia.

5.2- El ribosoma

5.3- Iniciación, elongación y terminación.

5.4- Modificaciones post-translacionales de las proteínas.

5.5- Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


CAPÍTULO 6: PLEGAMIENTO Y DESTINO DE LAS PROTEINAS
Una proteína functional debe:

A) Estar correctamente plegada


B) Estar en la localización cellular correcta

Mecanismos de plegamiento; Enzimas y chaperonas

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
Christian Afinsen (1957) demostró que una proteína
(RNAsa) que se desnaturalizaba, se replegaba
espontáneamente a su conformación nativa (activa).

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas The Cell. Cooper 8th ed.


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
Existen varios niveles de complejidad a la hora de explicar cómo se pliega una
proteína para ser funcional:

1. Estructura primaria: secuencia de Aas


unidas por enlaces peptídicos.

2. E. secundaria: Donde se establecen


organizaciones locales de AAs en forma de
helices o láminas.

3. Estructura terciaria: Donde las proteínas


adquieren estructuras 3D complejas.

4. Estructura cuaternaria: formada por


asociaciones multiméricas ó
supramoleculares

Mol. Cell. Biol. Lodish 8th ed.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA PRIMARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.

1. El enlace peptídico forma un plano.

2. Los planos de dos enlaces peptícos solo


pueden rotar en ángulos phi (φ) y psi (ψ)
alrededor de un carbonoα.
3. La paradoja de Levinthal:
Mol. Cell. Biol. Lodish 8th ed.
Un polipéptido pequeño de 100 AAs tiene 99
BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL Y METABÓLICA enlaces peptídicos y 198 ángulos de rotación
phi y psi.
Tiempo para que una proteína se pliegue
correctamente?

-Suponiendo 3 conformaciones estables de


las cadenas lateral/ángulo por ángulo

-Posibilidades 3198 si cada una llevara un


Mol. Biol. Cell. Alberts 6th ed. tiempo pequeño 10-13seg, tardaría 1077 años

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA PRIMARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.

-Sin embargo el proceso de plegamiento de 1


proteína de 100 AAs es prácticamente
inmediato.
-Existen varios mecanismos que intervienen
en el proceso.
-Las proteínas se pliegan para alcanzar un
estado de minima energía libre.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA PRIMARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.

-Sin embargo el proceso de plegamiento de 1


proteína de 100 AAs es prácticamente
inmediato.
-Existen varios mecanismos que intervienen
en el proceso.
-Las proteínas se pliegan para alcanzar un
estado de minima energía libre.
-Las proteínas denominadas chaperonas juegan
un papel importante:

-Promueven el plegamiento

-Previenen formación de oligomeros o grandes


F. Ulrich Hartl. Et al. Nature 2011
agregados q a veces provienen de estados
intermedios de plegamiento .

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA PRIMARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
-La suma de varias fuerzas débiles, no-covalentes, crea una unión fuerte esencial en el
plegamiento de proteínas:
1) Puentes de hidrógeno, 2) las atracciones electrostáticas (+, -) y las fuerzas de van der
Waals; También las atracciones hidrófobicas.

Mol. Biol. Cell. Alberts 6th ed.


Tema 5: Plegamiento y función de proteínas
PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA PRIMARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
-La suma de varias fuerzas débiles, no-covalentes, crea una unión fuerte esencial en el
plegamiento de proteínas:
1) Puentes de hidrógeno, 2) las atracciones electrostáticas (+, -) y las fuerzas de van der
Waals; También las atracciones hidrófobicas.

-La distribución de aminoácidos polares vs.


No-polares es determinante.

-Los AAs polares tienden a situarse en el


exterior de la proteína y así interaccionar
con el H20.

-Los AAs no-polares forman un cuerpo


hidrofóbico en el interior de la proteína

Mol. Biol. Cell. Alberts 6th ed.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA SECUNDARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
2. E. secundaria: Organizaciones locales de AAs en forma de hélices o láminas.

-Hélices alfa:
-Estabilizadas por puentes de
hidrógeno entre N-H y C=O.

-Las cadenas laterales se disponen


hacia afuera.

Mol. Biol. Cell. Alberts 6th ed.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA SECUNDARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
2. E. secundaria: Organizaciones locales de AAs en forma de hélices o láminas.

-Hélices alfa:
-Estabilizadas por puentes de
hidrógeno entre N-H y C=O.

-Las cadenas laterales se disponen


hacia afuera.
-Láminas beta:
-Disposición paralela ó anti-paralela
de péptidos adyacentes.
-Estabilizadas por puentes de
hidrógeno entre N-H y C=O. de
cadenas diferentes

-Las cadenas laterales se disponen


Mol. Biol. Cell. Alberts 6th ed.
hacia afuera.
Tema 5: Plegamiento y función de proteínas
PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA TERCIARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
2. E. secundaria: Organizaciones locales de AAs en forma de hélices o láminas.
3. E. terciaria: Organizaciones 3D funcionales.
-Estabilización por puentes de hidrógeno entre N-H y C=O y por
interacciones hidrofóbicas

-Incluye la estabilización de estructuras secundarias.


Tema 5: Plegamiento y función de proteínas

-Se forman estructuras poco rígidas y bastante flexibles/permisivas.

-Los puentes di-sulfuro limitan esta permisividad.

The Cell. Cooper 8th ed.


PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS. ESTRUCTURA CUATERNARIA
1. Estructura primaria: secuencia de AAs unidos por enlaces peptídicos.
2. E. secundaria: Organizaciones locales de AAs en forma de hélices o láminas.
3. E. terciaria: Organizaciones 3D funcionales.
4. E. cuaternaria: Organizaciones 3D de varios péptidos.

Ejemplo de estructura terciaria


y cuaternaria.

-Hemaglutinina (HA) en la
superficie de la membrana de un
virus de influenza
Conformaciones de hélices alfa y
láminas beta (marrón)

-La estructura cuaternaria


estabiliza tres subunidades de
HA cada una incorpora ac. siálico

Mol. Cell. Biol. Lodish 8th ed.

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LAS CHAPERONAS PLIEGAN PROTEÍNAS IN VIVO
-Las chaperonas se unen en N-terminal a cadenas de polipéptidos que están siendo
sintetizadas en los ribosomas.
-la gran concentración de proteínas favorece intercacciones moleculares específicas.
-Estabiliza la proteína, previene plegamientos aberrantes y la formación de agregados
no deseados con otras proteínas.
-La conformación final depende de la secuencia de Aas.
Tema 5: Plegamiento y función de proteínas
LAS CHAPERONAS PLIEGAN PROTEÍNAS IN VIVO
-Las chaperonas se unen en N-terminal a cadenas de polipéptidos que están siendo
sintetizadas en los ribosomas.
-Estabilizan polipéptidos en el cytosol y durante su transporte a organelas.

-Otras características:
Hidrolizan ATP para funcionar.
Incremento de su concentración en
situaciones de stress:

-Calor: Heat Shock Proteins

-IMPORTANTE:
Muchas regiones de muchas proteínas
permanecen desestructuradas

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


LAS CHAPERONAS PLIEGAN PROTEÍNAS IN VIVO
1. Chaperonas: Se unen a un segmento corto (unos 100 AAs), generalmente de
naturaleza hidrofóbica de una proteína substrato y la estabilizan bien sin plegar, ó
bien, parcialmente plegada.
Familia: Hsp70 (por su peso molecular en Kda), (DnaK en bacterias)
Familia Hsp90. Pliega muchas proteínas involucradas en señalización intracellular.
Otras familias: Hsp40, Hsp100, sHsp.

2. Chaperoninas: Forman cámaras de plegamiento donde las proteínas tienen tiempo


para plegarse correctamente.

Familia Hsp60: TCP1 en vertebrados, GroEL en bacterias.


CCT o TRiC: pliega tubulinas y actina

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


FAMILIA Hsp70
Hsp70 (por su peso molecular en Kda), (DnaK en bacterias), se unen a segmentos
hidrofóbicos cortos de unos 7 AAs

Son las más abundantes

A) Dominio N-terminal (ATPase).


La hidrólisis de ATP provoca
cambios conformacionales de B.
Adapted from HSPIR Database
B) Unión a substrato.
Se asocial temporalmente con
pequeñas regiones ricas en Aas
hidrofóbicos.
C) The lid:
Abierta: Hsp70 está unida a ATP
Cerrada: Hsp70 está unida a ADP
-La unión al sustrato está favorecida
por las Hsp40 (cochaperonas)
Tema 5: Plegamiento y función de proteínas
FAMILIA Hsp90
Hsp90 (por su peso molecular en Kda), son una de las proteínas que más se expresan
en eucariotas (alrededor del 1% de la proteína soluble total).

-Participan en el plegamiento de proteínas en un estado de


plegamiento/procesamiento más avanzado.

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CHAPERONINAS
CHAPERONINAS
-Forman complejos oligoméricos (alrededor de 800 kDa) en forma de cámara o caja.
-Las Hsp60 (57 kDa; muy conservadas y ubicuas) forman dos anillos heptaméricos
con una cavidad central.
-Participan en el plegamiento de proteínas en un estado de
plegamiento/procesamiento más avanzado.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


CHAPERONINAS
CHAPERONINAS
-Forman complejos oligoméricos (alrededor de 800 kDa) en forma de cámara o caja.
-Las Hsp60 (57 kDa; muy conservadas y ubicuas) forman dos anillos heptaméricos
con una cavidad central.
-Participan en el plegamiento de proteínas en un estado de
plegamiento/procesamiento más avanzado.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ACCION SECUENCIAL DE LAS CHAPERONAS Y CHAPERONINAS

The Cell 7th ed.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


PAPEL GENERAL DE LAS CHAPERONAS

3
1

2 2

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENZIMAS CON FUNCIÓN CHAPERONA
Protein disulfide isomerase (PDI) Catalizan la formación de puentes didulfuro. Las PDI
son abundantes en el ER, donde el ambiente oxidativo favorece este proceso.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENZIMAS CON FUNCIÓN CHAPERONA
Protein disulfide isomerase (PDI) Catalizan la formación de puentes didulfuro. Las PDI
son abundantes en el ER, donde el ambiente oxidativo favorece este proceso.

Peptidyl prolyl isomerases: Catalizan la isomerización en forma de configuraciones cis-trans de


enlaces peptídicos con residuos de prolina (Pro). De otra forma se limita el plegamiento
correcto de algunas proteínas.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ALGUNAS CUESTIONES SOBRE EL PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
-Cadenas polipeptídicas desordenadas: Una cantidad importante de fragmentos
proteicos permanecen desordenados.

-Para conformar, por ejemplo, una estructura


estable cuando la proteína a la que pertenecen
forma un complejo con otra molécula.

-Para participar en cambios estructurales y/o


de función tras ser modificadas. Por ejemplo
por fosforilación.

-Para mantener proteínas que van a


interaccionar en proximidad. (ej. scaffolds)

-Para formar barreras de difusión


(ej. Poro nuclear).

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
-Fibrosis quística: Causada por una mutación recesiva del gen CFTR.

-Incidencia de 1/3000-4000

-La alteración más frecuente Phe508 afecta a


su interacción con las chaperonas y produce un
plegamiento deficiente.

-Como consecuencia no se produce el


transporte de iones de Cl- a traves de la MP.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
-Fibrosis quística: Causada por una mutación recesiva del gen CFTR.
-Otros ejemplos:.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
-Fibrosis quística: Causada por una mutación recesiva del gen CFTR.
-Otros ejemplos:

Formación de agregados amiloides caracterizados por la adopción de estructuras


en forma de láminas beta que se acumulan. Causa Alzheimer (cerebro) ó diabetes

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
-Fibrosis quística: Causada por una mutación recesiva del gen CFTR.
-Otros ejemplos:

Formación de agregados amiloides caracterizados por la adopción de estructuras


en forma de láminas beta que se acumulan. Causa Alzheimer (cerebro) ó diabetes

-En el caso del Alzheimer, se


produce:

-Agregados de fragmentos de la
proteina precursora amiloide (APP).

-Formación de nudos
neurofibrilares que acumulan
proteínas TAU hiper-fosforiladas
que se acumulan en el cerebro.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
-Fibrosis quística: Causada por una mutación recesiva del gen CFTR.
-Otros ejemplos:

Formación de agregados amiloides caracterizados por la adopción de estructuras


en forma de láminas beta que se acumulan. Causa Alzheimer (cerebro) ó diabetes .

Agregados de huntingtina en el cerebro

-Producida por la acumulación de


nucleótidos CAG en el gen que
codifican para Gln y alargan la
proteína de HTT.

-La acumulación de cadenas largas


de Gln, genera proteínas muy
pegajosas q generan estos
agregados.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
La propagación de priones es otra enfermedad causada por defectos del plegamiento

-Enfermedad de las vacas locas,


transmitida a humanos?

-Tambien se desarrolla
espontáneamente pero es ultra-rara

Fuente el Pais.

Tema 5: Plegamiento y función de proteínas


ENFERMEDADES DERIVADAS DE FALLOS EN EL PLEGAMIENTO
La propagación de priones es otra enfermedad causada por defectos del plegamiento

-Enfermedad de las vacas locas,


transmitida a humanos?

-Creutzfelt-Jakob, tambien se desarrolla


espontáneamente en humanos pero es
ultra-rara.

La proteína nativa se denomina PrPc


forma de hélice alfa. En su estado
infeccioso se denomina PrPSc . La forma
infecciosa se propaga por inducer el
plegamiento amiloide de la forma
normal y agregación.

Se comporta como una enfermedad


infecciosa mediada por proteínas mal
The Cell, 7th ed.
plegadas en ausencia de material
genético.
Tema 5: Plegamiento y función de proteínas

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