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4. CINÉTICA MICROBIOLÓGICA:
4.1. CINÉTICA ENZIMÁTICA: es el estudio de las reacciones químicas
catalizadas por enzimas, proporcionando información directa del
mecanismo de la reacción catalítica y de la especificidad del enzima.
4.1.1. PROPIEDADES CATALÍTICAS DE LAS ENZIMAS:
4.1.1.1. ENZIMAS: son moléculas orgánicas que actúan como catalizadores,
acelerando las reacciones químicas, sin consumirse ni pasar a formar parte
de los productos de la reacción; por lo general son proteínas, aunque existe
el ARN que tiene actividad catalítica.
4.1.1.2. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS: en función de su acción catalítica,
se clasifican en seis grandes grupos o clases:
CLASE 1: OXIDORREDUCTASA.
CLASE 2: TRANSFERASAS
CLASE 3: HIDROLASAS
CLASE 4: LIASAS
CLASE 5: ISOMERASAS
CLASE 6: LIGASAS
4.1.1.3: NOMENCLATURA EC DE LAS ENZIMAS:
El nombre de cada enzima puede ser clasificado por un código numérico,
encabezado por las letras EC (Enzyme Comisión), seguidas de cuatro
números separados por un punto, como se ilustra en el GRAFICO No 4.1-1
*Anteriormente, las enzimas recibían los nombres particulares con las que
los designaban sus descubridores. Al aumentarse el número de las
enzimas conocidas, se hizo necesario establecer una nomenclatura
sistemática, que informará sobre la acción específica de cada enzima y los
sustratos sobre los que actuaba.
GRÁFICO No 4.1-1
E.C.1.2.3.4.
CLASE PRINCIPAL
SUBCLASE (Tipo de enlace sobre el que actúa)
SUB-SUBCLAS (Grupo sobre el que actúa, etc.)
NÚMERO DE ORDEN (En que fue añadido)
4.1.4.1. MECANISMOS DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA: La reacción química
catalizada, por un enzima, utiliza igual cantidad de sustrato y genera la
misma cantidad de producto que la misma reacción no catalizada. Tal como
ocurre con otros tipos de catálisis, las enzimas no alteran, para nada, el
equilibrio de la reacción, entre el sustrato y el producto.
La velocidad de la reacción química va aumentando, en la medida que
aumenta la concentración de sustrato, hasta que la enzima se satura y
después que la enzima alcanza el punto de saturación, aunque se añada
más sustrato, no aumentará la eficiencia.
*Sintetizando, se reafirma, las enzimas aumentan la velocidad sin
modificar la constante de equilibrio de la reacción.
En general, las condiciones para que se efectué una reacción bioquímica,
son:
a. Los reactivos deben colisionar.
b. La colisión molecular tiene que ocurrir con una orientación adecuada.
c. Debe haber un equilibrio favorable: La ∆𝐺 𝑜 debe ser negativo.
Esquematizando, la reacción enzimática (4.1-1) se representa así:
𝐾1 𝐾2
E + S ES E +P (4.1-1)
𝐾−1 𝐾−2
La enzima (E) se une al sustrato (S), a través de su centro activo y le hace
adoptar un estado de transición (ES), semejante al estado de transición de
las reacciones no catalizadas, pero de menor energía.
Los siguientes gráficos ilustran el mecanismo de la catálisis enzimática:
* GRÁFICO 4.1-2: MODELO DE AJUSTE INDUCIDO (Kosland,1958)
𝑃1
E + S ⇾ E S ⇾E +
𝑃2
GRAFICO 4.1-3
ENERGÍA DE ACTIVACIÓN DE LA GLUCOSA CATALIZADA POR UNA ENZIMA
𝐸 + 𝑆 ⇌ 𝐸𝑆 ⇀ 𝐸 + 𝑃 (4.1-2)
𝑲−𝟏
𝑑[𝐸𝑆]
= 𝐾1 [𝐸 ][𝑆] − 𝐾−1[𝐸𝑆] − 𝐾2 [𝐸𝑆] = 0
𝑑𝑡
𝐾1 [𝐸][𝑆] 𝐾−1 + 𝐾2
[𝐸𝑆] = ⇾ Se define a 𝐾𝑚 =
𝐾−1 +𝐾2 𝐾1
GRÁFICO 4.1-4
REPRESENTACIÓN GRÁFICA DE LA ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
𝟏 𝑽𝒎𝒂𝒙 [𝑺]
𝑉𝒎𝒂𝒙 = ⇾ 0,006𝑀 + [𝑆] = 3[𝑆] ⇾ 𝟐[𝑺] = 0,006M
𝟑 𝟎,𝟎𝟎𝟔+[𝑺]
[𝑺] = 𝟎, 𝟎𝟎𝟑 𝑴
4.1.2. Determine la fracción de la velocidad máxima que se obtendría con
una concentración de sustrato equivalente a seis veces la constante de
Michaelis-Menten.
SOLUCIÓN DEL PROBLEMA:
En la ecuación de Michaelis- Menten, reemplazamos la concentración de
sustrato dada [𝑆] = 6𝐾𝑚 y obtenemos la fracción requerida:
𝑉max[𝑆] 𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆] 𝑉max[𝑆] 1
𝑉𝑂 = ⇾𝑉0 = = = 𝑉𝑚𝑎𝑥
𝐾𝑚 +[𝑆] 6[𝑆]+[𝑆] 7[𝑆] 7
1 𝐾𝑚 +[𝑆]
=
𝑉𝑜 𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆]
Linealización
1 𝐾𝑚 1 1
= + (4.1-3.1
𝑉𝑜 𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆] 𝑉𝑚𝑎𝑥
1
𝑦 = 𝑚 + 𝑦0 [Linea recta]
[𝑆]
𝐾𝑚
=𝑚
𝑉𝑚𝑎𝑥
1⁄
𝑉𝑚𝑎𝑥
𝑦0 = − 1⁄𝐾
𝑚
1⁄
[𝑆]
4.1.7.2. ECUACIÓN DE EADIE-HOFSTEE:
Esta transformación lineal de la ecuación de Michael-Menten se obtiene de
la siguiente de la siguiente manera:
𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆]
𝑉𝑜 = (4.1-3)
𝐾𝑚 +[𝑆]
𝑽𝒐
𝑽𝒎𝒂𝒙
−𝑲𝒎
𝑽𝒎𝒂𝒙
𝑲𝒎
𝑽𝒐
[𝑺]
1 𝐾𝑚 +[𝑆]
=
𝑉0 𝑉𝑚𝑎𝑥 [𝑆]
[𝑆] 𝐾𝑚 +[𝑆]
= Linealización
𝑉𝑜 𝑉𝑚𝑎𝑥
[𝑺] 𝑲𝒎 𝟏
= + [S]
𝑽𝟎 𝑽𝒎𝒂𝒙 𝑽𝒎𝒂𝒙
[𝑺] 𝟏 𝑲𝒎
= [𝑺] + (4.1-3.3)
𝑽𝟎 𝑽𝒎𝒂𝒙 𝑽𝒎𝒂𝒙
[𝑺]
= 𝒎[𝑺] + 𝒚𝒐 (Linea recta)
𝑽𝟎
[𝑆]
Al graficar ⁄𝑉 VS [𝑆] se puede determinar los parámetros cinéticos
0
𝐾𝑚 𝑦 𝑉𝑚𝑎𝑥
[𝑺]
⁄𝑽
𝟎
𝟏
𝒎=
𝑽𝒎𝒂𝒙
𝑲𝒎
𝑽𝒎𝒂𝒙
−𝑲𝒎
[𝑺]
4.2. CINÉTICA MICROBIANA: Es el estudio sistemático de los procesos y
reacciones de la vida microbiana, consistente con la reproducción,
desarrollo, muerte, adaptación, ciclos celulares e interacciones
ambientales.
4.2.1. CRECIMIENTO MICROBIANO: es el incremento ordenado de todos los
constituyentes químicos de los microorganismos por aumento en la masa
microbiana o en el número de células.
4.2.2. MEDICIÓN DEL CRECIMIENTO: el crecimiento de una población se
mide a través de los siguientes métodos.
4.2.2.1. MÉTODOS DIRECTOS:
a. Conteo del número de células, por cuenta directa en el microscopio o
por cuenta en el número de células vivas o viables.
b. Determinación de la masa celular, por peso en seco, después de una
filtración o de una centrifugación.
4.2.2.2. MÉTODOS INDIRECTOS: con los cuales se logra determinar el
crecimiento microbiano, a través de procesos, tales como:
a. Consumo de sustrato.
b. Formación de productos.
c. Mediciones cinéticas.
d. Actividades enzimáticas.
e. determinación de componentes celulares.
* En general, la escogencia de un método para determinar el crecimiento
depende de la clase de microorganismo, del medio de cultivo utilizado,
de la sensibilidad requerida en la medición, el tiempo requerido y de la
misma confianza en el método.
GRÁFICO No 4.2-
60
50
𝑵𝒕
40
30
20
10
0 10 20 30 40 50 60
𝒕: 𝒎𝒊𝒏 ⇾
Las anteriores ilustraciones pueden expresarse en ecuaciones para
determinar el tiempo de generación (g), bajo el supuesto que:
𝑵𝟎 : es número inicial de células.
𝑵𝒕 : es número de células o población en el tiempo t.
𝒏 : es el número de generaciones.
Del análisis de la Tabla No 4.2-1, se infiere:
𝑵𝒕 = 𝑵𝒐 𝟐𝒏 (4.1-1)
Para obtener, explícitamente, la expresión para calcular el número de
generaciones, se aplica la función logaritmo a la ecuación anterior:
𝑙𝑜𝑔𝑁𝑡 = log 𝑁0 𝑋 𝑛 log 2
𝑙𝑜𝑔𝑁𝑡 −𝑙𝑜𝑔𝑁0
𝑛= (4.1-2)
log 2
La velocidad de crecimiento, durante esta fase exponencial, en un cultivo
discontinuo, pude expresarse por la constante de velocidad de crecimiento
(𝒌) , equivalente al número de generaciones por unidad de tiempo,
generalmente expresado en horas, o sea:
𝑛
𝑘= (4.1-3)
𝑡
Al reemplazar 𝑛 por la relación obtenida anteriormente, se llega a que:
𝑙𝑜𝑔𝑁𝑡 −𝑙𝑜𝑔𝑁𝑜
𝑘= (4.1-4)
𝑡 𝑙𝑜𝑔2
𝑔 = 1⁄𝑘
𝑡𝐴 = 𝑡𝐵 * CLAVE:
A B
𝑛 1
𝑘= =
𝑡 𝑔
𝑡 = 𝑛𝑔
𝑛𝐴 = 4⁄log 2
𝑡𝐴 = 𝑡𝐵
𝑛𝐴 𝑔𝐴 = 𝑛𝑏 𝑔𝐵
𝑛𝐴 𝑔𝐵 /2= 𝑛𝐵 𝑔𝐵
𝑛𝐵 = 𝑛𝐴 /2
𝑁𝑡𝐵 = 𝑁0𝐵 2𝑛𝐵
𝑛𝐴
𝑁𝑡𝐵 = 𝑁0𝐵 2 2
4 2
4 (2𝑙𝑜𝑔2) 4 (log 2)
𝑁𝑡𝐵 = 10 2 = 10 2
𝑁𝑡𝐵 = 104 ∗ 102
𝑁𝑡𝐵 = 106
𝑁𝑡𝐵 = 1 𝑚𝑖𝑙𝑙ó𝑛 𝑑𝑒 𝑐é𝑙𝑢𝑙𝑎𝑠
𝑁𝑡 = 𝑁0 2𝑛
𝑁𝑡
𝑁0 =
2𝑛
1024000 𝑐é𝑙𝑢𝑙𝑎𝑠
𝑁0 =
210
1024000 𝑐é𝑙𝑢𝑙𝑎𝑠
𝑁0 =
1024
𝑁0 = 1000 𝑐é𝑙𝑢𝑙𝑎𝑠
4.2.2.3. CRECIMIENTO CONTINUO: Es el crecimiento en cual el medio de
cultivo se renueva constantemente y el número de células y el estado
metabólico permanecen en estado de equilibrio.
El crecimiento continuo se realiza en un reactor biológico, el cual es un
tanque de producción que mantiene el crecimiento microbiano, en la fase
exponencial, con un aporte continuo de nuevo material para que pueda ser
utilizado por los microorganismos, a la vez que se va retirando el exceso de
estos.
El tipo más común de cultivo continuo se realiza en el quimiostato, en el
cual se controla la densidad de la población y la tasa de crecimiento del
cultivo y consiste básicamente en el siguiente esquema:
GRÁFICO No 4.2-3
REACTIVOS: METABOLISMO:
M𝑀𝐸 PRODUCTOS:
𝐹𝐶𝐸 CATABOLISMO
𝐹𝑁 𝑃{ 𝑋, 𝐶𝑂2 , 𝐻2 𝑂, ∆𝐻𝑅 }
𝑂2
ANABOLISMO
(𝑃, 𝑆, 𝐾, 𝑀𝑔 )
(𝐶𝑎 , 𝑀𝑛 , 𝐹𝑒 , 𝑒𝑡𝑐) 𝑃(No metabólicos)
𝐹𝑎𝑐𝑡𝑜𝑟𝑒𝑠 𝐴𝑚𝑏𝑖𝑒𝑛𝑡𝑎𝑙𝑒𝑠
REACTOR BIOQUÍMICO
b. PROCESOS ANAERÓBICOS:
𝑎𝐹𝐶𝐸 + 𝑏𝐹𝑁 ⇾ 𝑐𝑋 + 𝑑𝑃 + 𝑓𝐻2 𝑂 + ∆𝐻𝑅
GRÁFICO No 4.1-5
REACTIVOS: PRODUCTOS:
FC
FN MIROORGANISMOS 𝑷𝑴 : 𝑋, 𝐶𝑂2 , 𝐻2𝑂, ∆𝐻𝑅
𝑂2 (𝐴𝑒𝑟ó𝑏𝑖𝑐𝑜𝑠) QUIMIOORGANOTRÓFOS
*(𝑃, 𝑆, 𝐾, 𝑀𝑔 ) 𝑷
∗ (𝐶𝑎 , 𝑀𝑛 , 𝐹𝑒, 𝑒𝑡𝑐)
∗ 𝐹𝑎𝑐𝑡𝑜𝑟𝑒𝑠 𝑑𝑒 𝑐𝑟𝑒𝑐𝑖𝑚𝑖𝑒𝑛𝑡𝑜
CAJA NEGRA
𝐶𝑂2 + 𝐻2 𝑂 + 𝑁𝐻3
COMPUESTO
DE: C, H, O y N + 𝑛𝑂2 P{ }+∆𝐻𝐶
𝐶𝑂2 + 𝐻2 𝑂 + 𝑁2
𝑒𝑞 𝘦−
𝑟𝑋 2 = 4eq 𝘦− X 1,2⁄𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 = 4,8
𝑁
⁄𝐶 − 𝑚𝑜𝑙
𝐶𝐻2 𝑂 + 𝑎𝑁𝐻3 + 𝑏𝑂2 ⇾ 𝑦𝑋⁄𝑠 𝐶𝐻1,8 𝑂0,5 𝑁0,2 + 𝑦𝑃⁄𝑠 𝐶𝐻3 𝑂0,5 + 𝑦𝐶𝑂2⁄ 𝐶𝑂2 + 𝑤𝐻2 𝑂 + ∆𝐻𝑅
𝑠
𝑎 ∶ 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝐹𝑁⁄
𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑂2⁄
𝑏 ∶ 𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
𝑦𝑋⁄𝑠 ∶ 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑋⁄𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝐶𝑂2⁄
𝑦𝐶𝑂2⁄ : 𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
𝑆
𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝐻2 𝑂⁄
𝑤 ∶ 𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
𝑘𝑖𝑙𝑜𝐽𝑢𝑙𝑖𝑜𝑠⁄
∆𝐻𝑅 : 𝐶 − 𝑚𝑜𝑙 𝑑𝑒 𝑆
Obsérvese que los coeficientes estequiométricos pueden expresarse
como rendimientos y si bien no se ha tenido en cuenta el tiempo en que
ocurre la susodicha reacción, conocemos que las concentraciones de los
nutrientes y productos van a evolucionar, de alguna forma en el
transcurso del cultivo. Analizamos el ejemplo, más sencillo , de cultivo
con los nutrientes necesarios para su crecimiento e inoculamos, en
forma estéril, la cepa que queremos producir como biomasa; si no
intervenimos más el proceso ( continuo o discontinuo), al final del
cultivo, observaremos que las cantidades de nutrientes, que colocamos
al inicio, disminuyen e incluso aparecerán productos del metabolismo
microbiano y habrá un incremento de biomasa, como resultado de la
reproducción celular: Tomando el inicio y final de dicho cultivo, como
puntos de referencia, podemos calcular los rendimientos de tal cultivo,
en función de las medidas experimentales de la concentración de los
reactivos y de los productos, de la siguiente manera:
𝐵𝑖𝑜𝑚𝑎𝑠𝑎 𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑖𝑑𝑎 ∆𝑋 𝑋𝑓 −𝑋𝑜
𝑦𝑋⁄ = = =
𝑆 𝐹𝐶𝐸 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑢𝑚𝑖𝑑𝑎 ∆𝑆 𝑆𝑜 −𝑆𝑓
𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜 𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑖𝑑𝑜 ∆𝑃 𝑃𝑓
𝑦𝑃⁄ = = =
𝑆 𝐹𝐶𝐸 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑢𝑚𝑖𝑑𝑎 ∆𝑆 𝑆0 −𝑆𝑓
𝑦𝑋⁄ ∆𝑋
𝑆 ∆𝑆 ∆𝑋
𝑦𝑋⁄ = = ∆𝑁 =
𝑁 𝑎 ∆𝑁
∆𝑆