Bioenergética.

¿Qué es la Bioenergética?

Es el estudio de la fuente de energía de la célula y organismo, y cómo esta energía es usada

para generar trabajo. Todos los procesos que requieren energía sirven para el crecimiento,
estructura, generación de moléculas, almacenaje y una serie de actividades a nivel celular.

¿Cómo se almacena esa energía?

A través de los enlaces químicos entre las moléculas, y se extrae gracias a los procesos
de oxidación gradual que llevaran a la síntesis y generación de moléculas de CO2 y agua,
que son el producto final de estos procesos catabólicos.

La gran mayoría de las células obtiene esa energía y nuestros

nutrientes serán los alimentos con macromoléculas como lípidos,
proteínas y carbohidratos y estos serán catabolizados oxidados para liberar energía.

Diferencia entre combustión y oxidación biológica.

En ambos casos tendremos hidrógeno y oxígeno para generar agua, pero la combustión
(que no es una reacción fácil para la célula) libera muchísima energía en forma de calor.

En el caso de las oxidaciones biológicas, la energía liberada no es calor sino ATP y eso ocurre
en la cadena transportadora de electrones. Esa energía la célula es utilizada para distintos
procesos como el trabajo químico, mecánico y electroquímico.

A continuación se muestra un ejemplo para clarificar algunos conceptos.

Imagine tener un papel en la mano, este papel está en presencia de oxígeno, y eso según la
reacción que se puede observar en la imagen, se puede transformar en humo, cenizas, CO 2
y agua. Evidentemente, este no es un proceso espontáneo, el papel lo tenemos en la mano y
no por estar en presencia de oxígeno, se descompondrá automáticamente en humo, cenizas,
CO2 y agua.Para que ocurra el proceso, se le debe dar energía al sistema, por ejemplo,
encendiendo un fósforo.
Entonces ocurrirá que este papel que tiene las moléculas muy ordenaditas, gracias al calor
aplicado van a desordenarse, esto se traducirá en pérdida de energía libre. La energía libre
es aquella energía para hacer trabajo.

Todas estas reacciones químicas que van a ocurrir, solo van a ser favorables cuando
implique pérdida de energía libre.

Las moléculas se desordenan Pérdida de

Energía Libre Energía para hacer “trabajo”
En la imagen se puede observar una esfera verde en un río, la esfera llega a una pendiente
y cae, esa reacción es energéticamente favorable, ya que no habrá problema para que esta
esfera caiga. El proceso reverso, donde la esfera tuviese que subir la pendiente, no sería
energéticamente favorable.

Al esquematizar estas reacciones en una gráfica, se puede

apreciar en el eje de las abscisas la vía de reacción y en el eje de las ordenadas a la energía total. La
molécula X se va a transformar en la molécula Y, se puede ver también, que el nivel de energía de la
molécula X es mayor que la de Y, por lo tanto esta última es más estable, energéticamente hablando.

Este proceso requiere saltar una barrera energética, esa activación puede ser facilitada, en los
sistemas biológicos, por las enzimas.
Las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores, es decir, aceleran las reacciones,
pero aquellas reacciones energéticamente favorables. Esta aceleración puede darse por un
factor de al menos 1014, o sea que puede aumentar la velocidad de reacción en gran magnitud.

¿Qué es una reacción energéticamente favorable?

Es una reacción química que ocurre de forma espontánea, siempre que esto se traduzca en
un desorden del universo.

En la imagen pueden verse cubos hielo, los que comenzarán a derretirse, se observa que
las moléculas de agua en el cubo de hielo están mucho más ordenadas que en su forma
líquida. Este es un proceso energéticamente favorable porque se traduce en un incremento
en el desorden.

Lo mismo ocurre en este otro ejemplo, donde si miramos, a la derecha tenemos un contenedor
vacío y uno con gas en su interior, separados por un pequeño tabique o llave, si la abrimos,
estas moléculas de gas pasarán al contenedor antes vacío, desordenándose. Esto es un
proceso espontáneo.
Energía libre de Gibbs (G)

Energía para hacer trabajo. Está implicada en el incremento del desorden en el universo.

Cambio en esta energía libre (ΔG): Combina los cambios en la entalpía y entropía, y
predice si una reacción es o no energéticamente favorable.

-Entalpía: Se relaciona con el calor.

-Entropía: Se relaciona con el orden.

En esta imagen vemos una persona que está subiendo una roca en
esta montaña, este proceso no es espontáneo, requiere de
energía.

En cambio, al dejar caer la

piedra estamos hablando de un proceso
energéticamente favorable, ya que la piedra caerá sin
ningún problema y con ello se liberará energía.

Entonces si lo vemos en el esquema (ver imagen),

subir la piedra requerirá un trabajo, el sistema
requiere de energía. Ese ΔG será positivo.

Al dejar caer la piedra, esto no requerirá de energía,

por lo tanto, esta será una reacción en donde se
libere calor, energía. El ΔG será menor a 0.

Reacción energéticamente favorable: ΔG < 0

Reacción energéticamente desfavorable: ΔG > 0

Reacción en equilibrio: ΔG = 0

Segunda Ley de la Termodinámica

La cantidad de orden en el universo, o en un sistema aislado, siempre va a decrecer. O sea,

el desorden se incrementa.

La entropía en un sistema y su alrededor se incrementa de forma espontánea. Mayor

desorden, mayor entropía. >Desorden >Entropía

Vemos este contenedor que tiene un tabique que

separa dos gases. Si sacamos ese tabique estos
gases se van a mezclar y evidentemente habrá más
desorden.
Estos gases también pueden interactuar entre ellos,
supongamos que tenemos moléculas de oxígeno e
hidrógeno, entonces se formará agua. Esto estará más
ordenado, por lo tanto, si logramos ordenar estas
moléculas se liberará calor, y este calor liberado inducirá
al desorden en el medio externo.

O sea, si aquí ordenamos significa que en otro lugar se

estará desordenando.Acá podemos ver otro ejemplo A
medida que pasa el tiempo el cubo de azúcar que está dentro del vaso precipitado se va a disolver, pasa
de tener un mayor orden o uno más desordenado (vaso precipitado derecha arriba)

¿El proceso para revertir este proceso (a) se puede realizar?

Si, es más lento como también más difícil, un ejemplo es con la evaporación del agua, lo que se
conseguirá es que el azúcar consiga un mayor orden dentro de la solución (no se conseguirá el
mismo orden del cubo). (b) al conseguir un mayor orden del azúcar
(vaso derecho abajo) a la vez provocará un mayor desorden de las
moléculas de gas que están por encima del azúcar, ya que tienen
mayor movimiento que una molécula líquida.

En esta reacción que está la glucosa más oxígeno en los reactantes se transforma en CO2 y agua Lo que
se puede ver debajo de la reacción hay en las reactantes 7 moléculas, después pasa a tener 12 moléculas
de producto y al aumentar el número de moléculas se aumenta el desorden y con esto se aumenta la
entropía. Acá podemos ver que pasar de un estado líquido a un estado gaseoso pasa a estar más
desordenado Acá representa para de un estado sólido a un estado líquido en el cual hay también un mayor
desorden en el estado líquido. Acá el soluto se va a disolver en el disolvente
y se formara esta disolución lo cual provoca que pase de un orden de
moléculas a uno de mayor desorden.En el caso de las proteínas la cual se
representa acá, la proteína tiene que alcanzar una estructura y ensamblaje
correcto, el cual en la imagen de arriba todavía no lo alcanza.
En la imagen de abajo se ve una proteína ensamblada y ordenada lo cual
representa que hay una baja entropía, para que se logre eso la entropía
tiene que haberse incrementado en algún otro lugar del sistema o alrededor
de estas proteínas.

Lo que quieren decir estas representaciones de proteínas, es que está ocultando esos residuos que son
más hidrofóbicos los cuales no están en contacto con el medio acuoso.

Alguna molécula o proteína que no es polar, no le gusta estar interactuando con el agua, lo que harán
están moléculas para poder evitar ese contacto, es ordenarse o asociarse entre ellas lo cual provoca tener
regiones que no estarán interactuando con el agua, llevando esto a que en el agua haya un mayor
desorden quiere decir que si se logra orden en un lugar es porque se incrementa el desorden en el medio
que lo rodea.
Análisis Termodinámico de una Célula.

Las células necesitan nutrientes que vienen de su alimentación.

¿Qué se va a lograr con esos nutrientes, con la energía que viene de su proceso de
degradación?

Las moléculas (verde), que están en la imagen de la izquierda están desordenadas

y en la de la derecha están ordenadas.

La energía que se va a liberar va a ser en forma de calor.

El calor va a inducir desorden, por lo que vemos que si dentro de la célula se ha

ordenado en el medio extracelular se ha llevado a un desorden.
Por lo tanto, hay que tener en claro que la célula en si no está desordenada, tiene una baja
entropía.

Un aspecto importante es que la célula, termodinámicamente hablando, no es un sistema

aislado.

Los sistemas que existen son:

Sistema abierto: Permite el intercambio tanto de energía como de materia.

Sistema cerrado: Solamente permite el intercambio de energía.

Sistema aislado: No permite el intercambio ni de energía ni de materia.

La célula es un sistema abierto.

En el fondo esto es lo que permite las reacciones a nivel celular.

A pesar de que las reacciones pueden ser reversibles y que podrían llegar a un equilibrio,
esto no se logrará, porque este equilibrio se dará en un sistema aislado, por ejemplo, en un
tubo de ensayo.

Lo que ocurre en una célula es que el compuesto A se transforma en el compuesto B y este

compuesto B podría dar origen al A. Pero este proceso, este equilibrio, no ocurre.

El proceso celular va a continuar gracias a que está molécula A qué se convirtió en B, ahora
esta molécula B pasa a ser sustrato para convertirse en otro producto que será el C. A-->B--
>C

Por lo tanto, lo que ocurre en la célula es que los productos no se van acumulando, sino que
se van utilizando como sustratos de las siguientes reacciones y esto hace que no se alcance
el equilibrio.

Por eso es importante tener presente que esto es posible gracias a que la célula, el
organismo, es un sistema abierto.
Primera Ley de la Termodinámica.

“La energía puede ser convertida de una forma a otra, pero no puede ser creada o
destruida, es constante”

En la imagen se puede ver como va cambiando la energía a través de las

distintas reacciones, a pesar de que la energía total va a mantenerse.

Energía Potencial à Cinética à Calórica.

Tenemos un ladrillo que está suspendido y va a tener una energía potencial debido a su
posición.

¿Qué pasa si dejamos caer este ladrillo?

Va a haber un cambio de energía cinética porque va a haber movimiento y cuando este

llegue al suelo se va a liberar calor (energía calórica).

La energía potencial que era inicial tendrá un alto grado de ordenamiento, va a estar
dada por la posición y estará asociada en cierto modo con los enlaces químicos.

Por otro lado, la energía cinética, que será un ordenamiento inferior al del potencial, esta
será la energía del movimiento.

Todas las energías (potencial, cinética, calórica) están asociadas a cambios en tipo de
energía que tienen que ver con distintos grados de ordenamiento. Aquí el calor se liberará y
el ordenamiento será incluso menor.

La energía cambiará como resultado de las reacciones químicas, pero la energía total será
siempre la misma.

Reacciones energéticamente favorables y desfavorables

Dentro de la biología existen 2 grupos de

reacciones, las reacciones
energéticamente favorables que tienen su
energía libre negativa pudiendo ocurrir
espontáneamente, mientras que el otro
grupo es el de reacciones
energéticamente desfavorables que no
ocurren espontáneamente, su energía
libre es positiva y requerirán un
suministro extra de energía.
Modelo mecánico de las reacciones acopladas

El modelo explica que una roca cae con cierta energía la cual se disipa en forma de calor
cuando la roca choca con el suelo. Este proceso es energéticamente favorable.

El proceso de levantar un balde con agua es energéticamente desfavorable, por lo que por
sí solo jamás se producirá.
 Ahora bien, si se conecta al balde una polea que toma la energía que proviene de la roca en
caída, entonces este proceso desfavorable se podrá realizar, cabe destacar que el calor que
dispara la rica al caer será menor puesto que la energía no varía, solo se transforma y en este
caso parte de la energía fue entregada a la polea por lo que el resto de la energía disponible
para el calor será menor. Finalmente, este transporte del balde con agua podrá realizar otras
funciones como la activación de una máquina hidráulica.

Las reacciones acopladas favorecen las reacciones

energéticamente desfavorables

En los procesos metabólicos se acoplarán o unirán procesos metabólicos favorables y

desfavorables para así mantener la vida de una célula. En las reacciones mostradas en la
imagen se desprenden una favorable y otra desfavorable. La de energía libre 10 no podrá
realizarse por sí sola, pero la de energía libre de -20 si lo podrá, pero es necesario que
ambas ocurran, por lo que se acoplan, sus energías libres se suman ósea 10+ -20 dando
como resultado una reacción global con energía de -10, la cual es energéticamente
favorable.Los procesos catabólicos son procedimientos de degradación de
macromoléculas de manera favorable, liberando calor y energía, la cual es utilizada por los
procesos anabólicos, los cuales implican la síntesis de macromoléculas de una manera
desfavorable, pero que, al usar la energía disponible, sí se logra concretar. Algo similar
ocurre en procesos de hidrólisis (favorable) que corresponde a la ruptura de una molécula
teniendo como reactante el agua y los procesos de condensación (desfavorable) el cual
libera agua en sus productos.

Reacciones acopladas en macromoléculas.

En los sistemas biológicos la energía de enlace la da el atp (principal transportador de
energía que tenemos)

El atp se puede hidrolizar en adp y fosfato inorgánico.(El atp tiene 3 grupos fosfatos y el
adp 2 + el fosfatoinorgánico)

La reacción favorable es la del delta g negativo(hidrólisis del atp) en cambio combinar adp
+ fosfatoinorgánico para sintetizar atp no es favorableenergéticamente (delta g es mayor
a cero)
El atp gracias a los enlaces altamente energético de los grupos fosfatos entrega energía a una
molécula cuando se asocia el grupo fosfato a ella (los grupos fosfatos son altamente energéticos)
El aa glutámico permite la síntesis del aa glutamina —> El glutámico al reaccionar con atp se
hidroliza en adp y fosfato inorgánico, el fosfato de asocia al glutamato y forma un enlace altamente
energético con la que le permite llevar a cabo la reacción.

● La glutamina tiene un grupo amino más que el glutamato

El glutamato es Altamente energético gracias al grupo fosfato que tiene asociado, esta
energía de enlace permite hacer el intercambio se reemplaza el grupo fosfato liberado por
un grupo amino y le da energia libre al compuesto

Formas de Hidrólisis del ATP.

Ppi: pirufosfato, se descompone después en dos fosfato inorgánico

● ambas formas de hidrólisis se traducen en energía utilizable

El segundo ejemplo de hidrólisis ocurre en la síntesis de ácidos nucleicos
Es importante que para el proceso de síntesis de atp o sus reacciones se
requiere de ion magnesio (el déficit de este ion prácticamente altera todos los
procesos metabólicos porque no permite sintetizar atp)

En cada célula se consumen 10 millones de atp por segundo

● el atp no se almacena sintetiza y se utiliza