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Una vez que la proteína se encuentra dentro del RE, se pliega y se modifica con azúcares y otros
grupos funcionales. Después, las proteínas se empaquetan en vesículas que se desplazan hacia el
complejo de Golgi, donde se producen más modificaciones y clasificación.
En el complejo de Golgi, las proteínas se clasifican en vesículas de transporte que las dirigen hacia
su destino final. Las proteínas pueden ser enviadas a la membrana plasmática para su secreción
fuera de la célula, a las membranas intracelulares o al exterior de la célula a través de exocitosis.
En el caso de las proteínas que se dirigen a las membranas intracelulares, se fusionan con la
membrana del orgánulo correspondiente. Por ejemplo, las proteínas destinadas a las mitocondrias
se fusionan con la membrana mitocondrial externa y luego son transportadas hacia la matriz
mitocondrial.