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BLOQUE 1
1. Describir los diferentes niveles estructurales de las proteínas
mencionando: enlaces que las estabilizan y conformación de su
estructura.
“En los mecanismos moleculares de casi todos los procesos biológicos participa
alguna o más proteínas”
En la exploración de los
mecanismos moleculares de un
proceso biológico, el bioquímico
debe estudiar de manera casi
inevitable una o más proteínas a
la vez, ya que en una sola célula
se pueden encontrar miles de
proteínas diferentes siendo éstas
los árbitros de las funciones
moleculares.
Las proteínas de todos los organismos
están construidas a partir su unidad
monomérica, estructura de sus
subunidades estructurales ”los
aminoácidos” es relativamente simple,
cada proteína está conformada por un
conjunto de 20 aminoácidos.
Son más solubles en agua o hidrofílicos que los aminoácidos apolares, debido a que
contiene grupos funcionales que forman puentes de hidrogeno con el agua. En esta
clase de aminoácidos se incluye: la serina, treonina, cisteína, asparagina y glutamina.
La estructura de moléculas
grandes como las proteínas
pueden definirse, según
varios niveles de
complejidad ordenados en
una especie de jerarquía
conceptual.
Normalmente se definen 4
niveles de estructura de las
proteínas:
❖ Primaria
❖ Secundaria
❖ Terciaria
❖ Cuaternaria
Estructura primaria
El enlace peptídico tiene carácter parcial de doble enlace por lo que es plano y rígido,
por lo que la estabiliza, pero en algunas ocasiones pueden ocurrir enlaces disulfuros,
para estabilizarla también.
➢ Hélice – α
➢ Hoja plegada - β
Aunque la energía de los enlaces es menor que la de las uniones covalentes, los
enlaces o puentes de hidrogeno desempeñan un cometido fundamental en la
estabilización de las moléculas proteicas. La cadena lateral R de los aminoácidos se
extiende hacia fuera de la hélice.
En la configuración de la
hoja plegada-β, el esqueleto
de la cadena polipeptídica
se extiende en zigzag.
Cuando las cadenas
polipeptídicas en zigzag
están dispuestas lado a
lado forman una estructura
que se parece a una serie
de pliegues.
Las láminas-β que interaccionan pueden disponerse para formar una lámina-β
paralela, en la que los segmentos adyacentes de la cadena polipeptídica proceden en
la misma dirección amino a carboxilo, o una lámina-β antiparalela, en la que proceden
en direcciones opuestas.
Lámina-β paralela
Arriba: lámina-β antiparalela. Los pares de enlaces de hidrógeno se alternan entre estar
muy juntos y separados, y están orientados aproximadamente perpendiculares a la
cadena principal del polipéptido.
Bucles y torsiones
Los giros y las torsiones se refieren a
segmentos cortos de aminoácidos que unen
dos unidades de la estructura secundaria,
como dos hebras adyacentes de una lámina β
antiparalela. Un giro β implica cuatro residuos
de aminoacilo, en los que el primer residuo
está unido por enlaces de hidrógeno al cuarto,
lo que da como resultado un giro apretado de
180°. La prolina y la glicina a menudo están
presentes en giros β.
Estructura terciaria
Estructura
La estructura de triple hélice del colágeno es exclusiva en las proteínas.
• Gly 35%
• Pro y 4-Hyp 21%
• Ala 11%
FIGURA 51-3 Representación esquemática del filamento fino, que muestra la configuración
espacial de sus tres principales componentes proteicos: actina, troponina y tropomiosina.
El panel superior muestra moléculas individuales de Actina G. El panel del medio muestra los
monómeros de actina ensamblados en Actina F. Moléculas individuales de tropomiosina (dos
hebras enrolladas una alrededor de la otra) y de troponina (formadas de sus tres
subunidades) también se muestran. El panel inferior muestra el filamento fino ensamblado,
que consiste en Actina F, tropomiosina, y las tres subunidades de troponina (TpC, TpI y TpT).
Proteína tetramérica que se encuentra en eritrocitos y
transporta O2, desde los pulmones hacia los tejidos.
Eritrocitos humanos normales: discos bicóncavos
pequeños (6 a 9 ym de diámetro). Vida media 120 días.
Transportan Hb.
Por ejemplo, la hemoglobina puede transportar H+ y CO2 desde los tejidos a los
pulmones, y puede llevar 4 moléculas de O2 desde los pulmones a las células del
organismo. Además, las propiedades de unión al oxígeno de la hemoglobina están
reguladas por interacción con efectores alostéricos (v. pág. 29).
Estructura cuaternaria de la hemoglobina.
El tetrámero hemoglobina puede imaginarse como un compuesto de dos dímeros
idénticos (αβ)1 y (αβ)2. Las dos cadenas polipeptídicas del interior de cada dímero se
mantienen estrechamente unidas, principalmente mediante interacciones hidrófobas
(fig. 3-4).
[Nota: en este caso, los residuos de aminoácidos hidrófobos están localizados no sólo
en el interior de la molécula, sino también en una región sobre la superficie de cada
subunidad]
[Nota: la unión del O2 al hierro hemo empuja el hierro al plano del grupo hemo. Dado
que el hierro está unido a la histidina proximal (F8), se produce un movimiento de las
cadenas globina que altera la superficie de contacto entre los dímeros αβ]
Estructura del grupo hemo
Esta homología hace de la mioglobina un modelo útil para interpretar algunas de las
propiedades más complejas de la hemoglobina.
1. Contenido α-helicoidal: la mioglobina es una molécula compacta, con
aproximadamente el 80 % de su cadena polipeptídica plegada en ocho tramos
de hélice-α. Estas regiones α-helicoidales, marcadas de A-H en la figura 3-2 A,
terminan por la presencia de prolina, cuyo anillo de cinco miembros no puede
acomodarse en una hélice α (v. pág. 16), o bien por la de giros β y bucles
estabilizados por puentes de hidrógeno y enlaces iónicos (v. pág. 17).
[Nota: los enlaces iónicos también se denominan interacciones electrostáticas o
puentes salinos.]
Estas interacciones son débiles y los ligandos pueden llegar a ser desplazados por
competidores del lugar de unión.
Osteogénesis imperfecta
Los trastornos genéticos de la biosíntesis de
colágeno incluyen varias formas de
osteogénesis imperfecta, caracterizadas por
huesos frágiles.
La osteogénesis imperfecta es una enfermedad que hace que los huesos se rompan
(se fracturen) fácilmente. También se le conoce como la enfermedad de los huesos de
cristal. Sus síntomas pueden ser leves o graves, dependiendo del tipo de osteogénesis
imperfecta que tenga.
Cualquier persona puede nacer con osteogénesis imperfecta, pero las personas que
tienen familiares con esta enfermedad tienen una mayor probabilidad.
Hay al muchos tipos diferentes de la enfermedad. Los tipos varían mucho, tanto dentro
como entre tipos. Se basan en el tipo de herencia, los signos y síntomas. Estos incluyen
hallazgos en radiografías y otras pruebas de imagen.
• Tipo I. Tipo más leve y más común. Alrededor del 50% de todos los niños
afectados tienen este tipo. Hay pocas fracturas y deformidades
• Tipo II. Tipo más grave. Un bebé tiene brazos y piernas muy cortos, un pecho
pequeño y un cráneo blando. Él o ella puede nacer con huesos fracturados.
También puede tener bajo peso al nacer y pulmones que no están bien
desarrollados. Un bebé con OI tipo II generalmente muere a las pocas semanas
de nacer
• Tipo III. El tipo más grave en bebés que no mueren como recién nacidos. Al nacer,
un bebé puede tener brazos y piernas ligeramente más cortos de lo normal y
fracturas de brazos, piernas y costillas. Un bebé también puede tener una cabeza
más grande de lo normal, una cara en forma de triángulo, un pecho y una
columna vertebral deformados, y problemas para respirar y tragar. Estos
síntomas son diferentes en cada bebé.
• Tipo IV. Los síntomas son entre leves y severos. Un bebé con tipo IV puede ser
diagnosticado al nacer. Es posible que no tenga ninguna fractura hasta que
gatee o camine. Los huesos de los brazos y las piernas pueden no estar rectos.
Es posible que no crezca normalmente.
• Tipo V. Similar al tipo IV. Los síntomas pueden ser de medio a grave. Es común
tener áreas engrosadas agrandadas (callos hipertróficos) en las áreas donde se
fracturan los huesos grandes
• Tipo VI. Muy raro. Los síntomas son medios. Similar al tipo IV.
• Tipo VII. Puede ser como el tipo IV o el tipo II. Es común tener una altura más corta
de lo normal. También es común tener la parte superior del brazo y los fémures
más cortos de lo normal.
• Tipo VIII. Similar a los tipos II y III. Huesos muy blandos y problemas graves de
crecimiento.
30_osteogenesis_imp.pdf (aeped.es)
Enfermedad de Alzheimer
El replegamiento o mal plegamiento de otra proteína endógena del tejido cerebral
humano, β-amiloide, es una característica prominente de la enfermedad de Alzheimer.
Si bien la causa principal de la enfermedad sigue siendo esquiva, las placas seniles
características y los haces neurofibrilares contienen agregados de la proteína β-
amiloide, un polipéptido de 4.3 kDa producido por la escisión proteolítica de una
proteína más grande conocida como proteína precursora amiloide.