Tema 6.

Nucleósidos, nucleótidos y ácidos

nucleicos.

1. Estructura general de los nucleósidos y nucleótidos.

Los nucleótidos participan en multitud de funciones celulares. Colaboran en funciones de

oxidorreducción, transferencia de energía, señales intracelulares y reacciones de
biosíntesis. Además, son los constituyentes de los ácidos nucleicos: ácido
desoxirribonucleico (DNA) y ácido ribonucleico (RNA), las principales moléculas
participantes en el almacenamiento y la descodificación de la información genética. Los
nucleótidos y los ácidos nucleicos también desempeñan papeles estructurales y catalíticos
en la célula. Ningún otro tipo de biomolécula participa en funciones tan variadas o en
tantas funciones esenciales para la vida.

Los nucleótidos están constituidos por tres componentes característicos: una base
nitrogenada, una pentosa y al menos un grupo fosfato.

Las bases nitrogenadas son moléculas planas, aromáticas, heterocíclicas, que derivan de
la purina o de la pirimidina. Las bases púricas más comunes son la adenina (A) y la
guanina (G). Ambas aparecen tanto en el DNA como en el RNA. Las bases
pirimidínicas principales son la citosina (C), el uracilo (U) y la timina (T). La citosina
se encuentra en ambos tipos de ácidos nucleicos, pero la timina sólo aparece en el DNA
y el uracilo únicamente en el RNA.
CAPÍTULO 6. NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS NUC

PURINAS
H NH 2 o

H
N
Ce N
.
N

9
N
H
1
s H
H N N
1
H
H2N N l
H
Purina Adenina Guanina

Figura 6-1. Bases púricas

de los ácidos nucleicos. La
nadas que forman parte de
se forman a partir de la pur
Pirimidina Citosina Uracilo
midina.

[ Base Nitrogenada + Azúcar = NUCLEÓSIDO J

Cltosina){_ _,_)
Nl: N;:
O N

+
/ H \
1 1
H20
J
OANJ
\ OH/ Desoxicitidina
(1-13-desoxirribofuranosil-citosina)
O , , H H
. H O ,. H H
H · 2' H OH H
OH H Desoxirribosa
 Las bases se unen a una pentosa (mediante el N-1 en las pirimidinas y el N-9 en las
purinas), a través de un enlace N-b-glucosídico con el C'-1 de la pentosa. A los átomos
de las pentosas de los nucleótidos se les añade el signo prima (') para distinguirlos de los
átomos de las bases nitrogenadas. En los ribonucleótidos, la pentosa es la D-ribosa,
mientras que en los desoxirribonucleótidos (desoxinucleótidos) el azúcar es la 2'-
desoxi-D-ribosa. Ambos tipos de pentosas se encuentran en forma b· El compuesto
resultante de la unión de una base más la pentosa es un nucleósido.

El grupo fosfato se une en la posición 5' de la pentosa normalmente, aunque también

Tema 6. Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos
puede aparecen en otras posiciones (2', 3'). La base más la pentosa más el fosfato
constituyen el nucleótido.
•Estructura general de los nucleósidos y nucleótidos
Tema 6. Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos

•Estructura general de los nucleósidos y nucleótidos: Nucleótidos nucleicos y no nucleicos

Los cuatro desoxirribonucleótidos principales que forman parte del DNA y los cuatro
ribonucleótidos
Nucleicos: precursores principales que forman parte del RNA son:
de los ácidos nucleicos

Ácidos ribonucleicos (ARN, o RNA)

Ácidos desoxirribonucleicos (ADN, o DNA)

Nucleótidos no nucleicos: Se encuentran libres en las células que intervienen en el

metabolismo y su regulación. actúan como activadores enzimas (aportando E en las
reacciones), como coenzimas o como intermediarios activos de la síntesis de
biomoléculas.

2. Oligonucleótidos y polinucleótidos.

Los nucleótidos pueden unirse unos a otros para formar el DNA o el RNA. La unión se
realiza mediante "puentes" de grupos fosfato, en los cuales el grupo -OH en la posición
5' de un nucleótido está unido al grupo -OH del siguiente mediante un enlace fosfodiéster.
De esta forma, los esqueletos de los ácidos nucleicos consisten en residuos de fosfato y
pentosa, quedando las bases nitrogenadas como grupos laterales unidos al esqueleto.

Todos los enlaces fosfodiéster tienen la misma orientación a lo largo de la cadena, con lo
cual cada cadena lineal de ácido nucleico tiene una polaridad específica y extremos 5' y
3' diferenciados. El residuo terminal cuyo C-5' no está unido a otro nucleótido se conoce
como extremo 5', mientras que el residuo terminal cuyo C-3' no está unido a otros
nucleótidos se llama extremo 3'. Por convención, la secuencia de residuos nucleotídicos
en un ácido nucleico se escribe, de izquierda a derecha, desde el extremo 5' hasta el 3'.

Un ácido nucleico de cadena corta se denomina oligonucleótido (generalmente hasta 50

nucleótidos). Los ácidos nucleicos de mayor longitud se denominan polinucleótidos.
 Principalmente ADN y ARN

•Estructura del ADN y del ARN

Estructura primaria o secuencia: tipo, número y orden de los residuos de nucleótido que los forman
Las cadenas están orientadas, sentido y extremos 5’ y 3’

5’ ATG 3’ 5’ UGC 3’

3. Estructura del ADN y del ARN.

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL ADN:

En 1953 Watson y Crick postularon un modelo tridimensional para el DNA. El modelo

de Watson y Crick tiene las siguientes características principales:

1. Existen dos cadenas de polinucleótidos enrolladas alrededor de un eje común,

formando una doble hélice.
2. Las dos cadenas del DNA son antiparalelas (es decir, transcurren en direcciones
opuestas), pero cada una forma una hélice
3. Las bases ocupan el centro de la hélice y las cadenas de azúcares y fosfatos se sitúan
en el exterior. Esto minimiza las repulsiones entre los grupos fosfato cargados. La
superficie de la doble hélice contiene dos hendiduras de ancho desigual: los surcos
mayor y menor.
4. Cada base está unida por puentes de hidrógeno a una base de la hebra opuesta, para
formar un par de bases plano. Cada residuo de adenina debe formar pareja con un
residuo de timina y viceversa, y cada residuo de guanina debe aparearse con un
residuo de citosina y viceversa. Estas interacciones por puentes de hidrógeno,
conocidas como apareamiento de bases complementarias, da como resultado la
asociación específica de las dos cadenas de la doble hélice.

La doble hélice del DNA se mantiene unida por dos tipos de fuerzas: los enlaces de
hidrógeno entre los pares de bases complementarias, y las interacciones de apilamiento
de las bases. Entre G y C se pueden formar tres enlaces de hidrógeno, mientras que
solamente se pueden establecer dos entre A y T. Esta es una de las razones de la dificultad
para separar las hebras apareadas del DNA: cuanto mayor sea la relación de pares de
bases G≡C con respecto a las A=T, más difícil será su separación. La complementariedad
de las hebras del DNA se debe a los enlaces de hidrógeno que se establecen entre los
pares de bases.
•Estructura del ADN y del ARN
Estructura secundaria: DNA : normalmente doble cadena antiparalela y complementaria
pares A-T (dos puentes de H) y G-C (tres puentes de H)

5’ TCGTCA 3’

TCGTCA
5’ TCGTCA 3’
3’ AGCAGT 5’

5’ TGACGA 3’

TGACGA

El ADN esta constituido por dos tipos de estructuras:

• Estructura primaria: secuencia de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiester

entre el fosfato del C5’ de un nucleótido y el OH del C3’ del siguiente nucleótido.
Las cadenas están orientadas desde el extremo 5’ al extremo 3’.
• Estructura secundaria: disposición en el espacio de 2 cadenas de nucleótidos
formando una doble hélice en la que las bases nitrogenadas están enfrentadas y
unidas por puentes de hidrógeno. es una estructura fibrilar repetitiva de 20Å de Æ
en la que se repiten las bases cada 3,4 Å. la composición de bases varía, pero para
la misma especie el contenido en bases púricas es igual al de pirimidinicas.
El DNA es una molécula muy flexible, que puede presentar numerosas variaciones
Tema 6. Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos
estructurales. En el DNA celular se observan muchas desviaciones significativas de la
estructura de Watson y Crick. Estas variaciones estructurales no tienen ningún efecto
sobre las propiedades fundamentales del DNA definidas•Estructura
por Watson del ADN y del ARN
y Crick, y reflejan
tres aspectos: las diferentes conformaciones posibles de Estructura
la desoxirribosa,
secundaria: la DNA rotación
: estructura doble helicoidal co
alrededor de los enlaces del esqueleto de la hélice, y la libre rotación en torno al enlace
glucosídico.

La estructura de Watson y Crick se conoce también

como forma B del DNA o DNA B. La forma B es la
estructura más estable que puede adoptar un DNA de
secuencia al azar en condiciones fisiológicas. Las
formas A y Z son dos variantes estructurales.

La forma A predomina en disoluciones relativamente

pobres en agua. El DNA está estructurdado en una
doble hélice dextrógira, pero la hélice es más gruesa y
el número de pares de bases por vue1ta es de 11, en
1ugar de 1os 10,5 de la forma B del DNA. El plano de
los pares de bases de la forma A tiene una inclinación
de unos 20° con respecto al eje de la hélice. Esto hace
que el surco mayor sea más profundo y el surco
menor más superficial.

El DNA Z supone una mayor desviación de la forma B.

Es una hélice levógira. Contiene 12 pares de bases por vuelta y la estructura es más
delgada y alargada. Las cadenas del DNA adoptan un plegamiento en zigzag.

No está claro si el DNA A se encuentra en las células, pero hay datos a favor de la
presencia de zonas de DNA Z en procariotas y eucariotas. Estas regiones pueden
participar en la regulación de la expresión de algunos genes o en la recombinación
genética.

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL RNA:

El vínculo entre el DNA y las enzimas (que son, en su gran mayoría, proteínas) es el
RNA. El DNA de un gen se transcribe para producir una molécula de RNA que es
complementaria con el DNA. La secuencia de RNA es entonces traducida a la secuencia
correspondiente de aminoácidos para formar una proteína. Esta transferencia de
información biológica se resume en el llamado dogma central de la biología molecular
formulado por Crick en 1958.

Las células contienen diversos tipos de RNA:

• El RNA ribosómico (rRNA): es el componente principal de los ribosomas.

• El RNA de transferencia (tRNA): Transporta los aminoácidos en forma activada
al ribosoma para la formación de enlaces peptídicos a partir de la secuencia
codificada por el mRNA molde. En el tRNA se establecen puentes de hidrógeno
intracatenarios, y se forman pares de bases A-U y G-C similares a los del DNA,
salvo por la sustitución de la timina por uracilo.
 • El RNA mensajero (mRNA): Es el molde para la síntesis de proteínas o
traducción.
• El RNA nuclear pequeño (soRNA): Su función es contribuir al procesamiento
del mRNA inicial que se transcribe del DNA, para dar una forma madura que
pueda exportarse del núcleo.

El RNA, al igual que el ADN tiene varias estructuras:

• Estructura secundaria: es monocatenaria, aunque en algunos casos puede ser

bicatenaria, G-C se unen mediante 3 enlaces de H, A-U mediante 2 enlaces de H
y entre G-U no hay enlace pero no rompe la hélice
• Estructura terciaria: algunas zonas llamadas horquillas pueden presentar
estructura de doble hélice como resultado de la formación del enlace de H entre
las bases complementarias. Por otro lado cuando las zonas complementarias están
Tema 6. Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos

separadas por regiones no complementarias se forman bucles (interacciones entre

•Estructura del ADN y del ARN
regiones de cadena sencilla más o menos alejadas que dan lugar a plegamiento
Estructura terciaria del RNA :

tridimensional (pseudoknot)) Interacciones entre regiones de cadena sencilla más o menos alejadas que dan lugar
a plegamiento tridimensional (pseudoknot)

Tema 6. Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos

•Desnaturalización y renaturaliza
Desnaturalización: proceso por el cu
Física: c
Química
Renaturalización: proceso de adquis

5. Desnaturalización y renaturalización de los ácidos nucleicos. Física: b

Química
Hibridación: proceso de renaturaliza
• Desnaturalización: Proceso por el cual el ADN o el ARN pierde su estructura
secundaria. Causas:
o Física: un aumento de la temperatura provoca un
aumento de la energía de la molécula causando la
ruptura de los puentes de hidrógeno. la temperatura
de fusión consigue el 50% y la de
desnaturalización.
o Química: se alteran las condiciones de ph. medio
básico (pH)
• Renaturalización: Proceso de adquisición de la estructura
secundaria de moléculas de ADN o ARN previamente
desnaturalizadas. Causas:
o Física: bajada lenta y progresiva de la temperatura
o Química: neutralización de la solución
• Hibridación: proceso de renaturalización de ADN o ARN
de distintos orígenes formándose moléculas mixtas
(hibridas) con una hebra de un origen y otra de otro.