P3E2.

El documento de texto elaborado

Curso: Modelado de Nicho Ecológico

Objetivos

1. Temas determinados en la guía de actividades de aprendizaje

 Informática de la Biodiversidad
 Algoritmos de Modelación
 Generación de MNE y MDP empleando Maxent

2. Objetivos establecidos en la guía de actividades de aprendizaje

Que el alumno adquiera los fundamentos teóricos y prácticos para la elaboración e interpretación
de Modelos de Nicho Ecológico (MNE) y de Distribución Potencial (MDP), mediante la utilización
de algoritmos matemáticos que contribuyan al conocimiento de la biodiversidad a través de la
identificación de patrones de riqueza de especies, del reconocimiento de posibles sitios de
búsqueda para especies nuevas, de zonas prioritarias para la conservación, así como los efectos
que el Cambio Climático pudiera tener sobre la distribución de las especies.

3. Fundamentos para el desarrollo de las actividades determinadas en la guía de actividades de

aprendizaje
El curso se desarrollará bajo la modalidad presencial a través de clases teóricas y prácticas, para el
procesamiento y análisis de datos de distribución de una especie de interés. Para ello, los
estudiantes recopilarán la información a partir de bases de datos disponibles en línea, cartografía y
variables ambientales, además de involucrarse en visitas a colecciones científicas para que
conozcan las fuentes primarias de dicha información. Asimismo, se llevará a cabo una revisión
minuciosa de dicha información (errores taxonómicos, geográficos, etc.), con el fin de mejorar su
calidad. Los alumnos deberán participar activamente en la discusión de artículos referentes a
temas vistos en clase, con el objetivo de reafirmar los conceptos teóricos. Como parte del
programa, los estudiantes formarán equipos para desarrollar un proyecto final, en el cual,
elaborarán un Modelo de Nicho Ecológico de una especie de su interés, considerando todos los
elementos vistos a lo largo del semestre. Finalmente, se realizará la corroboración en campo de
los MNE en una localidad cercana, con la finalidad de que los alumnos validen su trabajo en un
escenario real y que su esfuerzo pueda verse reflejado en una posible publicación científica.

4. Título: Informática de la Biodiversidad

1.1 Manejo básico de bases de datos.
1.1.1 Uso de Access (consultas de selección, elaboración e importación de tablas,
actualización de datos, etc.).
1.1.2 Limpieza de la base de datos (errores taxonómicos, geográficos, etc.).
1.2 ¿Qué es un Sistema de Información Geográfica (SIG)?
1.3 Tipos de datos:
1.3.1 ¿Qué es un vector?
1.3.2 ¿Qué es un raster?
 P3E2. El documento de texto elaborado

1.4 Análisis espacial con Quantum GIS.

1.4.1 Importación de los datos (tablas de atributos).
1.4.2 Manejo de vectores.
1.4.3 Manejo de rasters
5. Desarrollo del tema
En esta unidad se ejecutaran los desempeños de:
 Desarrolla la capacidad para el manejo de bases de datos
 Implementar el uso de bases de datos para la elaboración de productos como vectores
en un sistema de información geográfica.
 Manejo de un sistema de Información geográfica (QGIS)

Título: Algoritmos de Modelación:

5.1 Modelos mecanísticos.

5.2 Modelos correlativos.
5.2.1 Modelos discriminantes: Ramdom forest, análisis de discriminantes mixtos (MDA), análisis de
correspondencia canónicas (CCA), modelos lineares generalizados (GLM), Máxima Entropía
(Maxent), BIOMOD.
5.2.2 Modelos descriptivos: BIOCLIM, DOMAIN.
5.2.3 Modelos mixtos: Algoritmos Genéticos de Modelación (GARP, DK-GARP, OM-GARP).
5.3 Modelos basados en procesos.

Desarrollo del tema

En esta unidad se ejecutaran los desempeños de:
 Desarrolla los conceptos sobre los diferentes modelos de modelación
 Se ejemplifican los diferentes algoritmos de modelación
 Se realizan ejercicios de modelación con el algoritmo de Maxent
Título: 6. Generación de MNE y MDP empleando Maxent
6.1 Preparación de los datos de distribución.
6.2 Preparación de las variables ambientales.
6.3 Preparación del área de calibración (M del diagrama BAM).
6.4 Configuración del programa.
6.5 Interpretación de resultados.
6.6 Ventajas y desventajas de emplear Maxent

Desarrollo del Tema

 Se preparan la base de datos necesaria de entrada para generar los modelos de nicho
ecológico
 Se desarrollan las variables ambientales y el área de espacio para la generación de los
modelos de nicho
 Se elaboran los modelos de nicho con el algoritmo de Maxent
 P3E2. El documento de texto elaborado

6. Referencias bibliográficas

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Thuiller W, Fortin MJ, Randin C, Zimmermann NE, Graham CH, Guisan A (2012)
Measuring ecological niche overlap from occurrence and spatial environmental data.
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5. Broennimann O, Treier UA, Müller-Schärer H, Thuillier W, Peterson AT, Guisan A.

Evidence of climatic niche shift during biological invasion. Ecol Lett, 2007; 10: 701˗709.

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7. Cruz-Cárdenas, G. L. López-Mata, J. T. Silva, N. Bernal-Santana, F. Estrada-Godoy y J.

A. López-Sandoval. 2016. Potential distrribution model of Pinaceae species under climate
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8. Elith J, Graham CH, Anderson RP, Dudík M, Ferrier S, Guisan A et al. Novel methods
improve prediction of species’ distributions from occurrence data. Ecography, 2006; 29:
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9. Elith J, Leathwick JR. Species distribution models: ecological explanation and prediction
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10. Estrada, A. S., E. Ortiz, J. L. Villaseñor y F. J. Espinosa-García. 2016. The distribution

of cultivated species of Porophyllum (Asteraceae) and their wild relatives under climate
change. Systematic and Biodiversity 14: 572-582.

7. Se presenta sin errores ortográficos.

8. Está generado en formato digital.