Plantas con buen rendimiento en estrés Plantas con bajo rendimiento en estrés

valor de valor de valor de valor de valor de valor de

expresión expresión expresión expresión expresión expresión
Gen Réplica 1 Réplica 2 Réplica 3 Media Réplica 1 Réplica 2 Réplica 3

psaA 260 255 261 258.666667 263 260 255

AtBAK1 900 920 914 911.333333 50 55 60

AtHSD1 900 915 910 908.333333 40 35 39

chbP 250 230 240 240 250 260 230

 CYP 400 350 405 385 100 95 80

DWF4 800 900 850 850 200 210 196

GhDET2 240 230 225 231.666667 50 55 60

hepS 60 80 65 68.3333333 70 65 68
 LTMF 302 305 306 304.333333 302 308 304

mvaA 350 340 360 350 410 390 380

OsBRI1 1000 980 990 990 130 125 130

OsDWARF4 115 110 112 112.333333 300 350 320

OsGSK1 840 820 835 831.666667 114 120 113

PAXM 120 160 150 143.333333 130 150 145

petN 240 400 600 413.333333 230 500 400

psbA 310 300 350 320 300 305 320

 psbE 250 220 230 233.333333 240 250 240

psbL 340 330 320 330 310 320 340

wecB 400 540 830 590 650 630 400

ZmDWF4 115 110 109 111.333333 30 35 30

DWF4
GhDET2
OsDWARF4
CYP
AtBAK1
dimiento en estrés

NOMBRE GEN/PROTEINA
Media p-value Significativo Fold change Log2 FC

259.333333 0.99742931 -0.0037135 Fotosistema I P700 clorofila a

0.834019 No apoproteína A1

RECEPTOR QUINASA 1 ASOCIADO A

55 <0,000001 Yes 16.569697 4.05047531 LOS BRASINOSTEROIDES INSENSITIVO
1

38 23.9035088 4.5791505 11-beta-hidroxiesteroide

<0,000001 Yes deshidrogenasa 1A

246.666667 0.561438 No 0.97297297 -0.03952836 N,N'-diacetilquitobiosa fosforilasa

91.6666667 0.000094 Yes 4.2 2.07038933 Citocromo P450 2D4

Citocromo P450 90B1

202 0.000024 Yes 4.20792079 2.07310755
Arabidopsis thaliana

Esteroide 5-alfa-reductasa DET2

55 0.000005 Yes 4.21212121 2.07454695 ( Gossypium hirsutum (Algodón
Upland))

Heptaprenil difosfato sintasa

componente 2
67.6666667 0.919321 No 1.00985222 0.01414418
Geobacillus stearothermophilus
(Bacillus stearothermophilus)
 Indol diterpeno preniltransferasa ltmF
Epichloe festucae var. lolii
304.666667 0.883461 No 0.99890591 -0.00157931
(Neotyphodium lolii) (Acremonium
lolii)

3-hidroxi-3-metilglutaril-coenzima A
reductasa (HMG-CoA reductasa)
393.333333 0.014721 No 0.88983051 -0.16839753
Pseudomonas mevalonii

Receptor de brasinoesteroide LRR

quinasa BRI1
128.333333 <0,000001 Yes 7.71428571 2.94753258
Oryza sativa subsp. japónica (arroz)

Citocromo P450 90B2

323.333333 0.000133 Yes 0.34742268 -1.52523616
Oryza sativa subsp. japónica (arroz)
 Proteína quinasa relacionada con
Shaggy GSK1
115.666667 <0,000001 Yes 7.19020173 2.84603225
Oryza sativa subsp. japónica (arroz)

monooxigenasa paxM dependiente de

FAD
141.666667 0.907271 No 1.01176471 0.01687382
Penicillium paxilli

Subunidad 8 del complejo citocromo

b6-f, cloroplástico
376.666667 0.792816 No 1.09734513 0.13401735
Chlamydomonas reinhardtii
(Chlamydomonas smithii)

308.333333 0.51649 No 1.03783784 0.05358104 Fotosistema II proteína D1 2

243.333333 0.348641 No 0.95890411 -0.06054154 Citocromo b559 subunidad alfa

Fotosistema II centro de reacción

323.333333 0.561438 No 1.02061856 0.02944378
proteína L

560 0.851129 No 1.05357143 0.07528813 UDP-N-acetilglucosamina 2-epimerasa

31.6666667 0.000006 Yes 3.51578947 1.81384868 Proteína esteroide 22-alfa-hidroxilasa

 VIA SEÑALIZACION / PROCESO BIOLOGICO

FOTOSINTESIS

ENLACE PROTEINA-CROMOFORO

RESPUESTA DE DEFENSA

Proceso de biosíntesis de esteroides

Biosíntesis de lípidos , Metabolismo de lípidos

proceso metabolico de carbohidratos.

 Biosíntesis de ubiquinona y otros terpenoides-
quinonas
Biosíntesis de fenilpropanoide
Biosíntesis de flavonoides
Biosíntesis de metabolitos secundarios, Biosíntesis
de hormonas esteroides

proceso biosintético de brasinoesteroides,

homeostasis de brasinoesteroides, vía de
señalización mediada por ácido jasmónico,
desarrollo de la hoja, dar forma a la hoja, respuesta
a brasinoesteroide, respuesta al ácido jasmónico,
proceso metabólico de esteroles, crecimiento
celular unidimensional

proceso biosintético de brasinoesteroides,

alargamiento de tricomas de semillas, iniciación de
tricomas de semillas

proceso biosintético de isoprenoides

proceso biosintético de menaquinona
 proceso metabólico de los alcaloides

Este gen codifica la enzima HMG-CoA reductasa, la

cual controla la velocidad de la vía del mevalonato,
la vía metabólica que produce colesterol y otros
isoprenoides, esta enzima actúa desacetilando el
mevalonato a HMG-CoA.

* Vía de señalización mediada por brasinoesteroides

* Detección de estímulo brasinoesteroide
* Vía de señalización mediada por hormonas
* formación de haces de microtúbulos
* escotomorfogénesis

• proceso biosintético de brasinoesteroides

• homeostasis de brasinoesteroides
• vía de señalización mediada por ácido
jasmónico
• desarrollo de la hoja
• dar forma a la hoja
• respuesta a brasinoesteroide
• proceso metabólico de esteroles
• crecimiento celular unidimensional
 • vía de señalización mediada por
brasinoesteroides
• regulación negativa de la vía de señalización
mediada por brasinoesteroides
• transducción de señales

Esta proteína está involucrada en la biosíntesis de

metabolitos secundarios.

Fijación de FAD
actividad monooxigenasa

ensamblaje del complejo de citocromo

fotosíntesis

Transporte fotosintético de electrones en el

fotosistema II, enlace proteína-cromóforo,
Respuesta al herbicida.
Cadena fotosintética de transporte de electrones

FOTOSINTESIS

 Biosíntesis del antígeno común enterobacteriano

Enlace hierro, actividad monooxigenasa,

 USO BIOTECNOLOGICO

Transferencia de electrones del par de clorofila a los aceptores A0, A1, FX, FA,
FB. Por lo tanto se puede usar como transporte de electrones en la
fotosintesis. Metabolismo del almidón y la sacarosa, Biosíntesis de
antibióticos enediinos Biosíntesis de flavonoides.

Se puede utilizar en plantas que no tengan la capacidad de controlar la

expresion de genes en ausencia de patogenos. Cultivos cuyas plantas
presenten dificultades en activar los mecanismos de defensa y crecimiento
vegetal dependiente de BR. Quinasa de doble especificidad que actúa sobre
sustratos que contienen serina/treonina y tirosina, tambien puede utilizarse
en plantas que no tengan una respuesta rapida frente a patogenos.

Participa en el desarrollo y crecimiento de las plantas, formacion de semillas,

puede usarse en cultivos cuyo desarrollo se vea afectado por algun estrés
biotico o abiotico debido a que se sobreexpresa en dichas condiciones y se ha
detecado en la maduracion temprana de las semillas.

Cataliza la fosforólisis reversible de quitobiosa, regua de manera positiva el

proceso metabolico de los carbohidratos, al clonar un gen de
glicosiltransferasa de la familia 36 de Vibrio proteolyticus cuya secuencia de
aminoacidos es muy similar a chBP de Vibrio furnissii, la enzima recombinante
catalizó la fosforólisis reversible de (GlcNAc)2 (quitobiosa) para formar 2-
acetamida-2-desoxi-alfa-D-glucosa 1-fosfato [GlcNAc-1-P] y GlcNAc, pero no
mostró actividad sobre la celobiosa, indicando que la enzima era ChBP
 Participa en una vía de transporte de electrones dependiente de
NADPH. Oxida una variedad de compuestos estructuralmente no
relacionados, incluidos esteroides, ácidos grasos y xenobióticos. En las
plantas, estas enzimas participan en la biosíntesis de productos secundarios
(e.g. flavonoides, alkaloides) y de hormonas, así como en la desintoxicación
de herbicidas. Por otra parte, el empleo de técnicas moleculares ha permitido
la inserción de genes del CYP450 de mamíferos en un mayor número de
especies de plantas para favorecer la tolerancia a herbicidas.

Cataliza el paso C22-alfa-hidroxilación en la biosíntesis de brasinoesteroides,

por ejemplo la sobreexpresión de DWF4 gen mejoró la calidad del fruto del
tomate y aceleró la maduración del fruto

Involucrado en un paso de reducción en la biosíntesis del esteroide vegetal,

brassinolide.

Promueve la iniciación y elongación de las fibras de algodón (tricomas de la

semilla)

Suministra difosfato de heptaprenilo, el precursor de la cadena lateral de la

quinona isoprenoide menaquinona-7 (MQ-7).
 indol diterpeno preniltransferasa; parte del grupo de genes que intervienen
en la biosíntesis de lolitrems, micotoxinas indol-diterpénicas que son potentes
tremorgens en mamíferos y son sintetizadas por endófitos fúngicos
clavicipitáceos en asociación con sus huéspedes de hierba.
Análisis funcional de un grupo de genes de indol-diterpeno para la biosíntesis
de lolitrem B en el endosimbionte de hierba Epichloe festucae.

Caracterización de la enzima para producción de fármacos inhibidores.

La quinasa receptora implicaba la transducción de señales de

brasinoesteroides (BR). Regula, en respuesta a la unión de BR, una cascada de
señalización implicada en el desarrollo de las plantas, la promoción de la
elongación celular y la floración (Probable). Activa la señalización de BR
apuntando y fosforilando BSK3, un regulador positivo de la señalización de BR

Cataliza el paso C22-alfa-hidroxilación en la biosíntesis de brasinoesteroides,

que es el paso limitante de la velocidad en esta vía biosintética

Necesario para las respuestas de auxina involucradas en la regulación de la

longitud de las células epidérmicas de la articulación de la lámina
 Probable serina-treonina quinasa que puede actuar como un regulador
negativo de la señalización de brasinoesteroides (BR) durante el desarrollo
floral. Puede tener funciones fisiológicas en las vías de transducción de
señales de estrés

monooxigenasa dependiente de FAD; parte del grupo de genes que

intervienen en la biosíntesis de paxillina, una micotoxina que actúa como
inhibidor de los canales maxi-K de mamíferos.
Se propone PaxG, la geranilgeranil difosfato (GGPP) sintasa para catalizar el
primer paso en la biosíntesis de paxillina

Componente del complejo citocromo b6-f, que media la transferencia de

electrones entre el fotosistema II (PSII) y el fotosistema I (PSI), el flujo cíclico
de electrones alrededor del PSI y las transiciones de estado.

A diferencia de sus ortólogos, esta proteína no está codificada en el

cloroplasto.

El heterodímero D1/D2 se une a P680, las clorofilas que son el principal

donante de electrones del PSII y los subsiguientes aceptores de
electrones. Comparte un hierro no hemo y cada subunidad se une a feofitina,
quinona, clorofilas adicionales, carotenoides y lípidos. D1 proporciona la
mayoría de los ligandos para el grupo Mn4-Ca-O5 del complejo generador de
oxígeno (OEC),los sitios de union Q se unen a los herbicidas como atrazina, el
BNT, el diuron o el ioxinil.
Este gen es un heterodimero compuesto por dos subunidades y un cofactor
hemo, su principal funcion es participar en una via secundaria de transporte
de electrones que ayuda a proteger el fotosistema II de los daños causados
por la luz.

Consiste en un complejo de antena central que captura fotones y una cadena

de transferencia de electrones que convierte la excitación fotónica en una
separación de carga. Esta subunidad se encuentra en la interfase monómero-
monómero y es necesaria para el correcto ensamblaje y/o dimerización del
PSII.

Cumple roles biológicos muy importantes a nivel de regulación, función y

estructuración del metabolismo, para una correcta estabilidad del organismo.
Actúa como complejo sustrato para diferentes enzimas, permitiendo
generalmente, la incorporación del acetilglucosamina a la cadena de
oligosacáridos de la proteína 

Actividad oxidorreductasa, actuando sobre donantes apareados, con

incorporación o reducción de oxígeno molecular.
ll
 NOMBRE GEN/PROTEINA VIA SEÑALIZACION USO BIOTECNOLOGICO

FOTOSINTESIS
psaA
Fotosistema I P700 clorofila ENLACE PROTEINA- transporte de electrones en
a apoproteína A1 CROMOFORO las plantas

actividad de
AtBAK1 Receptor quinasa asociado a heterodimerización de
BRI1 proteínas

AtHSD1 Proceso de biosíntesis de

esteroides
11-beta-hidroxiesteroide Biosíntesis de lípidos ,
deshidrogenasa 1A Metabolismo de lípidos
chbP N,N'-diacetilquitobiosa proceso metabolico de
fosforilasa carbohidratos.
CYP Citocromo P450 2D4
DWF4
GhDET2
hepS
LTMF
mvaA
OsBRI1
OsDWARF4
OsGSK1
PAXM
petN
psbA
psbE
psbL
wecB
ZmDWF4
 valor de valor de valor de valor de valor de
expresión expresión expresión expresión expresión
Gen Réplica 1 Réplica 2 Réplica 3 Media Réplica 1 Réplica 2
psaA 260 255 261 258.666667 263 260
AtBAK1 900 920 914 911.333333 50 55
AtHSD1 900 915 910 908.333333 40 35
chbP 250 230 240 240 250 260
CYP 400 350 405 385 100 95
DWF4 800 900 850 850 200 210
GhDET2 240 230 225 231.666667 50 55
hepS 60 80 65 68.3333333 70 65
LTMF 302 305 306 304.333333 302 308
mvaA 350 340 360 350 410 390
OsBRI1 1000 980 990 990 130 125
OsDWARF4 115 110 112 112.333333 300 350
OsGSK1 840 820 835 831.666667 114 120
PAXM 120 160 150 143.333333 130 150
petN 240 400 600 413.333333 230 500
psbA 310 300 350 320 300 305
psbE 250 220 230 233.333333 240 250
psbL 340 330 320 330 310 320
wecB 400 540 830 590 650 630
ZmDWF4 115 110 109 111.333333 30 35
valor de
expresión
Réplica 3 Media p-value Significativo Fold change Log2 FC
255 259.333333 0.834019 No 0.99742931 -0.0037135 -0.66666667
60 55 <0,000001 Yes 16.569697 4.05047531
39 38 <0,000001 Yes 23.9035088 4.5791505 870.333333
230 246.666667 0.561438 No 0.97297297 -0.03952836 -6.66666667
80 91.6666667 0.000094 Yes 4.2 2.07038933 293.333333
196 202 0.000024 Yes 4.20792079 2.07310755 648
60 55 0.000005 Yes 4.21212121 2.07454695 176.666667
68 67.6666667 0.919321 No 1.00985222 0.01414418 0.66666667
304 304.666667 0.883461 No 0.99890591 -0.00157931 -0.33333333
380 393.333333 0.014721 No 0.88983051 -0.16839753 -43.3333333
130 128.333333 <0,000001 Yes 7.71428571 2.94753258 860
320 323.333333 0.000133 Yes 0.34742268 -1.52523616 -211
113 115.666667 <0,000001 Yes 7.19020173 2.84603225 716
145 141.666667 0.907271 No 1.01176471 0.01687382 1.66666667
400 376.666667 0.792816 No 1.09734513 0.13401735 36.6666667
320 308.333333 0.51649 No 1.03783784 0.05358104 11.6666667
240 243.333333 0.348641 No 0.95890411 -0.06054154 -10
340 323.333333 0.561438 No 1.02061856 0.02944378 6.66666667
400 560 0.851129 No 1.05357143 0.07528813 30
30 31.6666667 0.000006 Yes 3.51578947 1.81384868 79.6666667