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0. COORDINACIÓN
NOMBRE FILIACIÓN
Coordinadores Daniel Vega Depto. de Materia Condensada, Centro
Atómico Constituyentes - CNEA
Eduardo Howard IFLYSIB, CONICET, La Plata
Sebastian Klinke Fundación Instituto Leloir, IIBBA-
CONICET
Editor LAHN: Gabriela Aurelio Proyecto LAHN - CNEA
1. RESUMEN
En este documento se condensan los aportes de diferentes grupos de investigación de Argentina,
integrando los intereses de varias instituciones del sector científico-tecnológico sobre la posibilidad de
contar con un instrumento de difracción de neutrones para monocristales en el Laboratorio LAHN. Los
aportes de cada grupo fueron compilados mediante una convocatoria abierta a toda la comunidad
científica en los meses de Noviembre y Diciembre 2016.
INDICE
0.COORDINACIÓN.......................................................................................................................1
1.RESUMEN.................................................................................................................................1
2.ABREVIATURAS Y DEFINICIONES...............................................................................................3
2.1.Abreviaturas.....................................................................................................................................3
3.INTRODUCCIÓN........................................................................................................................4
3.1 Generalidades de la técnica...............................................................................................................4
3.2 Ventajas de la difracción de haces de neutrones................................................................................4
3.3 La difracción de monocristales...........................................................................................................5
3.4 Neutrones para estudio de macromoléculas y proteínas...................................................................5
3.5 Oportunidades científicas en Argentina y la región............................................................................6
3.6 Contexto internacional y estadísticas de uso.....................................................................................7
4.CASO CIENTÍFICO......................................................................................................................8
4.1. Contribuciones de los usuarios..............................................................................................8
4.1.1. Estudios de densidad de carga.......................................................................................................9
4.1.2 Estudio de transiciones de fase.....................................................................................................10
4.1.3 Determinación de enlaces de hidrógeno.......................................................................................12
4.1.4 Estudio de compuestos tautoméricos...........................................................................................14
4.1.5 Hidruros metálicos........................................................................................................................15
4.1.6 Propiedades magnéticas en monocristales...................................................................................16
4.1.7 Estudios de la influencia de la temperatura, presión, campos eléctricos y magnéticos en los
materiales resuelta en el tiempo...........................................................................................................17
4.1.8 Estudios de localización de moléculas adsorbidas en materiales porosos cristalinos....................18
4.1.9 Catálisis en enzimas hémicas y modelos biomiméticos de porfirinas............................................20
4.1.10 Interacciones Agósticas en Complejos Organometálicos.............................................................21
4.1.11 Estudios de alta resolución de macromoléculas por Difracción de rayos X y Neutrones..............21
4.1.12 Cristalógrafos de macromoléculas del Instituto Leloir.................................................................23
5.REQUERIMIENTOS DE DISEÑO................................................................................................24
5.1.Condiseraciones Básicas......................................................................................................24
5.2.Requerimientos para un difractómetro de monocristales en el LAHN..................................24
6.CONSLUSIONES.......................................................................................................................25
7.REFERENCIAS..........................................................................................................................26
8.ANEXOS..................................................................................................................................27
8.1.ANEXO I...............................................................................................................................27
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2. ABREVIATURAS Y DEFINICIONES
2.1. Abreviaturas
LAHN: Departamento Administración del Proyecto uso de haces de neutrones del RA10.
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3. INTRODUCCIÓN
Tanto Argentina como otros países Latinoamericanos cuentan con grupos de investigación experimentados
en cristalografía estructural, con capacidad para aprovechar al máximo esta nueva facilidad experimental.
Sin embargo, debe destacarse que hay varios grupos que se encuentran en pleno crecimiento y otros en sus
inicios. Por esta razón, es previsible que la demanda de información estructural proporcionada por estos
experimentos se incremente en el futuro. Una muestra ha sido el rápido crecimiento de las áreas de la
química relacionadas con la química supramolecular, la ingeniería cristalina y el modelado molecular, que
requiere de información precisa fundamental acerca de interacciones intermoleculares débiles que
involucran los átomos de hidrógeno.
La difracción de neutrones proporciona los medios para la caracterización completa de tales interacciones
en el estado sólido. Efectivamente, los neutrones cobran particular importancia para la determinación de la
estructura debido a varias de sus características:
• Los neutrones son dispersados principalmente por el núcleo, en lugar de la nube de electrones de
un átomo como ocurre con los Rayos X. Así, la sección eficaz de dispersión de neutrones de un
átomo no es simplemente proporcional al número atómico
• Debido a la naturaleza isotrópica de la dispersión por los núcleos, el factor de forma de los
neutrones no depende del ángulo de dispersión (a diferencia de lo que ocurre con los rayos X) lo
cual permite ganar información más precisa respecto de los parámetros de desplazamiento
atómico, anisotropías, etc.
• El momento magnético que posee el neutrón da lugar a la dispersión magnética, lo que permite una
caracterización más detallada de los materiales magnéticos ya sea de naturaleza extendida como de
origen molecular, permitiendo determinar órdenes magnéticos, distribución de densidad de spin y
anisotropía de los momentos magnéticos. Es la técnica de excelencia para este tipo de estudios ya
que los rayos X no brindan esta información.
• Los neutrones juegan un papel crítico en la determinación de las posiciones del átomo de
hidrógeno. Esto es esencial para la caracterización de interacciones de enlaces de hidrógeno en
sólidos (biología, química), hidruros metálicos (catálisis) y compuestos orgánicos (fármacos,
química, biología). Los átomos livianos como el hidrógeno se pueden localizar de manera precisa,
incluso en presencia de átomos pesados tales como uranio o platino.
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• Otra limitación de las técnicas de rayos X surge en los casos en que es necesario distinguir entre
elementos de número atómico similar. Numerosas aplicaciones tecnológicas tales como la catálisis y
el desarrollo de dispositivos fotónicos se ven ampliamente favorecidas si se incorporan
simultáneamente distintos tipos de iones metálicos. Se presenta con frecuencia la incorporación de
iones cuya estructura electrónica hace que su diferenciación por técnicas que emplean rayos X, no
sea una cuestión trivial. Sin embargo, en muchos casos, las secciones eficaces de dispersión de
neutrones difieren notablemente y proporcionan un alto nivel de contraste entre tales tipos de
átomos o entre sus isótopos. Esto conduce a que se pueda precisar y distinguir la posición
cristalográfica de iones diferentes, lo cual permite conocer su ordenamiento y en función de esto,
interpretar por ejemplo, mecanismos de reacciones catalíticas en las que estos materiales
intervienen. El aporte de estos estudios contribuye a mejorar el diseño de los catalizadores y
redunda en la optimización de métodos de producción de sustancias de alto valor agregado. De la
misma manera para el caso de dispositivos opto-electrónicos.
• Las muestras no se dañan por radiación como en el caso de Rayos-X, un aspecto fundamental para
el estudio de macromoléculas. Es posible así estudiar las muestras a temperatura ambiente, y
trabajar durante todo un experimento (de varias horas o días) con un único cristal.
Ahora bien, debido a la naturaleza de la interacción del neutrón con los cristales, los eventos de
scattering son muy poco probables, lo cual en el caso de trabajar con monocristales, hace que los
experimentos sean excesivamente largos. Esto se agrava si se emplea radiación monocromática y si
se miden cristales muy pequeños. Una forma de mejorar la estadística significativamente, y lograr
reducir los tiempos de medición es emplear la técnica conocida como quasi-Laue, donde el haz de
neutrones no se monocromatiza sino que se emplea un rango de longitudes de onda (de ahí el
prefijo quasi) situado dentro del espectro propio del moderador (espectro de neutrones fríos o de
neutrones térmicos).
La estructura tridimensional que adoptan las proteínas, y las biomacromoléculas en general, está
determinada por el medio acuoso del interior de la célula, y por tanto las distintas capas de hidratación de
la proteína determinan su estructura, y condicionan su función. Además, prácticamente la mitad de los
átomos que conforman una proteína son hidrógenos y, en casi todos los casos, algunos de ellos juegan un
rol esencial en la función.
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A diferencia de la cristalografía por difracción de rayos X, donde los hidrógenos son muy difíciles de
visualizar aun a alta resolución, la cristalografía de proteínas por difracción de neutrones (Neutron Protein
Crystallography, NPC) se vale de la posibilidad de reemplazar hidrógenos por deuterios, y de la fuerte
interacción de los neutrones con el núcleo de este isótopo.
Refinar una estructura obtenida por difracción de neutrones y por difracción de rayos X (joint X-ray/neutron
refinement) permite combinar la información sobre la posición de los núcleos con la información sobre la
nube electrónica, permitiendo conocer la conformación tridimensional, los estados de protonación y las
capas de hidratación ordenada y semiordenada de la macromolécula. Además, durante el proceso de
colección de datos, el cristal no sufre daño por radiación (característico en rayos X) y puede ser utilizado
para otros experimentos posteriores.
La limitación más importante que posee la cristalografía de neutrones para estudio de proteínas es el flujo,
que es órdenes de magnitud menor que los flujos de Rayos-X disponibles en sincrotrones o generadores de
laboratorio. Sin embargo, los avances permanentes en el campo de detectores, monocromadores y también
en técnicas de crecimiento de cristales más grandes, están revirtiendo esta desventaja progresivamente.
En el contexto de las necesidades de investigación de Argentina se detectan una serie de tipos de materiales
con problemáticas de interés para abordar su estudio por difracción de neutrones por monocristal:
Adicionalmente, existen aspectos de particular interés para la comunidad científica argentina que pueden
ser abordados por la difracción de neutrones por monocristal:
250
proteínas y macromoléculas
200
magnetismo
Número de entradas en Scopus al 31/12/2016
150
100
50
Fig. 1: Evolución del número de publicaciones en la base de datos SCOPUS con un criterio de búsqueda
por palabras clave: neutron AND diffraction AND (single-crystal OR "single crystal")
4. CASO CIENTÍFICO
En esta sección se describirán algunos proyectos asociados a diferentes áreas que son actualmente
desarrollados por grupos de investigación establecidos en Argentina (y Uruguay) y han manifestado interés
y necesidad de contar con una herramienta poderosa como la difracción de neutrones de monocristal. Un
breve análisis muestra que la distribución geográfica de los mismos es amplia lo que garantiza un espectro
“federal” de potenciales usuarios.
Investigadores
Título Instituciones Pág.
interesados
Estudios de densidad de carga Daniel Vega CNEA (CAC) 9
M. Mercedes Blanco FfyB-UBA
M. Sol Shmidt FCEN,UBA/INQUIMAE,CONICET
Pablo Alborés FCE, UNLP/IFLP, CONICET
Graciela Punte FI, UNLP/ IFLP, CONICET
Gustavo Echeverría
Estudio de transiciones de fase Daniel Vega CNEA - Conicet 11
Pablo Gaztañaga
Gabriela Aurelio
Ana Laura Larralde
• “On the use of crystal vibrational modes in the estimation of the anisotropic displacement parameters of
hydrogen atoms in molecular crystals: Para-nitroaniline as a test case”. Pozzi, C.G., Fantoni, A.C., Goeta, A.E.,
De Matos Gomes, E., McIntyre, G.J., Punte, G.,Phys. 423, 85-91 (2013). ISSN: 0301-0104 ELSEVIER.
• “On the electron density topology and electrostatic properties of nitroanilines. A theoretical investigation
on m-nitroaniline and 2-methyl-5-nitroaniline crystals. A. C. Fantoni, C. G. Pozzi, G. Punte. J. Phys.A 113 (34),
9527-9532 (2009)
• “Role of the hydrogen bonds in nitroanilines' aggregation: Charge density study of m-nitroaniline”. C. G.
Pozzi,C. Fantoni, G. Punte y G. Goeta. Chem Phys. 358, 68-74 (2009). ELSEVIER
• "Role of the Hydrogen Bonds in Nitroanilines Aggregation: Charge Density Study of 2-Methyl-5-
nitroaniline". J. Ellena , A. E. Goeta, J. A. K. Howard and G. Punte. J. Phys.A105, 8696-8708 (2001). ISSN:
1089-5639. ED. AMER. CHEMICAL SOCIETY
• “Hydrogen Bonding in Nitroanilines: Neutron Difraction Study of m-Nitroaniline at 100K”. A.E. Goeta, C.C.
Wilson, J.C. Autino, J. Ellena& G. Punte (2000). Chem. Mat. 12(11), 3342-3346.
• “Experimental Evidence for the Amino-group Non-Planarity in Nitroanilines: Neutron Diffraction Study of 2-
Methyl-5-nitroaniline at 100K”. J. Ellena, A.E. Goeta, J.A.K. Howard, C.C. Wilson, J.C. Autino& G. Punte (1999).
Acta Cryst. B55, 209-215.
a) Posibles interesados
Los sistemas termodinámicos en equilibrio, como un sólido cristalino, están caracterizados por encontrase
en un estado que minimiza su energía libre. Por regla general, el sistema se torna más ordenado según
desciende la temperatura. Esta dependencia es debida a que las fuerzas de cohesión prevalecen sobre el
movimiento térmico, según disminuye éste. Tal dependencia puede provocar una transición de fase
estructural determinada por la mejora en la estabilidad al aumentar la cohesión, provocando un cambio en
el estado cristalino para minimizar aún más la energía libre. Algunas veces, los sistemas pueden ser
capturados en situación metaestable, caracterizada por ubicarse en un estado que constituye un mínimo
local de la energía libre. El cambio de este estado a otro de mayor cohesión también se produce por una
transición de fase. En todos los casos, la determinación de las posiciones atómicas y nucleares permite
conocer con precisión este “juego” entre la mejora en la cohesión y la disminución del movimiento térmico,
teniendo en cuenta que la cohesión es generalmente debida a interacciones químicas (determinadas por los
electrones) mientras que el movimiento térmico se relaciona con el desplazamiento de la masa
(mayoritariamente localizada en el núcleo), para lo cual la difracción de neutrones por monocristal
constituye una información relevante y complementaria a la de difracción de rayos X.
• Con monocristales:
Propuesta presentada en PSI (Suiza) – 2 días en difractómetro ZEBRA “Exploring the magnetic phase
diagram of the magnetoelectric oxide CaBaCo4O7”
• Con muestras policristalinas:
Más de 10 propuestas aprobadas para estudios de transiciones de fase estructurales y/o magnéticas
en sistemas variados (aleaciones binarias y ternarias, óxidos complejos magnéticos)
• 2014 Studies in materials science and magnetism at Centro Atómico Bariloche using neutron
powder diffraction, G Aurelio, Neutron News, 25:4, 12-15
• 2011 Thermal expansion of layered cobaltites Y(Ba1−xSrx)Co2 O5+δ with x = 0, 0.05 and 0.10, G.
Aurelio, S. Bustingorry, R. D. Sánchez, G. J. Cuello, Journal of Physics: Condensed Matter 23, 315403
• 2012 Neutron diffraction study of stability and phase transitions in Cu-Sn-In alloys as alternative
Pb-free solder, G. Aurelio, S. Sommadossi y G. J. Cuello, Journal of Applied Physics 112, 053520
• 2012 Crystal structure of Cu-Sn-In alloys around the eta phase field studied by neutron diffraction,
G. Aurelio, S. Sommadossi y G. J. Cuello, Journal of Electronic Materials 41, 3223
• 2002 Metastable phases in the Ti-V system: Part I. Neutron diffraction study and assessment of
structural properties, G Aurelio, AF Guillermet, GJ Cuello, J Campo, Metallurgical and Materials
Transactions A 33 (5), 1307-1317
• 2001 Structural properties and stability of metastable phases in the Zr-Nb system: Part I.
Systematics of quenching-and-aging experiments, G Aurelio, AF Guillermet, GJ Cuello, J Campo,
Metallurgical and Materials Transactions A 32 (8), 1903-1910
• 2007 Probing phase coexistence and stabilization of the spin-ordered ferrimagnetic state by
calcium addition in the Y (Ba_ {1− x} Ca_ {x}) Co_ {2} O_ {5.5} layered cobaltites using neutron
diffraction. G Aurelio, J Curiale, RD Sánchez, GJ Cuello, Physical Review B 76 (21), 214417
• 2003 Structural properties and stability of metastable phases in the Zr-Nb system: Part II. Aging of
bcc (β) alloys and assessment of β-Zr, G Aurelio, AF Guillermet, GJ Cuello, J Campo, Metallurgical
and Materials Transactions A 34 (12), 2771-2779
• 2006 Structural properties of FCC and HCP phases in the Fe–Mn–Si system: A neutron diffraction
experiment, J Martínez, G Aurelio, GJ Cuello, SM Cotes, J Desimoni, Materials Science and
Engineering: A 437 (2), 323-327
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• 2005 Structural properties and high-temperature reactions of the metastable Ω phase in Zr–Nb
alloys, G Aurelio, A Fernández Guillermet, GJ Cuello, J Campo, Journal of nuclear materials 341 (1),
1-11
a) Posibles interesados
En las moléculas orgánicas, estos enlaces estabilizan la cohesión del estado cristalino. Desde el punto de
vista de la ingeniería cristalina, es posible intentar entender estas uniones intermoleculares como
generadores de una supramolécula y pensar que el correcto entendimiento de los mismos permitirá
generar nuevos cristales con propiedades físicas y/o químicas deseadas. Uno de los caminos para alcanzar
este objetivo es identificar la existencia de “synthons” como elementos base para la ingeniería cristalina.
Cada vez es más frecuente el encontrar situaciones ambiguas en la determinación de los enlaces de
hidrógeno por difracción de rayos X. La difracción de neutrones por monocristales se convierte en una
herramienta casi única para proporcionar información precisa sobre la cohesión estructural e identificar
“synthons”.
El planteo de este tipo de estructuras brinda una imagen más real de las moléculas y permiten justificar
tanto la reactividad como las características espectroscópicas de estos compuestos. La difracción de
neutrones por monocristales brinda de manera excluyente la información necesaria para la elucidación de
este tipo de estructuras.
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O H O H
O O
H H
O O
N N
H O H O
Fig. 3 Enlaces de hidrógeno asistidos por resonancia (efecto
RAHB) en el ácido 3-hidroxiquinurénico.
En este tema también resulta de interés determinar las interacciones puente-H que permiten el desarrollo
de sub-estructuras (1D, 2D y 3D) de agua confinada en el interior de poros de materiales cristalinos de
diversa naturaleza. Difícilmente exista un compuesto que haya demandado tanta atención e interés como el
agua debido a su importancia fundamental en procesos biológicos y químicos. Sin embargo a pesar de
haber sido sujeto de una gran cantidad de estudios, el agua continúa presentando aspectos a estudiar.
La comprensión del comportamiento de agua altamente confinada, hielo, hielo amorfo y clatratos hidratos
(o hidratos de gas), no sólo enriquece nuestra interpretación de transiciones de fase y estructuras de sólidos
quasi-bi-dimensionales (quasi-two-dimensional, Q2D) no encontradas en fases bulk, sino también tiene
importante implicancia en diversos fenómenos en la intersección entre la física, la química, la biología
celular, la ingeniería química y la nanociencia. Ejemplos relevantes incluyen, entre otros, lubricación en
nanofluídica y dispositivos del tipo lab-on-a-chip, síntesis de proteínas anticongelantes que inhiben la
formación de hielo, enfriamiento rápido de suspensiones biológicas o secuestro de agua emulsionada bajo
altas presiones, y almacenamiento de H2 y CO2en clatratos de gas.
En este sentido, la determinación precisa de las interacciones de H resulta crucial. Dado, que si se trata de
moléculas de agua confinadas, la propia densidad electrónica del H puede quedar “perdida” en el interior
de un canal o cavidad rodeado por átomos de distinta naturaleza. Por lo tanto la determinación de las
posiciones nucleares de los H mediante difracción de neutrones, es de vital importancia para la correcta
determinación y estudio de estas sub-estructuras formadas por el agua, las cuales en muchos casos,
muestran características (densidad, distancias de enlace, comportamiento dinámico, etc) que no se
corresponden con las que presenta el agua líquida o en fases cristalinas bulk.
La difracción de neutrones puede contribuir altamente en este tipo de estudios, como se muestra en la
referencia [6].
• "Experimental evidence for the amino group non-planarity in nitroanilines: neutron diffraction
study of 2-methyl-5-nitroaniline at 100K". Ellena, J., Goeta, A.E., Howard, J.A.K. Wilson, J.C. Autino
y Punte, G. Acta Cryst B55, (1999). ISSN: 0108-7681.
a) Posibles interesados
O OH
N N
H
I II
Fig. 4: Equilibrio tautomérico 4-
quinolinona 4-hidroxiquinolina.
a) Posibles interesados
La difracción de neutrones aporta una mejor comprensión de la naturaleza de los enlaces y de la reactividad
de los complejos de metales de transición con ligandos hidruros ya que arroja información estructural más
precisa en la posición de los hidrógenos. Por un lado esto tiene implicancias significativas en la comprensión
y desarrollo de nuevos sistemas catalíticos.
Fig. 5:
Casos aún más interesantes se presentan en hidruros de Ru ó Rh binucleares puenteados por la bisfosfina
(ver Fig. 5). Estos ejemplos han servido como modelos para sistemas de catálisis basados en la
hidrogenación.
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Fig. 6:
Casos de ligandos tridentados revisten fuerte interés en áreas académicas e industriales tanto por la
novedosa coordinación química como por las propiedades catalíticas. La Fig. 6 muestra un ejemplo de Ru
con fosfinas trípodas. Se ha demostrado que estos ligandos se pueden coordinan a una amplia variedad de
metales de transición, algunos de los cuales han sido evaluado para la actividad catalítica. Los primeros
ejemplos incluyen complejos de Rh-TrifosPh, utilizados para la hidrogenación y formulación de varios
alquenos o la hidrogenación de Quinolina, una importante impureza encontrada en los combustibles.
Fig. 7:
En todos estos casos resulta de interés poder identificar la presencia y ubicación de los átomos de
hidrógeno en los hidruros. Las ventajas comparativas del uso de difracción de neutrones proporcionan una
herramienta única para avanzar en el conocimiento y funcionalidad de estos compuestos.
a) Posibles interesados
Los estudios de magnetismo en monocristales abarcan prácticamente la mitad de los estudios totales
empleando esta técnica, como se mostró en la Fig. 1. En grupos argentinos esta técnica no se ha utilizado en
forma directa.
Ver punto Estudio de transiciones de fase (Pág.11)
a) Posibles interesados
Los cambios en las variables termodinámicas pueden generar modificaciones en las características
estructurales. Estas variaciones demoran cierto tiempo en avanzar en la estructura cristalina. La posibilidad
de estudiar los fenómenos dependientes del tiempo es de sumo interés y se requiere del seguimiento de
una característica particular de la dispersión del cristal (ya sea la intensidad de un conjunto particular de
picos de difracción o la radiación difusa) en función del tiempo (en la escala de horas). Un difractómetro de
neutrones para monocristales con un detector de área permitiría este seguimiento, en el cual una imagen
con enorme información estructural puede obtenerse en minutos. Un detector de placa de imagen podría
ser adecuado para eso.
a) Posibles interesados
Según la IUPAC, los MOFs son compuestos cristalinos cuyas redes están constituidas por iones metálicos que
se autoensamblan con ligandos orgánicos multifuncionales, generando redes orgánico-inorgánicas
poliméricas periódicas que poseen cavidades o canales con un volumen libre potencial. En la última década
ha crecido el interés en estos materiales debido a sus propiedades en catálisis heterogénea, luminiscencia,
adsorción y separación de gases, etc. Como rasgo esencial estos materiales presentan canales y cavidades
de distinta forma y funcionalidad, con altas áreas superficiales, excelentes capacidades de adsorción de H2,
metano, captura selectiva de CO2, separación de hidrocarburos, etc.
Dado que es posible obtener MOFs con un gran número de elementos de la Tabla Periódica y con diversos
tipos de moléculas orgánicas como ligandos, se han diseñado y sintetizado (a escala micro- y nanocristalina)
MOFs con características bio-compatibles (Bio-MOFs). Esto, sumado a las cualidades descriptas, ha abierto
la posibilidad de emplearlos como soportes en liberación controlada de fármacos, lo cual resulta una
excelente alternativa para la administración de drogas que poseen cierta toxicidad y que por ende,
requieren que la concentración en sangre se mantenga en un nivel bajo, pero constante. Se han conseguido
resultados muy promisorios en la administración de fármacos tales como analgésicos, anti-cancerígenos,
anti-HIV, etc.
Una de las ventajas de los MOFs frente a otros materiales porosos tradicionales es la posibilidad de
optimizar las interacciones host-guest, no sólo variando el tamaño de poros sino también
funcionalizándolos con grupos químicos que controlen la cinética de liberación de los agentes terapéuticos.
En este sentido, estudios que apuntan a profundizar en las interacciones entre moléculas quimi- o
fisisorbidas, de distinta naturaleza (fármacos o gases) tiene gran relevancia debido a que permite no solo
comprender el proceso a nivel molecular, sino mejorar el diseño de materiales con propiedades
optimizadas. Existen en este campo, estudios cristalográficos que han empleado la difracción de neutrones,
en monocristal y polvos, para determinar no solo la posición de moléculas en el interior de cavidades y
canales de MOFs, sino también para determinar con precisión la estructura cristalina de redes flexibles que
presentan comportamientos estructurales dinámicos en función de estimulos externos (presión de gases,
temperatura, vacío, etc).
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Por otra parte, las zeolitas, son materiales microporosos netamente inorgánicos, cuyas estructuras
cristalinas están basadas en la condensación de tetraedros de SiO4. Es posible sustituir parcialmente iones
Si(IV) por Al(III), generando un desbalance de las cargas que es compensado mediante la incorporación de
cationes Na+, K+, o también cationes derivados de aminas orgánicas cuaternarias, las cuales se emplean en
las síntesis para actuar como templates o moldes. Actualmente, de acuerdo con la International Zeolite
Association, se han identificado 232 tipos de zeolitas con estructuras diferentes, de los cuales más de 40
ocurren en la naturaleza y los restantes son sintéticos. Debido a sus características porosas, en los últimos
años se han estudiado algunas zeolitas como soportes en liberación de fármacos útiles en el tratamiento del
Cáncer, el asma y la enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC). Un rasgo que los distinque frente a
los MOFs es su mayor estabilidad tanto química como térmica, lo cual los mantiene como materiales
porosos muy interesantes para ser aplicados en diversos campos como la adsorción, separación, catálisis,
etc.
Tabla 1
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Los estudios cristalográficos en los que las moléculas de gas adsorbidas se encuentran dentro de
los poros de MOF (u otros materiales porosos) presentan desafíos experimentales y de
refinamiento estructural significativos. Sin embargo, tales estudios se han llevado a cabo con éxito
en una amplia gama de redes metal-orgánicos utilizando difracción de neutrones de monocristal y
polvo (ver Tabla 1). Estos estudios han permitido obtener una importante información estructural
sobre la posición de las moléculas de gases contenidas dentro de estos materiales porosos y la
naturaleza de las interacciones que intervienen en la retención de estas moléculas. A medida que
las capacidades de difracción continúan avanzando, se prevé que la caracterización cristalográfica
de las moléculas de gas adsorbidas dentro de los MOFs y materiales porosos relacionados se
hará más rutinariamente. Esos estudios seguirán contribuyendo de manera importante no sólo al
desarrollo de los MOF y materiales conexos, sino también al impulso de la cristalografía hacia
nuevas fronteras.
a) Posibles interesados
El análisis estructural por difracción de neutrones puede resultar fundamental en el campo de la química
bioniorgánica. Esto es debido a que en muchas especies propuestas como intermediarios clave en ciclos
catalíticos resulta importante determinar el estado de deprotonación o en otros casos los enlaces de
hidrógeno con aminoácidos son fundamentales para la estabilidad de la especie. Este último es el caso del
aducto del oxígeno en la mioglobina, MbO2, en el que se encontró que el enlace de hidrógeno entre la
histidina distal y el oxígeno es responsable de la estabilidad del aducto, lo cual pudo concluirse mediante un
análisis estructural por difracción de neutrones [7].
Las enzimas hémicas llevan a cabo un amplio rango de oxidaciones en biología. Estas enzimas activan la
molécula de oxígeno mediante la formación de especies intermediarias Fe-oxo (ferrilo). Desde siempre
permanece la pregunta acerca de la naturaleza del enlace hierro-oxígeno y, en particular, es de interés
determinar el estado de protonación.
a) Posibles interesados
a) Posibles interesados
El estudio y clasificación adecuados de minerales naturales es una de las principales herramientas para la
conocer en profundidad los recursos minerales nacionales y sus utilidades. Muchos de estos son de gran
importancia tecnológica. Estos estudios requieren de análisisprecisascombinando diferentes técnicas como
por ejemplo difracción de rayos-x en monocristal, espectroscopia raman, microanalises y principalmente
difracción de neutrones. Esto se debe a que el análisis y clasificaciones de estos minerales requiere muchas
veces de la determinación de la presencia o no de especiesatómicas leves en presencia de átomos pesados.
Un ejemplo de este tipo son los pirocloros de formula general A 2B2X6Y que cristalizan en el grupo espacial
cubico Fd-3m. La cantidad máxima de H2O en la estructura de pirocloro está controlada por la ocupación de
cationes del sitio A. El contenido máximo de H2O oscila entre 1,00 H2O por formula unitaria para
piroclorosideales y 1,75 H2O por formula unitaria para pirocloros deficientes. Si hay un gran déficit de
cationes en A y el total analítico es muy bajo, podríamos sospechar la presencia de H2O en los sitios A del
mineral. Podemos calcular el máximo posible H2O estructural en el mineral y compararlo con los déficits
analíticos en EPMA datos. Pero uno no debe asumir que todo el H2O en los pirocloroses estructural, ni que
los déficits analíticos en los datos de microanálisis de sondas electrónicas (EPMA) para los minerales de
pirocloroson atribuibles al H2O estructural. Gran parte del H2O es adsorbida, y por lo tanto no es
estructural. En este sentido, es interesante observar que los análisis químicos de pirocloros de uranio
geológicamente joven, no metamitoria, indican bajos contenidos de H2O.
Desafortunadamente, no podemos asegurar el
contenido de una especie neutra a partir de
mediciones de densidad, o de la determinación
de la densidad de electrones en una estructura,
ninguna de las cuales sería muy precisa en
presencia de átomos pesados.Más aun, algunas
posiciones catiónicas en la estructura de
pirocloros están ocupadas por átomos pesados
tales como Ta y Ti (ver Fig. 8). Por lo tanto, es
extremadamente difícil determinar la posición
de átomos ligeros como por ejemplo Hidrógenos
y oxígenos, usando solamente difracción de
rayos X. Sin embargo, se puede utilizar la
difracción de neutrones de monocristal para este
propósito, ya que es complementaria a la
difracción de rayos X y puede distinguir
Fig. 8 Estructura cristalina de hidroxialciomicrolita. fácilmente elementos ligeros en presencia de
Octaedros rosados: grupos TaO6, esferas verdes: cationes elementos pesados. Así este tipo de medidas
Ca1, esferas marrones: cationes Na1, esferas rojas: aniones permitiría, por ejemplo, estudiar la posición de
O1, esferas naranjas: aniones F1 y esferas azul oscuro: los átomos de hidrógeno en los minerales
átomos H1. piroclorales, ya que la localización e
identificación precisa de moléculas de hidroxilo
y/o agua es esencial para la caracterización de nuevas especies naturales del supergrupo pirocloro.
a) Posibles interesados
En nuestro laboratorio nos hemos especializado en el estudio de estructuras de proteínas por rayos X a alta
resolución (menor que 0.85 Å) y por difracción de neutrones. Hemos trabajado en la enzima Aldosa
Reductasa, en la Proteína Anticongelante de Tipo III total y parcialmente deuterada, y en la Proteína
Transportadora de Ácidos Grasos (FABP).
Tanto los estudios de alta resolución como los de difracción de neutrones requieren cristales de un tamaño
y calidad que solo alcanzan por el momento menos del 0.1% de las estructuras depositadas en el Protein
Data Bank, si bien esta fracción tiende a aumentar en años recientes.
En estos estudios, al salir de las situaciones estándar, se emplean técnicas de crecimiento cristalino,
colección de datos y afinamiento de la estructura adaptadas a cada caso. Como contraparte, se obtiene
información sobre la proteína, su hidratación tomando en cuenta la orientación del agua como dipolo, los
estados de protonación y polarización de los residuos, y la presencia de “anomalías” a la geometría
estándar que nos permiten dar una respuesta a la pregunta biológica que motiva el estudio, a la vez que
contribuye a incrementar nuestro conocimiento básico sobre la estructura y función de las macromoléculas.
Trabajamos actualmente en colaboración con el grupo de Alberto Podjarny en Estrasburgo, Francia, y Eddy
Arnold, de Rutgers, New Jersey, en el estudio por difracción de neutrones de la Transcriptasa Reversa de
HIV, con el objeto de obtener una descripción completa del sitio activo y así contribuir al diseño racional de
fármacos basados en el conocimiento de la estructura.
a) Posibles interesados
Nuestro laboratorio se dedica a estudiar los mecanismos moleculares que subyacen a la patogenicidad
bacteriana y a la respuesta del sistema inmune contra proteínas inmunogénicas.
Asimismo, a través de la Plataforma PLABEM, financiada por el FONCyT, brindamos el servicio de resolución
de estructuras de macromoléculas por cristalografía de rayos X para toda la comunidad académica de
Argentina.
Si bien nuestro grupo no tiene experiencia previa en difracción de neutrones, consideramos importante
destacar que nuestro laboratorio es pionero en Argentina en difracción de rayos X de macromoléculas tanto
en know-how como en instrumentación. Desde comienzos de 2014, y a través de la Plataforma PLABEM,
operamos el único difractómetro de rayos X de macromoléculas de Argentina (un equipo de microfoco
Bruker D8 QUEST) y tenemos un total de más de 20 estructuras resueltas a la fecha. Asimismo, desde 2012
nuestro grupo coordina el acceso global de otros 10 laboratorios de Argentina al sincrotrón SOLEIL de
Francia (http://www.synchrotron-soleil.fr/), para hacer uso de las líneas de cristalografía de
macromoléculas PROXIMA 1 y PROXIMA 2. Consideramos de alto interés la posibilidad de acceder a
difracción de neutrones en un futuro cercano en Argentina, lo que sin duda aumentará el impacto de
nuestras investigaciones.
5. REQUERIMIENTOS DE DISEÑO
A continuación se presenta una Tabla con los instrumentos especialmente diseñados para cristalografía de
proteínas. Dada la demanda volcada en los presentes casos científicos, parece adecuado considerar
difractómetros quasi-Laue multipropósito.
Del análisis de los casos científicos presentado, se deducen algunos requerimientos básicos para el diseño
de un instrumento de difracción de monocristal de neutrones en el LAHN.
En cuanto a la ubicación del instrumento, se distinguen dos tipos de problemas que precisan (a) un haz de
neutrones fríos (estudios de proteínas y macromoléculas) y (b) un haz de neutrones térmicos (pequeñas
moléculas, transiciones de fase, ciencia de materiales). Una posible solución es diseñar un instrumento que
se pueda transladar.
6. CONSLUSIONES
Las investigaciones mencionadas anteriormente se podrían llevar a cabo en una instalación de difracción de
neutrones por monocristales en el RA10.
Se considera que existirían por lo menos dos aspectos concurrentes para el éxito de esta propuesta. En
primer lugar, la posibilidad de estudiar muestras monocristalinas de tamaño comparable o algo mayor que
las utilizadas habitualmente para estudios de monocristales por difracción de rayos X. En segundo lugar, la
posibilidad de utilizar un sistema de detección de alta sensibilidad y amplio rango dinámico, que permita
versatilidad.
FO-PR-002 r 3
SC-LAHN-003
CASO CIENTÍFICO
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7. REFERENCIAS
[1] Neutron crystallography: opportunities, challenges, and limitations, Blakeley, M.P., Langan, P., Niimura, N.,
Podjarny, A., (2008) Current Opinion in Structural Biology, 18 (5), pp. 593-600.
[2] Neutron protein crystallography: A complementary tool for locating hydrogens in proteins William
B. O'Dell, Annette M. Bodenheimer, Flora Meilleur,, Archives of Biochemistry and Biophysics, Volume 602, 15
July 2016, Pages 48-60.
[3] Single-Crystal Neutron Diffraction at the Australian Replacement Research Reactor. Report of the Single-Crystal
Diffraction Workshop ANSTO 11-12 December 2001. Edited by Wim T. Klooster.
[4] Single Crystal Neutron Diffraction from Molecular Materials, Chick C. Wilson, World Scientific, (2000).
[5] Neutrons expand the field of structural biology, Nobuo Niimura, Current Opinion in Structural Biology, Volume 9,
Issue 5, (1999), Pages 602-608.
[6] Two-Dimensional Water and Ice Layers: Neutron Diffraction Studies at 278, 263, and 20 K. Christoph Janiak,
Tobias G. Scharmann y Sax A. Mason. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14010-14011 Experimento realizado en D19,
Institut Laue-LangeVin, Grenoble, France. Cooperative Hydrogen-Bonding Effects in a Water Square: A Single-Crystal
Neutron and Partial Atomic Charges and Hardness Analysis Study. David R. Turner , Marc Henry , Clive Wilkinson ,
Garry J. McIntyre , Sax A. Mason , Andres E. Goeta ,y Jonathan W. Steed. J. Am. Chem. Soc., 2005, 127 (31), pp 11063–
11074. Experimento realizado en VIVALDI, ILL, Grenoble. Neutron Diffraction Studies on Guest-Induced Distortions in
Urea Inclusion Compounds. Rachael Lee, Sax A. Mason, Estelle Mossou, Glenn Lamming, Michael R. Probert, y
Jonathan W. Steed. Cryst. Growth Des., 2016, 16 (12), pp 7175–7185. Experimento realizado en D19, ILL, Grenoble.
[7] Phillips, S. E. V.; Schoenborn, B. P. Nature, 1981, 292, 81
[8] Casadei. C. M. et al. Science, 2014, 345 (6193), 193
[9] Lehnert, N; Speelman, A. L. Acc. Chem. Res., 2014, 47,1106., Doctorovich, F.; Bikiel. D. E., Pellegrino, J.; Suárez, S. A.;
Martí, M. A. Acc. Chem. Res., 2014, 47, 2907.
[10] Lehnert, N; Speelman, A. L. Acc. Chem. Res., 2014, 47,1106
[11] Robert Bau, Sax A. Mason, Brian O. Patrick, Craig S. Adams, W. Brett Sharp, and Peter Legzdins Organometallics
2001, 20, 4492-4501
[12] Walter Baratta, Carlo Mealli, Eberhardt Herdtweck, Andrea Ienco, Sax A. Mason, and Pierluigi Rigo J. Am. Chem.
Soc. 2004, 126, 5549-5562
[13] Gaviglio, C., Ben-David, Y., Shimon, L.J.W., Doctorovich, F., and Milstein, D. Organometallics 2009 28, 1917.
[14] Cole, J. M.; Gibson, V. C.; Howard, J. A. K.; McIntyre, G. J.; Walker, G. L. P. Chem. Commun. 1998, 1829.
Klooster, W. T.; Brammer, L.; Schaverien, C. J.; Budzelaar, P. H. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1381.
Klooster, W. T.; Lu, R. S.; Anwander, R.; Evans, W. J.; Koetzle, T. F.; Bau, R. Angew. Chem.,Int. Ed. 1998, 37, 1268.
[15] https://neutrons.ornl.gov/imagine
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SC-LAHN-003
CASO CIENTÍFICO
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8. ANEXOS
8.1. ANEXO I