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Dr.

Antonio Barbadilla

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Dr. Antonio Barbadilla

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PROBLEMA: ¿CÓMO SE DESCODIFICA EL ARNm?

¿Cómo pasar del lenguaje de 4 letras del ADN


(o ARNm) a otro de 20 letras (los aminoácidos de las
proteínas)?
EL CÓDIGO GENÉTICO

Es la correspondencia entre la secuencia de nucleótidos de un


gen del ADN, a través de su copia en el ARNm, y la secuencia
de los aminoácidos de la proteína que dicho gen sintetiza en los
ribosomas.

¿Cómo pasar de un lenguaje de


4 letras a otro de 20 letras?
DESARROLLO EXPERIMENTAL DE NIRENBERG Y MATTHAEI

Preparan 20 tubos con extracto de E.


Coli y lo necesario para síntesis de
proteínas. Añadieron en cada tubo uno
de los 20 aminoácidos marcados
radiactivamente.

Poli U

Añaden a cada tubo ARN igual al


sintetizado por Severo Ochoa: “poli U”

Fen*- Fen*- Fen*- Fen*- Fen*

En sólo uno de los tubos se obtuvo un


polipéptido que era de fenilalanina.
Aceptando que el código genético está
formado por tripletes, dedujeron que el
UUU codificaba para fenilalanina.
EL CÓDIGO GENÉTICO
Ej. DE CODIFICACIÓN DE UN PÉPTIDO CON 6 AMINOÁCIDOS
EL CÓDIGO GENÉTICO (orden alfabético)
EL CÓDIGO GENÉTICO
EL CÓDIGO GENÉTICO

UAA UGA
UAG

AUG

Iniciación Ej. ¿Qué aminoácido está


codificado por el codón GAC?
Terminación
CARACTERÍSTICAS DEL CÓDIGO GENÉTICO

UNIVERSAL DEGENERADO (REDUNDANTE)

Compartido por todos los organismos A excepción de la metionina y el triptófano, un


conocidos incluso los virus. aminoácido está codificado por más de un
codón (son codones sinónimos).
Ha tenido un solo origen evolutivo.
Esto es una ventaja ante las mutaciones.
Existen excepciones en las mitocondrias
y algunos protozoos.
CARECE DE SOLAPAMIENTO

SIN IMPERFECCIÓN (NO AMBIGUO) Los tripletes se disponen de manera lineal y


Cada triplete o codón solo codifica a un continua, sin espacios entre ellos y sin
aminoácido. compartir bases nitrogenadas.
EXCEPCIONES A LA UNIVERSALIDAD DEL CÓDIGO GENÉTICO
TRADUCCIÓN. SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
ELEMENTOS NECESARIOS PARA TRADUCCIÓN

LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

necesita

ENZIMAS Y ARN DE
RIBOSOMAS AMINOÁCIDOS ARN MENSAJERO ENERGÍA TRANSFERENCIA

Formados por Donde se unen los Como la


Tiene
SUBUNIDAD dos
Donde se une el
AMINOACIL-ARNt zonas
GRANDE
-SINTETASA
Por donde
SUBUNIDAD se une al
PEQUEÑA
ANTICODÓN
Donde se sitúa el

Donde se
SITIO A AMINOÁCIDO EXTREMO 3’
une el
Tienen
tres SITIO P POLIPÉPTIDO
lugares
SITIO E ARNt
Nucleolo

Los ribosomas se
forman en el
nucleolo
Núcleo
Vemos aquí ribosomas saliendo del núcleo.
EL ARNt ES EL INTÉRPRETE ENTRE LOS TRIPLETES Y LOS aa
ARN TRANSFERENTE

2
ARN TRANSFERENTE

Transportan los aminoácidos hasta los ribosomas. Sitio de


unión al aa

Los ARNt tienen las sig.


características: Zona de unión
al ribosoma
En el extremo 5’ tiene un triplete
con G y un ácido fosfórico libre.

En el extremo 3’ tiene tres bases


(CCA) sin aparear. Por este
extremo se une al aminoácido.
Zona de unión a
la enzima que lo
En el brazo A tiene un triplete
une al aa
de bases llamado anticodón,
diferente para cada ARNt en
función del aa que transportan.
Zona de unión al ARNm
Paso previo a la traducción: ACTIVACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

Gracias a la enzima
Aminoacil ARNt sintetasa

Aminoácido

Aminoacil ARNt sintetasa

Tiene dos sitios activos muy específicos: uno


de ellos reconoce al aminoácido y el otro
identifica determinadas secuencias de bases
características de cada ARNt.
ACTIVACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
ACTIVACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

aa + ATP aa-AMP + PPi

Aminoacil ARNt sintetasa


+ +

Aminoácido (aa-AMP)
Ácido aminoaciladenílico

ARNtx

La unión se realiza en el
extremo 3’ del ARNt

Existen al menos 20 aminoacil-ARNt-


sintetasas, una para cada aminoácido.
Aminoacil-ARNtx
Son enzimas muy específicas
ACTIVACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

Aminoacil-ARNt sintetasa
EL BALANCEO DE LA 3ª BASE DEL ANTICODÓN

Como no hay una relación directa entre los tripletes del ARNm y los aa, la
causa de la degeneración del código genético debe estar en el ARNt.

La complementariedad entre el codón del ARNm y el anticodón del ARNt sólo


es estricta en las dos primeras bases del anticodón (sentido 3´-5´), mientras
que la 3ª base del anticodón (extremo 5´) puede aparearse “defectuosamente”
con otras bases distintas a la complementaria normal (→ balanceo). Este
balanceo es la causa de la degeneración del código genético.
EL BALANCEO DE LA 3ª BASE DEL ANTICODÓN

Debido al balanceo, un mismo


ARNt puede unirse con su
anticodón a codones diferentes
que especifican al mismo
aminoácido.
EL BALANCEO DE LA 3ª BASE DEL ANTICODÓN

También puede haber más de un


ARNt con anticodones diferentes
que aceptan el mimo aminoácido
(→ isoaceptores).

(ARNm)

En la tabla se indican tres ARNt de serina que pueden leer cada uno dos
codones diferentes en el ARNm. Estos tres ARN-t son isoaceptores porque
aceptan al mismo aminoácido pero están codificados por genes distintos.
FASES DE LA TRADUCCIÓN

• Iniciación de la síntesis
1

• Elongación de la cadena
peptídica
2

• Terminación
3
Etapa 1:
1. INICIACIÓN DE LA SÍNTESIS DE LA CADENA PEPTÍDICA.

El primer paso (en eucariotas) consiste en la formación del


complejo de iniciación 80S, formado por un ribosoma unido por una
parte al ARNm y por otra al ARNt iniciador cargado con el
aminoácido metionina: ARNtiMet

Met
ARNtiMet

U A C
A U G
ARNm
1. INICIACIÓN DE LA SÍNTESIS DE LA CADENA PEPTÍDICA.

40S
Primero ciertos factores de iniciación
facilitan que la subunidad menor del
ribosoma (40S) reconozca la “caperuza”
de m-GTP (metil guanosina trifosfato) y
se una al ARNm en el extremo 5´.

Después se une el ARNt iniciador


cargado con el aminoácido metionina,
ARNtiMet, a la subunidad menor del
ribosoma (40S), gracias a otros factores 60S
de iniciación y la energía del GTP.
1. INICIACIÓN DE LA SÍNTESIS DE LA CADENA PEPTÍDICA.

40S

La subunidad pequeña del ribosoma


rastrea al ARNm (en sentido 5´-3´)
hasta encontrar el primer codón de
iniciación AUG. 60S

Se produce entonces el
apareamiento del anticodón UAC del
ARNtiMet con el codón de iniciación
AUG del ARNm.
1. INICIACIÓN DE LA SÍNTESIS DE LA CADENA PEPTÍDICA.

40S

Por último, la subunidad mayor del 60S

ribosoma (60S) se acopla con la


subunidad pequeña (40S), el ARNm y
el ARNtiMet, para formar el complejo
de iniciación 80S completo y
funcional, liberándose los factores de
iniciación.
SITIOS ACTIVOS DEL RIBOSOMA

Centro peptidil (P):


Sitio donde se sitúa el primer
aminoacil-ARNt, y también el
polipéptido que se va a ir
sintetizando.

Centro aminoacil o aceptor (A):


Sitio donde se van añadiendo los
nuevos aminoácidos.

Centro E o de salida:
Sitio donde se une el ARNt que
acaba de aportar su aminoácido y
va a salir del ribosoma.
Ribosoma traduciendo un ARNm
POLIRRIBOSOMAS O POLISOMAS

Si el ARN a traducir es lo suficientemente largo, puede ser leído por más de un


ribosoma a la vez, formando un polirribosoma o polisoma.

ARNm

Proteína en
formación

Microfotografía electrónica (MET, falso color) de Ribosoma


un polirribosoma.
Polisomas o
polirribosomas
Etapas 2 y 3:
TRADUCCIÓN: INICIACIÓN Y ELONGACIÓN

Codón iniciador
E P A (AUG)
INICIACIÓN
ARNm Posición E
Posición P

ARNtiMet

Subunidad grande
Posición A Aminoacil -ARNt

Desplazamiento del ribosoma

5’ 3’

Enlace peptídico

El aminoácido se
libera del ARNt ELONGACIÓN
TRADUCCIÓN: TERMINACIÓN

Codón de terminación Separación de las dos


(UAA, UGA, UAG) subunidades del ribosoma
ARNm
ARNm

ARNt

Porción final de la Factor de


cadena proteica liberación

A medida que se van sintetizando, las proteínas adquieren la


estructura secundaria y terciaria que les corresponde.
1. INICIACIÓN

(unida al ARNtiMet, reconoce la


“caperuza” , uniéndose al ARNm)

Codon de iniciación

ARNtiMet
(ARNt iniciador)
2. ELONGACIÓN. ENTRADA DEL SIGUIENTE ARNt-aa (Gln)

ARNtGln

(→ peptidil-transferasa)
2. ELONGACIÓN. FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO
2. ELONGACIÓN. TRANSLOCACIÓN

El ribosoma
2. ELONGACIÓN. NUEVO ENLACE PEPTÍDICO
2. ELONGACIÓN. NUEVA TRANSLOCACIÓN
3. FINALIZACIÓN
3. FINALIZACIÓN
MADURACIÓN POSTRADUCCIONAL DE LAS PROTEÍNAS

Los polipéctidos recién sintetizados no son funcionales, ya que


deben adoptar la conformación espacial adecuada que determina su
función biológica.

Este plegamiento de las


cadenas peptídicas es
espontáneo.

A veces sufren la adición de grupos


prostéticos, cortes proteolíticos que
acortan el péptido, unión de varias
cadenas peptídicas,…
PLEGAMIENTO POSTRADUCCIONAL. LAS CHAPERONAS

El plegamiento de las cadenas suele ser espontáneo, pero otras


veces requieren la acción de las chaperonas moleculares, cuya
función consiste en facilitar el plegamiento y autoensamblaje de
las cadenas peptídicas.

Anillo aleatorio Conformación activa

Chaperona

Las chaperonas tb. contribuyen al tráfico


de proteínas, y, en condiciones adversas,
actúan como proteínas de choque
térmico o anti-estrés, un sistema
defensivo y protector que evita la
desnaturalización de las proteínas .
EXPORTACIÓN Y DESTINO DE LAS PROTEÍNAS
La localización de los ribosomas en el citoplasma depende del destino
final de la proteínas que esté sintetizando

Las proteínas que van a ser exportadas al núcleo, mitocondrias, cloroplastos o


peroxisomas se sintetizan en ribosomas libres del citosol.

Las proteínas cuyo destino es ser componentes estructurales de las membranas,


o bien hormonas o enzimas que van a ser enviadas al exterior de la célula o al
interior de los lisosomas, se sintetizan en ribosomas situados en la superficie de
las membranas del RER.
EXPORTACIÓN Y DESTINO DE LAS PROTEÍNAS
La cadena peptídica posee al principio una secuencia o péptido señal (20-30 aa)
que marca el destino de la proteína. En su transporte también participan
determinadas chaperonas.
Tranquilos… Aún queda la
regulación de la expresión génica.

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