Es el sistema más complejo. La oxidación es la pérdida de electrones de un átomo lo
que hace que disminuya su energía potencial. El cuerpo descompone combustibles con la ayuda de oxígeno para generar energía, método principl durante pruebas de resistencia. Es un proceso aeróbico ya que se emplea oxígeno. La producción de ATP se realiza dentro de las mitocondrias y también se hallan distribuidas por el sarcoplasma. Cuando una sustancia se oxida, los átomos de hidrogeno liberados no permanecen libres en la célula sino que se transfieren de inmediato a otro compuesto a través de coenzimas. Las reacciones de oxidación y reducción siempre están acopladas. Estas reacciones apareadas se denominan reacciones de óxidoreducción o rédox. Por ejemplo, cuando el ácido láctico se oxida para formar ácido pirúvico, los dos atomos de hidrógeno eliminados se utilizan para reducir el NAD+ (nicotinamida adenina dinucleótido con carga positiva adicional por la pérdida de un ion hidruro).