UNAJMA: E.P.

INGENIERÍA AMBIENTAL
MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL
SESIÓN DE APRENDIZAJE 2
Parte I

1. Aspectos taxonómicos
2. Diversidad microbiana
Bacterias, hongos, algas,
protozoarios Dra. Julia Iraida Ortiz
Guizado
INTRODUCCIÓN

Los microorganismos son los

seres más primitivos y
numerosos que existen en la
Tierra, colonizan todo
ambiente: suelo, agua y aire,
participan de forma vital en
todos los ecosistemas y
están en interacción continua
con las plantas, los animales
y el hombre (Montaño y Col. 2010)
 INTRODUCCIÓN

La ciencia de la microbiología estudia los microorganismos

y cómo funcionan, especialmente las bacterias, un grupo
muy grande de células muy pequeñas … también estudia
la diversidad y la evolución de las células microbianas,
cómo surgieron los diferentes tipos de microorganismos y
por qué.
Abarca la ecología, su hábitat, cómo se asocian y cooperan
los microorganismos entre sí, y qué influencia tienen en el
mundo en general(Brock, 2015)
 DIVERSIDAD MICROBIANA
Conjunto de
microorganismos
mayormente no
visibles a simple
vista, están
conformados por
organismos
procariotas
(bacterias) y
eucariotas (hongos,
algas, protozoarios
y líquenes)
https://www.youtube.com/watch?v=KWMQoZXqLK8
 MICROORGANISMOS EXTREMÓFILOS

❑ ACIDÓFILOS
❑ ALCALÓFILOS
❑ XERÓFILOS
❑ BARÓFILOS
❑ CRIPTOENDOLITOS
❑ METALOTOLERANTES
❑ PSICRÓFILOS
❑ OSMÓFILOS
❑ TERMÓFILOS
❑ RADIÓFILOS
 Beneficios ambientales de los
microorganismos
1. Descomposición y mineralización de desechos orgánicos (materia
orgánica).
2. Regulación de los ciclos biogeoquímicos (nitrógeno, fósforo, azufre,
etc.).
3. Retención y liberación de nutrientes para las plantas.
4. Generación, mantenimiento y renovación del suelo y su fertilidad.
5. Regulación atmosférica de gases (producción y consumo: CO2 N2O,
N2, etc.).
6. Regulación de las poblaciones de animales y plantas.
7. Control de plagas agrícolas y urbanas.
8. Síntesis de productos farmacéuticos, alimenticios, industriales y de
control biológico.
9. Mantenimiento de la productividad primaria de agro ecosistemas y
ecosistemas.
10. Recuperación y remediación de ecosistemas degradados
(Montaño y Col. 2010)
 TAXONOMÍA
Ciencia y/o subdisciplina
de la Biología
Z A

Principios Ordenar Animales

I

Para Sistemas
Tiene
L

Fines Jerarquizar Plantas

I

Clasificar
U T

Métodos Microorganismos

Sistema internacional de nomenclatura binomial En División (Phylum)

Clase
Para Orden
Familia
Acuñar el nombre científico Género
Especie
A la
Especie La Categoría Categorías
Siendo
biológica fundamental taxonómicas
ANTECEDENTES DE LA TAXONOMÍA

CARLOS LINNEO (SUECIA 1707-1778)

Autor del sistema de calificación de plantas (1753):
Especie, como unidad básica de clasificación
Padre de la taxonomía moderna
Clasificó más de 8000 especies de animales y 6000
especies de vegetales.
 ANTECEDENTES DE LA TAXONOMÍA

Clasificación
seres vivos PROTISTA

• Bacterias
• Algas
• Protozoarios
REINOS • Hongos

Ernst Haeckel (Alemania 1834-1919) PLANTAE

Zoólogo Naturalista Filósofo. Aportó
a la teoría de la selección natural.
Autor de la clasificación de los ANIMALIA
microorganismos como el reino
protista.
 ¿Por qué Haeckel clasificó a los
microrganismos en el reino protista?

REINO PROTISTA

PROCARIOTAS Y
EUCARIOTAS
❑ No forman tejidos,
❑ No son plantas ni animales
❑ Unicelulares o pluricelulares
❑ Algas Ejemplo
❑ Hongos Euglena: tienen membrana celular
❑ Protozoarios pero realizan fotosíntesis
❑ bacterias. Hongos: tienen pared celular pero no
realizan fotosíntesis
 ANTECEDENTES DE LA TAXONOMÍA
Edouard Chaton (Biólogo
francés 1883-1947) PROCARIOTA

Microorganismos que
Clasificación no tienen membrana
seres vivos nuclear

EUCARIOTA

Microorganismos
con membrana
nuclear
ANTECEDENTES DE LA TAXONOMÍA
Herbert Copeland (Biólogo, USA 1902-
1968) MONERA

• Bacterias

PROTISTA

Clasificación • Algas
seres vivos • Hongos
• Protozoarios

PLANTAE

ANIMALIA
 ANTECEDENTES DE LA TAXONOMÍA
Robert Whittaker (Biólogo, MONERA
USA 1920-1980) • Bacterias

FUNGI
• Hongos
Clasificación
seres vivos PROTISTA
• Algas
• Protozoarios

PLANTAE

ANIMALIA
 RELACIONES EVOLUTIVAS DEL
PLATEAMIENTO DE WHITTAKER-WOESE
DOMINIO
EUKARIA

DOMINIO DOMINIO
BACTERIA ARCHEA
TAXONOMÍA DE MICROORGANISMOS
PILARES

CLASIFICACIÓN NOMENCLATURA IDENTIFICACIÓN

Ordenación de los Dar nombre a los

Acuñar un
microorganismos microorganismos
microorganismo de
según semejanzas o mediante normas
acuerdo a sus
parentescos establecidas del
características dentro
evolutivos en grupos sistema binomial
de un taxón o grupo
o taxones internacional

El manual de clasificación más utilizado es el

MANUAL DE BERGEY
 TIPOS DE TAXONOMÍA MICROBIANA

TAXONOMÍA TAXONOMÍA TAXONOMÍA

FENOTÍPICA GENOTÍPICA POLIFÁSICA

MEDIANTE MEDIANTE GENES COMBINA LO

CARACTERES DE Consiste en GENÉTICO Y
FORMA, ESTRUCTURA desarrollar pruebas FENOTÍPICO
Y FISIOLOGÍA moleculares de % de
Se utiliza microscopía Guanina (G) y Es decir luego de
de alta resolución Citosina (C) analizar
Pruebas bioquímicas Hibridación de ADN estructuralmente y
del metabolismo Composición de fisiológicamente, se
microbiano. Análisis bases realiza las pruebas
de la estructura de los Secuenciación de moleculares o
microorganismos nucleótidos genéticas
 ¿Qué es composición de bases
del ADN?

Consiste en establecer la proporción de las bases del ADN, expresadas

en porcentajes moleculares (mol%) de Guanina+Citosina (G+C).

Este método se fundamenta en que la cantidad relativa de G+C es

característica para cada especie y que existe escasa variación en la
cantidad de G+C dentro de un mismo grupo taxonómico (entre 3-5%).

Además, existe una cierta correlación entre la composición de bases y el

tipo fisiológico, por ej. los organismos de respiración aeróbica tienen una
proporción de G+C entre 60-75% mientras que los organismos
fermentadores poseen valores muy inferiores
 ¿Qué es secuenciación de
nucleótidos?

Consiste en establecer el orden o secuencia en que están

colocados los nucleótidos dentro de las moléculas de ácidos
nucleicos, a través de la replicación del ADN. Esta información
es clave para la diferencia entre organismos.

Para la taxonomía de bacterias las moléculas más utilizadas

son la fracción de 16S del ARN ribosómico (1500 nucleótidos) y
el ADN de los plásmidos (son moléculas extracomosomales de
ADN)
¿Qué es secuenciación de
nucleótidos?
 ¿Qué es hibridación de ADN?

Permite estudiar el grado de relación genética entre dos ADN.

La proporción de similitud genética que se acepta para asignar el

nivel taxonómico a dos organismos es:

a) 99% o 100% pertenecen a la misma cepa (clon),

b) mayor de 60% pertenecen a la misma especie;
c) mayor de 20% pertenecen al mismo género,
d) entre 1 y el 5% pertenecen a géneros no relacionados.
¿Qué es hibridación de ADN?
¿Qué es hibridación de ADN?
 DAVID HENDRICKS
BERGEY
(1860-1973)
Dr. En Medicina, Pensilvania,
USA.
En la práctica se dedicó a la
microbiología como profesor
de la universidad

Estableció el Código
Internacional de
Nomenclatura de Bacterias

Utilizó los siguientes criterios: MORFOLOGÍA, COLORACIÓN GRAM,

RELACIÓN CON EL OXÍGENO Y MOTILIDAD
 CRITERIOS DE CLASIFICACIÓN DE BERGEY´S

Clasificación Clasificación Clasificación

fenotípica analítica genotípica
• Microscópica • Ácidos grasos en • Relación G:C
• Macroscópica pared celular • Hibridación ADN
• Biotipo • Lípidos celulares • Secuencia de
• Serotipo totales ácido nucleico
• Estándar de • Proteínas • Fragmentos ADN
antibiograma celulares totales cromosómico
• Fagotipo • Electrolisis • Plásmidos
enzimática • Ribotipificación
• PCR: Reacción
cadena
polimerasa
 MANUAL DE BERGEY
VOLUMEN I VOLUMEN II VOLUMEN V
Bacterias Gram Proteobacterias, bacterias Bacterias Gram negativas
negativas especiales gram negativas de importancia diferentes 8 grupos
Cianobacterias. clínica
No son de importancia (Grupos alfa, beta, delta, Producen enfermedades
clínica gamma y épsilon) Ejm: Ejm: Chlamydia,
Neisseria, Brucella, Legionella, Treponema, Borrelia o
Pseudomonas, Haemophilus, Bacteroide
VOLUMEN III
Campylobacter y
Bacterias Gram Enterobacterias,
positivos con bajo
VOLUMEN IV
contenido en G+C
Bacterias Gram positivos
Staphylococcus, especiales con alto contenido
Streptococcus, en G+C
Enterococcus, Mycobacterium y
Clostridium y Bacillus Corynebacterium.
 TAXONOMÍA BACTERIANA: Criterios
Ecológicas y
Morfológicas Fisiológicas
epidemiológicas
• Estructura celular: forma, • Tipo de metabolismo • Relaciones
esporas, flagelos, cilios, • Fuentes de energía y interespecíficas:
cápsula, inclusiones carbono antibiosis, simbiosis,
• Características • Fuentes de nitrógeno comensalismo,
ultraestructurales • Fuentes de minerales amensalismo.
• Coloración Gram • Metabolitos • Patogenicidad
• Componentes de pared celular • Productos de fermentación • Toxicidad
• Morfología de colonias • Temperatura • Hábitat
• Necesidades gaseosas: O2, • Degradación de M.O.
Genéticas CO2, H2S • Biorremediación
• Osmotolerancia
• Antibiograma
• Reproducción • Luminiscencia
• Mapa genético • Fotosíntesis
• PCR • Etc.
• Tipo de ADN
• Plásmidos, Bacteriófagos
• Transducción, conjugación,
transformación
ALGUNOS EJEMPLOS DE NOMBRES
CIENTÍFICOS
 REINO
MONERA
 Reino monera

❑Unicelulares procariotas (no tienen membrana nuclear

❑En medios de cultivo forma colonias
❑Reproducción asexual fisión binaria
❑Reproducción sexual por conjugación
❑Pared celular con peptidoglucano (mureína)
❑Gram positivos o Gram negativos
❑Se mueven por flagelos
❑Con bacterioclorofila los que realizan fotosíntesis, pero no
tienen cloroplastos.
❑No tienen Aparato de Golgi ni retículo endoplasmático
 Reino monera
Cianobacterias (azules),
Bacterias autótrofas: Rhodobacterias (rojas)
fotosíntesis Chlorobacterias (verdes)
(bacterioclorofila)

❑ Comensales: se alimentan del huésped sin

producir enfermedad
❑ Parásitos: producen enfermedad en el huésped
Bacterias ❑ Simbióticos: se alimentan mutuamente con el
huésped si producir daños
heterótrofas: no
❑ Industriales: producen sustancias de importancia
realizan fotosíntesis industrial: antibióticos, alcoholes, ácido orgánicos,
vitaminas, proteínas, bioabonos
❑ Saprófitos y ecológicos: servicios ambientales de
recuperación de suelos, remediación, bioabonos,
Reino monera: bacterias gram
positivas y gram negativas
Estructura de una bacteria
Reino monera: bacterias azules
Gro. Chroococcus SP.

Morfología: célula esférica

en pequeños grupos ,
raramente células
solitarias. esta rodeada de
una envoltura mucilaginosa
bien delimitada incolora.

Hábitat: Planctónica.
desembocadura de ríos y
arroyos junto a vegetación
acuática.
Ampliamente distribuida en
las zonas frías
 Reino monera: bacterias simbióticas

Se encuentran en las raíces de las leguminosas y fijan

el nitrógeno atmosférico para la síntesis de proteínas
de las menestras

Rhizobium sp
 Reino protista
1. Unicelulares o pluricelulares no forman tejidos
2. Eucariotas, es decir tienen membrana nuclear
3. Algunos protistas forman colonias
5. Pueden reproducirse de forma sexual o asexual
6. Se mueven por flagelos, pseudópodos o cilios

Protozoarios Algas
 Protozoarios
❑Eucariotas, uninucleado o multinucleados.
❑Unicelulares, raras veces multicelulares
❑Sin clorofila, NO fotosíntesis, excepción las Euglenophytas
si tiene cloroplastos
❑Heterótrofos, la mayoría.
❑Saprófitos o de vida libre se alimentan de la
descomposición de la materia orgánica.
❑Los patógenos parasitan las plantas y animales
❑No tienen pared celular, tienen vacuolas
❑Reproducción fisión binaria, fisión múltiple, conjugación
❑Movimiento por pseudópodos, membrana ondulante o
flagelos
Protozoarios: Amoeba
Protozoarios: Paramecium
Protozoarios: EUGLENAS
REINO FUNGI
 Características generales
❑Unicelulares o pluricelulares, eucariotas
❑Sin clorofila, NO fotosíntesis
❑Heterótrofos
❑Saprófitos (descomponen la materia orgánica)
❑Los patógenos parasitan las plantas y animales
❑Simbióticos con raíces de coníferas (Micorrizas)
❑Industriales: antibióticos, alcoholes, vitaminas
❑Asociación con algas (líquenes)
❑Pared celular similar a las plantas
❑Reproducción asexual por hifas o esporas (sexual o asexual)
❑Forman los micelios a partir de hifas
❑Fuente principal de energía y carbono, los carbohidratos
❑La humedad un factor predisponentes de su hábitat
Hongos
Hongos: Levaduras
Hongos: Basidiomycetos
Hongos: hongos filamentosos

Esporas

Hifas
MICORRIZAS
ALGAS
Características generales
❑Unicelulares o pluricelulares, eucariotas
❑Con clorofila, SI fotosíntesis
❑Otros pigmentos: azules, dorados, rojos
❑Autótrofos
❑Las algas filamentosas simple o ramificadas
❑Los patógenos parasitan a los peces
❑Industriales: agar
❑Asociación con hongos (líquenes)
❑Pared celular similar a las plantas
❑Fuente principal de energía (Luz) y de carbono(CO2)
❑Hábitat: aguas continentales y marinas
❑Microscópicos y macroscópicos
❑Reproducción sexual y asexual
CHLOROPHYTAS
RHODOPHYTAS CHRISOPHYTAS
DIATOMEAS
PHAEOPHYTAS DINOFLAGELADOS