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Dr Z. Honores G. Dr M. García A.
AMINOACIDOS
La fórmula general de un aminoácido es
átomo carbono α
H
grupo amino
H2N C COOH ggrupo
p carboxilo
R
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Familia de Aminoácidos
Los aminoácidos comunes son agrupados de
acuerdo a si su cadena lateral son:
• Ácidos
Á d
• Básicos
• Polar no cargados
• No polares
Estos 20 aminoácidos son nombrados por
abreviaciones de tres o una letra
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Aminoácidos no Polares y Polares sin carga
Aminoacidos Alifaticos
CH3
H3C CH3
CH H2C
H3C CH3
H CH3 CH CH2 H3C CH
+
+
H3N C COO-
+
H3N C COO- +
H3N C COO- +
H3N C COO- H3N C COO-
H H H H H
Glicina (Gly) G Alanina (Ala) A Valina (Val) V Leucina (Leu) L Isoleucina (Ile) I
H H H H H
Serina (Ser) S Cisteina (Cys) C Treonina (Thr) T Metionina (Met) M Prolina (Pro) P
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Aminoácidos Aromáticos y Polares
Aminoacidos aromaticos
OH H
N Aminoacidos básicos
NH2
CH2 CH2 CH2 C NH2+
+ - + - + - HN NH3+ NH
H3 N C COO H3 N C COO H3 N C COO
NH+ CH2 CH2
H H H CH2 CH2
CH2 CH2 CH2
Fenilalanina (Phe) F Tirosina (Tyr) Y Triptofano (Trp) W +
H3 N C COO - +
H3 N C COO - +
H3 N C COO -
H H H
Aminoacidos acidos y sus amidas Histidina (His) H Lisina (Lys) K Arginina (Arg) R
O O- O NH2
O - C C
O O NH2
C CH2 C CH2
CH2 CH2 CH2 CH2
+
H3N C COO- +
H3N C COO- +
H3N C COO- +
H3N C COO-
H H H H
Ac. Aspartico (Asp) D Ac. Glutamico (Glu) Asparagina (Asn) N GLutamina (Gln)
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AMINOÁCIDOS CON CADENA HIDROFÓBICA
- - -
COO COO COO- COO
+ + + +
H3N H H3N H H3N H H3N H
- -
COO- COO
- COO COO
+ + + +
H3N H H3N H H3N H H3N H
-
- - COO
COO COO
+
+ + H3N H
H3N H H3N H
CH2
H C OH
CH2OH
CH 3 C
H2N O
Serina Treonina
Asparagina
COO-
+
H3N H
CH2
CH2
C
H2N O
Glutamina
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CASOS ESPECIALES
- -
COO COO
- COO
+ +
H3 N H +
H3N H H2N H
CH2 H
SH
Glicina Prolina
Cisteína
í
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AMINOACIDOS CON CARGA ELECTRICA EN LA CADENA LATERAL
- - -
COO COO COO
+ + +
H3N H H3N H H3N H
CH2 CH2 CH2
CH2 CH2
NH
CH2 CH2
HN Carga negativa
NH CH2
NH2 Histidina NH3
NH2
Lisina
Arginina
COO- COO
-
+ +
H3N H H3N H
CH2 CH2
Carga positiva
-
COO CH2
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En la célula, donde el pH es cercano a 7, los aminoácidos libres existen en su
forma ionizada; pero cuando es incorporada en una cadena polipeptídica, y
las cargas en los grupos aminos y carboxílicos desaparecen.
desaparecen Un modelo de
balones y bastones y un modelo de Van der Waals son mostrado a la derecha de
la formula estructural. Para alanina, la cadena lateral es un grupo –CH3.
H pH=7
H
+ -
H2N C COOH H3N C COO
CH3 CH3
Forma no ionizada Forma ionizada
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QUIRALIDAD
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Estereoisómeros de los α-aminoácidos
L-alanina D-alanina
+
NH3 NH3+
H3C C H H C CH3
C C
O O O O
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ISÓMEROS ÓPTICOS
El átomo
á d
de carbono
b α es asimétrico,
é llo cuall permite lla formación
f ó de
d dos
d
isomeros de imágenes de espejo (-o estereo), D y L
H+ H+
H H H
+
H3N C COOH +
H3N C COO- H2N C COO-
pKa pKa
R R R
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La carga
g de la
cadena lateral de un
aminoácido depende
d l pH
del H
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Formación de un péptido
p p
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Rotación alrededor de los Enlaces en una Cadena
Polipeptídica
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4 Aminoacidos Monómeros
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Una pequeña parte de una
proteína mostrando cuatro
aminoácidos.
i á id C d
Cada
aminoácido es unido al
siguiente por un enlace
covalente, uno de los
cuales es mostrado en
amarillo. Una proteína
p
también es referido como
polipéptido. Las cadenas
laterales de los
aminoácidos son mostrados
en rojo y los átomos de un
aminoácidos (ácido
glutámico) son
mostrados en una caja gris
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PEPTIDOS
Enlaces pept
peptídicos.
d cos. Deb
Debido
do a la geometr
geometría
a del enlace, tanto el átomo
de carbono como los de nitrógeno, y oxígeno presentan hibridación
sp2, lo que implica una disposición triangular plana de los cinco
p α.
orbitales enlazantes tipo
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Los electrones p de los tres átomos (C, O, N) no
O R´
R
implicados en el enlace σ, pueden formar orbitales
C N
híbrido π. Como el N es menos electronegativo que
R H el O,, el enlace C-O tiene un 60% de carácter de
doble enlace, mientras que el C-N tiene un 40%.
O R´
C N
R H
En tanto,
tanto los péptidos podrán cambiar de conformación por giro de los carbonos tetraédricos
(hibridación sp3) de los radicales R y R', pero no por rotación de los átomos con hibridación sp2.
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PEPTIDOS
4 Aminoacidos
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I
Importancia
t i bi
biológica
ló i
¾A
¾Agentes vasoactivos
i
¾Hormonas
¾A tibióti
¾Antibióticos
¾Neurotransmisores
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