MACROPROCESO RECURSOS E INFRAESTRUCTURA Y LABORATORIOS

Nombre del Proceso:

CODIGO: LA-FM-007
GESTIÓN DE LABORATORIOS
Nombre del Documento: VERSION: 6

FORMATO PRACTICAS DE LABORATORIOS FECHA: 16/noviembre/2021

GUÍA DE LABORATORIO DE PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMÁGENES

Unidad didáctica: Fundamentos de la Imagen Digital
Eje Temático: Herramientas matemáticas básicas utilizadas en el procesamiento de
imágenes digitales. Conceptos básicos de binarización de imágenes. Interpolación espacial
y transformación afín

1
COMPETENCIAS DISCIPLINARIAS
Guía No.

• Comprende y aplica herramientas matemáticas para el análisis y diseño de

procedimientos de procesamiento de imágenes en aplicaciones médicas,
considerando los desafíos de la ingeniería biomédica moderna.
2, 4 y 6 1, 2 y 3
sesiones semanas • Implementa métodos de procesamiento de imágenes médicas que satisfagan
Horas de trabajo la tarea específica de la aplicación, buscando el uso eficiente de los recursos
6 horas con 6 horas computacionales disponibles.
docente autónomas
• Evalúa diferentes tecnologías de programación estándar para el diseño de
soluciones de imagen médica, considerando las necesidades de los posibles
usuarios.

COMPETENCIAS GENÉRICAS
• Comprende conceptos y principios matemáticos que le permiten modelar
Tipo de trabajo procesos y fenómenos en campos de aplicación profesional.
• Desarrolla sistemas y procesos para resolver problemas reales, utilizando
diferentes técnicas y herramientas tecnológicas.
• Propone y valida alternativas de solución para abordar problemas prácticos
utilizando conceptos elaborados.

Grupal X Individual Laboratorio requerido

Introducción

A continuación, se describen los aspectos fundamentales para el desarrollo de la práctica de laboratorio:

1. Componentes: Las actividades prácticas se componen de dos aspectos fundamentales:

• Desarrollo experimental: es el producto práctico verificable obtenido como resultado de las acciones,
actitudes y habilidades del estudioso en la sala de laboratorio, valorado mediante la presentación de
los resultados finales de: diseño, validación en simulación y validación experimental, y la sustentación
individual y grupal de los mismos.
• Informe de la actividad: es el diligenciamiento al documento anexo “Informe de laboratorio”,
consistente en la elaboración de las preguntas teórico-prácticas y la solución del cuestionario.

2. Condiciones generales de desarrollo: El desarrollo de las actividades tendrá las siguientes características
• Las actividades prácticas (desarrollo experimental e informe de la actividad) serán desarrolladas en
equipos de trabajo conformados de forma libre y responsable para el desarrollo de cada actividad,
máximo de tres estudiantes.
• Cada grupo de trabajo estará conformado por máximo 3 estudiosos
• Se dará entendido que la práctica de laboratorio ha finalizado cuando se han presentado y sustentado
los resultados finales de: diseño, validación en simulación y validación experimental, junto con la
entrega del informe.

3. Plazos: Las fechas para la entrega de cada componente son las siguientes:
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• Desarrollo experimental: Únicamente durante el transcurso de las sesiones presenciales de práctica

• Entrega de informes: Únicamente durante el transcurso de las sesiones presenciales de práctica.

Nota: No se recibirán prácticas durante los últimos 10 minutos de la sesión de laboratorio, en cumplimiento
del Artículo 16 del “Reglamento de Laboratorios y Espacios Especializados”.

Con ayuda de las herramientas computacionales, disponibles en el laboratorio de la Universidad Manuela

Beltrán, siga los procedimientos presentados por el docente durante la sesión de teoría desarrollada en el
laboratorio, con el propósito de fortalecer los saberes asociados a la unidad temática para este laboratorio.
Tenga en cuenta las siguientes recomendaciones:
• Informe oportunamente al docente si presenta algún inconveniente con el manejo de las herramientas
computacionales. Esto incluye el manejo de Tool boxes y librerías, errores graves en las compilaciones
o ejecuciones, y demás situaciones que no pueda resolver de forma autónoma.
• Socialice con su grupo de trabajo y con el docente, los resultados de cada desarrollo (simulación o
implementación) obtenido con ayuda de las herramientas computacionales. Para ello deberá
relacionar los diferentes conceptos teóricos estudiados en las sesiones de teoría.
• Organice una bitácora personal con los resultados de las actividades realizadas con ayuda de las
herramientas computacionales (archivos y códigos fuente).

A continuación, se presenta el procedimiento especifico de la práctica distribuido en tres sesiones.

Session 1 (2 hours): Load a medical image and apply the following process:

1. Negative, Brightness, Contrast logarithmic and exponential

2. Show each image result compared with the original one.
3. Normalize the image between 0 and 1 and between -1 and 1 values.
4. Show the matrix and the image results.

Session 2 (2 hours): Load a medical image and apply the following process without using functions:

1. Create one function to normalize the image between 0 and 255.

2. Design a proper image histogram equalization function using the procedure seen in session class theory.
3. Apply the histogram equalization method to the image to enhancement itself.
4. Compare results from Session 1.

Session 3 (2 hours): Load a medical image and apply the following process without using functions:

1. Re-scale (Reduce) the original gray Resolution by factor K= 2, 3, 4 and show the result.
2. Re-scale (Expand) the original gray resolution by a factor of K= 2, 3, 4 and show the result.
3. In the Expand step, implement the Nearest neighbor interpolation.
4. Create one function to perform three affine transformations with Nearest neighbor interpolation.
5. Apply affine transformation (Translation, Rotation and Scaling) to the medical image.

Bibliografía recomendada
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Unidad
Eje Temático Referente bibliográfico
Didáctica
Demirkaya, O., Hakan Asyali, M., & Sahoo, P. K. (2008). Image
Herramientas matemáticas processing with MATLAB: applications in medicine and biology. Taylor &
Fundamentos de la Imagen Digital

básicas utilizadas en el Francis Group. (Catálogo UMB Bogotá)

procesamiento de
imágenes digitales. Semmlow, J. L. (2008). Biosignal and medical image processing (2a. ed.).
Taylor & Francis Group. (Catálogo UMB Bogotá)

Qiang Wu, Fatima Merchant, & Kenneth Castleman. (2008). Microscope

Conceptos básicos de
Image Processing. Academic Press. (eBook Collection (EBSCOhost))
binarización de imágenes.
Alan C. Bovik. (2009). The Essential Guide to Image Processing: Vol. 2nd
ed. Academic Press. (eBook Collection (EBSCOhost))
Interpolación espacial y
Zhuang, L., & Guan, Y. (2019). Image enhancement using modified
transformación afín.
histogram and log-exp transformation. symmetry, 11(8), 1062.
(Recuperado de internet).

Palabras clave

POINT TO POINT TRANSFORM, HISTOGRAM EQUALIZATION, HISTOGRAM THRESHOLDING

Marco conceptual o referencial

The Biomedical engineering provides assistance for medical diagnosis techniques based on medical
information from different modalities like medical images. The medical Images are defined as the set of
techniques and processes to obtain human body images with clinical relevance. Different types of diseases
are only revealed to the physicians when they analyze the information from a clinical image, but some signs of
illness are difficult to see or need special processing to reveal the relevant information. An Image can be
defined as a two-dimensional function f(x,y) or matrix denoted as I(i,j), the minimum element which composes
the image is called Pixel and stores an intensity value that represents the captured value of the real world. In
general terms there are 3 types of Image intensity representations.
• Black and white are represented in plane R and its pixel values are logical between (0,1).
• Grayscale is represented in plane R and its pixel values are in the range between (0, 2^bit depth).
• Color is represented in 3 planes R, depending on the color model used each plane has, with values between
(0, 2^bit depth).

Format Description

BMP Is RAW format without compression popularized by the windows OS, main
advantage of this is the independency of the display device.

PNG Is a raster graphics file format that supports lossless data compression?

JPG A commonly used method for lossy compression for digital images, produced by
digital photography. The degree of compression can be adjusted, allowing a
selectable tradeoff between storage size and image quality.

JPEG
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TIFF Lossless compression format.

DICOM Medical compression format.

• Matrix: A 2D array.
• Re-scale: change the dimensions.
• Raster: a set of horizontal lines composed of individual pixels, used to form an image on a CRT or other
screen.
• Gray level: number of gray tones given by the bit depth - boundary window. - BithDepth: depth in bits of a
given image.
• Resolution: size of the image in rows and columns.
• Image: Matrix of gray levels, is a perception and a capture of light in the Hilbertian space.
• Pixel: The minimum unit of a digital image and represents a single gray level value in the image.
• Histogram: The frequency of repetitions of gray levels in a given image.

Pre-saberes Requeridos.

Actividad de trabajo independiente

Leer un artículo especializado y desarrollar los siguientes ítems.

1. Search the following article in the specialized databases and complete the information about it.
Title Image enhancement using modified histogram and log-exp
transformation
Journal or conference
Publisher
Keywords
Year
Authors
Database
Citation (APA)

2. Construct a brief conceptual map of the article

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
3. Write in your own words, what is the main contribution of the article?
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
4. Write in your own words the aspects that could be improved by the author of the article.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Materiales, equipos e insumos a utilizar
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Materiales, equipos e insumos Materiales del Estudiante

proporcionados por la Universidad
Computador con: Apuntes Clase
C/C++, Matlab >2017, Python 3.9

Precauciones, nivel de riesgo y recomendaciones a considerar

CLASIFICACIÓN DEL RIESGO Muy alto Alto Medio Bajo

FACTORES DE RIESGO COMO MINIMIZAR LOS FACTORES DE RIESGO

• Durante la permanencia en el Laboratorio, el practicante

debe certificar que se cumple y se sigue con el Reglamento
Técnico de Instalaciones Eléctricas (RETIE), Resolución 18
0398 de 7 de abril de 2004 y Resolución 18 1419 de 1 de
noviembre de 2005 del Ministerio de Minas y Energía.
(artículo 5. Riesgos eléctricos) RETIE
• Durante la permanencia en el Laboratorio, el practicante
debe retirar de sus manos y brazos: anillos, cadenas u
otros adornos metálicos que puedan crear riesgos de
choques eléctricos.
• Revisar que el área de trabajo este despejada sin
elementos ajenos a la práctica, ni conductores sueltos o
expuestos, disponer la instrumentación y materiales de
forma organizada.
• En caso de tener cabello largo, sujetarlo para evitar
contacto con los componentes o la instrumentación, de
igual forma evitar prendas con elementos sueltos o que
puedan interferir.
• Cuando suministre energía eléctrica al circuito en prueba o
evaluación, no entre en contacto con partes metálicas que
estén energizadas.
• No utilice cables o alambres desnudos.
• Antes de suministrar energía eléctrica (conexión de la
batería, pila o fuente de poder) a los circuitos de la práctica,
se debe revisar cuidadosamente las conexiones
propuestas en el diagrama del circuito de prueba, para
evitar cortos circuitos.
• No ingresar líquidos o alimentos al área de laboratorio, que
puedan causar riesgos de cortos o afectar los resultados
de la práctica.

RECOMENDACIONES, CONSIDERACIONES PARA EL USO DE MATERIAL Y EPP

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Consideraciones para el uso de los equipos usados en la práctica:

• Para utilizar un Multímetro verifique previamente la función que va a evaluar, así como la escala de medida o rango,
la polaridad para no causar accidentes que puedan destruir el instrumento o causarle traumatismos físicos y
económicos al practicante.
• Utilice las herramientas propuestas en la práctica. No se permite utilizar corta uñas, limas para las uñas u otros
objetos no apropiados para la práctica de buena ingeniería.
• Cumplir con el REGLAMENTO DE UTILIZACIÓN DE LOS LABORATORIOS DE ELECTRÓNICA DE LA UMB.
• La fuente de poder LM 4501, está dotada de un indicador de sobre carga (PV Max.), el cual se encenderá cuando
los terminales de potencia (+5 VDC, +15VDC y -15 VDC) presenten un corto circuito.
• Los elementos metálicos ajenos a la práctica (atornilladores, tornillos, monedas, etc.) deben permanecer lejos de
las ranuras X2, X3, X4.
• Los terminales de conexión A, B, C, Y D no deben ser conectados a ningún equipo, deben permanecer libres.
• Este equipo puede ser sensible a electricidad estática, por lo tanto debe conectarse la manilla anti electrostática en
punto metálico localizado en la parte inferior izquierda.
• Revise que los equipos en préstamo funcionen correctamente en el momento de solicitarlos en el almacén, de lo
contrario perderá tiempo en la realización de la práctica o en caso más grave, hacer la reposición de un equipo que
usted no averió.
• Mantenga el orden ubicándose exclusivamente en el banco de trabajo asignado por los laboratoristas. No cambie
el banco de trabajo sin la autorización de estos.
• Revise que los elementos de conexión (sondas, conectores, caimanes, etc.) funcionen correctamente antes de
usarlos en mediciones de los circuitos, de manera que detecte y corrija las fallas antes de iniciar la práctica.
• Por su seguridad y la de sus compañeros, esté atento a los equipos tomados en préstamo, así como sus propios
materiales y objetos personales.
• Consulte con el docente cualquier duda que tenga respecto al uso correcto de los equipos. Recuerde que son
instrumentos sofisticados que deben ser manipulados adecuadamente para evitar daños y fallas de
funcionamiento.
• Concéntrese en el trabajo que esté realizando en la práctica de laboratorio. Las distracciones pueden poner en
riesgo su integridad física y la de sus compañeros.
• Para el resto de la instrumentación consultar los manuales de operación de los equipos.

CONSIDERACIONES ÉTICAS

Procedimiento de la práctica

En el siguiente diagrama de flujo se presenta el procedimiento general de la práctica.

Desarrollo de las Elaboración

Lectura de la guía y
actividades Registro de Presentación y del informe
INICIO desarrollo de la FIN
propuestas en el resultados sustentación de
consulta previa
procedimiento laborarotio
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Rubrica de evaluación
Max
Criterio Calificaciones %
Pts.
0.75 0.675 0.675 0.6 0.6 0.45 0.45 0.3 0.3 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
Los estudiosos
Los estudiosos
Los estudiosos demuestran que Los estudiosos
demuestran que
demuestran que conocen la guía del demuestran que Los estudiosos
conocen la guía del
conocen la guía del laboratorio y conocen la guía del desconocen la guía
laboratorio y conocen 0.75 15%
laboratorio y conocen el desconocen el laboratorio y conocen del laboratorio, y
el procedimiento a
procedimiento a seguir. procedimiento a el procedimiento a desconocen el
(Entrega de avances)

seguir. Traen el
Traen el material que seguir. Traen el seguir. Traen el procedimiento a
material que deben
deben emplear y material que deben material que deben seguir. No traen el
emplear y entregan el
Práctica

entregan el avance de la emplear y entregan el emplear pero no material.

avance de la práctica
práctica organizado. avance de la práctica presentan el avance.
desorganizado.
organizado.
0.5 0.45 0.45 0.4 0.4 0.3 0.3 0.2 0.2 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
Registran algunas Registran las
Registran medidas y Registran medidas y Registran medidas y
medidas inexactas medidas imprecisas
resultados con unidades resultados con resultados con
con unidades e inexactas sin 0.5 10%
correctas, realizan su unidades correctas, unidades incorrectas,
incorrectas y unidades, no
representación gráfica realizan su realizan su
presentan la presentan
sin errores y realizan un representación gráfica representación gráfica
representación representación
análisis razonable y sin errores y realizan sin errores y realizan
gráfica con errores y gráfica y carecen
excelente. un análisis adecuado. un análisis confuso.
un análisis confuso. de análisis.
1.25 1.125 1.125 1 0.15 0.1125 0.1125 0.075 0.075 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
Los estudiosos
Los estudiosos Los estudiosos
Los estudiosos entregan entregan su informe Los estudiosos
entregan su informe a entregan su informe a
su informe a tiempo, con a tiempo, con buena entregan su
tiempo, con buena tiempo, con buena
buena presentación, presentación, con informe fuera de
presentación, presentación,
resultados completos, resultados tiempo. Por lo
resultados completos, resultados completos, 1.25 25%
en el formato incompletos, en el tanto, el 25% de la
en el formato en el formato
establecido, resuelven el formato establecido, calificación de la
establecido, resuelven establecido, aunque
(Documento final del laboratorio)

cuestionario y los no resuelven el práctica es 0.0 y los

el cuestionario y los no resuelven el
problemas propuestos. cuestionario, ni los ítems de las
problemas propuestos, cuestionario, ni los
Tienen conclusiones problemas competencias
aunque las problemas propuestos
evidenciando un aporte propuestos y las comunicativas no
conclusiones no son y las conclusiones no
significativo. conclusiones no son serán evaluados.
coherentes. son coherentes.
Informe

coherentes.
0.75 0.675 0.675 0.6 0.6 0.45 0.45 0.3 0.3 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
El informe del
El informe del El informe del
laboratorio está bien
laboratorio está bien laboratorio está bien El informe del
redactado y falta una El informe del
redactado, redactado, laboratorio está bien
estructura laboratorio no es
coherentemente y con coherentemente y con redactado y falta una
organizada. Tiene coherente. Tiene
una estructura una estructura estructura organizada. 0.75 15%
algunos errores de algunos errores de
organizada. No tiene organizada. Tiene No tiene errores de
ortografía. ortografía. No hace
errores de ortografía. algunos errores de ortografía. Además,
Ocasionalmente uso de un lenguaje
Además, Hace un uso ortografía. Además, hace uso de un
hace uso de un técnico apropiado
sobresaliente del hace un buen uso del lenguaje técnico
lenguaje técnico para la práctica de
lenguaje técnico lenguaje técnico apropiado para la
apropiado para la laboratorio.
apropiado para la apropiado para la práctica de laboratorio.
práctica de
práctica de laboratorio. práctica de laboratorio.
laboratorio.
1 0.9 0.9 0.8 0.8 0.6 0.6 0.4 0.4 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
(Defensa de la práctica ante el

Los estudiosos
Los estudiosos realizan la
Los estudiosos
realizan la sustentación con Los estudiosos
Sustentación

Los estudiosos realizan realizan la

sustentación con mucha dificultad. realizan la
docente)

la sustentación sin sustentación sin

alguna dificultad. Aunque demuestran sustentación con
dificultad. Demuestran dificultad. Demuestran 1 20%
Aunque demuestran algunos mucha dificultad.
los conocimientos los conocimientos
algunos conocimientos conocimientos No demuestran
adquiridos mostrando adquiridos, aunque
adquiridos, no adquiridos, no conocimientos
apropiación del tema y con dificultad muestran
muestran apropiación demuestran adquiridos, y el
el programa cumple con apropiación del tema y
del tema y el programa apropiación del tema, programa no
todo lo solicitado. el programa cumple
cumple casi en su y el programa realiza lo solicitado.
con lo solicitado.
totalidad lo solicitado. cumple parcialmente
con lo solicitado.
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0.25 0.225 0.225 0.2 0.2 0.15 0.15 0.1 0.1 0

Excelente Muy bien Bien Regular Mal
(Trabajo durante la práctica)

Los estudiosos
Los estudiosos Los estudiosos muestran bastante
Los estudiosos Los estudiosos
Comportamiento

muestran perfecto muestran perfecto desorden durante

muestran perfecto orden muestran desorden y
orden durante la orden durante la la práctica, se les
durante la práctica, descuido en el
práctica, respeto hacia práctica, respeto hacia llama la atención
respeto hacia sus desarrollo de la 0.25 5%
sus compañeros y su sus compañeros y su por el
compañeros y su práctica. Presentan
docente, sin embargo, docente, sin embargo, comportamiento
docente, cuidado en el falta de respeto entre
tienen descuido en el tienen descuido en el con sus
uso de los equipos del ellos y, en ocasiones,
uso de los equipos del uso de los equipos del compañeros, sin
laboratorio. Acatan las no atienden las
laboratorio. Acatan las laboratorio y no acatan embargo, no
instrucciones del instrucciones del
instrucciones del las instrucciones del acatan las
docente. docente.
docente. docente. instrucciones del
docente.
0.5 0.45 0.45 0.4 0.4 0.3 0.3 0.2 0.2 0
Excelente Muy bien Bien Regular Mal
(Actividad de trabajo

Comprende Comprende
No comprende, ni
independiente)

información relevante información relevante

Investigativa

Comprende e interpreta interpreta

en un texto de en un texto de
información relevante en información relevante Presenta los
divulgación científica divulgación científica 0.5 10%
un texto de divulgación en un texto de numerales de la
aunque no la aunque no la
científica. Además, divulgación científica. actividad de
interpreta. Sin interpreta. Además,
presenta los numerales Además, presenta manera incompleta
embargo, presenta los presenta los
de la actividad de los numerales de la y equivocada.
numerales de la numerales de la
manera completa. actividad de manera
actividad de manera actividad de manera
incompleta.
completa. incompleta.
Total 5 100%