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Capítulo 1.

Fundamentos de la
Bioquímica La bioquímica describe en términos
moleculares las estructuras, mecanismos y
Los organismos vivos se distinguen de otras
agrupaciones de materia debido a procesos químicos compartidos por todos
características distintivas como: los organismos y define los principios de
organización que subyacen en todas las
• Un elevado grado de complejidad formas de vida.
química y de organización
microscópica. Estos están formados
por miles de moléculas diferentes,
como polímeros muy largos, que a su 1.1 Fundamentos Celulares
vez cuentan con subunidades que a
Los organismos más pequeños son
su vez cuentan con la capacidad de
interactuar de forma pacífica y unicelulares y microscópicos. Los
selectiva con otras moléculas organismos mayores, multicelulares,
celulares. contienen muchos tipos de células
variables en tamaño, forma y funciones
• La existencia de sistemas para la especializadas.
extracción, transformación y uso
de energía del entorno. Esto permite
a los organismos construir y mantener
complejas estructuras y llevar a cabo
trabajos mecánico, químico, osmótico
y eléctrico en busca de quedar en
equilibrio con su entorno.

• La existencia de funciones La membrana plasmática. Define la


definidas para cada uno de los periferia de la célula y separa su
componentes de un organismo. La
contenido del medio externo. Se compone
relación entre los componentes
de moléculas de lípidos y de proteínas
químicos de un organismo vivo es
dinámica; los cambios en uno de los que forman una fina barrera hidrofóbica,
componentes producen cambios flexible y resistente alrededor de la célula.
compensatorios en otro.
La membrana actúa como una barrera a
la libre circulación de iones inorgánicos y
• Mecanismos para detectar y
responder a las alteraciones en su de la mayor parte de compuestos
entorno. Esto se debe a procesos cargados o polares.
químicos internos o de la localización
Citoplasma. Está compuesto por una
en el ambiente que los rodea.
disolución acuosa (citosol).
Citosol. Forma parte del citoplasma, en él
• La capacidad de autorreplicarse y hay múltiples partículas en suspensión
autoensamblarse de manera
con funciones específicas
precisa.
Ribosomas y Proteasomas. Es en
donde tiene lugar la síntesis y
• La capacidad de cambiar lo largo degradación de proteínas.
del tiempo mediante evolución
gradual.

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Metabolitos. Son intermediarios de las algunos nutrientes orgánicos de otros
rutas biosintéticas y degradativas. organismos.
Coenzimas. Compuestos esenciales en Bacterias y Arqueas comparten muchas
muchas reacciones catalizadas características.
enzimáticamente y también de iones
inorgánicos. • Ribosomas
• Plásmidos: segmentos circulares de
Núcleo o Nucleoide. Ellos contienen el
DNA de menor tamaño del nucleoide.
genoma que es el conjunto completo de
• Envoltura celular
genes.
• Nucleoide
• Las bacterias y arqueas el • Pili: proporcionan puntos de
nucleoide no está separado del adhesión a la superficie de otras
citoplasma por una membrana células
• En las eucariotas el núcleo está • Flagelos: propulsan la célula a través
rodeado por una membrana doble de su medio
que es la envoltura nuclear.
Diferencias entre bacterias gran-positivas
(Células con envoltura nuclear
(color morado, mucho peptidoglucano) y
pertenecen al dominio eukarya, los
bacterias gran-negativas (color rosado, poco
organismos sin membrana nuclear
pertenecen dos grupos: Bacteria que se peptidoglucano)
encuentran en suelos, agua o en tejidos,
y arquea que se encuentran en medios
extremos: sal, temperatura o ácidos) Orgánulos de las células eucariotas:

Bacteria y Arquea son organismos Célula Animal.


unicelulares tanto aeróbicos (abundante
suministro de oxígeno) como anaeróbicos
(prácticamente sin oxígeno obtienen su
energía a través de otros compuestos (N,
S, CO2 etc.) estrictos y facultativos.
Los organismos se pueden clasificar
según su fuente de energía:

• Fotótrofos: obtiene su energía a


partir de la luz. Que a su vez se
dividen en fotoautótrofos fuente de
carbono a partir de CO2 y • Ribosomas: participan en la síntesis
fotoheterótrofos Fuente de de proteínas.
carbono a partir de compuestos
• Peroxisomas: participan en la
orgánicos
oxidación de ácidos grasos.
• Quimiótrofos obtienen su energía
• Citoesqueleto: da soporte a los
a partir de compuestos químicos.
Que a su vez se dividen en: orgánulos y permite el movimiento
quimioautótrofos fuente de de orgánulos o metabolitos a través
carbono a partir del CO2 o del citoplasma
quimioheterótrofos requieren

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• Lisosoma: propio de células animales • Tilacoides: donde tiene lugar la
se encarga de la degradación de los síntesis de ATP que aprovecha la
desechos celulares innecesarios energía de la luz.
• Vesículas de transporte: transporta • Pared celular: confiere forma y
lípidos y proteínas entre el RE, rigidez; protege a la célula del
aparato de Golgi y membrana hinchamiento osmótico.
plasmática • Vacuola: degrada y recicla
• Complejo de Golgi: modifica macromoléculas y almacena
empaqueta y distribuye proteínas a metabolitos.
otros orgánulos para su exportación • Plasmodesmos: orificios que
• Retículo endoplasmático liso (REL): permiten el paso entre dos células
lugar de síntesis de lípidos y vegetales.
metabolitos de fármacos. • Glioxisoma: contiene enzimas del
• Núcleo: contiene los genes glioxilato.
(cromatina: conjunto de ácidos
nucleicos y proteínas).
• Nucléolo: lugar de la síntesis de RNA ¿Qué es una célula?
ribosómico.
Construcción de estructuras
• Retículo endoplasmático rugoso: en
supramoleculares.
este lugar se lleva a cabo la mayor
parte de síntesis de proteínas.
• Membrana plasmática: separa la
célula de su entorno, regula el 1.2 Fundamentos químicos.
movimiento hacia dentro y fuera de la
célula.
• Mitocondria: oxida combustible para
producir ATP.

Célula vegetal.

• Cloroplasto: recolecta energía solar,


produce ATP y glúcidos.
• Gránulos de almidón: almacén
temporal de glúcidos producto de la
fotosíntesis.

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Proteínas: son largos polímeros de
aminoácidos que constituyen junto con el
agua, la fracción celular más importante
(macromolécula informativa) .
Proteoma: es el conjunto de todas las
proteínas que funcionan en una celula y la
proteómica es la caracterización
sistemática de este complemento de
Versatilidad del carbono.
proteínas.
• El carbono puede formar
Los ácidos nucleicos (DNA Y RNA): son
covalentemente cadenas lineales,
polímeros de nucleótidos. Almacenan y
ramificadas y estructuras transmiten la información genética
circulares. (algunas moléculas de RNA desempeñan
• Puede crear uniones consigo papeles estructurales y catalíticos y a su
mismo y otros átomos vez es una macromolécula informativa).
• La mayoría de las biomoléculas
son derivadas de los Genoma: es la secuencia completa del
hidrocarburos. ADN celular y la Genómica es la
• Los grupos funcionales dan caracterización de la estructura
características químicas comparativa (función, evolución y
específicas. mapeado de los genomas).
Polisacáridos: polímeros de azúcares
sencillos tales como la glucosa los cuales
tienen tres funciones principales:

• Almacén de combustibles
energéticos.
• Componentes estructurales
rígidos de las paredes celulares
(plantas y bacterias)
Un metabolito es el conjunto de • Elementos de reconocimiento
moléculas orgánicas pequeñas, y al extracelular que se unen a
conjunto de metabolitos se le denomina proteínas de otras células.
metaboloma.
(Oligosacáridos son los polímeros más
La metabolómica es la caracterización cortos de azúcares)
sistemática del metaboloma.
Glicoma: es el conjunto de moléculas que
Macromoléculas: son polímeros de contienen glúcidos.
masa molecular superior a 5000,
Lípidos: son derivados insolubles de
construidos partir de precursores
hidrocarburos, con las siguientes
relativamente simples
funciones:
Oligómeros: Son los polímeros más
• Acatúan como componentes
cortos (monómeros) los cuales
estructurales de las membranas
constituyen a las macromoléculas

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• Reserva de combustible rico en
energía, pigmentos y señales
intracelulares.
Lipidoma: moléculas con lípidos
Transcriptoma: conjunto de ARN
mensajero.
Estructura tridimensional: Se describe en
términos de configuración.
Los enlaces covalentes y los grupos son
importantes. Para la configuración absoluta (D/L) hay
que ver donde se encuentra el alcohol (OH) o
También es importante su estereoquímica El NH3, sí están a la derecha Son “D” y sí
que es la distribución de los átomos de están a la izquierda son “L”.
una biomolécula en el espacio Pero en la naturaleza los aminoácidos
Estereoisómeros: moléculas con presentan configuración “L”.
mismos enlaces químicos y misma La glucosa y todos los sacaridos en la
fórmula química, pero diferente naturaleza presentan una configuración “D”.
configuración de sus átomos en el
(En el laboratorio les pela la berta y pueden
espacio.
hacer “D” y “L” de ambos)
Existe la configuración de isómeros
Para saber la configuración R/S hay que
geométricos (cis-trans)
recordar las prioridades y así se numeran y se
puede hacer las rotaciones, sí va a favor de
las manecillas del reloj es R, si va en contra es
L)

-OCH3> -OH> NH2 > -COOH > -CHO >


CH2OH> -CH3 > -H

(Si hay un “-H” en la horizontal se le da “vuelta”


Si es R se convierte en L y sí es L se convierte
en R)

1.3 Fundamentos Físicos.


Las reacciones sintéticas requieren
energía
Los organismos vivos existen en un
estado estacionario dinámico aya no se
encuentran nunca en equilibrio con su
entorno

• Continuamente se sintetizan y se
degradan pequeñas moléculas,
macromoléculas y complejos

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supramoleculares mediante
reacciones químicas.
• Se necesita del constante flujo de
masa y energía a través del
sistema.
• La constancia en la concentración
es el resultado de un estado
estacionario dinámico (está en
constante cambio), un estado
estacionario que se encuentra
lejos del equilibrio.
Los organismos transforman energía y El ATP es el menos estable, funciona como
materia de su entorno. una moneda energética

• Sistema: conjunto de reactivos y El adenosine monophosphate AMP es cuando


productos presentes (todo aquello se liberan dos moléculas de fosforo del ATP
que está incluido en una región
El metabolismo está regulado para
definida del espacio)
conseguir equilibrio y economía
• Entorno: El disolvente que los
contiene en la atmósfera Rutas o vías: así se le domina a los
circundantes. millones de reacciones químicas
• Universo: es el conjunto del catalizadas en el interior de las células, se
sistema y su entorno. encuentran organizadas en muchas
secuencias de reacciones consecutivas
Existen diversos tipos de sistemas:
En las rutas el producto de una reacción
• Sistema abierto: es cuando pasa a ser el reactivo de la siguiente.
existe un intercambio de materia y
energía en un sistema (acá se Catabolismo: es el conjunto de
encuentran los seres vivos) reacciones degradativas productoras de
• Sistema cerrado: es cuando energía.
existe intercambio de energía, Anabolismo: son rutas sintéticas que
pero no materia. requieren, invariablemente, un aporte de
• Sistema aislado: cuando el energía puesto que parten de pequeñas
sistema no intercambia materia ni moléculas precursoras y las convierten en
energía con su entorno. moléculas progresivamente mayores y
complejas.
Nosotros los seres vivos respondemos a
la primera ley de la termodinámica que Metabolismo: Lo constituyen la compleja
describe el principio de la conservación de red de rutas catalizadas por enzimas tanto
la energía. catabólicas como anabólicas.

Enzimas: catálisis biológicas.


Las enzimas proveen un entorno mas
confortable para el estado de transición

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1.4 Fundamentos Genéticos No hay muchas cosas interesantes en el
punto 1.5 pero denle una leída xd me dio
Las células y os organismos vivos tienen pereza leer a conciencia para el resumen
la capacidad para reproducirse con :v
fidelidad casi perfecta a lo largo de
incontables generaciones
El ADN (ácido desoxirribonucleico) cada
nucleótido puede asociarse
específicamente con otro nucleótido de la
cadena complementaria
La secuencia de subunidades
monoméricas codifica las instrucciones
para formar todos los demás
componentes celulares
Actúa como molde para la producción de
moléculas idénticas de ADN (para
replicación e incluso su separación)
EL ADN transporta información
hereditaria acumulada a lo largo de miles
de millones de años de evolución
Cada tres nucleótidos se forma un
amioacido
ADN → ARN → Proteína
Una secuencia de desoxirribonucleótidos
(ADN) codifica por medio del ARN
mensajero (intermediario), la producción
de una proteína correspondiente con la
secuencia lineal
El plegamiento de la proteína origina una
estructura en 3D y da una configuración
nativa (quiere decir que es funcional)

1.5 Fundamentos evolutivos.


Todos los organismos modernos
descienden de un progenitor evolutivo
común a través de una serie de pequeños
cambios (mutaciones), que conferirán, en
cada caso.
Mutaciones: alteraciones en la secuencia
de nucleótidos.

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