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Estructura y Función de Aminoácidos y Proteínas
Estructura y Función de Aminoácidos y Proteínas
3.1. AMINOÁCIDOS COMO ción diferentes, pero resulta aún más sor-
CONSTITUYENTES DE LAS prendente que todas ellas estén integradas
PROTEÍNAS por sólo 20 aminoácidos comunes. Los ami-
noácidos comunes son aquéllos para los que
Las células vivas producen gran variedad de existe un codón específico en el código ge-
macromoléculas como son las proteínas, nético del DNA (ver el capítulo Ácidos nu-
ácidos nucleicos y polisacáridos, entre cleicos). Los aminoácidos derivados son
otros. Estas macromoléculas son biopolíme- generados después de su incorporación a la
ros constituidos por unidades monoméricas molécula proteínica.
o estructurales. Para los ácidos nucleicos, Además de ser las unidades estructurales
las unidades estructurales son los nucleóti- de las proteínas, los aminoácidos tienen
dos; para los polisacáridos son los monosa- otras funciones importantes como la trans-
cáridos. misión de impulsos en el sistema nervioso,
En virtud de que las proteínas desempeñan como material energético, y otros.
una amplia variedad de funciones esenciales
en los organismos, las cuales describiremos
más adelante, es evidente que para conocer 3.1.1. Estructura general
tanto el funcionamiento normal como pa-
tológico de un organismo se requiere un Desde el descubrimiento del primer aminoá-
conocimiento claro de la estructura y pro- cido, asparagina, en 1806, habrían de pasar
piedades de las proteínas. más de 130 años para que le llegara el turno
Aunque muchas proteínas contienen otras a la treonina, con la que se cerró la lista de
sustancias, además de los aminoácidos, la los 20 aminoácidos.
estructura y muchas de sus propiedades bio- Un aminoácido es un compuesto que con-
lógicas están determinadas por las clases de tiene dos grupos funcionales: un grupo amino
aminoácidos presentes y el orden en el que y uno carboxüo. Ambos grupos están unidos
están dispuestos en la cadena polipeptídica. al mismo átomo de carbono, designado car-
Es asombroso que en una célula existan bono a. Al carbono a de cada aminoácido
millares de proteínas con estructura y fun- también está unido un átomo de hidrógeno y
Tabla 3.2.
Clasificación de los L-a-aminoácidos presentes
del espárrago, alanina de alantoides) o de al- en las proteínas con base a las polaridades relati-
guna propiedad característica (glicina por su vas de sus grupos R. Un grupo no polar es aquel
sabor dulce). De la denominación trivial ha que tiene poca o ninguna diferencia de car-
surgido una abreviatura de tres letras que, da- ga de una región a otra, en tanto que un grupo
das las técnicas modernas de secuenciación, polar tiene una diferencia de carga relativamen-
han obligado la anotación de los aminoáci- te grande en diferentes regiones.
dos por una sola letra mayúscula (tabla 3.1.).
Los aminoácidos presentes en las proteí-
nas pueden clasificarse en dos grandes gru-
pos dependiendo de la polaridad relativa de
sus grupos R (tabla 3.2).
3.2.2. Formación
El enlace peptídico posee una serie de inte-
resantes características estructurales. Dada
33. PÉPTIDOS
3.3.1. Definición
Cuando los grupos amino y carboxilo de los
aminoácidos se combinan para formar un
polipéptido. Los aminoácidos constituyen-
tes se denominan residuos de aminoácidos.
Un péptido consta de dos o más residuos de
aminoácidos unidos por enlaces peptídicos.
En la figura 3.10 se muestra un tripéptido en
3.2.5. Rotación del enlace el que hay que hacer notar que es aquel for-
mado con tres residuos, no con tres enlaces
Así como en el enlace peptídico no puede peptídicos.
haber rotación, sí puede haberla en torno a
los enlaces C-N y C-C determinando ángu-
los de conformación (y y <fr) que, en las 3.3.2. Clasificación
proteínas naturales, presentan poca variabi-
lidad en sus valores. Esto trae como conse- Por convención, las estructuras peptídicas se
cuencia que, en un péptido, los enlaces describen a partir del residuo amino termi-
peptídicos presentan una alternancia que de- nal (grupo-NH2 libre), que se coloca a la iz-
termina una secuencia en zig-zag (fig. 3.10). quierda, y termina con el residuo carboxilo
terminal (grupo -COOH libre) que se coloca 3.3.4. Péptidos de importancia biológica
a la derecha. La repetición de este proceso
secuencial genera un polipéptido con una En todos los seres vivos se han aislado pép-
secuencia de aminoácidos específica ( R r tidos de interés biológico. Uno de los más
R2-R3-R4... Rp). sencillos es el tripéptido glutatión (y-gluta-
Aunque existen discrepancias en la litera- mil-cisteinil-glicina), en el cual el glutamo
tura, el término oligopéptido se reserva para inicial está unido a la cisteína por medio del
moléculas con 2 a 20 residuos, polipéptido carboxilo gama (y) en lugar del alfa ( a ), co-
de 20 a 50 residuos y proteína a las que su- mo ocurre con la gran mayoría de los péptidos.
peran esta cifra. Este tripéptido lleva a cabo funciones oxido-
rreductoras por su grupo sulfhídrilo (-SH),
se requiere para la actividad de varias enzimas
3.3.3. Representación de estructuras y participa en el transporte de aminoácidos.
Un grupo importante es el de los péptidos
Las estructuras polipeptídicas pueden repre- cerebrales con actividad de neurotransmiso-
sentarse colocando el aminoácido inicial (el res, como la sustancia P (decapéptido) o los
del extremo amino terminal) y a partir de és- analgésicos opiáceos como las endorfinas y
te colocar en zig-zag los residuos en el orden encefalinas. Tir-Gli-Gli-Fen-Met Encefali-
secuencial correspondiente (fig. 3.11). na (Metionina) Arg-Pro-Lis-Pro-Gln-Fen-
Como los polipétidos pueden contener un Fen-Gli-Leu-Met Sustancia P.
número de residuos muy elevado, es poco La oxitocina y vasopresina son polipéti-
práctico usar las fórmulas estructurales con- dos cíclicos. Los antibióticos polipeptídicos
vencionales. En cambio, puede utilizarse la a menudo contienen D y L-aminoácidos y
abreviatura de tres letras (o incluso de una otros no presentes en proteínas, por ejemplo,
sola) para designar el péptido. En nuestro la tirocidina y gramicidina S, que contienen
ejemplo (fig. 3.11) se podría escribir: Ala - D-fenilalanina y ornitina. Estos polipétidos
Ser - Gli - Tre, o bien, A-S-G-T-. no son sintetizados en los ribosomas.
Otros polipéptidos importantes son las el caso de los receptores hormonales situa-
hormonas colecistocinina y gastrina, la insu- dos en la membrana celular o en el citosol.
lina y glucagón, la hormona liberadora de ti- Dentro de las proteínas estructurales se
rotropina y otras. encuentran el colágeno, la elastina y la que-
ratina.
Así pues, las proteínas son quizá las macro-
3.4. PROTEÍNAS moléculas más versátiles, que se responsabili-
zan en gran parte de las funciones metabólicas
3.4.1. Definición y de la morfología de los seres vivos. No en
vano el término proteína deriva del griego
Las proteínas constituyen sin duda uno de proteos que significa "primero", "primoridaT.
los grupos de moléculas de gran trascenden-
cia en los seres vivos. Todas las proteínas
son polipéptidos de peso molecular elevado. 3.4.3. Clasificación
Arbitrariamente, como se ha señalado antes,
se ha establecido como línea divisoria entre En la actualidad no existe un sistema de cla-
polipétidos y proteínas un peso molecular de sificación de las proteínas universalmente
8,000 y 10,000. Una proteína simple es aqué- aceptado. Durante mucho tiempo se dividie-
lla que contiene sólo aminoácidos; una proteí- ron en simples y conjugadas. Sin embargo,
na compleja contiene, además, otras moléculas en todas las proteínas, aun las más simples,
diferentes como el hemo (de la hemoglobi- casi siempre están asociadas otras moléculas
na), vitaminas, lípidos, carbohidratos o ele- llamadas grupo prostético. En esto se basa
mentos minerales (metaloenzimas). la clasificación propuesta en la tabla 3.3.
Las proteínas desempeñan una amplia varie- Un sistema de clasificación basado en la so-
dad de funciones que pueden agruparse en lubilidad todavía está en uso, en particular
dos clases: dinámicas y estructurales. De las en bioquímica clínica (tabla 3.4.).
funciones dinámicas, la más importante es la Sin embargo en esta clasificación, no se
función catalítica. De hecho, la mayor parte puede hacer una distinción entre albúminas
de las reacciones químicas celulares son y globulinas únicamente en base a sus solu-
catalizadas por enzimas, casi todas ellas de bilidades en agua o en soluciones salinas.
naturaleza proteica. En realidad, estas molé- Así, se subdividieron en seudoglobulinas
culas son tan importantes que merecen un (solubles al agua) y euglobulinas (insolubles
capítulo especial dentro de la bioquímica. en agua exenta de sales).
Otra función dinámica de las proteínas es
el transporte, ejemplos de este grupo son la
hemoglobina y mioglobina. Otras proteínas 3.4.3.2. Basada en la forma
actúan como hormonas. Las proteínas tam-
bién pueden funcionar con un papel protector Otra clasificación se basa en la forma (rela-
como las inmunoglobulinas y el interferón. ción entre longitud y amplitud) y en ésta se
Algunas participan en los mecanismos con- consideran Xas proteínas globulares, de for-
tráctiles como la miosina y actina. Otras tie- ma esférica, solubles en agua, dentro de las
nen una función de reconocimiento, como es cuales se encuentran la insulina, albúmina y
Albúminas Solubles en agua y en soluciones salinas. Sin aminoácidos distintivos
Globulinas Escasamente solubles en agua pero solubles en soluciones salinas.
Sin aminoácidos distintivos
Protaminas Solubles en etanol a 70-80% pero insolubles en agua y en alcohol etilíco
absoluto. Ricas en arginina
Histonas Solubles en soluciones salinas
Escleroproteínas Insolubles en agua o en soluciones salinas. Ricas en glicina, alanina y prolina
En la conformación de a-hélice las cadenas porque no puede ocurrir rotación del enlace
laterales R se proyectan en forma perpendi- N-C. La presencia de prolina entre dos cade-
cular al eje de la hélice y hacia el exterior de nas en a-hélice produce una acodadura de
la estructura en espiral generada por la cade- la dirección general de la molécula, lo cual
na peptídica. Si estos grupos R están próxi- es de gran importancia en la configuración
mos y tienen carga del mismo signo o están general de una proteína. Otro aminoácido
ramificados (valina, isoleucina), sus interac- que tiende a desestabilizar la a-hélice es la
ciones desestabilizan la estructura helicoi- glicina, por tener un grupo R muy pequeño.
dal. Otro factor que rompe la conformación Pauling y Corey también propusieron otra
a-helicoidal es la presencia de prolina, ya estructura secundaria que es la estructura P
que el anillo pirrolidina de su cadena lateral (P porque fue una segunda estructura, sien-
interacciona estéricamente con la cadena la- do la a-hélice la primera). La conformación p
teral del aminoácido precedente y, además, está formada por dos o más cadenas polipep-
tídicas que pueden ser paralelas (en el mismo tática de tipo salino entre un grupo carboxi-
sentido) o antiparalelas (en direcciones opues- lato (-COO - ) y un grupo amino (-NH3+) de
tas) y se estabilizan también por puentes de residuos glutamato o aspartato con Usina o
hidrógeno (fig. 3.13). En tanto que la hélice arginina; b) puentes de hidrógeno, entre gru-
es una cadena polipeptídica enrollada, la tira pos carboxilato, oxhidrilo (-OH) o los pro-
plegada p está extendida y se dispone a la pios grupos carbonilo (-C=0) de las
manera de un acordeón con los grupos R pro- uniones peptídicas; c) interacción de cade-
yectados por encima y por debajo de los planos nas polares, como los grupos aromáticos de
generados por las cadenas polipeptídicas. La la fenilalanina o los no aromáticos de alani-
estabilidad es mayor en la conformación an- na e isoleucina, etc; d) fuerzas de Van der
tiparalela, la más frecuente en las proteínas Waals, cuando los residuos son idénticos
naturales, incluso más que la a-hélice. como dos metilos de la alanina, hidroximeti-
En general, estas estructuras laminares se los de la serina, etc; e) puentes disulfuro,
dan en las proteínas fibrosas como la quera- que se establecen entre los grupos sulfhidri-
tina del pelo y la piel, la fibroma de la seda; lo (-SH) de la cisteína para dar el enlace co-
la sustancia amiloide que se deposita en valente disulfuro (-S-S-) entre cadenas
condiciones patológicas, es un depósito de vecinas (fig. 3.15).
proteína en forma de tira plegada. El resultado de las distintas uniones des-
Es común que en numerosas proteínas critas es una estructura terciaria de gran es-
ocurran simultáneamente ambas estructuras, tabilidad. El estudio de la estructura terciaria
la a-hélice y la hoja plegada p, como se ha sido posible gracias a la cristalografía de
ilustra en la fig. 3.14. rayos X desarrollada por la escuela de Bragg
Finalmente, dentro de la estructura secun- en Cambridge y a la labor pionera de Ken-
daria, pueden existir algunas regiones de las drew sobre la mioglobina y de Perutz sobre
proteínas que no son a-hélice ni tira plega- la hemoglobina.
da, sino que son conformaciones enrolladas Las estructuras terciarias de las proteínas
al azar. En términos de su función biológi- permiten agruparlas en familias y subfami-
ca, las regiones de enrollamiento aleatorio lias; por ejemplo, proteínas fibrosas de for-
son de igual importancia que las de a-hélice ma alargada y proteínas globulares de forma
o tira plegada. esferoidal.
Figura 3.15. Tipo de uniones que estabilizan el plegamiento de las proteínas. 1. interacción electrostática; 2
puentes de hidrógeno, entre treonina y serina; 3 interacción dipolo-dipolo entre dos serinas; 4 unión de disul-
furo, convalente, entre dos cisternas, y 5. interacción hidrofóbica entre leucina e isoleucina.
Figura 3.16. Estructura cuaternaria de ias proteínas. Esquema de la disposición de cuatro subunidades de una
molécula de hemoglobina, formada por dos cadenas a en la parte inferior de la figura y dos cadenas p en la
parte superior.
Los enlaces que mantienen la estructura formaciones nativas de la mayor parte de las
cuaternaria son del mismo tipo que los que proteínas están estabilizadas sólo por enla-
mantienen la estructura terciaria, excepto ces no covalentes, el plegamiento puede ser
enlaces covalentes. Por ejemplo, la ot-qui- alterado por condiciones como alta tempera-
motripsina contiene tres cadenas polipeptí- tura, pH extremo o presencia de solventes
dicas unidas por enlaces disulfuro y no se orgánicos que debilitan las interacciones no
considera estructura cuaternaria. La mioglo- covalentes.
bina está compuesta por una sola cadena
polipeptídica y no posee estructura cuater-
naria. Sin embargo, la hemoglobina contie- 3.5. L Desnaturalización
ne 4 subunidades unidas no covalentemente
y, por tanto, tiene estructura cuaternaria. La La alteración de una proteína que modifique
enzima aspartato transcarbamilasa tiene una su conformación nativa se denomina desna-
estructura cuaternaria formada por 12 subu- turalización; este cambio provoca la consi-
nidades. Otros ejemplos incluyen la sintetasa guiente alteración o desaparición de sus
de ácidos grasos, la piruvato deshidrogena- funciones. En una proteína se produce la
sa, a las cuales se les conoce como complejos desnaturalización al perder su estructura se-
multier>zimáticos o estructuras supramole- cundaria, terciaria y cuaternaria, conserván-
culares. dose la primaria (covalente). En el estado
La estructura cuaternaria está íntimamen- desnaturalizado los niveles de estructura-
te ligada a las propiedades reguladoras de ción superior de la conformación nativa se
las proteínas, particularmente en los siste- encuentran al azar, es decir la proteína alta-
mas llamados alostéricos. En estos siste- mente ordenada queda reducida a un poli-
mas, la respuesta puede estar afectada por la mero estadístico formado por una cadena de
presencia de efectores (inhibidores o activa- aminoácidos (fig. 3.17). La existencia de en-
dores) que modulan la acción primaria de la laces disulfuro en una proteína aumenta su
proteína (ver capítulo de Enzimas). resistencia a la desnaturalización.
Las estructuras secundaria y terciaria de
una proteína están determinadas por la es-
tructura primaria. Por lo tanto, no es necesario 3.5.1.1. Agentes desnaturalizantes
postular un control genético independiente
para los niveles de estructuración superiores Todos aquellos agentes capaces de romper o
al nivel primario, puesto que la estructura alterar los enlaces que mantienen las estruc-
primaria determina la secundaria, terciaria y turas de orden superior de una proteína pue-
(cuando está presente) la cuaternaria. den desnaturalizarla.
Un agente desnaturalizante muy común es
el calor, esto tiene aplicación cotidiana en el
3.5. RELACIÓN ENTRE laboratorio de bioquímica. Otros agentes fí-
ESTRUCTURA Y FUNCIÓN sicos (radiaciones, tensoactividad, altas
presiones) o químicos (ácidos, álcalis, urea,
La actividad biológica de una proteína de- detergentes) capaces de alterar las interac-
pende del ordenamiento tridimensional ciones débiles pueden llegar a desnaturalizar
apropiado de sus grupos funcionales. De es- las proteínas. En proteínas cuya estructura
te modo, las proteínas sólo funcionan cuan- tridimensional está determinada por enlaces
do están plegadas en su estructura original o disulfuro, pueden ser desnaturalizadas por
conformación nativa. Debido a que las con- agentes reductores como el mercaptoetanol
o el ditiotreitol. En ocasiones esta alteración membranal) reconocer a la molécula en
es reversible cuando se elimina el agente cuestión y asociarse con ella en forma espe-
agresivo. En otros casos la desnaturaliza- cífica. Para explicar el fenómeno de la espe-
ción es irreversible. cificidad, Emil Fisher propuso en 1894 una
Una consecuencia de la desnaturalización analogía similar a la que existe entre llave y
es la pérdida drástica de solubilidad. Otras cerradura.
alteraciones incluyen disminución de la vis- En las proteínas donde más se ha ejempli-
cosidad, velocidad de difusión y facilidad ficado el fenómeno de la especificidad de
con que cristalizan. reconocimiento molecular es entre las enzi-
Siendo la conformación de la molécula mas y su sustrato; de ellas nos ocuparemos
proteínica la base principal de su función, al más adelante. Otro ejemplo es el de la globi-
desnaturalizarse la proteína, se altera su acti- na que se une específicamente a su grupo
vidad fisiológica. Por ejemplo, las globuli- prostético, el grupo hemo, debido a que la
nas plasmáticas desnaturalizadas pierden proteína tiene un hueco molecular con la
sus funciones de anticuerpos. forma precisa para el hemo y dado que las
cadenas laterales de los aminoácidos en con-
tacto con el anillo son no polares.
3.5.2. Complementarte dad y capacidad Clásico ejemplo de reconocimiento es la
de reconocimiento unión de sustancias llamadas antígenos con
su anticuerpo específico. El anticuerpo es
Existen proteínas capaces de reconocer de- una molécula proteínica especial pertene-
terminado tipo de moléculas que serán objeto ciente al grupo de las inmunoglobulinas.
de su actividad. Ese sitio de reconocimiento Los receptores membranales de reconoci-
se debe a la presencia en la proteína de una miento de las hormonas, que representan el
estructura complementaria a la de la molé- primer sitio de acción hormonal, son tam-
cula (llámese sustrato, hormona, antígeno, bién proteínas de reconocimiento.
efector, grupo prostético), que permite a la Como regla general, un sitio fijador (de
proteína (sea enzima, anticuerpo, receptor reconocimiento) en una proteína se ajusta al
compuesto que se va a unir en forma, tama- paración y detección de productos de reac-
ño y polaridad. ción y la determinación e identificación de
compuestos. Desarrollada en 1944 por Mar-
tin en Inglaterra, consiste en colocar en tiras
3.5.3. Alosterismo de papel como soporte de una fase estacio-
naria acuosa mientras una fase móvil orgá-
En algunas enzimas y en la hemoglobina se nica se desplaza en la tira, gotas de la
encuentra, además del sitio activo (para el sustancia a separar cerca del punto donde
sustrato), otro sitio de reconocimiento para partirá el desplazamiento de la fase orgánica
moléculas llamadas efectores alostéricos; la (fig. 3.18).
ocupación de este otro sitio determina una La relación de la distancia recorrida por el
inhibición o una activación de la reacción, compuesto entre la distancia que recorre el
mecanismo conocido como alostérico. Un frente del solvente desde el sitio de aplica-
mecanismo alostérico es un proceso común ción se conoce como valor Rf (relación de
en moléculas proteicas en el que la asocia- frentes) del compuesto. Bajo condiciones
ción del sustrato está influenciada por la fi- estrictamente controladas el Rf es una cons-
jación de otras moléculas que no son tante importante para propósitos de identifi-
sustratos directos de la proteína. En un pro- cación.
ceso alostérico debe haber en la proteína El método descrito es cromatografía uni-
centros separados de fijación para el sustrato dimensional. La cromatografía bidimensio-
(por ejemplo, O2 en el caso de la hemoglobi- nal es una variante de considerable poder de
na) y el efector (inhibidor o activador) que separación, ya que se emplean dos diferen-
ejerce el control alostérico. tes solventes aplicados secuencialmente pa-
ra desplazar un solo compuesto (fig. 3.19).
La gota del compuesto (generalmente un
3.6. MÉTODOS DE SEPARACIÓN Y aminoácido o un péptido) se "revela" como
ANÁLISIS una mancha en el papel. El material usado
como revelador es usualmente la ninhidrina
3.6.1. Cromatografía mencionada antes.
La cromatografía en capa fina utiliza el
Las experiencias en cromatografía se re- mismo principio de la cromatografía en pa-
montan a 1850, cuando Runge describió un pel (cromatografía de adsorción); el soporte
método para el análisis de mezclas de colo- utilizado es sílica gel o celulosa colocadas
rantes, aplicando gotas de colorantes en pa- en una hoja de vidrio o plástico en forma de
pel y notando la separación en diferentes capas muy finas. En este proceso, la separa-
colores. Sin embargo, el crédito del descu- ción cromatográfica es muy rápida (fig.
brimiento de'la cromatografía se le dá al bo- 3.20).
tánico Tswett, quien en 1906 efectuó la Las dos primeras técnicas descritas se uti-
separación de mezclas de pigmentos vegeta- lizan generalmente para separar e identificar
les en un tubo conteniendo material adsor- aminoácidos o péptidos pequeños. A conti-
b e n t e s ó l i d o f i n a m e n t e d i v i d i d o . La nuación se describirán técnicas para la sepa-
separación cromatográfica se basa en el coe- ración e identificación de proteínas.
ficiente de partición líquido-líquido de los También utilizando una separación en co-
compuestos. lumna, pero aprovechando las cargas resi-
La cromatografía en papel, como todas duales de las proteínas como carácter
las técnicas simples, ha revolucionado la se- diferencial, se describe la cromatografía de
Figura 3.18 Cromatografía en papel.
intercambio iónico. Las resinas de intercam- Las resinas cargadas negativamente fijan
bio iónico para preparar la columna croma- cationes conociéndose como resinas de in-
tográfica, se preparan a partir de materiales tercambio catiónico. Igualmente, las resinas
insolubles (agarosa, poliacrilamina, celulosa, cargadas positivamente fijan aniones y se
etc.) que contienen ligandos cargados negati- denominan resinas de intercambio aniónico.
vamente (R-CH3-COO--SO5) o ligandos El grado de retención o retardo de una pro-
cargados positivamente (dietilamino) uni- teína (o aminoácido) por una resina depen-
dos a la resina insoluole. derá del número de cargas (positivas o
negativas) de la proteína al pH del experi-
mento (revisar pl de una proteína). Aquellas
moléculas proteicas con la misma carga que
la resina se eliminarán primero, seguidas por
proteínas de carga opuesta, que por atrac-
ción de cargas, se retendrán más tiempo en
la columna. Cuando es difícil eliminar una
molécula fuertemente atraída por la resina,
se utilizan cambios de pH o fuerza iónica
para debilitar la interacción.
Los derivados de celulosa como carboxi-
metil celulosa (CMC) y dietilaminoetil celu-
cero), no se desplazan ni hacia el cátodo ni La adición de base a la forma dipolar de la
hacia el ánodo en un campo eléctrico. El glicina, completa la titulación del grupo -
punto isoeléctrico (pl) de un aminoácido se NH 3, el pH de la solución es superior a 11.5
define como el pH en el cual no tiene carga y la especie predominante tiene una carga
eléctrica neta; en el caso de los aminoácidos formal de -1 (forma aniónica).
con sólo un grupo amino y uno carboxilo co- Como puede verse en la fíg. 3.5, la glicina
rresponde a la siguiente ecuación: y otros aminoácidos con cadena lateral no
ionizable y valores de pKi próximos a 2.5 y
pl = | ( P K 1+ pK2) de pK2 próximos a 9.5, pueden actuar como
amortiguadores en dos zonas de pH, donde
ninguna les permite actuar como amortigua-
Si consideramos la curva de titulación de dores al pH fisiológico del plasma.
un aminoácido sencillo como la glicina, su Precisamente, el pH de 7.4 es un valor
equilibrio de ionización corresponde a: cercano al pl de dichos aminoácidos, y éste
A pH de 1 la forma iónica predominante es el punto de menor solubilidad de aminoá-
tiene una carga de +1 (forma catiónica) y se cidos y proteínas.
desplazará hacia el cátodo en un campo Un caso más complejo lo constituyen los
eléctrico. La adición de base hasta alcanzar aminoácidos con un grupo ionizable en su
la forma de zwitterión, corresponde al punto cadena lateral. Tal es el caso del ácido glutá-
isoeléctrico (pl=5.97). mico y del aspártico que poseen un grupo
losa (DEAE) se han utilizado con éxito en la identificar se pasa a través de una columna
purificación de proteínas. empaquetada con pequeñas esferas de resina
En la cromatografía líquida de alta reso- insoluble. Como en esta técnica la resina es-
lución, la mezcla de proteínas a separar e tá tan densamente empaquetada se requiere
de bombeo a elevada presión para forzar el cla de proteínas se separa en función del ta-
paso de la proteína. En esta técnica la co- maño saliendo primero las proteínas más
lumna es metálica y no de vidrio como la grandes y a continuación las más pequeñas,
cromatografía a presión normal. Las esferas las cuales se retardan por tener que viajar por
de resina pueden cubrirse con grupos carga- el retículo del gel (fig. 3.21).
dos, como en la cromatografía de intercam-
bio iónico, o con residuos hidrofóbicos con
lo que las moléculas no polares se retrasarán
al paso por la resina. Las esferas pueden ser
porosas y actuar con el mismo principio de
la cromatografía de exclusión molecular, se-
parando moléculas grandes de las pequeñas.
La cromatografía de afinidad se basa en
la alta afinidad que tienen las proteínas por
sus sustratos, grupos prostéticos, receptores
de membrana, inhibidores no covalentes es-
pecíficos y anticuerpos específicos. Estos
compuestos de alta afinidad se pueden unir
en forma covalente a una resina insoluble y
utilizarse para purificar una proteína me-
diante cromatografía en columna.
ANTICUERPOS (Igs)
Figura 3.30 Esquema de un antigeno, que puede ser una proteína y donde se muestran distintos e hipotéticos
determinantes antigénicos y cómo a ellos se pueden unir diferentes anticuerpos de manera especifica.
Diámetro de 1 5 A
Prolina
Figura 3.37 Estructura de! colágeno desde la secuencia primaria hasta la fibrilla.
Para que se realicen los movimientos de actividad continua son muy abundantes en
una célula (pseudópodos) o de un organismo mitocondrias, mioglobina y citocromos, son
(contracción muscular) se requiere de un los llamados músculos rojos; en cambio, los
mecanismo disparador del proceso (el Ca 2+ ), músculos blancos son poco abundantes en
una fuente de energía (el ATP) y un sistema mitocondrias y mioglobina y su metabo-
transductor (el músculo). El músculo es el lismo es anaeróbico.
principal transductor bioquímico que con- Las miofibrillas son la maquinaria contrác-
vierte la energía (química) potencial en til del músculo y su unidad es la sarcómera.
energía (mecánica) cinética. Este sistema me- Cuando se examinan cortes de una miofibrilla
canoquímico es la maquinaria más eficiente y al microscopio óptico o electrónico presentan
versátil de conversión energética jamás co- un aspecto estriado. Este se debe a la alter-
nocida. nancia de bandas oscuras y claras; la banda
Un transductor químico-mecánico debe oscura, banda A, es anisotrópica, birrefrin-
satisfacer varios requerimientos: 1) suminis- gente a la luz polarizada, lo cual sugiere un
tro constante de energía; 2) debe haber un ordenamiento geométrico regular de las mo-
sistema regulador de la actividad mecánica; léculas; la banda I es isotrópica, no es refrin-
3) debe existir un operador, función cubierta gente, lo que indica un ordenamiento más al
por el sistema nervioso y 4) que la máquina azar. Dentro de la banda A se distingue una
pueda regresar a su estado original. Estos re- zona de poca densidad a los electrones o zo-
querimientos son satisfechos, en el hombre, na H con una línea central muy densa, linea
por tres tipos de músculos: esquelético, car- M. Dentro de la banda I se define una línea
diaco y liso. El músculo esquelético y car- muy densa a los electrones o línea Z; dos lí-
diaco aparecen estriados en el microscopio; neas Z delimitan una sarcómera (fig. 3.38).
el músculo liso no es estriado. El músculo Detrás de la estructura microscópica de la
esquelético se encuentra bajo control ner- miofibrilla subyace una estructura molecu-
vioso voluntario, el músculo cardiaco y liso lar de sus componentes. Cada sarcómera está
es de control involuntario. formada por filamentos gruesos, confinados
El tejido muscular es el más abundante del a la zona H de la banda A y que constan de
cuerpo humano. Más del 40% de la masa muscu- la proteína miosina; los filamentos delgados
lar de un individuo adulto es músculo esquelé- se localizan en la banda I pero se extienden
tico. Durante una actividad muscular intensa, hasta la banda A y consisten en las proteínas
los músculos pueden consumir 85% o más acuna, tropomiosina y troponina. La línea Z
del ATP total producido en el metabolismo. es un material amorfo de a-actinina al cual
Todos los músculos estriados del cuerpo se unen los filamentos delgados y la línea M
están formados por gran número de fibras. es un ensanchamiento de los filamentos
Cada fibra muscular contiene millares de gruesos formada por proteína M. Al corte
miofibrillas, ordenadas en paralelo, las cua- transversal, cada filamento grueso está ro-
les poseen a su vez unos 2,500 filamentos deado por seis filamentos delgados y cada
que se encuentran inmersos en un citoplas- filamento delgado está rodeado por tres fila-
ma soluble (sarcoplasma), rodeados por una mentos gruesos (fig. 3.39).
membrana celular (sarcolema). La célula
muscular posee un abundante retículo endo-
plásmico (sarcoplásmico) poco rugoso, lo Proteínas musculares
cual habla de una síntesis proteica muscular
poco activa; su contenido en mitocondrias La actina, descubierta por Straub, es una
es muy variable, los músculos aeróbicos de proteína globular que representa el 25% en
peso de la proteína muicular. La forma glo- de un complejo actomiosina que aumentó la
bular monomérica es la actina-G, la cual se viscosidad de la solución. La fibra de acto-
prolimeriza, en presencia de Mg 2 + para for- miosina preparada por Engelhardt, posee un
mar un filamento de doble hélice, insoluble, comportamiento óptico de doble refracción
llamado actina-F. Ninguna de las dos for- análogo a la fibra muscular intacta; esto jus-
mas (G o F) muestra actividad catalítica. tificó el considerar que una fibra de acto-
La tropomiosina, descubierta por Bailey, miosina preparada es, en efecto, un modelo
es una molécula en forma de varilla o bastón molecular de la fibrilla muscular.
que se encuentra asociada con filamentos de
actina. Constituye el 2.5% de las proteínas
musculares. La otra proteína ligada a la acti- Bases moleculares de la contracción
na es la troponina. Mientras que la tropo- muscular
miosina existe en todos los músculos, la
troponina es exclusiva del músculo estriado. La contracción muscular se inicia con la lle-
La troponina consta de tres subunidades di- gada del impulso nervioso y con ello la ace-
ferentes: la troponina-C, proteína fijadora de tilcolina que despolariza la membrana
calcio; la troponina-I, inhibe la interacción muscular y se alcanza el potencial crítico o
actina-miosina y también la actividad de acción que se propaga por el sarcolema.
ATPasa; la troponina-T, interviene en el en- Esta despolarización provoca aumento de
samble de las subunidades C e I al complejo permeabilidad al Ca 2+ . En ausencia de cal-
actina-tropomiosina (fig. 3.40). cio la interacción actinamiosina está inhibi-
El componente fundamental del filamento da por la troponina-I y el músculo está en
grueso es la miosina descubierta por Kuhne, reposo, relajado. Al entrar el Ca 2 + al sarco-
es la proteína más abundante del músculo plasma, se une a la troponina-C y se produce
esquelético (55% de la proteína muscular). un cambio conformacional que afecta a las
La miosina está compuesta por dos cadenas otras subunidades de troponina y a la tropo-
pesadas entrelazadas helicoidalmente con miosina que se desplaza de su lugar y permi-
una cabeza globular en cada extremo, lo cual te interaccionar a las cabezas globulares de
le da un aspecto característico (fig. 3.41). la miosina con las moléculas de actina.
Además, cada cabeza globular está asociada En conjunto, se produce un deslizamiento de
a dos cadenas ligeras. La porción globular filamentos de actina sobre los de miosina y con
de la miosina tiene actividad ATPasa y se ello un acortamiento, no de filamentos, sino de
combina con la actina. la zona H (fig. 3.42). Al acortarse la zona H,
Cuando la miosina es digerida con tripsi- se acorta la sarcómera, la miofibrilla y el
na, se forman 2 fragmentos denominados músculo completo. La energía que aporta fuer-
meromiosinas. La meromiosina pesada po- za para la contracción muscular es la hidró-
see la porción globular y parte de la porción lisis del ATP (ver capítulo Bioenergética). La
fibrosa; conserva la actividad ATPasa y se característica de este ciclo bioquímico de con-
une a la actina-F. La meromiosina ligera tracción es que la actina posee poca afinidad
contiene la porción fibrosa y no muestra ac- por el complejo miosina-ATP (fibra-relajada);
tividad ATPasa ni se une a la actina-F. La al hidrolizarse el ATP, se produce la contrac-
actividad ATPasa se incrementa 100 a 200 ción por la elevada afinidad de la actina por el
veces por la adición de actina-F. complejo miosina-ADP (fibra contraída). En
Actomiosina. Hace ya más de 30 años que términos simples, la energía producida por
Szent-Gyórgyi mezcló en un tubo de ensayo hidrólisis de ATP se usa para que se produz-
actina con miosina y observó la formación ca la unión-desunión de actina y miosina.
La relajación de músculo tiene lugar con dio de una Na+-K+-ATPasa. En esta fase de
el cese del impulso nervioso y el retorno del relajación interviene también el ATP para
sarcolema a su estado polarizado original lo bombear Ca2+, contra un gradiente de con-
cual se logra por bombeo de Na+ hacia afue- centración, hacia afuera de la célula por una
ra y de K+ hacia dentro de la célula por me- C 1+-M | + -ATPasa.
El grupo carboxilo puede ser química- te detectar cantidades del orden de 1 micro-
mente descarboxilado para dar la correspon- gramo ó 3 * 10~9 moles de un aminoácido.
diente amina. La fluorescamina reacciona con los ami-
noácidos a temperatura ambiente dando un
producto fluorescente, cuya concentración
5.13.2. Reacciones del grupo a -amino puede medirse con un espectrofluorímetro.
Este es un reactivo aún más sensible (10 a
El grupo amino de los aminoácidos reaccio- 100 veces mayor que la ninhidrina), ya que
na con la ninhidrina en caliente para dar un permite detectar cantidades de nanogramos
compuesto púrpura intenso (excepto la de un aminoácido o 10-10 a 10"11 moles.
prolina que da un derivado amarillo) que La reacción con dinitrofluoro benceno
absorbe al máximo la luz con longitud de (reactivo de Sanger) fue muy utilizada hace
onda de 570 nm (el amarillo de la prolina a años para identificar aminoácidos N-termi-
440 nm). nales, hoy, casi en desuso. Los a -aminoáci-
El color obtenido con la ninhidrina es la dos en presencia del reactivo dan lugar a los
base de una prueba colorimétrica que permi- dinitrofenil derivados.
3.13.3. Reacciones de la cadena lateral el grupo indol del triptófano. El reactivo de
Pauly da un color rojo con el imidazol de la
Un buen número de reacciones químicas histidina y el fenol de la tirosina.
pueden ser utilizadas para cuantificar cade-
nas laterales específicas en una solución de
aminoácidos libres o proteínas desnaturali- 3.1.4. Clasificación
zada.
El reactivo de Ellman (ácido ditiobis-ni- Entre las diferentes clasificaciones estructura-
trobenzoico) reacciona con el tiol de la ca- les de los aminoácidos, quizá la más extendida
dena lateral de la cisterna a pH 8.0 dando un es la que los agrupa según las propiedades
producto, el ácido tionitrobenzoico, que ab- fisicoquímicas de su cadena lateral, en parti-
sorbe intensamente a 412 nm. cular, en cuanto a su polaridad. Los aminoá-
La reacción de Sakaguchi se utiliza para cidos se denominan en forma sistemática o
cuantificar espectrofotométricamente el trivial. La más extendida es la denomina-
grupo guanidino de la arginina. El reactivo ción trivial o común, fruto del material don-
de Ehlrich es un ensayo colorimétrico para de se aislaron por primera vez (asparagina